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当前共找到 40345 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-06-07 |
Breast Cancer Brain Metastases: Current Understanding and Future Directions
2026-Feb-05, Current oncology reports
IF:4.7Q1
DOI:10.1007/s11912-026-01753-y
PMID:41642399
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综述 | 综述乳腺癌脑转移的最新进展，包括转移机制、肿瘤微环境相互作用、受体不一致性、诊断创新及治疗策略 | 整合了JAK-STAT信号、同源重组缺陷、神经元拟态等新机制，并强调受体不一致性对系统治疗的影响以及液体活检、空间转录组学等新兴诊断工具的应用 | 机器学习外部验证有限，前瞻性试验证据不足 | 阐明乳腺癌脑转移的精准管理策略并确定未来研究优先方向 | 乳腺癌脑转移的分子机制、诊断方法和治疗策略 | 机器学习 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 图像， 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 642 | 2026-06-07 |
Integrative metabolomic and single-cell transcriptomic analysis of recurrent condyloma acuminatum in humans
2026-Feb-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37989-8
PMID:41639275
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研究论文 | 结合代谢组学和单细胞转录组学分析复发性尖锐湿疣的分子和免疫机制 | 首次整合代谢组学与单细胞RNA测序，揭示复发尖锐湿疣中角质细胞、M2巨噬细胞和树突状细胞中代谢基因失调及精氨酸-多胺通路改变的协同作用 | NA | 探究尖锐湿疣复发的分子和免疫机制 | 人类尖锐湿疣复发患者的病变组织 | 单细胞转录组学 | 尖锐湿疣 | 代谢组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据，单细胞转录组数据 | 人类复发尖锐湿疣病变组织和对照样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 643 | 2026-06-07 |
STransfer: a transfer learning-enhanced graph convolutional network for clustering spatial transcriptomics data
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag049
PMID:41601194
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研究论文 | 提出一种基于迁移学习的图卷积网络STransfer，用于空间转录组数据聚类 | 结合图卷积网络与正点互信息分别建模局部和全局空间依赖，利用注意力机制融合多图特征，并引入跨切片知识迁移提升未标记切片聚类精度 | 未明确提及局限性（摘要中仅聚焦方法优势与实验验证） | 提升空间转录组多切片数据集的聚类准确性并降低人工标注成本 | 空间转录组组织切片数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 图卷积网络（GCN） | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 644 | 2026-06-07 |
Inference of marker genes of subtle cell state changes via iLR: iterative logistic regression
2026-Feb-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag051
PMID:41627891
|
研究论文 | 提出迭代逻辑回归（iLR）方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别微小细胞状态变化的标记基因 | 结合帕累托前沿优化平衡基因集大小和分类性能，能识别跨器官、跨物种的转录特征 | 仅在模拟数据和特定疾病数据集上验证，实际临床适用性需进一步测试 | 开发一种能从复杂单细胞数据中推断可解释转录特征的方法 | 神经元亚型（健康vs自闭症患者）、不同肿瘤微环境中的细胞类型 | 机器学习 | 自闭症谱系障碍， 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 逻辑回归 | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 645 | 2026-06-07 |
TOP2A drives T-cell infiltration and immune remodeling in cyclophosphamide-induced cystitis: a single-cell sequencing study with potential implications for interstitial cystitis
2026-Feb-02, BMC urology
IF:1.7Q3
DOI:10.1186/s12894-026-02061-0
PMID:41622168
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研究论文 | 利用环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型，通过单细胞测序揭示TOP2A驱动T细胞浸润和免疫重塑的机制，为间质性膀胱炎提供潜在治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序联合节律基因和免疫微环境分析，发现TOP2A是连接节律基因簇和免疫基因簇的唯一重叠基因，并验证其与T细胞浸润的强相关性 | 研究仅限于动物模型，尚未在人类间质性膀胱炎组织中进行验证，且机制探究未深入阐明TOP2A调控T细胞浸润的具体信号通路 | 探讨环磷酰胺诱导的膀胱炎模型中节律基因和免疫微环境重塑的作用，重点关注TOP2A对T细胞浸润的影响 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型及膀胱组织 | 数字病理学 | 间质性膀胱炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 环磷酰胺诱导的膀胱炎大鼠模型（具体样本量未提供） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 646 | 2026-06-07 |
Single-nucleus transcriptional and chromatin accessibility analyses of maturing mouse Achilles tendon uncover the molecular landscape of tendon stem/progenitor cells
2026-Feb-02, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104768
PMID:41627310
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研究论文 | 通过单细胞核转录组和染色质可及性分析，揭示了小鼠成熟跟腱中肌腱干/祖细胞的分子特征 | 首次鉴定出CD55和CD248作为肌腱干/祖细胞的新型表面抗原标志物 | 未提及具体局限性 | 研究肌腱修复能力随生长下降的分子机制，鉴定肌腱干/祖细胞特征标志物 | 2周龄和6周龄小鼠的跟腱细胞 | 单细胞组学 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序、单细胞核RNA测序、单细胞核ATAC测序 | NA | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | 2周龄和6周龄小鼠跟腱组织 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞核RNA测序, 单细胞核ATAC测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和单细胞核ATAC测序系统 |
| 647 | 2026-06-07 |
A single-nucleus RNA sequencing reveals the differential fate mechanism underlying flavonoid biosynthesis of middle and inner tepals in Chimonanthus praecox
2026-Feb, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150307
PMID:41554353
|
研究论文 | 通过单核RNA测序揭示蜡梅内层和中层花被片中类黄酮生物合成的差异命运机制 | 首次利用单核RNA测序构建蜡梅花被片的单细胞转录组图谱，并通过伪时间分析发现细胞发育调控决定花被片颜色命运，同时鉴定了多个关键转录因子 | 尚未明确这些调控因子在花被片颜色形成中的具体功能验证 | 理解蜡梅花被片中类黄酮代谢物特定积累的分子机制 | 蜡梅内层和中层花被片 | 数字病理学 | 不适用 | 单核RNA测序 | 不适用 | 单细胞转录组数据 | 内层花被片13,073个细胞核，中层花被片12,625个细胞核 | 不适用 | 单核RNA测序 | 不适用 | 不适用 |
| 648 | 2026-06-07 |
Integrated immune profiling of chordomas reveals spatially organized niches and functional heterogeneity
2026-Feb-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf213
PMID:41586579
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序、TCR分析和多重免疫荧光，对脊索瘤的免疫微环境进行整合分析，揭示了空间组织的免疫生态位和功能异质性 | 首次整合空间、转录组和TCR数据，系统揭示脊索瘤免疫景观的异质性和系统性免疫动态，并识别肿瘤特异性TCR基序 | 样本量较小（35例肿瘤和6例配对PBMC），且为单一肿瘤类型，可能限制结果的普适性 | 解析脊索瘤的免疫微环境特征，探索系统性抗肿瘤免疫机制及潜在免疫治疗靶点 | 35例脊索瘤样本和6例配对肿瘤-外周血单核细胞样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体谱分析、多重免疫荧光 | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据、TCR序列数据、空间蛋白表达数据 | 35例肿瘤样本和6例配对外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 649 | 2026-06-07 |
Immunomodulatory Mechanism of Baiyaojian Decoction on Periodontitis: Network Pharmacology, Single-Cell RNA Sequencing and Molecular Docking
2026-Feb, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.71034
PMID:41605874
|
研究论文 | 通过网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接探讨白药煎剂对牙周炎的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接多种方法，系统阐明白药煎剂治疗牙周炎的多成分、多靶点免疫调节机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证，缺乏动物模型和临床试验的进一步验证 | 揭示白药煎剂治疗牙周炎的分子免疫调节机制 | 白药煎剂的活性成分及其治疗牙周炎的靶点 | 自然语言处理 | 牙周炎 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, RNA-seq | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据, 分子结构数据 | GSE16134包含273个样本, GSE152042和GSE171213包含单细胞RNA-seq样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 650 | 2026-06-07 |
Ligand-receptor hotspots in dendritic-T cell niches expose targets in autoimmunity
2026-Feb, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2026.01.006
PMID:41616848
|
研究论文 | 通过空间转录组学和单细胞RNA测序分析树突状细胞-T细胞相互作用位点的配体-受体网络，揭示自身免疫性皮肤炎症中的新靶点F11R | 首次将空间转录组数据与单细胞RNA测序结合，建立树突状细胞-T细胞共定位区域的配体-受体网络分析框架，并识别出与银屑病严重程度相关的空间富集信号F11R | 未提供明确局限性信息，可能包括样本量有限或验证范围局限于特定数据集 | 识别与自身免疫性皮肤炎症相关的树突状细胞-T细胞通信新兴介质 | 特应性皮炎和银屑病患者的皮肤组织样本 | 计算生物学 | 自身免疫性疾病、银屑病、特应性皮炎 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 包含特应性皮炎和银屑病皮肤样本，具体数量未提及 | 10x Genomics | 空间转录组学、单细胞RNA测序、CITE-seq | 10x Visium、10x Chromium | 10x Visium空间转录组平台、10x Chromium单细胞RNA测序平台、CITE-seq蛋白质组学分析 |
| 651 | 2026-06-07 |
Multi-omics analysis reveals that ginsenoside Rb1 improves prognostic outcomes in sepsis by modulating mitochondrial metabolism MTHFD2 targets
2026-Feb-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37362-9
PMID:41622321
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示人参皂苷Rb1通过调节线粒体代谢MTHFD2靶点改善脓毒症预后的机制 | 首次发现MTHFD2作为脓毒症关键靶点，并通过分子对接筛选出人参皂苷Rb1与之相互作用，动物实验验证其改善器官功能和生存率的效果 | 未提及具体限制 | 增强脓毒症风险分层并识别潜在治疗靶点 | 脓毒症患者和正常样本的线粒体代谢相关基因差异表达 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞测序、分子对接 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 公共数据库的脓毒症和正常样本，以及CLP诱导的脓毒症大鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 652 | 2026-06-07 |
Single-cell analysis reveals neuroprotective histone deacetylase inhibitor pathways
2026-Feb, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.71108
PMID:41630642
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组学和体外验证，整合分析发现组蛋白去乙酰化酶抑制剂曲古抑菌素A通过DISC1通路对阿尔茨海默病具有神经保护作用 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组学整合分析，揭示DISC1作为阿尔茨海默病治疗靶点，并阐明曲古抑菌素A通过GSK3β、线粒体转运和突触可塑性通路发挥神经保护作用 | 未明确提及研究局限性 | 识别可用于阿尔茨海默病的药物再利用候选药物，并阐明其作用机制 | 阿尔茨海默病患者的皮层组织单细胞RNA测序数据集、人诱导多能干细胞来源的皮层神经元暴露于β-淀粉样蛋白寡聚体 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，体外验证 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据 | 阿尔茨海默病皮层区域多个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 653 | 2026-06-07 |
Single-Cell RNA Sequencing and Network Pharmacology Reveal the Potential Role of Oxidative Phosphorylation Inactivation in Diagnosing and Treating Chronic Tendon Injuries
2026-Feb, The journal of gene medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jgm.70085
PMID:41610872
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和网络药理学揭示氧化磷酸化失活在慢性肌腱损伤诊断和治疗中的潜在作用 | 首次结合单细胞RNA测序与网络药理学，系统解析氧化磷酸化通路在慢性肌腱损伤不同细胞类型中的下调机制，并筛选出丙戊酸等潜在治疗药物 | 研究主要基于体外实验和分子对接，缺乏体内动物模型验证；未深入探讨丙戊酸激活OXPHOS的具体分子通路机制 | 阐明氧化磷酸化在慢性肌腱损伤中的作用机制，并探索基于该通路的诊断和治疗策略 | 慢性肌腱损伤患者的病变与非病变肌腱组织，包含肌腱细胞、血管内皮细胞、肌腱干细胞、脂肪细胞和神经元 | 单细胞测序 | 肌腱损伤 | 单细胞RNA测序, Bulk RNA测序, 分子对接 | NA | 基因表达数据 | 多个慢性肌腱损伤患者的病变与非病变肌腱组织样本 | Illumina | 单细胞RNA测序, Bulk RNA测序 | Illumina测序平台 | NA |
| 654 | 2026-06-07 |
Neoadjuvant modified FOLFIRINOX plus nivolumab in borderline-resectable pancreatic ductal adenocarcinoma: a pilot phase 1 trial
2026-Jan-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68976-2
PMID:41620440
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研究论文 | 一项评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗治疗临界可切除胰腺导管腺癌的单臂1b/2期临床试验 | 首次在临界可切除胰腺导管腺癌中评估新辅助化疗联合免疫检查点抑制剂的安全性和病理学缓解率，并通过空间转录组学揭示治疗诱导的肿瘤微环境变化 | 单臂设计、样本量较小（28例患者）、缺乏随机对照，且主要终点为安全性和病理学缓解率，生存数据为事后分析 | 评估新辅助改良FOLFIRINOX联合纳武利尤单抗在临界可切除胰腺导管腺癌患者中的安全性和疗效 | 28例临界可切除胰腺导管腺癌患者 | 数字病理学 | 胰腺导管腺癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、免疫组化图像、空间转录组数据 | 28例患者（其中22例接受手术） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 655 | 2026-06-07 |
Oxidative stress-associated genes TPPP3 and VEGFA in COPD revealed by bulk and single-cell sequencing analysis
2026-Jan-31, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-37375-4
PMID:41620539
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研究论文 | 通过整体和单细胞测序分析，揭示氧化应激相关基因TPPP3和VEGFA在慢性阻塞性肺疾病中的作用 | 首次整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，结合机器学习算法筛选出12个与氧化应激相关的COPD核心基因，并实验验证TPPP3和VEGFA在上皮细胞中的高表达及其在组织重塑中的潜在作用 | 基于公开数据库的二次分析，缺乏大规模临床队列验证；实验验证仅在细胞模型中进行，未在动物或人体组织中进一步确认 | 识别并验证COPD中关键的氧化应激相关基因和通路 | COPD患者样本数据（来自GEO数据库）以及人支气管上皮细胞（BEAS-2B） | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | LASSO回归, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 来自GEO数据库的COPD公共数据集（具体数量未披露） | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 656 | 2026-06-07 |
Integrated single-cell and bulk RNA sequencing unravels neutrophil heterogeneity and validates SPP1 as a prognostic biomarker in cervical cancer
2026-Jan-30, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-15636-9
PMID:41612311
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研究论文 | 整合单细胞与bulk RNA测序揭示宫颈癌中嗜中性粒细胞异质性并验证SPP1作为预后生物标志物 | 首次在宫颈癌中描绘出四种功能不同的嗜中性粒细胞亚群，并发现SPP1-CD44轴介导的嗜中性粒细胞-肿瘤细胞串扰机制，基于此构建的预后模型展现出临床风险分层价值 | 未明确提及，但可能是单细胞样本量较小（n=5）以及对SPP1功能的体外验证仍需更多临床样本支持 | 解析宫颈癌肿瘤微环境中嗜中性粒细胞的异质性及其与肿瘤细胞的相互作用，鉴定新的预后生物标志物 | 宫颈癌组织中的嗜中性粒细胞亚群及其微环境 | 机器学习 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序，LASSO-Cox回归 | LASSO-Cox回归模型，Seurat聚类 | 基因表达数据 | 5例宫颈癌组织（单细胞RNA测序），TCGA-CESC和GTEx队列（bulk RNA测序） | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2026-06-07 |
From origins to nomenclature: illuminating the landscape of CNS fibroblasts and fibroblast-like cells
2026-Jan-30, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-026-02236-8
PMID:41618474
|
综述 | 综述中枢神经系统成纤维细胞及成纤维样细胞的起源、亚型、命名及功能 | 系统梳理了中枢神经系统成纤维细胞及其类似细胞（如血管软脑膜细胞和A型周细胞）的命名混乱问题，并重点探讨了PVF细胞的发育来源 | 未明确说明局限性 | 澄清中枢神经系统成纤维细胞及相关细胞的命名问题，提供细胞亚型和功能的全面见解 | 中枢神经系统成纤维细胞、血管软脑膜细胞、A型周细胞等成纤维样细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 658 | 2026-06-07 |
RNA2seg: a generalist model for cell segmentation in image-based spatial transcriptomics
2026-Jan-30, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03908-9
PMID:41618375
|
研究论文 | 提出一种名为RNA2seg的通用细胞分割模型，用于基于成像的空间转录组学中准确分配RNA分子 | 采用教师-学生训练方案，整合RNA点云与膜和核染色数据，在MERFISH和CosMx数据集的4百万细胞上训练，展现出零样本和少样本学习的卓越性能 | NA | 解决基于成像的空间转录组学中细胞分割的挑战 | 来自七个器官的MERFISH和CosMx数据集中的细胞 | 计算机视觉 | NA | 空间转录组学，MERFISH，CosMx | 教师-学生网络 | 图像，RNA点云 | 超过400万细胞 | NA | 空间转录组学 | MERFISH, CosMx | 基于成像的空间转录组学平台 |
| 659 | 2026-06-07 |
Resolving clonal evolution and selection of extrachromosomal DNA at single-cell resolution
2026-Jan-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-03933-2
PMID:41606654
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研究论文 | 本研究提出一种计算方法ecSingle，利用标准单细胞RNA测序中的等位基因失衡和异常表达，在单细胞水平解析染色体外DNA的肿瘤异质性 | 首次通过单细胞RNA测序数据在单细胞水平解析染色体外DNA的克隆进化与选择，结合单分子长读长测序提升分辨率 | 未明确提及研究局限性 | 在单细胞水平解析染色体外DNA的肿瘤内异质性和克隆选择 | 肿瘤样本中的染色体外DNA以及携带癌基因的克隆 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序、单分子长读长测序 | NA | 基因表达数据、测序数据 | 肿瘤样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 标准单细胞RNA测序平台 |
| 660 | 2026-06-07 |
Preventing surgery-induced natural killer cell suppression and metastases by inhibiting PI3K-gamma signaling in myeloid-derived suppressor cells
2026-Jan-29, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013304
PMID:41611243
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研究论文 | 通过抑制髓源性抑制细胞中的PI3K-γ信号通路，防止手术引起的自然杀伤细胞抑制和转移 | 首次功能性表征手术诱导的MDSCs，并通过小分子筛选发现PI3K-γ抑制剂可有效逆转其免疫抑制活性，为术后治疗提供新策略 | 未提及具体局限性 | 功能性表征手术诱导的MDSCs并识别潜在治疗策略以减轻其免疫抑制效应 | 癌症手术患者的sx-MDSCs及术后自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、多色流式细胞术、小分子库筛选 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 55名癌症手术患者，以及临床前小鼠模型 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | 单细胞RNA测序用于患者样本分析 |