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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6481 | 2026-05-02 |
MTHFD2 ablation in T cells protects against heart transplant rejection by perturbing IRF4/PD-1 pathway through the metabolic-epigenetic nexus
2023-11, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2023.07.009
PMID:37495036
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研究论文 | 揭示MTHFD2在T细胞中通过代谢-表观遗传学影响IRF4/PD-1通路从而保护心脏移植免受排斥的机制 | 首次发现一碳代谢酶MTHFD2作为同种反应T细胞的代谢检查点,通过H3K4me3介导的代谢-表观遗传学机制影响IRF4/PD-1通路,并提出其作为心脏移植排斥治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型,且未深入探讨MTHFD2在其他免疫细胞中的作用或其长期治疗效果 | 研究一碳代谢酶MTHFD2在心脏移植排斥中的作用及其机制,评估其作为治疗靶点的可能性 | 人类和鼠类心脏移植受体的心脏组织、T细胞特异性Mthfd2基因敲除小鼠、人源化皮肤移植模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、酶联免疫斑点法、切割靶点与标记法 | NA | 基因表达数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | 人类和鼠类心脏移植受体心脏组织,小鼠T细胞特异性Mthfd2基因敲除模型,人源化皮肤移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6482 | 2026-05-02 |
Dissecting the single-cell transcriptome network of macrophage and identifies a signature to predict prognosis in lung adenocarcinoma
2023-Oct, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-023-00816-7
PMID:37079186
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肺腺癌中不同来源巨噬细胞的功能差异并构建预后预测模型 | 首次根据来源将巨噬细胞分为肺泡巨噬细胞和间质巨噬细胞,并阐明其在肿瘤微环境中的不同功能及预后价值 | 未提及具体局限性 | 探索不同来源巨噬细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的功能及作为预后和治疗预测标志物的潜力 | 肺腺癌患者的肿瘤组织、正常肺组织和外周血样本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 21例肺腺癌、12例正常和4例外周血样本用于单细胞分析;502例TCGA患者用于构建模型;544例GEO数据集患者用于验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6483 | 2026-05-02 |
Spatial transcriptomic profiling of coronary endothelial cells in SARS-CoV-2 myocarditis
2023, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2023.1118024
PMID:36968839
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研究论文 | 利用数字空间转录组学技术分析SARS-CoV-2心肌炎患者冠状动脉内皮细胞的转录特征 | 首次在保留组织原位结构的情况下,通过空间转录组学分析SARS-CoV-2感染对心肌和冠状动脉血管内皮细胞的差异表达影响 | 样本量较小(4例对照,8例COVID-19患者);未在大血管内皮观察到类似变化,限制了内皮炎作为COVID-19心血管事件关键驱动因素的结论 | 探讨重症COVID-19患者冠状动脉内皮和心肌的转录编程变化 | COVID-19患者和对照尸检心脏组织中的心肌及冠状动脉血管组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 12例尸检心脏组织样本(4例对照,8例COVID-19患者) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6484 | 2026-05-02 |
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00705-5
PMID:36136268
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研究论文 | 利用结直肠癌类器官模型通过单细胞RNA测序揭示奥沙利铂耐药机制 | 建立了来自奥沙利铂耐药和初治患者的患者源性类器官模型,并通过单细胞RNA测序解析耐药细胞群体及相关信号通路和驱动基因 | 未提及具体局限性 | 研究结直肠癌对奥沙利铂化疗耐药的分子机制 | 来自奥沙利铂耐药和初治结直肠癌患者的患者源性类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两株患者源性类器官(来自耐药和初治患者各一株) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6485 | 2026-05-02 |
Molecular signaling in pancreatic ductal metaplasia: emerging biomarkers for detection and intervention of early pancreatic cancer
2022-Apr, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-022-00664-x
PMID:35290607
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综述 | 总结了胰腺导管化生的分子机制及其作为早期胰腺癌检测和干预生物标志物的潜力 | 通过整合基因工程小鼠模型、细胞谱系追踪和单细胞测序等最新技术,揭示了PDM形成和演化的新型细胞和分子机制,并探讨其作为早期胰腺癌生物标志物的临床应用前景 | 基于综述性分析,可能缺乏原始实验数据支持,且PDM标志物向临床转化的有效性需进一步验证 | 阐释胰腺导管化生的细胞和分子机制,并探讨其作为早期胰腺癌筛查和干预生物标志物的潜在价值 | 胰腺导管化生细胞及其基因调控网络 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序,细胞谱系追踪 | NA | 文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 可能使用10x Chromium平台进行单细胞转录组分析 |
| 6486 | 2026-05-02 |
A comprehensive prognostic signature for glioblastoma patients based on transcriptomics and single cell sequencing
2021-Aug, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-021-00612-1
PMID:34142341
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研究论文 | 基于转录组学和单细胞测序构建胶质母细胞瘤综合预后标志物 | 结合TCGA和CGGA数据库筛选出七种差异表达基因作为预后标志物,并利用单细胞测序分析这些基因在肿瘤细胞增殖和进展中的功能,最终构建了综合临床特征和基因谱的预后模型 | 模型主要基于公共数据集,可能在外部验证数据中表现待进一步确认,且老年患者亚组的特异性表现需更多研究支持 | 揭示胶质母细胞瘤的潜在预后标志基因并构建有效的预后模型 | 胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq, 单细胞测序, 实时定量PCR | 预后风险评分模型 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | TCGA和CGGA数据库中的胶质母细胞瘤患者样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6487 | 2026-05-02 |
1p/19q co-deletion status is associated with distinct tumor-associated macrophage infiltration in IDH mutated lower-grade gliomas
2021-Feb, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-020-00561-1
PMID:32915415
|
研究论文 | 本研究探讨1p/19q共缺失状态对IDH突变低级别胶质瘤中肿瘤相关巨噬细胞浸润的影响 | 首次揭示1p/19q共缺失状态与IDH突变低级别胶质瘤中TAM表型及浸润程度的关联,并发现M-CSF和TGFβ1信号通路可能介导这一过程 | 研究主要依赖TCGA转录组数据和有限样本的免疫染色,小鼠模型可能无法完全模拟人类疾病 | 确定1p/19q共缺失状态是否影响IDH突变低级别胶质瘤中TAM的表型或浸润程度 | IDH突变低级别胶质瘤中的肿瘤相关巨噬细胞 | 机器学习 | 脑胶质瘤 | RNA-seq、单细胞RNA测序、免疫染色、小分子抑制剂 | NA | 转录组数据、单细胞测序数据、组织样本图像 | 230个TCGA样本及IDH突变LGG原代样本 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6488 | 2026-05-01 |
HOX code-based stratification reveals RUNX1T1-HDAC reprogramming as a targetable driver of lineage plasticity across cancers
2026-Jun-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218465
PMID:41912135
|
研究论文 | 通过分析80,000多个RNA-seq样本的HOX基因表达,发现HOX代码能够跨癌种区分谱系受限和谱系可塑性状态,并揭示RUNX1T1-HDAC轴作为可治疗靶点 | 首次建立基于HOX代码的跨癌种谱系可塑性分类框架,发现RUNX1T1作为跨谱系可塑性调节因子,并验证HDAC3抑制可作为治疗策略 | 未明确提及,但可能包括机制验证主要基于前列腺癌模型,以及临床验证样本范围的潜在限制 | 探索HOX代码作为跨癌种谱系可塑性生物标志物的可行性,并鉴定潜在治疗靶点 | 前列腺癌、肺癌和急性髓系白血病的谱系可塑性亚型及相关细胞模型 | 机器学习 | 前列腺癌、肺癌、急性髓系白血病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, CUT&RUN, 共免疫沉淀, 脂质纳米颗粒 | 人工智能结构建模 | RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据, 染色质图谱数据 | 超过80,000个RNA-seq样本,涵盖23种癌症类型的114个亚型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6489 | 2026-05-01 |
AMPK-p38 axis converts human pluripotent stem cells to naive state
2026-May-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2026.115569
PMID:42058906
|
研究论文 | 本研究发现AMPK-p38轴可单独诱导人类多能干细胞(hPSCs)从始发态向原始态转化,并揭示了中间状态细胞的特征 | 首次发现AMPK/p38通路单因子即可驱动始发态hPSC向原始态转变,无需多种外源因子;通过scRNA-seq与RNA速率分析揭示了始发态与原始态之间的中间细胞状态 | 未提及具体局限性,可能需要进一步验证AMPK-p38通路的长期稳定性和安全性 | 探索将人类多能干细胞从始发态高效转化为原始态的新机制与简化方法 | 人类多能干细胞(hPSCs)在始发态与原始态之间的转化过程及中间状态细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,研究基于细胞系实验及单细胞分析 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 使用10x Chromium平台进行单细胞RNA测序,结合RNA速率分析和Totem轨迹映射分析中间状态 |
| 6490 | 2026-05-01 |
Single-Cell Profiling Reveals Divergent Mechanisms of Fibrosis in Localized Scleroderma and Systemic Sclerosis
2026-May, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.70039
PMID:41451447
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研究论文 | 通过单细胞测序揭示局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化的不同机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较两种纤维化疾病的机制差异,发现局限性硬皮病中三级淋巴结构驱动的局部免疫激活,而系统性硬化症中CREB3L1高表达成纤维细胞的系统性活化 | 样本量较小(每组仅3例患者),且未进行大规模队列验证 | 阐明局限性硬皮病和系统性硬化症纤维化差异的分子机制 | 皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病患者、3例系统性硬化症患者)及小鼠模型 | 数字病理学 | 纤维化疾病(局限性硬皮病、系统性硬化症) | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9例皮肤活检样本(3例健康对照、3例局限性硬皮病、3例系统性硬化症) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 6491 | 2026-05-01 |
Transcriptomics analyses reveal microgravity triggers estrogen synthesis amidst degeneration and aging in human ovarian granulosa cells
2026-May, Life sciences in space research
IF:2.9Q2
DOI:10.1016/j.lssr.2025.12.002
PMID:42056751
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研究论文 | 通过转录组学分析揭示微重力诱发人卵巢颗粒细胞退化和衰老过程中的雌激素合成 | 首次系统表征微重力对人卵巢颗粒细胞的多方面影响,包括细胞骨架、线粒体功能和雌激素合成相关过程的破坏,并鉴定抗衰老化合物如雷帕霉素作为潜在干预措施 | 由于测序数据稀缺,机制研究和干预开发受到限制,且研究仅在体外进行 | 探究微重力对人卵巢颗粒细胞的影响及其对生殖内分泌健康的潜在机制 | 人卵巢颗粒细胞 | 转录组学 | 生殖内分泌疾病 | 转录组学分析、单细胞转录组学解卷积分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6492 | 2026-05-01 |
Methylene blue restores NAD+/NADH homeostasis to attenuate Achilles tendinopathy via activating AIF/Mitochondrial respiratory chain complex I
2026-May, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2026.101085
PMID:42058931
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research paper | 本研究探讨亚甲蓝通过恢复NAD+/NADH稳态缓解跟腱病的机制,并发现其通过激活AIF/线粒体呼吸链复合体I发挥作用 | 首次揭示亚甲蓝靶向NAD代谢通过AIF驱动的线粒体修复机制促进线粒体复合体I生物合成,为老药新用提供转化医学范例 | 未提及具体研究局限性 | 研究NAD代谢失调在跟腱病中的作用,评估亚甲蓝恢复NAD稳态和缓解跟腱病的疗效 | 人类跟腱组织、大鼠实验性跟腱病模型、大鼠原代跟腱细胞 | machine learning | geriatric disease | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类跟腱组织和大鼠跟腱样本,具体数量未提及 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6493 | 2026-05-01 |
Clec3b⁺ fibroblasts are the primary effectors of portal fibrosis following activation via a KLF4/periostin axis
2026-Apr-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-72394-9
PMID:42056126
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪,鉴定Clec3b⁺成纤维细胞为门脉纤维化的主要效应细胞,并揭示KLF4/Periostin轴调控其活化 | 首次明确Clec3b⁺成纤维细胞是胆道损伤后门脉纤维化的主要效应细胞,并发现KLF4/Periostin信号轴是调控其活化的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型,可能不完全代表人类疾病,且未涉及其他慢性肝病中的门脉纤维化机制 | 探究胆道疾病中门脉纤维化的细胞和分子机制,特别是寻找关键效应细胞和调控通路 | 小鼠模型中的门脉成纤维细胞,特别是Clec3b⁺成纤维细胞亚群 | 数字病理学 | 胆道疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型样本,具体数量文中未提及 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于小鼠门脉成纤维细胞分析 |
| 6494 | 2026-05-01 |
Spatial transcriptomic mapping of canine osteosarcoma reveals immune microenvironment features linked to survival
2026-Apr-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-10152-9
PMID:42056464
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研究论文 | 利用空间转录组技术绘制犬骨肉瘤的免疫微环境图谱,揭示与生存相关的特征 | 首次使用10x Genomics Visium平台对犬骨肉瘤进行空间转录组分析,结合单细胞数据解卷积,识别与生存相关的免疫细胞空间共定位模式 | 样本量较小(11只犬的14个肿瘤样本),未提及技术重复或批次效应校正 | 探究犬骨肉瘤肿瘤内异质性和肿瘤微环境的空间特征,识别与生存相关的免疫微环境特征 | 11只犬的14个骨肉瘤肿瘤样本(包括原发、转移和复发肿瘤),按生存结果分层 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 11只犬的14个肿瘤样本,共18,834个组织斑点 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium平台用于新鲜冷冻犬骨肉瘤组织切片的空间基因表达分析 |
| 6495 | 2026-05-01 |
Targeting GPR34 in damage-associated macrophages enhances anti-tumor immunity and the efficacy of Surufatinib in pancreatic cancer
2026-Apr-28, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02641-4
PMID:42045172
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序识别出高表达GPR34的损伤相关巨噬细胞亚群,并证明靶向GPR34可增强胰腺癌抗肿瘤免疫和索凡替尼疗效 | 首次在胰腺癌中发现GPR34+损伤相关巨噬细胞亚群,揭示其通过释放LysoPS促进CXCL16分泌和胞葬作用导致CD8 T细胞耗竭的机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外共培养,尚需进一步的临床试验验证 | 探究靶向GPR34在胰腺癌免疫治疗中的潜在价值 | 胰腺导管腺癌患者标本、Gpr34小鼠模型及体外共培养体系 | 机器学习 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 接受索凡替尼联合化疗的患者标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6496 | 2026-05-01 |
Neutrophil-derived reactive oxygen species and bystander tissue damage in inflammatory bowel disease
2026-Apr-22, Free radical biology & medicine
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综述 | 探讨中性粒细胞来源的活性氧在炎症性肠病中旁观者组织损伤的作用机制 | 整合了氧化还原蛋白质组学、空间转录组学、活体成像和单细胞分析等最新技术,揭示了中性粒细胞氧化损伤并非不可规避的炎症副产物,而是动态、情境依赖且具有治疗靶向潜力的过程 | 未明确指出具体的实验数据或临床验证,属于文献综述,缺乏原创实验证据 | 综述中性粒细胞氧化自由基生物学在胃肠道黏膜中的知识,评估减轻旁观者损伤同时保留宿主防御的治疗策略 | 中性粒细胞及其在炎症性肠病中产生的活性氧和活性氮物种 | 数字病理学, 机器学习, 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 氧化还原蛋白质组学, 空间转录组学, 活体成像, 单细胞分析 | NA | 文本, 图像 | NA | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium空间转录组学平台,Illumina NovaSeq测序系统 |
| 6497 | 2026-05-01 |
Metabolic reprogramming and signalling networks in microglial activation: Implications for neurodegeneration
2026-Apr-22, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2026.103138
PMID:42031319
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评论 | 综述小胶质细胞激活中的代谢重编程和信号网络,及其在神经退行性疾病中的作用 | 提出将小胶质细胞激活视为代谢-炎症整合网络,并强调炎症消退失败而非持续激活是慢性神经炎症的关键 | 代谢抑制剂的临床不可行性,需转向TREM2免疫调节剂和消退激动剂 | 整合单细胞转录组学、空间蛋白质组学和代谢组学,提供小胶质细胞激活的综合视角 | 小胶质细胞,特别是疾病相关小胶质细胞 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6498 | 2026-05-01 |
Deciphering IFN signaling in gastric cancer: A single-cell and bulk transcriptomic integration reveals CXCR4 as a key immunomodulator and prognostic determinant
2026-Apr-21, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102778
PMID:42019279
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研究论文 | 通过单细胞和批量转录组学整合,解析胃癌中干扰素信号通路,发现CXCR4作为关键免疫调节因子和预后决定因子 | 首次在单细胞分辨率下深入解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号网络,并识别出CXCR4作为与干扰素信号紧密相关的关键免疫调节因子和预后生物标志物 | 研究主要基于公开数据集和体外细胞实验,缺乏体内验证和临床队列的进一步证实 | 解析胃癌肿瘤微环境中干扰素信号通路的作用,识别可干预的靶点以优化免疫治疗策略 | 胃癌患者的肿瘤组织样本及AGS胃癌细胞系 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、批量转录组分析、qRT-PCR、Western blot、流式细胞术、CCK-8、Transwell、划痕实验 | NA | 基因表达数据 | 多个胃癌患者样本数据集(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6499 | 2026-05-01 |
Single-Cell sequencing investigation of endoplasmic reticulum stress-related genes in gastric cancer prognostic models and identification of NOX5 as a novel therapeutic target
2026-Apr-20, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102780
PMID:42013548
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研究论文 | 利用单细胞测序研究内质网应激相关基因在胃癌预后模型中的作用,并鉴定NOX5为新治疗靶点 | 首次通过单细胞RNA测序分析构建基于内质网应激的胃癌预后模型,并发现NOX5作为新潜在治疗靶点 | NA | 开发基于单细胞分析的内质网应激相关预后标志物,并鉴定潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系AGS和MKN-45 | 机器学习,自然语言处理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | Cox回归,LASSO | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6500 | 2026-05-01 |
Locat: Joint enrichment and depletion testing identifies localized marker genes in single-cell transcriptomics
2026-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.04.03.716370
PMID:41993378
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研究论文 | 提出一种名为Locat的框架,通过联合评估单细胞转录组数据中基因表达的富集和缺失,识别高度特异性的局部化标记基因 | 传统方法仅关注基因在候选群体内的富集,Locat同时检测表达在群体外是否显著缺失,并整合两者形成统一的局部化评分 | NA | 开发一种新的统计框架,以识别单细胞转录组数据中具有高度空间特异性的标记基因 | 单细胞转录组数据中的基因表达模式 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权高斯混合模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |