单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 37421 篇文献，本页显示第 6241 - 6260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6241 | 2025-11-28 |
SLC16A3 is a Prognostic Marker and Affects Immune Regulation in Bladder Cancer
2025, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
|
研究论文 | 本研究系统分析了SLC16A3在膀胱癌中的表达及其与预后的关系，探讨了其通过调节代谢和m6A甲基化影响免疫浸润的机制 | 首次系统分析SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节功能，建立了可靠的预后模型 | 研究主要基于公共数据库和回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探讨SLC16A3在膀胱癌中的预后价值和免疫调节机制 | 膀胱癌患者和膀胱癌细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞测序，逆转录定量PCR，免疫组织化学，生物信息学分析 | 预后模型 | 基因表达数据，临床数据，单细胞测序数据 | 412例膀胱癌患者和3,115个膀胱癌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6242 | 2025-11-28 |
Single-cell transcriptomics profiling reveals cellular origins and molecular drivers underlying melanoma brain metastasis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336502
PMID:41284647
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子驱动机制 | 首次识别出与脑转移相关的肿瘤细胞亚群MBMATCs，并开发了能够预测脑转移风险的MBM-Index生物标志物 | 样本量相对有限（26个黑色素瘤样本），需要在更大队列中进一步验证 | 探索黑色素瘤脑转移的细胞起源和分子机制 | 黑色素瘤患者肿瘤样本 | 单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 26个黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 6243 | 2025-11-28 |
Integrative Bulk and Single-Cell Transcriptome Analyses Reveal Mitochondrial Metabolism-Related Biomarkers in IgA Nephropathy with Experimental Validation
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S565202
PMID:41287774
|
研究论文 | 通过整合批量转录组和单细胞RNA测序分析，鉴定IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物CYP27B1和PCK1 | 首次整合批量转录组和单细胞RNA测序分析揭示IgA肾病中线粒体代谢相关生物标志物，并确定近端肾小管细胞为关键细胞类型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证机制 | 确定线粒体代谢相关生物标志物在IgA肾病中的作用 | IgA肾病患者的转录组数据 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习算法, 逆转录定量PCR | 机器学习算法 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6244 | 2025-11-28 |
Elevated ITGAV Expression in Seropositive Rheumatoid Arthritis: Diagnostic Potential and Immunopathological Insights
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S540469
PMID:41287769
|
研究论文 | 本研究探讨整合素αV（ITGAV）在血清阳性类风湿关节炎中的表达及其作为诊断生物标志物的潜力 | 首次系统评估ITGAV在类风湿关节炎中的诊断价值，并通过单细胞转录组分析揭示其在炎症免疫细胞亚群中的特异性表达 | 需要未来纵向和功能研究验证其在个性化疾病管理中的作用 | 研究ITGAV作为类风湿关节炎潜在诊断生物标志物的价值 | 类风湿关节炎患者、骨关节炎患者和健康对照者的外周血样本 | 生物医学研究 | 类风湿关节炎 | ELISA, 单细胞RNA测序, 转录组分析, ROC曲线分析 | NA | 血液样本, 转录组数据, 临床参数 | 类风湿关节炎患者、骨关节炎患者和健康对照者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6245 | 2025-11-27 |
CAP-CD56+CD271+ BMSCs exos-loaded PVA/SA sustained-release hydrogel attenuates chondrocyte senescence and ameliorates lumbar facet joint osteoarthritis
2026-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.10.027
PMID:41282412
|
研究论文 | 本研究开发了一种新型CAP-CD56+CD271+ BMSCs外泌体-PVA/SA水凝胶缓释系统，用于治疗腰椎小关节骨关节炎 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定CD56+CD271+ BMSCs亚群，并开发了软骨细胞特异性抗原肽修饰的外泌体联合水凝胶缓释系统 | NA | 开发针对腰椎小关节骨关节炎的靶向治疗方法并阐明其分子机制 | 骨髓间充质干细胞亚群、外泌体、水凝胶材料和软骨细胞 | 组织工程与再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 分子实验, 体外和体内实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6246 | 2025-11-27 |
Mechanically adaptive Mg-Ti composites guided by single-cell insights accelerate load-bearing bone regeneration via dual modulation of osteogenesis and osteoclastogenesis
2026-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.10.038
PMID:41282413
|
研究论文 | 本研究开发了一种机械适应性Mg-Ti复合材料，通过单细胞RNA测序指导，实现成骨和破骨细胞生成的双重调节，加速承重骨再生 | 首次结合单细胞RNA测序揭示Mg选择性促进MSCs成骨分化并抑制破骨前体细胞成熟的分子机制，设计出机械性能随时间自适应优化的复合材料 | 研究仅报告了8周内的实验结果，长期效果和临床转化潜力需要进一步验证 | 开发能够同时满足机械稳定性和生物整合性的承重骨修复材料 | 镁钛复合材料在骨再生过程中的生物学效应和机械性能 | 组织工程与再生医学 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序，3D打印技术 | NA | 基因表达数据，机械性能数据，组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6247 | 2025-11-27 |
HyperDiffuseNet: A Deep Hyperbolic Manifold Learning Method for Dimensionality Reduction in Spatial Transcriptomics
2025-Dec, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251377097
PMID:40982255
|
研究论文 | 提出一种基于双曲流形学习的深度几何学习框架HyperDiffuseNet，用于空间转录组数据的降维表示 | 首次将双曲潜在空间与变分自编码器结合用于空间转录组数据，通过图卷积网络学习多尺度空间依赖关系并整合扩散矩阵到双曲嵌入中 | 仅在多个ST数据集上进行了实证评估，未涉及更广泛的生物学验证或临床应用 | 解决空间转录组数据高维度和复杂空间层次结构分析挑战 | 空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 变分自编码器, 图卷积网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6248 | 2025-11-27 |
stPipe: a flexible and streamlined R/Bioconductor pipeline for preprocessing sequencing-based spatial transcriptomics data
2025-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf167
PMID:41278534
|
研究论文 | 介绍了一个用于预处理测序空间转录组数据的灵活简化R/Bioconductor流程stPipe | 开发了首个全面模块化的预处理流程，支持所有主流测序空间转录组平台，提供统一的数据处理标准 | 仅支持测序空间转录组数据，不包含基于成像的空间转录组技术 | 解决不同空间转录组平台数据预处理标准化和简化的问题 | 测序空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 空间转录组测序数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seq, Stereo-seq | 支持所有主流测序空间转录组平台 |
| 6249 | 2025-11-27 |
An engineered human hepatitis A virus capable of rapid proliferation in vitro and causing hepatitis in mice
2025-Dec, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101582
PMID:41281447
|
研究论文 | 通过理性诱变开发了一种能在体外快速增殖并能在小鼠体内引发甲型肝炎的工程化人类甲型肝炎病毒 | 开发了具有遗传可操作性的重组HAV-2m病毒，在体外复制效率高，并建立了能诱导急性甲型肝炎的小鼠模型，揭示了病毒2C蛋白中的新型毒力决定因子 | 研究使用Ifnar1基因敲除小鼠模型，可能不能完全模拟人类免疫系统对HAV的反应 | 开发遗传可操作的甲型肝炎病毒模型以促进发病机制研究和抗病毒策略评估 | 工程化人类甲型肝炎病毒(HAV-2m)和Ifnar1-/-小鼠 | 病毒学 | 甲型肝炎 | 单细胞RNA测序, 理性诱变, 反向遗传学 | 动物模型 | 基因序列数据, 病理学数据, 血清生化数据 | Ifnar1-/-小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6250 | 2025-11-27 |
Relevance of Clonal Hematopoiesis in Immune Cells for Degenerative Aortic Valve Stenosis
2025-Nov-26, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.044406
PMID:41294132
|
综述 | 本文综述了意义未明克隆性造血在退行性主动脉瓣狭窄中的临床相关性及其对心功能的影响 | 首次系统阐述CHIP与AVS的关联机制，包括炎症通路分析和实验模型验证 | 主要基于现有研究综述，缺乏原始数据验证 | 探讨CHIP在退行性主动脉瓣狭窄发病机制中的作用 | 退行性主动脉瓣狭窄患者和实验动物模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 荧光激活细胞分选, 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据, 实验数据 | 约三分之一严重AVS患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6251 | 2025-11-27 |
C-C Chemokine Receptor 4 Deficiency Protects Against Abdominal Aortic Aneurysm Formation
2025-Nov-26, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.125.043202
PMID:41294146
|
研究论文 | 本研究通过基因缺陷小鼠模型揭示CCR4缺失对腹主动脉瘤形成的保护作用及免疫调节机制 | 首次发现CCR4缺失通过调节Th1/T细胞平衡和IFN-γ产生抑制腹主动脉瘤发展 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究CCR4在腹主动脉瘤发病机制中的具体作用 | 高胆固醇血症CCR4缺陷小鼠（Ccr4-/-Apoe-/-） | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，组织学分析，生化检测 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据，组织形态数据 | 基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6252 | 2025-11-27 |
Elevated tumor-associated androgen receptor activity correlates with poor immune infiltration and immunotherapy response across cancer types
2025-Nov-26, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0409
PMID:41295980
|
研究论文 | 本研究通过泛癌分析揭示了雄激素受体活性与肿瘤免疫浸润及免疫治疗反应的负相关性 | 首次在泛癌水平系统揭示雄激素受体活性与免疫浸润的负相关性，并证明其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要前瞻性临床试验验证 | 探究雄激素受体活性在不同癌种和性别中对肿瘤免疫浸润及免疫治疗反应的影响 | 33种TCGA癌症类型、前列腺癌单细胞数据集、免疫治疗队列患者 | 生物信息学 | 多癌种 | RNA-seq、单细胞RNA-seq、通路分析、Cox回归、数字空间分析、免疫组织化学 | 网络推断方法、生存分析模型 | 转录组数据、单细胞数据、蛋白质组数据、临床数据 | 33种TCGA癌症类型的批量RNA-seq数据、前列腺癌单细胞meta-atlas、免疫治疗队列 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 6253 | 2025-11-27 |
Molecular pathology of intraductal papillary mucinous neoplasms of the pancreas: current understanding and perspectives on malignant progression
2025-Nov-26, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02328-7
PMID:41296011
|
综述 | 本文总结胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤的分子病理学研究进展，特别关注其恶性进展机制 | 整合新一代测序技术、单细胞测序和空间转录组学等最新技术揭示IPMN的分子特征 | 目前尚未建立有效的非手术治疗策略，分子发病机制仍不完全清楚 | 阐明胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤的分子病理学特征和恶性进展机制 | 胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤及其向胰腺导管腺癌的进展过程 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 新一代测序、单细胞测序、空间转录组学、质谱分析 | 基因工程小鼠模型 | 基因组数据、转录组数据、蛋白质组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞测序、空间转录组学、新一代测序 | NA | NA |
| 6254 | 2025-11-27 |
Rewiring the transcriptome: diagnostic and therapeutic implications of alternative splicing in solid cancers
2025-Nov-26, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-11302-8
PMID:41296088
|
综述 | 本文综述了实体瘤中可变剪接的分子机制、临床意义及治疗策略 | 系统整合了可变剪接在癌症诊断和治疗中的最新进展，强调剪接衍生新抗原和靶向治疗策略的创新性 | 存在剪接异质性、脱靶效应和蛋白质水平验证不完整等临床转化挑战 | 探讨可变剪接在实体瘤中的诊断和治疗意义 | 实体瘤（包括乳腺癌、前列腺癌、肺癌、结直肠癌和中枢神经系统肿瘤） | 生物医学 | 实体瘤 | 长读长测序、单细胞转录组学、蛋白质基因组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6255 | 2025-11-27 |
Development and validation of a cuproptosis-related gene signature for predicting prognosis and drug sensitivity in gastric cancer
2025-Nov-26, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04132-4
PMID:41296174
|
研究论文 | 开发并验证了一个基于铜死亡相关基因的胃癌预后预测模型 | 首次构建了基于铜死亡相关基因的胃癌预后模型，并评估了其对化疗和免疫治疗反应的预测价值 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 构建胃癌预后预测模型并评估其临床实用性 | 胃癌患者 | 生物信息学 | 胃癌 | 转录组测序，单细胞RNA测序，qRT-PCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的胃癌患者样本 | NA | RNA-seq，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6256 | 2025-11-27 |
Unraveling the carcinogenic mechanisms of benzo[a]pyrene in prostate cancer: a multi-omics approach
2025-Nov-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04842-0
PMID:41288678
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了苯并[a]芘在前列腺癌中的致癌机制 | 首次整合网络毒理学、单细胞转录组学、分子对接、孟德尔随机化和文献计量学等多种方法系统研究BaP在前列腺癌中的作用机制 | NA | 阐明苯并[a]芘在前列腺癌发生发展中的致病机制 | 前列腺癌相关基因和苯并[a]芘作用靶点 | 多组学分析 | 前列腺癌 | 网络毒理学,单细胞转录组学,差异基因表达分析,分子对接,孟德尔随机化,文献计量学 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6257 | 2025-11-27 |
Unraveling the ferroptosis landscape in intervertebral disc degeneration through integrated bioinformatics and single-cell sequencing
2025-Nov-25, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04826-0
PMID:41288682
|
研究论文 | 通过整合生物信息学和单细胞测序技术系统解析椎间盘退变中铁死亡的作用机制并探索白藜芦醇的治疗潜力 | 首次在单细胞水平系统揭示椎间盘退变中铁死亡相关基因网络的细胞异质性表达模式及细胞间相互作用 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 阐明铁死亡在椎间盘退变发病机制中的作用并探索潜在药物治疗靶点 | 椎间盘退变患者样本及体外培养的髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 分子对接, CCK-8检测, RT-qPCR | CytoTRACE轨迹推断 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6258 | 2025-11-27 |
Using single cell sequencing to investigate tumor microenvironment differences in left and right colon cancer and prognosis-related core genes
2025-Nov-25, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03375-5
PMID:41288794
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术研究左右结肠癌肿瘤微环境差异并构建预后相关风险模型 | 首次在单细胞水平系统比较左右结肠癌的肿瘤微环境差异，并识别出7个预后相关核心基因 | 数据来源于公共数据库，缺乏独立验证队列 | 探究左右结肠癌肿瘤微环境差异并建立预后预测模型 | 结肠癌患者单细胞RNA测序数据和TCGA数据库临床数据 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, 免疫组化 | Cox回归模型, 列线图模型 | 单细胞RNA测序数据, 临床数据, 免疫组化图像 | GEO数据库单细胞数据和TCGA结肠癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6259 | 2025-11-27 |
Function and Development of Deep-sea Mussel Bacteriocytes Revealed by SnRNA-seq and Spatial Transcriptomics
2025-Nov-25, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf109
PMID:41289084
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示深海贻贝细菌细胞的功能与发育机制 | 首次结合原位去定植实验、单核转录组和空间转录组技术系统解析深海共生体系中细菌细胞的功能与发育轨迹 | NA | 探究深海贻贝与化学合成微生物共生体系中细菌细胞的功能特性和发育过程 | 深海贻贝的细菌细胞（宿主细胞内共生菌） | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 原位去定植实验, 多组学分析, 3D重建 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6260 | 2025-11-27 |
CD8+ T cell depletion promotes human Tph/Tfh cell proliferation and Sjögren syndrome-like symptoms in PBMC-based humanized mice
2025-Nov-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191700
PMID:41277554
|
研究论文 | 本研究开发了一种通过CD8+ T细胞耗竭促进人Tph/Tfh和B细胞增殖的方法，并建立了干燥综合征样症状的人源化小鼠模型 | 首次发现CD8+ T细胞耗竭可促进人Tph/Tfh细胞在体增殖，并建立了可模拟干燥综合征症状的PBMC人源化小鼠模型 | 研究基于人源化小鼠模型，与真实人体环境存在差异 | 研究人Tph/Tfh细胞分化机制及干燥综合征发病机理 | 人外周血单个核细胞、人源化小鼠模型、Tph/Tfh细胞、B细胞、CD8+ T细胞 | 免疫学 | 干燥综合征 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 多色流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 人PBMC移植的免疫缺陷小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | NA |