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当前共找到 38102 篇文献,本页显示第 701 - 720 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
701 2026-03-29
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-11, Nature reviews. Urology
综述 本文总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用和发现 首次系统回顾了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌中的研究,揭示了肿瘤微环境的空间异性和相互作用 目前仅针对透明细胞肾细胞癌这一亚型,且技术应用尚处于早期阶段 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的潜力和应用价值 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 数字病理学 肾细胞癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
702 2026-03-29
Gene-regulatory programs that specify age-related differences during thymocyte development
2025-Jul-22, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和染色质可及性图谱,揭示了年龄相关差异的基因调控程序 通过整合转录组和染色质可及性数据,结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序,鉴定了调控T细胞发育年龄差异的保守转录因子Zbtb20 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和测序深度 探究T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 新生和成年小鼠的胸腺细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析, CRISPR扰动 NA 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 新生和成年小鼠的胸腺细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
703 2026-03-29
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为SwarmMAP的基于群体学习(Swarm Learning)的机器学习方法,用于在单细胞测序数据中以去中心化的方式自动进行细胞类型注释 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释,实现了在无需交换原始数据的情况下进行去中心化模型训练,解决了数据隐私和可扩展性问题 摘要中未明确提及具体的研究局限性 开发一种标准化、自动化且保护隐私的跨数据集细胞类型注释方法 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞转录组数据 机器学习 NA 单细胞测序 基于Swarm Learning的机器学习模型 单细胞转录组数据 摘要中未提供具体样本数量,涉及多个数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
704 2026-03-29
KLF4 in smooth muscle cell-derived progenitor cells is essential for angiotensin II-induced cardiac inflammation and fibrosis
2024-Jun-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中向肌成纤维细胞分化的轨迹,并发现转录因子KLF4在此过程中的关键作用 通过单细胞RNA测序和空间转录组学方法,首次阐明了冠状动脉相关AdvSca1-SM细胞在心脏纤维化中的促纤维化分化轨迹,并发现KLF4的双重功能 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;KLF4调控AdvSca1-SM表型的具体分子机制仍需进一步探索 探究AdvSca1-SM细胞在血管紧张素II诱导的心脏纤维化中的作用及KLF4的调控机制 小鼠血管平滑肌细胞来源的AdvSca1-SM细胞及人类心脏肥厚组织 心血管疾病 心血管疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 谱系追踪, RNA测序 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
705 2026-03-29
Generation and Downstream Analysis of Single-Cell and Single-Nuclei Transcriptomes in Brain Organoids
2024-03-29, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提供了一个关于在脑类器官中生成和分析单细胞及单核转录组的逐步实验指南 通过结合单细胞和单核转录组学方法,克服了难以分离细胞类型的限制,使单个细胞的转录组分析在脑类器官研究中普遍适用 NA 为脑类器官研究提供单细胞和单核转录组学的实验流程,以促进对大脑发育的细胞过程和分子机制的全面研究 脑类器官 数字病理学 NA 单细胞转录组学,单核转录组学,RNA-seq NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq NA NA
706 2026-03-29
Spatial High-resolution Analysis of Gene Expression Levels in Tendons
2024-03-08, Journal of visualized experiments : JoVE
方法论文 本文综述了肌腱组织中空间高分辨率基因表达水平的分析方法,重点关注新型原位杂交技术 针对富含基质的肌腱组织,提出了单细胞水平的空间转录组学分析方法,解决了低细胞数、低RNA含量和高基质背景的挑战 NA 开发并优化肌腱组织中空间基因表达水平的分析方法 肌腱组织,特别是年轻和老年动物模型及人类肌腱样本 数字病理学 NA 原位杂交,空间转录组学 NA 图像,RNA空间表达数据 NA NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
707 2026-03-29
Proteogenomic and V(D)J Analysis of Human Decidual T Cells Highlights Unique Transcriptional Programming and Clonal Distribution
2023-07-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本研究利用单细胞多组学技术分析了人类蜕膜T细胞的转录组、蛋白质组和T细胞受体库,揭示了其在母胎界面独特的转录编程和克隆分布 首次同时获取单细胞水平的转录组、有限蛋白质组和受体库数据,系统揭示了蜕膜T细胞独特的转录编程特征和克隆多样性降低现象 样本量相对有限,蛋白质检测为有限蛋白质组而非全面蛋白质组,功能验证实验不足 探究母胎界面免疫耐受机制中T细胞的角色和特性 人类蜕膜T细胞和匹配的外周血T细胞 单细胞组学 生殖免疫 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、有限蛋白质数据、T细胞受体序列数据 人类蜕膜和外周血T细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
708 2026-03-29
Preparation of noninfectious scRNAseq samples from SARS-CoV-2-infected epithelial cells
2023, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本文描述了一种从SARS-CoV-2感染细胞中制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法,使研究能在BSL2设施中安全进行 开发了一种使用甲醇-丙酮固定和灭活SARS-CoV-2的方法,使单细胞RNA测序分析能在较低生物安全级别的设施中进行,扩大了研究社区的可及性 方法仅在非洲绿猴肾上皮细胞和原代人肺上皮细胞上测试,可能不适用于所有细胞类型或病毒株,且未评估长期存储对样本质量的影响 开发一种安全制备非传染性单细胞RNA测序样本的方法,以促进SARS-CoV-2宿主反应的高通量研究 SARS-CoV-2感染的非洲绿猴肾上皮细胞(Vero-E6)和原代人肺上皮细胞 单细胞测序 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNAseq)、组织培养感染剂量测定(TCID50)、流式细胞术 NA RNA序列数据 未明确指定样本数量,但涉及两种细胞类型(Vero-E6细胞和原代人肺上皮细胞) NA 单细胞RNA测序 NA NA
709 2026-03-29
Tumors induce de novo steroid biosynthesis in T cells to evade immunity
2020-07-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文揭示了肿瘤通过诱导T细胞从头合成类固醇来逃避免疫反应的新机制 首次发现并表征了肿瘤诱导的T细胞从头类固醇合成,作为抗肿瘤免疫抑制的一种新机制,并证明抑制该通路可恢复抗肿瘤免疫力 研究主要基于小鼠模型,人类T细胞中的类似机制尚需进一步验证 探究肿瘤如何通过调控T细胞功能来逃避免疫反应 T淋巴细胞和肿瘤微环境 免疫学 癌症 单细胞转录组学 转基因小鼠模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
710 2026-03-29
Comparative analysis of single-cell transcriptomics in human and Zebrafish oocytes
2020-Jul-08, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA-seq技术比较了人类和斑马鱼卵母细胞的转录组,揭示了二者在基因表达水平上的高度一致性和功能相似性 首次直接比较人类和斑马鱼卵母细胞的单细胞转录组,发现同源基因在两者中高度表达且功能类别相似 仅基于三个单细胞RNA-seq研究进行比较,样本量有限,且未涵盖所有卵母细胞发育阶段 评估斑马鱼作为研究人类卵母细胞的有效模型生物的可行性 人类和斑马鱼的卵母细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq NA 单细胞转录组数据 斑马鱼卵母细胞单细胞RNA-seq数据及两项人类卵母细胞单细胞RNA-seq研究数据 NA 单细胞RNA-seq NA NA
711 2026-03-29
Simple Method to Quantify Protein Abundances from 1000 Cells
2020-Jun-30, ACS omega IF:3.7Q2
研究论文 本文介绍了一种从1000个哺乳动物干细胞中量化蛋白质表达水平的简化蛋白质组学工作流程 整合并优化了多项近期技术进展,实现了从极少量细胞(低至1000个)中进行蛋白质定量,无需特殊设备,仅需细胞裂解工具 方法虽已验证于小鼠胚胎干细胞和体外分化运动神经元,但在其他细胞类型或更复杂组织中的适用性可能有限 开发一种从最小输入样本中获取蛋白质组学数据的简单准确方法 小鼠胚胎干细胞、体外分化运动神经元以及荧光激活细胞分选纯化的海鞘细胞 蛋白质组学 NA 化学肽标记 NA 蛋白质表达数据 低至1000个哺乳动物干细胞 NA 蛋白质组学 NA NA
712 2026-03-28
Integrated bioinformatics analysis reveals cross-talking hub genes and therapeutic agents between sepsis and acute myocardial infarction
2026-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 本研究通过整合生物信息学分析,识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因,并探讨了其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 首次系统性地识别了脓毒症和急性心肌梗死之间的交叉核心基因(JAK2、MYD88、TIMP1),并验证了槲皮素作为潜在靶向治疗药物的结合亲和力 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏临床前或临床试验数据来证实治疗效果的体内有效性 识别脓毒症和急性心肌梗死之间的共享核心基因,并探索其作为治疗靶点和药物候选物的潜力 脓毒症和急性心肌梗死患者的基因表达数据 生物信息学 脓毒症和急性心肌梗死 RNA测序、差异表达基因分析、加权基因共表达网络分析、功能富集分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、分子对接模拟、qPCR验证 MCC/Degree算法 基因表达数据 NA NA RNA测序 NA NA
713 2026-03-28
Cell-type-specific genetic associations in Lewy body dementia identified using single-cell eQTL-based Mendelian randomization
2026-Jun, Archives of gerontology and geriatrics IF:3.5Q2
研究论文 本研究利用单细胞eQTL进行孟德尔随机化分析,识别了路易体痴呆中细胞类型特异的遗传关联 首次将单细胞转录组范围的孟德尔随机化与脑细胞类型特异性eQTL结合,揭示了ANKRD65在兴奋性神经元中表达与路易体痴呆风险的关联 研究主要基于遗传推断,需要进一步实验验证功能机制;样本分层可能影响统计效力 探索遗传变异通过细胞类型特异性机制影响路易体痴呆易感性的关联 路易体痴呆患者及对照人群的脑组织样本 生物信息学 神经退行性疾病 单细胞转录组测序,孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析 逆方差加权模型 遗传与转录组数据 基于APOE ε4携带状态分层的独立路易体痴呆队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
714 2026-03-28
Multi-omics analysis reveals AR as a potential prognostic factor and immune-related therapeutic target in gastric cancer
2026-Jun, Biochemistry and biophysics reports IF:2.3Q3
研究论文 本研究通过多组学技术全面分析了雄激素受体(AR)在胃癌中的表达、预后价值及免疫相关作用 首次系统性地分析了AR在多种癌症类型中的肿瘤免疫微环境作用及其对预后和免疫治疗反应的预测价值,特别是在胃癌中作为不良预后风险因子的发现 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证;样本来源和数量未具体说明;未涉及AR靶向治疗的临床前或临床试验 探讨AR在肿瘤免疫微环境中的作用及其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的潜力 多种癌症类型,重点关注胃癌 生物信息学 胃癌 多组学分析、基因集富集分析、单细胞测序 NA 基因组、转录组、单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
715 2026-03-28
Genome and Single-Cell Transcriptome Reveal the Evolution of Holoparasitic Plants: A Case Study of Cistanche deserticola
2026-Apr, Plant biotechnology journal IF:10.1Q1
研究论文 本研究通过构建染色体级别基因组图谱和单细胞转录组图谱,揭示了肉苁蓉作为全寄生植物的分子与细胞进化机制 首次构建了肉苁蓉的染色体级别基因组图谱,并结合单细胞转录组技术揭示了寄生相关细胞的阶段特异性分化过程 研究主要聚焦于单一物种,未与其他寄生植物进行广泛比较,且数据库功能可能受限于当前数据整合范围 探索全寄生植物肉苁蓉在分子和细胞水平的进化机制 肉苁蓉(Cistanche deserticola)及其基因组与单细胞转录组数据 植物基因组学与单细胞生物学 NA 基因组测序、单细胞RNA-seq NA 基因组数据、单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
716 2026-03-28
Optimizing Single-Cell Long-Read Sequencing for Enhanced Isoform Detection in Pancreatic Islets
2026-Apr-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本研究优化了单细胞长读长测序协议,以增强胰腺胰岛中异构体的检测能力 通过优化5'文库制备协议并采用胰岛素转录本靶向耗竭策略,提高了长读长测序在单细胞水平上的转录本检测效率和准确性 技术挑战包括读长不足和较高错误率,可能影响某些低丰度转录本的识别 优化单细胞长读长测序协议,以改善胰腺胰岛中异构体的检测和基因表达分析 胰腺胰岛中的各种细胞类型,特别是胰岛内分泌细胞 数字病理学 糖尿病 单细胞长读长测序 NA RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
717 2026-03-28
Activation of the Pancreatic "Metabolic Synapse" Aggravates Type 2 Diabetes Mellitus by Inducing PANoptosis in β-Cells
2026-Apr-01, Diabetes IF:6.2Q1
研究论文 本文通过单细胞测序和体外实验,揭示了胰腺成纤维细胞通过分泌过量谷氨酸激活β细胞中的NMDAR,从而触发PANoptosis并加速2型糖尿病进展的新机制 首次提出“代谢突触”概念来描述胰腺成纤维细胞与β细胞间的相互作用,并发现谷氨酸-NMDAR轴在2型糖尿病发病中的关键作用 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据,缺乏大规模临床验证;人类胰腺样本的NMDAR表达变化仅作为相关性观察,未进行功能验证 探究胰腺成纤维细胞对β细胞功能障碍和2型糖尿病进展的贡献,并阐明减肥手术改善糖尿病的机制 胰腺β细胞、胰腺成纤维细胞、2型糖尿病患者胰腺样本 数字病理学 2型糖尿病 单细胞测序 NA 单细胞测序数据、体外实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
718 2026-03-28
Endogenous oestrogens as neuroprotective modulators in the human retina: Evidence from transcriptomic profiling and aromatase inhibition
2026-Apr, Journal of neuroendocrinology IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析人类视网膜中类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的表达,并利用芳香化酶抑制剂letrozole在小鼠视网膜外植体中验证局部雌激素合成的功能相关性 首次在人类视网膜单细胞水平系统分析类固醇激素代谢和雌激素信号通路基因的细胞类型特异性表达,并实验证明局部雌激素合成对光感受器维持和免疫调节的潜在保护作用 研究主要基于转录组数据,需要进一步的功能验证;小鼠外植体模型可能无法完全模拟人类视网膜的生理环境 探究人类视网膜中内源性雌激素的神经保护作用机制 人类视网膜细胞和小鼠视网膜外植体 数字病理学 视网膜疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 数据集E-MTAB-7316(具体样本数未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
719 2026-03-28
FAM216A and CCDC166 are not essential for male fertility
2026-Mar-31, Reproduction, fertility, and development
研究论文 本研究通过基因敲除小鼠模型探究了FAM216A和CCDC166基因在雄性生育力中的作用 首次系统评估了FAM216A和CCDC166这两个睾丸富集基因在雄性生育中的功能,并发现其敲除不影响小鼠生育力 研究仅在小鼠模型中进行,未直接在牛等牲畜中验证,且可能存在物种特异性差异 探究FAM216A和CCDC166基因在雄性生育力中的功能 基因敲除小鼠模型 生殖生物学 生育障碍 系统发育分析、序列比对、单细胞转录组数据分析、RT-PCR、基因敲除、组织化学染色、生育力分析 基因敲除小鼠模型 基因序列数据、转录组数据、组织切片图像 未明确说明具体样本数量,但涉及基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
720 2026-03-28
Pathogenic GM-CSF drives functional diversification of inflammatory macrophages in autoimmune arthritis
2026-Mar-27, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了在自身免疫性关节炎中,GM-CSF如何驱动炎症巨噬细胞的功能多样化,从而加剧关节炎症和疼痛 首次阐明GM-CSF在自身免疫性关节炎中促进Ly6C单核细胞分化为功能不同的巨噬细胞亚群,并识别出两个GM-CSF依赖的致病性巨噬细胞亚群,包括独特的EpCAM巨噬细胞亚群,后者表达与关节炎疼痛相关的促痛介质 研究基于T辅助17细胞介导的自身免疫性关节炎模型,可能不完全反映所有类型的关节炎或人类疾病情况,且单细胞RNA测序数据可能受样本大小和技术限制影响 探究自身免疫性关节炎中巨噬细胞发育和功能多样化的机制,特别是GM-CSF在其中的作用 关节浸润的Ly6C单核细胞和GM-CSF依赖的致病性滑膜巨噬细胞亚群 单细胞生物学 自身免疫性关节炎 单细胞RNA测序 NA RNA序列数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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