单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
661	2025-05-14	Investigating ferroptosis-related genes NFE2L2 in neutrophils for ankylosing spondylitis: therapeutic potential of cassia twigs 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-88775-x PMID:40064975	研究论文	探讨铁死亡相关基因NFE2L2在中性粒细胞中对强直性脊柱炎的作用及中药肉桂的治疗潜力	首次将铁死亡基因NFE2L2与强直性脊柱炎的中性粒细胞关联，并发现中药肉桂可通过作用于该基因治疗疾病	研究样本量未明确说明，且机制研究仍需进一步实验验证	探索铁死亡与免疫细胞在强直性脊柱炎中的关系及中药治疗机制	强直性脊柱炎患者数据、中性粒细胞、铁死亡基因NFE2L2、中药肉桂	生物医学	强直性脊柱炎	转录组测序、单细胞测序、免疫组化、分子对接	机器学习	临床数据、转录组数据、单细胞数据	未明确说明
662	2025-05-14	Identification of potential drug targets for pelvic organ prolapse using a proteome-wide Mendelian randomization approach 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92800-4 PMID:40064973	研究论文	通过蛋白质组范围的孟德尔随机化方法识别盆腔器官脱垂的潜在药物靶点	首次使用蛋白质组范围的孟德尔随机化(PW-MR)方法识别EFEMP1和MFAP4作为盆腔器官脱垂的潜在药物靶点，并结合单细胞RNA测序数据和分子对接分析验证其可行性和安全性	研究基于FinnGen队列数据，可能受限于该人群的遗传背景，且需要进一步的实验验证	探索盆腔器官脱垂的新治疗靶点	盆腔器官脱垂患者	生物信息学	盆腔器官脱垂	蛋白质组范围的孟德尔随机化(PW-MR)、贝叶斯共定位分析、单细胞RNA测序、分子对接分析	孟德尔随机化模型	基因组数据、蛋白质组数据、单细胞RNA测序数据	FinnGen队列数据（具体样本量未明确说明）
663	2025-05-14	Transcriptome combined with single-cell sequencing explored prognostic markers associated with T cell exhaustion characteristics in head and neck squamous carcinoma 2025-Mar-10, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-91299-z PMID:40065044	研究论文	本研究通过转录组和单细胞测序技术，探索了头颈部鳞状细胞癌中与T细胞耗竭特征相关的预后标志物	构建了HNSC的单细胞图谱，深入分析了T细胞的异质性，并鉴定了与T细胞C2亚群相关的五个特征，开发了临床预后模型	虽然绘制了T细胞异质性和分化轨迹，但这些亚群之间的相互关系仍不清楚，需要进一步研究具体的生物过程和分子进化机制	增强HNSC免疫治疗方法的疗效，改善患者预后	头颈部鳞状细胞癌（HNSC）中的T细胞	数字病理	头颈部鳞状细胞癌	转录组测序, 单细胞测序	临床预后模型	基因表达数据	NA
664	2025-05-14	Imbalance of bladder neurohomeostasis by Myosin 5a aggravates diabetic cystopathy 2025-Mar-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.) DOI:10.1186/s10020-025-01140-6 PMID:40065210	研究论文	本研究探讨了Myosin 5a在糖尿病性膀胱病变（DCP）中的潜在调控作用	首次揭示了Myosin 5a在糖尿病性膀胱病变中的调控机制及其与膀胱过度活动的关联	研究主要基于动物模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证	探究Myosin 5a是否在糖尿病性膀胱病变中发挥潜在调控作用	糖尿病大鼠和Myosin 5a缺陷型DBA小鼠的膀胱组织	神经生物学	糖尿病性膀胱病变	单细胞RNA测序、尿动力学评估、免疫组织化学	动物模型（大鼠和小鼠）	基因表达数据、生理功能数据	未明确说明样本数量，使用糖尿病大鼠和Myosin 5a缺陷型DBA小鼠
665	2025-05-14	Prognostic implications and characterization of tumor-associated tertiary lymphoid structures genes in pancreatic cancer 2025-Mar-10, Journal of translational medicine IF:6.1Q1 DOI:10.1186/s12967-025-06152-8 PMID:40065365	研究论文	本研究探讨了胰腺导管腺癌(PDAC)中肿瘤相关三级淋巴结构(TA-TLS)基因的表达特征及其预后意义，并构建了基于TLS基因的风险评估模型	首次在PDAC中系统分析了TA-TLS基因的表达特征，构建了TLS评分系统和风险预测模型，并探索了关键基因DNASE1L3的抗肿瘤机制	研究主要基于回顾性数据，需要进一步的前瞻性研究验证	探索TA-TLS基因在PDAC中的作用，以增强免疫治疗效果	胰腺导管腺癌(PDAC)患者	肿瘤免疫学	胰腺癌	转录组分析、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、免疫组化(IHC)、基因集富集分析(GSEA)	LASSO回归模型	基因表达数据、临床数据	310例PDAC患者(来自GEO数据库)
666	2025-05-14	Single-cell transcriptome analysis reveals cellular heterogeneity in the aortas of Takayasu arteritis 2025-Mar-10, Arthritis research & therapy IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s13075-025-03523-w PMID:40065428	研究论文	通过单细胞转录组分析揭示大动脉炎患者主动脉中的细胞异质性	首次在大动脉炎患者主动脉组织中鉴定出11种主要细胞类型，并揭示了T细胞、B细胞、巨噬细胞等细胞亚型特异性基因表达特征及其在疾病发病机制中的活跃参与	样本量较小（仅3例TAK患者主动脉样本），且对照组数据来自公开数据库	揭示大动脉炎的细胞异质性并发现潜在治疗靶点	大动脉炎患者主动脉组织及外周血T细胞	数字病理学	大动脉炎	单细胞转录组分析、bulk RNA测序	NA	转录组数据	3例TAK患者主动脉样本 + 8例TAK患者和8例健康志愿者的外周血T细胞样本
667	2025-05-14	Exploring the "chemo" in chemoimmunotherapy for triple-negative breast cancer 2025-Mar-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.02.016 PMID:40068590	研究论文	本文通过单细胞RNA测序比较了三阴性乳腺癌在接受PD-L1抑制剂atezolizumab联合紫杉醇或白蛋白结合型紫杉醇治疗后的免疫细胞动态变化	发现了不同的T细胞激活模式，并突出了白蛋白结合型紫杉醇组合中肥大细胞在免疫激活中的独特作用	NA	探索三阴性乳腺癌化学免疫治疗中的化疗作用机制	三阴性乳腺癌患者	癌症研究	三阴性乳腺癌	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
668	2025-05-14	PRMT5 highly expressed on CD16 + CD56- natural killer cells is correlated with NK cells exhaustion in colorectal cancer mesenchyme 2025-Mar-08, Cancer immunology, immunotherapy : CII DOI:10.1007/s00262-025-03981-w PMID:40056169	research paper	研究结直肠癌微环境中自然杀伤细胞（NK细胞）表型变化与重要免疫检查点表达之间的关系	首次发现PRMT5和SIGIRR在CD16+CD56- NK细胞中的高表达与NK细胞功能衰竭相关，并可能影响结直肠癌的进展	研究样本量有限（194例），且仅针对结直肠癌，未涉及其他癌症类型	探究结直肠癌微环境中NK细胞表型变化与免疫检查点表达的关联	结直肠癌患者的NK细胞及其表面受体	肿瘤免疫学	结直肠癌	免疫组织化学染色、多重免疫组织化学、单细胞测序	NA	临床样本数据	194例结直肠癌患者
669	2025-05-14	Individualized therapy guided by single-cell sequencing in anti-GABAAR encephalitis 2025-Mar-08, Translational psychiatry IF:5.8Q1 DOI:10.1038/s41398-025-03300-y PMID:40057475	研究论文	本文通过单细胞测序技术指导抗GABAAR脑炎的个体化治疗	利用单细胞测序技术识别出单克隆CD8 T细胞和异常的JAK-STAT信号通路在疾病中的作用，并发现LMO5蛋白能激活特定CD8 T细胞	研究仅基于一个病例和四个健康志愿者的样本，样本量较小	探索抗GABAAR脑炎的个体化治疗方法	一名难治性抗GABAAR脑炎患者和四名健康志愿者的PBMCs及脑脊液细胞	数字病理学	脑炎	单细胞测序	NA	单细胞数据	1名患者和4名健康志愿者的PBMCs及患者的脑脊液细胞
670	2025-05-14	Microbial metabolites control self-renewal and precancerous progression of human cervical stem cells 2025-Mar-08, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57323-6 PMID:40057497	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序和宫颈类器官模型，揭示了人类宫颈干细胞的调控机制及其在宫颈健康和疾病中的作用	发现了乳酸菌衍生的乳酸通过PI3K-AKT通路和YAP1调控宫颈干细胞的自我更新和早期肿瘤发生，并区分了D-乳酸和L-乳酸的不同作用	研究主要关注宫颈干细胞的体外模型，体内验证可能不足	探索宫颈干细胞的调控机制及其在宫颈癌发生中的作用	人类和小鼠的宫颈干细胞	细胞生物学	宫颈癌	单细胞RNA测序，类器官培养	NA	RNA测序数据	未明确说明样本数量，但涉及人类和小鼠的宫颈组织
671	2025-05-14	IL-19 as a promising theranostic target to reprogram the glioblastoma immunosuppressive microenvironment 2025-Mar-08, Journal of biomedical science IF:9.0Q1 DOI:10.1186/s12929-025-01126-w PMID:40057744	研究论文	本文探讨了IL-19作为胶质母细胞瘤免疫抑制微环境的重要调控因子及其作为诊疗靶点的潜力	发现IL-19通过IL-19/WISP1信号通路促进TMZ耐药性GBM细胞的迁移和侵袭，并开发了新型CHOL-PEG-SPIO-IL-19纳米颗粒用于靶向诊疗	研究主要基于小鼠模型和体外实验，临床转化效果需进一步验证	探索IL-19在胶质母细胞瘤免疫抑制微环境中的作用及其作为诊疗靶点的可行性	胶质母细胞瘤患者样本、TMZ敏感/耐药GBM细胞系、Il-19基因敲除小鼠模型	肿瘤免疫治疗	胶质母细胞瘤	RNA测序、单细胞转录组分析、CRISPR基因编辑、纳米颗粒合成、MRI成像	动物模型（GBM小鼠模型）	基因组数据、转录组数据、影像数据	台湾GBM队列和TCGA数据库的临床样本、体外培养细胞系、动物模型
672	2025-05-14	Extraction of a stromal metastatic gene signature in breast cancer via spatial profiling 2025-Mar-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR IF:11.4Q1 DOI:10.1186/s13046-025-03353-3 PMID:40065328	研究论文	通过空间转录组学分析乳腺癌原发灶和转移灶的转录特征，识别出一个基质转移特征	首次利用空间转录组学技术识别乳腺癌转移灶的基质特征，为理解转移机制提供了新视角	研究样本量有限，需要进一步验证	识别乳腺癌转移灶的分子特征，探索转移机制	乳腺癌原发灶和转移灶的转录特征	数字病理学	乳腺癌	空间转录组学	NA	转录组数据	代表性微区域样本集和小鼠模型
673	2025-05-14	Extracellular vesicular delivery of ceramides from pulmonary macrophages to endothelial cells facilitates chronic obstructive pulmonary disease 2025-Mar-07, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02125-y PMID:40055817	研究论文	本研究揭示了肺巨噬细胞通过细胞外囊泡将神经酰胺传递给内皮细胞，从而促进慢性阻塞性肺疾病(COPD)发展的新机制	首次发现神经酰胺作为细胞间信号分子，通过细胞外囊泡介导肺巨噬细胞与内皮细胞间的代谢通讯，在COPD发病中起关键作用	研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本验证仍需进一步扩大	探究神经酰胺在COPD发病中作为细胞间信号分子的作用机制	肺巨噬细胞、内皮细胞、COPD患者和小鼠模型	呼吸系统疾病	慢性阻塞性肺疾病(COPD)	单细胞RNA测序、质谱脂质组学、透射电镜、纳米颗粒追踪分析	小鼠COPD模型	RNA测序数据、脂质组学数据、显微镜图像	人类肺组织样本、暴露于香烟烟雾的小鼠模型
674	2025-05-14	Single-cell transcriptomics reveals inter-ethnic variation in immune response to Falciparum malaria 2025-Mar-06, American journal of human genetics IF:8.1Q1 DOI:10.1016/j.ajhg.2025.01.020 PMID:39970911	研究论文	通过单细胞转录组学揭示了非洲不同种族对恶性疟疾免疫反应的差异	首次在单细胞水平上比较了Fulani和Mossi两个种族对疟疾的免疫反应差异，并发现了种族特异性的免疫特征和遗传调控变异	研究样本仅来自布基纳法索农村地区的儿童，可能无法完全代表其他人群	探究非洲不同种族对恶性疟疾免疫反应差异的分子和细胞机制	126名感染和未感染的Fulani和Mossi儿童的外周血单个核细胞	单细胞转录组学	疟疾	单细胞转录组测序	NA	单细胞RNA测序数据	126名儿童（Fulani和Mossi种族），超过70,000个单细胞转录组
675	2025-05-14	Bacteroides fragilis Toxin Suppresses METTL3-Mediated m6A Modification in Macrophage to Promote Inflammatory Bowel Disease 2025-Mar-05, Journal of Crohn's & colitis DOI:10.1093/ecco-jcc/jjae179 PMID:40065724	研究论文	本研究探讨了脆弱拟杆菌毒素（BFT）通过抑制METTL3介导的m6A修饰在巨噬细胞中促进炎症性肠病的机制	揭示了BFT通过抑制FOXD3表达减少METTL3转录，进而降低m6A修饰，并通过减少YTHDF2依赖的mRNA降解促进ITGA5表达的新机制	研究主要基于体外和动物模型，人类临床应用的转化需要进一步验证	研究BFT与宿主相互作用对宿主mRNA m6A修饰的影响及其机制	炎症性肠病患者和硫酸葡聚糖钠诱导的结肠炎小鼠	分子生物学	炎症性肠病	单细胞测序	NA	基因表达数据	炎症性肠病患者和结肠炎小鼠模型
676	2025-05-14	HOXA1 Contributes to Bronchial Epithelial Cell Cycle Progression by Regulating p21/CDKN1A 2025-Mar-05, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26052332 PMID:40076953	研究论文	本研究探讨了HOXA1基因在支气管上皮细胞周期进程中的作用及其通过调控p21/CDKN1A影响细胞增殖的机制	首次揭示了HOXA1基因通过调节p21/CDKN1A影响气道上皮细胞周期进程和增殖的新机制	研究仅使用体外细胞模型，未在体内模型或临床样本中进行验证	探究HOXA1基因在气道上皮细胞增殖和迁移中的作用	支气管上皮细胞	细胞生物学	慢性阻塞性肺病	CRISPR/CAS9基因编辑技术、单细胞RNA测序、流式细胞术	基因敲除细胞模型	基因表达数据	NA
677	2025-05-14	TrAGEDy-trajectory alignment of gene expression dynamics 2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btaf073 PMID:40065693	研究论文	提出了一种名为TrAGEDy的方法，用于对齐单细胞转录组测序中的独立轨迹，避免误差较大的整合步骤	TrAGEDy能够对齐不对称的生物过程轨迹，优于现有工具，并能捕捉更多生物学相关基因和过程	未明确提及具体局限性	开发一种新方法以改善单细胞转录组测序数据的轨迹对齐	单细胞转录组测序数据，特别是T细胞和Trypanosoma brucei血流形式的发育过程	生物信息学	NA	单细胞转录组测序	NA	基因表达数据	模拟数据集和真实数据集（具体数量未提及）
678	2025-05-14	AJGM: joint learning of heterogeneous gene networks with adaptive graphical model 2025-Mar-04, Bioinformatics (Oxford, England) DOI:10.1093/bioinformatics/btaf096 PMID:40073230	research paper	提出了一种自适应联合图形模型（AJGM），用于从具有未知异质性的单细胞或批量数据中估计多个基因网络	引入了整体网络来捕捉所有样本共享的关系，并通过自适应权重在亚型网络和整体网络之间建立连接，从而更有效地关注所有网络共享的基因关系	GGM假设数据服从多元高斯分布，而零膨胀的scRNA-seq数据往往不符合这一假设	推断基因网络以深入了解生物通路和基因间的功能关系	单细胞或批量基因表达数据	machine learning	triple-negative breast cancer	scRNA-seq	Adaptive Joint Graphical Model (AJGM)	gene expression data	NA
679	2025-05-14	NAD+ Promotes Superovulation of Huaxi Cattle Through Regulation of Cumulus Cell Proliferation and Oocyte Maturation 2025-Mar-04, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26052276 PMID:40076893	研究论文	本研究探讨了NAD+对华西牛超排卵过程中卵丘细胞增殖和卵母细胞成熟的调控作用	首次发现NAD+通过调节脂质代谢途径和优化激素分泌水平提高超排卵效率	研究仅针对华西牛，未在其他牛种中验证	提高家畜繁殖效率和生产优质胚胎	华西牛的卵丘细胞和卵母细胞	动物繁殖学	NA	血清代谢组学和单细胞RNA测序	NA	代谢组数据和转录组数据	未明确说明样本数量
680	2025-05-14	Integrated Single-Cell Transcriptome and eQTL Analyses Reveal the Role of PZP in Aging and Chronic Kidney Disease 2025-Mar, The journal of gene medicine IF:3.2Q2 DOI:10.1002/jgm.70015 PMID:40058366	研究论文	本研究通过整合单细胞转录组和eQTL分析，揭示了PZP在衰老和慢性肾病中的作用	首次发现CD8+ TCM细胞和PZP基因在衰老与慢性肾病共病机制中的关键作用，并验证了PZP作为生物标志物的潜力	样本来源仅限于外周血，未涉及肾脏组织；临床样本量相对有限	探索衰老与慢性肾病共病的遗传和免疫机制	年轻对照组、老年个体和慢性肾病患者的外周血样本	生物医学	慢性肾病	单细胞RNA测序、eQTL分析、孟德尔随机化分析	NA	单细胞转录组数据、基因组队列数据	包含UK Biobank和FinnGen基因组队列数据，具体临床样本量未明确说明