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当前共找到 34043 篇文献，本页显示第 641 - 660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2025-12-08 |
Comprehensive analysis of the role of diverse programmed cell death patterns in sepsis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685533
PMID:41346577
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研究论文 | 本研究通过整合公共转录组数据与独立验证队列，系统分析了脓毒症中多种程序性细胞死亡模式的作用，并开发了诊断风险评分 | 首次系统整合公共微阵列、单细胞转录组数据及独立高通量测序验证，全面揭示了脓毒症中铁死亡、双硫死亡、NETosis和胞吞性死亡四种关键失调的PCD通路，并确定了单核细胞作为整合PCD、代谢重编程和免疫通讯的核心枢纽 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质或功能层面的直接验证；样本量相对有限，且部分数据来自公共数据库，可能存在批次效应 | 系统表征脓毒症中多样化的程序性细胞死亡模式及其临床相关性，以寻找新的诊断标志物和治疗靶点 | 脓毒症患者和健康对照的转录组数据（包括公共数据集和独立队列） | 生物信息学 | 脓毒症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 微阵列 | LASSO回归 | 转录组数据 | 公共数据集：81名对照，165名脓毒症患者；单细胞数据集：4名对照，4名早期脓毒症患者，共52,315个细胞；外加一个独立的RNA-seq验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 642 | 2025-12-08 |
R3HDM4 influences kidney renal clear cell carcinoma progression, immune modulation, and potential links to the IGSF8 immune checkpoint
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1722358
PMID:41346582
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研究论文 | 本研究探讨了R3HDM4基因在肾透明细胞癌中的致癌作用、免疫调节功能及其与免疫检查点IGSF8的潜在联系 | 首次通过整合多组学数据系统评估R3HDM4在KIRC中的预后价值，并发现其通过调控EMT和免疫微环境影响肿瘤进展，同时揭示了与IGSF8免疫检查点的潜在关联 | IGSF8在免疫检查点调控中的作用仍属推测，需要进一步实验验证；研究主要基于生物信息学分析，临床样本验证相对有限 | 阐明R3HDM4在肾透明细胞癌发病机制中的作用，探索其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 肾透明细胞癌组织样本、癌细胞系、肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、免疫组化、Western印迹、RT-qPCR、siRNA敲低 | NA | 基因表达数据、临床数据、DNA甲基化数据、免疫浸润数据 | 来自TCGA、GEO、ArrayExpress、ICGC等多个数据库的KIRC样本数据，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 643 | 2025-12-08 |
Disc inflammation and intercellular communication in shaping the immune microenvironment of intervertebral disc degeneration
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1719293
PMID:41346614
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研究论文 | 本研究通过整合多组转录组和单细胞RNA-seq数据，结合生物信息学分析和体外验证，识别了与椎间盘退变相关的关键生物标志物及其免疫调控作用 | 整合了多种生物信息学方法（如SHAP、孟德尔随机化、CellChat分析）和单细胞RNA-seq数据，系统性地揭示了MMP9、HPGD和UCHL1作为IDD关键生物标志物的作用，并首次强调了MIF信号通路在髓核细胞与免疫细胞互作中的关键角色 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证，缺乏体内实验或临床样本的广泛验证，可能限制其直接临床转化性 | 探究椎间盘退变的分子和免疫机制，识别诊断和治疗潜在靶点 | 椎间盘退变相关的基因和免疫细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq, Western blot | ANN, LASSO, 随机森林, SVM-RFE | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 644 | 2025-12-08 |
Myeloid PDLIM2 repression as a common mechanism of infection susceptibility in lung diseases
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1669117
PMID:41346604
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研究论文 | 本文探讨了PDLIM2在肺部疾病中的抑制作用及其与感染易感性的关联 | 揭示了PDLIM2在肺部疾病中的广泛抑制作用，特别是在髓系细胞中，作为驱动COPD、ILD/IPF和肺癌的共同机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本数据有限，且未详细探讨PDLIM2抑制的具体分子机制 | 研究PDLIM2在慢性阻塞性肺病（COPD）和间质性肺病（ILD/IPF）中的作用及其与感染易感性的关系 | 人类肺部样本、PDLIM2条件敲除小鼠和野生型小鼠 | 生物医学研究 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、组织学分析、体外吞噬和中性粒细胞胞外陷阱（NET）形成实验 | 条件敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织学图像、单细胞RNA测序数据 | 人类肺部样本（具体数量未明确）、PDLIM2条件敲除小鼠和野生型小鼠（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 645 | 2025-12-08 |
Prognostic differential subpopulation classification and immunotherapy response prediction in pancreatic cancer patients based on the gene features of necrotizing apoptosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592231
PMID:41346619
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研究论文 | 本研究基于坏死性凋亡相关基因特征，对胰腺癌患者进行预后亚群分类并预测免疫治疗反应 | 通过多组学数据（包括单细胞数据集、孟德尔随机化和空间转录组学分析）揭示CHST11作为关键预后生物标志物与坏死性凋亡及胰腺癌恶性预后的关联 | NA | 探索坏死性凋亡相关基因在胰腺癌中的预后意义 | 胰腺癌患者 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 聚类分析、差异表达分析、Spearman相关分析、孟德尔随机化、空间转录组学 | 预后模型 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 646 | 2025-12-08 |
Integrated multi-omics reveals GABARAP-mediated mitophagy and pyruvate metabolism as key drivers of osteosarcoma progression
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680554
PMID:41346635
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多组学分析，揭示了GABARAP介导的线粒体自噬与丙酮酸代谢在骨肉瘤进展中的关键驱动作用 | 首次系统性地将GABARAP、线粒体自噬和丙酮酸代谢在骨肉瘤中联系起来，并揭示了其通过代谢适应和免疫逃逸促进肿瘤进展的机制 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏体内模型验证；样本量有限，且未涉及治疗干预的临床前评估 | 探究骨肉瘤中细胞异质性、肿瘤微环境特征以及线粒体自噬与代谢的相互作用机制 | 骨肉瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞（T细胞、NK细胞、Tregs、M2巨噬细胞） | 生物信息学、肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合分析、体外功能实验 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、公共基因表达数据集 | 多个公共数据集（GSE162454, GSE237070, TARGET, GSE21257, GSE32981） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 647 | 2025-12-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Peritoneal Environment and New Insights into Fibrosis in a Continuous Ambulatory Peritoneal Dialysis Patient: A Longitudinal Self-Controlled Study from Dialysis Initiation to 3-Year Follow-Up
2025 Jan-Dec, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000548294
PMID:41347053
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了一名连续非卧床腹膜透析患者从透析开始到3年随访期间腹膜透析流出液中的细胞动态变化，揭示了腹膜纤维化的机制 | 首次在连续非卧床腹膜透析患者中采用纵向自对照设计，利用单细胞RNA测序技术从透析起始至3年随访期间动态解析腹膜微环境及纤维化进程 | 研究仅基于单一样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究长期腹膜透析中腹膜微环境的动态变化及其与腹膜纤维化的关系 | 连续非卧床腹膜透析患者的腹膜透析流出液中的免疫细胞和腹膜间皮细胞 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 1名连续非卧床腹膜透析患者在透析起始和3年随访两个时间点的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 648 | 2025-12-08 |
Improved characterization of single-cell RNA-seq libraries with paired-end avidity sequencing
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.10.602909
PMID:39026715
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研究论文 | 本文评估了Element Biosciences的亲和碱基化学测序技术在单细胞RNA-seq文库中准确测序通过同聚物引物位点的能力，及其对多聚腺苷酸化位点精确量化的影响 | 首次利用Element Aviti仪器的亲和碱基化学测序技术，成功测序通过单细胞RNA-seq中的胸腺嘧啶同聚物，实现配对末端比对以直接独立分配读取到多聚腺苷酸化位点 | 与单端比对相比，配对末端比对并未一致提高读取映射率，且存在低水平伪影，需调整适配器修剪和比对工作流程 | 改进单细胞RNA-seq文库的表征，特别是多聚腺苷酸化位点的精确量化 | 单细胞RNA-seq文库中的cDNA片段，包括同聚物引物位点和后续cDNA序列 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA-seq, 亲和碱基化学测序 | NA | 序列数据 | NA | Element Biosciences, Illumina | 单细胞RNA-seq | Element Aviti, Illumina测序平台 | Element Aviti仪器用于亲和碱基化学测序，Illumina平台用于标准测序比较 |
| 649 | 2025-12-07 |
XPR1 regulates fetal liver macrophage development, identity, and pyrenocyte clearance
2026-Feb-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241587
PMID:41335223
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研究论文 | 本文揭示了磷酸盐转运蛋白XPR1对胎儿肝脏巨噬细胞发育、身份识别及红细胞核清除功能的关键作用 | 首次发现XPR1作为唯一已知的磷酸盐输出蛋白，对胎儿巨噬细胞发育具有特异性调控作用，并阐明了其在红细胞生成相关巨噬细胞功能中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性尚未验证；巨噬细胞功能变化的分子通路细节有待进一步解析 | 探究磷酸盐转运蛋白XPR1在胎儿巨噬细胞发育和功能中的作用机制 | 小鼠胎儿肝脏巨噬细胞、脾脏红髓巨噬细胞、骨髓巨噬细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、条件性基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 条件性Xpr1敲除小鼠胚胎及成年个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 650 | 2025-12-07 |
RNA tomography reveals spatial gene expression maps of Arabidopsis thaliana roots infected with Heterodera schachtii
2026-Jan, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70674
PMID:41104608
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为RNA tomography的空间转录组学技术，用于绘制拟南芥根部感染甜菜胞囊线虫后的空间基因表达图谱 | 首次将RNA tomography技术应用于植物研究，实现了高空间分辨率的基因表达分析，并成功定位了线虫咽腺及未表征基因的表达区域 | 研究仅关注感染后1-2天的早期阶段，可能未覆盖整个寄生过程的动态变化，且技术应用范围有待进一步验证 | 探究植物寄生线虫诱导的取食结构形成与发育的分子机制 | 拟南芥（Arabidopsis thaliana）根部及感染其的甜菜胞囊线虫（Heterodera schachtii） | 空间转录组学 | 植物寄生线虫病 | RNA tomography | NA | 空间基因表达数据 | 96个连续横截面（每片20微米），采集自感染后1天和2天的拟南芥根部 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 651 | 2025-12-07 |
A genomic view of Earth's biomes
2026-Jan, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00888-1
PMID:40954201
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综述 | 本文综述了基因组中心方法在调查地球生物群落中微生物和病毒多样性中的应用，包括单细胞测序和功能分析的最新进展 | 整合了基因组中心方法，特别是单细胞测序和功能分析技术，以全面理解微生物多样性及其功能 | NA | 通过基因组数据更全面地理解地球生物群落中微生物组的结构和功能 | 地球生物群落中的微生物和病毒 | 自然语言处理 | NA | 高通量测序，单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 652 | 2025-12-07 |
Microglial Prrc2a regulates microglia-neuron interaction in cerebellum and motor functions in mice
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113949
PMID:41341849
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研究论文 | 本研究探讨了转录后调节因子Prrc2a在小脑小胶质细胞中的功能，及其对小胶质细胞-神经元相互作用和小鼠运动功能的调控机制 | 首次在小脑特异性小胶质细胞条件性敲除模型中揭示Prrc2a通过调控转录组稳定性影响小胶质细胞活化状态，进而调节浦肯野细胞形态与电生理活动 | 研究局限于小鼠模型，未在人类组织或临床样本中验证；机制研究主要基于转录组层面，缺乏蛋白质水平验证 | 探究小胶质细胞特异性转录后调节因子Prrc2a在小脑发育与功能中的作用机制 | 小脑小胶质细胞、浦肯野细胞、小鼠运动功能 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、电生理记录 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、形态学数据、电生理数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 653 | 2025-12-07 |
Unraveling tumor associated macrophage biology in gynecological cancers for targeted therapy in the single cell omics era
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113924
PMID:41341850
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综述 | 本文总结了单细胞组学时代下，针对妇科癌症中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的生物学特性及其作为靶向治疗新策略的最新证据 | 系统性地整合了单细胞RNA测序技术揭示的TAM亚群异质性、表型可塑性及其在肿瘤进展和耐药中的特定作用，并评估了靶向特定TAM亚型的转化策略 | 作为一篇综述文章，主要基于现有文献进行总结和评述，未提供新的原始实验数据或验证 | 旨在阐明妇科癌症中肿瘤相关巨噬细胞的生物学特性，探索其作为改善临床疗效的靶向治疗新途径 | 妇科癌症（如卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌等）及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 654 | 2025-12-07 |
Single‑cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and identifies CLOCK as a key regulator in fibrotic skin diseases
2025-Dec-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30260-6
PMID:41350567
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了纤维化皮肤疾病中成纤维细胞的异质性，并识别出CLOCK作为瘢痕疙瘩的关键调控因子 | 首次通过单细胞RNA测序系统解析了正常皮肤、瘢痕、瘢痕疙瘩和硬皮病中成纤维细胞的异质性，并发现了疾病特异性调控因子如CLOCK | 研究主要基于公共数据库数据，缺乏实验验证的深度；样本来源可能有限，未涵盖所有纤维化疾病亚型 | 探究纤维化皮肤疾病的细胞机制，识别关键调控因子以开发靶向治疗策略 | 纤维化皮肤疾病（包括瘢痕、瘢痕疙瘩、硬皮病）中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库的多个样本，涵盖正常皮肤、瘢痕、瘢痕疙瘩和硬皮病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 655 | 2025-12-07 |
Using single-cell and transcriptome data to identify prognostic genes associated with SUMO-ylation and their molecular regulatory mechanisms in breast cancer
2025-Dec-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15265-8
PMID:41350692
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据，识别了与乳腺癌预后相关的SUMO化修饰基因，并构建和验证了一个风险预测模型 | 首次在单细胞水平上系统性地识别并验证了与乳腺癌预后相关的SUMO化修饰基因，并构建了具有良好预测性能的风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析，尽管进行了RT-qPCR验证，但进一步的体内外功能实验验证尚不充分 | 探索SUMO化修饰相关基因在乳腺癌中的预后价值及其分子调控机制 | 乳腺癌患者组织样本及其转录组和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析，RT-qPCR | 风险预测模型，列线图模型 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据，临床数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量，涉及乳腺癌及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 656 | 2025-12-07 |
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular g-globin gene expression in Agdb-thalassemia
2025-Dec-06, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016755
PMID:41351474
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 657 | 2025-12-07 |
Drosophila and mouse intestinal stem cells are spatiotemporally specified by Notch suppression and Wnt activation
2025-Dec-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7272
PMID:41337595
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研究论文 | 本研究通过果蝇和小鼠模型，揭示了肠道干细胞在发育过程中通过Notch抑制和Wnt激活的时空协调机制进行特化的保守过程 | 首次在果蝇蛹期肠道中精确量化了ISC特化的时间窗口和细胞数量，并证明了Notch抑制与Wnt激活的空间协同作用在昆虫到哺乳动物中的保守性 | 研究主要基于果蝇和小鼠的胚胎/发育阶段，成年肠道稳态中的机制可能有所不同，且单细胞测序样本量相对有限 | 探究肠道干细胞在发育过程中的特化机制及其信号通路调控 | 果蝇蛹期中肠和小鼠胚胎肠道中的肠道干细胞及前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序、遗传学实验、细胞计数与追踪 | NA | 单细胞基因表达数据、显微图像数据 | 约6000个果蝇肠道上皮细胞（其中约150个ISC） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 658 | 2025-12-07 |
Single-cell sequencing of rodent ventral pallidum reveals diverse neuronal subtypes with noncanonical interregional continuity
2025-Dec-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp3059
PMID:41337598
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了腹侧苍白球（VP）的神经元亚型多样性及其与基底神经节外区域的非典型连续性 | 首次对啮齿类动物腹侧苍白球进行跨物种单细胞转录组测序，鉴定出16个保守的神经元亚类，并发现这些细胞类型超越了传统解剖边界，与纹状体、下丘脑等区域共享 | 研究主要基于啮齿类动物模型，人类VP的转录组特征仍需验证；高脂饮食影响的分子机制尚未完全阐明 | 探究腹侧苍白球的区域身份特征及其细胞类型多样性 | 小鼠和大鼠的腹侧苍白球组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 啮齿类动物（小鼠和大鼠）腹侧苍白球组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 659 | 2025-12-07 |
Uncoupling Protein 1 (UCP1) in Non-Adipose Tissue
2025-Dec-05, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00260.2025
PMID:41348594
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研究论文 | 本研究系统性地探究了UCP1在非脂肪组织中的表达模式及其在发育过程中的潜在非产热功能 | 首次发现UCP1在胚胎发育早期（E10.5）即在非产热组织中表达，早于脂肪组织形成，并揭示了其在视网膜发育中的生理作用 | UCP1在非脂肪组织中的具体分子机制和广泛生理功能仍需进一步研究 | 探究UCP1在非脂肪组织中的表达模式、发育动态及其非产热功能 | UCP1基因敲入小鼠、UCP1-Cre转基因小鼠及其与Ai9-tdTomato报告鼠的杂交后代 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 660 | 2025-12-07 |
Molecular basis for de novo thymus regeneration in a vertebrate, the axolotl
2025-Dec-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adw9903
PMID:41348861
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研究论文 | 本研究揭示了脊椎动物蝾螈能够实现胸腺的从头再生，并探讨了其分子机制 | 首次在脊椎动物中展示了胸腺的从头再生能力，并识别了midkine信号作为早期驱动因子，而FOXN1在再生启动中非必需 | 研究主要基于蝾螈模型，其发现向哺乳动物临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究脊椎动物胸腺再生的分子基础，以指导未来促进胸腺再生的临床策略 | 蝾螈（axolotl）的胸腺组织 | 发育生物学与再生医学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组学、遗传学方法、移植实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |