本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7201 | 2025-11-01 |
Kell and Kx blood group systems: an update
2025-Sep-01, Immunohematology
|
综述 | 更新自2015年以来Kell和Kx血型系统的最新研究进展,包括新发现的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性的关系 | 首次报道婴儿McLeod综合征诊断,发现大量新抗原和等位基因(截至2025年Kell系统已有38种抗原),强调分子诊断在解决血清学模糊性和神经退行性疾病诊断中的作用 | NA | 总结Kell和Kx血型系统的最新研究进展和临床应用 | Kell和Kx血型系统的抗原、等位基因及其与红细胞膜稳定性和疾病的关系 | NA | 血液系统疾病 | 单细胞测序、多组学分析、基因编辑、细胞治疗 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 7202 | 2025-10-31 |
Thymic myeloid cells are heterogenous and include a novel population of transitional dendritic cells
2026-Jan-05, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20250733
PMID:41123595
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示胸腺髓系细胞的异质性并鉴定出一种新型过渡性树突状细胞群 | 发现传统认知的DC2实际包含四个不同细胞谱系,并首次鉴定出CX3CR1+过渡性树突状细胞(tDC)这一新型细胞群 | 研究主要基于小鼠模型,人类胸腺髓系细胞的异质性仍需验证 | 解析胸腺髓系细胞的谱系身份、发育和成熟机制 | 胸腺髓系细胞(包括树突状细胞和巨噬细胞) | 单细胞生物学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组测序,谱系定义小鼠模型 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7203 | 2025-10-31 |
Pan-cancer neural regulation pattern with implications for patient stratification and immunotherapy
2025-Dec-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102732
PMID:41147013
|
研究论文 | 通过整合多组学数据系统描绘了泛癌神经调控模式及其对患者分层和免疫治疗的临床意义 | 首次系统性描绘泛癌神经-肿瘤相互作用全景图,发现神经信号与临床特征的相关性并构建神经癌症亚型分类 | 基于回顾性数据分析,需要进一步实验验证神经调控机制 | 探究神经系统与癌症相互作用的调控模式及其在免疫治疗中的临床应用价值 | 10,000+ TCGA批量转录组、239个泛癌空间转录组、115个批量检查点抑制剂治疗转录组和120,000+单细胞转录组 | 生物信息学 | 泛癌研究 | 批量转录组测序, 空间转录组学, 单细胞转录组测序 | 配体-受体相互作用网络分析 | 转录组数据, 空间转录组数据 | >10,000 TCGA样本 + 239空间样本 + 115治疗样本 + >120,000单细胞 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7204 | 2025-10-31 |
Single-Cell RNA-Seq Revealed the Immune Microenvironment Reprogramming by Dexmedetomidine Treatment in Ischemic Stroke
2025-Dec, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05237-1
PMID:40751033
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了右美托咪定通过HK2介导的小胶质细胞代谢重编程维持免疫微环境稳态,从而在缺血性脑卒中发挥神经保护作用的机制 | 首次采用多组学方法系统阐明右美托咪定通过HK2调控小胶质细胞代谢重编程维持免疫微环境稳态的神经保护机制 | 研究主要基于小鼠MCAO模型,尚未在人类临床样本中验证 | 探究右美托咪定在缺血性脑卒中中的神经保护作用机制 | 大脑中动脉闭塞模型小鼠和小胶质细胞 | 单细胞组学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, 代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | MCAO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 7205 | 2025-10-31 |
Beyond gut and neural mechanisms: A multi-organ system perspective on insecticide resistance
2025-Dec, Pesticide biochemistry and physiology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.pestbp.2025.106701
PMID:41162084
|
综述 | 本文从多器官系统视角探讨杀虫剂抗性的形成机制,突破传统孤立研究的局限 | 提出将杀虫剂抗性视为多器官协同作用的系统现象,强调器官间信号传导和补偿机制的重要性 | 在解析器官间通讯、识别组织特异性抗性标记物及开发现场诊断方法方面仍存在挑战 | 探索多器官系统在塑造杀虫剂抗性中的作用机制 | 昆虫的脂肪体代谢、循环运输、跨代效应、呼吸调节、马氏管排泄和内分泌调节等生理系统 | 系统生物学 | NA | 多组学技术、单细胞RNA测序、先进成像技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7206 | 2025-10-31 |
Caloric Restriction Substantially Improves Glucose Regulation in Mice With Hnf1a-Deficient Beta-Cells
2025-Dec, Acta physiologica (Oxford, England)
DOI:10.1111/apha.70121
PMID:41165340
|
研究论文 | 本研究探讨饮食对HNF1A突变胰岛β细胞的影响,发现热量限制显著改善Hnf1a缺陷β细胞的血糖调节 | 首次系统研究饮食因素对HNF1A-MODY疾病发生发展的影响,揭示了Hnf1a缺陷β细胞对饮食线索的高度敏感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类验证仅使用体外干细胞胰岛,样本规模有限 | 探索环境因素(特别是饮食)对HNF1A-MODY发病和进展的影响机制 | 转基因小鼠(Hnf1a突变β细胞)和人类干细胞胰岛(HNF1AP291fsinsC杂合突变) | 代谢疾病研究 | 单基因糖尿病(HNF1A-MODY) | 免疫荧光、蛋白质组学、bulk转录组学、单细胞转录组学 | 转基因小鼠模型、干细胞胰岛模型 | 生理测试数据、蛋白质组数据、转录组数据 | 转基因小鼠暴露于四种不同饮食方案,人类干细胞胰岛及其同基因对照 | NA | 单细胞转录组学, bulk转录组学, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 7207 | 2025-10-31 |
Eupatilin ameliorates spinal cord injury by inhibiting damage-associated microglia and optimizing the regenerative microenvironment
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113687
PMID:41146716
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现损伤相关小胶质细胞在急性脊髓损伤中的关键作用,并证实黄岑素能促进其向稳态小胶质细胞转化 | 首次通过整合单细胞RNA测序和微阵列数据识别急性脊髓损伤特异性损伤相关小胶质细胞亚群,并发现黄岑素促进其向有益表型转化的新功能 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型,尚未在更大型动物或临床样本中验证 | 探索脊髓损伤中小胶质细胞的动态变化及黄岑素的治疗机制 | C57BL/6小鼠脊髓挫伤模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序, 微阵列分析, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7208 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA sequencing reveals the ameliorative effects of Kai-Xin-San on depression via regulating neuroplasticity and inflammation in the hypothalamus of rats
2025-Nov-10, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示开心散通过调节下丘脑神经可塑性和炎症改善大鼠抑郁的分子机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术系统阐明开心散通过抑制前驱活性、恢复星形胶质细胞线粒体代谢和重塑神经-星形胶质细胞相互作用网络来增强突触可塑性的抗抑郁机制 | 研究仅针对大鼠下丘脑区域,未涉及其他脑区;样本数量相对有限 | 探究开心散改善抑郁症状的分子机制 | 慢性不可预见轻度应激诱导的抑郁模型大鼠 | 单细胞转录组学 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,行为学实验,分子生物学实验 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,行为学数据 | 45,482个下丘脑细胞,来自对照组、CUMS模型组、开心散治疗组和氟西汀治疗组大鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7209 | 2025-10-31 |
CRISPLD2, a novel insulin-sensitizing adipokine that alters adipocyte size
2025-Nov, Obesity (Silver Spring, Md.)
DOI:10.1002/oby.24342
PMID:40855979
|
研究论文 | 本研究探讨新型脂肪因子CRISPLD2在调节脂肪组织纤维化和改善胰岛素敏感性方面的功能 | 首次发现CRISPLD2能够改变脂肪细胞大小并改善胰岛素敏感性,同时揭示其通过调节胶原转录和纤维化发挥作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床意义尚需进一步验证 | 探索CRISPLD2脂肪因子在脂肪组织结构和功能调节中的作用机制 | 脂肪特异性过表达CRISPLD2的小鼠模型和3T3-L1脂肪细胞 | 分子生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, 质谱分析, transwell实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质互作数据 | 脂肪特异性CRISPLD2过表达小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7210 | 2025-10-31 |
Targeting MAT2A synergistically induces DNA damage in osteosarcoma cells through EZH2-mediated H3K27me3 modification
2025-Nov, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.09.007
PMID:41146859
|
研究论文 | 本研究通过靶向MAT2A与EZH2抑制联合治疗,协同诱导骨肉瘤细胞DNA损伤并抑制肿瘤生长 | 首次发现MAT2A抑制与EZH2抑制在骨肉瘤治疗中的协同作用机制,通过代谢与表观遗传双重干预策略 | NA | 探索代谢与表观遗传联合干预在骨肉瘤治疗中的潜在价值 | 骨肉瘤细胞 | 单细胞测序 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序,高通量化合物筛选 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 7211 | 2025-10-31 |
Single-cell RNA profiling of blood CD4+ T cells identifies distinct helper and dysfunctional regulatory clusters in children with SLE
2025-Nov, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02297-2
PMID:41120754
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿童系统性红斑狼疮患者血液CD4⁺ T细胞的异质性 | 首次在儿童SLE患者中通过单细胞RNA测序识别出独特的辅助性T细胞和功能失调调节性T细胞亚群,并发现TLR5和FCRL3在SLE初始T细胞中的上调 | 研究样本仅限于儿童患者,未包含成人队列;样本量相对有限 | 表征系统性红斑狼疮患者CD4⁺ T细胞区室的复杂性 | 儿童系统性红斑狼疮患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | 单细胞组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童SLE患者和健康供体的血液CD4⁺ T细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7212 | 2025-10-31 |
Mapping disease-specific vascular cell populations responsible for obliterative arterial remodelling during the development of pulmonary arterial hypertension
2025-Oct-28, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf146
PMID:40875786
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别肺动脉高压发展中导致闭塞性动脉重构的疾病特异性血管细胞群 | 首次在肺动脉高压模型中通过多时间点单细胞转录组分析鉴定出两种疾病特异性内皮细胞群,并发现TM4SF1作为动脉重构的新治疗靶点 | 研究基于动物模型,在人类患者中的验证仍需进一步研究 | 阐明肺动脉高压发展中闭塞性动脉病变形成的细胞机制 | 肺动脉高压大鼠模型和PAH患者的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,RNA velocity分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个时间点的肺动脉高压模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7213 | 2025-10-31 |
Changes in neural progenitor lineage composition during astrocytic differentiation of human iPSCs
2025-Oct-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96423
PMID:41150379
|
研究论文 | 本研究通过追踪人类iPSCs分化为星形胶质细胞的过程,揭示了神经祖细胞谱系组成的变化及其对星形胶质细胞区域特性的影响 | 首次证明iPSCs衍生的星形胶质细胞谱系组成不能准确反映原始祖细胞群体,并识别了LMX1A祖细胞来源星形胶质细胞的独特转录组特征 | 研究仅聚焦于LMX1A腹侧中脑祖细胞,未涵盖其他脑区祖细胞类型 | 探究人类iPSCs分化为星形胶质细胞过程中神经祖细胞谱系组成的变化规律 | 人类诱导多能干细胞(iPSCs)及其分化的神经祖细胞和星形胶质细胞 | 干细胞生物学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,细胞谱系追踪 | 人类iPSCs分化模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 深度单细胞RNA测序 |
| 7214 | 2025-10-31 |
TBXAS1 deficiency causes autoinflammation responsive to IL-6 inhibitor
2025-Oct-28, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.09.014
PMID:41162285
|
研究论文 | 本研究揭示了TBXAS1缺陷通过花生四烯酸代谢异常导致自身炎症的新机制,并证实IL-6抑制剂治疗的有效性 | 首次发现TBXAS1缺陷通过PGE2-EP2/cAMP/CREB通路诱导IL-6表达引发自身炎症,并成功应用IL-6抑制剂治疗 | 研究仅纳入2例患者,样本量较小 | 探索TBXAS1缺陷引起自身炎症的分子机制并研究靶向治疗策略 | 2例TBXAS1缺陷患者及其外周血单个核细胞 | NA | Ghosal血骨发育不良 | 全外显子组测序, Sanger测序, qRT-PCR, Western blotting, 细胞因子珠阵列, ELISA, 质谱分析, 飞行时间流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 蛋白质数据, 代谢物数据, 单细胞转录组数据 | 2例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7215 | 2025-10-31 |
Multi-omics profiling uncovers paradoxical Epstein-Barr virus involvement in autoimmune liver disease pathogenesis
2025-Oct-27, AMB Express
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s13568-025-01975-6
PMID:41144108
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示EB病毒在自身免疫性肝病发病机制中的复杂作用 | 首次提供EB病毒与自身免疫性肝病关联的遗传学证据,发现EB病毒在疾病中可能扮演双重角色 | 基于观察性研究和数据库分析,因果关系仍需进一步验证 | 探究EB病毒与自身免疫性肝病之间的因果关系和分子机制 | 自身免疫性肝病患者群体和EB病毒相关抗体 | 生物信息学 | 自身免疫性肝病 | 双样本孟德尔随机化分析,GSMR,GWAS,转录组分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞测序数据 | 基于FinnGen数据库的GWAS汇总统计数据 | NA | 单细胞RNA测序,全基因组关联分析 | NA | NA |
| 7216 | 2025-10-31 |
Deciphering splicing heterogeneity at single-cell resolution by SCSES
2025-Oct-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64517-5
PMID:41145486
|
研究论文 | 开发了一种名为SCSES的计算框架,用于在单细胞水平增强选择性剪接分析 | 通过数据扩散在相似细胞和事件间共享信息来推断和补全缺失的剪接变化 | 未在摘要中明确说明 | 解决单细胞RNA测序中准确表征剪接变化的挑战 | 单细胞剪接异质性 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 数据扩散算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7217 | 2025-10-31 |
Hmox1 expression indicates distinct injury phenotypes of proximal tubule cells in sepsis-associated acute kidney injury
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05764-w
PMID:41145479
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,鉴定Hmox1作为脓毒症相关急性肾损伤中近端小管细胞损伤的特异性生物标志物 | 首次发现Hmox1高表达和低表达的近端小管细胞亚群在SAKI中表现出不同的表型特征 | NA | 识别SAKI诊断的特异性生物标志物并阐明其病理机制 | 肾组织中的近端小管细胞 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7218 | 2025-10-31 |
SPP1+ macrophages promote colorectal cancer progression by activating JAK2/STAT3 signaling pathway
2025-Oct-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-21420-9
PMID:41145614
|
研究论文 | 本研究揭示SPP1+巨噬细胞通过激活JAK2/STAT3信号通路促进结直肠癌进展的机制 | 首次发现SPP1+肿瘤相关巨噬细胞的极性改变通过JAK2/STAT3通路调控结直肠癌进展 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,需要进一步临床验证 | 探索肿瘤相关巨噬细胞极性改变对结直肠癌进展的影响及分子机制 | 结直肠癌细胞(MC38)和肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 流式细胞分选, 细胞共培养, CCK-8检测, TUNEL染色, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | 小鼠结直肠癌模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7219 | 2025-10-31 |
Intratumoral plasma cells predict patient prognosis and responsiveness to neoadjuvant immunotherapy in advanced gastric cancer
2025-Oct-27, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01071-9
PMID:41145683
|
研究论文 | 本研究通过多中心数据整合分析,开发了基于肿瘤内浆细胞的MZB1阳性评分系统,用于预测晚期胃癌患者对免疫治疗的预后和反应性 | 首次发现成熟三级淋巴结构是胃癌浸润浆细胞中体细胞超突变和克隆选择的关键位点,并建立了基于浆细胞浸润程度的MZB1阳性评分系统 | 研究依赖于胃镜活检组织,存在组织样本大小的固有局限性 | 开发新的生物标志物来预测胃癌患者对免疫治疗的反应和预后 | 晚期胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,转录组测序 | NA | 组织样本,转录组数据,空间转录组数据 | 来自七个独立医疗中心的胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 7220 | 2025-10-31 |
KIAA1429-mediated M6A methylation inhibits osteoclast differentiation via stabilizing Lrp4 mRNA and protects against osteoporosis
2025-Oct-27, Cellular & molecular biology letters
IF:9.2Q1
DOI:10.1186/s11658-025-00800-z
PMID:41146006
|
研究论文 | 本研究探讨KIAA1429介导的m6A甲基化通过稳定Lrp4 mRNA抑制破骨细胞分化并预防骨质疏松的机制 | 首次揭示KIAA1429通过m6A-YTHDC1-LRP4-TNFAIP3轴抑制NF-κB信号通路的新机制 | 未明确说明样本规模及临床数据的具体来源 | 探究KIAA1429在骨质疏松及破骨细胞分化中的生物学功能及分子机制 | 骨质疏松患者临床样本、卵巢切除小鼠模型、破骨细胞 | 表观遗传学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, m6A甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |