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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 661 | 2026-09-04 |
Truncated Gpr114-based ultrasound-hypersensitive gene circuit for controlled expression of therapeutics
2026-Aug-05, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76393-8
PMID:42686781
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研究论文 | 本研究结合AlphaFold3预测和分子动力学模拟,开发出基于截短的Gpr114超声超敏基因回路,用于控制治疗性蛋白表达,并在小鼠模型中验证其对肿瘤的抑制作用。 | 首次利用AlphaFold3预测和分子动力学模拟筛选出对短脉冲超声高度敏感的Gpr114变体,并将其与合成基因回路融合,实现超声远程控制治疗基因的表达。 | 文中未明确提及局限性。 | 开发一种基于超声敏感的基因回路,实现对治疗性基因表达进行远程控制,以增强抗肿瘤免疫治疗的效果。 | 雌性荷瘤小鼠及其肿瘤组织。 | 合成生物学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 分子动力学模拟和AlphaFold3预测模型 | 基因表达数据和单细胞转录组数据 | 研究使用雌性荷瘤小鼠,样本量未具体说明。 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 662 | 2026-09-04 |
Gata3 dosage governs primitive endoderm versus trophectoderm specification in embryonic stem cells
2026-08, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-026-00860-y
PMID:42410264
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研究论文 | 本研究揭示Gata3转录因子剂量在小鼠胚胎干细胞中指导原始内胚层与滋养外胚层谱系特化的作用 | 重新定义Gata3不仅作为滋养外胚层决定因子,还是一个剂量敏感的中心开关,通过剂量依赖的增强子重分布和染色质结合来指导谱系分化 | 未提供明确的局限性信息 | 探讨Gata3剂量如何调控胚胎干细胞中原始内胚层与滋养外胚层的互斥谱系特化 | 小鼠胚胎干细胞 | 机器学习和生物信息学 | NA | 单细胞转录组学、全基因组结合分析 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 663 | 2026-09-04 |
Immune hallmarks of recurrent immune checkpoint inhibitor-mediated inflammatory arthritis
2026-Jul-31, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-1639
PMID:42536056
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研究论文 | 通过纵向分析免疫检查点抑制剂介导的炎症性关节炎患者的滑液样本,揭示其复发的免疫机制 | 首次对复发性免疫检查点抑制剂相关关节炎进行纵向单细胞分析,发现效应CD8+ T细胞和PD-1hiCXCL13hiCD4+ T细胞在第一和第二次复发事件中共享克隆扩增的特征 | 样本量较小(6例患者),且机制研究主要在转录水平,可能需进一步功能验证 | 阐明复发性免疫检查点抑制剂相关炎症性关节炎的细胞和分子机制,特别是免疫记忆反应的作用 | 免疫检查点抑制剂相关炎症性关节炎患者(首次和第二次发作)的滑液细胞 | 免疫学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组和单细胞免疫组库数据及流式细胞术数据 | 6例ICI-IA患者的12份滑液样本,以及6例非癌症骨关节炎患者的滑液样本作为阴性对照 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序 | NA | NA |
| 664 | 2026-09-04 |
Longitudinal analysis reveals myeloid cell contributions to murine neuroPASC pathogenesis
2026-07-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76156-5
PMID:42669720
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研究论文 | 对SARS-CoV-2感染小鼠进行纵向单细胞RNA测序分析,揭示髓系细胞在神经PASC发病机制中的贡献 | 首次通过纵向单细胞RNA测序分析,绘制了神经PASC期间大脑髓系免疫动态的高分辨率图谱,并揭示了微胶质细胞在维持慢性神经炎症中的核心作用 | 由于是基于小鼠模型的研究,结果可能不完全适用于人类神经PASC | 探究神经PASC中髓系细胞(特别是微胶质细胞)对神经炎症起始和持续的作用机制 | SARS-CoV-2感染小鼠的大脑免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 神经PASC(COVID-19后神经精神后遗症) | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 来自0、6、30和100天感染后时间点的脑免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 665 | 2026-09-04 |
Role and prognostic value of N6-methyladenosine RNA modification regulators in glycolytic reprogramming during sepsis
2026-Jul-30, Journal of intensive care
IF:3.8Q1
DOI:10.1186/s40560-026-00920-4
PMID:42675521
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研究论文 | 本研究整合多个脓毒症转录组队列数据,分析m6A RNA修饰调节因子在脓毒症中的表达及其与糖酵解重编程和预后的关联。 | 首次系统阐明ALKBH5相关m6A修饰与脓毒症糖酵解重编程的关联,并构建了基于m6A相关基因的预后模型。 | 研究结果基于生物信息学分析,缺乏前瞻性实验验证,且预后模型的外部可重复性不完全,需在更大临床队列中验证。 | 探讨脓毒症中m6A调节因子表达特征及其与糖酵解重编程的关联,并评估其预后价值。 | 脓毒症患者转录组数据、ALKBH5敲除模型、MeRIP-seq数据及单细胞RNA测序数据。 | 机器学习和生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序、MeRIP-seq、单细胞RNA测序、基因敲除模型 | LASSO-Cox回归模型、CIBERSORT免疫浸润分析 | 转录组测序数据、MeRIP-seq数据、单细胞RNA-seq数据 | 多个GEO队列(GSE65682, GSE95233, GSE54514, GSE198316, GSE224650, GSE225143, GSE147363),具体样本数未在摘要中提供。 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、MeRIP-seq | NA | NA |
| 666 | 2026-09-04 |
Single-cell profiling of natural killer/T-cell lymphoma reveals stratified immune features and potential therapeutic implications
2026-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76152-9
PMID:42660902
|
研究论文 | 通过对63个样本进行单细胞RNA测序并整合空间转录组、批量转录组、蛋白质组和代谢组数据,绘制了自然杀伤/T细胞淋巴瘤的分子图谱,揭示了四种分子亚型及其独特的免疫和代谢特征,为患者分层和治疗策略提供见解 | 首次在自然杀伤/T细胞淋巴瘤中整合单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组及代谢组等多组学数据,系统解析肿瘤间和肿瘤内异质性,并定义了与不同分子和免疫特征关联的四种功能元程序 | 基于标题和摘要,未明确提及研究的具体局限性 | 解析自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤细胞异质性及其与免疫微环境的相互作用,并探索不同分子亚型在治疗应答上的潜在意义 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者的肿瘤样本及肿瘤微环境中的免疫细胞等 | 单细胞组学 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 单细胞转录组、空间转录组、转录组、蛋白质组、代谢组数据 | 63个样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量转录组学 | NA | NA |
| 667 | 2026-09-04 |
Multi-omic analysis of androgen-deprived human testes reveals Sertoli cell regulation and niche reprogramming
2026-07-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76120-3
PMID:42660954
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research paper | 该研究利用去雄激素的人睾丸组织,构建了整合单核RNA测序、单细胞ATAC测序和空间转录组的多组学图谱,揭示了支持细胞的功能调控和微环境重编程机制 | 首次在人类去雄激素模型中构建多组学图谱,发现NRG2作为雄激素依赖的微环境因子促进精原细胞增殖,并发现去雄激素导致间质细胞异位表达WT1并重编程为支持细胞样状态 | 研究基于去雄激素组织,可能无法完全反映自然衰老或疾病状态下的变化,且涉及伦理和技术限制,样本数量有限 | 探究雄激素调控成人睾丸功能的分子机制,为雄激素相关性不育和生殖疾病的治疗提供资源 | 去雄激素处理的人成人睾丸组织,研究其中的支持细胞、间质细胞和精原细胞 | digital pathology | 不育 | 单核RNA测序、单细胞ATAC测序、空间转录组 | NA | 基因表达数据、开放染色质数据、空间表达数据 | 未提供具体样本量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 668 | 2026-09-04 |
Mechanistic study on comorbidities of kidney stones and sepsis using transcriptome sequencing combined with single-cell spatial transcriptome sequencing
2026-Jul-17, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000049779
PMID:42469985
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研究论文 | 本研究利用转录组测序和单细胞空间转录组测序技术探究肾结石与脓毒症共病的分子机制,并筛选关键基因 | 首次结合转录组、单细胞RNA测序和空间转录组数据,系统分析肾结石与脓毒症共病的分子调控网络,并鉴定出5个关键基因及其细胞类型特异性表达模式 | 研究基于公共数据库数据,缺乏实验验证;样本量可能有限;分子对接和药物预测结果需要进一步体内外实验证实 | 探索肾结石与脓毒症共病的分子调控网络,筛选关键基因并阐明其在疾病进展中的作用 | 肾结石和脓毒症患者的转录组、单细胞RNA测序及空间转录组数据 | 转录组学 | 肾结石、脓毒症 | 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | 随机森林、LASSO回归 | 转录组数据、单细胞测序数据、空间转录组数据 | 未在标题和摘要中提供具体样本数量 | NA | 转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组测序 | NA | 数据来源于基因表达综合数据库,具体平台未说明 |
| 669 | 2026-09-04 |
Intervening in p53-Induced Death Domain Protein 1 to Decrease Regulatory T Cell Recruitment Boosts the Effectiveness of Radiofrequency Ablation Combined With Anti-Programmed Cell Death Protein-1 Therapy in Hepatocellular Carcinoma
2026-Jul-03, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101844
PMID:42398821
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研究论文 | 本研究探讨了在肝细胞癌中干扰p53诱导死亡结构域蛋白1以减少调节性T细胞招募,从而增强射频消融联合抗程序性细胞死亡蛋白-1疗法的疗效 | 首次揭示p53诱导死亡结构域蛋白1通过caspase-2/鼠双微体2轴增强p53表达、促进转化生长因子-β1分泌并驱动T细胞分化,从而连接不完全消融与免疫抑制微环境,为联合治疗提供新靶点 | 研究主要基于小鼠模型和回顾性临床数据,缺乏前瞻性临床试验验证,且机制研究侧重单一靶点,可能需要更大样本和多方验证 | 识别不完全射频消融后残余肿瘤细胞与免疫抑制微环境之间的肿瘤内在分子联系,以改善治疗结果 | 肝细胞癌患者和小鼠模型中的肿瘤细胞及调节性T细胞 | 机器学习、数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、转录组分析、蛋白质印迹、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、免疫组织化学/免疫荧光 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA) | 转录组数据、蛋白质表达、细胞影像 | 回顾性临床队列及小鼠模型,具体样本数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 670 | 2026-09-04 |
Quantitative molecular cartography of emergency myelopoiesis reveals conserved modules of hematopoietic activation
2026-Jul-02, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2026.05.007
PMID:42314682
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序定量描绘紧急髓系造血的分子图谱,揭示造血干细胞和祖细胞激活的保守模块 | 提出了可推广的细胞注释方法HemaScribe和精细化的造血分化定量模型HemaScape,并首次系统比较多种紧急髓系造血诱导剂,发现跨炎症挑战保守的髓系祖细胞激活模块,且该模块在人类中保守并可预测急性髓系白血病预后 | 摘要未提及局限性 | 探究不同紧急髓系造血诱导剂如何通过共享或独特的分子机制调控造血干细胞和祖细胞 | 小鼠造血干细胞和祖细胞(HSPCs),以及人类成人和儿童急性髓系白血病相关数据 | 单细胞转录组学、造血生物学 | 急性髓系白血病(成人和儿童) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | HemaScribe(细胞注释方法),HemaScape(造血分化定量模型) | 单细胞转录组数据 | 多种小鼠HSPCs样本,以及人类急性髓系白血病样本的跨验证数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 671 | 2026-09-04 |
Characteristics of Splenic CD8αβ+ γδT Cells in Plasmodium yoelii Infection
2026-Jul, Parasite immunology
IF:1.4Q3
DOI:10.1111/pim.70091
PMID:42390699
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研究论文 | 本研究探讨了约氏疟原虫感染小鼠脾脏中CD8αβ+ γδT细胞的特征,发现其活化与功能增强,可能参与抗疟疾免疫应答。 | 首次详细表征了疟疾感染中CD8αβ γδT这一特定亚群的表型和功能特性,揭示了其向IFN-γ产生型极化并上调DNA复制修复相关基因。 | 研究基于小鼠模型,未探讨CD8αβ γδT细胞在人疟疾感染中的确切功能;样本量有限,且未进行功能验证实验。 | 明确CD8αβ γδT细胞在约氏疟原虫感染中的频率变化、表型特征和功能作用及潜在机制。 | 约氏疟原虫感染的C57BL/6小鼠脾脏中的CD45+淋巴细胞,特别是CD8αβ γδT细胞。 | 免疫学 | 疟疾 | 流式细胞术、单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 细胞(免疫细胞) | 共使用若干只雌性C57BL/6小鼠(具体数量未在摘要中指定) | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | NA |
| 672 | 2026-09-04 |
Therapeutic effects of Icariside II on radiation cystitis: revealing the mechanistic role of the FN1/Itgαvβ6-PI3K/AKT signaling pathway using single-cell RNA sequencing
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000005212
PMID:42682324
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序揭示放射性膀胱炎的细胞异质性,并阐明淫羊藿次苷II通过调节FN1/Itgαvβ6-PI3K/AKT信号通路发挥治疗作用的机制 | 首次通过单细胞RNA测序描绘放射性膀胱炎的膀胱细胞图谱,识别出16种细胞类型,并发现FN1-Itgαvβ6相互作用是纤维化进展的关键驱动因素,同时验证了淫羊藿次苷II作为潜在治疗药物的作用 | 该研究基于大鼠模型,其发现需要进一步在人类样本中验证;未提供充分的体内疗效数据,且对ICA II的长期安全性评估不足 | 阐明放射对膀胱不同细胞类型的影响,并探究淫羊藿次苷II在放射性膀胱炎治疗中的保护作用及潜在分子机制 | 放射性膀胱炎大鼠模型中的膀胱细胞,以及淫羊藿次苷II对细胞间相互作用的影响 | 单细胞测序 | 放射性膀胱炎 | 单细胞RNA测序、免疫共沉淀、分子动力学模拟 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 实验使用大鼠模型,具体样本数量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 673 | 2026-09-04 |
RUNX3+ basal-like malignant cells: architects of an immunosuppressive microenvironment in bladder cancer: a comprehensive bioinformatics analysis of single-cell and spatial transcriptomics
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000005103
PMID:42682391
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研究论文 | 本研究通过对膀胱癌单细胞和空间转录组数据进行综合分析,揭示了RUNX3+基底样恶性细胞在免疫抑制微环境中的重要作用及其作为预后标志物的潜力 | 整合多个公开的单细胞RNA-seq数据集,并结合单核和空间转录组数据验证,首次识别出RUNX3调控的基底样恶性细胞亚群及其通过MIF-CD74信号通路与免疫细胞互作的机制 | 研究主要基于公开数据集和生信分析,缺乏实验验证的深度,且样本来源的异质性可能影响结果的普适性 | 利用单细胞和空间转录组学技术,深入解析膀胱癌的细胞异质性,识别可靠的预后生物标志物,并为个体化治疗策略提供依据 | 膀胱癌和正常样本中的恶性上皮细胞、免疫细胞(如CD8 T细胞、IL7R+初始T细胞、FCN1+单核细胞)及其微环境 | 生物信息学分析、单细胞转录组学、空间转录组学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、空间转录组测序、RNA荧光原位杂交 | NA | 基因表达数据(单细胞、单核、空间) | 62个膀胱癌和正常样本,超过530,000个细胞 | 10x Genomics, Illumina, NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq, 10x Visium | 10x Chromium Single Cell 3', 10x Visium Spatial Transcriptomics |
| 674 | 2026-09-04 |
Potential of RAD51C as a hub gene and therapeutic target in bladder cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2026-Jul, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000005112
PMID:42682403
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研究论文 | 通过生物信息学与实验分析,揭示RAD51C作为膀胱癌枢纽基因和治疗靶点的潜力 | 结合多算法机器学习与单细胞RNA测序,识别CREB-c-Jun转录因子靶向关键基因,并首次提名RAD51C作为膀胱癌治疗靶点 | 未提供明确的局限性说明 | 评估CREB-c-Jun转录因子靶向基因在膀胱癌预后及免疫治疗反应中的作用,并探索RAD51C作为治疗靶点的可行性 | 膀胱癌细胞系、肿瘤组织样本、基因表达及突变数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序、RNA测序、机器学习 | 多算法机器学习模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据、临床数据 | 未具体说明样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
| 675 | 2026-09-04 |
Blood IL-6 is a critical trigger of depressive symptoms in a mouse model for human atopic dermatitis
2026-Jun-20, Translational psychiatry
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41398-026-04211-2
PMID:42321187
|
研究论文 | 研究揭示特应性皮炎中血液IL-6和可溶性IL-6Rα通过破坏血脑屏障和抑制海马神经发生触发抑郁症状 | 首次证明外周血IL-6和sIL-6Rα在特应性皮炎中介导抑郁行为,并确定其通过IL-6Rβ而非IL-6Rα发挥作用 | 使用小鼠模型,可能不能完全代表人类特应性皮炎相关抑郁的复杂性 | 探究特应性皮炎导致抑郁症状的潜在机制,特别是IL-6在中枢神经系统中的作用 | NC/Tnd小鼠(自发性AD)、IL-6缺陷小鼠、培养的神经元祖细胞 | 神经科学、免疫学、基因组学 | 特应性皮炎、抑郁症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型、中和抗体实验 | 转录组数据、行为学数据 | 详见正文 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 不清楚 |
| 676 | 2026-09-04 |
An LSCC-specific R-loop-related model predicts prognosis and neoadjuvant immunotherapy response and identifies EIF5A2-mediated tumor-immune crosstalk
2026-Jun-20, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-026-04456-7
PMID:42323596
|
研究论文 | 本研究构建了喉鳞状细胞癌特异性R-loop相关预后模型,并鉴定出EIF5A2为核心免疫调控基因,揭示了其在肿瘤-免疫相互作用中的作用 | 首次构建喉鳞状细胞癌特异性R-loop相关基因预后模型,并利用单细胞RNA测序数据识别核心基因EIF5A2,揭示其介导的肿瘤-免疫串扰机制 | 主要依赖公共数据库数据进行验证,缺乏前瞻性临床队列和体外功能实验验证 | 开发喉鳞状细胞癌的预后分层和免疫治疗预测生物标志物,并探索R-loop相关的肿瘤免疫调控机制 | 喉鳞状细胞癌患者,包括TCGA-LSCC队列、GSE25727、GSE27020、GSE210287和GSE290927数据集中的样本 | 基因组学、转录组学 | 喉鳞状细胞癌 | 转录组测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | LASSO-Cox回归模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据、临床数据 | 多个公共数据集,具体样本量未在摘要中明确 | NA | 批量RNA测序(bulk RNA-seq)、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 677 | 2026-09-04 |
GenOT: generative optimal transport enables spatiotemporal interpolation and generation in cross-platform spatial transcriptomics
2026-Jun-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04166-z
PMID:42321873
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研究论文 | 提出了GenOT,一种结合多尺度图自监督对比学习与最优传输重心理论的生成框架,用于跨切片和跨平台的空间转录组时空插值 | 核心创新在于引入基于最优传输重心的插值算法,数学建模异质性样本间的空间分布差异,以重建时空基因表达动态 | 摘要中未提及明显局限 | 实现空间转录组学中跨平台和跨样本的时空数据插值与生成,以整合信息并重建发育轨迹 | 空间转录组数据,涵盖不同切片和平台的数据集 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 生成框架(可能基于图神经网络和最优传输,未具体指定模型架构如CNN等) | 空间基因表达数据 | 摘要中未明确提及样本数量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 678 | 2026-09-04 |
FSTL4 interaction with Gαi proteins activates the Akt-mTOR pathway to drive malignant phenotypes in non-small cell lung cancer
2026-06-17, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-03001-z
PMID:42310642
|
研究论文 | 本研究探讨了FSTL4在非小细胞肺癌中的临床相关性、细胞类型特异性定位及其通过激活Akt-mTOR通路驱动恶性表型的机制 | 首次揭示FSTL4与Gαi蛋白相互作用并通过Gαi1/3-Akt-mTOR级联促进NSCLC恶性表型,且对恶性细胞具有选择性依赖性 | 未明确提及研究局限性 | 确定FSTL4在NSCLC中的临床意义、细胞类型特异性定位及其机制作用,评估其作为预后生物标志物的潜力 | 非小细胞肺癌组织样本、肺腺癌细胞系、正常肺上皮细胞、原发性人NSCLC细胞及异种移植小鼠模型 | 癌症生物学 | 非小细胞肺癌 | 单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因敲除、基因敲低、过表达、蛋白质互作分析、免疫印迹、异种移植实验 | 不适用 | 临床组织数据、单细胞转录组、细胞实验数据 | TCGA数据及局部切除组织样本,具体样本量未在摘要中提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 679 | 2026-09-04 |
Decoding regional keratinization in human oral mucosa through high-resolution spatial transcriptomics
2026-Jun-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-53276-y
PMID:42297861
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研究论文 | 本研究通过高分辨率空间转录组学构建人类口腔黏膜的图谱,揭示角化与非角化区域的特异性分子机制 | 首次使用10x Visium HD平台在人类口腔黏膜中实现高分辨率空间转录组分析,识别出驱动角化差异的基质-上皮相互作用 | 研究仅基于两名健康供者,样本量小,可能限制结果的普遍性 | 理解口腔黏膜区域特异性角化的空间和分子机制,为再生治疗提供基础 | 人类口腔黏膜中龈牙结合部的角化与非角化区域 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | 聚类分析、伪时间轨迹推断、配体-受体网络分析 | 空间转录组数据 | 两名健康供者的龈牙结合部标本,产生2个角化区和2个非角化区 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium HD | 10x Visium HD平台用于福尔马林固定石蜡包埋标本 |
| 680 | 2026-09-04 |
Multi-omics and experimental evidence in human chondrocytes identify caspase-8 as a non-apoptotic regulator of inflammatory, senescent, and fibrotic signaling in osteoarthritis
2026-06-06, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-026-02985-y
PMID:42249421
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研究论文 | 通过多组学分析与实验验证,在人软骨细胞中鉴定caspase-8作为骨关节炎中非凋亡性的炎症、衰老和纤维化信号调节因子 | 首次系统揭示caspase-8在骨关节炎软骨细胞中作为非凋亡性调控枢纽,连接炎症-衰老与纤维化重塑,并结合多组学、功能实验和孟德尔随机化验证其治疗靶点潜力 | 摘要未明确提及研究的局限性,可能包括样本来源有限、动物模型与人类差异及因果推断的潜在混杂等,但文中未提供具体信息 | 研究caspase-8在骨关节炎发病机制中的作用及其作为疾病修饰治疗靶点的潜力 | 人类骨关节炎软骨细胞、衰老(晚期传代)软骨细胞、自然老化软骨、小鼠DMM模型软骨及软骨细胞亚群 | 基因组学、转录组学、蛋白质组学、生物信息学 | 骨关节炎 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 空间转录组学, 定量蛋白质组学, siRNA敲低, 抑制剂处理, 蛋白质-蛋白质对接, 孟德尔随机化, SMR/HEIDI分析 | NA | 转录组数据(RNA-seq)、单细胞转录组、空间转录组、蛋白质组学数据、临床和遗传关联数据 | 多个公开数据集(GSE168505、GSE246425、GSE287861、GSE26475、GSE254844、GSE255460)及体外实验样本,具体数量不明 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |