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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6981 2025-11-10
Differential gene expression profiling and machine learning-based discovery of key genetic markers in VTE and CKD
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 通过转录组学和机器学习分析识别静脉血栓栓塞和慢性肾脏病共享的关键基因标记 首次结合三种机器学习算法(LASSO、SVM-RFE、随机森林)识别VTE和CKD共享的关键基因,并构建诊断列线图 研究依赖公共数据集,需要进一步实验验证基因功能机制 揭示静脉血栓栓塞和慢性肾脏病之间的遗传特征和分子通路联系 VTE和CKD患者的基因表达谱数据 机器学习 静脉血栓栓塞,慢性肾脏病 转录组分析,单细胞RNA测序 LASSO,SVM-RFE,随机森林 基因表达数据 使用多个数据集(GSE37171和GSE48000)的患者样本 NA 单细胞RNA测序,转录组分析 NA NA
6982 2025-11-10
Identification of immunogenic cell death signature genes in hepatocellular carcinoma: from single-cell transcriptomics to in vitro mechanistic validation and comprehensive prognostic modeling with hundreds of machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学和多组学数据,识别肝细胞癌中的免疫原性细胞死亡特征基因,并构建预后模型 首次在肝细胞癌中系统表征免疫原性细胞死亡特征,整合单细胞和批量转录组数据,并通过数百种机器学习算法优化预后模型 研究样本量相对有限,需要前瞻性临床验证 开发肝细胞癌免疫治疗的可靠预后生物标志物和精准分层模型 肝细胞癌患者样本和HepG2细胞系 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, 批量转录组学, 机器学习, 功能验证实验 多种机器学习算法, ssGSEA, WGCNA 单细胞转录组数据, 批量转录组数据 7个HCC样本(44,461个细胞), 三个独立队列(TCGA-HCC 371例, GSE14520 242例, ICGC 445例) NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
6983 2025-11-10
CD44 and CLDN3 as immune-metabolic regulators in acute pancreatitis: a multi-modal transcriptomics study and experimental validation
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多模态转录组学分析和实验验证,揭示了CD44和CLDN3作为急性胰腺炎中免疫代谢调控关键生物标志物的作用 首次发现CD44和CLDN3是胰腺腺泡细胞与免疫细胞间免疫代谢失调的关键生物标志物,并揭示了CLDN3在mRNA和蛋白水平表达不一致的现象 研究样本量有限,主要基于公共数据集和动物模型验证,需要进一步临床研究确认 探索急性胰腺炎中免疫代谢调控的关键分子机制 急性胰腺炎小鼠模型和公共转录组数据集 生物信息学 急性胰腺炎 转录组测序,单细胞RNA测序,机器学习算法,免疫组织化学 三种机器学习算法,单样本基因集富集分析 基因表达数据,单细胞转录组数据 多个公共数据集(GSE65146,GSE109227,GSE279876)和动物模型 NA 转录组测序,单细胞RNA测序 NA NA
6984 2025-11-10
DOCK3 orchestrates metastasis and immune microenvironment in prostate cancer
2025, Frontiers in urology
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境重塑中的关键作用 首次系统阐明DOCK3在前列腺癌中协调转移和免疫微环境的双重功能,发现其与肿瘤突变负荷和细胞毒性免疫细胞浸润的显著关联 研究主要基于计算分析和现有数据库,缺乏实验验证DOCK3功能机制 探究DOCK3在前列腺癌转移和肿瘤免疫微环境中的作用 前列腺癌患者样本和细胞 生物信息学 前列腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 基因组分析 DESeq2, CIBERSORT, ssGSEA, xCell, WGCNA, Harmony, UMAP 基因表达数据, 单细胞数据, 基因组数据 TCGA-PRAD: 499个肿瘤/52个正常样本; GEO单细胞数据: 45,325个细胞 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
6985 2025-11-09
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Potential Mechanism of RUNX3 Reshaping Tumor Microenvironment in Non-small-cell Lung Cancer
2025-Dec, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了RUNX3在非小细胞肺癌中重塑肿瘤微环境的潜在机制 首次在单细胞水平上系统分析RUNX3表达状态对非小细胞肺癌肿瘤微环境的影响 样本量较小(仅7例患者),需要更大规模研究验证 探索RUNX3在非小细胞肺癌中调控肿瘤微环境的具体生物学机制 非小细胞肺癌患者的癌组织和癌旁组织 单细胞测序分析 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序,免疫组织化学染色 Seurat分析流程 单细胞转录组数据 7例非小细胞肺癌患者,包含3对癌和癌旁组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6986 2025-11-09
Tumor-derived CCL5 recruits CCR1+ macrophages to suppress apoptosis and drive proliferation in duodenal adenocarcinoma
2025-Dec-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了十二指肠腺癌中肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞抑制细胞凋亡并促进增殖的机制 首次在十二指肠腺癌中发现肿瘤细胞通过CCL5/CCR1轴招募巨噬细胞并抑制凋亡的免疫逃逸机制 研究样本量有限且为罕见胃肠道恶性肿瘤 阐明十二指肠腺癌肿瘤微环境中肿瘤细胞与巨噬细胞的相互作用机制 十二指肠腺癌患者原发肿瘤组织及匹配的癌旁正常组织 单细胞测序分析 十二指肠腺癌 单细胞RNA测序, 患者来源类器官培养, 功能实验, 批量转录组分析 NA 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 十二指肠腺癌患者原发肿瘤和匹配正常组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6987 2025-11-09
Vascular Niches Are the Primary Hotspots in Cardiac Aging
2025-Nov-07, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术,揭示了血管微环境是心脏衰老过程中的主要热点区域 首次通过整合单核RNA测序和空间转录组学技术系统描绘了心脏衰老过程中的微环境变化,并识别出血管相关细胞生态位作为衰老的关键热点 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类心脏组织中验证 探究心脏组织中驱动年龄相关变化的微环境特征 3月龄和18月龄小鼠的心脏组织 空间转录组学 心血管疾病 单核RNA测序, 空间转录组学, 衰老细胞清除治疗 NA 基因表达数据, 空间定位数据 不同年龄阶段的小鼠心脏组织 NA 单核RNA测序, 空间转录组学 NA NA
6988 2025-11-09
Spatial and functional dissection of cancer-associated fibroblasts-mediated immune modulation in H. pylori-associated gastric cancer
2025-Nov-06, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究通过空间转录组学和单细胞RNA-seq分析,揭示了幽门螺杆菌相关胃癌中癌症相关成纤维细胞的空间分布和免疫调节功能 首次系统解析了幽门螺杆菌阳性胃癌中CAF亚型的空间分布特征及其通过WNT5-FZD相互作用和ZFP36介导的FN1 mRNA稳定性调控免疫抑制的新机制 研究样本量相对有限(71例GC患者),且主要基于回顾性队列分析 阐明癌症相关成纤维细胞在幽门螺杆菌相关胃癌中的空间组织和免疫调节功能 胃癌患者的肿瘤组织样本 空间转录组学 胃癌 空间转录组学,单细胞RNA-seq,LACE-seq,CIBERSORT-ABS,Kaplan-Meier分析 NA 空间转录组数据,单细胞RNA-seq数据,临床数据 71例GC患者肿瘤组织,整合三个独立队列(中国、美国、新加坡)数据 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
6989 2025-11-09
Spatial transcriptomic landscape and cellular neighborhood heterogeneity in cervical cancer: integrative single-cell and spatial RNA sequencing analysis
2025-Nov-05, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,构建了首个宫颈癌综合空间分子图谱 首次建立宫颈癌综合空间转录组图谱,识别38个具有独特分子特征的细胞邻域,揭示肿瘤微环境的空间组织模式 NA 构建宫颈癌空间转录组图谱,解析肿瘤微环境的空间组织和细胞间关系 宫颈癌组织样本和HeLa、SiHa细胞系 空间转录组学 宫颈癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 定量PCR NA 基因表达数据, 空间位置数据 公共GEO数据库数据集和实验验证细胞系 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组平台
6990 2025-11-09
Exploration of prognosis and immune infiltration characteristics in glioblastoma multiforme based on lipid metabolism related genes
2025-Nov-05, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 本研究基于脂代谢相关基因探索多形性胶质母细胞瘤的预后和免疫浸润特征 首次基于脂代谢相关基因将GBM患者分为两个预后不同的亚群,并鉴定出四个新的预后相关枢纽基因 研究主要依赖公共数据库的回顾性数据,需要进一步实验验证 识别GBM中与脂代谢相关的预后生物标志物和治疗靶点 多形性胶质母细胞瘤患者 生物信息学 多形性胶质母细胞瘤 转录组分析,单细胞测序,生物信息学算法 LASSO-Cox回归分析 转录组数据,临床数据 TCGA和GEO数据库中的GBM患者样本 NA 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq NA NA
6991 2025-11-09
Identification of lactylation-related biomarkers in HNSC by integrating machine learning and Spatial transcriptomics analysis
2025-Nov-05, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 通过整合机器学习和空间转录组学分析识别头颈部鳞状细胞癌中与乳酸化修饰相关的生物标志物 首次结合12种机器学习方法和空间转录组学技术系统筛选HNSC中乳酸化相关关键基因,并揭示其在肿瘤核心区域的优先表达模式 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证这些基因在乳酸化修饰中的具体分子机制 识别头颈部鳞状细胞癌中关键的乳酸化相关基因及其预后影响 头颈部鳞状细胞癌患者基因表达数据 机器学习 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组学,单细胞分析,Western blotting,RT-qPCR 多种机器学习方法,WGCNA,CIBERSORT 基因表达数据,空间转录组数据 TCGA-HNSC队列和GSE6631数据集 NA 空间转录组学,单细胞转录组学 NA NA
6992 2025-11-09
Spatial single-cell atlas reveals regional variations in healthy and diseased human lung
2025-Nov-05, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据构建了人类肺部空间单细胞图谱,揭示了健康与疾病状态下肺组织的区域变异 首次在人类肺部应用三种空间转录组学方法,构建了具有空间分辨率的三维组织参考图谱,并发现了慢性阻塞性肺病中上皮细胞类型组成的未知失衡 研究仅关注了三个代表性肺部区域,可能未完全覆盖整个肺部的空间异质性 理解肺组织地形和外部因素对细胞类型内基因表达变异的影响 人类肺部细胞,包括罕见上皮细胞 空间转录组学 慢性阻塞性肺病 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据, 空间定位数据 数百万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA 三种不同的空间转录组学方法
6993 2025-11-09
Bone marrow-derived emergency monopoiesis drives brain-lung axis injury after traumatic brain injury via IL-1
2025-Nov-05, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 本研究揭示了创伤性脑损伤后骨髓来源的紧急单核细胞生成通过IL-1驱动脑-肺轴损伤的机制 首次发现颅骨骨髓在TBI后24小时内发生IL-1驱动的紧急单核细胞生成,并阐明其作为多器官损伤核心驱动因素的新机制 NA 探索创伤性脑损伤引发外周器官损伤的机制基础 创伤性脑损伤患者和小鼠模型 单细胞生物学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6994 2025-11-09
Integrating genetics and transcriptome analyses identify potential biomarkers and immune interactions in metabolic syndrome-related sarcopenia
2025-Nov-05, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究通过整合遗传学和转录组学分析,识别代谢综合征相关肌肉减少症的潜在生物标志物和免疫相互作用 首次从遗传学角度揭示代谢综合征与肌肉减少症的共病机制,发现9个多效性基因作为潜在干预靶点 研究结果需要在更大样本和更多人群中进一步验证 探索代谢综合征与肌肉减少症之间的潜在机制和生物标志物 代谢综合征和肌肉减少症相关的遗传和转录组数据 生物信息学 代谢综合征和肌肉减少症 全基因组关联研究,连锁不平衡评分回归,孟德尔随机化,转录组范围关联研究,单细胞RNA测序 临床预测模型 遗传数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6995 2025-11-09
Harnessing multi-omics approaches to decipher tumor evolution and improve diagnosis and therapy in lung cancer
2025-Nov-05, Biomarker research IF:9.5Q1
综述 本文综述了多组学方法在解析肺癌肿瘤进化及改善诊疗中的应用前景 系统阐述多组学方法在构建肺癌生态系统全景中的整合应用价值 NA 探讨多组学方法在肺癌研究中的潜力与应用 肺癌肿瘤异质性与肿瘤微环境 生物信息学 肺癌 全基因组测序,单细胞测序,空间转录组学 多组学整合模型 多组学数据 NA NA 单细胞测序,空间转录组学 NA NA
6996 2025-11-09
In vitro derivation of midbrain dopaminergic neurons from porcine embryonic stem cells in multi-dimensional conditions
2025-Nov-05, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1
研究论文 本研究建立了从猪胚胎干细胞在二维和三维条件下高效分化中脑多巴胺能神经元的物种优化方案 首次建立了从猪干细胞生成功能验证的中脑多巴胺能神经元和中脑类器官的稳健平台,揭示了物种特异性信号动态 仅使用猪胚胎干细胞进行研究,未与其他物种进行直接比较 建立物种优化的条件,从猪胚胎干细胞在二维和三维环境中衍生功能性中脑多巴胺能神经元 体外受精和孤雌生殖激活来源的猪胚胎干细胞 干细胞生物学 神经系统疾病 免疫荧光、膜片钳电生理学、微电极阵列记录、多巴胺ELISA、RNA测序 NA 基因表达数据、电生理数据、蛋白质数据 猪胚胎干细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6997 2025-11-09
The molecular complexity of deep vein thrombosis was preliminarily explored based on the ceRNA network, scRNA-seq and AlphaFold 2
2025-Nov-04, BMC medical genomics IF:2.1Q3
研究论文 本研究通过ceRNA网络、单细胞RNA测序和AlphaFold 2技术初步探索深静脉血栓形成的分子复杂性 首次结合ceRNA网络构建、多种PPI网络算法、AlphaFold 2结构预测和单细胞RNA测序技术系统研究深静脉血栓的分子机制 样本量较小(内部测试集10例,外部验证集14例,单细胞测序6例),需要更大规模研究验证 识别与深静脉血栓相关的高度特异性基因并研究其复杂性 深静脉血栓患者和健康对照者的血液样本 生物信息学 深静脉血栓 单细胞RNA测序, 全转录组分析, 蛋白质结构预测 ceRNA网络模型, PPI网络分析 RNA测序数据, 基因表达数据 内部测试集10例(4例患者+6例对照),外部验证集14例,单细胞测序6例(3例患者+3例对照) NA 单细胞RNA测序, 全转录组测序 NA NA
6998 2025-11-09
USP2-mediated PPARγ stabilization promotes hepatocellular carcinoma progression and M2 macrophage polarization via oleic acid
2025-Nov-04, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究揭示USP2通过稳定PPARγ促进肝癌进展和M2巨噬细胞极化的分子机制 首次发现USP2通过去泛素化稳定PPARγ,促进脂肪酸合成和油酸产生,进而驱动M2巨噬细胞极化的新机制 研究主要基于体外模型和动物实验,需要进一步临床验证 探索USP2在肝细胞癌进展和肿瘤微环境调控中的作用机制 肝癌患者来源类器官、肝癌细胞系、动物模型和巨噬细胞 癌症生物学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫共沉淀、CUT&RUN、ELISA、质谱分析 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、代谢数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6999 2025-11-09
Emodin Alleviates Sepsis-Induced Multiorgan Damage by Inhibiting NETosis through Targeting Neutrophils BCL-10
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究揭示大黄素通过靶向中性粒细胞BCL-10抑制NETosis,缓解脓毒症引起的多器官损伤 首次发现大黄素可直接靶向BCL-10蛋白,通过调节BCL-10/MALT1复合物抑制NF-κB信号通路和NETs形成 NA 探究大黄素在脓毒症中对多器官保护作用的分子机制 中性粒细胞及其NETs形成过程 分子生物学 脓毒症 蛋白质微阵列,表面等离子共振,分子对接,单细胞测序 NA 体外实验数据,体内实验数据,蛋白质相互作用数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
7000 2025-11-09
HLA-A*02:01 Presents Penicillin-Modified Cysteinylated Peptides for T Cell Recognition
2025-Nov, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究揭示HLA-A*02:01通过半胱氨酸修饰呈递青霉素修饰肽段激活T细胞反应的分子机制 首次发现青霉素优先修饰HLA肽段中的半胱氨酸残基,并证实通过二硫键介导的肽段修饰机制可诱导T细胞识别 研究仅聚焦于HLA-A*02:01单倍型和青霉素特异性反应,未涵盖其他HLA类型或β-内酰胺类药物 阐明青霉素诱导T细胞介导过敏反应的分子机制 HLA-A*02:01呈递的青霉素修饰肽段及患者来源的青霉素特异性T细胞 免疫学 药物过敏 免疫肽组学、单细胞测序、报告细胞系检测 NA 蛋白质组数据、单细胞TCR序列数据 过敏患者来源的CD8+ T细胞 NA 单细胞测序 NA NA
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