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当前共找到 40234 篇文献,本页显示第 681 - 700 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
681 2026-06-05
A comprehensive benchmarking study on computational tools for cross-omics label transfer from single-cell RNA to ATAC data
2026-Apr-01, G3 (Bethesda, Md.)
研究论文 本研究对从单细胞RNA数据到ATAC数据的跨组学标签转移的计算工具进行了全面的基准测试评估 首次系统评估了27种计算工具在scRNA-seq到scATAC-seq标签转移中的性能,并揭示了数据不平衡、跨组学差异等因素对模型性能的影响 未对所有方法进行所有可能的数据场景测试,且基准测试结果可能受限于所选数据集和评估指标 评估现有计算工具在scRNA-seq到scATAC-seq跨组学标签转移中的性能,为未来方法开发提供建议 27种计算工具在人类和小鼠组织单细胞RNA和ATAC数据上的标签转移任务 机器学习 NA scRNA-seq, scATAC-seq Bridge, GLUE, bindSC等深度学习模型 单细胞RNA和ATAC测序数据 多种人类和小鼠组织样本 NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
682 2026-06-05
Engineered TIGIT-Blockade Membrane Vesicles Synergize with Microwave Ablation to Mediate Liver Metastases Eradication
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序揭示微波消融治疗后过渡区的免疫抑制微环境,并开发工程化TIGIT阻断膜囊泡,协同微波消融实现肝转移的根除 首次开发了封装贝伐珠单抗的工程化膜囊泡(Bev@TPNVs),融合TIGIT表达膜和血小板膜,能特异性靶向肝脏和过渡区,抑制新生血管并恢复CD8 T细胞抗肿瘤功能 文章未提及明显局限性 开发一种新型联合免疫疗法,以消除微波消融后肝转移复发 实验性肝转移小鼠模型中的肿瘤微环境及过渡区免疫细胞 机器学习 肝转移 单细胞RNA测序, 流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 基于实验性肝转移小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
683 2026-06-05
Multi-omics reveals hepatotoxic mechanisms and key toxic components of Polygoni Multiflori Radix and its processed products
2026-Apr, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1
研究论文 综合多组学方法揭示何首乌及其炮制品的肝毒性机制和关键毒性成分 首次整合非靶向血清代谢组学、肝脏空间转录组学和肝脏空间代谢组学来阐明肝毒性机制 未提及 阐明何首乌及其炮制品的肝毒性过程并识别主要毒性成分 何首乌及其炮制品 机器学习和计算生物学 肝毒性、胆汁淤积 非靶向代谢组学、空间转录组学、空间代谢组学、质谱分析、细胞毒性测试 NA 文本、图像(空间数据) 未提及具体样本数量 NA 空间转录组学、空间代谢组学、非靶向代谢组学 NA NA
684 2026-06-05
Bioinformatics approach to identifying molecular targets of Danlou tablet against atherosclerosis: a machine learning pharmacology study
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 采用网络药理学、生物信息学、单细胞RNA测序、机器学习、分子对接和分子动力学模拟等方法,鉴定丹蒌片抗动脉粥样硬化的分子靶点 首次整合多种计算和实验方法,提出HAS2作为丹蒌片中β-谷甾醇抗动脉粥样硬化的新候选靶点 实验验证仅限于初步靶点结合(CETSA和ELISA),缺乏体内功能实验验证机制假说 鉴定丹蒌片治疗动脉粥样硬化的新分子靶点并生成机制假说 丹蒌片生物活性成分、动脉粥样硬化相关靶点、人脐静脉内皮细胞 机器学习 动脉粥样硬化 NGS, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, CETSA, ELISA 机器学习算法 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
685 2026-06-05
Metabolic surgery mitigates early kidney injury in obese youth with diabetes by suppressing mTORC1/JAK/STAT signaling
2026-Apr-01, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 代谢手术通过抑制mTORC1/JAK/STAT信号通路减轻肥胖青少年糖尿病早期肾损伤 首次通过配对分析结合单细胞RNA测序,揭示垂直袖状胃切除术后肾脏在结构和分子层面的适应性改变,并明确mTORC1/JAK/STAT信号通路在其中的关键作用 样本量较小(5名青少年),且研究仅针对垂直袖状胃切除术一种手术方式,结果可能不适用于其他代谢手术类型 探究垂直袖状胃切除术对肥胖2型糖尿病青少年肾脏的结构和分子变化及其机制 患有2型糖尿病和肥胖的青少年 机器学习 糖尿病肾病 单细胞RNA测序 NA 转录组数据、蛋白质组数据 5名肥胖2型糖尿病青少年(配对分析),以及独立队列中64名青少年 NA 单细胞RNA测序 NA NA
686 2026-06-05
Comprehensive bioinformatic analysis and experimental validation identify MT1M and MT1X as key metallothioneins in BC pathogenesis
2026-Apr, Journal of trace elements in medicine and biology : organ of the Society for Minerals and Trace Elements (GMS) IF:3.6Q2
研究论文 通过综合生物信息学分析与实验验证,揭示MT1M和MT1X作为乳腺癌发病机制中的关键金属硫蛋白 首次整合多个数据集和多种机器学习方法,系统识别并验证MT1M和MT1X在乳腺癌中的核心作用,结合单细胞测序和空间转录组学分析其表达模式 研究依赖于公共数据集,样本量有限;功能验证仅限于体外实验,缺乏体内模型验证 探索金属硫蛋白相关基因在乳腺癌发病机制中的作用及其作为治疗靶点的潜力 乳腺癌患者的组织样本和细胞系 数字病理学 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, PCR, Western blot LASSO回归, 随机森林, 逻辑回归 图像, 文本 两个乳腺癌数据集GSE42568和GSE29044 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序, 10x Visium空间基因表达
687 2026-06-05
Coronary artery disease risk gene PRDM16 regulates smooth muscle homeostasis
2026-Apr, Journal of molecular and cellular cardiology IF:4.9Q2
研究论文 本文发现冠心病风险基因PRDM16在血管平滑肌细胞中高度表达,并通过抑制Tgfb2表达调控平滑肌稳态和新生内膜形成 首次发现PRDM16在血管平滑肌细胞中的功能,并揭示其通过抑制Tgfb2启动子活性调控TGF-β信号通路的分子机制 仅在雄性小鼠中观察到表型,且未在人类样本中验证PRDM16与冠心病因果关系的直接证据 筛选动脉组织中超级增强子调控的转录因子,鉴定血管平滑肌稳态的新型调控因子 人动脉组织、小鼠血管平滑肌细胞和小鼠模型 基因组学 冠心病 ChIP-seq, RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, Western blotting NA 基因表达数据, 测序数据, 组织学图像 多个人动脉组织样本、PRDM16条件性敲除和组成性敲除小鼠模型(含假手术和左颈动脉结扎处理组) Illumina Bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq Illumina NovaSeq(推测) 用于ChIP-seq的H3K27ac抗体富集、RNA-seq文库构建(具体平台未详细说明)
688 2026-06-05
Pre-operative risk assessment of hepatocellular carcinoma recurrence in liver transplant recipients by non-invasive detection of pre-existing genetic lesions
2026-Apr, Clinical and molecular hepatology IF:14.0Q1
研究论文 开发基于液体活检的肝移植前肝细胞癌复发风险评估模型 结合cfDNA拷贝数改变特征与单细胞转录组数据,追溯复发相关cfDNA来源,并构建整合cfDNA特征与临床指标的ZJU标准预测工具 未明确说明样本量较小或外部验证局限性,但研究涉及多中心、多组学分析 开发基于液体活检的术前风险分层模型,用于预测肝细胞癌移植后复发 260名来自三个中心的肝细胞癌患者 机器学习 肝细胞癌 低覆盖全基因组测序、全外显子测序、单核RNA测序、空间转录组学 NA 测序数据、临床数据、转录组数据 260名肝细胞癌患者 NA cfDNA测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 NA 低覆盖全基因组测序用于cfDNA,单核RNA测序和空间转录组测序用于匹配组织
689 2026-06-05
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
研究论文 通过多组学分析,系统表征苯并[a]芘毒性网络,鉴定出头颈部鳞状细胞癌中SERPINE1和STK3作为预后标志物和治疗靶点 首次整合空间转录组学、单细胞RNA测序和机器学习,系统解析BaP诱导的头颈部鳞状细胞癌毒性网络及程序性细胞死亡机制,鉴定SERPINE1和STK3作为核心毒性介质和预后标志物 未在独立大样本队列中验证生物标志物的临床实用性;分子动力学模拟和分子对接结果需进一步实验验证;BaP与靶点蛋白的相互作用的体内证据不足 阐明苯并[a]芘诱导头颈部鳞状细胞癌毒性的分子网络及其与程序性细胞死亡的关系,鉴定新的预后标志物和治疗靶点 头颈部鳞状细胞癌组织样本及BaP毒性靶点 机器学习、数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 空间转录组、scRNA-seq、分子对接、分子动力学模拟、GSEA RF、SVM 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 GSE30784数据集(HNSC样本数未明确)、TCGA-HNSC队列(样本数未明确) Illumina(推测) 空间转录组学、单细胞RNA测序 10x Visium(推测)、10x Chromium(推测) NA(摘要未提供具体平台配置细节)
690 2026-06-05
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology IF:4.8Q1
research paper 本文揭示HSPB1通过CCL20-CCR6轴调控Treg细胞募集,抑制其表达可双重抑制结直肠癌肿瘤生长并逆转免疫抑制微环境 首次利用单细胞RNA-seq和空间转录组学联合分析鉴定HSPB1作为肿瘤内Treg/CD8+ T细胞比例的关键调控因子,并揭示其通过CCL20-CCR6轴调控Treg募集的新机制 研究主要基于小鼠皮下肿瘤模型,人源肿瘤样本及临床转化验证有限 阐明结直肠癌中HSPB1调控肿瘤内Treg/CD8+ T细胞比例及免疫抑制微环境的分子机制 HSPB1基因、Treg细胞、CD8+ T细胞、结直肠癌肿瘤微环境 machine learning, digital pathology colorectal cancer single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, CRISPR-Cas9, bulk RNA-seq, flow cytometry NA single-cell gene expression data, spatial gene expression data, bulk RNA-seq data MC38和SW480细胞系的小鼠皮下肿瘤模型 10x Genomics, Illumina single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics, bulk RNA-seq 10x Chromium, 10x Visium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium FFPE, Illumina NovaSeq 6000
691 2026-06-05
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 研究揭示了成纤维细胞活化蛋白(FAP)通过非酶机制与PLAUR/ITGB1相互作用,促进促炎性巨噬细胞极化,从而驱动胸主动脉夹层(TAD)进展的关键机制 首次发现FAP通过非酶活性位点直接结合巨噬细胞PLAUR,激活ITGB1/FAK信号通路促进炎症性巨噬细胞极化,开辟了TAD靶向治疗的新途径 未明确说明,需原文补充 探究成纤维细胞活化蛋白(FAP)在胸主动脉夹层(TAD)发病机制中的作用及其分子机制 人TAD标本及β-氨基丙腈诱导的TAD小鼠模型 心血管疾病 胸主动脉夹层 RNA-seq, 单细胞RNA测序, 表面等离子共振(SPR), 免疫共沉淀(co-IP) NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 人TAD标本及基因敲除小鼠模型(具体样本量未明确) NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
692 2026-06-05
Fut8-Mediated Core Fucosylation of Toll-Like Receptor 4 Exacerbates Periodontitis Via Hyperactivation of NF-κB Signalling
2026-Apr, International dental journal IF:3.2Q1
研究论文 本研究揭示了核心岩藻糖基转移酶Fut8通过介导Toll样受体4的核心岩藻糖基化,过度激活NF-κB信号通路,从而加剧牙周炎 首次阐明Fut8在牙周炎中通过TLR4的核心岩藻糖基化调控NF-κB通路的作用机制,并验证了靶向抑制Fut8的治疗潜力 未提及具体局限性 探讨核心岩藻糖基化在牙周炎慢性炎症中的作用机制及治疗潜力 牙周炎患者和健康个体的牙龈样本、小鼠牙周炎模型、人牙龈成纤维细胞模型 数字病理学 牙周炎 转录组测序、单细胞测序、基因沉默、免疫共沉淀 NA 转录组数据、单细胞测序数据 牙周炎患者和健康个体的牙龈样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
693 2026-06-05
Aberrant medial ganglionic eminence (MGE) GABAergic neurogenesis contributes to Huntington's disease pathogenesis
2026-Apr, Neurobiology of disease IF:5.1Q1
研究论文 本研究探讨了内侧神经节隆起(MGE)GABA能神经发生异常在亨廷顿病(HD)发病机制中的作用 首次揭示MGE神经发生异常是HD发病的关键发育机制,并通过谱系特异性基因拯救实验证实其因果贡献 未提及 探究MGE来源的GABA能神经元发育异常对亨廷顿病发病的因果贡献 BACHD小鼠模型的胚胎及早期出生后阶段MGE来源的GABA能神经元 数字病理学 亨廷顿病 单细胞RNA测序,免疫组化分析,条件性基因敲除 NA 单细胞转录组数据,免疫组化图像 多个发育阶段的BACHD小鼠胚胎和出生后样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
694 2026-06-05
Single-cell atlas of the equine placenta reveals cellular heterogeneity and gestational-stage-associated programs
2026-Mar-25, Placenta IF:3.0Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序构建马胎盘全孕期的细胞图谱,揭示细胞异质性与妊娠阶段相关程序 首次提供马胎盘的高分辨率单细胞转录组图谱,揭示了滋养层、基质和霍夫鲍尔样细胞中此前未被识别的异质性 样本量较小(仅1例早期和2例足月胎盘),且未涵盖全部妊娠阶段 阐明马胎盘的细胞组成与发育动态,为比较胎盘生物学和妊娠疾病研究奠定基础 马(Equus caballus)胎盘绒毛膜尿囊组织 单细胞转录组学 妊娠相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 3例马胎盘(1例早期、2例足月) NA 单细胞RNA测序 NA NA
695 2026-06-05
scRNA-seq of preeclamptic trophoblasts identifies EBI3, COL17A1, miR-27a-5p, and miR-193b-5p as hypoxia markers: validation of neuradapt as a superior mimetic to cobalt chloride
2026-Mar-25, Placenta IF:3.0Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序分析先兆子痫胎盘滋养层细胞,鉴定EBI3、COL17A1、miR-27a-5p和miR-193b-5p为缺氧标志物,并验证Neuradapt比氯化钴更优的模拟效果 首次整合患者组织分析和体外模型,从单细胞水平鉴定出先兆子痫中共同的缺氧标志物,并发现Neuradapt能更准确地再现先兆子痫的转录组特征,优于传统氯化钴模型 未提及 探索先兆子痫中胎盘缺氧的分子标志物,并比较不同化学模拟物在体外模型中再现疾病基因谱的保真度 早发性先兆子痫(eoPE)和晚发性先兆子痫(loPE)患者的胎盘组织,以及BeWo b30滋养层细胞系 单细胞组学 先兆子痫 scRNA-seq, RNA-seq, small RNA-seq, qPCR NA 单细胞转录组数据,RNA-seq数据,小RNA测序数据 10例早发性先兆子痫、7例晚发性先兆子痫及其匹配对照胎盘样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
696 2026-06-05
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
综述 讨论microRNA在脑组织空间中的调控作用,特别是从3'UTR视角分析当前空间转录组学在量化miRNA及其靶点方面的挑战与未来方向 首次从3'UTR角度全面综述miRNA在脑组织空间中的调控机制,并提出尚无方法能同时量化miRNA及其靶3'UTR的空间分布,强调了3'UTR异构体空间变异的重要性 未提供具体实验数据或验证结果,仅基于现有文献总结并提出未来研究方向 探讨miRNA介导的调控在神经发育和神经元功能中的空间组织机制,并总结当前空间量化方法及挑战 脑组织中的miRNA和3'UTR异构体 数字病理学 老年性疾病 空间转录组学 NA 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
697 2026-06-05
Myd88 and Sqstm1 as novel biomarkers for pyroptosis-driven immune checkpoint inhibitors-related myocarditis
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序鉴定Myd88和Sqstm1作为免疫检查点抑制剂相关心肌炎中细胞焦亡的关键基因,并验证其表达水平和诊断价值 首次揭示Myd88和Sqstm1作为细胞焦亡驱动的新型生物标志物在免疫检查点抑制剂相关心肌炎中的作用 NA 表征免疫检查点抑制剂相关心肌炎中介导细胞焦亡的关键基因 免疫检查点抑制剂相关心肌炎患者和小鼠模型 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
698 2026-06-05
Immune triad microenvironments define coordinated activation architecture in psoriatic disease
2026-Mar-15, International immunopharmacology IF:4.8Q1
研究论文 该研究通过整合外周血CITE-seq和空间转录组学数据,定义了银屑病中三种免疫三元组(DC-T-NK、单核细胞-中性粒细胞-MAIT细胞及单核细胞-MAIT-中性粒细胞三元组)的协调活化架构 首次提出免疫三元组概念作为分析银屑病炎症组织架构的统一框架,并揭示其系统性活化同步性及在表皮中的主导定位 研究尚未在更大规模队列或纵向样本中验证三元组的动态变化及因果关系 探究银屑病中免疫细胞三元组的空间分布和活化模式及其与炎症严重程度的关联 银屑病患者的组织样本和外周血样本 数字病理学 银屑病 CITE-seq, 空间转录组学 NA 基因表达数据, 空间转录组数据 涉及银屑病患者的组织及外周血样本(具体数量未提及) NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 使用CITE-seq进行外周血免疫分析,空间转录组学揭示组织微环境中的三元组定位
699 2026-06-05
Cardiac Macrophages and Fibroblasts Modulate Atrial Fibrillation Maintenance
2026-Mar-13, Circulation research IF:16.5Q1
研究论文 本研究探讨了心脏巨噬细胞和成纤维细胞在持续性房颤维持中的区域特异性作用 首次在猪和人类模型中揭示了驱动区心肌驻留巨噬细胞富集及其促进心肌细胞稳态和存活的转录组与蛋白质组特征 未明确说明 研究成纤维细胞和巨噬细胞群体在房颤维持中的区域差异特征 猪和人类的心脏组织样本 数字病理学 心血管疾病 流式细胞术、单细胞RNA测序、免疫组化、蛋白质组分析 NA 基因表达数据、蛋白质数据 猪模型(N=27+27),对照(N=9+4);人类房颤患者(N=20),对照(N=7) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
700 2026-06-05
Targeting perilipin 5 ameliorates diabetic cardiomyopathy via regulating glycolysis and mitochondrial dynamics
2026-Mar-11, Clinical science (London, England : 1979)
研究论文 本研究探讨了脂滴相关蛋白perilipin 5在高糖条件下对糖酵解、凋亡和线粒体功能的调节作用,及其在糖尿病心肌病中的治疗潜力 首次揭示Plin5通过调控糖酵解和线粒体动力学在糖尿病心肌病中的作用机制,并利用单细胞RNA测序分析确认其心肌细胞特异性表达上调 高糖条件下Plin5过表达的抗凋亡效果减弱,且研究主要基于细胞和动物模型,临床验证尚缺乏 阐明Plin5在糖尿病心肌病中的功能及潜在治疗靶点 AC16人心肌细胞、人心脏成纤维细胞及高脂饮食联合链脲佐菌素诱导的糖尿病心肌病小鼠模型 机器学习 糖尿病心肌病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 细胞系(AC16和HCFs)及野生型和Plin5敲除小鼠 未明确说明 单细胞RNA测序 未明确说明 未明确说明
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