单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
621	2025-05-14	Interferon-γ-stimulated antigen-presenting cancer-associated fibroblasts hinder neoadjuvant chemoimmunotherapy efficacy in lung cancer 2025-Mar-18, Cell reports. Medicine DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102017 PMID:40056907	research paper	该研究通过单细胞测序分析揭示了抗原呈递癌症相关成纤维细胞(apCAFs)如何通过干扰素γ刺激的途径阻碍肺癌新辅助化疗免疫疗法的疗效	首次发现apCAFs通过JAK1/2-STAT1-IFI6/27途径扩张并促进PD-L2表达，揭示了其通过PD-L2-RGMB轴触发FOXP1调节性T细胞积累的新机制	研究样本量未明确说明，且机制研究主要在体外模型中进行，需要更多临床验证	探究新辅助化疗免疫疗法(NCIT)在非小细胞肺癌中疗效受限的机制	非小细胞肺癌(NSCLC)患者和癌症相关成纤维细胞(CAFs)	肿瘤免疫学	肺癌	单细胞测序分析	NA	单细胞测序数据	未明确说明(来自NCIT队列)
622	2025-05-14	Periarteriolar niches become inflamed in aging bone marrow, remodeling the stromal microenvironment and depleting lymphoid progenitors 2025-Mar-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2412317122 PMID:40063797	研究论文	该研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠骨髓基质细胞在衰老过程中的变化，揭示了衰老骨髓中动脉周围微环境的炎症变化及其对淋巴祖细胞的影响	首次在衰老骨髓中鉴定出五种转录不同的LepR细胞亚群，并揭示了动脉周围微环境炎症变化与淋巴祖细胞耗竭的机制	研究仅基于小鼠模型，人类骨髓衰老的类似机制尚未验证	探究骨髓基质细胞在衰老过程中的变化及其对造血干细胞微环境的影响	小鼠骨髓中的LepR基质细胞、内皮细胞和造血干细胞	细胞生物学	衰老相关疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	2月龄、12月龄和24月龄小鼠的骨髓基质细胞
623	2025-05-14	Cell type and region-specific transcriptional changes in the endometrium of women with RIF identify potential treatment targets 2025-Mar-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2421254122 PMID:40063812	研究论文	本研究利用空间转录组学技术，分析了反复植入失败（RIF）患者子宫内膜中不同区域和细胞类型的基因表达差异，并探索了潜在的治疗靶点	首次在RIF患者中应用空间转录组学技术，揭示了子宫内膜不同区域和细胞类型的特异性基因表达变化，并提出了潜在的治疗化合物	样本量较小（RIF组和对照组各8例），且研究结果需要进一步的实验验证	探索反复植入失败（RIF）的分子机制并寻找潜在治疗靶点	人类子宫内膜组织	生殖医学	不孕症	空间转录组学	NA	基因表达数据	16例（8例RIF患者和8例生育能力正常的对照）
624	2025-05-14	Expansion and pathogenic activation of skeletal muscle-resident macrophages in mdx5cv/Ccr2-/- mice 2025-Mar-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1 DOI:10.1073/pnas.2410095122 PMID:40067893	研究论文	本研究探讨了在Duchenne肌营养不良症（DMD）小鼠模型中，骨骼肌驻留巨噬细胞的扩张及其致病性激活的机制	揭示了在CCR2缺陷的DMD小鼠模型中，骨骼肌驻留巨噬细胞的扩张和致病性激活，以及FAPs通过CSF-1刺激巨噬细胞增殖的调控作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类DMD患者中验证	探究DMD小鼠模型中骨骼肌驻留巨噬细胞的扩张机制及其致病作用	mdx5cv/Ccr2-/-小鼠和对照小鼠的骨骼肌驻留巨噬细胞	肌肉疾病研究	Duchenne肌营养不良症	单细胞RNA测序分析和基于谱系追踪的巨噬细胞起源研究	小鼠模型	基因表达数据和细胞谱系数据	未明确提及具体样本数量，但涉及多组小鼠的比较研究
625	2025-05-14	Intensive stress impedes hair follicle growth through triggering cell cycle arrest of hair follicle stem cells 2025-Mar-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202403343R PMID:40059814	研究论文	研究高强度压力通过触发毛囊干细胞的细胞周期停滞来阻碍毛囊生长的机制	揭示了高强度压力通过交感神经系统/去甲肾上腺素/cAMP通路抑制毛囊生长的细胞周期	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证	探究高强度压力对毛囊生长的具体影响及其机制	小鼠的毛囊干细胞和HaCaT细胞	细胞生物学	脱发	单细胞RNA测序	小鼠模型	基因表达数据	小鼠皮肤样本
626	2025-05-14	Transcriptomic and metabolic profiling reveals the effects of long-term microwave exposure on testicular tissue 2025-Mar-15, Ecotoxicology and environmental safety IF:6.2Q1 DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.118040 PMID:40086029	研究论文	本研究通过转录组学和代谢组学分析，探讨了长期微波暴露对睾丸组织的影响	首次结合bulk RNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序和染色质可及性测序技术，全面解析微波辐射对睾丸组织的转录和代谢影响	研究仅使用大鼠模型，结果可能无法完全反映人类情况	探究长期微波辐射对男性生殖系统的影响	大鼠睾丸组织	生物医学	男性生殖系统疾病	bulk RNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序、染色质可及性测序	NA	转录组数据、代谢组数据、单细胞数据	经过六周微波辐射处理的大鼠样本
627	2025-05-14	Shaping early neural development by timed elevated tissue oxygen tension: Insights from multiomic analysis on human cerebral organoids 2025-Mar-14, Science advances IF:11.7Q1 DOI:10.1126/sciadv.ado1164 PMID:40073136	research paper	该研究利用人类脑类器官模型和多组学分析，探讨了氧气在早期神经发育中的关键作用	揭示了第4至6周期间脑类器官内氧气张力升高与神经发生的关系，并发现通过缺氧处理或神经球蛋白基因沉默可抑制这一现象	研究基于体外模型，可能无法完全反映体内神经发育的复杂性	探究氧气在早期神经发育中的作用机制	人类脑类器官	神经科学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序、多组学分析、先进显微镜技术	人类脑类器官模型	多组学数据	NA
628	2025-05-14	Single-cell RNA sequencing revealed changes in the tumor microenvironment induced by radiotherapy for cervical cancer and the molecular mechanism of mast cells in immunosuppression 2025-Mar-14, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-025-01564-7 PMID:40082276	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了宫颈癌放疗后肿瘤微环境的变化以及肥大细胞在免疫抑制中的分子机制	首次应用单细胞RNA测序技术分析宫颈癌患者放疗前后组织样本，揭示了放疗后肥大细胞在肿瘤免疫抑制和基质重塑中的关键作用	研究样本量较小（仅3例患者），可能影响结果的普遍性	探究宫颈癌放疗后肿瘤微环境变化，为提高放疗治疗效果提供依据	宫颈癌患者放疗前后的组织样本	数字病理学	宫颈癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	3例宫颈癌患者的52,506个细胞
629	2025-05-14	Exosome-mediated effects of BRCA1 on cardiovascular artery disease 2025-Mar-13, Cell biology and toxicology IF:5.3Q1 DOI:10.1007/s10565-025-09996-4 PMID:40080209	研究论文	研究探讨了M1巨噬细胞来源的外泌体（Exo）中BRCA1对冠状动脉粥样硬化疾病（CAD）的影响	揭示了BRCA1通过外泌体介导对心肌细胞凋亡和平滑肌细胞行为的调控作用，为CAD治疗提供了新的分子靶点	NA	探究BRCA1在外泌体中对CAD进展的影响	M1巨噬细胞、心肌细胞、平滑肌细胞	NA	心血管疾病	单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、慢病毒转染	NA	RNA-seq数据	NA
630	2025-05-14	Single-cell spatial transcriptomics unravels cell states and ecosystems associated with clinical response to immunotherapy 2025-Mar-13, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1 DOI:10.1136/jitc-2024-011308 PMID:40081939	研究论文	利用单细胞空间转录组学解析肿瘤微环境的细胞状态和生态系统，及其与免疫治疗临床反应的关系	首次在vHSIL患者中应用单细胞空间转录组学技术，揭示了免疫治疗反应与肿瘤微环境中细胞异质性和空间相互作用的关联	研究样本量较小（20例），且仅针对vHSIL这一特定肿瘤类型	探究肿瘤微环境对免疫治疗疗效的影响机制	外阴高级别鳞状上皮内病变（vHSIL）患者的肿瘤组织	数字病理学	外阴癌	单细胞空间转录组学	NA	转录组数据	20例vHSIL患者（包括完全应答者、部分应答者和无应答者）
631	2025-05-14	TIMM23 overexpression drives NSCLC cell growth and survival by enhancing mitochondrial function 2025-Mar-13, Cell death & disease IF:8.1Q1 DOI:10.1038/s41419-025-07505-3 PMID:40082395	研究论文	研究TIMM23过表达通过增强线粒体功能促进非小细胞肺癌（NSCLC）细胞生长和存活的机制	首次揭示TIMM23在NSCLC中的促肿瘤作用及其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于体外和动物模型，临床转化仍需进一步验证	探究TIMM23在NSCLC中的表达特征及其对肿瘤细胞生长的影响	非小细胞肺癌（NSCLC）细胞和组织	癌症生物学	肺癌	单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9基因编辑、shRNA沉默、腺相关病毒递送	NA	基因表达数据、蛋白质水平数据、细胞功能实验数据	多个原代/已建立的NSCLC细胞系及裸鼠皮下移植瘤模型
632	2025-05-14	A single-cell network approach to decode metabolic regulation in gynecologic and breast cancers 2025-Mar-13, NPJ systems biology and applications IF:3.5Q1 DOI:10.1038/s41540-025-00506-0 PMID:40082472	研究论文	本研究采用单细胞网络方法解码妇科和乳腺癌中的代谢调控机制	利用单细胞RNA测序数据构建癌症特异性蛋白互作网络和基因调控网络，揭示代谢重编程与转录调控的复杂相互作用	NA	解析妇科和乳腺癌中代谢异质性及其调控机制，为精准治疗提供策略	妇科和乳腺癌细胞	生物信息学	妇科癌症, 乳腺癌	scRNA-seq	蛋白互作网络(PPI), 基因调控网络(GRNs)	单细胞转录组数据	NA
633	2025-05-14	Mesothelioma cell heterogeneity identified by single cell RNA sequencing 2025-Mar-13, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92542-3 PMID:40082554	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术探究了间皮瘤细胞的异质性，揭示了不同来源细胞群的独特基因特征	可能是首个利用scRNA-seq技术探索循环间皮瘤细胞异质性的研究，鉴定了不同亚群的独特基因特征	研究主要基于小鼠模型，人类样本验证不足	探究间皮瘤细胞异质性及其对疾病进展和治疗的影响	间皮瘤细胞（来自细胞培养、腹腔灌洗液和循环肿瘤细胞）	数字病理学	间皮瘤	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	RNA测序数据	来自细胞培养(CC)、腹腔灌洗液(Lav)和循环肿瘤细胞(CTC)的小鼠模型样本
634	2025-05-14	Impdh1 was identified as a key protein promotes diabetic vasculopathy by intervention of vascular endothelial cell pyroptosis 2025-Mar-13, BMC cardiovascular disorders IF:2.0Q3 DOI:10.1186/s12872-025-04604-z PMID:40082765	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和大规模RNA测序分析，发现Impdh1是促进糖尿病血管病变的关键蛋白，通过干预血管内皮细胞焦亡发挥作用	首次将Impdh1鉴定为与糖尿病血管病变相关的焦亡相关基因，并证明其通过抑制焦亡和炎症保护主动脉内皮细胞	研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证	阐明糖尿病血管病变的分子机制，寻找潜在治疗靶点	糖尿病小鼠模型和血管内皮细胞	分子生物学	糖尿病血管病变	scRNA-seq, bulk RNA-seq, qRT-PCR, IHC, IF, ELISA	小鼠糖尿病模型	基因表达数据、组织病理学图像	未明确说明具体样本数量，使用GSE169332数据集和小鼠模型数据
635	2025-05-14	Basal cell adhesion molecule (BCAM) promotes mesothelial-to-mesenchymal transition and tumor angiogenesis through paracrine signaling 2025-Mar-13, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02128-9 PMID:40082910	研究论文	本研究探讨了基底细胞粘附分子（BCAM）如何通过旁分泌信号促进间皮-间质转化（MMT）和肿瘤血管生成，从而推动卵巢癌的进展	揭示了BCAM通过诱导特定细胞因子的分泌促进MMT和血管生成的新机制，并发现这些变化与卵巢癌患者的不良预后相关	研究主要基于体外实验和小鼠模型，需要进一步临床验证	探究BCAM在卵巢癌转移过程中的作用机制	卵巢癌细胞和间皮细胞	肿瘤生物学	卵巢癌	亲和蛋白质组学、RNA测序（bulk和单细胞）、活细胞和多光子显微镜	小鼠肿瘤模型	蛋白质组数据、转录组数据、影像数据	卵巢癌患者的腹水样本和网膜间皮细胞亚群
636	2025-05-14	MuCST: restoring and integrating heterogeneous morphology images and spatial transcriptomics data with contrastive learning 2025-Mar-13, Genome medicine IF:10.4Q1 DOI:10.1186/s13073-025-01449-1 PMID:40082941	research paper	提出了一种名为MuCST的多模态对比学习方法，用于整合空间转录组学数据，包括去噪、异质性消除和兼容特征学习	MuCST通过对比学习整合多模态空间转录组学数据，能够准确识别空间域，并适用于不同数据集平台	未提及具体的局限性	开发一种灵活的多模态对比学习方法，用于整合空间转录组学数据	空间转录组学数据，包括空间位置、组织学图像和转录谱	生物信息学	NA	对比学习	MuCST	图像、空间位置、转录谱	NA
637	2025-05-14	Structure and function relationships of mucociliary clearance in human and rat airways 2025-Mar-12, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-025-57667-z PMID:40069153	研究论文	本研究探讨了人类和大鼠气道中粘液纤毛清除的结构与功能关系，揭示了物种间的差异及其对清除效率的影响	通过单细胞转录组学和基于物理的建模，建立了评估人类气道功能的通用基准，并揭示了实验室培养物与人类气道在清除效率上的结构差异	研究主要基于女性大鼠和人类气道的比较，可能无法完全代表其他物种或性别的差异	研究人类和大鼠气道中粘液纤毛清除的结构与功能关系，以更好地理解气道疾病的特异性损伤	人类和雌性大鼠的气道	生物医学研究	慢性阻塞性肺病(COPD)和哮喘	单细胞转录组学和基于物理的建模	NA	生物样本数据和实验数据	NA
638	2025-05-14	Integrative single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies lactylation-related signature in osteosarcoma 2025-Mar-12, Functional & integrative genomics IF:3.9Q1 DOI:10.1007/s10142-025-01559-4 PMID:40072643	研究论文	本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据，识别了与骨肉瘤中乳酸化相关的基因特征，旨在提高预后准确性和免疫治疗效果	首次整合单细胞和批量RNA-seq数据，识别了与乳酸代谢密切相关的277个基因，并从中筛选出9个关键基因，这些基因在骨肉瘤患者的预后预测中表现出强大的预测能力	研究依赖于公共数据集，可能受到数据质量和样本量的限制	阐明乳酸化相关基因在骨肉瘤中的作用，以提高预后准确性和免疫治疗效果	骨肉瘤患者	生物信息学	骨肉瘤	单细胞RNA-seq，批量RNA-seq	LASSO算法，uni-Cox回归	RNA-seq数据	NA
639	2025-05-14	Single-cell eQTL mapping in yeast reveals a tradeoff between growth and reproduction 2025-Mar-12, eLife IF:6.4Q1 DOI:10.7554/eLife.95566 PMID:40073070	研究论文	本文通过单细胞RNA测序技术在酵母中绘制了eQTL图谱，揭示了生长与繁殖之间的权衡关系	开发了一种一锅法方法，通过单细胞RNA测序绘制eQTL图谱，并识别了等位基因特异性表达噪声和影响细胞周期进程的位点	研究仅基于酵母细胞，可能不直接适用于更复杂的生物系统	探索遗传变异对基因表达及其下游性状的影响	酵母单细胞	基因组学	NA	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞基因表达数据	超过100,000个单细胞，来自三个杂交系
640	2025-05-14	Heterogeneous cellular responses to hyperthermia support combined intraperitoneal hyperthermic immunotherapy for ovarian cancer mouse models 2025-Mar-12, Science translational medicine IF:15.8Q1 DOI:10.1126/scitranslmed.adp2124 PMID:40073154	研究论文	本研究探讨了高温腹腔化疗（HIPEC）在卵巢癌中的效果，并通过单细胞RNA测序分析了高温（HT）对肿瘤和微环境的同质和异质细胞反应	通过单细胞RNA测序和CUT&Tag技术揭示了HSF1在常温和高温下的差异结合程序和转录调控机制，并证实了HT与PD-L1阻断的联合抗肿瘤效果	研究结果基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中得到验证	探索高温腹腔化疗（HIPEC）在卵巢癌治疗中的效果及其与免疫治疗的联合应用	卵巢癌小鼠模型及肿瘤微环境中的细胞反应	肿瘤学	卵巢癌	单细胞RNA测序、CUT&Tag、RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	NA