单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35811 篇文献，本页显示第 721 - 740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 721 | 2026-01-23 |
The Glutamine Metabolic Switch Influences the Response of Neonatal Intestinal Macrophages to Breast Milk
2025-Nov-29, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101683
PMID:41320153
|
研究论文 | 本研究探讨了谷氨酰胺和谷氨酸在新生儿坏死性小肠结肠炎（NEC）中对肠道巨噬细胞代谢重编程的双重作用 | 揭示了谷氨酰胺代谢开关在新生儿肠道巨噬细胞响应母乳中的关键作用，并发现其效果具有时间依赖性 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，人类数据仅来自已发表的scRNA-seq数据重分析，缺乏直接的人类干预实验验证 | 探究谷氨酰胺和谷氨酸如何影响新生儿肠道炎症及其机制 | 新生儿大鼠NEC模型、骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）、回肠巨噬细胞 | NA | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 722 | 2026-01-23 |
In vitro models to mimic tumor endothelial cell-mediated immune cell reprogramming in lung adenocarcinoma
2025-Nov-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03576-4
PMID:41310721
|
研究论文 | 本研究通过体外模型探究了非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞如何调节免疫细胞，揭示了其在肿瘤微环境免疫抑制中的作用 | 利用2D和3D共培养模型结合单细胞RNA测序技术，首次在非小细胞肺癌中系统揭示了肿瘤内皮细胞的异质性及其通过MIF信号促进M2样巨噬细胞极化的机制 | 研究主要基于体外模型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 探究非小细胞肺癌中肿瘤内皮细胞对免疫细胞的重编程作用及其机制 | 非小细胞肺癌细胞、正常内皮细胞、免疫细胞（CD4 T细胞、CD8 T细胞、巨噬细胞） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组、蛋白质组、激酶组数据 | 多种非小细胞肺癌细胞系及患者来源的肿瘤内皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 723 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the heterogeneity and functional characteristics of macrophage subpopulations in colon cancer
2025-Nov-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04002-z
PMID:41276730
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了结肠癌中巨噬细胞亚群的异质性和功能特征，并重点探讨了SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 首次在结肠癌中利用单细胞RNA测序技术系统鉴定出五个巨噬细胞亚型，并发现Macrophages_SPP1亚型在肿瘤中显著富集，具有独特的代谢和免疫抑制功能，同时通过计算机模拟SPP1敲除揭示了其在免疫抑制肿瘤微环境形成中的关键作用 | 研究仅基于三名结肠癌患者的样本，样本量较小，且为观察性研究，缺乏体内实验验证 | 探究结肠癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其功能特征，特别是SPP1在巨噬细胞亚型中的作用 | 结肠癌患者的肿瘤组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三名结肠癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 724 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptome atlas of adult male and female human hookworm Ancylostoma ceylanicum
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113846
PMID:41362773
|
研究论文 | 本研究构建了成年雄性和雌性锡兰钩虫的单细胞转录组图谱，揭示了性别特异性基因表达和细胞多样性 | 首次提供了锡兰钩虫的全面单细胞转录组图谱，揭示了性别间细胞类型差异和新的分子标记 | 未提及样本数量或技术重复的详细信息，可能限制统计分析的稳健性 | 推进对钩虫生物学的基本理解，为开发新的治疗或疫苗靶点提供基础 | 成年雄性和雌性锡兰钩虫（Ancylostoma ceylanicum） | 单细胞组学 | 钩虫病 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，RNA荧光原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 725 | 2026-01-23 |
Spatial transcriptomics in bone research: navigating hype and hurdles
2025-Nov-13, Pathology
IF:3.6Q1
DOI:10.1016/j.pathol.2025.10.003
PMID:41475999
|
综述 | 本文综述了空间转录组学在骨骼研究中的应用，探讨了其技术优势、组织处理挑战、平台限制及未来方向 | 系统总结了空间转录组学在骨骼研究中的独特应用挑战，如骨组织脱钙问题，并整合了平台比较与生物信息学分析考量 | 未提出具体的新实验数据或技术解决方案，主要基于现有文献综述，缺乏对新兴平台如Visium FFPE在骨骼中应用的深入评估 | 评估空间转录组学技术在骨骼研究中的适用性、挑战及未来潜力 | 骨骼组织样本、动物模型及肌肉骨骼系统 | 空间转录组学 | 肌肉骨骼疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达空间数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 726 | 2026-01-23 |
Gsx2 Regulates Oligodendrocyte Precursor Formation in the Zebrafish Spinal Cord
2025-Oct-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.18.683250
PMID:41279990
|
研究论文 | 本研究利用斑马鱼模型，通过单细胞RNA测序和单核ATAC测序数据，揭示了Gsx2在调控脊髓中少突胶质前体细胞形成时间中的作用 | 首次在斑马鱼脊髓中识别出pre-OPCs亚群，并发现Gsx2通过调控基因网络影响OPC形成的时机，而非分化过程 | 研究主要基于斑马鱼模型，结果在哺乳动物中的普适性需进一步验证，且基因调控网络的具体机制尚未完全阐明 | 探究脊髓神经前体细胞向少突胶质细胞谱系分化的分子机制，特别是Gsx2在OPC形成中的功能 | 斑马鱼脊髓中的神经前体细胞、pre-OPCs、少突胶质前体细胞及少突胶质细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单核ATAC测序, CRISPR/Cas9基因组编辑 | NA | 单细胞转录组数据, 单核染色质可及性数据 | 斑马鱼胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核ATAC-seq | NA | NA |
| 727 | 2026-01-23 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术解码HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的应激状态 | 采用TempO-LINC平台生成单细胞转录组图谱，系统分析多种应激反应通路，并利用文献来源的基因特征对单个细胞进行评分和聚类，揭示细胞应激状态的动态变化 | 研究仅针对HepaRG细胞系，未涉及其他细胞类型或体内模型，且化学暴露时间固定为24小时，可能未捕捉到更早期或更晚期的应激响应 | 解码细胞在毒理学相关化学物质暴露下的应激状态，以理解细胞适应性反应与终末结局之间的转换 | HepaRG细胞（人类肝细胞系） | 单细胞转录组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序（SCTr） | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞，暴露于7种化学物质（依托泊苷、布雷菲德菌素A、环己酰亚胺、鱼藤酮、tBHQ、曲格列酮、衣霉素）的三种浓度下24小时 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱 |
| 728 | 2026-01-23 |
Segger: Fast and accurate cell segmentation of imaging-based spatial transcriptomics data
2025-Mar-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643160
PMID:40161614
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为segger的快速准确细胞分割方法，用于成像空间转录组学数据 | 提出了一种基于异构图表示和图神经网络的细胞分割方法，将细胞分割视为转录本到细胞的链接预测任务，并利用单细胞RNA-seq信息改进转录本分配 | NA | 解决成像空间转录组学中转录本准确分配到细胞的问题 | 成像空间转录组学数据 | 计算机视觉 | NA | 成像空间转录组学 | 图神经网络 | 图像 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | NA |
| 729 | 2026-01-23 |
Novel Meningoencephalomyelitis Associated With Vimentin IgG Autoantibodies
2025-Mar-01, JAMA neurology
IF:20.4Q1
DOI:10.1001/jamaneurol.2024.4763
PMID:39836414
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种与波形蛋白IgG自身抗体相关的新型脑膜脑脊髓炎综合征 | 首次发现并描述了靶向星形胶质细胞中间丝蛋白波形蛋白的自身抗体与一种独特的脑膜脑脊髓炎综合征的关联 | 研究为回顾性病例系列，样本量较小（14例患者），且随访时间中位数仅为23个月 | 表征一种与未知星形胶质细胞自身抗体相关的脑膜脑脊髓炎综合征 | 患有未明确中枢神经系统自身免疫性疾病且具有相似临床和影像学特征的患者 | NA | 脑膜脑脊髓炎 | 单细胞RNA测序，基于细胞的测定，基于组织的测定 | NA | RNA序列数据，临床数据，影像学数据 | 14名候选患者（其中2名索引患者进行了scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 730 | 2026-01-23 |
LST1: a novel biomarker for efferocytosis in the co-occurrence of type 2 diabetes mellitus and clear cell renal cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1737749
PMID:41488617
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，识别出LST1是2型糖尿病与肾透明细胞癌共病的关键调控基因，并验证了其在巨噬细胞介导的胞葬作用及免疫调控中的核心作用 | 首次发现LST1作为T2DM与ccRCC共病的关键调控因子，揭示了其在连接两种疾病的免疫调控通路中的新作用，为研究糖尿病与恶性肿瘤共存的免疫机制提供了新框架 | 研究主要基于公共数据库的单细胞转录组数据，虽然进行了体内外验证，但样本来源和数量可能有限，且具体分子机制有待进一步深入探索 | 识别T2DM与ccRCC共病的共同分子通路和新型生物标志物 | 2型糖尿病和肾透明细胞癌的共病模型 | 生物信息学 | 肾透明细胞癌, 2型糖尿病 | 单细胞转录组测序, 机器学习算法, GSEA算法, 体内外实验验证 | 机器学习算法（未指定具体模型） | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 731 | 2026-01-23 |
High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680437
PMID:41488614
|
研究论文 | 本研究利用10x Genomics平台和canFam4基因组，构建了健康小型犬外周血白细胞的单细胞转录组图谱，揭示了新的免疫亚群和检查点程序 | 首次使用canFam4基因组进行高分辨率单细胞RNA测序，在健康犬中识别出51个独特的免疫亚群，包括在canFam3.1研究中未被充分代表的细胞类型，并揭示了免疫检查点机制 | 研究仅基于六只健康小型犬，样本量有限，可能无法完全代表所有犬种或健康状况 | 旨在通过单细胞RNA测序高分辨率解析健康犬的免疫异质性，并识别新的免疫亚群和功能特征 | 六只健康小型犬的外周血白细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 六只健康小型犬 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics平台用于单细胞RNA测序 |
| 732 | 2026-01-23 |
scVAR: integrating genomics and transcriptomics from single-cell RNA-seq -insights from leukemia case studies
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1604484
PMID:41555915
|
研究论文 | 本文介绍了scVAR，一种利用变分自编码器从单细胞RNA测序数据中学习和整合遗传变异的计算框架，应用于白血病案例研究 | 开发了基于交叉注意力融合层的编码器-解码器架构，将转录组和变异信息整合到统一潜在表示中，增强了在噪声和稀疏条件下检测细微细胞差异的能力 | 由于使用3' scRNA-seq，变异检测仅限于捕获区域 | 整合单细胞RNA测序中的基因组和转录组信息，以更好地表征细胞状态和疾病过程 | 急性髓系白血病（AML）和急性淋巴细胞白血病（ALL） | 机器学习 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 变分自编码器（VAE） | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 733 | 2026-01-23 |
Correction: High-resolution single-cell RNA sequencing using canFam4 reveals novel immune subsets and checkpoint programs in healthy dogs
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1773404
PMID:41567218
|
correction | 本文是对先前发表的一篇关于使用canFam4进行高分辨率单细胞RNA测序以揭示健康犬类新型免疫亚群和检查点程序的研究文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 734 | 2026-01-23 |
Inflammation and mechanical force-induced bone remodeling
2024-Dec-30, Periodontology 2000
IF:17.5Q1
DOI:10.1111/prd.12619
PMID:39740162
|
综述 | 本文综述了炎症和机械力诱导的骨重塑过程，重点关注牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞作用 | 利用单细胞RNA测序技术的新进展，深入探讨了不同细胞类型在炎症和机械力驱动的骨重塑中的作用和相互作用，并分析了这两种条件（慢性炎症与急性瞬时炎症）的联合效应 | NA | 探讨炎症和机械力在骨重塑中的作用机制，特别是在牙周炎和正畸牙齿移动中的细胞和分子基础 | 宿主免疫细胞（角质形成细胞、白细胞、基质细胞、骨细胞、成骨细胞、破骨细胞）及其在骨重塑中的功能 | NA | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 735 | 2026-01-23 |
Neuron-glia crosstalk and inflammatory mediators in migraine pathophysiology
2024-11-12, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
综述 | 本文综述了偏头痛病理生理学中神经胶质细胞相互作用和炎症介质的作用机制 | 整合了细胞和分子层面的神经炎症机制，并强调了如PBR28靶向成像和单细胞测序等新技术在理解偏头痛神经炎症中的突破性应用 | 作为一篇综述文章，未进行原始研究，主要基于现有文献总结，可能未涵盖所有最新进展 | 概述偏头痛中神经炎症的机制，并探讨其治疗靶点 | 偏头痛的神经炎症过程，涉及中枢和外周神经系统的胶质细胞及炎症介质 | 神经科学 | 偏头痛 | 单细胞测序，靶向成像 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 736 | 2026-01-23 |
Bacterial phenotypic heterogeneity through the lens of single-cell RNA sequencing
2024 Feb-Apr, Transcription
DOI:10.1080/21541264.2024.2334110
PMID:38532542
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在研究细菌表型异质性方面的应用与前景 | 将单细胞转录组学技术应用于微生物群体，为研究细胞分化和细菌生态学提供了新的视角 | 作为一篇综述文章，未涉及具体实验数据或方法验证 | 探讨细菌转录异质性及其在微生物系统中的作用 | 细菌群体及其转录异质性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 737 | 2026-01-22 |
Construction of biomimetic gradient-structured cartilage organoids and mechanistic study of their application for cartilage rejuvenation
2026-May, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.12.052
PMID:41551764
|
研究论文 | 本研究开发了一种仿生梯度结构软骨类器官培养系统，用于诱导衰老软骨细胞的年轻化，并探索其在软骨再生中的应用机制 | 利用过表达SOX9的骨髓干细胞来源的细胞外囊泡与脱细胞软骨基质构建仿生梯度结构软骨类器官，结合单细胞测序揭示软骨细胞年轻化亚群，并构建体外骨关节炎芯片模型模拟机械微环境 | NA | 研究软骨类器官的构建及其在软骨年轻化和再生中的应用机制 | 衰老软骨细胞、骨髓干细胞、软骨类器官 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 738 | 2026-01-22 |
Engineered atopic dermatitis models for recreating hypoxic conditions in atopic dermatitis microenvironments
2026-May, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.12.045
PMID:41551767
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于明胶可交联水凝胶的工程化特应性皮炎模型，用于模拟AD微环境中的缺氧条件 | 利用单细胞RNA测序分析患者数据指导模型设计，首次在工程化AD模型中成功再现了缺氧微环境（O<5%）并整合了免疫刺激 | 模型基于工程化水凝胶构建，可能无法完全模拟真实皮肤组织的复杂结构和所有细胞类型相互作用 | 开发能够密切模拟特应性皮炎特征的临床前模型，用于药物筛选和基础研究 | 特应性皮炎（AD）组织微环境 | 组织工程与疾病模型 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序分析，3D细胞培养 | 水凝胶基工程化组织模型 | 基因表达数据，细胞培养数据 | 基于公共AD患者单细胞RNA测序数据 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 739 | 2026-01-22 |
Comparative spatial whole transcriptome analysis of matched frozen and formalin-fixed paraffin-embedded colorectal cancer tissues
2026-Mar, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102413
PMID:41550505
|
研究论文 | 本研究通过空间全转录组分析比较了匹配的冷冻和福尔马林固定石蜡包埋结直肠癌组织的基因表达谱 | 首次使用空间全转录组技术系统比较FFPE、FF和SF三种组织保存方法在结直肠癌样本中的表现，揭示了不同方法在细胞形态分辨和基因表达水平上的优势 | 研究仅基于单例IV期结直肠癌患者的36个组织区域，样本量有限，需要更大规模验证 | 评估不同组织保存方法（FFPE、FF、SF）对结直肠癌空间转录组分析质量的影响 | 结直肠癌组织样本 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 空间全转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | 36个组织区域（来自1例IV期结直肠癌患者） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 740 | 2026-01-22 |
Extracellular vesicles derived from adipose-derived mesenchymal stem/stromal cells prevent synovial inflammation and attenuate cartilage degeneration in rodent osteoarthritis
2026-Mar, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.101056
PMID:41551961
|
研究论文 | 本研究探讨了脂肪来源间充质干细胞衍生的细胞外囊泡（MSC-EVs）在啮齿动物骨关节炎模型中减轻滑膜炎症和软骨退化的作用 | 首次结合单细胞RNA测序技术，在体内外系统评估MSC-EVs对骨关节炎的免疫调节和软骨保护作用，并揭示了其促进巨噬细胞向M2表型极化的新机制 | 研究仅在啮齿动物模型中进行，尚未在人体临床试验中验证；MSC-EVs的具体作用分子机制尚未完全阐明 | 评估脂肪来源MSC-EVs作为骨关节炎疾病修饰疗法的治疗潜力 | RAW264.7巨噬样细胞、人滑膜细胞、MIA诱导的骨关节炎大鼠模型 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 细胞实验（RAW264.7细胞、人滑膜细胞）和动物模型（MIA诱导OA大鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |