本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-09-04 |
Porcine epidemic diarrhea virus infection promotes Peyer's patch immune induction and epithelial defense via single-cell transcriptional reprogramming
2026-Sep-02, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.02643-25
PMID:42684955
|
研究论文 | 利用单细胞RNA测序研究猪流行性腹泻病毒感染对肠上皮和Peyer's patches的转录重编程影响 | 首次通过单细胞转录组分析揭示PEDV感染协调肠上皮和Peyer's patches的免疫诱导及抗病毒防御机制,并发现一个保守的190基因上皮应答特征 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 理解猪流行性腹泻病毒与宿主的互作机制,为防控策略提供靶点 | 猪流行性腹泻病毒感染的猪肠道空肠组织(上皮和Peyer's patches) | 转录组学 | 猪流行性腹泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 摘要中未明确样本量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 622 | 2026-09-04 |
Spatial transcriptomics of primary and metastatic ALK-rearranged NSCLC reveals site-specific adaptations
2026-Sep-02, Current problems in cancer
IF:2.5Q3
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学分析ALK重排非小细胞肺癌原发灶和转移灶,揭示位点特异性肿瘤微环境适应及淋巴结转移中的风险相关特征 | 首次在ALK+ NSCLC中应用空间转录组学同时分析原发肺肿瘤、淋巴结转移和脑转移的肿瘤及基质区域,识别位点特异性微环境特征和探索性风险相关差异 | 样本量小且治疗暴露在风险组间存在显著差异,风险相关发现需在更大、均一治疗的队列中验证 | 探究ALK+ NSCLC不同转移部位(肺、淋巴结、脑)的肿瘤微环境适应及淋巴结转移中的风险相关签名 | 16例ALK+ NSCLC患者的原发肺肿瘤(3例)、淋巴结转移(10例)和脑转移(3例)及3例位点匹配的非肿瘤对照 | 空间转录组学 | 非小细胞肺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据及临床病理数据 | 16例肿瘤样本(3例肺、10例淋巴结、3例脑转移)及3例对照 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 623 | 2026-09-04 |
Comparative single-cell transcriptomics highlights species-biased developmental trajectories and candidate regulatory modules in primate spermatogenesis
2026-Sep-02, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2026.101281
PMID:42685515
|
研究论文 | 本研究整合了来自23个人类和4个猕猴睾丸的单细胞RNA测序数据,比较了从婴儿期到成年期的精子发生轨迹,识别出保守及物种偏倚的基因表达程序 | 首次在人类中发现富集的晚期精子细胞样转录状态Sperm.C2,并预测了CELF4和CTCF等候选调控因子在精子发生中的作用 | 猕猴数据集中未检测到Sperm.C2状态,可能受限于数据覆盖度或物种差异 | 阐明灵长类睾丸发育的进化保守性和物种特异性机制 | 人类和猕猴的睾丸样本,涵盖婴儿期至成年期 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 27个睾丸样本(23个人类,4个猕猴) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2026-09-04 |
Bisphenol A aggravates colitis-associated intestinal epithelial injury: Mitochondrial dysfunction and CASP1-associated inflammatory signaling
2026-Sep-02, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2026.120744
PMID:42685547
|
研究论文 | 本研究探讨双酚A在炎症性肠病相关条件下对肠道上皮线粒体功能及CASP1相关炎症信号的影响 | 首次结合小鼠模型、细胞实验、计算分析和人类单细胞转录组学,揭示BPA通过线粒体功能障碍和CASP1信号加重结肠炎相关上皮损伤 | VX-765未完全逆转所有炎症和代谢应激反应,提示其他机制可能参与;实验主要基于体外和小鼠模型,人体直接证据有限 | 探究BPA在IBD相关炎症条件下对上皮线粒体功能的影响及CASP1相关信号的贡献 | DSS诱导的结肠炎小鼠和NCM460肠道上皮细胞 | 毒理学与炎症研究 | 炎症性肠病 | DSS诱导结肠炎模型、细胞培养、分子模拟、单细胞转录组学 | 小鼠模型、细胞模型、计算模拟 | 组织、细胞、单细胞转录组数据 | 小鼠若干(具体数量未提供)及NCM460细胞系,人类单细胞数据来自公共数据库 | 未明确提及 | 单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 625 | 2026-09-04 |
The pseudouridine epitranscriptomic landscape of advanced prostate cancer therapeutic resistance identifies TIMM17A as a key player
2026-Sep-02, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102986
PMID:42685612
|
研究论文 | 该研究描绘了晚期前列腺癌治疗耐药中的伪尿苷表观转录组图谱,并确定TIMM17A为关键调控因子 | 首次系统描绘了晚期前列腺癌耐药中的伪尿苷(Ψ)表观转录组景观,并鉴定出TIMM17A作为新型治疗耐药介质 | 未明确提及,但可能包括体外和异种移植模型的局限性,以及公共数据集验证的依赖性 | 探索伪尿苷修饰在前列腺癌对雄激素受体信号抑制剂(ARSIs)耐药中的作用及机制 | 晚期前列腺癌细胞、异种移植肿瘤、单细胞RNA测序数据及公共数据集中的患者样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序、PA-Ψ测序 | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | PA-Ψ-seq技术 |
| 626 | 2026-09-04 |
REG3α is a Predictive Biomarker of Complicated Disease from Preclinical through Established Crohn's Disease
2026-Sep-02, Clinical gastroenterology and hepatology : the official clinical practice journal of the American Gastroenterological Association
IF:11.6Q1
DOI:10.1016/j.cgh.2026.08.028
PMID:42685961
|
研究论文 | 本研究评估了血清REG3α作为克罗恩病进展预测生物标志物的潜力,涵盖临床前至已确诊阶段。 | 首次表明血清REG3α在CD诊断前长达10年即可预测复杂病程,且独立于疾病活动性,并关联Paneth细胞亚群变化。 | 未明确提及局限性,但可推断需要更大样本验证及机制研究的深度限制。 | 评估血清REG3α与克罗恩病进展的关联及其作为非侵入性预后生物标志物的潜力。 | 克罗恩病患者及临床前个体,包括来自三个队列的血清和组织样本。 | 数字病理学 | 克罗恩病 | RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 血清样本、组织活检(RNA测序数据) | 394名患者(横断面队列),预诊断队列样本,配对回肠和结肠活检 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 627 | 2026-09-04 |
LIM and SH3 protein 1 deficiency confers resistance to cytotoxic lymphocyte-mediated lysis and immunotherapy in gastric cancer by disrupting cytoskeleton dynamics
2026-Sep-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-014475
PMID:42686372
|
研究论文 | 本研究揭示LASP1缺陷通过扰乱细胞骨架动力学介导的免疫突触膜脂质组织,使胃癌细胞抵抗细胞毒性淋巴细胞杀伤和抗PD-1免疫治疗 | 首次揭示LASP1作为支架蛋白调控Arp2/3复合物及细胞骨架动力学,影响免疫突触功能和免疫治疗响应 | 主要基于胃癌模型,需进一步在其他肿瘤类型中验证;机制研究主要在体外进行,体内验证相对有限 | 探究LASP1缺陷如何影响胃癌细胞对免疫治疗和细胞毒性淋巴细胞裂解的敏感性,并揭示其分子机制 | 胃癌细胞、细胞毒性淋巴细胞、抗PD-1治疗相关免疫微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、免疫组织化学、共免疫沉淀、免疫荧光、活细胞成像、Laurdan染色 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 628 | 2026-09-04 |
GTPase RAB31 supports ANXA1-driven macrophage education through clathrin-mediated endocytosis to suppress antitumor immunity
2026-Sep-02, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2026-015703
PMID:42686375
|
研究论文 | 本研究揭示了小GTP酶RAB31通过网格蛋白介导的内吞作用支持ANXA1驱动的巨噬细胞教育,从而抑制抗肿瘤免疫的机制 | 首次阐明RAB31在肿瘤相关巨噬细胞极化中的关键作用及其通过CME依赖方式维持FPR2稳定性、调节抗肿瘤免疫的分子机制 | 摘要中未提及研究局限性 | 探究RAB31通过网格蛋白介导的内吞作用调节肿瘤相关巨噬细胞极化及其对抗肿瘤免疫的影响 | 肿瘤相关巨噬细胞、CD8+ T细胞、小鼠肿瘤模型 | 免疫学, 肿瘤生物学 | 多种癌症(未特指) | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 流式细胞术, 免疫荧光, 质谱, 共免疫沉淀, 基因敲除小鼠 | NA | 基因表达数据、图像数据、流式细胞数据 | 多种人类癌症的公共scRNA-seq数据集及小鼠皮下肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 629 | 2026-09-04 |
Spatiotemporal lineage tracing reveals the dynamic spatial architecture of tumor growth and metastasis
2026-Sep-02, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-026-02739-z
PMID:42687033
|
研究论文 | 本研究整合高分辨率空间转录组学和谱系追踪技术,揭示了Kras;Trp53驱动的肺腺癌小鼠模型中肿瘤生长和转移的动态空间结构 | 创新地将空间转录组学与谱系追踪技术相结合,引入肿瘤系统地理学概念,从空间维度解析亚克隆扩张对微环境重塑及转移的影响 | 摘要中未提及明确的限制 | 阐明肿瘤扩张、可塑性和转移如何与微环境重塑共同演化,以及癌细胞状态和微环境结构的顺序变化如何协同促进肿瘤进展 | Kras;Trp53驱动的肺腺癌小鼠模型中的肿瘤细胞及其微环境 | 空间转录组学、谱系追踪 | 肺腺癌 | 空间转录组学、谱系追踪 | NA | 空间基因表达数据、谱系追踪数据 | 小鼠肿瘤样本(具体数量未在摘要中提及) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 630 | 2026-09-04 |
Glutathione Primes Mitochondrial Autophagy to Guide Pulp-Dentine Complex Repair
2026-Sep-02, International endodontic journal
IF:5.4Q1
DOI:10.1111/iej.70240
PMID:42687338
|
研究论文 | 该研究利用多组学整合方法,揭示了谷胱甘肽通过PINK1/Parkin线粒体自噬轴引导牙髓-牙本质复合体修复的分子机制 | 首次通过多组学整合(单细胞转录组、蛋白质组和代谢组)系统阐明谷胱甘肽代谢在牙本质生成中的中心调控作用,并发现GCLC介导的GSH抗氧化系统通过PINK1/Parkin线粒体自噬轴调节牙髓细胞分化,提出新的代谢-氧化信号回路作为再生牙髓病学的潜在治疗靶点 | 摘要未明确提及研究局限性 | 阐明人牙髓干细胞成牙本质分化过程中调控牙髓-牙本质复合体修复的关键分子机制 | 人牙髓干细胞(hDPSCs)、龋坏和健康牙髓组织、小鼠磨牙损伤模型 | 数字病理学 | 牙髓损伤和龋病 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物数据、图像数据 | 人类龋坏和健康牙髓组织,hDPSCs培养,小鼠磨牙损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、代谢组学 | NA | NA |
| 631 | 2026-09-04 |
Spatial Mapping of the Precancer-to-Cancer Transition in Breast and Prostate
2026-Sep-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-26-0012
PMID:41997105
|
研究论文 | 利用光片显微镜和空间转录组学,绘制乳腺和前列腺癌前病变向浸润性癌转变的空间图谱,并识别关键基因和免疫细胞特征 | 开发了一种整合体积重建和空间转录组学的多模态连续切片工作流,并首次用于描绘两种激素驱动腺癌的癌前至癌症转变的过渡连接 | 未提及明显的局限性 | 研究乳腺和前列腺癌前病变向浸润性癌转变的基因表达特征和结构变化 | 乳腺和前列腺癌组织样本中的癌前病变和浸润性区域 | 数字病理学 | 乳腺癌, 前列腺癌 | 光片显微镜, 空间转录组学 | NA | 图像, 基因表达数据 | 51例病例,319个空间检测 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 632 | 2026-09-04 |
Pulsed Electric Field Ablation Reprograms Tumor Immunity and Stimulates Germinal Center Formation in Tertiary Lymphoid Structures in Patients with Non-Small Cell Lung Cancer
2026-Sep-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-3847
PMID:42307634
|
研究论文 | 该治疗-切除临床研究评估了脉冲电场(PEF)消融在早期非小细胞肺癌(NSCLC)中调节抗肿瘤免疫的潜力,发现其可促进三级淋巴结构(TLS)中生发中心(GC)的形成 | 首次证明特异性PEF消融可诱导TLS中GC形成,上调CXCL13等细胞因子,并增强全身免疫,为增强免疫治疗反应提供新方法 | 该研究为探索性终点分析,样本量可能有限,且未报告长期临床结果或对免疫治疗反应的直接影响,具体局限性信息未见全文 | 评估专门PEF消融调节早期NSCLC抗肿瘤免疫的潜力,探索其诱导TLS及GC形成的能力 | 早期非小细胞肺癌患者的血液和肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 脉冲电场消融 | NA | 组织切片、细胞因子数据、单细胞RNA测序数据 | 治疗组与对照组患者,具体数量未提供 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 633 | 2026-09-04 |
Mast cell-derived IL-13 as a driver of Crohn disease-associated intestinal fibrosis
2026-Sep-01, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izag127
PMID:42418669
|
研究论文 | 本研究通过阻断IL-13或基因敲除,发现肥大细胞来源的IL-13驱动克罗恩病相关的肠道纤维化 | 首次确定肥大细胞是克罗恩病肠道纤维化中IL13的唯一来源,并证明IL-13而非IL-4是纤维化的关键驱动因子 | 研究主要基于SHIP缺陷小鼠模型,人类验证仅限于组织样本,未进行功能实验 | 识别驱动克罗恩病肠道纤维化的关键细胞因子及其细胞来源,以开发抗纤维化治疗 | SHIP缺陷小鼠,克罗恩病患者的肠道组织样本 | 免疫学 | 克罗恩病 | 基因敲除,中和抗体,单细胞RNA测序,RNAscope | 动物模型(SHIP基因缺陷小鼠) | 基因表达数据,组织学图像 | 涉及SHIP小鼠和人类切除组织样本,具体数量未说明 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 用于单细胞RNA测序分析 |
| 634 | 2026-09-04 |
Single-Cell Profiling Reveals Distinct Immune Hallmarks in Untreated Primary Colorectal and Liver Metastasis Cancers
2026-Sep, Chronic diseases and translational medicine
DOI:10.1002/cdt3.70051
PMID:42494952
|
研究论文 | 本研究通过对未治疗的原发性结直肠癌和肝转移癌进行单细胞分析,揭示了独特的免疫特征。 | 发现了肝转移肿瘤微环境中的新特征,包括CXCL13+CD4 T细胞和调节性CD4 T细胞富集、耗竭型CD8+ T细胞增加、SPP1+肿瘤巨噬细胞增加、IGFBP7+癌症相关成纤维细胞的出现,以及亚油酸代谢通路的相对激活。 | 样本量较小(仅9例未治疗的结直肠癌肝转移患者),且未进行功能验证实验。 | 解码结直肠癌转移与原发部位的肿瘤微环境差异,为生物标志物和治疗策略提供新见解。 | 9未治疗的结直肠癌肝转移患者的36个样本(来自4个解剖位置)。 | 基因组学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 9例患者、36个样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 635 | 2026-09-04 |
Single-cell transcriptomics reveal PD-1-loss-driven immune dysregulation of pulmonary lymphocytes during early Mycobacterium tuberculosis infection
2026-Sep, Microbiology spectrum
IF:3.7Q2
DOI:10.1128/spectrum.01199-26
PMID:42496156
|
研究论文 | 该研究通过单细胞转录组学分析了PD-1缺失小鼠在结核分枝杆菌感染早期肺脏B细胞和T细胞的转录及发育状态,揭示了PD-1在维持肺部淋巴细胞稳态中的关键作用 | 首次在早期结核感染背景下揭示PD-1缺失导致肺部淋巴细胞失衡的转录蓝图,包括调节性T细胞异常扩增、细胞毒性T细胞早期耗竭样分化及记忆B细胞成熟受损,并阐明B-T细胞通讯的改变 | 研究仅在PD-1敲除小鼠模型中进行,未在人类样本中验证;分析时间点限于感染后7天,未探讨长期效应 | 阐明PD-1在结核分枝杆菌感染早期对肺部B细胞和T细胞免疫应答的调控作用及潜在机制 | PD-1缺失小鼠和野生型小鼠感染结核分枝杆菌7天后的肺脏B细胞和T细胞 | 单细胞转录组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PD-1缺失小鼠和野生型小鼠各若干只(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 636 | 2026-09-04 |
Clinical, Histopathological, and Molecular Characterization of Pediatric MN1::ZNF341-Associated Cancer
2026-Sep, Pediatric blood & cancer
IF:2.4Q1
DOI:10.1002/1545-5017.70542
PMID:42535274
|
研究论文 | 本研究描述了四例伴有MN1::ZNF341融合的儿童恶性肿瘤,包括三例新生儿(其中一对同卵双胞胎)和一例青少年,通过详细的临床、组织病理学和分子特征分析,确认其与神经母细胞瘤和圆形细胞肉瘤等主要类似疾病不同,并表现出类固醇生成分化。 | 首次描述了四例新的MN1::ZNF341相关肿瘤,扩大了该疾病的临床病理谱,并通过单细胞RNA测序确认其独特的转录特征,区别于神经母细胞瘤。 | 样本数量有限,且未发现其他驱动事件,可能限制对肿瘤发生机制的全面理解。 | 揭示MN1::ZNF341相关儿童肿瘤的临床、组织病理学和分子特征,以区别于其他类似疾病,并进一步确认其作为一种独特的侵袭性儿童癌症。 | 四例患有MN1::ZNF341融合的儿童肿瘤患者,包括三例新生儿(含一对同卵双胞胎)和一例青少年。 | 数字病理学 | 儿童癌症 | 单细胞RNA测序,全基因组测序,靶向DNA测序 | NA | 基因表达数据,DNA序列数据,临床数据,病理图像 | 4例肿瘤样本(来自四名患者,其中一对为同卵双胞胎) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 637 | 2026-09-04 |
Beyond Morphology: Reframing Lymph-Node Metastasis Prediction Through Clonal Ecology-Decades-Long Genomic Instability and Polyclonal-to-Monoclonal Transitions as the Missing Dimension in Cancer
2026-Sep, Stem cells and development
IF:2.5Q2
DOI:10.1177/15473287261475554
PMID:42598790
|
综述 | 本文通过克隆生态学视角重新审视结直肠癌淋巴结转移预测,整合计算病理学与进化肿瘤学,提出超越静态形态学特征的预测模型框架 | 提出将克隆生态学作为可测量的新维度,定义五大方法论支柱,并引入亚克隆转换板模型和AI多模态整合以实现进化感知的转移预测 | 文中未提供具体的实验验证数据或定量结果,主要基于文献综合和理论框架构建,缺乏临床前瞻性研究支持 | 旨在扩展基于形态学的转移预测模型,使其涵盖克隆进化、亚克隆动态和生态交互,以更准确预测淋巴结转移并识别治疗窗口 | 结直肠癌肿瘤及其进化过程中的克隆群体、亚克隆、肿瘤微环境和相关基因组/转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、谱系追踪、空间转录组学、空间基因组学、液体活检、计算病理学 | 多实例学习、病理学基础模型 | 组织图像、单细胞转录组数据、空间转录组数据、基因组测序数据、纵向液体活检数据 | 未提供具体样本数量(文中提及一项KMT2A重排急性髓系白血病的纵向临床和实验研究作为支持性案例) | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、全基因组测序、谱系追踪 | NA | NA |
| 638 | 2026-09-04 |
Phase I trial of autologous regulatory T cells for immune aplastic anemia
2026-Sep-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2025.288962
PMID:41742894
|
研究论文 | 一项针对免疫介导再生障碍性贫血患者的自体调节性T细胞I期临床试验,评估其安全性和疗效 | 首次在免疫再生障碍性贫血中测试自体扩增的调节性T细胞输注,并利用质谱流式和单细胞测序追踪体内持久性及相关标志物 | 该试验为I期,样本量小(6例),且未设置对照组,结果需进一步验证 | 评估自体调节性T细胞在难治/复发性免疫再生障碍性贫血患者中的安全性和初步疗效 | 对标准治疗抵抗或难治的免疫再生障碍性贫血患者 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 质谱流式、单细胞测序 | NA | 血液样本数据 | 6例患者 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 639 | 2026-09-04 |
Spatial Total RNA Sequencing of Formalin-Fixed Paraffin-Embedded Tissue by spRandom-seq
2026-09, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.74487
PMID:42478573
|
研究论文 | 该研究介绍了一种基于随机引物的空间总RNA测序技术spRandom-seq,用于解析福尔马林固定石蜡包埋组织中的完整转录组,包括宿主、细菌和纳米级病毒RNA | 采用随机引物设计,能同时捕获宿主、细菌和病毒的RNA,包括长链非编码RNA和可变剪接事件,兼容现有空间转录组平台且操作简便 | 未提及具体限制,如对RNA降解或组织类型的适用范围等可能存在的挑战 | 开发一种适用于FFPE组织的空间总RNA测序技术,以全面解析组织微环境中的转录景观,推动临床病理和感染诊断应用 | 小鼠大脑、嗅球,以及乳腺癌、肺炎克雷伯菌感染组织、乙型肝炎病毒阳性肝细胞癌的临床FFPE样本 | 空间转录组学 | 乳腺癌、感染性疾病、肝细胞癌 | 随机引物空间总RNA测序 | NA | 空间转录组数据,包括RNA序列和拷贝数变异数据 | 小鼠脑组织、嗅球及若干临床FFPE样本(具体数量未提供) | NA | 空间总RNA测序 | spRandom-seq | 基于随机引物和现有空间转录组平台 |
| 640 | 2026-09-04 |
A Functionally Constrained Immune Ecosystem in Microsatellite-stable Colorectal Cancer Resolved by Single-cell and Exome Profiling
2026 Sep-Oct, Cancer genomics & proteomics
IF:2.6Q3
DOI:10.21873/cgp.20615
PMID:42674816
|
病例报告 | 通过单细胞和全外显子组测序分析一个微卫星稳定型结直肠癌病例,揭示T细胞丰富但免疫功能受限的微环境 | 首次在单细胞水平揭示MSS结直肠癌中T细胞丰度与免疫有效性脱节的现象 | 基于单一病例,缺乏多病例验证 | 探究MSS结直肠癌中T细胞浸润是否反映有效免疫或功能性免疫约束 | 一名77岁女性的错配修复完整、微卫星稳定型结直肠癌肿瘤、腺瘤及邻近正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 全外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,外显子组测序数据 | 1例患者的肿瘤、腺瘤和邻近正常组织 | NA | 全外显子组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |