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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6261 | 2026-03-03 |
Revealing the function and mechanism of piRNA-related genes in bladder cancer through single-cell sequencing and methylation analyses and construction of prognostic features based on consensus clustering
2026-Mar, Current urology
IF:0.9Q4
DOI:10.1097/CU9.0000000000000306
PMID:41668898
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和甲基化分析揭示了piRNA相关基因在膀胱癌中的功能和机制,并基于共识聚类构建了预后特征 | 首次结合单细胞测序、甲基化分析和共识聚类技术,系统性地探索piRNA相关基因在膀胱癌中的功能、机制及预后价值,并构建了一个包含MAPK13、INHBA和LAMB2的三基因预后模型 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模的前瞻性临床队列验证,且对piRNA相关基因的具体调控网络和体内功能机制仍需进一步深入探索 | 探索PIWI-interacting RNA相关基因在膀胱癌发生发展中的功能、潜在机制及其预后价值 | 膀胱癌细胞和组织,以及相关的PIWI-interacting RNA相关基因 | 生物信息学与计算生物学 | 膀胱癌 | 单细胞测序,甲基化测序,差异甲基化位点测序,定量聚合酶链反应,共识聚类,机器学习 | 共识聚类,逻辑回归 | 基因表达数据,甲基化数据,单细胞测序数据 | 基于The Cancer Genome Atlas-Urothelial Bladder Carcinoma数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,甲基化测序 | NA | NA |
| 6262 | 2026-03-03 |
Single-cell transcriptome analysis reveals a cellular immune response in common carp (Cyprinus carpio) infected with Aeromonas hydrophila
2026-Mar, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150936
PMID:41692207
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,全面探究了鲤鱼在感染嗜水气单胞菌后,其关键免疫器官头肾中的细胞免疫应答机制,特别关注了巨噬细胞在细胞水平的异质性、分化及分子调控网络 | 首次在鲤鱼中应用单细胞RNA测序技术,系统揭示了感染嗜水气单胞菌后头肾中巨噬细胞的异质性、分化轨迹和分子调控网络,为理解鱼类细胞免疫应答提供了新的视角 | NA | 探究鲤鱼在感染嗜水气单胞菌后的细胞免疫应答机制 | 鲤鱼(Cyprinus carpio)的头肾组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6263 | 2026-03-03 |
Evolutionary convergence and divergence of hippocampal cytoarchitecture between rodents and primates revealed by single-cell spatial transcriptomics
2026-Mar, National science review
IF:16.3Q1
DOI:10.1093/nsr/nwaf595
PMID:41768547
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研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学分析,揭示了啮齿动物与灵长类海马体细胞结构的进化趋同与差异 | 首次利用单细胞空间转录组学技术,跨物种比较了猕猴、狨猴和小鼠海马体的转录组图谱,发现了灵长类特异性和层状特异性的谷氨酸能细胞类型,以及GABA能细胞的进化富集 | 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本物种数量较少,可能未涵盖所有相关进化分支 | 探究海马体细胞类型和空间分布的跨物种进化模式,为理解海马体功能演化提供分子和细胞基础 | 猕猴、狨猴和小鼠的海马体组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞空间转录组学分析, 单核RNA测序 | NA | 空间转录组数据, RNA-seq数据 | 多个物种(猕猴、狨猴、小鼠)的海马体样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞空间转录组学, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 6264 | 2026-03-03 |
Single-cell advances in the investigation of the pathogenesis and treatment of brain metastasis
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf108
PMID:41769415
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综述 | 本文综述了近年来应用单细胞RNA测序技术研究脑转移瘤的进展,重点关注肿瘤异质性、肿瘤微环境以及治疗反应 | 系统总结了单细胞RNA-seq技术在脑转移瘤研究中的应用,整合了多个研究对肿瘤细胞转录特征、免疫细胞变化及微环境组成的发现 | 作为综述文章,未提出新的实验数据或模型,主要依赖现有研究的整合与分析 | 总结单细胞技术如何增进对脑转移瘤发病机制的理解,并探讨其对未来治疗策略的启示 | 脑转移瘤及其微环境中的肿瘤细胞、免疫细胞、血管细胞和基质细胞 | 数字病理学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6265 | 2026-03-03 |
Pitfalls in analysis and interpretation of single-cell RNA-seq data in cancer
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf047
PMID:41769412
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综述 | 本文讨论了癌症研究中单细胞和单核RNA测序数据分析的常见陷阱及其克服方法 | 系统性地识别并总结了癌症sc/snRNA-seq分析中的常见错误,包括统计分析、染色体畸变推断、轨迹分析和基于特征的批量RNA-seq数据分析中的潜在问题 | 作为一篇综述,未提供新的实验数据或具体案例分析,主要基于现有文献和经验进行讨论 | 旨在帮助研究人员避免单细胞RNA测序数据分析中的常见错误,提高分析质量和结果解释的可靠性 | 癌症研究中的单细胞和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、单核RNA测序(snRNA-seq) | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 6266 | 2026-03-03 |
Redefining the immune microenvironment of gliomas in the era of single-cell genomics
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf087
PMID:41769417
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综述 | 本文回顾了单细胞基因组学时代下对胶质瘤肿瘤免疫微环境(TIME)的重新定义,并探讨了其对开发有效免疫疗法的影响 | 利用单细胞RNA测序等单细胞技术,系统性地重新定义了胶质瘤的免疫微环境,强调了非恶性细胞及其与癌细胞相互作用的重要性 | 本文为综述文章,未涉及原始实验数据,主要基于现有研究进行总结和展望 | 总结单细胞基因组学对胶质瘤肿瘤免疫微环境(TIME)的研究进展,并探索其对免疫疗法开发的启示 | 胶质瘤的肿瘤免疫微环境(TIME),包括恶性细胞和非恶性细胞(如免疫细胞) | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6267 | 2026-03-03 |
Current landscape of single-cell genomics in meningioma
2026-Mar, Neuro-oncology advances
IF:3.7Q2
DOI:10.1093/noajnl/vdaf133
PMID:41769414
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综述 | 本文综述了单细胞基因组学在脑膜瘤研究中的当前应用与未来机遇 | 整合了单细胞测序技术、空间分辨数据和功能基因组学方法,以单细胞分辨率全面研究脑膜瘤的转录组和表观基因组,揭示肿瘤内和肿瘤间的异质性 | NA | 探讨单细胞组学在脑膜瘤研究中的应用现状与未来发展方向 | 脑膜瘤 | 数字病理学 | 脑膜瘤 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6268 | 2026-03-03 |
Identification of GLDN+ odontogenic stem cells as crucial for human tooth development and regeneration
2026-Feb-28, International journal of oral science
IF:10.8Q1
DOI:10.1038/s41368-025-00419-y
PMID:41760598
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序识别了人牙乳头中的GLDN+牙源性干细胞,并证实其在牙齿发育和再生中的关键作用 | 首次在人牙乳头中鉴定出GLDN+牙源性干细胞这一关键亚群,并揭示了其通过BMP5信号通路维持表型和功能的机制 | 研究主要基于体外和异位再生模型,在体功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 揭示人牙乳头细胞异质性,鉴定参与牙齿发育和再生的关键干细胞亚群 | 人牙乳头细胞 | 单细胞组学 | 牙科疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6269 | 2026-03-03 |
Step-by-Step Protocol for In Situ Profiling of RNA Subcellular Localization Using TATA-seq
2026-Feb-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.5611
PMID:41769253
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TATA-seq的原位RNA亚细胞定位分析详细实验方案 | 开发了一种利用抗体靶向和T7启动子介导的线性扩增,对无膜细胞器内RNA进行原位、高灵敏度测序的新方法 | NA | 建立一种高效、直接的方法来检测和展示无膜细胞器内RNA的分布与多样性 | 无膜细胞器(如核斑、旁斑等)内的RNA | 空间转录组学 | NA | Target Transcript Amplification and Sequencing (TATA-seq) | NA | RNA测序数据 | 低输入样本(<10,000个细胞) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6270 | 2026-03-03 |
A decline in follicle cell function is a major driver of Drosophila ovarian aging
2026-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.02.05.704044
PMID:41676725
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和遗传操作,揭示了果蝇卵巢衰老中滤泡细胞功能下降是主要驱动因素 | 发现滤泡细胞功能下降是卵巢衰老的关键驱动因素,并通过过表达Atg8a基因改善衰老表型 | 研究基于果蝇模型,结果在哺乳动物中的适用性需进一步验证 | 探究果蝇卵巢衰老的细胞机制 | 果蝇卵巢中的滤泡细胞和其他细胞类型 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 未明确样本数量,但涉及年轻和年老果蝇卵巢细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6271 | 2026-03-03 |
Activated Human Pancreatic Stellate Cells SignatureCommunication in Type 1 Diabetes
2026-Feb-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-8704281/v1
PMID:41674826
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞在细胞间通讯中的关键作用 | 首次利用单细胞转录组学数据探索了1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞的细胞间通讯特征,并识别了相关的信号通路变化 | 研究基于公开数据库的样本,样本量有限,且未进行实验验证 | 探究1型糖尿病中激活的胰腺星状细胞在细胞间通讯中的作用及其与疾病病理的关系 | 人类胰腺胰岛的单细胞RNA测序数据,包括1型糖尿病患者和对照组的样本 | 单细胞转录组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | CellChat R包 | 单细胞转录组数据 | 20名供体(包括1型糖尿病患者和对照组) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6272 | 2026-03-03 |
Performance of Naiive Spectral Geometric Models in Histopathology AI
2026-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.30.702908
PMID:41676645
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研究论文 | 本文系统评估了纯谱模型在数字病理学任务中的性能,并与CNN基线进行比较 | 首次对纯谱模型在数字病理学任务中进行系统评估,发现其作为CNN的补充工具在可解释性和处理方面具有价值 | 谱模型在空间转录组学任务中泛化能力差,性能未超越CNN基线 | 评估纯谱模型在数字病理学AI任务中的性能 | 数字病理学图像数据,包括乳腺癌组织切片、胶质母细胞瘤区域分类、空间转录组学和去噪任务 | 数字病理学 | 乳腺癌, 胶质母细胞瘤 | 谱几何特征, SNO嵌入 | 谱模型, CNN, 融合模型 | 图像, 空间转录组学数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium 10x |
| 6273 | 2026-03-03 |
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Genes for Essential Tremor and Reveals a Gap Between Computational Prediction and Experimental Validation
2026-Feb, Movement disorders : official journal of the Movement Disorder Society
IF:7.4Q1
DOI:10.1002/mds.70101
PMID:41178806
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研究论文 | 本研究通过多阶段计算框架整合多组学数据,优先筛选出12个与原发性震颤相关的高置信度候选基因,并揭示了计算预测与实验验证之间的差距 | 开发了一个整合跨组织转录组关联研究、组织特异性TWAS、基因关联分析、因果推断、共表达网络分析和药物基因组学的多阶段计算框架,并首次提出了原发性震颤的皮层假说 | 在死后小脑组织验证中未发现候选基因的显著差异表达,计算预测与现有患者组织验证结果存在不一致 | 阐明原发性震颤的遗传结构,将GWAS位点转化为效应基因以揭示疾病机制并开发靶向疗法 | 原发性震颤相关基因 | 生物信息学 | 原发性震颤 | GWAS, TWAS, 空间转录组学, 共表达网络分析, 药物基因组学 | UTMOST, FUSION, MAGMA, SMR, GeneMANIA | 基因组关联数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 两个独立的死后脑组织数据集(来自ET患者和对照) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6274 | 2026-03-03 |
Exploring the mechanism and therapeutic potential of BUB1 in regulating esophageal cancer progression based on 5-FU target prediction
2026-Jan-31, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04486-3
PMID:41618008
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探索BUB1作为5-FU潜在靶点在食管癌进展中的机制及治疗潜力 | 结合生物信息学分析和实验验证,首次系统性地将BUB1鉴定为5-FU在食管癌中的潜在治疗靶点,并揭示其通过调控细胞周期影响肿瘤侵袭迁移能力 | 研究主要基于细胞系实验,缺乏体内动物模型验证;临床相关性分析中BUB1表达与TNM分期无显著关联,其临床转化价值需进一步评估 | 从现有化疗方案中识别新的药物靶点,为食管癌治疗开发新策略 | 食管癌组织、KYSE150/TE1人食管癌细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 多组学分析、单细胞测序、Western blot、细胞划痕/Transwell实验、克隆形成实验 | WGCNA共表达网络、PPI网络、MCODE分析 | 基因表达数据、单细胞测序数据、蛋白质印迹数据 | GEO数据集GSE17351、GSE196756单细胞测序数据、TCGA食管癌数据、KYSE150/TE1细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6275 | 2026-03-03 |
Age-dependent immune responses and resident cell dynamics in young mice following pneumonia
2026-Jan-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114219
PMID:41488789
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序,揭示了幼鼠肺炎后年龄依赖的免疫反应和肺驻留细胞动态,强调了早期免疫发育对疾病易感性的影响 | 首次在幼鼠模型中,结合单细胞和批量RNA测序技术,全面绘制了新生儿与幼年鼠肺驻留细胞的转录组图谱,并揭示了年龄特异性免疫动态与健康结局的关联 | 研究仅基于小鼠模型,未涉及人类样本,且未探讨长期免疫后果或具体治疗干预 | 探究年龄特异性免疫动态与未成熟肺健康结局差异的关联 | 新生和幼年小鼠的肺组织 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但涉及新生和幼年小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6276 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals molecular heterogeneity and subtype-specific therapeutic targets in small cell lung cancer
2026-Jan-16, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01243-7
PMID:41545500
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术揭示了小细胞肺癌的分子异质性,并识别了亚型特异性治疗靶点 | 引入了Edgeindex指标定量评估肿瘤空间结构,并开发了专门的人工神经网络模型进行精确肿瘤注释 | NA | 解析小细胞肺癌的异质性并探索其分子机制 | 小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 人工神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6277 | 2026-03-03 |
Spatial transcriptomics reveals the mechanistic role of lactate metabolism in the pancreatic ductal adenocarcinoma microenvironment
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743187
PMID:41766855
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了乳酸代谢在胰腺导管腺癌微环境中的机制作用 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析,系统探究了乳酸代谢在PDAC肿瘤微环境中的具体角色,并构建了基于机器学习的新型预后模型 | 样本量相对有限(8个PDAC样本),且研究主要基于转录组数据,缺乏蛋白质或代谢组层面的验证 | 探究乳酸代谢在胰腺导管腺癌(PDAC)微环境中的作用机制及其临床意义 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者肿瘤组织中的恶性细胞及其微环境 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 高通量转录组测序、单细胞RNA测序、空间转录组学 | 集成机器学习(StepCox + Enet) | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 92名PDAC患者(ICGC队列),另有多组验证队列(GSE28735: 45例,GSE62452: 69例,GSE183795: 139例),单细胞分析涉及8个PDAC样本的50,795个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 6278 | 2026-03-03 |
Reprogramming the immunosuppressive breast cancer microenvironment: integrating cellular, metabolic, and stromal targets for rational immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1760782
PMID:41766877
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综述 | 本文综述了乳腺癌肿瘤免疫微环境(TIME)的细胞、分子和代谢复杂性,并探讨了将免疫抑制性“冷”肿瘤转化为免疫反应性“热”肿瘤的免疫治疗策略 | 整合了代谢调节、基质重编程和精准联合疗法等新方向,以克服原发性和获得性耐药,并强调了结合空间转录组学和液体活检等新兴生物标志物策略 | NA | 探讨乳腺癌肿瘤免疫微环境的免疫抑制机制,并评估当前和新兴的免疫治疗方法,旨在改善治疗反应和克服耐药性 | 乳腺癌肿瘤免疫微环境(TIME) | NA | 乳腺癌 | 空间转录组学,液体活检 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6279 | 2026-03-03 |
Integrative omics and experimental validation reveal METTL17 and SLC27A1 as biomarkers and potential therapeutic targets in chronic kidney disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1724740
PMID:41766913
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研究论文 | 本研究通过整合组学分析和实验验证,揭示了METTL17和SLC27A1作为慢性肾脏病(CKD)的生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次通过整合bulk RNA测序、单细胞转录组学和临床验证,系统性地鉴定了连接线粒体调控和巨噬细胞极化的关键基因METTL17和SLC27A1,并阐明了它们在CKD进展中的细胞特异性表达和细胞间通讯机制 | 研究主要基于转录组数据,蛋白质功能和调控机制需要进一步验证;动物模型为UUO模型,可能无法完全模拟人类CKD的所有病理特征 | 阐明慢性肾脏病(CKD)的分子机制,寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 慢性肾脏病(CKD)患者外周血样本、单侧输尿管梗阻(UUO)小鼠模型、近端肾小管细胞(PTCs)和平滑肌细胞(SMCs) | 生物信息学 | 慢性肾脏病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, qPCR, 免疫组织化学, Western blotting | 机器学习 | 转录组数据, 临床数据, 实验数据 | CKD患者外周血样本和UUO小鼠模型(具体样本数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6280 | 2026-03-03 |
Benign, persistent, and invasive: mechanistic and translational approaches to middle‑ear cholesteatoma
2026, Exploration of targeted anti-tumor therapy
DOI:10.37349/etat.2026.1002359
PMID:41767763
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综述 | 本文综述了中耳胆脂瘤的发病机制,并探讨了基于微环境的精准治疗策略 | 整合了单细胞转录组学、空间蛋白质组学和表观遗传学等最新机制研究,提出胆脂瘤的侵袭性源于微环境驱动而非遗传突变,为微环境导向的精准治疗提供了新视角 | 文章为综述性论文,未报告原始实验数据或具体临床研究结果,所提治疗策略大多处于临床前或早期实验阶段 | 阐明中耳胆脂瘤的发病机制并探索其转化治疗策略 | 中耳胆脂瘤(一种组织学良性但具有局部破坏性的角化鳞状上皮病变) | 数字病理学 | 耳部疾病(具体为中耳胆脂瘤) | 单细胞转录组学、空间蛋白质组学、表观遗传学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |