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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 641 | 2026-10-23 |
Transcriptional programming of early-forming memory B cells arises independently of cognate CD4+ T-cell interactions
2026-Apr-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag054
PMID:42001515
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研究论文 | 本文研究了在缺乏CD4+ T细胞的情况下,早期形成的记忆B细胞的转录编程是否依赖于CD4+ T细胞的相互作用 | 揭示了早期分化的记忆B细胞能够在不依赖CD4+ T细胞辅助的情况下形成多样化的记忆B细胞池,且转录差异极小 | 研究仅基于小鼠模型和流感感染,未涉及其他抗原或人类样本,且未全面评估功能差异 | 探究CD4+ T细胞相互作用对早期记忆B细胞分子编程和多样性的影响 | MHCII敲除小鼠和野生型小鼠中的记忆B细胞 | 免疫学 | 流感感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本(基因表达数据) | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 642 | 2026-10-23 |
Integrating Bulk RNA-Seq and Spatial Transcriptomics Data to Reveal Distinct Immune Escape Mechanism and Immunotherapy Based on Post-Translational Modification in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2026-04-01, Journal of immunotherapy (Hagerstown, Md. : 1997)
DOI:10.1097/CJI.0000000000000588
PMID:41268854
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研究论文 | 该研究整合批量RNA-seq和空间转录组数据,基于翻译后修饰(PTM)构建头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的预后评分,揭示免疫逃逸机制和免疫治疗响应 | 首次整合21种PTM类型构建共识聚类,结合机器学习开发PTM.score,并在多个独立队列和空间转录组中验证其预后和免疫治疗预测价值 | 未明确说明样本量有限或回顾性分析的局限性,需进一步前瞻性验证 | 探究PTM在HNSCC中的预后意义,并开发基于PTM的预后评分以评估免疫治疗响应 | 头颈部鳞状细胞癌患者 | 数字病理学, 机器学习 | 头颈部鳞状细胞癌 | 批量RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习 | 基因表达数据, 空间转录组数据 | TCGA-HNSCC, GSE41613, GSE42743, GSE65858合并的meta队列及4个外部独立队列和一个内部队列 | Illumina, 10x Genomics | bulk RNA-seq, 空间转录组学 | Illumina NovaSeq, 10x Visium | Illumina测序平台用于bulk RNA-seq,10x Visium用于空间转录组分析 |
| 643 | 2026-10-23 |
scComm: a contrastive learning framework for deciphering cell-cell communications at single-cell resolution
2026-Mar-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04043-9
PMID:41877186
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研究论文 | 本文提出了一个基于监督对比学习的计算框架scComm,用于在单细胞分辨率下推断细胞间通讯 | 利用监督对比学习在单个细胞水平推断细胞间通讯,避免了传统方法中按聚类聚合基因表达导致的簇内异质性丢失 | 未在摘要中明确说明 | 实现高分辨率的细胞间通讯分析,揭示现有方法遗漏的生物学见解 | 单细胞转录组数据,包括结直肠癌和肝癌样本 | 机器学习 | 结直肠癌, 肝癌 | 单细胞RNA测序 | 监督对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 644 | 2026-10-23 |
LMO1 expression in neuroblastoma cells reprograms tumor-associated macrophages to promote metastasis
2026-Mar-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115144
PMID:41858882
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研究论文 | 通过对过表达MYCN或MYCN+LMO1的斑马鱼神经母细胞瘤模型进行单细胞RNA测序,发现LMO1改变巨噬细胞转录状态并促进肿瘤转移 | 首次在神经母细胞瘤中发现LMO1通过重编程肿瘤相关巨噬细胞、增强其促转移特性来驱动转移,并揭示了PI3K-Akt信号和MMP表达在其中的作用 | 研究主要基于斑马鱼模型和体外条件培养基实验,缺乏人类患者样本验证和体内功能实验的进一步确认 | 探究LMO1与MYCN协同促进神经母细胞瘤发生和转移的机制,特别是对肿瘤微环境中巨噬细胞的影响 | 转基因斑马鱼神经母细胞瘤模型的原发肿瘤及人巨噬细胞 | 肿瘤生物学、单细胞转录组学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、文本 | 两种转基因斑马鱼肿瘤模型的原发肿瘤(MYCN单过表达和MYCN+LMO1过表达) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 645 | 2026-10-23 |
Single-cell and spatial profiling reveal cDC2A-CXCL13+CD8+ T-epithelial cell crosstalk and cytotoxicity through TNFRSF9 in cutaneous and mucosal lichen planus
2026-Mar-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70506-z
PMID:41832141
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、空间转录组学和蛋白质组学,揭示了在皮肤型和黏膜型扁平苔藓中,cDC2A细胞通过IL-15驱动CXCL13+CD8+ T细胞表达TNFRSF9,进而增强细胞毒性并与上皮细胞相互作用 | 首次在皮肤和黏膜扁平苔藓中鉴定出CXCL13+CD8+ T细胞的干扰素和细胞毒性特征,并发现了cDC2A-CXCL13+CD8+ T-上皮细胞通过TNFRSF9(4-1BB)的细胞间通讯轴 | 样本量相对有限(28例患者和18例健康对照),未涉及其他类型扁平苔藓的验证,且机制研究主要基于相关性分析 | 阐明扁平苔藓的免疫微环境,特别是T细胞与上皮细胞之间的相互作用机制 | 皮肤型和黏膜型扁平苔藓患者及健康对照的组织样本 | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | 扁平苔藓 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 蛋白质组数据 | 28例患者和18例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 646 | 2026-10-23 |
CRISPR-based functional genomics for dissecting therapeutic dependency in primary acute myeloid leukemia samples
2026-03-05, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2026.02.003
PMID:41759529
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研究论文 | 该研究开发了一个优化的基于CRISPR的功能基因组学平台,用于在患者来源的异种移植模型和原发性急性髓系白血病样本中进行直接功能研究 | 首次在携带多样致病突变原代AML样本中建立了优化的CRISPR功能基因组学平台,结合了体外和体内CRISPR-Cas9敲除、CRISPRi失活筛选以及Perturb-seq技术 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 建立通用稳健的框架,利用CRISPR功能基因组学直接剖析原代AML患者样本中的癌症依赖性和细胞异质性 | 患者来源的异种移植模型和原发性急性髓系白血病样本 | 功能基因组学 | 急性髓系白血病 | CRISPR-Cas9敲除, CRISPR干扰(CRISPRi), 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 647 | 2026-10-23 |
Integrating and mapping single-cell transcriptomics across the entire gene expression space
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag204
PMID:42059480
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研究论文 | 提出一个深度学习框架scGES,用于在整个基因表达空间内校正批次效应并实现单细胞转录组数据的整合与查询映射 | scGES不仅利用高变基因,还利用低变基因信息,在整个基因表达空间而非仅高变基因潜空间内校正批次效应,包含scGESI用于数据整合和scGESM用于查询映射两个模型 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 解决单细胞转录组数据整合中的批次效应问题,构建大规模单细胞参考图谱并将查询数据集映射到参考图谱上 | 单细胞转录组数据集 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组测序 | 深度学习框架 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 648 | 2026-10-23 |
Integrative multiomics analysis and CRISPR screening identify functional noncanonical translation loci in the mouse immune system
2026-Feb-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.23.707583
PMID:41808988
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研究论文 | 通过对小鼠免疫系统多个白细胞数据集进行统一的Ribo-seq荟萃分析,结合蛋白质组学和CRISPR筛选,系统鉴定并功能表征了非经典翻译位点 | 首次在小鼠免疫系统中进行全面非经典翻译调查;构建了包含22,276个非经典CDS的汇编;发现内源性逆转录病毒包膜来源蛋白SYNIR和SEMR调控巨噬细胞生物学功能 | 研究主要基于永生化骨髓来源巨噬细胞系和公共数据集重分析,体内生理功能验证有限 | 系统调查小鼠免疫系统中的非经典翻译事件及其在巨噬细胞中的功能后果 | 小鼠白细胞(巨噬细胞、树突状细胞、中性粒细胞、B细胞和T细胞)及永生化骨髓来源巨噬细胞 | 多组学分析、免疫学 | NA | Ribo-seq、蛋白质组学、CRISPR筛选、单细胞RNA-seq、质谱分析 | NA | 测序数据、质谱数据、图像 | 20个公共小鼠白细胞数据集 | NA | Ribo-seq、单细胞RNA-seq、质谱 | NA | NA |
| 649 | 2026-10-23 |
Exploring Vitamin D Signaling-Associated Biomarkers and Their Diagnostic Value in Diabetic Retinopathy: A Combined Transcriptomic and Single-Cell Analysis With Experimental Validation
2026, Journal of diabetes research
IF:3.6Q2
DOI:10.1155/jdr/7240252
PMID:42059276
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研究论文 | 该研究通过转录组学和单细胞分析筛选与维生素D信号相关的糖尿病视网膜病变生物标志物,并进行实验验证 | 首次将维生素D信号相关基因与糖尿病视网膜病变的生物标志物联系起来,结合转录组学、单细胞分析和实验验证,发现了SLC36A1和RAB23作为新的候选生物标志物 | 研究主要基于公共数据库和生物信息学分析,实验验证仅限于RT-qPCR,样本量有限,需要进一步的功能研究来证实这些生物标志物的作用机制 | 探索维生素D信号相关的下游基因和分子网络在糖尿病视网膜病变中的作用,并筛选高优先级的候选生物标志物 | 糖尿病视网膜病变相关的公共数据集和临床样本 | 转录组学, 单细胞分析 | 糖尿病视网膜病变 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, RT-qPCR | WGCNA, Boruta, SVM-RFE | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 650 | 2026-10-23 |
The Role of Chemokine-Related Genes in Diffuse Large B-Cell Lymphoma Prognosis and Tumor Microenvironment Characteristics
2026, Analytical cellular pathology (Amsterdam)
DOI:10.1155/ancp/6659091
PMID:42060374
|
研究论文 | 该研究通过生物信息学分析构建了基于趋化因子相关基因的DLBCL预后风险模型,并探讨其与肿瘤免疫微环境的关系 | 识别了23个与预后相关的趋化因子相关基因,构建了六基因预后模型,并结合单细胞测序揭示了预后基因与免疫细胞类型的相关性 | 摘要中未明确说明研究的局限性 | 探究趋化因子相关基因与弥漫性大B细胞淋巴瘤预后及肿瘤免疫微环境的关联 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 转录组测序,单细胞测序 | Lasso-Cox回归 | 基因表达数据,单细胞数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 651 | 2026-10-23 |
Single-cell RNA sequencing of healthy and diseased rat temporomandibular joint condyle cartilage
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0348175
PMID:42060618
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析了健康和骨关节炎诱导的成年大鼠颞下颌关节髁突软骨中的细胞群体及其变化 | 首次对健康和TMJOA大鼠髁突软骨进行单细胞转录组分析,揭示了独特的细胞亚群、分化轨迹以及Pleiotrophin在增殖区的特异性表达 | 研究仅基于大鼠模型,样本量有限,未在人类TMJOA样本中验证 | 探究颞下颌关节骨关节炎过程中髁突软骨细胞组成和细胞病理变化 | 成年大鼠颞下颌关节髁突软骨 | 单细胞转录组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康及OA诱导的成年大鼠髁突软骨样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 652 | 2026-10-23 |
Advancing lupus nephritis research through multi-omics and predictive modeling
2026 Jan-Dec, Innate immunity
IF:2.8Q3
DOI:10.1177/17534259261426818
PMID:42041246
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研究论文 | 该研究结合狼疮肾炎活检的单细胞RNA测序与大规模bulk RNA-seq队列,通过非负矩阵分解和CellChat解析细胞互作,并构建399个机器学习预测模型,识别CM2巨噬细胞及pDC-NK轴等关键驱动因素 | 将单细胞互作组与临床预测建模相结合,利用NMF定义免疫元程序,开发399个机器学习模型以克服样本量限制,并通过分子对接提出CYBB-地塞米松相互作用的结构假设 | 摘要未明确说明具体局限性,但样本量限制被提及,且分子对接结果仅为假设,需未来验证 | 推进狼疮肾炎研究,解析其细胞和分子驱动因素,实现精准检测并识别潜在治疗靶点 | 狼疮肾炎(LN)患者活检样本及bulk RNA-seq队列 | 数字病理学 | 狼疮肾炎 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 非负矩阵分解(NMF), CellChat, 机器学习, 分子对接 | 机器学习, 非负矩阵分解(NMF), CellChat | 图像(病理活检), 文本(转录组数据) | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 653 | 2026-10-23 |
Ferroptosis-associated candidate genes in aneurysmal subarachnoid hemorrhage: evidence from human peripheral blood and mouse brain
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1823039
PMID:42898173
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研究论文 | 该研究通过人类外周血数据集、小鼠皮层数据及单细胞RNA-seq数据,结合qPCR验证,识别出动脉瘤性蛛网膜下腔出血中铁死亡相关的候选基因MAPK3、STAT3、G6PD和PGD | 首次结合人类外周血和小鼠脑组织多层面数据系统筛选aSAH中铁死亡相关候选基因,并进行了临床qPCR、小鼠脑组织蛋白水平及单细胞水平的多重验证 | 样本量较小(人类qPCR仅10例患者和10例对照),灵芝酸A仅基于计算机模拟预测,缺乏功能验证 | 识别动脉瘤性蛛网膜下腔出血中铁死亡相关的候选基因并验证其表达 | 动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者外周血样本和小鼠SAH模型脑组织 | 机器学习 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, qPCR, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 文本, 图像 | 人类外周血数据集GSE36791(43例aSAH,18例对照),qPCR验证10例aSAH和10例对照,小鼠皮层数据集GSE79416,小鼠SAH单细胞RNA-seq数据集OMIX006611,小鼠实验每组6只 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 654 | 2026-10-23 |
GART expression is associated with a proliferative and purine-metabolic ISC-like epithelial state in ulcerative colitis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1913904
PMID:42898284
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研究论文 | 该文通过批量转录组、单细胞转录组和空间转录组等多模态数据,分析溃疡性结肠炎中GART表达与增殖及嘌呤代谢的ISC样上皮状态的关联 | 整合四个批量队列、两个单细胞数据集和空间转录组,结合多种探索性分析方法,揭示GART标记的ISC样上皮状态与嘌呤合成、DNA复制修复及有丝分裂程序的关联,并采用供体感知的伪批量或混合效应模型控制混杂因素 | 研究仅建立关联而非功能依赖性,GART并非特异性驱动因素,与其他嘌呤合成酶比较未显示独特性,单细胞队列间差异幅度不一,探索性网络分析未验证功能 | 表征溃疡性结肠炎中与GART表达相关的上皮状态,并确定该关联反映的是GART特异性程序还是更广泛的增殖和嘌呤代谢表型 | 溃疡性结肠炎患者结肠上皮细胞,包括人结肠批量转录组队列、单细胞RNA-seq数据集、空间转录组供体及DSS诱导结肠炎组织 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 转录组数据, 图像 | 四个批量转录组队列、两个单细胞RNA-seq数据集(GSE214695和SCP259)、七个独立空间转录组供体及人结肠多重免疫荧光组织 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 655 | 2026-10-23 |
Integrative multi-omics analysis reveals a membrane tension signature associated with tumor-stroma crosstalk in hepatocellular carcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1978174
PMID:42898294
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研究论文 | 该文通过整合多组学数据,构建了与膜张力相关的三基因预后特征,并揭示了其在肝细胞癌肿瘤-基质互作中的作用 | 首次构建膜张力相关基因预后特征,并结合单细胞和空间转录组揭示CFL1在肿瘤-基质互作中的潜在机制 | 研究基于计算分析,缺乏实验验证 | 探究膜张力相关基因在肝细胞癌中的预后价值及其与肿瘤-基质互作的关联 | 肝细胞癌患者样本及肿瘤微环境中的肿瘤细胞、成纤维细胞和T细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 转录组测序,单细胞转录组测序,空间转录组学 | LASSO-Cox回归 | 转录组数据,临床数据,图像 | NA | NA | bulk RNA-seq,单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 656 | 2026-10-23 |
An entosis-informed prognostic index for survival stratification and molecular characterization in lung adenocarcinoma
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1943127
PMID:42898290
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研究论文 | 该研究构建了一个基于内吞(entosis)相关基因的预后指数EPPI,用于肺腺癌的生存分层和分子特征分析 | 首次构建内吞相关预后指数EPPI,结合空间转录组和单细胞RNA测序揭示基因分布异质性,并通过分子对接和体外实验验证RAC1功能 | 预后区分能力中等,需要更多前瞻性队列验证,体外实验仅针对RAC1一个基因 | 构建内吞相关预后预测指数以对肺腺癌患者进行生存分层并表征其分子特征 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 转录组测序,空间转录组学,单细胞RNA测序,分子对接 | NA | 转录组数据,临床数据,体细胞突变数据,图像 | TCGA-LUAD队列及三个独立GEO队列(具体样本量未在摘要中说明) | NA | bulk RNA-seq, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 657 | 2026-10-23 |
Integrated pituitary adaptations to the low estrogen state
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1920998
PMID:42898303
|
研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和激素检测,揭示了低雌激素状态下小鼠垂体前叶细胞的整合性适应变化 | 首次在单细胞水平上分析VCD诱导的低雌激素状态下垂体前叶细胞的转录组变化,并结合血清激素水平揭示不同细胞类型的差异性响应 | 研究仅基于小鼠模型,样本量有限,未进行蛋白质水平验证,且VCD诱导的卵巢衰竭模型与自然绝经存在差异 | 探究低雌激素状态对垂体前叶功能的广泛营养性影响及其细胞类型特异性适应机制 | VCD处理的雌性小鼠(卵巢衰竭模型)与对照组的垂体前叶细胞 | 单细胞转录组学 | 内分泌疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 酶免疫分析 | NA | 基因表达数据, 血清激素数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 658 | 2026-10-23 |
A MYC-LDHA-MCT4 expression program marks an SPP1/TREM2-centered macrophage state in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1978427
PMID:42898383
|
研究论文 | 该文整合成像质谱流式、单细胞RNA-seq和空间转录组数据,揭示胰腺导管腺癌中MYC-LDHA-MCT4表达程序与以SPP1/TREM2为中心的巨噬细胞状态的空间关联 | 首次提出肿瘤MYC-LDHA-MCT4糖酵解程序与SPP1/TREM2巨噬细胞乳酸接收程序之间的空间关联假说,并结合临床试验样本与体外siRNA扰动验证 | 仅为探索性空间关联分析,不能证明乳酸转移;组成校正后效应不显著;生存关联因队列而异,异质性大 | 探究胰腺导管腺癌髓系屏障的代谢组织方式,以及肿瘤糖酵解程序与巨噬细胞状态之间的空间关系 | 胰腺导管腺癌患者肿瘤组织样本、THP-1来源巨噬细胞样细胞及原代人CD8+ T细胞 | 数字病理 | 胰腺癌 | 成像质谱流式、单细胞RNA-seq、空间转录组、siRNA扰动、条件培养基实验 | NA | 图像、文本 | NCT04177810 II期试验成像质谱流式样本、3个单细胞RNA-seq数据集、2个空间转录组队列共12张切片、3个生存队列 | NA | 成像质谱流式、单细胞RNA-seq、空间转录组 | NA | NA |
| 659 | 2026-10-23 |
Molecular characterization and pathogenicity stratification of YWHAG missense variants in developmental and epileptic encephalopathy
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1875740
PMID:42898427
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研究论文 | 该研究对55个YWHAG错义变异进行了分子特征分析和致病性分层,结合蛋白结构建模、时空表达谱、单细胞转录组和致病性预测工具评估,探索YWHAG变异与发育性癫痫性脑病的关系 | 首次系统探索YWHAG时空表达与致病性的相关性,并全面评估34种致病性预测工具在该基因变异上的表现,发现MetaSVM、MetaLR和ESM1b等元预测器优于传统保守性预测器;揭示了YWHAG在脑类器官成熟过程中从兴奋性和抑制性神经元表达转向以兴奋性神经元为主的三次发育峰值表达模式 | 研究主要基于计算预测和公共数据,缺乏实验功能验证;样本量有限(仅17个致病/可能致病变异);蛋白结构建模显示氢键改变无法可靠区分致病与良性变异,需进一步湿实验验证预测工具的临床适用性 | 探索YWHAG时空表达与致病性的相关性,寻找可靠的致病性指标,以促进发育性癫痫性脑病的临床遗传诊断 | YWHAG基因的55个错义变异(17个致病/可能致病变异和38个良性变异) | 计算生物学、遗传学、神经科学 | 发育性癫痫性脑病、癫痫 | 蛋白质结构建模、时空表达谱分析、单细胞转录组分析、PPI网络构建、功能富集分析、致病性预测工具评估 | MetaSVM、MetaLR、ESM1b等34种致病性预测工具(深度学习、集成算法、传统保守性预测器) | 基因变异数据、蛋白质结构数据、基因表达数据、单细胞转录组数据、蛋白质相互作用网络数据 | 55个YWHAG错义变异(17个致病/可能致病变异+38个良性变异) | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 660 | 2026-10-23 |
An integrative meningioma surfaceome atlas and a transferable framework for CAR-T target nomination
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1919802
PMID:42898508
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研究论文 | 构建脑膜瘤表面蛋白组图谱,并提出基于门控的可转移框架用于CAR-T靶点提名 | 整合单细胞转录组与表面蛋白组过滤,并引入系统安全性、膜拓扑可及性和安全×覆盖度等多重门控,区分发现与提名 | 所有发现基于转录组数据,需要表面蛋白水平验证;未提名经过验证的靶点;通用抗体对接仅为探索性 | 建立脑膜瘤表面抗原资源并开发可转移的CAR-T靶点提名框架 | 8名脑膜瘤患者的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 8名患者,80220个质控后细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |