单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37658 篇文献，本页显示第 701 - 720 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 701 | 2026-03-16 |
Investigating pulmonary neutrophil responses to inflammation in mice via flow cytometry
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae189
PMID:39212489
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过流式细胞术评估小鼠肺部中性粒细胞表型的详细实验方案 | 提供了一种针对真菌细胞壁颗粒zymosan诱导的肺部无菌炎症模型，结合细胞表面和细胞内标记的全面染色技术，适用于下游单细胞测序等应用 | NA | 探索肺部中性粒细胞在生理和病理条件下的复杂功能 | 小鼠肺部组织及气腔中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 肺部炎症 | 流式细胞术 | NA | 细胞表型数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 702 | 2026-03-16 |
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639868
PMID:40060644
|
研究论文 | 本文通过单核转录组学数据分析，揭示了阿尔茨海默病中Ast10星形胶质细胞亚群在认知衰退中的关键作用及其信号驱动机制 | 首次通过大规模单核转录组学元分析（869个大脑样本）识别出Ast10星形胶质细胞亚群，并利用空间转录组学验证其与配体的共定位，结合遗传学实验证实PLXNB1等信号通路的调控作用 | 研究主要基于转录组数据，功能机制验证仍需进一步实验；样本虽多样但可能存在批次效应；动物模型与人类疾病的直接对应性有限 | 探究阿尔茨海默病中病理性星形胶质细胞状态的信号驱动机制及其对认知衰退的贡献 | 阿尔茨海默病患者及衰老相关的大脑组织样本（人类和小鼠模型），重点关注星形胶质细胞和小胶质细胞亚群 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组测序（snRNAseq），空间转录组学，遗传学敲除实验 | NA | 转录组数据，空间基因表达数据 | 869个大脑样本（来自多样化捐赠者），涵盖人类和小鼠iPSC衍生细胞 | NA | 单核RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 703 | 2026-03-16 |
mTOR signaling regulates multiple metabolic pathways in human lung fibroblasts after TGF-β and in pulmonary fibrosis
2025-Feb-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00189.2024
PMID:39745695
|
研究论文 | 本研究探讨了mTOR和ATF4在TGF-β诱导的人肺成纤维细胞代谢重编程中的作用 | 首次系统揭示了mTOR和ATF4在调控肺成纤维细胞氨基酸稳态、糖酵解和TCA循环代谢途径中的关键作用，并通过单细胞RNA-seq数据验证了这些通路在IPF患者病理成纤维细胞中的激活 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证不足；代谢组学分析可能未覆盖所有相关代谢物 | 阐明mTOR信号通路在肺纤维化中调控成纤维细胞代谢重编程的分子机制 | 人肺成纤维细胞和IPF患者肺组织样本 | 分子生物学与代谢研究 | 肺纤维化 | RNA测序、代谢组学分析、单细胞RNA-seq数据分析 | NA | 转录组数据、代谢组数据、单细胞RNA-seq数据 | 未明确样本数量，但使用了人肺成纤维细胞和公开的单细胞RNA-seq数据集 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 704 | 2026-03-16 |
Amniotic fluid cell-free transcriptome: a glimpse into fetal development and placental cellular dynamics during normal pregnancy
2020-02-12, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-020-0690-5
PMID:32050959
|
研究论文 | 本研究通过分析羊水细胞游离转录组，探讨正常妊娠期间胎儿发育和胎盘细胞动态变化 | 首次报道单细胞基因组特征可在羊水中追踪并显示妊娠期间复杂的表达模式，同时揭示了选择性剪接在组织身份获取、器官发育和免疫过程中的作用 | 样本量相对有限（共98例），且仅关注正常妊娠，未纳入病理妊娠病例进行对比 | 建立正常妊娠羊水基因表达和剪接模式，为产科生物标志物发现提供基础 | 正常妊娠女性的羊水样本（孕中期30例，足月68例） | 转录组学 | NA | 人类转录组芯片（Human Transcriptome Arrays）和单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 98例羊水样本（孕中期30例，足月68例） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 705 | 2026-03-16 |
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14171-5
PMID:31996681
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析和抗体筛选，鉴定出CD44作为内皮向造血转变（EHT）的标志物，并揭示了其在造血干细胞和祖细胞（HSPCs）发育中的调控作用 | 首次识别CD44为EHT过程的特异性标记物，并证明其与透明质酸的相互作用是HSPC发育的关键调控因素 | 研究主要基于小鼠主动脉-性腺-中肾（AGM）区域，人类或其他物种中的适用性尚未验证 | 阐明内皮向造血转变（EHT）的中间步骤及调控机制 | 小鼠主动脉-性腺-中肾（AGM）区域的内皮细胞和造血干细胞/祖细胞（HSPCs） | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组分析，抗体筛选 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确指定样本数量，但涉及AGM区域的细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 706 | 2026-03-15 |
Tanreqing injection regulates Sema7a/Plxnc1 signaling pathway mediated neutrophil extracellular trap formation to alleviate lipopolysaccharide-induced acute lung injury
2026-May-23, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121397
PMID:41713818
|
研究论文 | 本研究探讨了痰热清注射液通过调节Sema7a/Plxnc1信号通路介导的中性粒细胞胞外诱捕网形成，以减轻脂多糖诱导的急性肺损伤 | 首次揭示了痰热清注射液通过抑制Sema7a/Plxnc1信号通路来减少中性粒细胞胞外诱捕网形成，从而缓解急性肺损伤的分子机制 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验，其结论在人体中的适用性尚需进一步临床验证 | 评估痰热清注射液对急性肺损伤的治疗效果并阐明其分子机制 | 脂多糖诱导的急性肺损伤大鼠模型 | 药理学与分子生物学 | 急性肺损伤 | 超高效液相色谱-四极杆-电喷雾质谱、代谢组学、RNA测序、单细胞测序、分子对接 | NA | 代谢组学数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞测序、RNA测序 | NA | NA |
| 707 | 2026-03-15 |
The co-action mechanism of agreement prescription "homotherapy for heteropathy" against esophageal, head and neck cancer, and lung cancer: network pharmacology, bioinformatics analysis, and experimental validation
2026-May-23, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2026.121430
PMID:41759559
|
研究论文 | 本研究通过网络药理学、生物信息学分析和实验验证，探讨了协定处方“异病同治”治疗食管癌、头颈癌和肺癌的共同靶点与分子机制 | 首次整合网络药理学、生物信息学（包括单细胞转录组学）和体内外实验，系统揭示了“异病同治”协定处方在多种癌症中的共同作用靶点（如CCR7、VEGFA）和PI3K-AKT通路机制 | 研究主要基于数据库分析和实验模型，未涉及临床患者数据，且具体处方成分未明确列出，可能影响结果的普适性 | 探索中医“异病同治”协定处方治疗食管癌、头颈癌和肺癌的共同分子靶点与作用机制 | 协定处方的活性成分、癌症相关基因、PI3K-AKT信号通路、以及食管癌、头颈癌和肺癌的细胞与动物模型 | 生物信息学 | 肺癌 | 网络药理学、生物信息学分析、分子对接、单细胞转录组学、体内外实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、转录组数据 | 未明确样本数量，但使用了TCGA/UALCAN数据库的泛癌数据及实验模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 708 | 2026-03-15 |
From Single-Cell Clusters to Causality: ITCH Engagement for CKD Uncovered by Integrative Analysis of MR and MAGMA
2026-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202502366R
PMID:41817007
|
研究论文 | 本研究通过整合人类肾脏单细胞RNA测序数据与遗传关联及因果推断框架，识别并验证了ITCH作为慢性肾脏病（CKD）的潜在易感基因 | 采用供体感知的伪批量策略缓解单细胞数据中的假重复问题，并整合转录组差异表达、孟德尔随机化（MR）和MAGMA基因水平关联分析等多层证据，首次将ITCH确立为CKD的高置信度候选基因 | 研究主要基于已有数据集和计算模拟，实验验证仅在动物模型中进行，尚未在人体中进行功能验证；药物预测部分为假设生成性质，需后续实验测试 | 识别慢性肾脏病（CKD）的潜在分子靶点 | 人类肾脏组织、实验性肾损伤模型 | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、MAGMA基因关联分析、免疫组织化学、分子对接、分子动力学模拟 | NA | 单细胞转录组数据、GWAS汇总统计数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 709 | 2026-03-15 |
[Spatial omics in pulmonary fibrosis: advancing mechanistic insights and therapeutic strategies]
2026-Mar-25, Zhejiang da xue xue bao. Yi xue ban = Journal of Zhejiang University. Medical sciences
DOI:10.3724/zdxbyxb-2025-0785
PMID:41631436
|
综述 | 本文综述了空间组学技术在肺纤维化研究中的应用进展，强调其在揭示疾病机制和指导治疗策略方面的潜力 | 整合空间代谢组学、转录组学和蛋白质组学技术，为肺纤维化提供前所未有的组织架构背景下的高通量可视化分析 | NA | 推进肺纤维化的机制理解和治疗策略开发 | 肺纤维化，特别是特发性肺纤维化（IPF） | 数字病理学 | 肺纤维化 | 空间代谢组学，空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间代谢组学，空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 710 | 2026-03-15 |
Identification of a putative progenitor-like chondrocyte subpopulation in osteoarthritic human cartilage
2026-Mar-14, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-026-04969-8
PMID:41827033
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在骨关节炎患者的软骨组织中鉴定出一个具有祖细胞样特征的软骨细胞亚群 | 在骨关节炎软骨中首次鉴定出三个新的软骨细胞亚群，包括一个具有祖细胞样特征的亚群，并描绘了其转录组特征和分化轨迹 | 研究样本量较小，且缺乏功能验证和空间定位验证 | 解析骨关节炎软骨细胞的异质性，并鉴定具有再生潜能的祖细胞样软骨细胞 | 骨关节炎患者的膝关节软骨细胞 | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 无监督聚类，伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 6名终末期骨关节炎患者的约14,000个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 基于液滴的单细胞RNA测序 |
| 711 | 2026-03-15 |
Integrated transcriptomics and single-cell analysis identify ITGAX⁺ macrophages as key immunosuppressive factors in the prostate cancer tumor microenvironment
2026-Mar-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04737-3
PMID:41824168
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析，识别出ITGAX⁺巨噬细胞作为前列腺癌肿瘤微环境中的关键免疫抑制因子 | 首次将ITGAX确定为前列腺癌预后基因，并通过单细胞RNA测序揭示其在巨噬细胞亚群中的富集及其与免疫抑制微环境的关联 | 研究主要基于TCGA等公共数据集，缺乏实验验证；样本量相对有限，且未涉及不同种族或亚型的比较分析 | 识别前列腺癌肿瘤微环境中新的生物标志物，以更好地理解疾病进展并为未来诊断或治疗策略提供信息 | 前列腺癌患者的肿瘤和正常前列腺组织样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 转录组学分析、单细胞RNA测序 | ESTIMATE算法、免疫去卷积算法、Cox回归、PPI网络分析、GSEA功能预测 | 转录组数据、临床数据、生存数据、单细胞RNA测序数据 | 551个样本（499个肿瘤样本和52个正常前列腺样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 712 | 2026-03-15 |
Loop of N2-polarized neutrophils and exhausted CD8 + T cells induces immunotherapy resistance in NSCLC
2026-Mar-13, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05457-y
PMID:41824204
|
研究论文 | 本研究通过整合大规模单细胞RNA测序数据，揭示了非小细胞肺癌中N2极化中性粒细胞与耗竭CD8⁺ T细胞之间形成正反馈环路导致免疫治疗耐药的机制，并基于此构建了深度学习预测模型 | 首次发现并表征了N2中性粒细胞与耗竭CD8⁺ T细胞之间通过ICAM1-整合素和CCL5-CCR1轴形成的自我维持免疫抑制环路，并基于该环路构建了可预测免疫治疗响应的深度学习模型 | 研究主要基于计算分析，需要进一步的实验验证来确认分子机制；模型在更多癌症类型中的普适性仍需验证 | 探究非小细胞肺癌中免疫抑制微环境的形成机制，并开发预测免疫治疗响应的临床模型 | 非小细胞肺癌肿瘤免疫微环境中的N2极化中性粒细胞和耗竭CD8⁺ T细胞 | 计算生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，通路富集分析，细胞间通讯分析，深度学习建模 | 深度神经网络 | 单细胞RNA测序数据，bulk RNA测序数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集和多个bulk RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 713 | 2026-03-15 |
Unraveling the role of cuproptosis in pulmonary fibrosis pathogenesis and prognosis: an integrative single-cell transcriptomics and microarray analysis
2026-Mar-13, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-026-05510-4
PMID:41824199
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和微阵列分析，揭示了铜死亡在肺纤维化发病机制和预后中的作用，并构建了一个基于4个铜死亡相关基因的预后风险模型 | 首次将铜死亡这一新型细胞死亡途径与肺纤维化联系起来，并通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据构建了一个稳健的预后风险评分模型 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性患者数据，需要在更大规模的前瞻性临床队列中进行验证 | 阐明铜死亡在肺纤维化中的生物学功能并建立预后预测模型 | 博来霉素诱导的小鼠肺纤维化模型、TGF-β1刺激的成纤维细胞、以及特发性肺纤维化患者样本 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, qRT-PCR, 免疫组织化学 | LASSO回归, Cox回归 | 基因表达数据 | GSE70866队列患者数据、小鼠模型、人类IPF样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 714 | 2026-03-15 |
Single-cell RNA sequencing unravels chondrocyte heterogeneity and immune cell interactions in knee osteoarthritis pathogenesis
2026-Mar-13, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-026-08030-0
PMID:41824220
|
研究论文 | 本研究通过整合公共GEO数据库中的单细胞RNA测序数据，系统分析了膝骨关节炎中软骨细胞的异质性及其与免疫细胞的相互作用 | 首次在膝骨关节炎中识别出八个软骨细胞亚群，并揭示了MIF信号在促进炎症微环境形成中的关键作用，以及C1Q+巨噬细胞通过补体级联反应增强淋巴细胞介导的细胞毒性 | 研究基于公共数据库的二次观察性分析，样本量相对有限（20例患者和6例健康供体），且未进行实验验证 | 全面表征膝骨关节炎中疾病特异性软骨细胞亚群及其分子特征，并解码浸润免疫细胞的组成多样性 | 膝骨关节炎患者和健康供体的软骨细胞及免疫细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | t-SNE聚类、伪时间分析、CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 20例膝骨关节炎患者和6例健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 715 | 2026-03-15 |
IDH2 Clonal Hematopoiesis and IKAROS Loss Cooperate in a B-ALL Subtype after Lenalidomide Therapy for Multiple Myeloma
2026-Mar-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031047
PMID:41824395
|
研究论文 | 本研究对来那度胺治疗多发性骨髓瘤后相关的B细胞前体急性淋巴细胞白血病（LenB-ALL）进行了全面的分子特征分析，揭示了其独特的分子亚型 | 首次系统性地定义了LenB-ALL的三种突变亚型，特别是发现IDH2 R140Q突变在该疾病中高度富集，并揭示了其起源于克隆性造血，且与IKZF1缺失协同作用 | 样本量相对有限（57例患者），且为观察性研究，无法完全确定来那度胺与白血病发生的直接因果关系 | 探究来那度胺治疗多发性骨髓瘤后发生继发性B-ALL的分子机制和特征 | 57例来那度胺相关B-ALL（LenB-ALL）患者 | 血液肿瘤学 | B细胞急性淋巴细胞白血病，多发性骨髓瘤 | 荧光激活细胞分选，单细胞RNA测序，转录组分析，DNA甲基化分析 | NA | 基因组数据，转录组数据，表观遗传数据，单细胞数据 | 57例LenB-ALL患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 716 | 2026-03-15 |
Neuronal and glial networks interact with traumatic brain injury to modulate cognition in ABCD study
2026-Mar-13, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-026-00681-8
PMID:41826372
|
研究论文 | 本研究整合了基因与轻度创伤性脑损伤（mTBI）交互作用的全基因组关联研究（GWAS）和单细胞RNA测序基因调控网络，以揭示调控mTBI后神经认知结果（特别是学习和记忆表现）的细胞类型特异性关键调节因子和分子机制 | 首次结合全基因组关联研究与单细胞RNA测序基因调控网络，在青少年脑认知发展（ABCD）队列中，从细胞类型特异性角度解析mTBI影响神经认知的复杂调控网络，并识别出海马体和皮层区域神经元与胶质细胞中的关键网络调节因子 | 研究基于观察性队列，可能受混杂因素影响；单细胞RNA测序数据可能未完全覆盖所有相关细胞类型或脑区；结果需要在独立队列中进一步验证 | 阐明轻度创伤性脑损伤（mTBI）影响青少年神经认知表现的生物学机制，特别是学习和记忆功能 | 青少年脑认知发展（ABCD）研究队列中的儿童和青少年，重点关注mTBI患者 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 全基因组关联研究（GWAS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 基于通路的多基因风险评分模型 | 基因组数据，单细胞转录组数据，神经认知评估数据 | ABCD研究队列参与者（具体样本量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 717 | 2026-03-15 |
Multicellular origins of murine ovarian inflammaging
2026-Mar-13, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09826-1
PMID:41826404
|
研究论文 | 本研究整合单细胞和空间转录组学，揭示了小鼠卵巢衰老过程中免疫细胞亚群的增加及其在促炎信号传导中的关键作用 | 首次整合单细胞和空间转录组学技术，系统定义了衰老小鼠卵巢中免疫细胞亚群（如巨噬细胞和T细胞）的组成变化及其双向信号传导机制，为卵巢炎症衰老提供了新的分子机制见解 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类卵巢中验证；空间转录组学的分辨率可能限制了对特定细胞类型相互作用的精确解析 | 探究卵巢衰老过程中免疫细胞的功能及其对炎症衰老表型的贡献 | 衰老小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 718 | 2026-03-15 |
Insights from pooled CRISPRi single-cell screens in K562 cells reveal gene functions, regulatory networks, and highlight opportunities and limitations
2026-Mar-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12667-1
PMID:41826830
|
研究论文 | 本研究通过改进的CRISPRi单细胞筛选方法，在K562细胞中敲低六个转录因子，揭示了基因功能、调控网络，并评估了该技术的潜力与局限性 | 采用改进的CROP-seq协议，无需单独的富集步骤即可直接从cDNA文库捕获sgRNA，显著提高了每个细胞的sgRNA分配准确性，并成功重建了转录调控网络，发现了新的调控相互作用 | CRISPRi介导的扰动效率存在变异性，仅约40-50%的靶基因能实现有效敲低，技术的可靠性、可扩展性和可重复性仍需进一步优化和标准化基准测试 | 评估和改进基于CRISPRi的汇集式单细胞筛选方法，以解析基因功能和重建基因调控网络 | K562细胞系中的六个转录因子：LMO2、TCF3、LDB1、MYB、GATA2和RUNX1 | 单细胞功能基因组学 | 血液系统疾病（白血病相关细胞模型） | CRISPR干扰（CRISPRi）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、CRISPR液滴测序（CROP-seq） | 基因调控网络（GRN）重建 | 单细胞转录组数据、sgRNA序列数据 | 未明确指定具体细胞数量，但使用了K562细胞系和公开的Perturb-seq CRISPRi数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 改进的CRISPR液滴测序（CROP-seq）协议 |
| 719 | 2026-03-15 |
Myeloid-derived immunosuppression of chimeric antigen receptor T cells in the neuronal microenvironment of glioblastoma
2026-Mar-13, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04783-2
PMID:41827001
|
研究论文 | 本研究利用人脑切片模型，通过单细胞测序和空间转录组学技术，揭示了胶质母细胞瘤中CAR-T细胞快速功能障碍的微环境机制和转录调控因子 | 首次在保留复杂胶质母细胞瘤微环境的人脑切片模型中，结合PIC-seq、空间转录组学和基因调控网络分析，系统描绘了CAR-T细胞与肿瘤生态系统间的相互作用 | 研究基于体外脑切片模型，可能无法完全模拟体内免疫微环境的动态变化；样本量相对有限 | 探究胶质母细胞瘤中CAR-T细胞疗法失效的微环境机制和调控通路 | NKG2D CAR-T细胞与胶质母细胞瘤微环境中的免疫细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | PIC-seq, 空间转录组学, 基因调控网络重建 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 720 | 2026-03-15 |
Single-cell transcriptomics reveals lipid metabolism reprogramming in macrophages in vitro during early stages of Leishmania donovani infection
2026-Mar-13, Parasites & vectors
IF:3.0Q1
DOI:10.1186/s13071-026-07361-w
PMID:41827050
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术分析了小鼠巨噬细胞感染利什曼原虫后的转录组景观，揭示了早期感染阶段脂质代谢重编程、细胞衰老启动及免疫协调响应等关键机制 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示利什曼原虫感染早期巨噬细胞的脂质代谢重编程现象，并发现寄生虫通过劫持宿主Fabp4/Cd36通路创建脂质庇护所的新机制 | 研究基于体外小鼠模型，人类感染环境的适用性需进一步验证；单细胞测序未结合蛋白质组或代谢组等多组学验证 | 阐明利什曼原虫感染的发病机制及寄生虫-宿主相互作用特征 | 感染利什曼原虫的小鼠巨噬细胞（包括感染细胞、旁观细胞和未暴露细胞） | 单细胞转录组学 | 利什曼病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 未明确样本数量的小鼠巨噬细胞群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |