单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 38102 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-03-29 |
In situ electrospinning at the operating table to immobilise mesenchymal stem cells on the bony wall for the regeneration of osteoporotic bone defects
2026-Feb-19, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04165-z
PMID:41715169
|
研究论文 | 本研究开发了一种手持式静电纺丝装置，用于在骨质疏松性骨缺损处原位固定间充质干细胞，以促进骨再生 | 提出了一种新型的干细胞递送策略，使用手持式静电纺丝装置在手术台旁原位固定MSCs，使其能直接粘附于复杂的骨壁表面，而无需依赖支架载体 | 研究主要在骨质疏松大鼠模型中进行，尚未在更大动物模型或人体中进行验证；TSG6的阻断实验可能未完全揭示所有免疫调节机制 | 开发一种改进的干细胞接种策略，用于治疗骨质疏松性骨缺损，并探究其促进骨再生的机制 | 间充质干细胞（MSCs）、骨质疏松大鼠的颅骨缺损模型 | 组织工程与再生医学 | 骨质疏松症 | 静电纺丝、流式细胞术、单细胞测序、组织mRNA测序、荧光检测 | 动物模型（大鼠） | 测序数据、流式细胞数据、荧光成像数据、组织学数据 | 骨质疏松大鼠模型（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞测序、mRNA测序 | NA | NA |
| 682 | 2026-03-29 |
Cerebral Venous Thrombosis in Previously Healthy Patients with Cryptococcal Meningitis
2026-Feb-18, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf653
PMID:41443253
|
研究论文 | 本研究回顾性分析了免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征和潜在机制 | 首次在免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者队列中系统研究CVST的发病率，并采用单细胞RNA测序技术探索神经炎症期间血栓形成相关基因的表达模式 | 回顾性研究设计，样本量有限（89例患者），单细胞测序仅在一例cPIIRS患者中进行，需要更大规模的前瞻性研究验证发现 | 探讨隐球菌性脑膜炎患者中脑静脉窦血栓形成的临床特征、发病率和潜在分子机制 | 免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者（非HIV感染） | 数字病理学 | 脑静脉窦血栓形成 | 单细胞RNA测序，遗传分析 | NA | 临床记录，神经影像数据，实验室数据，基因表达数据 | 89例免疫功能正常的隐球菌性脑膜炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2026-03-29 |
Immune regulation and cellular crosstalk drive non-fibrotic lung remodeling in pre-metamorphic frogs exposed to paraquat
2026-Feb-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02546-2
PMID:41709280
|
研究论文 | 本研究利用组织学分析、行为学检测和单细胞RNA测序技术，探究了环境相关浓度百草枯暴露对Microhyla fissipes蝌蚪肺部急性反应的影响，揭示了非纤维化肺重塑过程 | 首次在蝌蚪模型中揭示了百草枯暴露诱导的非纤维化肺重塑，涉及免疫调节和细胞间互作，并发现发育信号通路如Wnt/β-catenin的重新激活 | 研究结论仅适用于蝌蚪阶段和短期暴露，需要进一步评估长期或变态后的影响 | 研究环境化学物质对早期发育阶段脊椎动物肺部的急性损伤反应、恢复能力和发育可塑性 | Microhyla fissipes蝌蚪的肺部组织 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、组织学分析、行为学检测 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、行为数据 | 未明确指定样本数量，但涉及Microhyla fissipes蝌蚪群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2026-03-29 |
A comprehensive evaluation of long-read de novo transcriptome assembly
2026-Feb-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04001-5
PMID:41709347
|
研究论文 | 本文对RATTLE、RNA-Bloom2和isONform等长读长从头转录组组装工具进行了全面评估，并与短读长组装工具Trinity进行了性能比较 | 首次在模拟数据、spike-in序列和真实样本（人类和豌豆）中系统评估了长读长从头转录组组装工具，并分析了组装选择对差异基因/转录本表达检测的下游影响 | 与参考基因组引导的方法相比，长读长从头组装在准确性和冗余度方面仍存在局限 | 评估长读长从头转录组组装工具的性能，为无高质量参考基因组时的差异表达分析提供策略指导 | 长读长从头转录组组装工具（RATTLE、RNA-Bloom2、isONform）和短读长组装工具Trinity | 生物信息学 | NA | 长读长测序、转录组组装、差异表达分析 | NA | 测序数据（模拟数据、spike-in序列、真实样本数据） | 覆盖6百万至6千万读长的多个数据集，包括人类和豌豆样本 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | cDNA测序、直接RNA测序、单细胞测序 | ONT, PacBio | ONT cDNA测序、ONT直接RNA测序、PacBio 10×单细胞测序 |
| 685 | 2026-03-29 |
Spatiotemporal interplay between epithelial and mesenchymal cells drives human dentinogenesis
2026-Feb-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69545-3
PMID:41690906
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学构建了人类牙齿从萌发到萌出阶段发育图谱，揭示了上皮-间充质细胞间的时空相互作用机制 | 首次构建了涵盖人类牙齿完整发育过程的单细胞时空图谱，提出了WNT-NOTCH顺序激活调控模型，并鉴定出关键信号分子DLX6-AS1 | 研究主要基于发育阶段的观察，在成人牙齿修复中的长期效果和临床应用潜力仍需进一步验证 | 解析人类牙齿发育过程中上皮与间充质细胞相互作用的分子机制，为牙本质再生修复提供理论基础 | 人类牙齿发育过程中的牙乳头细胞、牙上皮细胞及成人牙髓干细胞 | 单细胞组学 | 牙本质缺损 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 涵盖牙齿发育从起始到萌出多个阶段的人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 686 | 2026-03-29 |
Liver sinusoidal endothelial TGF-β signaling accelerates partial endothelial-mesenchymal transition and MASH through Notch
2026-Feb-10, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2026.101784
PMID:41861675
|
研究论文 | 本研究揭示了肝脏窦内皮细胞（LSECs）通过TGF-β/Notch信号轴驱动的部分内皮-间质转化（EndMT）在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH）进展中的关键作用 | 首次在MASH肝脏中鉴定出一个由LSECs通过部分EndMT产生的独特双表型细胞群，并阐明了TGF-β/Notch信号轴驱动这一过程及疾病进展的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，在MASH患者队列中的验证是未来需要开展的工作 | 探究LSECs在MASH进展中的具体作用及其功能障碍的分子机制 | 晚期MASH小鼠的肝脏、LSEC特异性转基因小鼠模型、原代LSECs、人脐静脉内皮细胞（HUVECs） | 单细胞组学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎（MASH） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、谱系追踪、体内外功能实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠：单细胞测序每组6只，体内实验每组3-10只，原代细胞实验每组3-6只；体外实验使用HUVECs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 687 | 2026-03-29 |
Interferon stimulation and NKG2D expression drive enhanced natural killer cell antibody-dependent cellular cytotoxicity against viral infections
2026-Feb-09, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiag019
PMID:41634919
|
研究论文 | 本研究结合功能性ADCC实验与单细胞转录组学，揭示了COVID-19患者自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性反应的分子机制，特别是干扰素刺激和NKG2D表达的关键作用 | 首次通过单细胞转录组学分析COVID-19患者外周NK细胞的ADCC反应，发现干扰素刺激基因和NKG2D表达与ADCC反应水平相关，并揭示了抗体介导ADCC能力与干扰素激活之间的负调控机制 | 研究样本仅限于COVID-19患者，未涵盖其他病毒感染；单细胞转录组学数据为横断面研究，缺乏动态追踪；机制验证主要在体外进行，需体内实验进一步确认 | 探究自然杀伤细胞抗体依赖性细胞毒性反应的分子决定因素，以优化疫苗接种和治疗策略 | COVID-19患者的外周自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | COVID-19参与者的外周NK细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 688 | 2026-03-29 |
Inactivation of Hes1 in Skeletal Undifferentiated Cells Increases Bone Volume
2026-Feb-04, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/endocr/bqag015
PMID:41685823
|
研究论文 | 本文研究了在骨骼未分化细胞中失活Hes1基因对骨量的影响 | 首次在LepR+细胞中特异性失活Hes1基因，揭示其通过抑制RANKL表达减少骨吸收，从而增加骨量，而HES1对成骨或成脂分化影响较小 | 研究仅在小鼠模型中进行，未涉及人类样本；骨量增加仅发生在股骨，而椎骨和皮质骨未受影响；性别差异仅在成骨细胞数量中观察到 | 探究Notch信号通路靶基因Hes1在LepR+细胞中对骨代谢的调控作用 | LepR-Cre;Hes1Δ/Δ基因工程小鼠及其对照小鼠的骨骼组织 | 骨骼生物学 | NA | 单细胞RNA测序，骨组织形态计量学，细胞培养 | NA | 基因表达数据，组织形态数据 | 5月龄的LepR-Cre;Hes1Δ/Δ小鼠和Hes1loxP/loxP同窝对照小鼠，包括雄性和雌性 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 689 | 2026-03-29 |
Colorectal microenvironment determines the prognosis of colorectal cancer
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01599-7
PMID:41495419
|
研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌患者的肿瘤和非肿瘤组织，评估了区分支持癌细胞生长的微环境与健康微环境的可行性，并发现微环境特征可作为预后生物标志物 | 首次利用bulk RNA测序数据将结直肠癌患者分为肿瘤支持性微环境和健康微环境组，并结合单细胞RNA测序揭示了微环境中特定细胞类型间的相互作用 | 样本量相对有限（273对样本），且研究主要基于回顾性分析，需要进一步前瞻性验证 | 评估结直肠微环境对癌症预后的影响，并探索其作为预后生物标志物的潜力 | 结直肠癌患者及其配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 273对配对的非肿瘤组织和肿瘤样本 | NA | bulk RNA测序, 16S rRNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 690 | 2026-03-29 |
Microglial CX3CR1 deficiency regulates the selective vulnerability of cone photoreceptors via STAT3/CCL-ACKR1 signaling in the mouse retina
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01618-7
PMID:41535549
|
研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞CX3CR1缺陷通过STAT3/CCL-ACKR1信号通路导致小鼠视网膜中视锥光感受器选择性易损性的分子机制 | 首次发现CX3CR1缺陷通过STAT3介导小胶质细胞神经毒性，并鉴定出CCL-ACKR1信号通路在视锥细胞选择性丢失中的关键作用 | 研究局限于小鼠模型，人类视网膜中的机制仍需验证 | 探究神经退行性疾病中神经元选择性易损性的分子机制 | 小鼠视网膜中的小胶质细胞、星形胶质细胞和视锥光感受器 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 蛋白质组学分析、单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 691 | 2026-03-29 |
Single-immunocyte transcriptomics reveal the role of natural killer cell-dependent exogenous antigen presentation in ankylosing spondylitis severity
2026-Feb, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01619-6
PMID:41593306
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析强直性脊柱炎患者外周血单个核细胞，揭示了自然杀伤细胞依赖性外源性抗原呈递在疾病严重程度中的作用 | 首次鉴定出具有抗原呈递功能的NK细胞亚群（APC-NK），并阐明其在AS疾病进展中的关键作用，通过小鼠模型验证了HLA-DRB1 NK细胞加速AS样病变的机制 | 研究样本量有限，且主要基于外周血样本，未深入探究关节局部免疫微环境的变化 | 探究强直性脊柱炎发病、加重和缓解过程中的细胞分类学和免疫学特征，揭示导致AS病变的内在规律 | 健康供体和不同疾病阶段的强直性脊柱炎患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体和不同疾病阶段的AS患者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 692 | 2026-03-29 |
Mechanisms of immune escape and extramedullary tropism in leukemia cutis
2026-Jan-01, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025029121
PMID:41026928
|
研究论文 | 本研究通过批量及单细胞转录组分析，揭示了急性髓系白血病皮肤浸润（白血病皮肤浸润）的免疫逃逸机制和髓外归巢特性 | 首次对孤立性髓外疾病（皮肤和皮下组织）的白血病皮肤浸润进行批量及单细胞转录组分析，揭示了其独特的免疫微环境特征、T细胞耗竭特征、HLA II类分子下调的免疫逃逸表型，以及与骨髓复发白血病不同的归巢受体表达谱 | 样本量相对较小（23个活检样本来自10名患者），部分发现（如HLA II下调）仅在部分样本中观察到（4/7），且对白血病特异性T细胞的定量分析主要基于一名患者的连续样本 | 探究急性髓系白血病髓外归巢（特别是皮肤浸润）的机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 急性髓系白血病（AML）患者的皮肤和皮下组织活检样本（白血病皮肤浸润），以及作为对照的骨髓复发样本和正常健康皮肤 | 数字病理学 | 白血病 | 批量转录组测序，单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 23个白血病皮肤浸润活检样本（来自10名患者），7个骨髓复发样本 | NA | 单细胞RNA-seq， bulk RNA-seq | NA | NA |
| 693 | 2026-03-29 |
Single-cell omics for nutrition research: an emerging opportunity for human-centric investigations
2026, Critical reviews in food science and nutrition
IF:7.3Q1
DOI:10.1080/10408398.2025.2566387
PMID:41176166
|
综述 | 本文综述了单细胞组学技术在营养研究中的新兴应用及其潜力 | 提出了将单细胞组学技术与类器官、器官芯片等先进人体衍生系统相结合，以在生理相关背景下进行机制研究的新框架 | 讨论了该领域面临的技术限制、模型选择困难和机构偏见等关键挑战 | 推进以人为中心的营养研究，揭示饮食化合物对人类健康的影响机制 | 饮食化合物与人体细胞的相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单细胞蛋白质组学，单细胞代谢组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 694 | 2026-03-29 |
Resveratrol Alleviates Intervertebral Disc Degeneration by Targeting NCOA4-Mediated Ferritinophagy Through Dual Antioxidant and Anti-Inflammatory Effects
2026, Drug design, development and therapy
DOI:10.2147/DDDT.S575321
PMID:41873334
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验模型，揭示了NCOA4介导的铁蛋白自噬在椎间盘退变中的关键作用，并发现白藜芦醇通过靶向NCOA4发挥双重抗氧化和抗炎效应来缓解退变 | 首次将铁蛋白自噬确立为椎间盘退变的新型病理机制，并阐明NCOA4作为协调铁死亡与自噬交互作用的关键节点，同时验证了天然化合物白藜芦醇通过多靶点调控炎症和铁稳态通路治疗椎间盘退变的潜力 | 研究主要基于大鼠模型和细胞实验，临床转化仍需进一步验证；铁蛋白自噬的具体调控网络及其与其他细胞死亡方式的相互作用尚未完全阐明 | 探究铁蛋白自噬在椎间盘退变中的作用机制，并评估白藜芦醇的治疗效果 | 椎间盘退变患者样本、大鼠椎间盘退变模型、髓核细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 椎间盘退变 | 生物信息学分析、单细胞测序、转录组分析、实验模型验证 | NA | 临床转录组数据、单细胞测序数据、实验数据 | 未明确具体样本数量，涉及临床样本、大鼠模型和细胞研究 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 695 | 2026-03-29 |
A lactylation modification-related prediction model for the diagnosis of ulcerative colitis based on machine learning
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1717232
PMID:41890712
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法分析基因表达数据，识别了与溃疡性结肠炎相关的乳酰化修饰核心基因，并构建了一个高预测性能的诊断模型 | 首次结合乳酰化修饰与机器学习构建UC诊断模型，并利用单细胞RNA测序数据探索乳酰化在UC免疫细胞中的分布 | 研究基于公共数据集，样本量有限，且体外验证仅涉及基因表达变化，未深入机制 | 开发基于乳酰化修饰的溃疡性结肠炎诊断预测模型 | 溃疡性结肠炎患者基因表达数据及免疫细胞 | 机器学习 | 溃疡性结肠炎 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 机器学习模型（未指定具体类型） | 基因表达数据 | 基于三个GEO数据集（GSE206285, GSE75214, GSE87466），具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 696 | 2026-03-29 |
Renshen-Baidu-San restores epithelial-immune crosstalk and drives type 2 immune repair in ulcerative colitis: an integrated multi-omics study
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777808
PMID:41890762
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，揭示了人参败毒散在溃疡性结肠炎中通过调节代谢途径、恢复上皮-免疫互作并驱动2型免疫修复的治疗机制 | 首次结合血清代谢组学、单细胞RNA测序和结肠类器官实验，系统阐明了人参败毒散通过调节Tuft细胞和T-1细胞亚群、抑制NF-κB-TNF-α信号通路，恢复上皮-免疫串扰并促进2型免疫修复的多重生物学机制 | 研究基于DSS诱导的小鼠溃疡性结肠炎模型，其结论在人类患者中的直接适用性仍需进一步验证 | 阐明人参败毒散治疗溃疡性结肠炎的多种生物学机制 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型及结肠类器官 | 多组学整合分析 | 溃疡性结肠炎 | 血清代谢组学, 网络药理学, 分子对接, 单细胞RNA测序, 结肠类器官培养, 组织病理学, 免疫组化, 免疫荧光, 定量RT-PCR, ELISA, 流式细胞术 | NA | 代谢组数据, 转录组数据, 图像数据, 蛋白互作数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 697 | 2026-03-29 |
M2-type tumor-associated macrophages promote invasion of canine breast cancer through ADAM9 upregulation
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1777860
PMID:41890767
|
研究论文 | 本研究通过犬乳腺肿瘤模型结合人类转录组数据，揭示了ADAM9作为M2型肿瘤相关巨噬细胞促进肿瘤侵袭的关键效应分子 | 首次在跨物种（犬与人类）模型中系统验证ADAM9在M2型TAMs中的特异性富集及其通过ECM重塑和细胞骨架调控促进肿瘤侵袭的机制 | 研究主要基于体外模型和转录组分析，缺乏体内实验的全面验证；犬模型与人类肿瘤的完全等效性仍需进一步确认 | 探究肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）驱动肿瘤侵袭的分子机制，并识别关键效应分子 | 犬乳腺肿瘤细胞、M2型肿瘤相关巨噬细胞、癌症干细胞（CSCs） | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、基因敲低、细胞迁移与侵袭实验 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、体外实验数据 | 未明确样本数量，包含犬乳腺肿瘤模型及公共人类转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 698 | 2026-03-29 |
Cell Differentiation of DPSCs Infected With Different Periodontal Pathogens
2026-Jan, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70045
PMID:40739838
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探究了两种牙周病原体（牙龈卟啉单胞菌和牙周二氧化碳嗜纤维菌）对人牙髓干细胞亚群分化的不同影响 | 首次在单细胞分辨率下揭示了不同牙周病原体对牙髓干细胞亚群分化的特异性调控作用，并识别出对特定病原体有独特反应的细胞亚群 | 研究样本来源于健康供体，未考虑临床患者个体差异；体外感染模型可能无法完全模拟体内复杂微环境 | 探究牙周病原体感染对牙髓干细胞分化的影响机制 | 人牙髓干细胞 | 单细胞组学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康供体来源的牙髓干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 699 | 2026-03-29 |
Model-based dimensionality reduction for single-cell RNA-seq using generalized bilinear models
2025-12-31, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxaf024
PMID:40795862
|
研究论文 | 本文提出了一种名为scGBM的新方法，用于单细胞RNA测序数据的模型降维，通过泊松双线性模型改进标准降维方法 | 开发了scGBM方法，使用泊松双线性模型直接建模计数数据，引入快速估计算法以扩展到百万级细胞数据集，并量化细胞潜在位置的不确定性 | 未明确提及具体局限性，但可能涉及模型假设或计算效率的进一步验证 | 解决单细胞RNA测序数据降维中的问题，如虚假异质性和生物变异性掩盖 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 泊松双线性模型 | 计数矩阵 | 数百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2026-03-29 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
|
综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型（CMS）的分类、预后预测作用、识别方法及其在指导个体化治疗中的应用与挑战 | 系统总结了基于基因表达谱、免疫组化（IHC）和基于深度学习的图像分类器（imCMS）等多种CMS识别方法，并探讨了利用单细胞RNA测序解决肿瘤内异质性（ITH）等新兴策略 | 肿瘤内异质性（ITH）和技术障碍阻碍了CMS分类在临床中的广泛采用 | 回顾CMS分类在结直肠癌中的预后和预测作用，评估其指导个体化治疗的潜力，并探讨临床应用的障碍与解决方案 | 结直肠癌（CRC）及其共识分子亚型（CMS1-4） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析，免疫组化（IHC），单细胞RNA测序，基于计算模型的图像分类（如深度学习） | 深度学习 | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |