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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-06-05 |
Cutting-Edge Technologies to Decode Tumor Microenvironment in Multiple Myeloma
2026-Mar, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.70171
PMID:41655245
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综述 | 综述了用于解码多发性骨髓瘤肿瘤微环境的前沿技术,包括单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术和先进成像技术 | 系统总结了多种新兴技术(单细胞组学、空间转录组学、质谱流式细胞术、人工智能)在解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的整合应用,强调了从空间异质性到精准医学转化的创新路径 | 技术复杂性高、资源需求大、缺乏标准化流程,限制了直接临床应用 | 综述新兴技术如何整合应用以解码多发性骨髓瘤肿瘤微环境生物学,推动精准医学发展 | 多发性骨髓瘤肿瘤微环境中的肿瘤细胞和免疫细胞相互作用及其空间异质性 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞组学, 空间转录组学, 质谱流式细胞术, 先进成像 | NA | 图像, 文本, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 702 | 2026-06-05 |
Integrating single-cell and spatial transcriptomics to dissect mast-cell heterogeneity and arginine-metabolism-associated markers in BRCA
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101281
PMID:41655499
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组学解析乳腺癌中肥大细胞的异质性与精氨酸代谢相关标志物 | 首次通过精氨酸代谢评分将肥大细胞分为高活性(HAS)和低活性(LAS)亚群,并揭示ASL高表达的肥大细胞在TNBC中的代谢重塑和通讯增强特性 | 未详细说明样本来源和实验验证的细胞系类型,缺乏体内动物模型验证 | 解析乳腺癌中肥大细胞的异质性和功能特化,特别是精氨酸代谢在塑造肿瘤微环境中的作用 | 乳腺癌中肥大细胞及其亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,Lasso-Cox回归 | Lasso-Cox, Monocle2, CellChat, hdWGCNA, MiloR | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据,批量基因表达数据 | 272,592个细胞(来自GSE161529)和空间转录组(GSE243022),TCGA和GSE42568批量数据 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,批量RNA-seq | NA | NA |
| 703 | 2026-06-05 |
Tumoroid model recreates clinically relevant phenotypes of high grade serous ovarian cancer cells, carcinoma associated fibroblasts, and macrophages
2026-Mar, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2026.02.005
PMID:41655669
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research paper | 本研究开发了一种三维异质性三组分肿瘤类器官模型,模拟高级别浆液性卵巢癌的肿瘤微环境,包括癌细胞、癌相关成纤维细胞和巨噬细胞,并验证了其在化疗耐药、癌症干细胞富集、迁移和侵袭等方面的临床相关表型 | 首次构建可调控的三组分肿瘤类器官模型,整合了间充质干细胞和巨噬细胞,能够更真实地重现肿瘤异质性细胞间的相互作用,并支持高通量药物筛选 | 未明确提及局限性,但模型可能无法完全再现体内复杂微环境的所有方面,且仅使用了有限数量的细胞系和原代细胞 | 探索卵巢癌肿瘤微环境中细胞间信号传导对临床表型的影响,并建立可用于靶向治疗前临床测试的体外模型 | 高级别浆液性卵巢癌的肿瘤微环境,包括癌细胞、癌相关成纤维细胞和巨噬细胞 | digital pathology | ovarian cancer | scRNA-seq | tumoroid | 基因表达数据 | 使用OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8细胞系,原代间充质干细胞和U937衍生的M2样巨噬细胞;具体样本量未明确说明 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 704 | 2026-06-05 |
The Poly(rC) binding protein 2 is required for spermatogenesis by regulating alternative splicing and mRNA stability
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150796
PMID:41655928
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据,发现PCBP2在非梗阻性无精子症患者睾丸组织中下调,并利用小鼠模型揭示PCBP2通过调控剪接和mRNA稳定性参与精子发生 | 首次鉴定并功能验证了PCBP2在精子发生中的不可或缺作用,揭示了其通过招募hnRNPU和DDX5调控减数分裂和精子形成相关基因的mRNA稳定性和选择性剪接的新机制 | 未详细说明PCBP2在其他类型男性不育中的潜在作用,以及从动物模型到人类治疗的直接转化挑战 | 探究多聚rC结合蛋白2在精子发生中的功能及其在非梗阻性无精子症中的作用机制 | 非梗阻性无精子症患者睾丸组织样本、PCBP2条件敲除小鼠模型 | 自然语言处理,机器学习 | 男性不育 | NGS, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, RIP-seq, 免疫沉淀-质谱联用 | NA | 图像,文本 | 患者睾丸组织样本(具体数量未提供)、小鼠模型(PCBP2条件敲除小鼠) | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2026-06-05 |
The proliferative Scissor+ gene signature model uncovers the ISG15-KPNA2 axis as a critical driver of malignancy in ccRCC
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150812
PMID:41663022
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示增殖性Scissor+基因特征模型及ISG15-KPNA2轴在透明细胞肾细胞癌恶性进展中的关键作用 | 首次利用Scissor算法从单细胞RNA-seq数据中识别增殖性Scissor+细胞,构建11基因预后模型,并发现ISG15通过泛素-蛋白酶体途径调控KPNA2稳定性促进肿瘤恶性表型 | 未明确说明局限性 | 探究透明细胞肾细胞癌中增殖性细胞亚群的转录特征及其临床相关性,并揭示关键调控机制 | 透明细胞肾细胞癌患者样本(包括单细胞RNA-seq数据和批量转录组数据)及ccRCC细胞系 | 机器学习和数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组测序、Scissor算法、机器学习、免疫共沉淀、免疫荧光、泛素化检测 | Lasso+plsRcox | 单细胞转录组数据和批量转录组数据(基因表达数据) | 多个队列数据(GSE156632、TCGA-KIRC、EMTAB1980、CPTAC) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 706 | 2026-06-05 |
Sarcoidosis: Disease mechanisms, diagnostic pathway and treatment
2026-Mar, Autoimmunity reviews
IF:9.2Q1
DOI:10.1016/j.autrev.2026.103993
PMID:41651390
|
综述 | 本文综述了结节病的发病机制、诊断途径和治疗方法 | 纳入了单细胞RNA测序和空间转录组学的最新研究成果,并提出了JAK抑制剂和mTOR抑制剂作为潜在治疗新方案 | 结节病罕见性、临床病程异质性及缺乏预后生物标志物,增加了临床试验设计与实施的难度 | 总结结节病的疾病机制、诊断挑战和现有及新兴治疗策略 | 结节病患者 | 数字病理学 | 结节病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间转录组学 |
| 707 | 2026-06-05 |
Tamoxifen promotes metastasis of breast cancer via reshaping lipid-driven fibrotic microenvironments in the lung
2026-Mar, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2026.101286
PMID:41666535
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研究论文 | 研究他莫昔芬通过重塑脂质驱动的肺部纤维化微环境促进乳腺癌转移的机制 | 首次揭示长期他莫昔芬治疗通过诱导肺部脂质积累和PRG4+巨噬细胞扩增,促进纤维化微环境形成,从而增加乳腺癌肺转移风险,并发现脂肪酸合酶抑制剂C75可逆转该过程 | 未明确他莫昔芬导致肺部脂质积累的具体分子机制,且动物模型与人类临床的差异可能影响结论的普适性 | 探究长期他莫昔芬治疗对雌激素受体阳性乳腺癌转移微环境形成的影响 | PyMT和4T1同种移植小鼠模型中的乳腺癌肺转移 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PyMT和4T1同种移植小鼠模型(具体样本数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 708 | 2026-06-05 |
Osteoarthritis and chondrosarcoma: Bioinformatics analysis based on single-cell RNA sequencing and molecular docking
2026-Mar, Advances in clinical and experimental medicine : official organ Wroclaw Medical University
IF:2.1Q3
DOI:10.17219/acem/205134
PMID:41669898
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序和分子对接技术,分析骨关节炎与软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制,并识别潜在治疗靶点 | 首次将单细胞RNA测序与分子对接技术联合应用于骨关节炎和软骨肉瘤的比较研究,揭示了两类关节致残疾病在细胞亚群分布和基因表达谱上的差异,并发现姜黄素和白藜芦醇与DAP3蛋白的结合潜力 | 研究基于公开数据集,可能受原始数据质量和样本数量的限制;分子对接结果需进一步实验验证 | 探究骨关节炎和软骨肉瘤的细胞异质性和分子机制,识别潜在治疗靶点 | 骨关节炎和软骨肉瘤的公开单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | 骨关节炎, 软骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 蛋白质结构数据 | 公开数据集,具体数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 709 | 2026-06-05 |
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Mar, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-026-01833-8
PMID:41670928
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研究论文 | 分析FGFR4和HER2共表达在HR+乳腺癌中与促炎性肿瘤微环境的关系 | 首次揭示FGFR4与HER2共表达可预测HR+乳腺癌中免疫微环境特征,提出免疫治疗潜力 | 样本量有限(94例),缺乏功能验证实验,需进一步探索治疗策略 | 探究FGFR4过表达肿瘤的分子特征,为HR+乳腺癌提供潜在治疗策略 | 53例HR+和41例HR-乳腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | DNA测序(AmoyDx Master Panel), 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据(基因表达谱), 单细胞RNA测序数据 | 94例患者(PUMCH队列),TCGA数据库和单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | AmoyDx Master Panel | AmoyDx Master Panel用于基因表达谱分析,单细胞RNA-seq数据用于验证 |
| 710 | 2026-06-05 |
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2026.01.005
PMID:41672640
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析阿尔波特综合征小鼠模型,发现Tnfsf15早期上调具有保护肾脏损伤的作用 | 首次在疾病发生前通过单细胞测序识别Tnfsf15的上调,并验证其保护作用 | 仅使用小鼠模型,缺乏人体样本验证;未明确Tnfsf15保护机制的具体分子通路 | 探究阿尔波特综合征早期分子变化及Tnfsf15对肾小球损伤的影响 | Col4a5 G5X阿尔波特小鼠模型 | 机器学习和基因组学 | 肾脏疾病(阿尔波特综合征) | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型(Col4a5 G5X) | 单细胞转录组数据 | 5周龄和8周龄小鼠肾小球样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 711 | 2026-06-05 |
A brain-gut excitatory peptide/CCHamide homolog regulates satiation and motivational state transitions in the Aplysia feeding circuit
2026-Mar, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2026.111257
PMID:41654135
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研究论文 | 本研究在海洋软体动物海兔中鉴定了脑-肠兴奋性肽/CCHamide同源物(apEP/CCHa),并揭示了其作为饱腹信号通过调节进食中枢模式发生器神经元来调控饱腹感和动机状态转换的机制 | 首次在软体动物中系统阐明EP/CCHa信号通路对进食回路的调节机制,发现两个进化上独立的受体亚型,并通过单细胞RNA测序精确定位到特定中枢模式发生器神经元 | 未能在其他软体动物或节肢动物中进行交叉验证,且对两个受体功能差异的具体机制探索有限 | 探究脑-肠肽EP/CCHa如何调控进食回路中的饱腹感和动机状态转换 | 海洋软体动物海兔(Aplysia)的进食回路 | 神经科学 | NA | 质谱分析、原位杂交、免疫组织化学、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、神经元活动数据 | 海兔标本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 712 | 2026-06-05 |
CEMUSA: a graph-based integrative metric for evaluating clusters in spatial transcriptomics
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag056
PMID:41663910
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研究论文 | 提出了一种基于图论的综合性空间聚类评估指标CEMUSA,用于解决现有评估指标仅关注标签一致性或空间组织而导致的偏倚问题 | 首次将标签一致性、空间组织和错误严重性三个因素整合到一个统一评估框架中,并通过图论方法实现 | 文中未明确提及局限性 | 开发一种能够同时考虑标签一致性、空间组织和错误严重性的有效指标,以评估空间转录组学中的聚类结果 | 空间转录组学数据中的聚类结果 | 机器学习和数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 模拟和真实数据集,具体数量未提及 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 713 | 2026-06-05 |
SPP1+ Macrophage-POSTN+ Fibroblast-Endothelial Triad Dictates Immunotherapy Response in Bladder Cancer
2026-Feb-28, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202504456RR
PMID:41653034
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研究论文 | 该研究整合空间转录组学、单细胞RNA测序和多重免疫荧光技术,揭示了膀胱癌免疫治疗反应中由SPP1+巨噬细胞-POSTN+成纤维细胞-内皮细胞组成的空间三联体结构及其对免疫治疗抵抗的作用机制 | 首次发现并验证了膀胱癌免疫治疗耐药的肿瘤微环境中由SPP1阳性肿瘤相关巨噬细胞、POSTN阳性癌症相关成纤维细胞和内皮细胞形成的空间三联体结构,并证实靶向SPP1可增强抗PD-1治疗效果 | 研究主要基于有限样本的观察性分析,临床前模型对SPP1抑制的效果验证尚需更大规模临床试验进一步确认 | 探究膀胱癌免疫治疗应答差异的肿瘤微环境空间结构机制,寻找克服免疫治疗耐药的新靶点 | 膀胱癌患者肿瘤组织样本及临床前模型 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 膀胱癌患者肿瘤组织样本(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium空间转录组学平台, 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 714 | 2026-06-05 |
Unveiling hidden variables in stressed bacteria
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.116966
PMID:41671084
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综述 | 揭示细菌应激反应中隐藏变量对表型异质性的预测作用 | 将看似随机的细菌应激响应重新定义为潜在确定性因素(隐藏变量)的结果,并提出通过先进技术揭示这些变量以实现预测微生物学 | 未详细讨论现有技术在识别隐藏变量时的实际局限性或潜在偏差 | 建立预测微生物学,连接单细胞微观状态与群体行为 | 细菌应激反应中的表型异质性现象 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 微流控, 机器学习 | NA | 图像, 文本, 轨迹数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序分析的10x Chromium系统 |
| 715 | 2026-06-05 |
DMC-BrainMap is an open-source, end-to-end tool for multi-feature brain mapping in different species
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101302
PMID:41666930
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研究论文 | DMC-BrainMap 是一款开源端到端工具,用于跨物种的多特征脑图谱绘制 | 提供无需编程的完整端到端流程,支持多物种、多发育阶段、多种脑解剖特征的映射与量化 | 未提及具体限制 | 为神经科学研究开发一个用户友好的开源工具,用于解剖数据的全自动处理与分析 | 小鼠、大鼠和斑马鱼的脑组织图像数据 | 计算机视觉 | NA | 组织学图像分析、染色、空间转录组学 | NA | 图像 | 涵盖小鼠、大鼠和斑马鱼的多品种样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 716 | 2026-06-05 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 提出Gloss预测模型框架,系统分析LIPSTIC与scRNA-seq联合数据中的细胞间分子交互特征 | 首次将群组套索回归应用于scRNA-seq数据,建立可解释的预测模型以量化细胞间物理交互的分子活性 | 未提及具体局限性 | 建立系统性预测框架,链接基因与通路活性至细胞间物理交互强度 | 小鼠肿瘤中的髓系-T细胞互作与病毒感染中的T细胞亚群互作 | 机器学习 | 肿瘤学 | scRNA-seq | 群组套索回归 | 单细胞转录组测序数据 | 多数据集基准测试 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2026-06-05 |
ETV2-ECSCR-mTOR pathways regulate reprogramming to the endothelial lineage
2026-Feb-23, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf075
PMID:41652899
|
研究论文 | 本研究揭示了ETV2-ECSCR-mTOR通路在重编程至内皮细胞谱系中的调控机制 | 首次发现ECSCR是ETV2的直接转录靶点,并通过mTORC1信号通路调控ETV2介导的细胞重编程速率 | 未明确提及样本量和临床转化验证 | 阐明ETV2下游靶点在调控内皮细胞重编程中的作用机制 | 小鼠胚胎体细胞和胚胎成纤维细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序、ATAC-seq、ChIP-seq、凝胶迁移实验、转录活性分析 | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、转录因子结合数据 | NA | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析ETV2过表达的胚状体分化和胚胎成纤维细胞重编程 |
| 718 | 2026-06-05 |
Spatiotemporal histogenesis of the developing human cerebellum reveals dynamic layering of Bergmann glia
2026-Feb-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2525673123
PMID:41665992
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研究论文 | 结合组织病理学分析、空间转录组学和单核RNA测序,绘制人类小脑伯格曼胶质细胞的发育图谱,揭示其时空组织动态及分子特征 | 首次揭示人类小脑伯格曼胶质细胞在11孕周出现,并发现其与浦肯野细胞形成独特的三层结构(含层间分离层),该结构可能为人类特有 | 研究主要基于组织样本的转录组分析,未进行功能验证实验 | 解析人类小脑发育过程中伯格曼胶质细胞的时空起源、分子身份及细胞谱系 | 人类小脑发育过程中的伯格曼胶质细胞及其前体细胞 | 数字病理学, 单细胞组学 | 神经发育疾病 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 组织病理学, 伪时间分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像 | 多个发育时间点的人类小脑组织样本(具体数量未提及) | 10x Genomics | 空间转录组学, 单核RNA测序 | 10x Visium, 10x Chromium | 10x Visium 空间转录组学平台, 10x Chromium 单核RNA测序平台 |
| 719 | 2026-06-05 |
TNF-⍺-mediated myeloid-instructed CD14+CD4+ T cells are associated with poor survival in lung adenocarcinoma
2026-Feb-17, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2026.102593
PMID:41666923
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研究论文 | 本文通过空间多组学分析非小细胞肺癌,发现TNF-α介导的CD14+CD4+ T细胞与患者生存率低相关 | 首次发现髓系细胞通过吞噬作用诱导形成CD14+CD4+ T细胞,并揭示TNF-α信号在此过程中的关键作用 | 未明确描述局限性 | 探究髓系驱动的免疫抑制机制,为改善肺癌免疫治疗提供新靶点 | 非小细胞肺癌组织及邻近非恶性肺组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学、空间多组学 | NA | 图像、文本 | 非小细胞肺癌患者样本(具体数量未提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 720 | 2026-06-05 |
RMzyme: regulations of RNA-modifying enzymes in humans
2026-Feb-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02568-2
PMID:41672979
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研究论文 | 通过378个多组学数据集对人类RNA修饰酶进行大规模表征,并开发了RMzyme平台 | 首次整合多组学数据(基因组学、转录组学、表观转录组学、蛋白质组学和翻译后修饰)对人类RNA修饰蛋白进行系统性大规模分析,并开发了综合性资源平台RMzyme | 未明确指出具体局限性,但可能涉及数据覆盖范围和验证的深入程度 | 系统研究人类RNA修饰酶的调控机制和功能 | 人类63种组织中的RNA修饰蛋白 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 多组学分析、非负矩阵分解 | 非负矩阵分解 | 多组学数据(基因组学、转录组学、表观转录组学、蛋白质组学、翻译后修饰) | 63种人类组织的378个多组学数据集 | NA | NA | NA | NA |