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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6501 | 2025-11-22 |
Leveraging diverse cell-death patterns to predict the prognosis and drug sensitivity of triple-negative breast cancer patients after surgery
2022-Nov, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1016/j.ijsu.2022.106936
PMID:36341760
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研究论文 | 通过分析12种细胞死亡模式建立细胞死亡指数模型,用于预测三阴性乳腺癌患者术后预后和药物敏感性 | 首次综合12种程序性细胞死亡模式建立预测模型,并识别出两种具有不同生物学过程的三阴性乳腺癌分子亚型 | 研究基于回顾性队列数据,需要前瞻性研究进一步验证 | 预测三阴性乳腺癌患者术后预后和化疗敏感性 | 三阴性乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 机器学习算法,转录组分析 | 无监督聚类模型,nomogram模型 | 转录组数据,基因组数据,临床信息 | 来自TCGA-BRCA、METABRIC、GSE58812、GSE21653、GSE176078、GSE75688和KM-plotter等多个队列的数据 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6502 | 2025-11-21 |
Decoding bioprocesses with transcriptomics: current status and future potential
2026 Jan-Feb, Biotechnology advances
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.biotechadv.2025.108736
PMID:41092969
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综述 | 本文总结了转录组学在生物过程工程中的应用现状并展望其未来潜力 | 系统梳理了从RT-qPCR到RNA-seq等转录组学技术在生物过程工程中的应用,并前瞻性地提出单细胞分析(scRNA-seq)和转录历史记录(Record-Seq)技术将推动对种群时空多样性的理解 | NA | 总结转录组学技术在生物过程工程领域的应用现状并展望未来发展 | 原核和真核细胞系统在生物过程中的基因表达谱 | 生物信息学 | NA | RT-qPCR, 微阵列, RNA-seq, scRNA-seq, Record-Seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 6503 | 2025-11-21 |
High-resolution spatial transcriptomics uncover epidermal-dermal divergences in Merkel cell carcinoma: spatial context reshapes the gene expression landscape
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03608-5
PMID:41131107
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术揭示了默克尔细胞癌中表皮和真皮区域的基因表达差异 | 首次在空间分辨率下展示了表皮性默克尔细胞癌的转录组特征,发现其具有角质形成细胞分化特征 | 样本数量有限,且主要关注表皮性肿瘤区域 | 探索表皮微环境对默克尔细胞癌肿瘤细胞行为的调控作用 | 默克尔细胞癌肿瘤细胞,特别是表皮性和真皮性肿瘤细胞 | 空间转录组学 | 默克尔细胞癌 | 高分辨率空间转录组学,单细胞转录组学 | NA | 空间转录组数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6504 | 2025-11-21 |
Macrophage Phospholipase D3 promotes atherosclerosis via exacerbating foam cell formation and inducing inflammatory responses
2025-Dec, International journal of cardiology. Heart & vasculature
DOI:10.1016/j.ijcha.2025.101834
PMID:41245776
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研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞磷脂酶D3通过加剧泡沫细胞形成和诱导炎症反应促进动脉粥样硬化的机制 | 首次系统阐明PLD3在动脉粥样硬化中的功能作用及分子机制,发现其通过CD36介导的脂质积累和NF-κB驱动的炎症反应促进疾病进展 | 研究主要基于小鼠模型和THP-1细胞系,人类样本验证相对有限 | 探究PLD3在动脉粥样硬化发生发展中的作用机制 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠模型、THP-1源性巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、qRT-PCR、western blotting、慢病毒介导的基因敲降、RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、图像数据 | 人类动脉粥样硬化组织、ApoE^-/-小鼠、THP-1细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6505 | 2025-11-21 |
YAP/TAZ deletion in vascular smooth muscle cells mirrors atherosclerosis-associated transcriptional programs
2025-Dec, Journal of molecular and cellular cardiology plus
DOI:10.1016/j.jmccpl.2025.100487
PMID:41246212
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研究论文 | 本研究通过血管平滑肌细胞特异性缺失YAP/TAZ,揭示其转录程序与动脉粥样硬化发展的相似性 | 首次证明YAP/TAZ缺失诱导的VSMC转录变化能重现动脉粥样硬化关键特征,并鉴定出19个保守的YAP-TEAD靶基因 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究YAP/TAZ缺失对血管平滑肌细胞表型的影响及其在动脉粥样硬化中的作用 | 血管平滑肌细胞(VSMC) | 转录组学 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ChIP-seq, 启动子基序分析 | NA | 转录组数据, 表观遗传数据 | 小鼠VSMC样本(2周和8周YAP/TAZ缺失时间点) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6506 | 2025-11-21 |
CD9 antibody enhances the anti-leukemia efficacy of γδT cells in adult B cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113752
PMID:41244573
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定B细胞急性淋巴细胞白血病中的侵袭性preB_CD9+亚群,并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞的抗白血病疗效 | 首次发现CD9在B-ALL复发患者中高表达,并证明抗CD9抗体可增强γδT细胞对CD9高表达白血病细胞的杀伤作用 | 样本量较小(10个样本),需要更大规模研究验证 | 探索B细胞急性淋巴细胞白血病的肿瘤微环境特征及免疫治疗新策略 | B细胞急性淋巴细胞白血病患者样本和健康志愿者样本 | 单细胞测序分析 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10个样本(3例复发患者,3例新诊断患者,4例健康志愿者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6507 | 2025-11-21 |
An easy and reproducible method for rapid tissue macroarray block construction
2025-Nov-20, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04326-9
PMID:41261245
|
研究论文 | 提出一种快速构建组织大阵列块的新方法,确保精确的组织定向且无需专用仪器 | 开发了使用海绵作为支架的快速组织大阵列构建技术,将处理时间减少10倍并解决组织定向难题 | 未提及方法验证的样本规模或与其他方法的直接比较数据 | 改进组织大阵列构建技术,提高病理诊断和研究效率 | 石蜡包埋组织样本 | 数字病理学 | NA | 组织大阵列构建技术 | NA | 组织样本 | 每个大阵列包含9-48个组织核心 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6508 | 2025-11-21 |
Multiplexed RNA imaging and in situ profiling in living cells
2025-Nov-19, Chemical science
IF:7.6Q1
DOI:10.1039/d5sc06220a
PMID:41210282
|
综述 | 本文探讨活细胞多重RNA成像技术及其与固定细胞空间转录组学方法的比较 | 开发了能够在活细胞中进行多重RNA成像的先进荧光探针技术,实现RNA定位、相互作用和浓度变化的实时监测 | 传统空间转录组学方法需要细胞固定和透化,只能提供静态快照 | 推进时空RNA分析技术,追踪RNA动态变化并揭示多种RNA物种间的时间关系 | 活细胞中的RNA分子 | 空间转录组学 | NA | 多重RNA成像,荧光原位杂交,测序 | NA | RNA图像,基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA分析 | NA | NA |
| 6509 | 2025-11-21 |
Targeting the origins of multiple myeloma along hematopoietic stem cell lymphoid lineage differentiation
2025-Nov-19, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adu0114
PMID:41259534
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序追踪多发性骨髓瘤在B细胞谱系分化过程中的恶性转化机制 | 首次在B细胞分化过程中识别了1q扩增和17p缺失的起源阶段,并发现FCRL5通过IRF4/SPI1复合物驱动恶性转化 | 未明确说明样本规模和实验设计的局限性 | 探索多发性骨髓瘤起始细胞的恶性转化机制和驱动基因 | 多发性骨髓瘤患者的造血干细胞至淋巴谱系分化各阶段细胞 | 单细胞基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序, 遗传示踪分析 | NA | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6510 | 2025-11-21 |
Integrated transcriptome profiling of plasma exosomes reveals molecular stratification of exocrine and endocrine disorders and S100A8-mediated cell interactions in chronic pancreatitis
2025-Nov-18, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00832-x
PMID:41249153
|
研究论文 | 通过血浆外泌体转录组测序建立慢性胰腺炎分子分型系统并揭示miR-24-3p/S100A8轴在疾病进展中的作用机制 | 首次建立基于血浆外泌体12个miRNA表达的3阶段分型系统,并发现外泌体miR-24-3p通过调控中性粒细胞S100A8影响胰腺星状细胞纤维化和巨噬细胞炎症的新机制 | 分型系统仅完成初步验证,需要更大样本量的前瞻性研究确认临床适用性 | 开发慢性胰腺炎外分泌和内分泌功能障碍的分子分型方法并探索其发病机制 | 慢性胰腺炎患者血浆外泌体、胰腺病变组织、CP小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性胰腺炎 | 转录组测序, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据, 单细胞测序数据 | CP患者队列和外部验证队列 | NA | 外泌体转录组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6511 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial multiomics identifies heterogeneous xylem development driven by mechanical stress in Populus
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.038
PMID:40701155
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术揭示了机械应力驱动的杨树木材异质性发育机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、代谢组学和磷酸化蛋白质组学,系统解析了张力木形成的细胞类型、谱系关系和分子调控网络 | 研究主要聚焦于杨树特定发育阶段,在其他树种或发育时期的普适性有待验证 | 探究机械应力下木材形成的细胞异质性发育机制 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材的木质部组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 代谢组学, 磷酸化蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间基因表达数据, 代谢物数据, 蛋白质磷酸化数据 | 杨树正常木材、张力木和对侧木材样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6512 | 2025-11-21 |
Single-cell transcriptomics identifies chondrocyte differentiation dynamics in vivo and in vitro
2025-Nov-17, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.06.031
PMID:40712580
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析体内外软骨细胞分化动态,建立评估和优化体外软骨生成方案的框架 | 首次结合胚胎长骨单细胞RNA测序数据与公共数据构建软骨内骨化图谱,并通过轨迹比对揭示体外分化中的脱靶现象 | 研究主要基于人类胚胎干细胞模型,尚未在更多细胞类型或临床样本中验证 | 优化体外软骨生成方案以更好地模拟体内发育过程 | 胚胎长骨组织、人类胚胎干细胞分化细胞 | 单细胞组学 | 肌肉骨骼疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 单核RNA测序(snRNA-seq) | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据 | 胚胎长骨样本及公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 6513 | 2025-11-21 |
Single-cell mapping reveals age-related alterations in periosteal progenitor cells and immune microenvironment
2025-Nov-17, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00263-9
PMID:41247564
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序绘制了小鼠骨膜衰老过程中的细胞图谱,揭示了祖细胞和免疫微环境的年龄相关变化 | 首次在单细胞水平系统描绘骨膜衰老过程,发现不同祖细胞亚群具有独特的衰老轨迹,并揭示祖细胞-免疫细胞相互作用在骨稳态中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究骨膜衰老的细胞和分子机制 | 3月、9月和18月龄小鼠的骨膜组织 | 单细胞生物学 | 骨骼老化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个年龄组的小鼠骨膜样本(3月、9月、18月龄) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6514 | 2025-11-21 |
Breast cancer remodels lymphatics in sentinel lymph nodes
2025-Nov-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-64981-z
PMID:41249124
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析乳腺癌患者前哨淋巴结中淋巴管内皮细胞亚群的重塑过程 | 首次在人类乳腺癌样本中揭示肿瘤转移导致淋巴结淋巴管内皮细胞亚群重塑,并发现MGP基因在转移过程中的关键作用 | 研究仅限于初治乳腺癌女性患者,样本来源相对单一 | 探究乳腺癌转移对前哨淋巴结淋巴管内皮细胞的影响机制 | 乳腺癌女性患者的配对转移和非转移前哨淋巴结 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 乳腺癌患者配对的转移和非转移前哨淋巴结样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6515 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial dissection of necroptosis spatiotemporal evolution driving lymph node metastasis in gastric cancer
2025-Nov-17, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02815-z
PMID:41249133
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析揭示了胃癌淋巴结转移过程中肿瘤细胞异质性和坏死性凋亡的时空演化机制 | 首次整合单细胞和空间分析技术揭示胃癌淋巴结转移过程中坏死性凋亡的时空演化特征,发现CHMP3基因和MDK-NCL信号通路在转移中的关键作用 | 样本量较小(仅4例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探究胃癌淋巴结转移的驱动机制和肿瘤微环境异质性 | 胃癌患者原发肿瘤和配对转移淋巴结组织 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光 | 伪时序分析 | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 4例胃癌患者(4个原发肿瘤和2个配对转移淋巴结) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6516 | 2025-11-21 |
Single-cell RNA sequencing reveals that kimchi dietary intervention modulates human antigen-presenting and CD4⁺ T cells
2025-Nov-17, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-025-00593-7
PMID:41249184
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示泡菜饮食干预调节人类抗原呈递细胞和CD4⁺ T细胞 | 首次在人类随机双盲安慰剂对照试验中使用单细胞RNA测序技术揭示泡菜对免疫系统的调节机制 | 样本量较小(13名超重成人),研究周期为12周 | 探究泡菜饮食干预对人类免疫功能的调节作用 | 超重成人的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 代谢相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 13名超重成人 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6517 | 2025-11-21 |
Engineered long-acting Irisin-albumin binding domain fusion protein for enhanced anti-inflammatory efficacy in lipopolysaccharide-induced systemic inflammation
2025-Nov-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09000-z
PMID:41249468
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研究论文 | 本研究开发了一种白蛋白结合域融合的鸢尾素蛋白,显著延长其半衰期并增强抗炎疗效 | 首次将白蛋白结合域与鸢尾素融合,显著延长血浆半衰期从<1小时至约10小时,并增强抗炎效果 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未进行人体临床试验 | 开发长效鸢尾素融合蛋白以增强抗炎治疗效果 | 脂多糖诱导的系统性炎症小鼠模型 | 生物医学工程 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序,蛋白质印迹,药代动力学研究 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,病理数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6518 | 2025-11-21 |
The Wnt/β-catenin-P2-HNF4α feedback loop facilitates colorectal tumorigenesis and malignancy
2025-Nov-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07133-7
PMID:41250108
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研究论文 | 本研究揭示了Wnt/β-catenin信号通路通过P2-HNF4α形成正反馈环路促进结直肠癌发生发展的新机制 | 首次发现P2-HNF4α作为Wnt/β-catenin通路的下游效应因子,并鉴定出Wnt/β-catenin-P2-HNF4α正反馈环路 | NA | 探究HNF4α不同亚型在结直肠癌中对Wnt/β-catenin信号通路的调控作用 | 结直肠癌细胞系、裸鼠皮下移植瘤模型、临床肿瘤样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, ChIP测序, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 表观遗传数据, 临床病理数据 | 临床肿瘤样本和正常对照组织 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 6519 | 2025-11-21 |
Molecular features of congenital cytomegalovirus infection in neonatal mouse brain at single-cell resolution
2025-Nov-17, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02158-x
PMID:41250226
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析先天性巨细胞病毒感染的新生小鼠大脑,揭示了病毒对不同细胞类型的感染特征及其对神经发育的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示先天性巨细胞病毒感染对新生小鼠大脑不同细胞类型的影响,特别是发现神经祖细胞和单核源性巨噬细胞是最易感染细胞类型 | 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的适用性需要进一步验证 | 探究先天性巨细胞病毒感染的分子特征及其对神经发育的影响机制 | 先天性巨细胞病毒感染的新生小鼠大脑组织 | 单细胞生物学 | 先天性巨细胞病毒感染 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生小鼠大脑22种细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6520 | 2025-11-21 |
Exhausted KLRG1hi CD8+ T and pathogenic GZMA+ Th17 cells are associated with the mild Mycoplasma pneumoniae pneumonia in children
2025-Nov, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2025.106642
PMID:41173398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和高维流式细胞术揭示了儿童轻度肺炎支原体肺炎中T细胞和B淋巴细胞的功能障碍特征 | 首次在MPP患儿中系统描述了耗竭性KLRG1hi CD8+ T细胞和致病性GZMA+ Th17细胞的免疫特征 | 研究仅限于轻度肺炎支原体肺炎患儿,未涉及重症病例 | 阐明适应性免疫在儿童肺炎支原体肺炎发病机制中的作用 | 肺炎支原体单一感染的轻度肺炎患儿 | 免疫学 | 肺炎支原体肺炎 | 单细胞RNA测序, 高维流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |