单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 40374 篇文献,本页显示第 6141 - 6160 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6141 2026-03-18
Dissecting the Single-Cell Diversity and Heterogeneity Underlying Cervical Precancerous Lesions and Cancer Tissues
2025-05, Reproductive sciences (Thousand Oaks, Calif.)
研究论文 本文通过整合单细胞数据集,研究了从宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性 利用单细胞组成数据分析(scCODA)揭示细胞类型组成变化,并通过ATAC-seq分析将表观遗传改变与基因表达谱关联,识别了关键转录因子(如YY1) 研究依赖于现有数据集整合,可能受样本来源和技术差异影响,且新队列数据(HRA001742)的相似性评估仅基于逻辑回归模型 探究宫颈癌前病变到宫颈鳞状细胞癌的细胞多样性和异质性,为靶向治疗提供基础 正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤的单细胞数据 数字病理学 宫颈癌 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, RT-qPCR, 免疫组化(IHC) 逻辑回归模型 单细胞测序数据, 表观遗传数据, 基因表达数据 四个单细胞数据集,包括正常组织、癌旁组织、癌前病变和宫颈肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq NA NA
6142 2026-03-18
Systematic evaluation of single-cell multimodal data integration for comprehensive human reference atlas
2025-Mar-06, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统评估了单细胞多模态数据整合方法在构建人类肾脏皮质参考图谱中的应用 开发了可解释的机器学习工具scOMM,并首次系统评估了水平整合(scRNA与snRNA-seq)和垂直整合(snRNA-seq与snATAC-seq)策略在复杂组织中的效果 研究仅针对肾脏皮质组织,未验证在其他复杂组织中的普适性 评估多模态单细胞数据整合策略对构建全面人类参考图谱的影响 人类肾脏皮质组织 单细胞组学 NA scRNA-seq, snRNA-seq, snATAC-seq 机器学习(scOMM工具) 单细胞多模态组学数据 19名捐赠者的119,744个高质量细胞核/细胞 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
6143 2026-03-18
Mixed exposure to PFOA and PFOS induces oocyte apoptosis and subfertility in mice by activating the Hippo signaling pathway
2025-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
研究论文 本研究探讨了PFOA和PFOS混合物暴露通过激活Hippo信号通路诱导小鼠卵母细胞凋亡并导致生育力下降的机制 首次揭示了PFOA和PFOS混合物通过激活Hippo信号通路损害卵母细胞质量和生育能力的分子机制,并利用单细胞转录组分析证实了其对能量代谢和凋亡的影响 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类中验证;混合物暴露的具体剂量和比例对结果的普适性有待进一步研究 探究PFOA和PFOS混合物暴露对卵母细胞质量和雌性生育能力的影响及其分子机制 雌性小鼠的卵母细胞 生殖毒理学 生殖系统疾病 单细胞转录组分析 动物模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6144 2026-03-18
Eliminating the persistent HIV reservoir based on biomarker expression - How do we get there?
2025-02, Virology IF:2.8Q3
综述 本文讨论了基于生物标志物表达来消除持久性HIV病毒库的挑战与前景 系统分析了导致HIV潜伏感染细胞生物标志物异质性的因素,并提出了通过识别共表达蛋白的最小组合来定义所有病毒库亚群的新策略 目前缺乏能够定义所有HIV潜伏感染细胞的单一特异性分子标志物,且对组织微环境和髓系细胞中潜伏感染细胞的表征仍不充分 探讨如何识别和利用生物标志物来靶向消除持久性HIV病毒库,以实现HIV治愈 HIV潜伏感染细胞及其相关的生物标志物 NA HIV感染 空间转录组学、蛋白质组学 NA NA NA NA 空间转录组学 NA NA
6145 2026-03-18
ImageDoubler: image-based doublet identification in single-cell sequencing
2025-01-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究提出了一种基于图像的模型ImageDoubler,用于识别单细胞测序中的双联体 首次利用Fluidigm单细胞测序图像数据进行双联体识别,相比传统基于基因组模拟数据的方法,F1分数至少提升33.1% 方法目前主要针对Fluidigm平台图像数据,在其他单细胞测序平台上的适用性有待验证 开发更有效的单细胞测序双联体检测方法 单细胞测序数据中的双联体(两个或多个细胞被一起测序) 数字病理学 NA 单细胞测序 图像识别模型 图像 NA Fluidigm 单细胞测序 NA Fluidigm单细胞测序图像数据
6146 2026-03-18
HIV-SEQ REVEALS GLOBAL HOST GENE EXPRESSION DIFFERENCES BETWEEN HIV-TRANSCRIBING CELLS FROM VIREMIC AND SUPPRESSED PEOPLE WITH HIV
2024-Dec-20, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种名为HIV-seq的新方法,用于更有效地捕获HIV转录本,并通过单细胞RNA-seq分析HIV感染者细胞,揭示了病毒转录细胞在病毒血症和抑制期间的基因表达差异 开发了HIV-seq方法,通过添加针对HIV基因组保守区域的自定义捕获序列,提高了HIV RNA+细胞的检测效率达44%,并结合CITE-seq进行表面表型分析,首次系统比较了病毒血症和ART抑制期间HIV转录细胞的转录特征 样本量相对较小,仅基于配对血液样本,可能无法完全代表所有组织中的HIV转录细胞,且方法依赖于自定义捕获序列的设计,可能对HIV变异株的覆盖不完全 研究HIV感染者中病毒转录细胞的基因表达差异,特别是在病毒血症和抗逆转录病毒治疗抑制期间的比较,以理解活跃病毒库细胞的持久性机制 HIV感染者的血液样本,包括病毒血症和ART抑制期间的配对样本 单细胞测序 HIV感染 单细胞RNA-seq, CITE-seq NA 单细胞转录组数据, 表面表型数据 配对血液样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq, 表面表型分析 NA NA
6147 2026-03-18
Human Anti-Glycan Reactivity is Driven by the Selection of B cells Utilizing Private Antibody Gene Rearrangements that are Affinity Maturated in Germinal Centers
2024-Oct-18, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过BCR受体克隆、表达及单细胞转录组学分析,探讨了人类对普遍存在的N-乙酰-D-葡萄糖胺(GlcNAc)表位的B细胞库,并揭示了抗糖抗体在生发中心依赖的亲和力成熟过程 结合BCR克隆表达与单细胞转录组学,首次系统分析了人类抗GlcNAc B细胞库的免疫系统发育史,揭示了其在早期儿童期通过生发中心进行亲和力成熟的新机制 研究主要关注GlcNAc表位,可能未全面覆盖其他糖类抗原;样本队列和年龄范围可能限制结论的普遍性 解析人类抗体库对碳水化合物抗原的广泛反应性机制,特别是针对GlcNAc表位的B细胞选择与成熟过程 人类队列中的循环抗GlcNAc B细胞及其BCR受体 免疫学 NA BCR受体克隆与表达、单细胞转录组学 NA 单细胞转录组数据、BCR序列数据 人类队列(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
6148 2026-03-18
Single-cell multidimensional profiling of tumor cell heterogeneity in supratentorial ependymomas
2024-Aug-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和活细胞成像技术,系统描绘了幕上室管膜瘤的肿瘤细胞异质性、空间组织和动态行为 首次在单细胞和空间维度上整合分析了幕上室管膜瘤的细胞状态、空间架构及微环境影响,揭示了肿瘤内两种不同的祖细胞样状态,并发现了脑内常驻细胞对肿瘤细胞向神经元样表型转化的新作用 未明确说明样本数量及具体技术平台细节,且研究聚焦于特定亚型,结论的普适性有待进一步验证 解析幕上室管膜瘤的肿瘤异质性、空间组织模式及其与神经微环境的相互作用 幕上室管膜瘤(一种儿童侵袭性脑肿瘤)的肿瘤细胞及其微环境 数字病理学 脑肿瘤(幕上室管膜瘤) 单细胞转录组测序, 空间转录组学, 活细胞成像 NA 转录组数据, 空间位置数据, 影像数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
6149 2026-03-18
Development of robust antiviral assays using relevant apical-out human airway organoids
2024-Jul-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了一种使用顶端向外人类气道类器官进行高通量抗病毒药物筛选的标准化方法 引入了具有反向双极性的气道类器官,实现了单类器官每孔的高通量培养和分析,提高了病毒感染效率和药物筛选的标准化水平 研究主要作为SARS-CoV-2的概念验证应用,尚未广泛扩展到其他病毒或疾病模型 开发标准化的类器官平台用于抗病毒药物发现和评估 人类气道类器官和SARS-CoV-2病毒株 数字病理学 呼吸道疾病 单细胞RNA测序,免疫组织化学 类器官模型 转录组数据,图像数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6150 2026-03-18
An update on methods for detection of prognostic and predictive biomarkers in melanoma
2023, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
综述 本文综述了黑色素瘤中预后和预测性免疫生物标志物检测的最新方法 整合了从批量组织基因表达谱到单细胞空间转录组学和基于人工智能的图像分析等多种技术,以全面表征黑色素瘤免疫微环境 作为综述文章,未提供原始实验数据或新方法验证,主要总结现有研究 改进黑色素瘤的免疫基础预测和预后生物标志物检测方法 黑色素瘤患者,特别是II-IV期患者 数字病理学 黑色素瘤 基因表达谱分析,空间转录组学,人工智能图像分析 NA 图像,文本(基因表达数据) NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
6151 2026-03-18
A novel lncRNA-mediated epigenetic regulatory mechanism in periodontitis
2023, International journal of biological sciences IF:8.2Q1
研究论文 本研究探讨了长链非编码RNA lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用及其治疗潜力 首次揭示了lncR-APDC在牙周炎中的关键调控作用,发现了一个新的上皮细胞亚群,并提出了lncR-APDC与特定蛋白直接结合的可能性 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证;部分分子相互作用机制尚未完全阐明 理解lncR-APDC在牙周炎进展中的调控作用 lncR-APDC基因敲除小鼠、实验性牙周炎模型、牙周组织免疫细胞 表观遗传学 牙周炎 单细胞RNA测序、基因敲除、AAV9介导的基因治疗 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据 基因敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6152 2026-03-18
Manifold Interpolating Optimal-Transport Flows for Trajectory Inference
2022-Dec, Advances in neural information processing systems
PMID:37397786
研究论文 提出了一种名为MIOFlow的方法,用于从稀疏时间点采集的静态快照样本中学习随机、连续的群体动态 结合动态模型、流形学习和最优传输,通过训练神经常微分方程在静态群体快照之间进行插值,并利用流形地面距离的最优传输进行惩罚 未在摘要中明确说明 从静态快照样本推断连续群体动态轨迹 模拟数据(含分叉与合并)和scRNA-seq数据(胚状体分化和急性髓系白血病治疗) 机器学习 急性髓系白血病 scRNA-seq 神经常微分方程(Neural ODE)、自编码器(GAE) 单细胞RNA测序数据、模拟数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6153 2026-03-17
Formononetin, an active component of RAS-RH, ameliorates radiation-induced mitochondrial fission dysfunction in endothelial cells via TCs-ECs crosstalk
2026-May, Microvascular research IF:2.9Q2
研究论文 本研究揭示了中药复方RAS-RH的活性成分芒柄花素通过调控心脏端细胞介导的旁分泌信号,减轻X射线辐射诱导的大鼠心脏微血管内皮细胞损伤的机制 首次阐明了芒柄花素通过AR/miR-151a-5p/Fis1轴介导心脏端细胞与内皮细胞之间的串扰,抑制线粒体过度分裂的核心机制 研究为体外细胞模型,缺乏体内实验验证;机制研究主要聚焦于Fis1通路,可能存在其他调控途径 探究RAS-RH及其活性成分芒柄花素缓解辐射诱导内皮细胞损伤的作用机制 大鼠心脏微血管内皮细胞、心脏端细胞 细胞生物学 辐射损伤 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、分子动力学模拟、Western blot、免疫荧光、流式细胞术 NA 基因表达数据、蛋白质数据、细胞成像数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6154 2026-03-17
BRIP1-mediated RINT1 acetylation and NF-κB activation promote DNA repair and immunosuppressive microenvironment in lung adenocarcinoma
2026-May-01, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 本研究揭示了BRIP1通过调控RINT1乙酰化和NF-κB信号通路,促进肺腺癌DNA修复和免疫抑制微环境形成的分子机制 首次发现BRIP1通过两条相互关联的通路协调DNA修复能力和先天免疫抑制,并建立了BRIP1作为DNA修复能力与免疫抑制之间分子联系的新角色 研究主要在细胞和动物模型中进行,临床转化效果需进一步验证;BRIP1调控的具体分子细节仍需深入探索 探究BRIP1在肺腺癌DNA修复和免疫逃逸中的作用机制,为联合免疫治疗提供新靶点 肺腺癌细胞、肿瘤组织、动物模型 肿瘤免疫学 肺腺癌 空间转录组学、单细胞RNA测序、多重免疫组化、功能实验 NA 基因表达数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据、免疫组化图像 未明确说明具体样本数量,涉及肿瘤组织和多个细胞系 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
6155 2026-03-17
The underlying mechanism of cardiac injury in exertional heat stroke rats based on the scRNA-seq analysis
2026-04-09, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本研究基于单细胞RNA测序分析,探讨了劳力性热射病大鼠心脏损伤的潜在机制 首次在劳力性热射病模型中应用单细胞RNA测序技术,系统性地鉴定了不同细胞类型中的差异表达基因,并验证了Hspa8、Hspe1、Id1、Ndufa4和Cd36等关键基因在心脏损伤机制中的作用 研究基于大鼠模型,其结果向人类临床应用的转化需要进一步验证;单细胞测序分析仅聚焦于基因表达层面,未深入探究蛋白质功能或翻译后修饰的影响 探究劳力性热射病中心脏损伤的细胞信号通路和关键基因,为早期识别心脏损伤生物标志物提供理论依据 劳力性热射病大鼠模型的心脏组织 单细胞组学 心血管疾病 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据,基因表达定量数据,组织切片图像 未明确说明具体样本数量的大鼠心脏组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6156 2026-03-17
Single-cell transcriptomics reveals targeted modulation of inflammatory repertoire by SOCE blockers
2026-Apr, Human immunology IF:3.1Q3
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,探究了SOCE阻断剂BTP2和CM4620在PHA驱动的T细胞活化模型中,对人类外周血单个核细胞炎症反应的特异性调控作用 首次在单细胞分辨率下揭示了SOCE阻断剂对特定免疫细胞亚群(CD8效应T细胞、NK细胞和CD4调节性T细胞)转录程序的特异性调控,为靶向免疫调节提供了新见解 研究基于体外PHA驱动的T细胞活化模型,可能无法完全反映体内复杂免疫环境;需要未来与常规免疫抑制剂进行头对头比较研究 探究SOCE阻断在特定活化背景下对免疫细胞功能的细胞类型特异性影响 正常人外周血单个核细胞(PBMCs) 单细胞组学 免疫介导性疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6157 2026-03-17
Exploring estrogen synthesis and metabolism related markers and immune dynamics in osteoporosis-insights from single-cell RNA sequencing and Mendelian randomization
2026-Apr, Experimental gerontology IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索骨质疏松症中雌激素合成与代谢相关标志物及免疫动态 结合单细胞RNA测序与孟德尔随机化分析,识别出CCND1、SCGB1A1和DDIT4作为骨质疏松症的新型生物标志物 样本量可能有限,且研究主要基于生物信息学分析,需要进一步实验验证其临床适用性 探索骨质疏松症中雌激素相关标志物以改善诊断和治疗 骨质疏松症患者 数字病理学 骨质疏松症 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blot 机器学习 RNA测序数据, 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6158 2026-03-17
Hot Zones for Liver Cancer: Metabolic Zonation, Ferroptosis, and the Origins of HCC
2026-Mar-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本研究通过小鼠遗传学与空间转录组学结合,揭示了肝癌(HCC)起源于肝脏特定代谢区域(区域3)的机制,并识别出Gstm2和Gstm3酶在抑制铁死亡和促进肿瘤形成中的关键作用 首次通过空间转录组学追踪肝脏特定区域的癌前肝细胞,发现肝癌主要起源于区域3,揭示了克隆扩张与肿瘤发生潜力之间的脱节,并识别出GSTMs酶在维持氧化还原平衡和抑制铁死亡中的核心作用 研究主要基于小鼠模型,结果在人类肝癌中的直接适用性需进一步验证,且未详细探讨其他潜在影响因素 探究肝癌在肝脏代谢异质性区域中的起源机制,并识别关键调控因子 小鼠肝脏的特定代谢区域(区域1和区域3)及其癌前肝细胞 空间转录组学 肝癌 空间转录组学 NA 空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
6159 2026-03-17
Spatially Resolved Opto-Omics Uncovers Functional Microglial Subtypes in Brain Metastasis
2026-Mar-16, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 本文介绍了一种名为“opto-omics”的前沿方法,用于在脑转移瘤微环境中映射活体、空间定位细胞的转录命运,揭示了功能性的小胶质细胞亚型 开发了opto-omics技术,结合光转换荧光蛋白和单细胞转录组学,实现了对活体、空间迁移小胶质细胞的实时转录分析,并识别出五个与特定生物过程相关的亚群 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类脑转移的复杂性;技术应用范围有限,需进一步验证在其他疾病或组织中的适用性 研究脑转移瘤微环境中小胶质细胞的功能亚型及其在肿瘤发展中的作用 小鼠模型中的小胶质细胞和播散性肿瘤细胞 数字病理学 脑转移瘤 opto-omics, 单细胞转录组学, 光转换荧光蛋白技术 NA 转录组数据, 空间定位数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6160 2026-03-17
SlGRF1 mediates gibberellin signaling to control cut-budding in tomato
2026-Mar-15, Journal of integrative plant biology IF:9.3Q1
研究论文 本研究探讨了番茄中切割诱导芽再生(cut-budding)的分子基础,重点关注生长调节因子1(SlGRF1)及其与赤霉素(GA)信号传导的关联 结合单细胞RNA测序、时序转录组分析和遗传验证,阐明了芽再生的关键阶段,并鉴定出SlGRF1作为关键调节因子,揭示了GA信号通过抑制SlGRF1表达负调控芽起始的新机制 NA 研究番茄中切割诱导芽再生(cut-budding)的分子机制 番茄(Solanum lycopersicum) 植物分子生物学 NA 单细胞RNA测序,时序转录组分析,CRISPR/Cas9基因敲除,ChIP-seq分析 NA RNA测序数据,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部