单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 29414 篇文献，本页显示第 661 - 680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2025-06-27 |
NOTCH3 Drives Fatty Acid Oxidation and Ferroptosis Resistance in Aggressive Meningiomas
2025-Jun-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6779386/v1
PMID:40502769
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研究论文 | 本研究揭示了NOTCH3在侵袭性脑膜瘤中通过驱动脂肪酸氧化和铁死亡抵抗的代谢重编程机制 | 首次发现NOTCH3通过调控脂肪酸氧化代谢途径导致铁死亡抵抗，为侵袭性脑膜瘤的恶性行为提供了新解释 | 研究主要基于细胞系模型，需要进一步在动物模型和临床样本中验证 | 探究NOTCH3在脑膜瘤代谢重编程中的作用机制 | NOTCH3阳性人脑膜瘤细胞系和患者来源的原代脑膜瘤细胞 | 肿瘤代谢 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序、非靶向代谢组学、脂质组学、批量RNA测序 | 细胞模型 | 转录组数据、代谢组数据、脂质组数据 | 人类脑膜瘤细胞系和患者来源的原代细胞系 |
| 662 | 2025-06-27 |
Integrative Analysis of Plasma Proteomics and Transcriptomics Reveals Potential Therapeutic Targets for Psoriasis
2025-Jun-04, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061380
PMID:40564099
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研究论文 | 通过整合血浆蛋白质组学和转录组学分析，揭示了银屑病潜在的治疗靶点 | 首次采用蛋白质组范围的孟德尔随机化(MR)分析结合单细胞RNA测序技术，鉴定出与银屑病风险显著相关的13种蛋白质，并发现IFNLR1和IFNGR2等干扰素家族蛋白具有成药潜力 | 研究主要基于欧洲人群数据，可能限制结果在其他种族的普适性 | 探索银屑病的新型治疗靶点 | 银屑病患者与健康对照组的血浆蛋白质和转录组数据 | 生物医学研究 | 银屑病 | 孟德尔随机化(MR)、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析、分子对接 | NA | 蛋白质组数据、转录组数据 | 发现阶段：UK Biobank 54,219人(2923种蛋白质)+FinnGen 10,312病例/397,564对照；验证阶段：冰岛和诺福克队列蛋白质数据+多数据库表型数据 |
| 663 | 2025-06-27 |
Novel mouse model reveals neurodevelopmental origin of PMM2-CDG brain pathology
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.01.657261
PMID:40501776
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研究论文 | 该研究通过新型小鼠模型揭示了PMM2-CDG脑病理的神经发育起源 | 通过配对flox等位基因和催化失活的敲入等位基因，克服了胚胎致死性，并模拟了患者相关的复合杂合致病变异 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究PMM2-CDG脑病理的神经发育机制 | 小鼠模型和PMM2-CDG患者 | 神经遗传学 | 先天性糖基化障碍(PMM2-CDG) | 多组学分析(代谢组学、糖组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、糖蛋白组学) | 基因修饰小鼠模型 | 多组学数据 | 小鼠模型和患者死后小脑组织 |
| 664 | 2025-06-27 |
Deciphering the combinatorial expression pattern and genetic regulatory mechanisms of Beats and Sides in the olfactory circuits of Drosophila
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.31.657193
PMID:40502011
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序数据集和转基因驱动线，研究果蝇嗅觉电路中Beat和Side基因家族的空间表达模式及其遗传调控机制 | 揭示了ORNs和PNs中Beat和Side基因家族的类特异性组合表达模式，并探索了其在嗅觉电路组装中的潜在作用 | 虽然扰动了Beat-IIa-Side-IV的相互作用，但在两个检查的肾小球中未观察到显著的错靶现象 | 探究Beat和Side基因家族在果蝇嗅觉电路组装中的组合表达模式和遗传调控机制 | 果蝇的嗅觉受体神经元（ORNs）及其突触目标投射神经元（PNs） | 神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），转基因驱动线 | NA | RNA-seq数据 | 公开可用的单细胞RNA-seq数据集和新生成的转基因驱动线 |
| 665 | 2025-06-27 |
Single-cell transcriptomics reveals probiotic reversal of neonatal morphine-induced gene disruptions underlying adolescent pain hypersensitivity
2025-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657034
PMID:40502161
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研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学揭示了益生菌逆转新生儿吗啡暴露引起的青少年疼痛过敏的基因表达变化 | 首次提供了新生儿吗啡暴露和益生菌干预后青少年中脑的单细胞RNA测序数据集，揭示了益生菌对转录组变化的缓解作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探究新生儿吗啡暴露对青少年疼痛通路的长期神经发育影响及益生菌的干预效果 | 青少年小鼠的中脑细胞 | 神经科学 | 疼痛过敏 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | 107,427个中脑单细胞 |
| 666 | 2025-06-27 |
Synthbar: A Lightweight Tool for Adding Synthetic Barcodes to Sequencing Reads
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.30.657070
PMID:40502055
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研究论文 | 介绍了一种轻量级工具Synthbar，用于在测序读取中添加合成条形码，以便与期望存在细胞条形码的计算工具兼容 | 填补了现有工具无法轻松添加合成细胞条形码的空白，支持用户自定义条形码并修改读取结构 | 未提及具体性能指标或与其他工具的对比结果 | 开发一种工具，使不包含细胞条形码的单细胞测序数据能够与需要细胞条形码的计算工具兼容 | 单细胞测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 测序数据 | NA |
| 667 | 2025-06-27 |
NOTCH1 Mutation and Survival Analysis of Tislelizumab in Advanced or Metastatic Esophageal Squamous Cell Carcinoma: A Biomarker Analysis From the Randomized, Phase III, RATIONALE-302 Trial
2025-Jun, Journal of clinical oncology : official journal of the American Society of Clinical Oncology
IF:42.1Q1
DOI:10.1200/JCO-24-01818
PMID:40179324
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research paper | 该研究通过基因组分析和转录组测序，探索了NOTCH1突变作为替雷利珠单抗在晚期或转移性食管鳞状细胞癌中生存获益的预测生物标志物 | 首次发现NOTCH1突变与替雷利珠单抗治疗的长期生存显著相关，并揭示了其潜在的分子机制 | 研究样本来源于单一临床试验，需进一步验证 | 寻找食管鳞状细胞癌免疫治疗的预测生物标志物 | 晚期或转移性食管鳞状细胞癌患者 | digital pathology | esophageal squamous cell carcinoma | 肿瘤基因组分析、转录组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | RATIONALE-302研究中的患者样本 |
| 668 | 2025-06-27 |
RIDDEN: Data-driven inference of receptor activity from transcriptomic data
2025-Jun, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013188
PMID:40522999
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研究论文 | 本文介绍了一种名为RIDDEN的计算工具，用于从受体调节的基因表达谱中预测受体活性，而非基于配体和受体基因的表达 | RIDDEN是首个直接从受体调节的基因表达谱预测受体活性的计算工具，避免了传统方法依赖配体和受体基因共表达的局限性 | NA | 开发一种能够准确推断受体活性的计算工具，以促进细胞间通讯的研究 | 受体活性的系统水平分析 | 生物信息学 | NA | 转录组数据分析 | RIDDEN模型 | 转录组数据 | 14463个扰动基因表达谱，涉及229种不同受体 |
| 669 | 2025-06-27 |
Single-Cell RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal a Novel Mechanism of Oligodendrocyte-Neuron Interaction in Cognitive Decline After High-Altitude Cerebral Edema
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70485
PMID:40546220
|
research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了高原脑水肿后认知下降中少突胶质细胞与神经元相互作用的新机制 | 发现了PI3K/mTOR动态变化、Rps29-bax轴和Tnfrsf21-App作为新型调节因子，为潜在治疗靶点提供了新见解 | 研究仅基于小鼠模型，人类相关性尚需进一步验证 | 探究高原脑水肿导致认知下降的细胞和分子机制 | 高原脑水肿小鼠模型中的海马组织 | digital pathology | geriatric disease | scRNA-seq, ST | mouse model | RNA sequencing data, spatial transcriptomics data | 未明确说明样本数量，但包含3天和7天两个时间点的分析 |
| 670 | 2025-06-27 |
A Temporal Single-Cell Multi-Omics Atlas of Murine Pancreatic Islet Remodeling During Hyperglycaemia Progression
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.29.656754
PMID:40568114
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研究论文 | 该研究通过纵向单细胞RNA测序和ATAC测序技术，揭示了高脂饮食诱导的小鼠胰岛重塑过程中的细胞组成和转录状态动态变化 | 首次构建了高血糖进展过程中小鼠胰岛细胞重塑的时序单细胞多组学图谱，揭示了β细胞的应激重编程和免疫细胞扩增等关键发现 | 研究仅使用C57BL/6小鼠模型，可能无法完全反映人类糖尿病病理变化的复杂性 | 探究肥胖诱导的胰岛素抵抗过程中胰岛细胞重塑的分子机制 | C57BL/6小鼠的胰岛细胞 | 单细胞组学 | 2型糖尿病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 高脂饮食喂养8、16和24周的C57BL/6小鼠胰岛细胞，以及年龄匹配的对照组 |
| 671 | 2025-06-27 |
Divergent Plastid Genomes in the Deepest-Branching Apicomplexan Parasites
2025-May-30, Genome biology and evolution
IF:3.2Q2
DOI:10.1093/gbe/evaf117
PMID:40476362
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研究论文 | 该研究通过单细胞测序技术，对最深分支的顶复门寄生虫——古簇虫的质体基因组进行了特征分析，填补了顶复门质体基因组多样性中的关键空白 | 首次对古簇虫的质体基因组进行了测序和特征分析，揭示了其与其他顶复门质体基因组的显著差异 | 研究仅针对4种已知古簇虫谱系的未培养代表进行分析，样本范围有限 | 探究顶复门寄生虫质体基因组的起源和进化 | 顶复门寄生虫中最深分支的古簇虫 | 寄生虫学 | 寄生虫感染 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 4种已知古簇虫谱系的未培养代表 |
| 672 | 2025-06-27 |
Multi-Omics and Experimental Validation Identify GPX7 and Glutathione-Associated Oxidative Stress as Potential Biomarkers in Ischemic Stroke
2025-May-30, Antioxidants (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/antiox14060665
PMID:40563300
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，确定了GPX7和谷胱甘肽相关氧化应激作为缺血性卒中的潜在生物标志物 | 首次通过多组学方法结合实验验证，系统分析了氧化应激相关基因在缺血性卒中中的功能和意义，并确定了GPX7作为特征基因 | 研究结果仍需在更大规模的临床样本中进一步验证 | 系统分析氧化应激相关基因在缺血性卒中中的功能和意义 | 缺血性卒中相关的基因表达数据集和氧化应激相关基因 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | 多组学分析、单细胞RNA测序、分子对接分析 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | Wistar大鼠大脑中动脉闭塞模型 |
| 673 | 2025-06-27 |
Advances in Genitourinary Tumor Genomics and Immunotherapy
2025-May-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16060667
PMID:40565559
|
综述 | 本文全面概述了当前用于免疫监测的技术和前沿的免疫调节方法，并探讨了个性化治疗、实时监测系统和人工智能如何塑造免疫治疗的未来 | 探讨了生物材料激活免疫细胞和基因工程细胞疗法等前沿免疫调节方法，以及人工智能在免疫治疗中的应用 | 需要进一步研究以克服现有技术的局限性 | 推动更安全、更有效的癌症治疗 | 泌尿生殖系统肿瘤的基因组学和免疫治疗 | 免疫学与生物工程 | 泌尿生殖系统肿瘤 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、多重细胞因子分析 | NA | NA | NA |
| 674 | 2025-06-27 |
Beyond Transposons: TIGD1 as a Pan-Cancer Biomarker and Immune Modulator
2025-May-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes16060674
PMID:40565566
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研究论文 | 本研究对TIGD1进行了全面的泛癌分析，评估了其表达模式、诊断效用、预后价值以及与免疫治疗反应和耐药性的关联 | 首次将TIGD1作为泛癌生物标志物和免疫调节因子进行系统性分析，揭示了其在肿瘤免疫微环境中的关键作用 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 评估TIGD1作为癌症生物标志物的潜力及其在免疫调节中的作用 | 多种癌症类型 | 生物信息学 | 泛癌(包括结肠癌、胃癌、肝癌和肺癌等) | 转录组分析、单细胞测序、基因集富集分析 | NA | 转录组数据和临床数据 | 来自TCGA和GTEx数据库的大量样本 |
| 675 | 2025-06-27 |
Single-Cell Transcriptomics Unveils the Mechanistic Role of FOSL1 in Cutaneous Wound Healing
2025-May-29, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061330
PMID:40564048
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了转录因子FOSL1在皮肤伤口愈合中的机制作用 | 首次将FOSL1确定为皮肤伤口愈合的关键调节因子，并揭示了其通过MAPK和EGFR信号通路调控的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和动物模型，尚未进行临床验证 | 探究FOSL1在皮肤伤口愈合中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 皮肤伤口愈合过程及相关分子机制 | 生物信息学 | 皮肤损伤 | 单细胞转录组学、Western blot分析、机器学习算法 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | GEO数据库数据集及动物组织样本 |
| 676 | 2025-06-27 |
Spatiotemporal Single-Cell Analysis Reveals T Cell Clonal Dynamics and Phenotypic Plasticity in Human Graft-versus-Host Disease
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.24.655962
PMID:40501545
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研究论文 | 通过时空单细胞分析揭示人类移植物抗宿主病中T细胞克隆动态和表型可塑性 | 开发了新的计算工具DecompTCR用于纵向TCR分析，揭示了与GVHD严重程度相关的克隆扩增程序和TCR特征 | 样本量相对较小（27名alloHCT受者），可能限制结果的普遍性 | 解析异基因造血细胞移植后T细胞介导的复杂病理机制 | 27名异基因造血细胞移植受者的T细胞 | 单细胞分析 | 移植物抗宿主病 | 混合淋巴细胞反应克隆'指纹识别'、TCR克隆分型、单细胞RNA/TCR测序、空间转录组学 | DecompTCR | 单细胞RNA测序数据、TCR测序数据、空间转录组数据 | 27名异基因造血细胞移植受者 |
| 677 | 2025-06-27 |
A novel frameshift mutation in Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 1 ( PIK3R1 ) causes immunodeficiency and Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655625
PMID:40568112
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研究论文 | 本文发现了一种新型的PIK3R1移码突变，该突变导致免疫缺陷和肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 首次报道了PIK3R1移码突变c.1710dup与ALS的关联，并通过iPSC和iPSC-derived motor neurons揭示了该突变导致PIK3R1单倍剂量不足及其对神经元功能和存活的影响 | 研究仅基于单个患者的样本，未进行大规模验证 | 探究PIK3R1突变在免疫缺陷和神经系统疾病中的作用机制 | 一名患有常见变异型免疫缺陷并发展为ALS的患者 | 遗传学 | 肌萎缩侧索硬化症 | iPSC技术、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | iPSC-derived motor neurons、brain organoids | 基因测序数据、单细胞RNA表达数据 | 1名患者及其iPSC衍生细胞 |
| 678 | 2025-06-27 |
Correction: Desterke et al. Single-Cell RNA-Seq Analysis Links DNMT3B and PFKFB4 Transcriptional Profiles with Metastatic Traits in Hepatoblastoma. Biomolecules 2024, 14, 1394
2025-May-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15060769
PMID:40563546
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correction | 对已发表文章中关于单细胞RNA测序分析链接DNMT3B和PFKFB4转录谱与肝母细胞瘤转移特性的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 679 | 2025-06-27 |
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.23.655817
PMID:40568097
|
研究论文 | 本文利用空间转录组学和流式细胞术研究了隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构，揭示了单核细胞来源的髓系细胞通过CD4 T辅助2型细胞的替代激活在潜在感染期间抑制肺部真菌清除的机制 | 研究发现替代激活的髓系细胞并非真菌的内在复制场所，且真菌主要存在于细胞外环境，提出了T辅助2型细胞-髓系细胞回路驱动细胞外真菌持续存在的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类肉芽肿的免疫机制可能存在差异 | 探究潜在真菌感染中无法产生灭菌免疫的机制 | 隐球菌肉芽肿的免疫细胞动态和真菌持续机制 | 免疫学 | 真菌感染 | 空间转录组学, 流式细胞术, 命运图谱分析 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | NA |
| 680 | 2025-06-27 |
Multi-Transcriptomic Analysis Reveals GSC-Driven MES-Like Differentiation via EMT in GBM Cell-Cell Communication
2025-May-26, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13061304
PMID:40564022
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研究论文 | 通过多转录组分析揭示了胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞通过EMT模式驱动MES样分化的细胞间通讯机制 | 首次利用多转录组分析结合scRNA-seq数据，揭示了GSCs通过EMT模式促进GBM进展的细胞通讯机制，并发现EMT相关基因驱动GSCs向MES样表型分化 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏体内实验验证EMT通路靶向治疗GBM的效果 | 探索胶质母细胞瘤中胶质瘤干细胞的细胞间通讯模式及其对肿瘤进展的影响 | 胶质母细胞瘤中的胶质瘤干细胞（GSCs）及其与其他细胞的通讯 | 肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | scRNA-seq, GSEA, ssGSEA, 空间转录组 | CellChat | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量（基于公共scRNA-seq数据库） |