单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 44757 篇文献,本页显示第 621 - 640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
621 2026-10-23
IGFBP5 derived from endothelial cells drive vascular invasion and liver metastasis of colorectal cancer by activating the ITGB3/PI3K/AKT Axis
2026-Jul-23, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肝转移样本,发现内皮细胞来源的IGFBP5通过激活ITGB3/PI3K/AKT轴驱动血管侵犯和肝转移 首次鉴定出IGFBP5_tipECs亚群在血管侵犯性结直肠癌肝转移中显著富集,并揭示了内皮细胞来源IGFBP5与肿瘤细胞ITGB3的直接配体-受体相互作用机制 样本量有限(8例肝转移样本),主要基于体外和动物实验验证,缺乏大规模临床队列验证 探究肿瘤微环境中内皮细胞如何调控结直肠癌血管侵犯和肝转移的分子机制 结直肠癌肝转移患者样本、人脐静脉内皮细胞、结直肠癌细胞系、患者来源的类器官 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序, RNA测序, 多重免疫荧光, 免疫共沉淀, 邻近连接 assay NA 单细胞转录组数据, 图像 8例结直肠癌肝转移样本(4例血管侵犯阳性,4例血管侵犯阴性) NA 单细胞RNA测序 NA NA
622 2026-10-23
Advancing assisted reproductive technology in Africa: a narrative review on the promising role of molecular biology and molecular techniques
2026-Jul-23, Reproductive health IF:3.6Q1
综述 本文综述分子生物学和先进分子技术在非洲辅助生殖技术中的应用前景与挑战 系统探讨PGT、NIPT、CRISPR/Cas9、MRT和单细胞RNA测序等分子技术在非洲ART中的整合潜力,并提出分阶段实施策略 为叙述性综述,未进行系统文献检索或定量分析,缺乏原始数据支持 探讨分子生物学和分子技术如何克服非洲ART面临的障碍并推动其发展 非洲地区接受辅助生殖技术的个体和夫妇 生殖医学 不孕不育 植入前遗传学检测, 无创产前检测, CRISPR/Cas9基因编辑, 线粒体替代疗法, 单细胞RNA测序, 液体活检, 基因组筛查 NA 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
623 2026-10-23
Benchmarking single-cell format conversion tools reveals interoperability gaps and introduces CrossCell for reliable cross-ecosystem data exchange
2026-Jul-22, BMC genomics IF:3.5Q2
研究论文 本文系统性地基准测试了五种单细胞数据格式转换工具,并提出了基于Rust的CrossCell工具以实现R与Python生态系统之间的可靠数据交换 首次对五种格式转换工具从七个维度进行系统全面基准测试,覆盖68个数据集,并引入基于Rust的运行时无关工具CrossCell,实现100%转换成功率及2.5-4.9倍加速 基准测试主要聚焦于RDS与H5AD两种格式之间的转换,未涵盖其他单细胞数据格式;现有工具在小于74,000细胞的数据集上已广泛失败,大规模转换问题仍未完全解决 评估现有单细胞RNA测序数据格式转换工具的可靠性、性能和数据保真度,并开发更优的跨生态系统数据交换工具 单细胞RNA测序数据集,共68个数据集,细胞数范围从1,438到1,665,937 单细胞组学数据分析 NA 单细胞RNA测序数据分析 NA 单细胞表达矩阵及元数据 68个数据集,细胞数范围1,438至1,665,937 NA 单细胞RNA-seq NA NA
624 2026-10-23
Radiotherapy and tertiary lymphoid structures: balancing immune activation and immune damage in cancer immunotherapy
2026-Jul-22, Molecular cancer IF:27.7Q1
综述 综述放疗与三级淋巴结构之间的双向关系及其在肿瘤免疫治疗中的作用 系统区分了放疗调控TLS的已验证机制与间接证据,并从剂量、分割、时机、照射体积、淋巴结管理和放疗模式等维度提出优化策略 为综述性文章,未提供原始实验数据;许多机制仍属假设性转化概念,缺乏TLS定向临床干预的确定性证据 总结放疗与三级淋巴结构生物学双向关系的现有证据,探讨如何平衡免疫激活与免疫损伤 肿瘤微环境中的三级淋巴结构及接受放疗的肿瘤患者 肿瘤免疫学 多种恶性肿瘤 NA NA 文本 NA NA NA NA NA
625 2026-10-23
Deciphering the heterogeneity of chicken gonadal primordial germ cells via single-cell RNA sequencing
2026-Jul-22, Cellular and molecular life sciences : CMLS IF:6.2Q1
研究论文 利用单细胞转录组分析揭示鸡胚胎性腺原始生殖细胞存在三种转录上不同的亚型,并证明体外培养的PGCs可通过血管注射整合到受体性腺中 首次发现鸡性腺原始生殖细胞存在三种转录上不同的亚型,打破了以往认为PGCs是均一细胞群体的观点;证明体外长期培养的基因修饰PGCs可通过二次血管注射重新建立并整合到受体性腺 摘要未提及具体样本量、测序平台和技术细节,也未说明亚型的功能验证和分子机制 解析鸡性腺原始生殖细胞的异质性,并探索体外培养PGCs的移植整合能力 鸡胚胎性腺原始生殖细胞(PGCs) 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
626 2026-10-23
Single-cell RNA sequencing reveals that TAF7 promotes colorectal cancer stemness by targeting SOX2
2026-Jul-22, Biology direct IF:5.7Q1
研究论文 该研究通过单细胞转录组测序发现TAF7通过靶向SOX2促进结直肠癌干性 首次揭示TAF7通过转录激活SOX2促进结直肠癌干性和EMT,并鉴定出TAF7+上皮细胞亚群 摘要未明确说明研究局限性 探究TAF7在结直肠癌干性中的作用及其分子机制 结直肠癌组织和癌旁正常组织、结直肠癌细胞系、结直肠癌异种移植小鼠模型 单细胞转录组学、肿瘤生物学 结直肠癌 单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀、双荧光素酶报告基因实验 NA 单细胞转录组数据、实验数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
627 2026-10-23
Emergence of Disease-relevant Aberrant Epithelial Cell States in Human Alveolar Organoids
2026-Jul-22, American journal of respiratory cell and molecular biology IF:5.9Q1
研究论文 该研究探讨了人类肺泡类器官在肺泡分化培养基及HIF2偏向性激活条件下出现的疾病相关异常上皮细胞状态 揭示了商业肺泡分化培养基诱导的是疾病相关的过渡态而非稳态AT1分化,并发现HIF2激活加剧了异常上皮转变 未明确说明样本量及具体供体数量,且体外类器官模型可能无法完全反映体内复杂微环境 研究HIF2激活如何影响人肺泡上皮类器官的分化,并模拟特发性肺纤维化中的异常上皮修复 人肺泡上皮类器官(来源于供体肺) 数字病理学, 机器学习 特发性肺纤维化 单细胞RNA测序, 定量无标记蛋白质组学, Cell Painting, 透射电子显微镜 NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
628 2026-10-23
CD73-LNPs promote antitumor T-cell immunity via amplifying TLR3-mediated immunostimulatory dendritic cell activation
2026-Jul-21, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究评估了CD73 mRNA疫苗(CD73-LNPs)的免疫原性,并阐明其通过TLR3介导的树突状细胞活化增强抗肿瘤T细胞免疫的机制 首次揭示CD73 mRNA疫苗通过TLR3信号通路激活树突状细胞,并上调CD8+ T细胞趋化因子受体表达促进T细胞浸润肿瘤微环境的机制 研究仅在小鼠模型中进行,尚未开展人体临床试验验证其安全性和有效性 评估CD73蛋白的免疫原性并阐明CD73 mRNA疫苗介导抗肿瘤免疫效应的机制 小鼠肿瘤模型(黑色素瘤、宫颈癌、卵巢癌、前列腺癌)及原代树突状细胞 肿瘤免疫学 黑色素瘤、宫颈癌、卵巢癌、前列腺癌 mRNA疫苗、体外转录、脂质纳米颗粒递送、ELISPOT、流式细胞术、单细胞转录组测序、bulk RNA转录组分析 NA 文本(转录组数据)、图像(流式细胞术数据) 多种小鼠肿瘤模型及原代树突状细胞,具体样本量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq NA NA
629 2026-10-23
Multi-omics profiling highlights RPLP0 as a potential biomarker for prognosis and response to immunotherapy in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jul-17, BMC cancer IF:3.4Q2
研究论文 该文通过整合bulk转录组、蛋白质组、单细胞RNA测序和空间转录组等多组学数据,并结合实验验证,系统研究了RPLP0在透明细胞肾细胞癌中的表达、预后价值、免疫相关性及生物学功能 首次对RPLP0在ccRCC中进行多组学整合分析,结合单细胞和空间转录组揭示其在恶性细胞区室中的富集及其与巨噬细胞的空间正相关,并通过体外实验验证其通过促进EMT推动肿瘤进展的功能 药物敏感性分析基于pRRophetic预测而非实际药物反应数据,体外实验结果需进一步体内验证,且RPLP0调控ccRCC的具体分子机制尚未完全阐明 阐明RPLP0在透明细胞肾细胞癌中的临床相关性、微环境影响及生物学作用,评估其作为预后和免疫治疗反应生物标志物的潜力 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者样本及ccRCC细胞系 数字病理, 多组学, 肿瘤免疫学 肾癌 bulk转录组测序, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR, 免疫荧光, Western blot NA 文本, 图像, 基因表达数据, 蛋白质数据 多个公共数据库队列(TCGA、GEO、ICGC、ArrayExpress、CPTAC、HPA)及临床组织样本和ccRCC细胞系,具体样本量未在摘要中说明 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 蛋白质组学 NA NA
630 2026-10-23
Nanoparticle Modulation of Immune and Vascular Microenvironment Dynamics Following Spinal Cord Injury
2026-Jul-08, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
研究论文 该研究探讨了纳米颗粒通过调节单核细胞和中性粒细胞的表型与迁移,改变脊髓损伤后免疫和血管微环境动态,促进促再生环境的机制 利用纳米颗粒靶向循环单核细胞和中性粒细胞,结合过继转移追踪和单细胞测序分析,系统揭示了纳米颗粒对损伤微环境中细胞间通讯网络的直接和间接调控作用 研究仅基于女性小鼠宫颈半切脊髓损伤模型,未涉及雄性动物或其他损伤模型;也未详细评估纳米颗粒的长期安全性和临床转化可行性 探究纳米颗粒在脊髓损伤急性期调节单核细胞和中性粒细胞表型及迁移的机制,并计算解析损伤微环境中细胞类型间的通讯网络 女性小鼠宫颈半切脊髓损伤模型中的循环单核细胞、中性粒细胞及损伤微环境中的多种细胞类型 数字病理学, 机器学习 脊髓损伤 单细胞测序, 过继转移 NA 文本, 图像 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
631 2026-10-23
Structural-functional network decoupling in early stage amyotrophic lateral sclerosis reveals cell-type specific transcriptional signatures
2026-07-02, BMC medicine IF:7.0Q1
研究论文 该研究分析了早期散发性肌萎缩侧索硬化症(ALS-ES)患者的多模态MRI数据,揭示了结构-功能网络解耦及其与细胞类型特异性转录组特征的关系 首次将早期ALS的结构-功能网络解耦与影像转录组学及单细胞RNA测序相结合,发现FMN1胶质细胞表达与网络解耦的空间关联,构建了从宏观神经影像到细胞病理的多尺度框架 样本量相对较小(73例患者和74例对照),为横断面研究,单细胞数据仅用于验证而非主要发现,且未进行纵向随访 探究早期肌萎缩侧索硬化症中宏观结构-功能耦合异常及其潜在的转录组学特征 73例早期散发性肌萎缩侧索硬化症患者和74例年龄性别匹配的健康对照 神经影像学 肌萎缩侧索硬化症 弥散张量成像,静息态功能磁共振成像,影像转录组学,单细胞RNA测序 梯度提升机 影像,文本(基因表达数据) 73例患者和74例健康对照的多模态MRI数据,以及来自艾伦人脑图谱的基因表达数据和独立单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
632 2026-10-23
Characterizing the Discordance between AT-Rich Interacting Domain 1A Protein and Genotype in Endometrioid-Type Endometrial Tumors
2026-07, The American journal of pathology
研究论文 本研究揭示了子宫内膜样子宫内膜肿瘤中ARID1A蛋白表达与基因型之间的不一致性,并分析了其相关的转录变化 发现ARID1A蛋白缺失可不依赖基因型发生,可能通过蛋白酶体降解途径实现,并证明ARID1A蛋白表达是ARID1A野生型子宫内膜样子宫内膜肿瘤患者总生存期的预测因子 摘要中未明确说明研究的具体局限性 探究ARID1A蛋白缺失如何塑造子宫内膜癌的发病机制,特别是蛋白表达与基因型之间的不一致性 子宫内膜样子宫内膜肿瘤患者样本及人子宫内膜癌细胞模型 数字病理学 子宫内膜癌 空间转录组学 NA 图像, 文本 71例人子宫内膜样子宫内膜肿瘤用于蛋白检测,16例人子宫内膜样子宫内膜肿瘤用于空间转录组分析 NA 空间转录组学 NA NA
633 2026-10-23
Persistent hindrances to data re-use in single-cell genomics
2026-Jun-24, Scientific data IF:5.8Q1
研究论文 评估GEO中公开的单细胞RNA测序研究(主要基于10x Genomics)的可重用性,关注细胞级表达计数矩阵和细胞类型注释的可用性 通过半自动和手动整理系统评估单细胞RNA测序数据的可重用性,揭示现有数据共享实践的不足 仅关注GEO中基于10x Genomics的数据集,可能未涵盖其他平台或数据库;依赖启发式方法进行自动重分析 评估公开单细胞RNA测序研究的可重用性,并提出改进数据共享实践的建议 Gene Expression Omnibus中公开的单细胞RNA测序研究,主要基于10x Genomics平台 单细胞基因组学 NA 单细胞RNA测序 NA 文本和计数矩阵数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 NA NA
634 2026-10-23
Longitudinal Single-Cell RNA-Sequencing Reveals Evolution of Micro- and Macro-states in Chronic Myeloid Leukemia
2026-Jun-22, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 该文通过纵向单细胞RNA测序与bulk转录组比较,揭示慢性髓性白血病在单细胞微状态与伪bulk宏观状态之间的表型演化规律 提出微状态与宏观状态的理论框架,利用状态转移理论解释离散疾病表型为何在单细胞层面被掩盖而在聚合宏观层面显现 摘要未明确说明样本量、具体方法细节及外部验证队列,框架的普适性仍需更多癌种验证 系统探索scRNA-seq与bulk转录组中CML特异信息含量,解析单细胞噪声数据如何涌现出离散疾病定义状态 慢性髓性白血病(CML)患者样本 单细胞转录组学 慢性髓性白血病 单细胞RNA测序, bulk转录组测序 NA 基因表达数据(单细胞转录组与bulk转录组) NA NA single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
635 2026-10-23
Claudin-1 targeting suppresses tumor growth, invasion, and metastasis in patient-derived cholangiocarcinoma models
2026-Jun-03, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 该研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学分析胆管癌患者组织,发现CLDN1在癌细胞中上调并与干性和细胞命运相关,通过遗传功能获得和缺失研究以及CLDN1单克隆抗体治疗,揭示了CLDN1作为致癌驱动因子和治疗靶点的作用 首次发现CLDN1是胆管癌的致癌驱动因子和治疗靶点,并证明靶向暴露的非连接CLDN1的单克隆抗体可抑制肿瘤生长、侵袭和转移,机制涉及抑制Notch1和TROP2/STAT3信号通路 摘要中未明确提及研究局限性 探究CLDN1在胆管癌中的功能角色及其作为治疗靶点的潜力 胆管癌患者组织样本、胆管癌细胞系、患者来源的异种移植模型和类器官 数字病理学 胆管癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CRISPR-Cas9, RNAi, confocal imaging NA 图像, 文本 NA NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
636 2026-10-23
Targeting noncanonical nuclear factor kappa B signalling in CYLD cutaneous syndrome by selective inhibition of IκB kinase alpha
2026-05-19, The British journal of dermatology
研究论文 该研究探讨了CYLD皮肤综合征(CCS)肿瘤中的NF-κB信号通路,发现非经典NF-κB信号激活,并鉴定IKKα为可靶向靶点,使用选择性IKKα抑制剂SU1644可降低肿瘤球体活力 首次在CCS肿瘤角质形成细胞中揭示非经典NF-κB信号激活(p100向p52加工增加及RelB表达升高),并开发了新型高选择性IKKα抑制剂SU1644,利用患者来源的CCS肿瘤球体培养模型验证其疗效 研究仅为临床前体外实验,缺乏体内动物模型和临床试验验证;样本量有限;SU1644的药代动力学和安全性尚未评估 研究CCS肿瘤中的NF-κB信号通路,寻找可药物靶点,为CCS患者提供非手术治疗方案 CYLD皮肤综合征患者的皮肤肿瘤组织及肿瘤角质形成细胞 数字病理学 CYLD皮肤综合征 bulk转录组学, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序 NA 文本, 图像 NA NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 NA NA
637 2026-10-23
Macrophage-related Genomic Signatures Predict HCC Prognosis and Therapy Response
2026 May-Jun, Cancer genomics & proteomics IF:2.6Q3
研究论文 该研究整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别与巨噬细胞相关的基因组特征,划分肝细胞癌分子亚型,并构建基于PCA的预后模型以预测生存和治疗反应 利用单细胞RNA测序数据鉴定巨噬细胞相关基因,结合共识聚类划分HCC分子亚型,并基于主成分分析构建预后模型,同时关联免疫浸润和药物敏感性预测治疗反应 需要更大规模队列验证,且缺乏深入的机制探索 识别巨噬细胞相关基因组特征,划分HCC分子亚型,构建预后模型以预测生存和治疗反应 肝细胞癌患者 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 主成分分析,Cox回归 基因表达数据,文本 NA NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
638 2026-10-23
A transcriptomic microglia taxonomy across mouse and human pathologies
2026-May, Nature immunology IF:27.7Q1
研究论文 通过整合超过一百万中枢神经系统细胞的单细胞RNA测序数据,构建了跨小鼠和人类病理的髓系细胞状态分类框架,并结合空间转录组学和体内扰动实验验证 建立了涵盖27个超级簇和192个簇的全面髓系细胞状态分类体系,整合了超过30种生理和病理条件的数据,并结合空间转录组学揭示免疫细胞状态在组织中的空间组织方式及其与局部细胞环境的相互作用 摘要中未明确提及研究的具体局限性 建立一个能够跨不同背景比较和分层小胶质细胞状态的分类框架,系统分类脑疾病及相关小鼠模型中的髓系细胞状态 中枢神经系统髓系细胞(包括小胶质细胞),来源于小鼠和人类的30多种生理和病理条件 单细胞转录组学 脑部疾病(神经系统疾病) 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 单细胞转录组数据,空间转录组数据 超过一百万中枢神经系统细胞,来自30多种生理和病理条件 NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
639 2026-10-23
Endothelial tenascin signaling preserves VSMCs contractile phenotype in the human arterial wall in type II diabetes mellitus
2026-04-29, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了2型糖尿病合并冠心病患者主动脉中VSMC_0亚型的富集及其与内皮细胞TNXB/ITGA8信号轴的调控关系 首次在2型糖尿病合并冠心病患者主动脉组织中鉴定出特殊的收缩型VSMC_0亚型,并发现内皮细胞来源的TNXB通过ITGA8受体维持VSMC收缩表型 研究主要基于观察性数据和体外功能验证,缺乏体内干预实验和更大规模队列验证 探究2型糖尿病如何重塑冠状动脉疾病患者血管平滑肌细胞状态及其调控机制 接受冠状动脉旁路移植手术的冠心病患者(伴或不伴2型糖尿病)的主动脉组织 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序,空间转录组学,高通量加权基因共表达网络分析,细胞间相互作用分析,RT-qPCR,蛋白质印迹,免疫荧光染色 NA 图像,文本 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
640 2026-10-23
Correction: Kobayashi et al. Pathogenesis of Graves' Disease Determined Using Single-Cell Sequencing with Thyroid Autoantigen Peptide Stimulation in B Cells. Cells 2025, 14, 1102
2026-Apr-23, Cells IF:5.1Q2
更正 本文是对原论文的作者列表进行更正,补充遗漏的作者Takahiro Tsujikawa和Shigeru Hirano NA NA 更正原论文的作者信息 NA NA 格雷夫斯病 单细胞测序 NA NA NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部