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当前共找到 35811 篇文献，本页显示第 621 - 640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 621 | 2026-01-24 |
Correction to: Integration of scRNA-seq and bulk tissue RNA-seq data to identify cancer-associated fibroblast-related gene RGMA as a potential treatment target for esophageal cancer
2025-Aug-12, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01681-3
PMID:40789770
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 622 | 2026-01-24 |
Integration of scRNA-seq and bulk tissue RNA-seq data to identify cancer-associated fibroblast-related gene RGMA as a potential treatment target for esophageal cancer
2025-Jul-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01660-8
PMID:40643758
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量组织RNA测序数据，识别出癌症相关成纤维细胞相关基因RGMA，并探讨其作为食管癌潜在治疗靶点的作用 | 首次结合scRNA-seq和WGCNA分析识别CAF相关基因RGMA，并验证其在食管癌中的抑癌功能及调控机制 | 研究主要基于公共数据集和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证，且体内实验模型有限 | 识别食管癌中癌症相关成纤维细胞的关键基因，探索其作为治疗靶点的潜力 | 食管癌组织、细胞系（ECA109）、癌症相关成纤维细胞（CAFs）和正常成纤维细胞（NFs） | 生物信息学 | 食管癌 | scRNA-seq, 批量RNA-seq, WGCNA, RT-qPCR, western blot, 体外和体内实验 | NA | 基因表达数据 | TCGA-ESCA队列数据集和GSE196756 scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 623 | 2026-01-24 |
Palmitoylation Dynamics in Systemic Lupus Erythematosus: Multi-Omics Insights and Potential Therapeutic Implications
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70346
PMID:40613570
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了棕榈酰化在系统性红斑狼疮中的动态作用及其潜在治疗靶点 | 结合多组学数据、单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法，首次系统性鉴定了与SLE相关的棕榈酰化相关基因及因果代谢物 | 研究结果基于公共数据集GSE61635，需要进一步实验验证；样本来源和临床异质性可能影响结论的普适性 | 探究棕榈酰化在系统性红斑狼疮发病机制中的作用并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 系统性红斑狼疮患者与健康对照的基因表达数据及免疫细胞 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 机器学习模型, 孟德尔随机化 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | 基于公共数据集GSE61635，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 624 | 2026-01-24 |
Noncanonical Differentiation of Memory B Cells Drives Latent Tuberculosis Infection Reactivation Upon Tumor Necrosis Factor-Alpha Inhibitor Therapy: An Integrative Transcriptomic Study
2025-Jul, International journal of rheumatic diseases
IF:2.4Q2
DOI:10.1111/1756-185X.70311
PMID:40686471
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学分析，揭示了记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的非经典分化轨迹及其代谢重编程作用 | 首次识别ROR1+记忆B细胞在结核病进展中的非经典分化轨迹，并发现其代谢重编程可能破坏免疫平衡，导致潜伏结核感染再激活 | 研究基于六个转录组数据集，样本量有限，且为回顾性分析，需进一步实验验证 | 探究肿瘤坏死因子抑制剂治疗中潜伏结核感染再激活的致病机制 | 记忆B细胞在结核病进展和肿瘤坏死因子抑制剂治疗中的转录变化 | 生物信息学 | 结核病 | 转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 六个转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 625 | 2026-01-24 |
WISP2/CCN5 revealed as a potential diagnostic biomarker for endometriosis based on machine learning and single-cell transcriptomic analysis
2025-Jun-19, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01631-z
PMID:40536575
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和单细胞转录组分析，揭示了WISP2/CCN5作为子宫内膜异位症潜在诊断生物标志物的可能性 | 首次结合机器学习与单细胞转录组学技术，识别并验证了WISP2/CCN5在子宫内膜异位症诊断中的潜在生物标志物作用，并探索了其表达调控机制 | 未明确说明样本的具体数量或来源，且研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证的详细描述 | 开发子宫内膜异位症的非侵入性诊断生物标志物，以缩短诊断延迟并实现早期筛查 | 子宫内膜组织（包括正常、在位和异位子宫内膜） | 机器学习 | 子宫内膜异位症 | 单细胞转录组测序 | 机器学习算法（具体未指定，但使用了三种算法） | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 626 | 2026-01-24 |
Integrated muti-omics data and machine learning reveal CD151 as a key biomarker inducing chemoresistance in metabolic syndrome-related early-onset left-sided colorectal cancer
2025-Jun-09, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01634-w
PMID:40484863
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，揭示了CD151是代谢综合征相关的早发性左侧结直肠癌中诱导化疗耐药的关键生物标志物 | 首次将代谢综合征与早发性左侧结直肠癌联系起来，并利用机器学习算法从多组学数据中识别出CD151作为关键生物标志物，揭示了其在基质重塑和化疗耐药中的作用 | 研究主要基于院内队列和生物信息学分析，虽然进行了体外实验验证，但缺乏大规模前瞻性临床队列的验证 | 识别和表征与代谢综合征相关的早发性左侧结直肠癌进展和治疗反应相关的关键生物标志物 | 早发性左侧结直肠癌患者，特别是与代谢综合征相关的亚型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序，定量实时PCR，Western blotting，免疫组织化学染色，分子对接 | 随机森林，支持向量机-递归特征消除 | 多组学数据，基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 院内队列的早发性结直肠癌患者（具体数量未在摘要中明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 627 | 2026-01-24 |
Analyzing the potential targets and mechanism of per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) on breast cancer by integrating network toxicology, single-cell sequencing, spatial transcriptomics, and molecular simulation
2025-Jun-04, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01616-y
PMID:40465018
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟，分析了PFAS对乳腺癌的潜在靶点和作用机制 | 首次将网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学和分子模拟相结合，系统揭示PFAS在乳腺癌发展中的分子机制，并识别了六个核心基因 | 研究主要基于计算和模拟方法，缺乏体内或体外实验验证，且PFAS的具体暴露剂量和长期效应未详细探讨 | 探究PFAS如何促进乳腺癌发展的分子机制，以评估环境污染物在癌症风险中的作用 | PFAS（特别是PFOA和PFOS）及其对乳腺癌的影响 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 网络毒理学、单细胞测序、空间转录组学、分子模拟 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络、分子模拟模型 | 基因表达数据、空间转录组数据、分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 628 | 2026-01-24 |
A Multi-omics approach to identify and validate shared genetic architecture in rheumatoid arthritis, multiple sclerosis, and type 1 diabetes: integrating GWAS, GEO, MSigDB, and scRNA-seq data
2025-Apr-21, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01598-x
PMID:40254686
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研究论文 | 本研究采用多组学方法，整合GWAS、GEO、MSigDB和scRNA-seq数据，识别并验证了类风湿关节炎、多发性硬化症和1型糖尿病之间的共享遗传结构，揭示了ROMO1作为关键共享遗传成分及其在单核细胞中的调控作用 | 首次通过整合多组学数据（包括GWAS、bulk RNA-seq、scRNA-seq和GEO数据）系统性地识别并验证了ROMO1作为RA、MS和T1D三种自身免疫疾病的共享遗传成分，并阐明了其通过ROS通路和单核细胞表位调控的潜在机制 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据库数据，缺乏实验验证；样本来源和数量可能存在异质性；ROS通路的具体调控机制仍需进一步探究 | 揭示类风湿关节炎、多发性硬化症和1型糖尿病三种自身免疫疾病之间的共享遗传结构及其分子机制 | 类风湿关节炎、多发性硬化症和1型糖尿病患者及健康对照的遗传和转录组数据 | 生物信息学 | 自身免疫疾病 | GWAS, bulk RNA-seq, scRNA-seq, 差异基因表达分析, LASSO回归, GSEA, ROC分析, 免疫浸润分析, 孟德尔随机化分析 | LASSO回归, GSEA, ROC分析, 孟德尔随机化 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 629 | 2026-01-24 |
Dynamic cellular composition and immune landscape revealed by single-cell transcriptome profiling in a brain arteriovenous malformation
2025-Mar-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01590-5
PMID:40146346
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了脑动静脉畸形中细胞组成和免疫景观的动态变化 | 首次在脑动静脉畸形中应用单细胞RNA测序技术，系统表征了细胞类型比例变化、基因表达差异和细胞通讯通路改变，发现了单核细胞-内皮细胞相互作用抑制和NK细胞相互作用促进的新机制 | 研究仅基于一个bAVM样本和三个健康对照样本，样本量较小，可能限制统计功效和结论的普适性 | 探究脑动静脉畸形的免疫机制和细胞功能变化 | 脑动静脉畸形组织和健康脑组织 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 1个bAVM样本和3个健康对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 630 | 2026-01-24 |
Single-cell RNA sequencing revealed changes in the tumor microenvironment induced by radiotherapy for cervical cancer and the molecular mechanism of mast cells in immunosuppression
2025-Mar-14, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01564-7
PMID:40082276
|
研究论文 | 本研究首次应用单细胞RNA测序技术，分析了宫颈癌患者放疗前后组织样本，揭示了放疗诱导的肿瘤微环境变化及肥大细胞在免疫抑制中的分子机制 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于宫颈癌放疗前后组织分析，揭示了放疗诱导的细胞异质性变化及肥大细胞在肿瘤免疫抑制和基质重塑中的关键作用 | 样本量较小（仅3名患者），可能限制结果的普遍性；未涉及长期随访或治疗效果的临床验证 | 研究宫颈癌放疗后肿瘤微环境的变化，以改善放疗治疗效果 | 宫颈癌患者放疗前后的组织样本 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3名宫颈癌患者的放疗前后组织样本，共52,506个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 631 | 2025-03-15 |
Predictive and personalized approaches for idiopathic pulmonary fibrosis: a Wnt-related gene set scoring framework integrating single-cell sequencing, spatial transcriptomics, and machine learning for diagnosis and prognosis
2025-Mar-13, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01571-8
PMID:40080215
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 632 | 2026-01-24 |
Integrative single-cell and bulk RNA-seq analysis identifies lactylation-related signature in osteosarcoma
2025-Mar-12, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01559-4
PMID:40072643
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA-seq数据，识别了骨肉瘤中与乳酸化相关的基因特征，旨在提高预后准确性和免疫治疗效果 | 首次结合单细胞测序AUCell评分和批量RNA-seq数据，系统识别骨肉瘤中乳酸化相关基因，并构建了具有强预测能力的九基因风险模型 | 基于公共数据集，缺乏独立验证队列；未进行实验验证基因功能 | 阐明乳酸化相关基因在骨肉瘤中的作用，改善预后评估和免疫治疗策略 | 骨肉瘤患者样本 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | LASSO, Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量，使用公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 633 | 2026-01-24 |
Transcriptomic profiling reveals mechanism, therapeutic potential, and prognostic value of cancer stemness characteristic in nasopharyngeal carcinoma
2025-Mar-07, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01561-w
PMID:40053129
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习分析单细胞RNA-seq及批量转录组数据，结合基础实验，探索鼻咽癌中的干细胞特性，揭示了其与复发、转移和耐药性的关联 | 首次在鼻咽癌中识别并验证了癌症干细胞相关特征（STEM-signature），并发现四种干细胞相关miRNA（miR-300、miR-361-5p、miR-1246、miR-1290）能增强鼻咽癌细胞的干细胞特性，为治疗提供了新靶点 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证，且样本来源和数量可能限制结论的普适性 | 探究鼻咽癌中癌症干细胞特性的机制、治疗潜力和预后价值 | 鼻咽癌细胞、单细胞RNA-seq数据、批量转录组数据、免疫细胞（如LAYN+CD8+ T细胞、CTLA4+CD4+ T细胞） | 生物信息学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA-seq、批量转录组分析、机器学习、LASSO Cox回归模型、NicheNet分析 | LASSO Cox回归模型 | 转录组数据（单细胞和批量） | 未明确指定样本数量，但涉及单细胞RNA-seq和批量转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 634 | 2026-01-24 |
The XCL1-XCR1 axis supports intestinal tissue residency and antitumor immunity
2025-Mar-03, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20240776
PMID:39841133
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研究论文 | 本研究揭示了XCL1-XCR1轴在调控肠道组织驻留记忆T细胞（TRM）空间分化和抗肿瘤免疫中的关键作用 | 首次发现CD8+ T细胞来源的XCL1对TRM形成至关重要，并证明该趋化因子轴通过非细胞自主方式引导肠道CD8+ TRM的空间分化和肿瘤控制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据验证相对有限；肿瘤微环境中其他细胞类型的相互作用机制尚未完全阐明 | 探究组织驻留记忆T细胞分化与功能的细胞互作机制及其在抗肿瘤免疫中的作用 | 肠道CD8+ T细胞、常规树突状细胞1型（cDC1）、肿瘤浸润淋巴细胞（TIL） | 免疫学 | 肿瘤 | 靶向空间转录组学、小鼠遗传模型 | NA | 空间转录组数据、基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 635 | 2026-01-24 |
Smoothie: Efficient Inference of Spatial Co-expression Networks from Denoised Spatial Transcriptomics Data
2025-Mar-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.640406
PMID:40060619
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Smoothie的方法，用于从去噪后的空间转录组数据中高效推断空间共表达网络 | Smoothie通过高斯平滑技术去噪空间转录组数据，并构建和整合全基因组共表达网络，利用隐式和显式并行化实现可扩展性，能处理超过1亿个空间解析点的大数据集 | NA | 从高分辨率空间转录组数据中提取深层生物学见解，包括基因模块检测、功能注释、基因表达与基因组结构的关联以及多样本比较 | 空间转录组数据中的基因表达模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 高斯平滑 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 636 | 2026-01-24 |
Immunomodulatory effects of traditional chinese medicine on cancer: insights from network pharmacology and single-cell RNA sequencing data on the treatment of lung adenocarcinoma with shenling baizhu powder
2025-Feb-28, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01550-z
PMID:40019596
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研究论文 | 本研究结合网络药理学和单细胞RNA测序数据，探讨了参苓白术散治疗肺腺癌的免疫调节机制 | 首次整合网络药理学与单细胞RNA测序技术，系统揭示了传统中药复方通过调节巨噬细胞相关基因（ALOX5、IL2RA、MMP9、PPARG）影响肿瘤免疫微环境的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和分子对接模拟，缺乏体内外实验验证；临床样本量未明确说明 | 探究参苓白术散治疗肺腺癌的免疫调节作用机制 | 肺腺癌患者样本（正常组与LUAD组） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，网络药理学，分子对接 | 机器学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 637 | 2026-01-24 |
Single-cell profiling and clinical characteristics analysis of lung squamous carcinoma
2025-Feb-27, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01556-7
PMID:40014154
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了肺鳞状细胞癌的肿瘤微环境和临床特征，构建了预后风险评分模型 | 首次结合TCGA和GEO数据库对504个LUSC样本进行单细胞RNA测序，并利用计算算法分析免疫细胞浸润和免疫检查点基因特征，识别出具有不同免疫和临床特征的两个基因簇 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，缺乏前瞻性验证，且样本量虽大但可能受数据来源异质性影响 | 阐明肺鳞状细胞癌的肿瘤微环境景观和临床特征，并开发预后预测模型 | 肺鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，q-PCR，免疫荧光 | COX比例风险模型，加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据，临床数据 | 504个肺鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 638 | 2026-01-24 |
Heterogeneity analysis and prognostic model construction of HPV negative oral squamous cell carcinoma T cells using ScRNA-seq and bulk-RNA analysis
2025-Jan-23, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01525-6
PMID:39849233
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-seq数据，分析了HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞的异质性，并构建了一个基于T细胞相关基因的预后风险模型 | 首次在HPV阴性口腔鳞状细胞癌中结合单细胞和bulk转录组数据系统分析T细胞异质性，并构建了基于T细胞相关基因的预后模型，为预测患者生存和免疫浸润水平提供了新见解 | 样本量相对有限（14个肿瘤样本和6个正常样本），模型需要在更大的独立队列中进行验证 | 评估HPV阴性口腔鳞状细胞癌中T细胞标记基因的表达谱，构建预后风险模型，并研究风险评分与免疫治疗反应的相关性 | HPV阴性口腔鳞状细胞癌患者 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, qRT-PCR | 预后风险模型 | 单细胞转录组数据, bulk转录组数据 | 14个HPV阴性OSCC样本和6个正常样本，共28,000个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 639 | 2026-01-24 |
Unraveling the potential mechanism and prognostic value of pentose phosphate pathway in hepatocellular carcinoma: a comprehensive analysis integrating bulk transcriptomics and single-cell sequencing data
2025-Jan-11, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-024-01521-w
PMID:39798003
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研究论文 | 本研究整合了批量转录组学和单细胞测序数据，构建了一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型，用于肝细胞癌患者的风险评估和预后预测 | 首次整合批量转录组学和单细胞测序数据，构建了一个与戊糖磷酸途径相关的十基因特征模型，并验证了其在预测肝细胞癌预后和免疫治疗反应方面的价值 | 研究主要基于回顾性数据，需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测能力 | 构建一个基于戊糖磷酸途径相关基因的模型，用于肝细胞癌患者的风险评估、预后预测和个体化治疗指导 | 肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 微阵列, 单细胞RNA测序 | 惩罚性Cox回归模型, LASSO回归 | 转录组数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA, GEO和ICGC数据库的多个队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 640 | 2026-01-24 |
Pig jejunal single-cell RNA landscapes revealing breed-specific immunology differentiation at various domestication stages
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1530214
PMID:40151618
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了野猪、金华猪和杜洛克猪空肠组织的免疫细胞图谱，揭示了不同驯化阶段猪品种间免疫功能的差异和进化 | 首次在单细胞分辨率下构建了猪空肠组织的免疫细胞图谱，开发了免疫细胞评估系统，并识别了与驯化相关的品种特异性基因模式 | 研究仅关注空肠组织，可能未全面反映整个肠道的免疫变化；样本量相对有限，未来可扩展至更多品种和部位 | 探究猪在驯化过程中肠道免疫功能的进化变化和细胞异质性 | 野猪、中国地方品种（金华猪）和集约化品种（杜洛克猪）的空肠组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 26,246个细胞，来自三个猪品种的空肠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |