单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40234 篇文献,本页显示第 721 - 740 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
721 2026-06-05
A dual-action nanoparticle approach for spinal cord injury treatment: ferroptosis inhibition, inflammation control, and Myelin preservation
2026-Feb-12, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
研究论文 一种新型双作用纳米颗粒通过抑制铁死亡、控制炎症和保护髓鞘来治疗脊髓损伤 首次使用从黄精提取的新型果聚糖包被硒纳米颗粒,并通过绿色抗坏血酸介导还原法合成PRP@SeNPs,实现对铁死亡和神经炎症的双重调控 该研究主要基于小鼠模型,未在大型动物或人体中进行验证,且未探讨长期安全性和生物降解性 开发一种无药物、生物相容性好的纳米治疗策略,通过补充硒来减轻脊髓损伤后的继发性损伤,促进神经保护和功能恢复 脊髓损伤小鼠模型及相关的神经元、少突胶质细胞和小胶质细胞 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 脊髓损伤小鼠模型(具体样本量未在摘要中提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
722 2026-06-05
PreTSA: computationally efficient modeling of temporal and spatial gene expression patterns
2026-Feb-12, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出一种名为PreTSA的计算方法,用于高效建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 PreTSA在保持与最先进方法一致结果的同时,显著降低计算时间,为极大型数据集中的基因表达模式研究提供独特解决方案 未提及 开发一种计算高效的方法,用于建模大规模单细胞和空间转录组数据中的时间和空间基因表达模式 大规模单细胞和空间转录组数据,包含数百万个细胞 机器学习 NA 单细胞转录组测序、空间转录组学 NA 基因表达数据 数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
723 2026-06-05
WAS Protein Deficiency Disrupts Memory B Cell Formation During Acute LCMV Infection
2026-Feb-11, Journal of clinical immunology IF:7.2Q1
研究论文 本研究利用急性LCMV感染的小鼠模型,揭示WAS蛋白缺乏会破坏记忆B细胞的形成,尤其在经典IgG2c MBCs比例下降和异常CD21low MBCs增加方面 首次在急性病毒感染的WASp基因敲除小鼠模型中,利用单细胞RNA测序技术阐明WASp缺乏如何促进异常记忆B细胞的形成,并发现WASp在异常MBCs中表达显著降低 未提及可能存在的局限性,例如研究仅在急性LCMV感染模型中进行,或缺乏对人类样本的直接验证 探究WAS蛋白缺乏对记忆B细胞分化的影响及其机制 WASp基因敲除小鼠及其在急性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)感染后的记忆B细胞分化 机器学习 Wiskott-Aldrich综合征 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 未明确说明样本数量,但涉及WASp敲除小鼠和对照小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
724 2026-06-05
Single-cell atlas of AML reveals age-related gene regulatory networks in t(8;21) AML
2026-Feb-11, eLife IF:6.4Q1
研究论文 通过对已发表单细胞RNA测序数据集的大规模整合,创建了急性髓系白血病(AML)的单细胞转录组图谱,并揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络 构建了迄今为止最大的人类AML单细胞数据资源(含748,679个细胞),并通过多组学数据验证,首次揭示了t(8;21) AML中与年龄相关的基因调控网络特征,发现BCLAF1作为儿科AML的潜在预后指标 NA 研究急性髓系白血病中t(8;21)亚型与年龄相关的基因调控网络机制 159名AML患者和51名健康供者的单细胞数据,重点分析20名t(8;21) AML患者 数字病理学 急性髓系白血病 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据 748,679个细胞,来自159名AML患者和51名健康供者(20项研究整合) NA 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 NA NA
725 2026-06-05
KLHDC4 serves as a novel prognostic biomarker and drives tumor progression via PI3K/AKT signaling in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-11, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 整合多组学数据系统评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床意义和功能作用,并实验验证其作为预后标志物和通过PI3K/AKT信号促进肿瘤进展 首次系统揭示KLHDC4在肾透明细胞癌中的预后价值及通过PI3K/AKT信号的致癌机制,并发现潜在的抑制剂来迪派韦 KLHDC4在恶性肿瘤中的临床意义和分子机制仍不清楚,尤其是肾透明细胞癌 评估KLHDC4在肾透明细胞癌中的临床相关性和功能作用 KLHDC4基因在多种癌症类型中的表达及肾透明细胞癌中的功能 生物信息学 肾细胞癌 多组学数据分析(转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序)、RNA测序、Western blot、分子对接 NA 转录组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据 多个癌症类型的数据集,含肾透明细胞癌患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
726 2026-06-05
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity in sepsis and down-regulation of SNHG5/miR-324-5p/CDK16 axis in T cells
2026-Feb-11, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示脓毒症中转录异质性及SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在T细胞中的下调 首次通过单细胞RNA-seq绘制脓毒症患者外周血单个核细胞图谱,并发现SNHG5/miR-324-5p/CDK16轴在炎症T细胞凋亡中的作用 样本量较小(仅3例脓毒症患者和3例健康志愿者),需要更多样本验证 研究脓毒症诱导的T淋巴细胞减少的分子机制 脓毒症患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 单细胞转录组学 脓毒症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3例脓毒症患者和3例健康志愿者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
727 2026-06-05
Single-cell transcriptomics reveal mechanisms of skeletal muscle differentiation across duck embryonic development
2026-Feb-11, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 通过单细胞转录组学揭示鸭胚胎发育过程中骨骼肌分化的机制 首次鉴定出慢肌纤维可通过LEF1+(I)亚型转分化为快肌纤维的机制,并证明该纤维类型转换程序在脊椎动物中系统发育保守 未提及明显局限性 探究脊椎动物肌肉纤维类型多样性的发育起源和调控通路 鸭胚胎发育过程中的骨骼肌 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 包含鸭胚胎发育多个阶段的骨骼肌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
728 2026-06-05
M5C-driven stabilization of SERPINB5 promotes cervical cancer progression and chemotherapy resistance
2026-Feb-11, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 该研究首次绘制了宫颈癌中RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C)甲基化组图谱,揭示了m5C驱动的SERPINB5稳定性增强促进宫颈癌进展和化疗耐药的新机制 首次在碱基分辨率水平构建宫颈癌m5C转录组图谱,并整合空间转录组学和单细胞RNA测序,发现m5C-SERPINB5轴作为宫颈癌恶性进展和化疗耐药的核心驱动机制 未提及 阐明RNA m5C修饰在宫颈癌进展和化疗耐药中的功能机制及治疗靶点 宫颈癌组织和细胞系 机器学习和数字病理学 宫颈癌 RNA甲基化测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 NA 转录组数据、空间转录组数据、单细胞测序数据 未提及 10x Genomics 单细胞RNA测序、空间转录组学 10x Chromium、10x Visium 10x Chromium单细胞RNA测序平台、10x Visium空间转录组学平台
729 2026-06-05
Single-cell transcriptome sequencing reveals immunological mechanisms by which recombinant Echinococcus granulosus P29 protein alleviates airway inflammation in mice with allergic asthma
2026-Feb-11, Parasites & vectors IF:3.0Q1
研究论文 通过单细胞转录组测序揭示重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的免疫机制 首次利用单细胞转录组测序技术结合实验方法,系统阐明rEg.P29通过调节T细胞亚群(如Th1、Th2、Th17和Treg)缓解过敏性哮喘的免疫机制,并发现Lag3+Tnfrsf9+ Treg细胞及其免疫抑制作用 未明确说明,但基于摘要可能限于小鼠模型及特定蛋白rEg.P29,需在临床样本中进一步验证 探讨重组细粒棘球蚴P29蛋白缓解过敏性哮喘小鼠气道炎症的效果及潜在免疫机制 过敏性哮喘小鼠模型(OVA诱导)及其肺组织细胞 数字病理学 过敏性哮喘 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 小鼠肺组织样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序 NA NA
730 2026-06-05
GPR35 protects against reperfusion injury in ischemic stroke by binding with the CR2 domain of Raf1
2026-Feb-10, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 研究发现GPR35通过与Raf1的CR2结构域结合,在缺血性脑卒中中保护免受再灌注损伤 首次揭示GPR35通过与Raf1的CR2结构域直接结合来调节Raf1/ERK1/2/MAPK信号通路,从而减轻缺血再灌注损伤和神经炎症 该研究主要基于小鼠模型,有待在人体中验证;且未完全阐明GPR35活化的下游分子机制细节 探究GPR35在缺血性脑卒中小鼠模型再灌注损伤中的作用及其分子机制 缺血性脑卒中小鼠模型中的小胶质细胞 生物医学 缺血性脑卒中 单细胞测序,共免疫沉淀 小鼠模型 NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
731 2026-06-05
Integration of Multi-Omics and Machine Learning Identifies TGFB1 and SERPINE1 as Biomarkers of Vascular Smooth Muscle Cell Senescence in Intracranial Aneurysms
2026-Feb-10, Translational stroke research IF:3.8Q2
research paper 通过整合多组学数据和机器学习,识别出TGFB1和SERPINE1作为颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的生物标志物 首次探究血管平滑肌细胞衰老在颅内动脉瘤发病机制中的作用,并利用多组学整合和机器学习方法鉴定出关键衰老相关基因TGFB1和SERPINE1 TGFB1和SERPINE1的具体机制仍需进一步研究和验证 识别颅内动脉瘤中血管平滑肌细胞衰老的关键调控基因及潜在生物标志物 颅内动脉瘤患者和弹性蛋白酶诱导的小鼠动脉瘤模型 machine learning cerebrovascular disease RNA-seq NA single-cell RNA sequencing data, bulk RNA sequencing data, microarray data 小鼠颅内动脉瘤模型(GSE193533)和人类组织样本 NA single-cell RNA-seq NA NA
732 2026-06-05
Combining Spatial Transcriptomics and Machine Learning Unravels Fibroblast-Related Biomarkers in Ulcerative Colitis
2026-Feb-10, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 结合空间转录组学和机器学习揭示溃疡性结肠炎中成纤维细胞相关的生物标志物 首次将空间转录组学与机器学习联合分析,鉴定出成纤维细胞相关生物标志物ANGPTL2,并通过体内外实验验证其作为非侵入性诊断指标和治疗靶点的潜力 未提供明确的局限性说明 探索成纤维细胞在溃疡性结肠炎发病机制中的作用并鉴定诊断生物标志物 溃疡性结肠炎患者和DSS诱导的UC小鼠模型 机器学习 溃疡性结肠炎 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 机器学习, IF, ELISA, WB 机器学习模型 基因表达数据, 空间转录组数据 多个数据集(GSE114374, GSE231993, GSE189184)及UC患者血清样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
733 2026-06-05
Cellular and transcriptional trajectories of neural fate specification in sea anemone uncover two modes of adult neurogenesis
2026-Feb-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过报告基因追踪和单细胞转录组学,揭示了海葵中成年神经发生的两种不同机制 首次在海葵中发现两种不同的成年神经发生模式:多能祖细胞直接分化为肽能神经元,以及刺细胞(特化的刺胞动物神经细胞)的逐步成熟过程 对神经命运决定过程中转录调控机制的详细解析仍有待深入 阐明刺胞动物成年神经发生的细胞谱系和转录程序 海葵(Nematostella vectensis) 机器学习 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 成年海葵样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
734 2026-06-05
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-Feb-10, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出了Seq-Scope-X技术,通过组织膨胀突破光学分辨率限制,实现了亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 首次将组织膨胀与亚微米级空间测序结合,显著减少转录扩散效应并将空间特征密度提高一个数量级,同时兼容空间蛋白质组学分析 未详细说明组织膨胀对RNA完整性的潜在影响及不同组织类型的适用性差异 开发超越光学分辨率的超高通量空间组学技术以解析细胞微环境 小鼠肝脏、脑、结肠组织及人类扁桃体组织中的单细胞和空间亚细胞结构 数字病理学 NA 空间转录组学,空间蛋白质组学,组织膨胀技术 NA 空间基因表达数据,空间蛋白标记数据 小鼠肝脏、脑、结肠组织样本及人类扁桃体组织样本(具体数量未说明) NA 空间转录组学,空间蛋白质组学 Seq-Scope-X 基于Seq-Scope平台的亚微米分辨率空间组学技术,结合组织膨胀实现超越光学分辨率的分析
735 2026-06-05
A single-cell transcriptomic dataset profiling traumatic brain injury and NeuroD1-based gene therapy in mice
2026-Feb-10, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 通过单细胞转录组数据集分析了小鼠创伤性脑损伤及基于NeuroD1的基因治疗的效果 首次利用单细胞RNA测序揭示NeuroD1基因治疗在创伤性脑损伤中对细胞组成和星形胶质细胞亚型的显著影响,并阐明了其恢复线粒体和代谢功能、抑制异常突触和髓鞘化过程的分子机制 论文未明确说明局限性,但可能包括样本量较小、仅使用小鼠模型以及未完全阐明所有潜在机制 阐明创伤性脑损伤中基于NeuroD1的基因治疗的分子和细胞机制 小鼠创伤性脑损伤模型及NeuroD1基因治疗后的脑组织细胞 机器学习 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 使用皮质刺伤小鼠模型的创伤性脑损伤样本,具体数量未提及 NA 单细胞RNA-seq NA NA
736 2026-06-05
ICE: robust detection of cellular senescence from weak single-cell signatures using imputation-based marker refinement
2026-Feb-10, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 提出了一种基于插值的细胞衰老检测框架ICE,用于从弱单细胞信号中稳健识别衰老细胞 通过整合表达插值与标记物细化,克服了经典衰老标记物表达弱且非特异性的限制,实现了对单细胞RNA-seq数据中衰老细胞的准确检测 可能依赖于特定插值方法,且在异质性较高的组织中的表现有待进一步验证 开发一种能可靠检测单细胞RNA-seq数据中衰老细胞的计算方法 胰腺β细胞和阿尔茨海默病样本中的小胶质细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 计算框架(插值与标记物细化) 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
737 2026-06-05
Mouse skeletal muscle satellite cells co-opt the tenogenic gene Scleraxis to instruct regeneration
2026-Feb-09, eLife IF:6.4Q1
研究论文 本研究揭示小鼠骨骼肌卫星细胞利用腱生成相关基因Scleraxis指导肌肉再生过程 首次证明腱生成相关转录因子Scx在成体肌肉干细胞中激活并功能性地调控肌肉再生,为肌肉再生与肌腱发育共享分子机制提供新视角 仅基于小鼠模型,尚需验证在人类肌肉再生中的保守性;未完全解析Scx在卫星细胞与其他细胞类型间的协同机制 探究腱生成相关基因Scleraxis在成体骨骼肌再生中的表达模式与功能作用 成年小鼠骨骼肌卫星细胞及其再生过程中的肌肉、肌腱组织 机器学习 NA 单细胞RNA测序、CUT&RUN NA 基因表达数据 成年小鼠骨骼肌样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
738 2026-06-05
DANST enables cell-type deconvolution in spatial transcriptomics using deep domain adversarial neural networks
2026-Feb-09, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 DANST框架利用深度域对抗神经网络实现空间转录组学中的细胞类型反卷积 首次将深度域对抗神经网络应用于空间转录组学细胞类型反卷积,通过整合单细胞RNA测序与推断空间坐标构建伪空间数据,并利用变分自编码器和域对抗架构实现特征对齐与准确标签迁移 未提及具体局限性 开发一种能够从混合基因表达数据中恢复细胞类型比例的空间转录组学反卷积框架 人类和小鼠数据集 机器学习 肿瘤微环境分析 空间转录组学, 单细胞RNA测序 深度域对抗神经网络, 变分自编码器 基因表达数据, 空间坐标 人类和小鼠数据集(未提供具体样本数量) NA 空间转录组学, 单细胞RNA测序 NA NA
739 2026-06-05
Loss of mechanical stress induces synovitis, fibrosis and articular cartilage degeneration via distinct synovial cell subsets
2026-Feb-09, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本研究揭示了机械应力缺失如何通过不同的滑膜细胞亚群导致滑膜炎、纤维化和关节软骨退化 利用最小机械应力小鼠模型首次阐明滑膜和软骨变化的时序机制,并识别出Lrrc15肌成纤维细胞和Mmp9巨噬细胞作为关键亚群 未说明具体限制 探究机械应力缺失导致关节功能障碍的分子机制 最小机械应力小鼠模型的关节组织 数字病理学 骨关节炎 RNA-seq, scRNA-seq, 组织学检查 NA 基因表达数据, 组织学图像 小鼠模型,具体样本数量未说明 Illumina bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq Illumina NovaSeq 用于bulk RNA-seq和scRNA-seq的测序平台
740 2026-06-05
A novel nanotherapeutic strategy: rescuing nucleus pulposus cells from fatty acid metabolic disorder and pyroptosis through ACOT13 by Chinese herbal formula nanoparticles
2026-Feb-08, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1
research paper 通过单细胞测序和多组学分析,研究脂肪酸代谢在椎间盘退变中的作用,并开发基于中药方剂的纳米颗粒治疗策略 首次发现ACOT13通过抑制AMPK/ACC信号通路导致脂肪酸代谢紊乱和细胞焦亡,加速椎间盘退变;创新性利用中药方剂自组装纳米颗粒调控ACOT13功能 未提及 探索脂肪酸代谢在椎间盘退变中的新机制并开发基于中药纳米颗粒的逆转退变疗法 临床样本中的髓核细胞 machine learning 椎间盘退变 单细胞测序, 多组学分析, 分子动力学模拟 NA 序列数据, 临床样本数据 NA NA single-cell RNA-seq, 多组学 NA NA
回到顶部