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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 681 - 700 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
681 2026-09-04
Multiscale hyperbolic embedding reveals hierarchical structure in complex biological systems
2026-Jun-02, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1
研究论文 引入多尺度双曲嵌入算法MuH-MDS,用于揭示复杂生物系统中的层级结构,并提升图谱推断和谱系重建的准确性。 采用绝热优化策略,通过固定簇质心、迭代优化局部位置,计算加速十倍,可处理超过8万样本的数据集,并在保持局部细节与全局层级的同时提供度量保真。 摘要中未提及明显的局限性。 开发可扩展且度量保真的多尺度双曲嵌入方法,以支持大规模生物数据集的层级结构可视化与定量解释。 多种基准数据集,包括秀丽隐杆线虫胚胎发生的单细胞RNA测序数据。 机器学习 NA 单细胞RNA测序 多尺度双曲多维缩放(MuH-MDS) 单细胞RNA测序表达数据 超过80,000个样本(用于评估计算扩展性);具体样本组成未详述 NA 单细胞RNA测序 NA NA
682 2026-09-04
Proteome-wide genetic study identified therapeutic targets for early-onset and late-onset Alzheimer's disease
2026-Jun, International journal of surgery (London, England)
研究论文 通过蛋白质组范围的孟德尔随机化等方法,识别早发性和晚发性阿尔茨海默病的治疗靶点 首次系统比较早发性与晚发性阿尔茨海默病的蛋白质组遗传证据,并利用分子对接和动态模拟验证药物靶点 研究结果基于遗传预测,需要进一步的实验验证 识别早发性和晚发性阿尔茨海默病特异性的治疗靶点 早发性和晚发性阿尔茨海默病相关的循环蛋白质 遗传学 阿尔茨海默病 孟德尔随机化、共定位分析、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 NA 蛋白质组数据和遗传数据 未提供具体样本量 NA 蛋白质组学、单细胞RNA测序 NA NA
683 2026-09-04
Intestinal epithelial PIEZO1 regulates macrophage-to-myofibroblast transition via epithelial-derived TGF-α signaling in Crohn's disease
2026-05-28, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了克罗恩病中肠道上皮细胞PIEZO1通过上皮来源的TGF-α信号调控巨噬细胞向肌成纤维细胞转化(MMT)的作用,表明其促进肠道纤维化。 首次揭示上皮细胞PIEZO1通过TGF-α介导的信号通路调节MMT,进而影响CD相关肠纤维化,并机械性阐明涉及PKA/NF-κB P65通路。 未提供明确的局限性信息,但可能包括样本量有限或动物模型与人类病理差异。 阐明肠道上皮细胞PIEZO1是否及如何通过MMT调控CD中的肠纤维化。 克罗恩病患者肠道组织样本、小鼠DSS诱导的慢性结肠炎相关纤维化模型、肠道上皮细胞及巨噬细胞培养。 数字病理学 克罗恩病 蛋白质印迹法、实时PCR、Masson三色染色、免疫荧光、免疫共沉淀、单细胞RNA测序、ELISA NA 图像、基因表达、蛋白质数据 未明确患者或小鼠样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
684 2026-09-04
Targeting Oncomucin-Driven Immunosuppression Improves the Efficacy of K-rasG12D Inhibition in Pancreatic Cancer
2026-May-25, Gastroenterology IF:25.7Q1
研究论文 研究致癌性黏蛋白(MUC4、MUC16、MUC5AC)在胰腺导管腺癌中的免疫抑制机制,并评估其靶向治疗与K-rasG12D抑制剂联合应用的疗效。 首次系统阐明跨膜致癌黏蛋白通过EGFR/UNC5B信号通路协同促进免疫逃逸,并证明靶向这些黏蛋白可增强K-rasG12D抑制剂的抗肿瘤效果,提出其作为新的免疫治疗靶点。 研究主要依赖小鼠模型和体外实验,临床验证数据有限,且未深入探讨不同黏蛋白亚群间的冗余或补偿机制。 评估致癌黏蛋白(oncoMUCs)对胰腺癌肿瘤微环境和免疫抑制的影响,并测试联合靶向策略在K-rasG12D抑制治疗中的作用。 胰腺导管腺癌患者的肿瘤样本、小鼠胰腺癌模型(自发性肿瘤),以及单细胞RNA测序数据。 免疫学及肿瘤微环境研究 胰腺癌 单细胞RNA测序、多重/顺序免疫染色、NanoString基因表达谱分析、基因沉默、药物处理 同基因小鼠胰腺癌模型 单细胞转录组数据、组织切片图像、基因表达数据 34例PDAC患者的单细胞RNA测序样本,以及多种同基因小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
685 2026-09-04
Durvalumab plus HAIC-FOLFOX followed by maintenance durvalumab for hepatocellular carcinoma with major portal invasion: phase 2 DurHope study
2026-May-18, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 一项单臂二期研究,评估度伐利尤单抗联合肝动脉灌注化疗(HAIC-FOLFOX)并维持度伐利尤单抗治疗伴有门静脉主干浸润(Vp3/4)的肝细胞癌患者的疗效和安全性 首次针对Vp4门静脉癌栓的肝细胞癌患者,评估度伐利尤单抗联合HAIC-FOLFOX作为一线治疗的疗效,并通过单核RNA测序等探索性分析发现潜在的疗效预测生物标志物 单臂设计、样本量小(30例),缺乏对照组,且生物标志物分析为事后探索性研究,需要进一步验证 评估度伐利尤单抗联合HAIC-FOLFOX作为一线治疗在伴有Vp3/4门静脉癌栓的肝细胞癌患者中的疗效和安全性,并探索潜在的生物标志物 伴有Vp3/4门静脉癌栓的肝细胞癌患者 机器学习 肝细胞癌 单核RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化 NA 基因表达数据, 图像 30例患者 10x Genomics 单核RNA测序, 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于肿瘤组织单核RNA测序和外周血单细胞RNA测序
686 2026-09-04
Single-cell resolution spatial transcriptomic signature of the retrosplenial cortex during memory consolidation
2026-Apr, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术解析了记忆巩固过程中压后皮层(RSC)的分子特征,并揭示了兴奋性神经元在空间记忆巩固中的关键作用 首次在单细胞分辨率下运用空间转录组学(包括靶向和非靶向方法)识别了RSC在空间记忆巩固早期时间窗口的转录特征,并结合深度学习工具和化学遗传学方法验证了RSC兴奋性神经元的功能 研究主要基于小鼠模型,可能不直接适用于人类;阿尔茨海默病模型中的观察可能仅限于特定的tau病理阶段;空间转录组学的检测范围有限 解析记忆巩固过程中RSC的神经元亚型及层特异性的转录组特征,并探究RSC兴奋性神经元对空间记忆巩固的贡献 成年小鼠的压后皮层(RSC),包括兴奋性神经元亚型和不同层状结构 转录组学 阿尔茨海默病及相关痴呆 空间转录组学、深度学习、化学遗传学 深度学习模型 空间转录组数据 多项小鼠实验,包括野生型和ADRD模型小鼠,具体数量未在标题和摘要中提供 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组学技术用于单细胞分辨率分析
687 2026-09-04
Postnatal upregulation of cyclooxygenase-2 (COX-2) drives anatomical closure of the ductus arteriosus
2026-04-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示出生后动脉导管平滑肌细胞中COX-2的上调驱动解剖性关闭的机制 首次通过单细胞RNA测序揭示出生后动脉导管平滑肌细胞形成独特的转录簇,并确定COX-2是驱动出生后动脉导管重塑的关键分子 研究主要基于小鼠模型,COX-2在人类动脉导管关闭中的作用需进一步验证;具体涉及的机制尚不明确 阐明出生后驱动动脉导管解剖性关闭的分子机制 出生前后小鼠动脉导管平滑肌细胞及其他细胞类型 基因组学 动脉导管未闭 单细胞RNA测序 单细胞转录组数据 小鼠动脉导管组织样本(数量未明确) NA 单细胞RNA测序 NA NA
688 2026-09-04
Single-cell mapping of tumor-driven macrophage reprogramming via ETV4-MC1R underlies immunotherapy resistance in colorectal cancer
2026-Apr, International journal of surgery (London, England)
研究论文 通过单细胞RNA测序,解析结直肠癌PD-1耐药相关的ETV4-MC1R信号轴及其对巨噬细胞重编程的驱动作用,提出联合治疗策略。 首次在单细胞水平重建MSI-H结直肠癌PD-1耐药的基因调控网络,揭示肿瘤内在ETV4-MC1R轴通过诱导M2巨噬细胞极化介导免疫逃逸的新机制,并验证了联合靶向该轴与抗PD-1治疗的协同抗肿瘤效果。 样本量较小(仅6例患者),且未在更大队列或不同肿瘤类型中验证发现。 阐明结直肠癌中PD-1耐药相关的基因调控网络和关键转录因子,探索克服免疫治疗耐药的新靶点。 PD-1耐药和敏感的MSI-H转移性结直肠癌肿瘤样本及其单细胞转录组数据。 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 机器学习模型(具体模型类型未明确) 单细胞转录组数据、双荧光素酶报告实验、染色质免疫沉淀、体外共培养实验和体内动物实验数据 3例PD-1耐药和3例PD-1敏感的MSI-H转移性结直肠癌患者的肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
689 2026-09-04
ESPeR-seq: Extremely Sensitive and Pure, End-to-end, RNA-seq library preparation
2026-Mar-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍ESPeR-seq,一种高灵敏度、纯净的全长单细胞RNA-seq文库制备新方法,解决非特异性PCR产物、无法精确捕获转录末端和幻影UMI等问题 提出Omega-dT引物实现精确链特异性TES捕获,利用含尿嘧啶的TSO和尿嘧啶不耐受DNA聚合酶建立生化多锁机制消除PCR背景和幻影UMI,并引入logQ-slope指标诊断UMI保真度 未明确提及局限,可能包括对特定样本或技术的依赖,但摘要中无相关信息 开发一种能够实现绝对定量准确性和全长异构体分辨率的单细胞RNA-seq测序方法 单细胞RNA转录本,具体包括基因模型重建、新型多外显子基因、未注释3'UTR扩展和候选eRNA等 自然语言处理 不适用,未涉及特定疾病 RNA-seq NA 测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
690 2026-09-04
STEVE: Single-cell Transcriptomics Expression Visualization and Evaluation
2026-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出STEVE框架,用于评估单细胞RNA测序中细胞类型注释的准确性、稳健性和可重复性。 首次提出数据集特异性的系统性框架来评估注释稳健性,包含三个互补模块:子采样评估、新细胞评估和注释基准测试。 未提及具体限制,但可能受限于评估数据集的数量和类型。 开发一个定量框架来评估scRNA-seq研究中细胞类型注释的准确性、稳健性和可重复性。 四个独立的scRNA-seq数据集,具有实验定义或专家管理的细胞类型标签。 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 概率模型 基因表达数据 四个独立scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
691 2026-09-04
Senescent Mesenchymal Stromal Cells Differentially Alter Adipogenesis in Adipose Tissue, Skeletal Muscle, and Bone Marrow
2026-Mar, Obesity (Silver Spring, Md.)
研究论文 本研究探讨衰老间充质基质细胞如何差异性调节脂肪组织、骨骼肌和骨髓中的脂肪生成 揭示了衰老间充质基质细胞通过旁分泌作用以组织特异性方式调节脂肪生成,而非细胞自主机制,为年龄相关的脂肪再分布提供了新见解 未明确指出,可能包括体外实验的局限性或需要体内验证 研究间充质基质细胞衰老如何调节脂肪生成,以理解年龄相关的脂肪再分布机制 小鼠骨骼肌、脂肪组织和骨髓中的原代间充质基质细胞 细胞生物学、衰老研究 老年性疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
692 2026-09-04
Novel association of NAV3 with dilated cardiomyopathy and its role in cardiac fibrosis
2026-03-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 本研究通过多组学方法揭示了NAV3与扩张型心肌病的关联及其在心脏纤维化中的功能性作用 首次发现NAV3在TGF-β1驱动的心脏成纤维细胞活化中的未知作用,且其通过非经典信号通路和细胞周期停滞促进促纤维化重塑,不依赖SMAD2/3 摘要中未提及研究的局限性 探究NAV3在心脏病理生理中的功能作用,特别是其在心脏纤维化和扩张型心肌病心肌恢复中的潜在调节作用 成人心脏组织单细胞RNA-seq数据及原代人心室心脏成纤维细胞 机器学习 扩张型心肌病 单细胞RNA测序、RNA测序、小干扰RNA介导的基因敲低、蛋白质印迹 不适用 基因表达数据、蛋白质表达数据 未明确提及样本量 不适用 单细胞RNA测序、批量RNA测序 不适用 不适用
693 2026-09-04
Comprehensive transcriptomics and proteomics analysis of neointima formation in human saphenous vein: implications for bypass graft disease
2026-02-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
研究论文 对人隐静脉新生内膜形成的转录组和蛋白质组进行综合分析,揭示其分子和细胞动态变化及其与旁路移植疾病的关系 首次整合转录组学和蛋白质组学分析人隐静脉新生内膜形成,并利用空间转录组学揭示成纤维细胞和血管平滑肌细胞的新状态,发现性别和体重指数相关的差异以及MIR647在维持血管收缩表型中的作用 信息不足于标题和摘要,无法明确说明局限性 阐明人隐静脉新生内膜形成的转录组和蛋白质组动态变化,为隐静脉移植疾病提供机制性见解 人体隐静脉样本,来自冠状动脉旁路移植手术的72名患者 转录组学, 蛋白质组学 冠心病, 移植物疾病 RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学分析 NA 基因表达数据, 蛋白质数据, 空间表达数据 72名患者的隐静脉样本 NA RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
694 2026-09-04
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2026-01-08, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 通过批量RNA测序和空间转录组学,识别与肉芽肿性肌炎疾病活动相关的独特基因表达特征,并验证CHIT1作为疾病严重程度的潜在标志物 首次系统描述了肉芽肿性肌炎的转录组特征,并识别出一个包含1293个上调基因和256个下调基因的疾病特异性基因签名,其中CHIT1为最显著上调基因,其表达与疾病严重性密切相关,并在肉芽肿和巨细胞中验证 样本中肉芽肿性肌炎病例数相对较少,且未提及多中心外部验证或纵向研究来评估基因签名的稳定性和预测价值 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制,通过转录组分析定义其特异性的基因表达谱 722例肌肉活检样本,包括38例肉芽肿性肌炎、其他肌病及健康对照 转录组学 肉芽肿性肌炎 批量RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 支持向量机 转录组数据, 空间转录组数据, 免疫组织化学图像 722例肌肉活检(其中肉芽肿性肌炎38例) NA 批量RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
695 2026-09-04
Integrating single-cell transcriptomics with deep learning for glioblastoma treatment
2026, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
综述 本文综述了如何将单细胞转录组学与深度学习相结合,以改善胶质母细胞瘤的治疗,重点关注识别治疗耐药性、评估现有模型及解决数据可用性问题 创新性地讨论了将scRNA-seq与深度学习结合用于胶质母细胞瘤治疗,提出通过计算模型处理海量数据以提供精确治疗建议 未明确提及局限性,但指出患者scRNA-seq数据可用性有限是需要克服的挑战 解释如何利用scRNA-seq识别胶质母细胞瘤治疗耐药关键区域,评估基于scRNA-seq的深度学习模型,并概述相关训练数据集 胶质母细胞瘤患者及其scRNA-seq数据 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序 深度学习模型 文本和单细胞转录组数据 未在标题和摘要中提供具体样本量 未明确提及 单细胞RNA测序 NA NA
696 2026-09-04
Myeloma-derived exosomal circ_0002724 promotes osteoclastogenesis through a miR-4753-3p/IFIT1 and RANK axis in myeloma bone disease
2026, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 该研究探讨了骨髓瘤来源的外泌体circ_0002724通过miR-4753-3p/IFIT1和RANK轴促进骨髓瘤骨病中破骨细胞生成的作用 首次揭示骨髓瘤细胞外泌体circ_0002724在骨髓瘤骨病中通过调控miR-4753-3p/IFIT1和RANK网络促进破骨细胞生成,提出circ_0002724作为潜在生物标志物和治疗靶点 未提及明确的局限性 阐明骨髓瘤细胞外泌体circRNA在骨髓瘤骨病破骨细胞过度激活中的作用机制 U266和MM1S骨髓瘤细胞系、THP-1细胞、骨髓瘤骨病患者血液及骨髓活检样本 数字病理学 多发性骨髓瘤骨病 circRNA测序, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, RNA-FISH/IF, 双荧光素酶报告基因实验, 免疫组化 NA 测序数据, 基因表达数据, 图像 NA NA circRNA测序, 单细胞RNA-seq NA NA
697 2026-09-04
Multi-omics integration identifies APOE as a metabolic regulator of macrophage-fibroblast crosstalk in idiopathic pulmonary fibrosis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学整合分析,确定了APOE作为特发性肺纤维化中巨噬细胞-成纤维细胞串扰的代谢调节因子 首次将阿尔茨海默病与特发性肺纤维化进行孟德尔随机化分析,并结合单细胞RNA测序和虚拟敲除技术,揭示APOE在巨噬细胞促纤维化极化中的保护作用 结果主要基于计算分析和体外实验,缺乏体内验证;且样本量有限,需进一步临床研究确认 探究阿尔茨海默病相关基因APOE在特发性肺纤维化巨噬细胞-成纤维细胞相互作用中的因果作用 特发性肺纤维化患者的单细胞转录组数据(GSE122960)及THP-1巨噬细胞和MRC-5成纤维细胞共培养模型 计算生物学、多组学整合、数字病理学 特发性肺纤维化、阿尔茨海默病 孟德尔随机化、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质相互作用网络分析、虚拟敲除(scTenifoldKnk)、体外基因沉默 CellChat、Monocle 3、scTenifoldKnk 遗传数据、单细胞转录组数据、体外实验数据 基于公共数据集GSE122960的未知患者数量及体外THP-1和MRC-5细胞实验 NA 单细胞RNA-seq NA NA
698 2026-09-04
Integrated single-cell and experimental analyses implicate GPRC5B in macrophage senescence-related alterations in postmenopausal osteoporosis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 该研究整合单细胞和转录组分析,结合机器学习与实验验证,发现GPRC5B在绝经后骨质疏松症巨噬细胞衰老相关改变中发挥作用 首次通过整合单细胞测序、机器学习和实验验证,识别GPRC5B为绝经后骨质疏松症相关候选基因,并揭示其通过DLG1/Kv1.3信号轴调控巨噬细胞衰老和极化 初步功能实验支持GPRC5B的作用,但其具体机制和转化潜力仍需进一步研究 阐明绝经后骨质疏松症中巨噬细胞衰老相关的分子改变,并识别潜在治疗靶点 绝经后骨质疏松症小鼠模型、原代骨髓来源巨噬细胞和RAW264.7细胞 机器学习 骨质疏松症 单细胞RNA测序、转录组分析 机器学习模型(具体未指定) 单细胞转录组数据、基因表达数据 小鼠模型和细胞系样本(具体数量未提供) NA 单细胞RNA测序 NA NA
699 2026-09-04
Single-cell transcriptomics identifies a putative perivascular macrophage-endothelial MIF-ACKR3 axis associated with endothelial activation in acute traumatic brain injury
2026, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
research paper 本研究通过单细胞转录组学识别出急性创伤性脑损伤中一个与内皮激活相关的血管周围巨噬细胞-内皮MIF-ACKR3轴 首次系统性地揭示了急性创伤性脑损伤中血管周围巨噬细胞与内皮细胞之间的MIF-ACKR3信号轴,并验证了其在内皮激活中的潜在作用 对血脑屏障完整性的直接功能影响及体内相关性尚需进一步验证 探讨急性创伤性脑损伤中血管周围巨噬细胞在脑内皮激活中的作用机制 小鼠急性创伤性脑损伤模型中的免疫和血管细胞群体 单细胞转录组学 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 公开小鼠数据集GSE290150(24小时创伤后) NA 单细胞RNA测序 NA NA
700 2026-09-04
Basophil-specific deletion of interleukin 15 impairs memory CD8+ T cell homeostasis in the bone marrow
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
research paper 通过单细胞RNA测序和细胞因子敲入报告小鼠,发现嗜碱性粒细胞是骨髓中表达IL-15最高的免疫细胞群体,其条件性删除IL-15会损害记忆CD8+ T细胞的稳态维持 首次揭示嗜碱性粒细胞是骨髓中IL-15的主要来源,并特异性支持记忆CD8+ T细胞的维持,而非其他IL-15依赖性免疫细胞 研究主要基于小鼠模型,可能不完全适用于人类;尚不清楚嗜碱性粒细胞来源的IL-15在病理条件下的作用 明确骨髓中嗜碱性粒细胞在稳态条件下对免疫细胞,特别是记忆CD8+ T细胞维持的生理功能 小鼠骨髓中的嗜碱性粒细胞、CD8+ T细胞(包括中央记忆和CD69组织驻留记忆细胞)、NK和NKT细胞 免疫学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 小鼠(具体数量未提供) 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序
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