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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6761 | 2025-11-15 |
Elucidating the Mechanism of Radiation Therapy on Mesenchymal Cell Fate in Preventing Heterotopic Ossification
2025-Dec-01, Annals of surgery
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/SLA.0000000000006366
PMID:38829115
|
研究论文 | 本研究通过动物模型探究放射治疗预防异位骨化的机制,在单细胞水平分析放射诱导的间充质细胞命运变化 | 首次在单细胞水平探索放射治疗预防创伤性异位骨化的机制,揭示放射对间充质祖细胞数量和分化的双重影响 | 研究仅限于小鼠模型,临床转化需进一步验证 | 阐明放射治疗预防异位骨化的分子机制 | C57BL6J雄性小鼠的间充质祖细胞 | 单细胞测序分析 | 异位骨化 | 单细胞RNA测序,免疫荧光显微镜,显微计算机断层扫描 | 动物模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6762 | 2025-11-15 |
Analysis of the role of RNA regulatory networks in cancer treatment: Mechanisms, applications and future prospects (Review)
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2909
PMID:41220798
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综述 | 本文综述了RNA调控网络在癌症治疗中的作用机制、应用前景及未来发展方向 | 重点关注isomiRs的功能动态及其在精准肿瘤学中的转化潜力,整合了单细胞测序和CRISPR筛选等先进技术 | NA | 分析RNA调控网络在癌症治疗中的机制、应用和未来前景 | RNA调控网络,特别是isomiRs和竞争性内源RNA网络 | 自然语言处理 | 癌症 | 单细胞测序,CRISPR筛选 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6763 | 2025-11-15 |
A drop-based workflow for fast and robust joint profiling of transcriptome and chromatin accessibility in the same cell
2025-Dec, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000258
PMID:41221081
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研究论文 | 开发了一种基于液滴微流控的单细胞多组学工作流程,可在同一细胞中同时分析转录组和染色质可及性 | 提出快速、稳健的液滴微流控协议,实现单细胞水平RNA和染色质可及性的同步分析 | NA | 开发单细胞多组学技术以解析细胞异质性和生物学复杂性 | 单个细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 数万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | 液滴微流控系统, 凝胶珠乳浊液(GEM)生成技术 |
| 6764 | 2025-11-15 |
TLR4-IN-C34 attenuates the progression of osteoarthritis through inhibiting inflammation, angiogenesis and pain
2025-Dec, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.112084
PMID:40854507
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研究论文 | 本文研究TLR4抑制剂C34通过抑制炎症、血管生成和疼痛来减缓骨关节炎进展的作用机制 | 首次在单细胞水平证实TLR4在OA患者软骨中表达升高,并发现特异性TLR4抑制剂C34具有多重抗OA效应 | NA | 探讨TLR4抑制剂C34对骨关节炎的治疗作用及机制 | 人类软骨样本、小鼠骨关节炎模型 | NA | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6765 | 2025-11-15 |
Evolution and Co-occurrence of PI3K Pathway Gene Mutations in Endometrial Carcinoma Molecular Subtypes at the Single-Cell Level
2025-Nov-14, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-1237
PMID:40833784
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研究论文 | 通过单细胞测序研究子宫内膜癌分子亚型中PI3K通路基因突变的进化模式和共存情况 | 首次在单细胞水平揭示不同分子亚型子宫内膜癌中PI3K通路基因突变的进化模式差异 | 样本量较小,属于探索性研究,需要进一步验证 | 探究PI3K通路基因突变在子宫内膜癌不同分子亚型中的进化模式 | 子宫内膜样子宫内膜癌组织样本 | 单细胞基因组学 | 子宫内膜癌 | 单核DNA测序 | NA | 基因组DNA序列数据 | 11个肿瘤样本(NSMP=5,MMRd=3,POLE=3),共50,009个细胞 | NA | 单细胞DNA测序 | NA | 针对64个癌症相关基因热点变异及PTEN、PIK3R1、PIK3CA编码序列的测序 |
| 6766 | 2025-11-15 |
Exploring the mediating role of potential therapeutic genes in the pathogenesis of hypopituitarism through the metabolites from a genomic perspective
2025-Nov-13, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-025-10169-1
PMID:41233666
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研究论文 | 通过整合基因组数据与代谢物信息,探索潜在治疗基因在垂体功能减退症发病机制中的中介作用 | 首次采用孟德尔随机化方法系统分析基因-代谢物-垂体功能减退症的因果路径,发现UBAC1基因通过1-Methyl-4-imidazoleacetate代谢物介导疾病风险的机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据,缺乏实验验证;中介效应仅解释4.35%的总效应,可能存在其他未发现的机制 | 识别垂体功能减退症的潜在药物靶点并阐明其发病机制 | 垂体功能减退症相关基因和血清/脑脊液代谢物 | 基因组学 | 垂体功能减退症 | 表达数量性状位点分析、全基因组关联研究、孟德尔随机化、贝叶斯共定位 | 两样本孟德尔随机化、两步孟德尔随机化 | 基因组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6767 | 2025-11-15 |
Tracing the enteric neural crest cell pathway from origin to colonization: insights into Hirschsprung's disease
2025-Nov-11, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11211-w
PMID:41217573
|
综述 | 本文系统综述了肠道神经系统发育过程中肠神经嵴细胞的迁移路径及其在先天性巨结肠症中的作用机制 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学新技术,揭示ENS发育过程中的时空异质性和谱系多样化 | 肠道组织的固有复杂性(包括多样细胞类型、微环境相互作用和多尺度调控网络)仍阻碍机制洞察和精准治疗 | 阐明肠道神经系统发育的分子机制,重点关注肠神经嵴细胞的迁移过程 | 肠神经嵴细胞及其形成的肠道神经系统 | 发育生物学 | 先天性巨结肠症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6768 | 2025-11-15 |
Single-cell hdWGCNA identifies ICI-related-colitis key CD8 + T cells linked to immunotherapy response and prognosis in colon cancer
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03891-4
PMID:41217618
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和hdWGCNA分析鉴定与免疫检查点抑制剂相关结肠炎(CIC)相关的关键CD8+T细胞,并探讨其对结肠癌预后和免疫治疗疗效的影响 | 首次使用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)识别CIC相关基因模块,发现CIC关键CD8+T细胞在免疫治疗反应中的重要作用 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究仍需进一步实验证实 | 探索免疫检查点抑制剂相关结肠炎的免疫学机制及其对结肠癌预后的影响 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和未发生结肠炎患者的单细胞RNA测序数据 | 单细胞转录组学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, 伪时间分析, hdWGCNA | 预后评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | PD-1抑制剂诱导结肠炎患者和对照患者的单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6769 | 2025-11-15 |
Deciphering cell-type-and temporally specific matrisome expression signatures in human cortical development and neurodevelopmental disorders via scRNA-seq meta-analysis
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64381-3
PMID:41219193
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序荟萃分析揭示人类皮质发育过程中细胞类型特异性和时间特异性的基质组表达特征及其与神经发育障碍的关联 | 首次通过大规模scRNA-seq荟萃分析系统描绘人类皮质发育过程中细胞类型特异性和时间特异性的基质组表达动态,并揭示其与神经发育障碍的关联 | 研究仅基于转录组数据,缺乏蛋白质水平验证;样本时间窗口限于孕8-26周;数据来源于不同研究的整合 | 阐明人类皮质发育过程中细胞类型特异性基质组基因表达特征及其在神经发育障碍中的潜在作用 | 人类皮质发育过程中的各种细胞类型及其基质组基因表达 | 单细胞转录组学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | 荟萃分析 | 单细胞转录组数据 | 37个供体,孕8-26周,来自6项独立研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6770 | 2025-11-15 |
In-silico discovery of druggable molecular signatures that drive dengue fever to severe dengue fever highlighting common pathogenesis through single-cell RNA-Seq analysis
2025-Nov-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23000-3
PMID:41219276
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现登革热向重症登革热转变的关键分子特征和候选药物 | 整合多个单细胞RNA测序数据集,识别出与登革热疾病进展相关的关键细胞类型和宿主基因,并通过计算药物筛选推荐候选治疗药物 | 研究基于计算分析,需要实验验证;样本来源和数量可能存在限制 | 探索登革热向重症登革热发展的分子机制并发现潜在治疗靶点 | 登革热和重症登革热患者样本 | 生物信息学 | 登革热 | 单细胞RNA测序, 细胞间通讯分析, 差异表达分析, 蛋白质相互作用网络分析, 分子对接, ADME/T分析 | PPI网络分析, 分子对接模型 | 单细胞RNA测序数据 | 两个数据集(GSE220969和GSE154386),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6771 | 2025-11-15 |
Exploring drug resistance via intercellular crosstalk using spatial transcriptomics in high-grade serous ovarian carcinoma
2025-Nov-11, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01122-1
PMID:41219363
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学探索高级别浆液性卵巢癌中细胞间通讯与PARP抑制剂耐药性的关系 | 首次结合空间转录组学和单细胞RNA测序数据,发现midkine信号通路在PARP抑制剂耐药中的作用,并鉴定出SDC4受体表达与患者生存期的关联 | 样本量较小(仅8个肿瘤样本),需要在更大队列中验证发现 | 探索高级别浆液性卵巢癌中PARP抑制剂耐药机制 | 高级别浆液性卵巢癌患者的肿瘤样本 | 空间转录组学 | 卵巢癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 8个高级别浆液性卵巢癌肿瘤样本 | 10x Genomics | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium | Visium空间转录组平台 |
| 6772 | 2025-11-15 |
Molecular mechanisms and genetic predisposition to osteoarthritis and osteosarcoma through Mendelian inheritance patterns
2025-Nov-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03917-x
PMID:41219646
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研究论文 | 通过孟德尔遗传方法系统分析骨关节炎和骨肉瘤的遗传变异特征和细胞分子网络 | 首次结合GWAS和单细胞RNA测序系统阐明两种骨科疾病的遗传易感机制和细胞异质性特征 | NA | 探究骨关节炎和骨肉瘤的遗传易感性和分子机制 | 骨关节炎和骨肉瘤的遗传变异及细胞分子网络 | 生物信息学 | 骨科疾病 | GWAS, 单细胞RNA测序, t-SNE降维分析, 蛋白互作网络分析 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6773 | 2025-11-15 |
Integrated bulk and single-cell transcriptomics identifies shared and specific immune signatures in Takayasu Arteritis
2025-Nov-11, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03673-x
PMID:41219777
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研究论文 | 通过整合外周血T细胞亚群的bulk RNA测序和主动脉组织的单细胞RNA测序,揭示高安动脉炎中CD4⁺和CD8⁺ T细胞的共享和特异性免疫特征 | 首次整合外周血T细胞亚群的bulk转录组和主动脉组织的单细胞转录组分析,发现EGR1作为跨区室一致上调的关键转录调节因子 | 样本量较小(8例初治TAK患者外周血,3例TAK患者主动脉组织),需更大规模验证 | 寻找高安动脉炎的机制性生物标志物和治疗靶点 | 高安动脉炎患者的外周血CD4⁺和CD8⁺ T细胞及主动脉组织 | 生物信息学 | 高安动脉炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 基因富集分析, 蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据 | 8例初治TAK患者外周血+3例健康对照,3例TAK患者主动脉组织+3例动脉粥样硬化对照 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6774 | 2025-11-15 |
Extracellular vesicle-induced lipid dysregulation drives liver premetastatic niche formation in colorectal cancer
2025-Nov-10, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-334851
PMID:40562522
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研究论文 | 本研究揭示了结直肠癌细胞来源的细胞外囊泡通过诱导肝脏脂质积累促进肝转移前微环境形成的机制 | 首次发现高转移性结直肠癌细胞通过细胞外囊泡传递促脂肪生成脂质驱动肝脏转移前微环境形成 | NA | 阐明结直肠癌细胞来源的细胞外囊泡促进肝转移前微环境形成的分子机制 | 结直肠癌细胞、肝转移前微环境、细胞外囊泡、库普弗细胞 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 脂质组学、单细胞测序、类器官培养 | NA | 脂质组数据、单细胞测序数据、临床样本数据 | 小鼠模型和结直肠癌患者肿瘤样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6775 | 2025-11-15 |
Investigating prognostic features in high-grade serous ovarian cancer through gene regulatory network inference with single-cell transcriptomic profiles
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-22937-9
PMID:41214061
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据推断基因调控网络,识别高级别浆液性卵巢癌的预后特征 | 开发了结合单细胞RNA测序分析、元细胞构建、基因调控网络推断和预后预测的分类流程,证明基于调控子的特征比差异表达特征更有效 | 需要同时具备用于GRN推断的单细胞数据和具有临床结果的大块RNA-seq数据才能推广到其他癌症类型 | 识别高级别浆液性卵巢癌的预后特征 | 高级别浆液性卵巢癌患者 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,大块RNA测序,基因调控网络推断 | 二元分类模型 | 单细胞转录组数据,大块RNA测序数据 | 118,173个细胞(来自HGSOC患者),1,211个元细胞,342名TCGA HGSOC患者 | NA | 单细胞RNA-seq,大块RNA-seq | NA | NA |
| 6776 | 2025-11-15 |
A novel information-theoretic approach reveals loss of effective biomolecular communication in aging muscle cells
2025-Nov-06, The journals of gerontology. Series A, Biological sciences and medical sciences
DOI:10.1093/gerona/glaf195
PMID:40920357
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研究论文 | 本研究应用信息论方法分析骨骼肌单细胞RNA-seq数据,揭示衰老过程中肌肉细胞生物分子通讯效率的下降 | 首次将信息论方法应用于单细胞RNA-seq数据,量化衰老过程中转录因子与靶基因间通讯效率的损失 | 研究仅基于转录组数据,未考虑其他分子层面的调控机制 | 探究衰老过程中生物分子通讯效率的变化规律 | 年轻、中年和老年动物的骨骼肌细胞 | 生物信息学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | 信息论模型 | 单细胞转录组数据 | 年轻、中年和老年三个年龄组的动物骨骼肌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6777 | 2025-11-15 |
Spatial Multiomics Defines a Shared Tumor Infiltrative Signature at the Resection Margin in High-Grade Gliomas
2025-Nov-03, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4708
PMID:40759029
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研究论文 | 本研究通过空间多组学技术定义了高级别胶质瘤切除边缘的共享肿瘤浸润特征 | 首次在匹配的肿瘤核心和边缘区域生成单核多组学数据集,结合空间转录组学识别出跨HGG亚型的共享浸润特征 | 样本量较小(4例用于单核测序,2例用于空间转录组学),需要更大队列验证 | 研究高级别胶质瘤切除边缘的残留病变生物学特征 | 高级别胶质瘤患者的肿瘤核心和边缘组织 | 数字病理学 | 脑胶质瘤 | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学, CRISPR/Cas9, 染色质免疫沉淀测序 | 计算分析包括功能富集、差异分析、RNA速度和伪时间分析 | 单细胞多组学数据、空间转录组数据 | 4例不同亚型的4级高级别胶质瘤(36,811个snRNA-seq核,30,705个snATAC-seq核),外加2例用于空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 单核ATAC测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6778 | 2025-11-15 |
Insulin signalling-associated cell fate promotes neoplastic invasiveness in non-functioning pituitary gonadotroph adenoma via cis-regulatory elements activation
2025-Nov, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03122-1
PMID:40935899
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据揭示了胰岛素信号相关细胞命运通过顺式调控元件激活促进无功能性垂体促性腺激素腺瘤的侵袭性 | 首次发现胰岛素信号相关细胞命运驱动肿瘤侵袭性,并识别了SREBF1和IGF2BP2相关顺式调控元件在染色质互作重建中的关键作用 | 样本量相对有限(3例单细胞测序患者),需要更大规模研究验证 | 探究无功能性垂体促性腺激素腺瘤侵袭性的分子机制 | 无功能性垂体促性腺激素腺瘤患者和原代细胞系 | 单细胞多组学 | 垂体腺瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq, 顺式共可及网络分析 | NA | 单细胞转录组数据,单细胞表观基因组数据 | 3例NFGA患者(单细胞测序),210例患者队列验证,3个原代细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 6779 | 2025-11-15 |
Immune cell dynamics and their role in cardiac injury: Mechanisms and therapeutic implications
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118608
PMID:41016152
|
综述 | 本文系统阐述了免疫细胞在心脏损伤中的动态变化机制及其治疗意义 | 整合单细胞转录组学、空间组学、免疫代谢和神经内分泌-免疫相互作用等多维度数据,提出精准免疫治疗框架 | NA | 阐明免疫细胞在心血管疾病中的动态作用机制及治疗策略 | 中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞、T细胞等免疫细胞及其与心肌细胞、成纤维细胞、内皮细胞的相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、空间组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 6780 | 2025-11-15 |
Spatial immune landscapes of the human placenta: Biomarkers and therapeutic insights in pregnancy disorders
2025-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118688
PMID:41160999
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研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学技术揭示人类胎盘的免疫景观及其在妊娠疾病中的生物标志物和治疗潜力 | 首次利用空间分析技术解析胎盘微环境中免疫细胞与滋养细胞的相互作用空间组织 | 未整合多组学和纵向分析数据 | 研究胎盘微环境在妊娠疾病中的免疫调控机制 | 人类胎盘组织 | 空间转录组学 | 妊娠疾病 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间基因表达数据, 空间蛋白质表达数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | NA |