单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 37403 篇文献，本页显示第 6301 - 6320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6301 | 2025-11-26 |
Transcriptional and epigenetic repression of hematopoietic stem cells underlies bone marrow failure after spinal cord injury
2025-Oct-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.05.680535
PMID:41279599
|
研究论文 | 本研究揭示了脊髓损伤通过转录和表观遗传抑制导致造血干细胞功能受损和骨髓衰竭的机制 | 首次发现脊髓损伤通过抑制造血干细胞的转录程序和染色质可塑性导致骨髓衰竭的系统性后果 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究脊髓损伤对造血干细胞功能和长期造血的影响机制 | 造血干细胞(HSCs) | 表观遗传学 | 脊髓损伤 | 单细胞转录组学,染色质可及性分析,体内移植实验 | NA | 基因表达数据,表观遗传数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq,ATAC-seq | NA | NA |
| 6302 | 2025-11-26 |
Investigating the dynamic signaling pathways involved in the specialization and differentiation of epiblast cells in early human embryos
2025-Oct, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2025.05.014
PMID:40581241
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类胚胎早期发育过程中外胚层细胞特化的动态信号通路 | 首次系统揭示BMP、WNT、FGF、LIF和TGFβ等多条信号通路在人类胚胎外胚层发育中的动态作用模式 | 研究结果基于RNA表达模式推断，需要蛋白质水平和功能验证 | 探索人类胚胎外胚层细胞特化和分化过程中的细胞间通讯机制 | 人类早期胚胎发育过程中的外胚层细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 涵盖植入前、植入后、原肠胚形成前和早期原肠胚形成阶段的人类胚胎 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6303 | 2025-11-26 |
Treg activation during allograft tolerance induction requires mitochondrion-induced TGF-β1 in type 1 conventional dendritic cells
2025-Sep-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178960
PMID:40644411
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研究论文 | 本研究揭示了1型常规树突状细胞通过线粒体代谢诱导TGF-β1表达，进而促进抗原特异性调节性T细胞生成和心脏移植物耐受的机制 | 首次发现cDC1细胞在移植物耐受诱导中的关键作用，并阐明线粒体代谢-TGF-β1信号轴调控抗原特异性Treg生成的新机制 | 研究基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；cDC1特异性基因敲除模型可能存在脱靶效应 | 探究1型常规树突状细胞在实体器官移植物耐受诱导中的作用机制 | 小鼠心脏移植模型、1型常规树突状细胞、CD4+CD25+FoxP3+调节性T细胞 | 免疫学 | 器官移植排斥 | 单细胞RNA测序、代谢分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6304 | 2025-11-26 |
Integrated multi-omics analysis identifies lipid metabolism biomarkers in ONFH and reveals therapeutic potential of retinoic acid
2025-Aug-21, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13703-y
PMID:40841396
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研究论文 | 通过多组学分析识别股骨头坏死中脂质代谢生物标志物并揭示视黄酸的治疗潜力 | 首次整合多组学分析与机器学习技术识别ONFH脂质代谢生物标志物，并通过单细胞测序验证生物标志物与免疫细胞的关联 | 未明确说明样本量大小及数据来源的具体细节 | 识别股骨头坏死的潜在生物标志物并为疾病治疗提供参考 | 股骨头坏死相关基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 股骨头坏死 | 多组学分析、机器学习、分子对接、单细胞测序 | 列线图模型、ROC曲线分析 | 基因组数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6305 | 2025-11-26 |
Piscis: a novel loss estimator of the F1 score enables accurate spot detection in fluorescence microscopy images via deep learning
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.31.578123
PMID:38352551
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研究论文 | 提出了一种名为Piscis的深度学习算法，通过新颖的SmoothF1损失函数实现荧光显微镜图像中RNA转录本斑点的自动检测 | 开发了SmoothF1损失函数，可近似F1分数并直接惩罚假阳性和假阴性，同时保持可微性以用于深度学习训练 | NA | 开发无需手动参数调优的自动斑点检测算法，用于空间转录组学图像分析 | 荧光显微镜图像中的RNA转录本斑点 | 计算机视觉 | NA | RNA荧光原位杂交 | 深度学习 | 图像 | 358张手动标注的实验RNA FISH图像和240张合成图像 | NA | 空间转录组学, 单分子RNA荧光原位杂交 | NA | NA |
| 6306 | 2025-11-26 |
Correction: Unveiling the NEFH+ malignant cell subtype: insights from single-cell RNA sequencing in prostate cancer progression and tumor microenvironment interactions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1718125
PMID:41280907
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correction | 对前列腺癌研究中关于NEFH+恶性细胞亚型的文章进行更正 | NA | NA | NA | NA | NA | prostate cancer | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6307 | 2025-11-26 |
Multimodal cortical neuronal cell type classification
2024-05, Pflugers Archiv : European journal of physiology
DOI:10.1007/s00424-024-02923-2
PMID:38376567
|
综述 | 本文综述了大脑皮层神经元细胞类型分类方法的历史演变和当前基于单细胞转录组学的分类进展 | 整合了形态学、电生理和转录组学多模态特征，提出了皮层神经元的新型分类框架 | 承认转录组学定义的细胞类型是否对应真实功能类型仍需未来验证 | 建立可靠的大脑皮层神经元细胞类型分类系统 | 大脑皮层兴奋性和抑制性神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6308 | 2025-11-26 |
Systematic benchmarking of imaging spatial transcriptomics platforms in FFPE tissues
2023-Dec-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.07.570603
PMID:38106230
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研究论文 | 对三种商业化成像空间转录组平台在FFPE组织中的性能进行系统性基准测试 | 首次在包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片上对三种商业iST平台进行全面性能比较 | 研究基于组织芯片样本，可能无法完全代表完整组织切片的情况 | 评估成像空间转录组平台在FFPE组织中的技术和生物学性能 | 包含23种肿瘤和正常组织类型的组织芯片连续切片 | 空间转录组学 | 多种肿瘤类型 | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 包含23种组织类型的组织芯片 | 10x Genomics | 成像空间转录组学 | 10x Xenium | 三种商业化成像空间转录组平台（包括10x Xenium） |
| 6309 | 2025-11-25 |
An integrated approach of experiment validation and single-cell RNA sequencing reveal dual-pathway inhibition of NLRP3/ferroptosis by flavonoids of Sanyeqing fibrous root in acute lung injury
2026-Feb-10, Journal of ethnopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jep.2025.120743
PMID:41115482
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研究论文 | 本研究通过实验验证和单细胞RNA测序揭示了三叶青纤维根黄酮类化合物通过双重通路抑制NLRP3/铁死亡缓解急性肺损伤的作用机制 | 首次发现三叶青纤维根黄酮类化合物能同时抑制NLRP3炎症小体激活和铁死亡通路，并通过单细胞RNA测序鉴定出双通路激活的巨噬细胞亚群 | 研究主要基于LPS诱导的急性肺损伤模型，临床转化价值需进一步验证 | 探究三叶青纤维根黄酮类化合物对急性肺损伤的保护作用及分子机制 | C57BL/6小鼠、BEAS-2B人支气管上皮细胞、人类支气管肺泡灌洗液样本 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序，UPLC-Q-TOF-MS/MS，HPLC | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，病理学数据 | 动物模型和细胞系实验，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6310 | 2025-11-25 |
Ciao3 knockout causes acute lung injury through immune activation using single cell sequencing
2025-Dec-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.124063
PMID:41187899
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示Ciao3基因敲除通过免疫激活导致急性肺损伤的机制 | 首次在Ciao3条件性敲除小鼠模型中结合单细胞RNA测序技术系统阐明免疫细胞在急性肺损伤中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本数量有限 | 阐明Ciao3基因缺失导致急性肺损伤的分子机制 | Ciao3基因突变患者和内皮细胞特异性Ciao3敲除小鼠 | 单细胞生物学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 免疫组化 | NA | 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 1名纯合子患者和Ciao3条件性敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6311 | 2025-11-25 |
Malignant cell-mediated Treg immune suppression via ICOSLG-ICOS axis in tumor microenvironment relates to nasopharyngeal carcinoma prognosis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115743
PMID:41151481
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示鼻咽癌肿瘤微环境中恶性细胞通过ICOSLG-ICOS轴激活Treg细胞介导免疫抑制的机制 | 首次在鼻咽癌中发现Mal (TUBB2B+)细胞通过ICOSLG-ICOS通路激活Treg (TNFRSF4+)细胞，进而抑制多种免疫细胞功能的免疫逃逸新机制 | 研究样本主要来自亚洲人群，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 阐明鼻咽癌肿瘤微环境中细胞间相互作用与患者预后的关系 | 鼻咽癌患者肿瘤组织和肿瘤微环境中的各类细胞 | 单细胞生物学 | 鼻咽癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 多重免疫组化 | scissor, scAB, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据, 空间转录组数据, 免疫组化图像 | 82个样本共488,771个细胞（其中50个样本269,521个单细胞），183例鼻咽癌患者批量RNA数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6312 | 2025-11-25 |
Melatonin ameliorates bronchopulmonary dysplasia by modulating the NF-κB pathway via the gut microbiota-short-chain fatty acid axis
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115730
PMID:41151484
|
研究论文 | 本研究揭示了褪黑素通过调节肠道微生物群-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的机制 | 首次发现褪黑素通过增加肠道Ligilactobacillus murinus丰度和短链脂肪酸产生，抑制NF-κB通路和细胞焦亡来改善BPD | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证仍需进一步研究 | 阐明褪黑素通过肠道微生物-短链脂肪酸轴改善支气管肺发育不良的作用机制 | 博来霉素诱导的BPD小鼠模型、人支气管上皮细胞(BEAS-2B)、婴儿肺组织单细胞RNA测序数据 | 生物医学研究 | 支气管肺发育不良 | 宏基因组学、16S rRNA测序、非靶向代谢组学、RNA转录组学、单细胞RNA测序 | 动物模型、细胞模型 | 基因组数据、转录组数据、代谢组数据、单细胞测序数据 | BPD小鼠模型、BEAS-2B细胞系、公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学,转录组学 | NA | NA |
| 6313 | 2025-11-25 |
Pirfenidone regulates obesity-related renal injury through the SIRT3 signaling pathway
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115709
PMID:41151486
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研究论文 | 本研究探讨了吡非尼酮通过SIRT3信号通路调节肥胖相关肾损伤的作用机制 | 首次揭示吡非尼酮通过SIRT3依赖方式改善肥胖相关肾损伤的新机制 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床验证 | 探究吡非尼酮对肥胖相关肾损伤的治疗作用及其分子机制 | C57BL/6J雄性小鼠、人近端肾小管上皮细胞(HK-2)和人原代肾近端小管上皮细胞(PTECs) | 分子生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞测序分析、分子对接、免疫共沉淀 | 动物模型、细胞模型 | 分子生物学数据、细胞实验数据 | C57BL/6J雄性小鼠分组实验，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6314 | 2025-11-25 |
GPRC5A+ myCAFs promote ESCC progression via TGF-β-induced fibroblast activation and ANXA1-mediated M2 macrophage polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115663
PMID:41082840
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现GPRC5A+肌成纤维细胞通过TGF-β通路激活成纤维细胞和ANXA1介导的M2巨噬细胞极化促进食管鳞癌进展 | 首次鉴定GPRC5A作为肌成纤维细胞亚群特异性标志物，并揭示其通过双重机制驱动肿瘤进展的新机制 | 样本量相对有限（15例肿瘤和11例正常组织），需进一步验证 | 探究食管鳞癌中癌相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境调控中的作用机制 | 食管鳞癌组织和正常食管组织 | 单细胞生物学 | 食管鳞癌 | 单细胞RNA测序，转录组去卷积分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例ESCC肿瘤组织和11例正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6315 | 2025-11-25 |
Paeoniflorin attenuates hepatic ischemia-reperfusion injury by modulating Tmem176b+ macrophages polarization
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115657
PMID:41092769
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示芍药苷通过调节Tmem176b+巨噬细胞极化减轻肝脏缺血再灌注损伤的机制 | 首次发现芍药苷特异性靶向Tmem176b+巨噬细胞亚群，通过调控THBS1-CD47免疫抑制轴和SPP1-CD44促炎信号通路发挥保护作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；单细胞测序样本量相对有限 | 探究芍药苷在肝脏缺血再灌注损伤中对巨噬细胞极化的调节机制 | 肝脏缺血再灌注损伤小鼠模型中的巨噬细胞亚群 | 单细胞组学 | 肝脏疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 45,673个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6316 | 2025-11-25 |
Integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq reveals that macrophage ferroptosis inhibits MSC osteogenic differentiation in inflammatory microenvironments
2025-Dec-10, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115744
PMID:41166988
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序技术，揭示巨噬细胞铁死亡在炎症微环境中抑制间充质干细胞成骨分化的机制 | 首次揭示巨噬细胞铁死亡通过调控M1/M2极化影响MSC PANoptosis和成骨分化的新机制 | 研究主要聚焦于巨噬细胞铁死亡的效应，其他细胞类型的贡献尚未充分探讨 | 探究炎症微环境中巨噬细胞铁死亡对骨再生和MSC成骨分化的影响机制 | 巨噬细胞、间充质干细胞(MSC)、骨感染临床样本 | 单细胞生物学 | 骨感染 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包含体内、体外实验和临床样本的多层次验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6317 | 2025-11-25 |
Single-Cell Profiling of Lichen Planus Reveals Type I IFN Response Triggering the Interface Dermatitis Reaction
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.043
PMID:40499747
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了扁平苔藓中I型干扰素反应触发界面皮炎反应的免疫发病机制 | 首次在扁平苔藓中发现I型干扰素富集环境，并证实IFN-β通过敏化角质形成细胞增强CD8 T细胞介导的细胞死亡 | NA | 研究扁平苔瘆的免疫发病机制及驱动界面皮炎反应的潜在机制 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤 | 单细胞组学 | 皮肤炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 扁平苔瘆患者皮损组织与健康对照皮肤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6318 | 2025-11-25 |
Analyzing the toxicological effects of PET-MPs on male infertility: Insights from network toxicology, mendelian randomization, and transcriptomics
2025-Dec, Reproductive biology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.repbio.2025.101076
PMID:40929757
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研究论文 | 本研究通过整合网络毒理学、孟德尔随机化和转录组学方法，探讨了PET微塑料导致男性不育的分子机制 | 首次发现CLK4是PET微塑料导致男性不育的功能靶点，并揭示了其通过调节Th1细胞浸润和干扰精子发生过程的双重作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外模拟，缺乏体内实验验证 | 探究PET微塑料对男性生殖功能损害的分子机制 | 男性不育相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 男性不育 | 网络毒理学, 孟德尔随机化, 转录组学, 分子对接, 分子动力学模拟, bulk RNA-seq, scRNA-seq | SMR分析 | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6319 | 2025-11-25 |
Molecular insights into the role of tumor-specific endothelial cells in metastasis
2025-Dec, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2025.104964
PMID:41015325
|
综述 | 本文综述了肿瘤特异性内皮细胞在肿瘤转移和免疫逃逸中的关键作用及其治疗潜力 | 系统阐述了肿瘤特异性内皮细胞区别于正常内皮细胞的独特特征及其在肿瘤进展中的多重功能 | NA | 探讨肿瘤特异性内皮细胞在癌症转移和治疗中的作用机制 | 肿瘤特异性内皮细胞 | 肿瘤生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6320 | 2025-11-25 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomics-Based Research Reveals Association Between M2a Macrophages and Tumor Spread through Air Spaces in Lung Adenocarcinoma
2025-Dec, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.07.017
PMID:40946801
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学技术揭示M2a巨噬细胞通过CCL17/CCR4轴促进β-catenin信号通路，从而增强肺腺癌气腔播散的发生发展 | 创新性地结合单细胞RNA测序与数字空间分析空间转录组学技术，针对STAS的空间特性探索肿瘤相关巨噬细胞的作用机制 | NA | 探索肺腺癌中气腔播散的发生和定植机制，特别是肿瘤相关巨噬细胞在其中的作用 | 肺腺癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 数字空间分析空间转录组学 |