本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-10-22 |
Network pharmacology, single-cell transcriptomics, machine learning and experimental validation identifying CHEK2 and HPGD as key therapeutic targets of berberine in diabetic nephropathy
2026-Oct-01, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-026-02052-2
PMID:42821141
|
研究论文 | 该研究结合网络药理学、单细胞转录组学、机器学习和实验验证,识别CHEK2和HPGD作为小檗碱治疗糖尿病肾病的关键靶点 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组学、高维WGCNA、机器学习(随机森林和SHAP分析)以及分子对接和分子动力学模拟,并结合体外拯救实验,系统识别并功能验证CHEK2和HPGD作为小檗碱治疗糖尿病肾病的关键靶点 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据和体外细胞实验验证,缺乏体内动物模型验证和临床样本验证 | 阐明小檗碱治疗糖尿病肾病的精确分子靶点和作用机制 | 糖尿病肾病相关的肾细胞(特别是足细胞)、小檗碱的分子靶点 | 网络药理学, 单细胞转录组学, 机器学习 | 糖尿病肾病 | bulk转录组微阵列, 单细胞RNA测序, 网络药理学, WGCNA, hdWGCNA, 机器学习, 分子对接, 分子动力学模拟, MM/PBSA计算 | 随机森林, SHAP分析 | 基因表达数据(微阵列和单细胞RNA测序数据), 文本(数据库靶点信息) | 使用了GSE96804、GSE30122两个bulk转录组微阵列数据集和GSE131882单细胞RNA测序数据集,单细胞分析鉴定出11种肾细胞类型 | NA | bulk转录组微阵列, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 722 | 2026-10-22 |
Lipid nanoparticle-formulated synthetic messenger RNA induces reversible hematopoietic bias via type I interferon responses under upper-bound inflammatory conditions in preclinical animal models
2026-Oct-01, Toxicological sciences : an official journal of the Society of Toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/toxsci/kfag134
PMID:42853072
|
研究论文 | 本研究在临床前动物模型中揭示了高剂量LNP配方合成mRNA通过I型干扰素信号引起可逆性造血谱系偏倚的机制 | 首次系统阐明LNP配方合成mRNA在高剂量暴露下通过I型干扰素依赖途径引起可逆性红系抑制与粒系扩增的造血偏倚,并验证了该现象跨物种(小鼠与非人灵长类)的普遍性,区分了mRNA配方与LNP载体的相对贡献 | 研究所用剂量为刻意设置的高于临床的超上限剂量,与临床实际暴露水平存在差距;机制解析主要依赖干扰素受体阻断,未完全阐明下游具体分子通路;非人灵长类样本量可能有限 | 探究高剂量LNP配方合成mRNA对骨髓造血的影晌及其机制基础,并评估该造血偏倚在不同物种间的可推广性 | 小鼠和非人灵长类动物模型 | 转录组学 | 传染病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 723 | 2026-10-22 |
Ablation of CDK6 and STAT5B rewires T cell developmental dynamics and prevents ALK+ lymphoma formation
2026-09-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77466-4
PMID:42881166
|
研究论文 | 该文研究了在NPM-ALK小鼠模型中同时敲除Cdk6和Stat5b如何阻止ALK+淋巴瘤形成,并揭示了其通过改变胸腺细胞发育轨迹和转录程序发挥作用的机制 | 首次证明同时遗传性删除Cdk6和Stat5b可完全预防NPM-ALK小鼠肿瘤形成;识别DN2/3胸腺细胞为ALK驱动恶性肿瘤的细胞起源;通过单细胞转录组学揭示肿瘤特异性分化轨迹被Cdk6/Stat5b联合缺失完全破坏;发现CDK6和STAT5B在肿瘤起始阶段共享参与细胞周期调控和凋亡的转录靶点;在人类ALCL细胞中双删除CDK6和STAT5B诱导情境依赖性合成致死;基于CDK6/STAT5B依赖性肿瘤起始基因的转录特征可识别高危ALCL患者亚组 | 摘要未明确说明研究的局限性 | 探究CDK6和STAT5B在淋巴瘤转化过程中的相互作用,以及同时敲除这两个基因对ALK+淋巴瘤形成的影响和机制 | NPM-ALK小鼠模型、人类ALCL细胞、ALCL患者 | 肿瘤生物学、单细胞转录组学 | 淋巴瘤(ALK+间变性大细胞淋巴瘤) | 单细胞转录组学、基因敲除、转录分析 | NPM-ALK小鼠模型 | 单细胞转录组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2026-10-22 |
Spatial profiling of the spleen in mouse and human myelofibrosis reveals complement-driven immune-stromal interactions as a therapeutic target
2026-09-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.07.012
PMID:42641607
|
研究论文 | 结合空间转录组、单核转录组、单细胞转录组和成像分析,绘制小鼠和人类骨髓纤维化脾脏中的髓外造血微环境,揭示补体驱动的免疫-基质相互作用是治疗靶点。 | 首次在空间和单细胞水平上系统绘制骨髓纤维化脾脏的髓外造血微环境,发现脾脏间充质基质细胞从支持造血向炎症和促纤维化状态转变,并证明补体C3缺失或药物抑制可逆转脾肿大和骨髓纤维化。 | 摘要未明确提及研究局限性,可能包括样本量有限、小鼠模型与人类疾病的差异以及补体抑制疗法的长期安全性和有效性尚需进一步验证。 | 阐明脾脏间充质基质在骨髓纤维化疾病进展中的作用,并寻找可靶向的治疗轴。 | 骨髓纤维化患者和小鼠的脾脏组织 | 空间转录组学、单细胞转录组学、数字病理学 | 骨髓纤维化 | 空间转录组学、单核RNA测序、单细胞RNA测序、成像分析 | NA | 图像、文本(转录组数据) | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | NA |
| 725 | 2026-10-22 |
Screening of metabolic-related biomarkers linking intervertebral disc degeneration and type 2 diabetes based on comprehensive bioinformatics analysis and machine learning
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2026.102593
PMID:42064579
|
研究论文 | 该文通过综合生物信息学分析和机器学习筛选连接椎间盘退变与2型糖尿病的代谢相关生物标志物AMBP | 首次结合多种机器学习算法识别出IVDD和T2D的共享生物标志物AMBP,并通过单细胞测序和实验验证了其与免疫细胞浸润及BCAA代谢的相关性 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,样本量有限,实验验证仅在临床样本和HNPC细胞中进行,缺乏更大规模的前瞻性队列验证和体内功能实验 | 识别2型糖尿病和椎间盘退变的共享生物标志物,探索其临床诊断价值及潜在调控机制 | 椎间盘退变患者和2型糖尿病患者的基因表达数据集,以及临床样本和HNPC细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变, 2型糖尿病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | Boruta, 随机森林, 支持向量机, XGBoost | 基因表达数据, 文本 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 726 | 2026-10-22 |
Challenging pacemaker implantation in a child with aggressive atrial standstill caused by compound heterozygous SCN5A variants
2026-Jun, Cardiology in the young
IF:0.9Q3
DOI:10.1017/S1047951126113511
PMID:42318680
|
病例报告 | 报告一例5岁患儿因SCN5A复合杂合变异导致侵袭性心房静止,在起搏器升级过程中面临挑战的病例 | 首次报道SCN5A复合杂合变异(c.2431C>T和c.2893C>T)导致儿童侵袭性心房静止,结合蛋白质结构建模和小鼠单细胞RNA测序数据揭示Scn5a表达局限于传导束和纤维而非心肌细胞 | 单病例报告,样本量小,缺乏功能验证实验,仅基于生物信息学预测和已有小鼠数据 | 探讨SCN5A相关心房静止的基因型-表型关联,强调器械植入过程中全面电生理评估的重要性,以及儿科患者生理性起搏策略的考虑 | 一名5岁女性患儿,表现为早期心动过缓并进展为侵袭性心房静止 | 心血管疾病 | 心律失常 | 基因检测、单细胞RNA测序、斑点追踪超声心动图、心内电生理检查 | NA | 临床数据、基因序列、单细胞转录组数据、超声图像 | 1例患者;小鼠scRNA-seq数据(GSE132658) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 727 | 2026-10-22 |
Reconstructing single-cell resolution from spatial transcriptomics with CellRefiner
2026-Feb-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70090-2
PMID:41760664
|
研究论文 | 提出CellRefiner方法,结合单细胞数据与空间转录组数据重建空间数据的单细胞分辨率 | 基于物理模型,将细胞建模为通过力连接的粒子,优化细胞位置时综合考虑空间邻近约束、基因表达相似性和配体-受体相互作用 | 需要配对的单细胞数据集;未明确说明在极低基因表达或高噪声数据下的表现 | 从非单细胞分辨率的空间转录组数据中重建单细胞分辨率,以支持需要单细胞分辨率和空间信息的下游分析 | 空间转录组数据中的细胞 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序, 单细胞RNA测序 | 物理模型 | 基因表达数据, 空间位置数据 | 多种模拟和真实数据集(Visium、MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2、STARmap),以及小鼠皮层和淋巴结组织 | 10x Genomics, 其他(MERFISH、seqFISH、Slide-seqV2、STARmap平台公司未明确) | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, MERFISH, seqFISH, Slide-seqV2, STARmap | NA |
| 728 | 2026-10-22 |
Male obesity causes adipose mitochondrial dysfunction in F1 mouse progeny via a let-7-DICER axis
2026-Feb-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69686-5
PMID:41735303
|
研究论文 | 该文揭示雄性肥胖通过精子中let-7d/e抑制DICER1导致F1代小鼠脂肪组织线粒体功能障碍 | 首次发现let-7d/e作为表观遗传介质在肥胖雄性精子中诱导并在子代脂肪组织中沉默DICER1,损害线粒体活性,且生活方式减重可逆转人类精液中LET-7D/E水平 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅限于精液let-7表达变化,未验证人类子代代谢表型 | 探究雄性肥胖对子代代谢的影响及其通过精子microRNA传递的表观遗传机制 | 雄性肥胖小鼠及其F1代雄性后代、人类肥胖男性精液样本 | 代谢表观遗传学 | 肥胖、代谢综合征 | 单细胞RNA测序、microRNA微注射、基因表达分析 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 729 | 2026-10-22 |
Macrophage-derived CXCL8 as a mediator of inflammatory attacks in Meniere's disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1683879
PMID:41869317
|
研究论文 | 该研究采用整合多组学方法探究梅尼埃病的免疫微环境,揭示巨噬细胞来源的CXCL8在真菌刺激下介导炎症发作的机制 | 提出梅尼埃病“低免疫-高炎症转换”新模型,首次将巨噬细胞来源的CXCL8及ALCAM-CD6通路确定为环境触发炎症发作的关键介质 | 摘要中未明确提及研究局限性,需依赖进一步实验验证该模型在更大队列中的普适性 | 阐明梅尼埃病由缓解期向急性炎症发作转变的免疫机制,为靶向免疫调节治疗提供基础 | 梅尼埃病患者及健康对照者的外周血单个核细胞和血清样本 | 免疫学、多组学、生物信息学 | 梅尼埃病 | bulk RNA-seq、单细胞RNA测序、生物信息学分析、蛋白-蛋白互作网络分析、免疫浸润分析、体外巨噬细胞刺激实验、免疫荧光染色、血清细胞因子检测 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据、图像、血清细胞因子数据 | GSE109558队列(MD患者与健康对照PBMC,经曲霉或青霉刺激)、GSE269117单细胞数据集、独立验证队列(血清细胞因子检测及体外巨噬细胞实验) | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 730 | 2026-10-22 |
Engineering of functional auditory neurons from human induced pluripotent stem cells
2026, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1016/j.mmr.2026.100008
PMID:42063462
|
研究论文 | 该研究建立了一种从人类诱导多能干细胞(hiPSCs)生成功能性螺旋神经节神经元(SGN)样细胞的分化方案,并对其形态、分子、电生理和功能特征进行了系统验证 | 通过模拟人类内耳发育的关键信号通路,结合磁珠分选、Sonic hedgehog处理及神经营养因子 cocktail,成功从hiPSCs高效生成具有体内SGN特征的功能性神经元,并证实其能与小鼠耳蜗毛细胞及耳蜗核神经元形成功能性突触连接 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 建立稳定可重复的hiPSCs向功能性人类SGN样神经元分化的方法,为研究人类听觉发育、疾病建模、药物筛选和细胞治疗提供平台 | 人类诱导多能干细胞(hiPSCs)及其分化产生的SGN样神经元 | 干细胞生物学、发育生物学、神经科学 | 听力损失/耳聋 | 单细胞RNA测序、免疫细胞化学、全细胞膜片钳电生理、共培养实验、钙离子成像 | NA | 基因表达数据、图像、电生理信号、钙成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 731 | 2026-10-22 |
Integrated multi-omics and single-cell transcriptomic analysis reveals shared molecular mechanisms and cell-cell communication signatures in gout and metabolic syndrome
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1749788
PMID:42063773
|
研究论文 | 该研究通过整合多组学和单细胞转录组分析,揭示了痛风和代谢综合征共享的分子机制及细胞间通讯特征,并进行实验验证 | 首次综合多组学与单细胞转录组分析揭示痛风和代谢综合征共享的分子景观,识别JAK1和CSF1R等核心基因,发现VISFATIN信号通路作为两者共同联系,并阐明NAMPT相关的细胞通讯网络 | 研究主要基于生物信息学预测和体外细胞模型验证,缺乏体内动物模型或临床样本的直接验证 | 全面探究痛风和代谢综合征共享的分子机制和细胞间通讯特征,识别并验证关键调控基因和通路,为精准诊断和治疗策略提供依据 | 痛风和代谢综合征的转录组数据集及体外细胞模型 | 多组学分析 | 痛风, 代谢综合征 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, qPCR, Western blot | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 732 | 2026-10-22 |
Integrative single-cell RNA-seq and ATAC-seq analysis reveals the key role of inflammatory cell activation in pulmonary arterial hypertension
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1796116
PMID:42064054
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序,构建了肺动脉高压小鼠的转录组和染色质可及性图谱,揭示了炎症细胞活化在PAH中的关键作用 | 首次构建了PAH小鼠的整合转录组和染色质可及性图谱,发现S100a9在粒细胞和CCR2+促炎巨噬细胞中特异性上调,且CCR2+巨噬细胞中S100a9启动子区染色质可及性增加,并通过S100a9全局敲除小鼠验证了其在PAH中的作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类PAH样本中验证;S100a9表达上调的炎症细胞激活与PAH发展的具体分子机制仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压的细胞异质性和分子复杂性,探究炎症细胞活化在PAH发病中的作用 | 肺动脉高压小鼠模型的肺组织 | 单细胞多组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 733 | 2026-10-22 |
Immune cells in liver injury: from pathogenic mechanisms to immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1770949
PMID:42064073
|
综述 | 系统阐述肝损伤中免疫细胞与炎症介质的相互作用、纤维化信号通路及细胞治疗临床进展 | 整合单细胞与空间转录组学揭示肝内免疫细胞异质性、空间分布和自噬特征及其对肝星状细胞活化的调控网络 | 为综述性文章,未提供原始实验数据或定量验证 | 阐明肝损伤中炎症介质与免疫细胞的相互作用及纤维化信号通路调控机制,为肝纤维化精准治疗提供理论基础 | 慢性肝病(NAFLD、NASH、病毒性肝炎)中的肝内免疫细胞(巨噬细胞、中性粒细胞、T细胞、非经典淋巴细胞)及肝星状细胞 | 数字病理 | 肝病 | 单细胞转录组测序、空间转录组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 734 | 2026-10-22 |
Disulfidptosis-related genes define a prognostic signature and novel therapeutic targets in Ewing's sarcoma through transcriptomic analysis and experimental validation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1722729
PMID:42064080
|
研究论文 | 通过转录组分析和实验验证,识别双硫死亡相关基因,构建尤文肉瘤预后特征模型并探索新治疗靶点 | 首次在尤文肉瘤中构建双硫死亡相关基因预后特征,结合单细胞分析和分子对接,并通过实验验证NDUFA11的致癌作用 | 仅基于公共数据集和RD-ES细胞系验证,缺乏体内动物实验和更大规模临床队列验证 | 评估双硫死亡相关基因在尤文肉瘤中的预后意义并探索潜在治疗靶点 | 尤文肉瘤患者样本和RD-ES细胞系 | 数字病理学,机器学习 | 尤文肉瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序,PCR,Western blotting,siRNA敲低 | LASSO,Cox回归,无监督聚类 | 基因表达数据,单细胞RNA测序数据,文本,图像 | 四个GEO数据集和RD-ES细胞系,具体样本数未在摘要中提及 | NA | bulk RNA-seq,single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2026-10-22 |
SpatialFinder: a human-in-the-loop vision-language framework for prioritizing high-value regions in spatial transcriptomics
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1746714
PMID:42064250
|
研究论文 | 提出SpatialFinder框架,结合生物医学视觉语言模型与人在回路优化流程,从常规H&E切片预测基因表达异质性并排序高价值ROI | 首次将生物医学VLM与人在回路优化相结合用于空间转录组ROI优先级排序,实现人机协作降低测序成本 | 仅在四种Visium HD组织类型上评估,缺乏更广泛组织类型与临床场景验证 | 利用常规H&E图像低成本识别空间转录组中最具信息量的感兴趣区域 | 空间转录组切片对应的H&E组织图像及ROI | 数字病理 | NA | 空间转录组测序 | 视觉语言模型(VLM) | 图像 | 四种Visium HD组织类型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Visium HD空间转录组及配套H&E切片 |
| 736 | 2026-10-22 |
Integrating bulk RNA-seq and ScRNA-seq to identify manganese metabolism-related subtypes and immunoregulatory mechanisms in liver hepatocellular carcinoma
2026-Jan, Open life sciences
IF:1.7Q3
DOI:10.1515/biol-2025-1298
PMID:42064840
|
研究论文 | 该研究整合bulk RNA-seq和scRNA-seq数据,识别肝细胞癌中锰代谢相关亚型、构建预后模型并探讨免疫调控机制 | 首次基于锰代谢相关基因对肝细胞癌进行分子分型,结合单细胞数据揭示T细胞通讯改变,并构建了包含CEP55和SPP1的两基因预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据,缺乏独立队列验证和实验验证;预后模型的临床实用性有待进一步评估 | 识别肝细胞癌中锰代谢相关亚型,构建预后模型,并探讨免疫调控机制和细胞通讯 | 肝细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肝癌 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO回归, 多因素Cox回归 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2026-10-22 |
Integrative Machine Learning and Experimental Validation Identify MYBL2 as a Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Hepatocellular Carcinoma
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075284
PMID:42065054
|
研究论文 | 该研究通过整合机器学习和实验验证,系统评估了MYBL2在肝细胞癌中的预后生物标志物和治疗靶点价值,并揭示了miR-29a对MYBL2的调控机制 | 首次系统验证MYBL2在HCC中的临床意义,并发现miR-29a通过直接结合MYBL2的3'-UTR抑制其翻译,建立了肿瘤抑制性miR-29a与MYBL2之间的明确调控关系 | 摘要中未明确提及 | 系统验证MYBL2的临床意义,阐明其在肿瘤进展和药物敏感性中的功能作用,并识别其上游调控机制 | 肝细胞癌(HCC)患者队列数据、HepG2细胞系、miR-29a转基因小鼠的WD/CCl4 HCC模型 | 机器学习,数字病理学,肿瘤生物学 | 肝癌 | LASSO特征选择、单细胞转录组学、药物基因组学筛选、CRISPR依赖性筛选、体外HepG2实验、荧光素酶报告基因检测、iTRAQ蛋白质组学、体内WD/CCl4 HCC模型 | LASSO回归,机器学习整合模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、药物基因组学数据、CRISPR筛选数据、蛋白质组学数据、图像数据 | TCGA和GEO队列数据、多种HCC细胞系、miR-29a转基因小鼠模型 | NA | 单细胞转录组学,bulk RNA-seq,iTRAQ蛋白质组学 | NA | NA |
| 738 | 2026-10-22 |
Identify MTDH as a Key Gene of Radio-Resistance in Colorectal Cancer Based on Multi-Omics and Experimental Validation
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.075314
PMID:42065055
|
研究论文 | 该文通过多组学分析与实验验证,鉴定MTDH为结直肠癌放疗抵抗的关键基因 | 首次融合14种机器学习算法与SHAP可解释性分析鉴定MTDH为放疗抵抗关键基因,并结合单细胞RNA测序、批量转录组数据和实验验证系统阐明其机制 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究MTDH对结直肠癌放疗抵抗的精确影响及其作为预后和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织、82例直肠癌患者组织样本、SW480和HT29细胞系及其放疗抵抗变体(SW480-R和HT29-R) | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序、机器学习、免疫荧光 | 机器学习算法(14种融合)、SHAP | 基因表达数据、图像 | 82例直肠癌患者组织样本,及SW480、HT29细胞系 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA-seq | NA | NA |
| 739 | 2026-10-22 |
Navigating the Labyrinth of Hepatocellular Carcinoma: Leveraging AI/ML for Precision Oncology
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074185
PMID:42065059
|
综述 | 本文综述了人工智能和机器学习在肝细胞癌精准肿瘤学中的应用,重点讨论了如何将高维多组学数据转化为临床可操作的见解 | 系统性地整合了AI/ML与多组学、空间转录组学、数字病理学和单细胞技术的融合应用,提出了面向肝细胞癌的自适应、空间信息驱动的精准医学新范式 | 作为综述文章,未提供原始实验数据验证;AI/ML方法在肝细胞癌中的临床转化仍面临数据标准化、模型可解释性和前瞻性验证等挑战 | 评估人工智能和机器学习作为整合工具,将高维多组学数据转化为肝细胞癌管理的临床可操作见解的作用 | 肝细胞癌及其相关的多组学数据、肿瘤微环境和治疗策略 | 数字病理 | 肝癌 | 多组学分析(基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、表观基因组学)、空间转录组学、单细胞技术 | NA | 多组学数据、图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞技术 | NA | NA |
| 740 | 2026-10-22 |
CDKN1A/p21 Influences the Survival and Expansion of Breast Cancer Stem Cells after Oxidative Damage
2026, Oncology research
IF:2.0Q3
DOI:10.32604/or.2026.074965
PMID:42065068
|
研究论文 | 该文探讨CDKN1A/p21在氧化损伤后乳腺癌干细胞存活与扩增中的作用及其调控机制 | 揭示CDKN1A/p21直接结合启动子调控CD44、SPP1和TMSB10基因表达,形成与乳腺癌复发转移相关的基因特征 | 仅使用三维体外模型,缺乏体内动物实验和临床样本验证 | 探索CDKN1A/p21在乳腺癌干细胞存活和扩增中的作用 | 乳腺癌干细胞 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 空间转录组学, 染色质免疫沉淀-定量PCR | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |