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当前共找到 34043 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2025-12-09 |
A Single-Cell Atlas of Transcriptional and Immunoglobulin Repertoire Evolution in Early B Cell Development
2025-Oct-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.08.681095
PMID:41278878
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，深入分析了早期B细胞发育过程中的转录组和免疫球蛋白库演化，揭示了重组事件后的增殖爆发和库特征变化 | 首次在单细胞水平上对早期B细胞发育进行深度转录组和免疫球蛋白库分析，发现了前B细胞阶段BCR重组后未描述的增殖爆发现象 | 研究仅基于六名健康供体，样本量相对有限，且未涵盖疾病状态或更广泛的个体差异 | 探究早期B细胞发育中转录组和免疫球蛋白库的演化规律，理解成熟免疫库多样性的形成基础 | 人类骨髓中的B细胞，包括从祖细胞到成熟B细胞的不同发育亚群 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 65,110个B细胞，来自六名健康供体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2025-12-09 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7564369/v1
PMID:41282090
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 | VISTA结合了变分推断和几何深度学习，联合建模scRNA-seq和SST数据，并引入不确定性量化，以解决SST技术基因检测数量有限的问题 | NA | 旨在通过预测未观测基因的表达，增强空间转录组学数据的分析能力 | 空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 几何深度学习 | 基因表达数据 | 四个SST数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 583 | 2025-12-09 |
Spatiotemporal dynamics of neuron differentiation and migration in the developing human spinal cord
2025-Oct, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.08.004
PMID:40825501
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和原位测序技术，揭示了人类和小鼠脊髓发育过程中神经元分化和迁移的时空动态与调控机制 | 首次在人类脊髓发育的早期阶段（Carnegie Stages 16-21）系统描绘了神经元分化和迁移的时空动态，并识别了跨物种保守的关键转录因子 | 研究主要聚焦于胚胎发育的特定阶段（CS16-21/E8.0-11.5），未涵盖更晚期的发育或成熟过程 | 探究人类脊髓发育过程中神经元亚型特化和迁移的分子机制 | 人类和小鼠胚胎脊髓组织 | 单细胞组学 | 神经系统发育 | 单细胞转录组测序, 原位测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 空间转录组数据 | 人类脊髓样本（CS16-21阶段）和小鼠脊髓样本（E8.0-11.5阶段） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 584 | 2025-12-09 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Sep-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.02.662808
PMID:40631124
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除Ptbp1基因，评估其在视网膜发育过程中的作用，发现Ptbp1对神经发生和细胞命运决定并非必需 | 使用遗传学方法直接验证Ptbp1在视网膜发育中的功能，挑战了先前基于RNA干扰研究提出的Ptbp1作为神经发生主要抑制因子的观点 | 研究仅聚焦于视网膜发育，未评估Ptbp1在其他神经系统区域的作用；scRNA-Seq显示转录变化较温和，可能未完全捕捉所有分子效应 | 评估Ptbp1在发育性神经发生中的作用，特别是其在视网膜细胞命运决定中的功能 | 小鼠视网膜祖细胞和Müller胶质细胞 | 发育生物学 | NA | 条件性基因敲除、免疫染色、bulk RNA-Seq、scRNA-Seq | NA | RNA测序数据、免疫染色图像 | 突变型动物（具体数量未明确说明） | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 585 | 2025-12-09 |
Metabolic reprogramming of arachidonic acid in clear cell renal carcinoma promotes an immunosuppressive microenvironment by activating MDK signaling pathway
2025-Aug-13, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01807-8
PMID:40802073
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序，探讨了透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关系，并揭示了花生四烯酸代谢异常通过激活MDK信号通路促进免疫抑制微环境的机制 | 首次结合单细胞和批量RNA测序技术，构建了ccRCC的代谢亚型，并发现花生四烯酸代谢异常通过MDK信号通路驱动免疫抑制，为免疫治疗提供了新的生物标志物和治疗靶点 | 研究主要基于测序数据和体外实验，缺乏大规模临床队列验证，且免疫治疗模型的体内效果需进一步确认 | 探究透明细胞肾细胞癌中代谢重编程与免疫耗竭的关联机制 | 透明细胞肾细胞癌患者样本及肿瘤细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫组化, Western blotting, ELISA, 细胞共培养 | Scissor算法, 细胞间通讯分析 | RNA测序数据, 蛋白质表达数据 | 未明确样本数量，但涉及ccRCC患者分组及细胞实验 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 586 | 2025-12-09 |
Decoding Cellular Stress States for Toxicology Using Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.10.657506
PMID:40766395
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术解码HepaRG细胞在多种化学物质暴露下的应激状态，揭示细胞适应性应激反应和潜在死亡过渡的动态变化 | 应用TempO-LINC平台生成大规模单细胞转录组数据，结合文献来源的应激反应通路基因签名对单个细胞进行评分和聚类，系统可视化化学物质诱导的细胞亚群动态变化 | 研究仅针对HepaRG细胞系在24小时暴露下的反应，未涉及其他细胞类型或更长时间点的动态变化 | 利用单细胞转录组学解码细胞应激状态，为毒理学研究提供新的见解 | HepaRG细胞 | 单细胞转录组学 | 毒理学 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约40,000个HepaRG细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | TempO-LINC | TempO-LINC平台用于生成单细胞转录组图谱 |
| 587 | 2025-12-09 |
Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663251
PMID:41200203
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肾移植早期急性排斥反应的免疫景观，并识别出Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下描绘了肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和细胞间通讯网络，并验证了Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点的潜力 | 研究基于大鼠模型，结果在人类中的适用性需进一步验证；样本时间点有限，可能未覆盖所有动态变化 | 阐明肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和局部细胞间通讯机制，并探索潜在治疗靶点 | 大鼠肾移植模型中的CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），多重免疫荧光，治疗干预实验 | 无监督聚类，细胞轨迹推断，细胞间通讯网络分析 | 单细胞转录组数据，图像数据 | 大鼠肾移植模型在移植后第0、1、3、7天采集的CD45+免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 588 | 2025-12-09 |
Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681989
PMID:41246346
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法，识别了主动脉夹层中与脂质代谢相关的新型生物标志物PLIN2和PLIN3 | 采用多模态策略结合单细胞RNA测序和机器学习，首次将PLIN2和PLIN3确定为主动脉夹层中脂质代谢的关键调节因子，并探索其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于计算分析和动物模型验证，缺乏大规模临床样本的直接验证，且分子机制需进一步实验探究 | 识别主动脉夹层中与脂质代谢失调相关的新型生物标志物，以阐明其病理机制并探索潜在治疗靶点 | 主动脉夹层患者样本和Ang II诱导的主动脉夹层小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析, 伪时间轨迹重建, 分子对接 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 主动脉夹层和对照样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 589 | 2025-12-09 |
Correction: Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1740964
PMID:41357176
|
correction | 本文是对先前发表文章的更正，涉及肾脏移植排斥早期免疫景观的单细胞转录组学研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 590 | 2025-12-09 |
Correction: Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1742065
PMID:41357238
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correction | 本文是对先前一篇关于整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别主动脉夹层新型脂质代谢相关生物标志物文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 591 | 2025-12-09 |
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350901
PMID:39101623
|
研究论文 | 本研究探讨了通过靶向CD28H特异性表位来激活NK细胞，增强其对肿瘤细胞的杀伤活性，并克服HHLA2和HLA-E的抑制信号 | 揭示了靶向CD28H特定表位的单克隆抗体能强烈激活NK细胞的钙流和细胞活性，并首次在透明细胞肾癌中通过scRNA-seq分析发现CD28H NK细胞浸润HHLA2阳性肿瘤 | 研究主要基于体外实验和细胞系模型，缺乏体内动物模型验证；样本量有限，仅涉及透明细胞肾癌的scRNA-seq分析 | 探索CD28H作为NK细胞新型激活靶点在抗肿瘤免疫治疗中的潜力 | NK细胞、造血细胞系、透明细胞肾癌细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量，但涉及透明细胞肾癌细胞的scRNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 592 | 2025-12-09 |
A human fetal lung cell atlas uncovers proximal-distal gradients of differentiation and key regulators of epithelial fates
2022-Dec-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.005
PMID:36493756
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA与ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像技术，构建了一个人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱 | 结合单细胞方法与空间分析，首次全面描绘了人类肺发育中上皮、间充质、内皮及红细胞/白细胞等细胞区室，并识别了包括发育特异性分泌祖细胞和与人类小细胞肺癌相关的神经内分泌细胞亚型在内的新细胞状态 | NA | 构建人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱，以揭示细胞分化梯度和关键调控因子 | 人类胎儿肺组织（孕后5-22周） | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 高通量空间转录组学, 单细胞成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 成像数据 | 涵盖孕后5-22周的人类胎儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 593 | 2025-12-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals beneficial mechanisms of Exendin-4 in autoimmune uveitis
2026-Jan, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117483
PMID:41173056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的有益作用机制 | 首次探索了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的作用，并揭示了其通过抑制PIM1-AKT-FOXO1通路恢复Teff/Treg细胞平衡的新机制 | 研究主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎模型，在人类疾病中的验证仅限于VKH患者，样本代表性可能有限 | 探究Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗潜力及其免疫调节机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎模型小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada病（VKH）患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 594 | 2025-12-08 |
Neutrophil extracellular traps released by CD177+ neutrophils aggravated inflammation and neuronal impairment post-SCI
2025-Dec-07, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02553-w
PMID:41353336
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定脊髓损伤后三种不同的中性粒细胞亚群，并揭示CD177+中性粒细胞通过形成中性粒细胞胞外陷阱加剧炎症和神经元损伤 | 首次在脊髓损伤模型中系统鉴定中性粒细胞亚群，并阐明CD177+中性粒细胞通过PAD4和ROS依赖的NETs形成机制促进炎症和神经元凋亡 | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，人类脊髓损伤的异质性可能未被完全涵盖 | 探究脊髓损伤后中性粒细胞的异质性及其在神经炎症和神经元损伤中的作用机制 | 脊髓损伤小鼠模型和患者样本中的中性粒细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，包括SCI小鼠模型和患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 595 | 2025-12-08 |
A mitochondria-related gene-based signature predicts pancreatic ductal adenocarcinoma clinical outcome and revealed CAMK2A/THEM4 regulates progression phenotypes and mitophagy in vivo and in vitro
2025-Dec-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07456-5
PMID:41353164
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研究论文 | 本研究开发了一个基于线粒体相关基因的12基因预后特征，用于预测胰腺导管腺癌（PDAC）的临床结局，并揭示了CAMK2A/THEM4在体内外调控进展表型和线粒体自噬的分子机制 | 首次在胰腺癌中开发了一个基于线粒体相关基因的预后特征，并深入研究了候选基因CAMK2A和THEM4的协同作用及其通过CAMK2A-THEM4-AKT轴调控PDAC进展的机制 | NA | 开发一个稳健的分子特征以改善PDAC的风险分层并识别潜在的治疗靶点 | 胰腺导管腺癌（PDAC）患者 | 机器学习 | 胰腺癌 | 机器学习、单细胞测序、免疫组织化学（IHC）微阵列、体内异种移植模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 596 | 2025-12-08 |
CSDE1 depletion inhibits tumor progression through enhancing B-cell infiltration in NSCLC
2025-Dec-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08282-9
PMID:41353256
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研究论文 | 本研究探讨了CSDE1基因在非小细胞肺癌（NSCLC）进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响，发现CSDE1通过调节肿瘤浸润B淋巴细胞（TIL-Bs）促进肿瘤进展 | 首次揭示了CSDE1通过调节肿瘤浸润B淋巴细胞（TIL-Bs）来促进肺癌进展的新机制，并证明B细胞在此过程中的关键作用，为肿瘤免疫治疗提供了新的潜在靶点 | 研究主要基于小鼠模型，其在人体中的具体作用机制和临床转化潜力仍需进一步验证 | 探究CSDE1在肺癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的影响 | 非小细胞肺癌（NSCLC） | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光 | 小鼠肿瘤模型 | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、免疫荧光图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 597 | 2025-12-08 |
Immune landscape-driven subtyping reveals distinct microenvironment and prognostic profiles in thymic epithelial tumors
2025-Dec-06, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01197-w
PMID:41353296
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研究论文 | 本研究通过整合公共数据集和内部验证队列的免疫相关基因表达数据，对胸腺上皮肿瘤进行了免疫亚型分类，并揭示了不同亚型在微环境特征和预后方面的显著差异 | 首次基于免疫相关基因表达谱对胸腺上皮肿瘤进行共识聚类，识别出淋巴细胞富集亚型和髓系/基质富集亚型这两种具有不同预后和微环境特征的亚型，并利用单细胞转录组学揭示了MIF介导的CD8+ T细胞功能抑制机制 | 研究样本量相对有限（总样本数119例），且验证队列主要依赖于单一机构（瑞金医院）的FFPE-RNA测序数据，未来需要在更大规模的多中心队列中进行验证 | 揭示胸腺上皮肿瘤的免疫异质性，建立与临床相关的免疫分类系统，为个性化治疗策略提供依据 | 胸腺上皮肿瘤患者样本 | 数字病理学 | 胸腺上皮肿瘤 | RNA测序，单细胞转录组学，多重免疫荧光 | 共识聚类，ROC曲线分析 | 基因表达数据，单细胞转录组数据，免疫荧光图像数据 | 119例（LRS亚型86例，MSRS亚型33例） | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 598 | 2025-12-08 |
From bulk RNA sequencing to spatial transcriptomics: a comparative review of differential gene expression analysis methods
2025-Dec-06, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00884-w
PMID:41353326
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 599 | 2025-12-08 |
Plate-based 10X Genomics-compatible single-cell RNA-sequencing based on Smart-seq3xpress
2025-Dec-06, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-12286-2
PMID:41353535
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研究论文 | 本文开发了一种基于Smart-seq3xpress原理的平板式、与10X Genomics兼容的单细胞RNA测序策略，旨在解决10X技术在小规模细胞群体分析中的限制 | PB10X方法结合了平板式单细胞RNA测序的灵活性和10X测序库制备的稳健性，同时保持与下游Cell Ranger数据处理的完全兼容性，特别在免疫受体库测序中表现出色 | NA | 开发一种成本效益高、与10X兼容的平板式单细胞RNA测序方法，以支持小规模细胞群体的基因表达和免疫受体分析 | Jurkat淋巴母细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达和T细胞受体序列数据 | NA | 10X Genomics | 单细胞RNA-seq | 10X Single Cell 5' library construction kit, 5' V(D)J kit, 5' Gene Expression kit | 基于Smart-seq3xpress原理的平板式10X兼容策略，支持384孔板中的荧光激活细胞分选 |
| 600 | 2025-12-08 |
Regenerative teeth induced by in vitro mesenchymal cells in mice via repressing BMP4 and activating retinoic acid/osteopontin
2025-Dec-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00271-9
PMID:41345270
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研究论文 | 本研究开发了一种优化的N2B27培养基，成功在小鼠中通过抑制BMP4和激活视黄酸/骨桥蛋白，诱导了体外培养的牙间充质细胞再生牙齿 | 开发了能维持牙间充质细胞成牙潜能长达14天的优化培养基，显著优于传统方法（≤24小时），并揭示了BMP4抑制和骨桥蛋白/视黄酸激活在牙齿再生中的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类细胞或临床环境中验证，且培养基的长期效果和安全性需进一步评估 | 研究牙齿再生中牙间充质细胞的体外培养和功能维持，以推进组织工程应用 | 小鼠牙间充质细胞（mDMCs） | 组织工程与再生医学 | 牙齿疾病或缺失 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |