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当前共找到 37664 篇文献，本页显示第 601 - 620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 601 | 2026-03-18 |
Systemic inflammatory perturbations triggered by neuropathic pain in L5 compressed mouse and rat model
2026-Jan, Journal of orthopaedic translation
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.jot.2025.10.006
PMID:41836581
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研究论文 | 本研究通过L5神经压迫小鼠和大鼠模型，揭示了神经病理性疼痛可引发全身性炎症反应，并重新定义了其为一种多器官疾病 | 首次系统性地揭示了神经病理性疼痛可引发全身性炎症反应，并通过多组学分析（转录组、单细胞测序、ATAC测序）绘制了跨器官的炎症图谱，识别了髓系免疫信号通路作为潜在治疗靶点 | 研究结果需要进一步的功能验证以确认潜在干预靶点的治疗效果 | 探究神经病理性疼痛是否以及如何诱导全身性炎症及其潜在机制 | L5神经压迫诱导的神经病理性疼痛小鼠和大鼠模型 | 神经科学，免疫学 | 神经病理性疼痛 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq | NA | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 使用L5神经压迫小鼠和大鼠模型，对多个器官系统（局部压迫神经L4-6、大脑、骨髓、心脏、肝脏、肺、肾脏、结肠、小肠、脊柱和脾脏）进行分析 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 602 | 2026-03-18 |
CEBPB-Regulated Gastric Cell Plasticity Promotes Liver Metastasis of Gastric Cancer
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0016
PMID:41836678
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研究论文 | 本研究揭示了胃癌肝转移的关键分子机制，发现CEBPB介导的转录和表观遗传重编程驱动胃癌细胞获得高可塑性，促进肝转移并逃避免疫监视 | 首次通过单细胞RNA测序等多组学方法系统揭示CEBPB在胃癌肝转移中的核心调控作用，并发现CD155-TIGIT轴作为潜在治疗靶点 | 未明确CEBPB激活的具体上游信号通路，且体内实验模型可能无法完全模拟人类肿瘤微环境 | 揭示胃癌肝转移的分子机制并探索治疗靶点 | 胃癌原发灶、配对肝转移灶、循环肿瘤细胞及正常癌旁组织 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序、转录组学、表观基因组学 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、表观遗传数据 | 未明确具体样本数量，但包含原发灶、转移灶、循环肿瘤细胞等多类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 603 | 2026-03-18 |
Spatio-temporal dynamics of autophagy-associated genes in macrophage-driven atherosclerosis: an integrated omics and experimental study
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1764263
PMID:41837135
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研究论文 | 本研究通过整合多组学方法，系统识别并表征了动脉粥样硬化中巨噬细胞自噬相关基因的时空动态，揭示了SNX5、SMG1和GSK3A作为核心调控因子在斑块稳定中的关键作用 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学及机器学习方法，系统解析了巨噬细胞自噬相关基因在动脉粥样硬化中的时空表达动态及其免疫调控功能 | 研究主要基于公共数据集和体外实验，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限，且空间转录组数据可能受技术分辨率限制 | 系统识别并表征动脉粥样硬化中巨噬细胞自噬相关基因的时空动态，探索其作为诊断生物标志物和治疗靶点的潜力 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞及相关自噬基因 | 生物信息学与计算生物学 | 心血管疾病 | 转录组学、单细胞RNA-seq、空间转录组学、qPCR、Western blot、免疫荧光 | LASSO、随机森林-支持向量机（RF-SVM） | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 基于公共数据集（GSE270260、GSE100927、GSE260657），具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 604 | 2026-03-18 |
Circulating tumor cells as predictive biomarkers in the risk stratification of DCIS: Evidence of early dissemination
2025-Oct-31, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adz0187
PMID:41160699
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研究论文 | 本研究探讨循环肿瘤细胞（CTCs）作为导管原位癌（DCIS）患者风险分层生物标志物的潜力，通过单细胞RNA测序分析CTCs与匹配组织，提供早期扩散证据 | 首次将CTCs作为DCIS风险分层生物标志物，结合微流控技术和单细胞RNA测序揭示早期扩散和克隆进化模型 | 样本量较小（34例患者），需更大规模验证；种族差异仅为初步观察 | 改善DCIS患者风险分层，减少过度治疗 | DCIS患者和健康对照的循环肿瘤细胞及匹配组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 34例DCIS患者及健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 605 | 2026-03-18 |
Integrated Transcriptomics and Single-Cell RNA Sequencing Analyses Reveal the Potential Role of Obesity-Related Genes in Polycystic Ovary Syndrome
2025-10, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-01968-7
PMID:40880058
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞RNA测序分析，揭示了肥胖相关基因在多囊卵巢综合征中的潜在作用，并鉴定了五个潜在的诊断生物标志物 | 首次通过整合公共数据库的差异表达基因、关键模块基因和肥胖相关基因，结合机器学习筛选，鉴定出CPT1A等五个PCOS诊断生物标志物，并利用单细胞分析明确了GSTP1和上皮细胞在PCOS早期发展中的关键作用 | 研究基于公共数据库数据，缺乏独立队列验证；单细胞分析的具体样本来源和实验细节未明确说明 | 阐明肥胖相关基因在多囊卵巢综合征发病机制中的作用，并寻找可靠的诊断生物标志物 | 多囊卵巢综合征患者与对照组的基因表达数据 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 转录组学分析，单细胞RNA测序，机器学习 | 机器学习（具体模型未指定），列线图 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 606 | 2026-03-18 |
scTWAS: A powerful statistical framework for single-cell transcriptome-wide association studies
2025-Sep-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6531106/v1
PMID:41256005
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研究论文 | 本文提出了一种名为scTWAS的统计方法，用于利用单细胞数据进行细胞类型特异性的转录组范围关联研究 | scTWAS通过潜变量模型和基于矩的估计方法，解决了单细胞数据中的强噪声、技术变异和高稀疏性等独特挑战，从而在血液和脑组织中一致提高了跨细胞类型的基因调控表达预测 | NA | 开发一种统计框架，以在单细胞水平上进行细胞类型特异性的转录组范围关联研究，识别与复杂性状和疾病相关的基因 | 血液和脑组织中的细胞类型，包括免疫细胞类型、疾病相关小胶质细胞、炎症性小胶质细胞和星形胶质细胞亚型 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 潜变量模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 607 | 2026-03-18 |
Scalable nonparametric clustering with unified marker gene selection for single-cell RNA-seq data
2025-Sep-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.11.579839
PMID:38405697
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研究论文 | 本文提出了一种名为NCLUSION的非参数聚类方法，用于单细胞RNA测序数据分析，该方法能够同时进行聚类和标记基因选择 | 提出了一种基于无限混合模型的非参数聚类方法，利用贝叶斯稀疏先验在聚类过程中同步识别标记基因，避免了传统方法中事后差异表达分析带来的高假阳性率问题 | 未明确说明方法在特定细胞类型或复杂组织中的适用性限制，也未讨论对批次效应的处理能力 | 开发一种可扩展的单细胞RNA测序数据聚类方法，同时解决聚类参数依赖和标记基因识别假阳性率高的问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 无限混合模型，变分推断算法 | 基因表达数据 | 可达数百万细胞的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 608 | 2026-03-18 |
Integrative genomics elucidates the evolutionary, temporal, and developmental origins of a hydrocephalus risk gene
2025-Sep-02, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.09.01.25334358
PMID:40950474
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研究论文 | 本研究通过整合基因组学方法，探讨了与脑积水风险相关的基因MAEL的进化起源、时间表达模式和发育表达谱 | 首次在单细胞水平上系统描述了MAEL基因在新生儿人脑中的进化、时间和发育表达模式，并直接验证了其在脑积水组织中的表达降低 | 研究主要基于观察性数据，缺乏直接的因果机制验证；样本量相对有限，且依赖于现有数据库和手术获取的组织 | 阐明MAEL基因的进化起源及其在脑积水和发育中人脑中的表达特征，以理解其变异如何导致脑积水 | MAEL基因、新生儿人脑组织、脑积水患者的手术获取的脑皮质组织 | 基因组学 | 脑积水 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、基因映射分析 | NA | 基因序列数据、单细胞RNA测序数据 | 49个脑区域的scRNA-seq数据，加上手术获取的脑积水组织样本 | Allen Institute | 单细胞RNA-seq | Developing Human Brain Atlas | NA |
| 609 | 2026-03-18 |
Single-Cell Transcriptome and RNA Sequencing Reveal Immune-Related Markers of Preeclampsia
2025-08, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-025-01843-5
PMID:40216654
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研究论文 | 本研究通过单细胞和RNA测序技术，比较了先兆子痫与非先兆子痫胎盘样本的免疫微环境，旨在发现调控先兆子痫的关键靶基因 | 首次在单细胞水平上对先兆子痫胎盘的免疫微环境进行系统分析，并识别出巨噬细胞中调控先兆子痫的7个关键靶基因（SLC9A9、SH2B3、SDC3、RCC2、F13A1、CCL2、CBLB） | 研究样本量未明确说明，且分析主要基于公共数据集，需要进一步实验验证这些靶基因的功能 | 探索先兆子痫胎盘免疫微环境中的关键调控基因 | 先兆子痫与非先兆子痫患者的胎盘组织 | 数字病理学 | 先兆子痫 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | Scenic包用于转录因子分析，伪时间分析，细胞间通讯分析 | 单细胞转录组数据，RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 610 | 2026-03-18 |
The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
|
综述 | 本文综述了单细胞测序技术在研究衰老相关细胞变化中的应用，总结了衰老对哺乳动物器官中细胞类型特异性群体变化的影响 | 通过整合过去十年的单细胞研究数据，系统性地总结了衰老对哺乳动物全身细胞类型特异性群体的影响，并探讨了性别和抗衰老干预对细胞群体动态的影响 | NA | 阐明衰老对哺乳动物细胞类型特异性群体变化的影响，为衰老和年龄相关疾病提供潜在治疗靶点 | 哺乳动物器官中的细胞类型特异性群体 | 基因组学 | 老年疾病 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 611 | 2026-03-18 |
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals metabolic dysfunction prior to overt tauopathy in the PS19 mouse model
2025-Jul-10, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6941464/v1
PMID:40671812
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研究论文 | 本研究利用PS19小鼠模型，通过空间转录组学分析揭示了tau蛋白病前期海马和皮层区域的代谢功能障碍 | 首次在PS19小鼠模型中，通过空间转录组学技术，在可检测的tau缠结病理出现前，识别出CA3区域糖酵解通路基因的早期上调，揭示了代谢失调与区域脆弱性的关联 | 研究基于转基因小鼠模型，可能无法完全模拟人类神经退行性疾病的复杂性，且样本量有限 | 探究tau蛋白病中区域脆弱性与tau驱动转录组变化之间的关系，特别是代谢功能障碍在疾病早期的作用 | PS19转基因小鼠模型的海马和皮层区域 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 612 | 2026-03-18 |
Guanylate-Binding Proteins Promote Host Defense Against Leishmania major by Balancing iNOS/Arg-1 in Myeloid Cells
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661809
PMID:40631203
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研究论文 | 本文探讨了鸟苷酸结合蛋白（GBPs）在宿主防御利什曼原虫感染中的作用，特别是在调节巨噬细胞中iNOS/Arg-1平衡以控制寄生虫方面的机制 | 首次系统研究了GBPs在皮肤利什曼病中的功能，揭示了其通过平衡iNOS和Arg-1表达来调节巨噬细胞免疫反应，从而影响寄生虫控制的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类疾病情况；且GBPs的具体作用通路仍需进一步探索 | 探究GBPs在宿主防御利什曼原虫感染中的免疫调节作用 | C57Bl/6小鼠、GBPChr3敲除小鼠、骨髓来源巨噬细胞（BMDMs） | 免疫学 | 皮肤利什曼病 | RNA-Seq、单细胞RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | C57Bl/6小鼠和GBPChr3敲除小鼠模型 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 613 | 2026-03-18 |
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-05-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672
PMID:40138759
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研究论文 | 本研究探讨了PINK1蛋白通过调控线粒体-内质网相互作用来调节猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 首次揭示了PINK1在猪肌肉内脂肪沉积中的关键作用，并发现其通过调控线粒体-内质网接触来影响脂肪沉积过程 | 研究主要基于猪模型，结果在人类或其他物种中的适用性尚需验证 | 探究PINK1如何调控猪肌肉内脂肪沉积的分子机制 | 猪的肌肉组织、纤维-脂肪祖细胞和脂肪细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个猪品种的肌肉组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 614 | 2026-03-18 |
Murine Aortic Valve Cell Heterogeneity at Birth
2025-May, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322280
PMID:40079140
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析新生小鼠主动脉瓣细胞异质性，揭示了出生时瓣膜内皮细胞和间质细胞的新亚群 | 首次在出生后第1天小鼠主动脉瓣中发现新的瓣膜内皮细胞亚群和三个先前未被认识的瓣膜间质细胞亚群（原始型、重塑型和生物活性型），并通过谱系追踪揭示了原始型间质细胞在出生后成熟过程中的时空轨迹 | 研究仅针对出生后第1天的小鼠主动脉瓣，未涵盖更广泛的发育阶段或人类样本，可能限制了结果的普遍性 | 探究主动脉瓣在出生后成熟过程中建立结构-功能关系的细胞机制 | 新生小鼠（出生后第1天）的主动脉瓣结构 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 615 | 2026-03-18 |
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-05, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
DOI:10.1007/s43032-024-01695-5
PMID:39354287
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研究论文 | 本文通过整合单细胞数据集，研究了从宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性 | 利用单细胞组成数据分析（scCODA）揭示细胞类型组成变化，并通过ATAC-seq分析将表观遗传改变与基因表达谱关联，识别了关键转录因子（如YY1） | 研究依赖于现有数据集整合，可能受样本来源和技术差异影响，且新队列数据（HRA001742）的相似性评估仅基于逻辑回归模型 | 探究宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性，为靶向治疗提供基础 | 正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤的单细胞数据 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化（IHC） | 逻辑回归模型 | 单细胞测序数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 | 四个单细胞数据集，包括正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 616 | 2026-03-18 |
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.06.637075
PMID:40093094
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研究论文 | 本研究系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建人类肾脏皮质参考图谱中的应用 | 开发了可解释的机器学习工具scOMM，并首次系统评估了水平整合（scRNA与snRNA-seq）和垂直整合（snRNA-seq与snATAC-seq）策略在复杂组织中的效果 | 研究仅针对肾脏皮质组织，未验证在其他复杂组织中的普适性 | 评估多模态单细胞数据整合策略对构建全面人类参考图谱的影响 | 人类肾脏皮质组织 | 单细胞组学 | NA | scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq | 机器学习（scOMM工具） | 单细胞多模态组学数据 | 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 617 | 2026-03-18 |
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2024.108829
PMID:39746460
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研究论文 | 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡并导致生育力下降的机制 | 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路损害卵母细胞质量和生育能力的分子机制，并利用单细胞转录组分析证实了其对能量代谢和凋亡的影响 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证；混合物暴露的具体剂量和比例对结果的普适性有待进一步研究 | 探究PFOA和PFOS混合物暴露对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响及其分子机制 | 雌性小鼠的卵母细胞 | 生殖毒理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组分析 | 动物模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 618 | 2026-03-18 |
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology
IF:2.8Q3
DOI:10.1016/j.virol.2024.110368
PMID:39721194
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综述 | 本文讨论了基于生物标志物表达来消除持久性HIV病毒库的挑战与前景 | 系统分析了导致HIV潜伏感染细胞生物标志物异质性的因素，并提出了通过识别共表达蛋白的最小组合来定义所有病毒库亚群的新策略 | 目前缺乏能够定义所有HIV潜伏感染细胞的单一特异性分子标志物，且对组织微环境和髓系细胞中潜伏感染细胞的表征仍不充分 | 探讨如何识别和利用生物标志物来靶向消除持久性HIV病毒库，以实现HIV治愈 | HIV潜伏感染细胞及其相关的生物标志物 | NA | HIV感染 | 空间转录组学、蛋白质组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 619 | 2026-03-18 |
ImageDoubler: image-based doublet identification in single-cell sequencing
2025-01-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55434-0
PMID:39747095
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研究论文 | 本研究提出了一种基于图像的模型ImageDoubler，用于识别单细胞测序中的双联体 | 首次利用Fluidigm单细胞测序图像数据进行双联体识别，相比传统基于基因组模拟数据的方法，F1分数至少提升33.1% | 方法目前主要针对Fluidigm平台图像数据，在其他单细胞测序平台上的适用性有待验证 | 开发更有效的单细胞测序双联体检测方法 | 单细胞测序数据中的双联体（两个或多个细胞被一起测序） | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 图像识别模型 | 图像 | NA | Fluidigm | 单细胞测序 | NA | Fluidigm单细胞测序图像数据 |
| 620 | 2026-03-18 |
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.17.629023
PMID:39763963
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研究论文 | 本研究开发了一种名为HIV-seq的新方法，用于更有效地捕获HIV转录本，并通过单细胞RNA-seq分析HIV感染者细胞，揭示了病毒转录细胞在病毒血症和抑制期间的基因表达差异 | 开发了HIV-seq方法，通过添加针对HIV基因组保守区域的自定义捕获序列，提高了HIV RNA+细胞的检测效率达44%，并结合CITE-seq进行表面表型分析，首次系统比较了病毒血症和ART抑制期间HIV转录细胞的转录特征 | 样本量相对较小，仅基于配对血液样本，可能无法完全代表所有组织中的HIV转录细胞，且方法依赖于自定义捕获序列的设计，可能对HIV变异株的覆盖不完全 | 研究HIV感染者中病毒转录细胞的基因表达差异，特别是在病毒血症和抗逆转录病毒治疗抑制期间的比较，以理解活跃病毒库细胞的持久性机制 | HIV感染者的血液样本，包括病毒血症和ART抑制期间的配对样本 | 单细胞测序 | HIV感染 | 单细胞RNA-seq, CITE-seq | NA | 单细胞转录组数据, 表面表型数据 | 配对血液样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 表面表型分析 | NA | NA |