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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6561 | 2025-11-20 |
Immune-related gene signatures of thin endometrium: a transcriptomic and single-cell study
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1626451
PMID:41113715
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研究论文 | 通过转录组学和单细胞研究揭示薄型子宫内膜的免疫相关基因特征 | 首次整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,发现薄型子宫内膜中免疫相关基因的差异表达特征 | 样本量有限,需要更大规模研究验证发现 | 识别薄型子宫内膜相关的差异表达基因和免疫特征 | 薄型子宫内膜患者和健康对照者的子宫内膜组织 | 转录组学 | 生殖系统疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qPCR | NA | 基因表达数据 | 薄型子宫内膜患者和健康对照者的子宫内膜组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6562 | 2025-11-20 |
OneSC: A computational platform for recapitulating cell state transitions
2024-Jun-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.31.596831
PMID:38895453
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研究论文 | 介绍OneSC计算平台,用于通过随机微分方程系统模拟细胞状态转换 | 不同于现有网络推断方法,OneSC优先生成能够产生忠实细胞状态转换和稳定细胞状态的布尔网络 | NA | 开发计算平台以模拟细胞状态转换和细胞命运决策 | 小鼠骨髓祖细胞及其分化轨迹 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 随机微分方程系统,布尔网络 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6563 | 2025-11-20 |
Revisiting the critical roles of reactive astrocytes in neurodegeneration
2023-07, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-023-02061-8
PMID:37037874
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综述 | 重新探讨反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的多维作用 | 基于单细胞测序分析提出星形胶质细胞亚群与其功能的精确关联 | NA | 重新评估反应性星形胶质细胞在神经退行性疾病中的关键作用 | 反应性星形胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞测序分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6564 | 2025-11-19 |
Aldehyde dehydrogenase ALDH3A1 rescues cigarette smoke-induced emphysema by conferring alveolar type 2 to type 1 cell transition
2025-Dec-16, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 本研究揭示了醛脱氢酶ALDH3A1通过促进肺泡Ⅱ型细胞向Ⅰ型细胞转化来挽救香烟烟雾诱导的肺气肿 | 首次发现AHR/ARNT/ALDH3A1信号通路在维持肺泡结构中的关键作用,并建立小鼠肺泡类器官模型模拟人类肺部变化 | 研究主要基于体外模型和动物模型,需要进一步验证在人类患者中的适用性 | 探究香烟烟雾诱导肺气肿中肺泡Ⅱ型细胞向Ⅰ型细胞转化的调控机制 | 人类肺泡细胞、小鼠肺气肿模型、肺泡类器官 | 生物医学研究 | 肺气肿 | 单细胞RNA测序,肺泡类器官培养,基因过表达 | 动物模型,体外类器官模型 | 基因表达数据,肺功能数据,组织形态数据 | 未明确样本数量,使用人类肺泡细胞、小鼠模型和类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6565 | 2025-11-19 |
High serum LDL promotes EMT and stemness through LDLR/FOXQ1/NF-κB1 pathway in epithelial ovarian cancer
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03609-4
PMID:41125790
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研究论文 | 本研究揭示了高血清LDL通过LDLR/FOXQ1/NF-κB1通路促进上皮性卵巢癌EMT和干性特征的机制 | 首次发现FOXQ1/β-Catenin/ADNP转录复合物,并阐明β-Catenin和ADNP在该通路中作为竞争性抑制因子的作用 | NA | 探究循环LDL在卵巢癌进展中的作用机制 | 上皮性卵巢癌细胞、卵巢癌异种移植转移模型、人类病理标本 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6566 | 2025-11-19 |
Dihydroartemisinin inhibits histone lactylation through YAP1 to act as a 'hot' switch for 'cold' tumor in hepatocellular carcinoma
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157307
PMID:41016295
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研究论文 | 本研究揭示双氢青蒿素通过抑制YAP1降低组蛋白乳酸化,将肝细胞癌的肿瘤微环境从免疫冷状态转变为免疫热状态 | 首次发现双氢青蒿素通过YAP1抑制组蛋白乳酸化的新机制,并证实其与抗PD-1疗法的协同作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索双氢青蒿素改变肝细胞癌免疫抑制微环境的具体机制 | 肝细胞癌小鼠模型、免疫细胞、YAP1信号通路 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组化,Western blot,免疫荧光,代谢流分析,免疫共沉淀,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | 多种基因工程小鼠模型(NCG小鼠、BALB/c裸鼠、CD8+T细胞缺失小鼠、肝脏特异性Yap1敲除小鼠) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6567 | 2025-11-19 |
Astragaloside VI attenuates mechanical stress-induced cardiac remodeling through piezo1-VDAC1 dependent endoplasmic reticulum unfolded protein response
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157288
PMID:41027153
|
研究论文 | 本研究探讨黄芪甲苷VI通过Piezo1-VDAC1依赖的内质网未折叠蛋白反应缓解机械应力诱导的心脏重塑的机制 | 首次揭示Piezo1-VDAC1相互作用通过调节内质网未折叠蛋白反应介导机械应力诱导心脏重塑的病理机制,并发现黄芪甲苷VI的治疗潜力 | 研究主要基于动物模型和体外实验,尚未进行临床试验验证 | 探索Piezo1对心肌细胞缺氧应激后内质网未折叠蛋白反应的影响及其在心脏重塑治疗中的潜力 | 心肌细胞、Piezo1/VDAC1转基因小鼠和野生型小鼠 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序,网络药理学,宏基因组学,激光共聚焦显微镜,免疫荧光 | 动物模型 | 基因组数据,蛋白质数据,图像数据 | 转基因小鼠和野生型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6568 | 2025-11-19 |
Crocin inhibits neutrophil migration and activation to treat hypoxic pulmonary hypertension through targeting HCK
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157334
PMID:41043333
|
研究论文 | 本研究揭示藏红花素通过靶向HCK抑制中性粒细胞迁移和活化,从而治疗缺氧性肺动脉高压 | 首次发现藏红花素直接靶向HCK蛋白,阐明其通过抑制中性粒细胞迁移和活化来改善肺动脉高压的新机制 | 研究主要基于大鼠模型和体外实验,尚未进行人体临床试验验证 | 探究藏红花素治疗缺氧性肺动脉高压的药理机制 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型、中性粒细胞、肺动脉平滑肌细胞 | 单细胞测序 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序,分子对接,细胞热位移分析,药物亲和响应靶点稳定性 | 动物疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 缺氧性肺动脉高压大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6569 | 2025-11-19 |
Targeting ICAM1/ITGB2 with plumbagin preserves intercellular adhesion and attenuates gastric precancerous lesions
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157449
PMID:41175578
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研究论文 | 本研究探讨了白花丹素通过靶向ICAM1/ITGB2相互作用维持细胞间粘附并减轻胃癌前病变的机制 | 首次发现白花丹素直接结合ICAM1蛋白的THR-85位点,阻断ICAM1/ITGB2相互作用,从而恢复细胞间粘附 | NA | 研究白花丹素对胃癌前病变的治疗效果及其分子机制 | 临床样本、人源胃类器官、胃癌前细胞(MC细胞)、ICAM1⁻/⁻细胞、GPL小鼠模型 | 分子生物学 | 胃癌前病变 | 单细胞测序、免疫荧光、Western blotting、MST、CETSA、DARTs、Co-IP | NA | 分子相互作用数据、基因表达数据、蛋白质数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6570 | 2025-11-19 |
Hydroxylsafflower yellow A modulates tumor vascularization in liver cancer through intercellular communication and extracellular matrix-receptor interactions
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157455
PMID:41197344
|
研究论文 | 本研究探讨羟基红花黄色素A通过调控细胞间通讯和细胞外基质-受体相互作用对肝癌血管化的影响 | 首次揭示HSYA通过上调miR-29a-3p表达,抑制Col-IV/ITGB1/FAK和PI3K/AKT信号通路,从而调节肿瘤血管生成的新机制 | 研究主要关注miR-29a-3p通路,可能还存在其他未被发现的调控机制 | 研究HSYA在纤维化相关肝癌中的作用机制 | 肝星状细胞、肝癌细胞、纤维化相关肝癌小鼠模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,分子生物学技术,共培养实验,组织染色,免疫组化,蛋白质印迹,RT-qPCR,扫描电镜,荧光原位杂交 | NA | 单细胞RNA测序数据,分子生物学数据,组织学图像 | 肝癌患者样本和纤维化相关肝癌小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6571 | 2025-11-19 |
Astragaloside IV reduces hepatitis B surface antigen level via monocyte/macrophages in chronic HBV infection mice
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157308
PMID:41046687
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研究论文 | 本研究开发了黄芪甲苷IV纳米制剂并验证其通过单核/巨噬细胞降低慢性HBV感染小鼠HBsAg水平的疗效 | 首次开发Pluronic® F-127包封的黄芪甲苷IV纳米制剂解决其低水溶性问题,并揭示其通过单核/巨噬细胞依赖机制降低HBsAg | 研究仅使用AAV-HBV小鼠模型,未在人类临床试验中验证 | 开发黄芪甲苷IV纳米制剂并研究其对慢性HBV感染的治疗效果及机制 | 慢性AAV-HBV感染小鼠模型 | 免疫学 | 乙型肝炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 马尔文激光粒度分析, 透射电子显微镜, 红外光谱 | AAV-HBV小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6572 | 2025-11-19 |
Spermidine enhances macrophages anti-inflammatory and regenerative functions by improving mitochondrial fitness
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157349
PMID:41067199
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研究论文 | 本研究探讨精胺通过改善线粒体功能增强巨噬细胞抗炎和再生能力及其在肝纤维化治疗中的潜力 | 首次揭示精胺通过PGC1α介导的线粒体适应性重塑巨噬细胞表型,并发现硬脂酰辅酶A去饱和酶1产生的油酸在这一过程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 研究精胺对巨噬细胞功能的调控机制及其在肝纤维化治疗中的应用价值 | 肝巨噬细胞、CCl4诱导的肝纤维化小鼠模型、巨噬细胞特异性PGC1α敲除小鼠 | 细胞代谢研究 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、细胞过继转移、基因敲除技术 | 动物模型 | 基因表达数据、代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6573 | 2025-11-19 |
Fufang Danshen Pill improves mitochondrial homeostasis by regulating the S100a9/TLR4 axis to alleviate myocardial ischemia-reperfusion injury
2025-Nov-25, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157433
PMID:41166904
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研究论文 | 本研究探讨复方丹参片通过调控S100a9/TLR4轴改善线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的机制 | 首次结合单细胞转录组和空间转录组技术揭示巨噬细胞特异性S100a9在心肌缺血再灌注损伤中的线粒体调控机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 阐明复方丹参片通过调控S100a9/TLR4轴改善心肌缺血再灌注损伤的治疗机制 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型及心肌组织 | 空间转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组,腺相关病毒介导的基因过表达 | NA | 转录组数据,空间基因表达数据 | 假手术组、缺血再灌注组和复方丹参片治疗组的小鼠心肌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6574 | 2025-11-19 |
Inhibiting KDM6A Phosphorylation Suppresses Glycolysis in Oral Squamous Cell Carcinoma
2025-Nov-18, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.70142
PMID:41251278
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研究论文 | 本研究揭示了KDM6A-pSer829磷酸化通过FBXW7介导的泛素化降解调控口腔鳞状细胞癌糖酵解代谢和细胞增殖的新机制 | 首次发现KDM6A-pSer829是FBXW7的识别位点,并证明该磷酸化修饰在OSCC糖酵解代谢中的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本验证不足 | 探究KDM6A特定翻译后修饰在口腔鳞状细胞癌代谢调控中的作用机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)细胞和小鼠模型 | 癌症代谢研究 | 口腔鳞状细胞癌 | Co-IP、免疫印迹、单细胞RNA测序、免疫荧光成像 | 条件性基因敲入小鼠模型 | 单细胞转录组数据、蛋白质相互作用数据 | Kdm6aS829A条件敲入小鼠舌组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6575 | 2025-11-19 |
ZEB1 promotes chemoimmunotherapy resistance in pancreatic cancer models by downregulating chromatin acetylation of CXCL16
2025-Nov-17, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI195970
PMID:40924501
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研究论文 | 本研究揭示转录因子ZEB1通过下调CXCL16染色质乙酰化驱动胰腺癌化疗免疫治疗耐药的新机制 | 首次发现ZEB1通过表观遗传调控CXCL16表达和SPP1分泌,同时影响肿瘤焦亡和CD8+ T细胞耗竭的双重耐药机制 | 研究主要基于临床前模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探究胰腺癌化疗免疫治疗耐药的分子机制并开发新的治疗策略 | 胰腺癌模型(包括患者来源类器官、异种移植和原位模型) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组学、表观遗传分析 | 患者来源类器官、异种移植模型、原位模型 | 转录组数据、表观遗传数据、临床数据 | 胰腺癌患者样本和多种临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6576 | 2025-11-19 |
Simultaneous Measurement of RNA Synthesis and Degradation Rates in Single Cells Unveils the Regulatory Mechanisms of Temporal RNA Dynamics
2025-Nov-17, Angewandte Chemie (International ed. in English)
DOI:10.1002/anie.202510939
PMID:41017207
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研究论文 | 开发了scDUAL-seq方法,首次在单细胞水平同时测量RNA合成和降解速率 | 整合双核苷类似物脉冲标记、化学核苷转化和单细胞RNA测序,实现单细胞中转录组范围内RNA合成和降解的同时记录 | NA | 解析动态过程中RNA调控机制 | 异质性细胞群体 | 单细胞测序技术 | NA | 双核苷类似物脉冲标记,化学核苷转化,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6577 | 2025-11-19 |
Integrative multi-omics and computational modeling reveal RPL22-driven skin aging mechanisms under PM2.5 exposure and identify high-stability natural inhibitors
2025-Nov-17, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04680-0
PMID:41247455
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和计算建模揭示了PM2.5通过上调RPL22加速皮肤衰老的机制,并筛选出高稳定性的天然抑制剂 | 首次结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和分子动力学模拟,系统揭示PM2.5通过RPL22-MYC通路驱动皮肤衰老的因果机制 | 研究基于欧洲人群数据,结果可能不适用于其他种族群体 | 阐明PM2.5暴露与皮肤衰老之间的因果分子机制并筛选有效抑制剂 | 欧洲人群皮肤组织样本和RPL22蛋白靶点 | 计算生物学 | 皮肤衰老 | 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 虚拟筛选, 分子动力学模拟 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据, 分子结构数据 | 基于GSE130973数据集和欧洲人群GWAS数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6578 | 2025-11-19 |
Image-enhanced Multi-Modal Contrastive Transformer for subcellular spatial transcriptomics
2025-Nov-17, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3630325
PMID:41247893
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研究论文 | 提出一种图像增强的多模态对比Transformer框架SIMMT,用于整合空间转录组数据和形态学图像以改善亚细胞分辨率分析 | 设计了双Transformer架构分别建模转录组和形态学图像,并引入对比学习模块在细胞水平对齐组织形态和基因表达 | NA | 开发计算方法来有效整合图像特征与转录组谱,实现全面的亚细胞数据分析 | 人类肺癌组织、小鼠脑组织、人类结直肠癌组织和人类卵巢癌组织的亚细胞空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 肺癌, 结直肠癌, 卵巢癌 | 空间分子成像技术 | Transformer, 对比学习 | 图像, 基因表达数据 | 多个组织类型的数据集(人类肺癌、小鼠脑、人类结直肠癌、人类卵巢癌) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6579 | 2025-11-19 |
ANPEP as a potential mediator linking aspartame exposure to MAFLD: insights from network toxicology and multi-omics analyses
2025-Nov-14, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004068
PMID:41247865
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学和多组学分析,揭示了ANPEP作为阿斯巴甜暴露与代谢相关脂肪性肝病之间的潜在介导因子 | 首次系统性地识别ANPEP作为阿斯巴甜与MAFLD关联的关键分子靶点,并采用多方法验证其在疾病进程中的作用 | 研究主要基于计算预测和动物模型,需要进一步临床研究验证 | 探索阿斯巴甜暴露与代谢相关脂肪性肝病之间的分子机制 | 阿斯巴甜、ANPEP基因、代谢相关脂肪性肝病 | 生物信息学 | 代谢相关脂肪性肝病 | 网络毒理学,分子对接,分子动力学模拟,机器学习,RNA测序,单细胞转录组学,孟德尔随机化,免疫荧光 | 机器学习 | 基因表达数据,单细胞数据,组织学数据 | 小鼠模型和人类肝组织样本 | NA | bulk RNA-seq,单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6580 | 2025-11-19 |
ELLA: modeling subcellular spatial variation of gene expression within cells in high-resolution spatial transcriptomics
2025-Nov-11, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64867-0
PMID:41219206
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研究论文 | 提出一种名为ELLA的统计框架,用于建模亚细胞mRNA定位并检测细胞内的空间变异基因 | 使用过度分散的非齐次泊松过程建模空间计数数据,并采用统一的细胞坐标系来锚定不同的细胞形态 | NA | 开发用于高分辨率空间转录组学中亚细胞空间表达分析的工具 | 亚细胞水平的基因表达空间变异 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 过度分散非齐次泊松过程 | 空间计数数据 | NA | NA | 高分辨率空间转录组学 | NA | NA |