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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-07-15
High-Risk Rhabdomyosarcomas Feature a Convergent Cell State
2026-Jul-14, Cancer research IF:12.5Q1
研究论文 该论文通过单细胞转录组学等技术发现高危横纹肌肉瘤的癌细胞无论FOXO1融合状态如何,均会汇聚到一个共同的细胞状态,并表现出神经特征 首次发现高危横纹肌肉瘤存在超越传统分子和组织学边界的汇聚性细胞状态,并揭示该状态表现出神经特征 摘要中未提及局限性 研究高危横纹肌肉瘤的细胞状态特征及其与FOXO1融合状态的关系 高危横纹肌肉瘤的癌细胞 数字病理学 横纹肌肉瘤 单细胞转录组测序、核转录组学、染色质可及性分析、空间转录组学、扰动研究 未提及 单细胞转录组数据、核转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 未提及具体样本数量 未提及 单细胞RNA测序、空间转录组学 未提及 未提及
582 2026-07-15
Concurrent genetic and non-genetic resistance mechanisms to KRAS inhibition in colorectal cancer
2026-Jul-13, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 该研究利用靶向外显子测序和空间转录组学技术,探究结直肠癌患者对KRAS抑制剂与EGFR抑制剂联合治疗产生耐药性的遗传与非遗传机制 首次在患者匹配的结直肠癌活检样本中,结合靶向外显子测序与空间转录组学,揭示KRAS抑制剂耐药过程中遗传事件与转录适应状态共存,并发现TBK1可作为克服耐药的新靶点 未明确说明具体局限性 阐明结直肠癌对KRAS抑制剂产生耐药性的遗传与非遗传机制 结直肠癌患者活检样本、人类和小鼠类器官模型 数字病理学 结直肠癌 靶向外显子测序、空间转录组学 NA 测序数据、空间转录组数据 患者匹配的结直肠癌活检样本 NA 空间转录组学 NA NA
583 2026-07-15
Hypoxia shapes both therapeutic response and resistance in metastatic clear cell renal cell carcinoma
2026-Jul-13, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 研究低氧在转移性透明细胞肾细胞癌中如何同时塑造治疗反应和耐药性 鉴定出低氧响应的SPP1肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)作为治疗反应和耐药性的双重标志,揭示低氧在VEGFR-TKI/aPD-1治疗中的双面作用 主要基于小鼠模型,人类数据来自队列分析,需要进一步验证低氧机制在临床中的应用 探究VEGFR-TKI和aPD-1联合治疗下肿瘤微环境演变及低氧在ccRCC治疗反应与耐药中的作用 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)肿瘤微环境中的巨噬细胞和低氧状态 生物信息学, 癌症免疫学 透明细胞肾细胞癌(ccRCC) 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 NA 单细胞转录组数据, 成像数据 包含转基因ccRCC小鼠模型以及人类治疗队列样本,具体数量未指定 NA 单细胞RNA测序, 成像质谱流式 NA NA
584 2026-07-15
Pathogenesis of diffuse large B cell lymphoma proteogenotypes
2026-Jul-13, Cancer cell IF:48.8Q1
研究论文 通过整合蛋白质组、转录组和基因组数据,识别出弥漫性大B细胞淋巴瘤的七种蛋白质基因组型,揭示其病理生理特征 首次基于蛋白质组学数据对DLBCL进行分子分型,发现与预后不良相关的新亚型PG4,并揭示其独特的肿瘤微环境特征 未明确说明研究局限性,但蛋白质组学数据的覆盖深度和样本量可能限制某些罕见亚型的发现 解析弥漫性大B细胞淋巴瘤的临床和分子异质性,为诊断和治疗提供蛋白质基因组学框架 478例弥漫性大B细胞淋巴瘤肿瘤样本 数字病理学 弥漫性大B细胞淋巴瘤 蛋白质组学、转录组学、基因组学、单细胞测序、空间转录组学 NA 蛋白质组、转录组、基因组、单细胞、空间转录组数据 478例DLBCL肿瘤样本 NA 单细胞RNA测序、空间转录组学 NA NA
585 2026-07-15
Construction and multi-omics validation of a five-gene ferroptosis-based model for predicting prognosis and therapy response in pancreatic ductal adenocarcinoma with immune landscape analysis
2026-Jul-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 构建了一个基于铁死亡的5基因预后模型,并在胰腺导管腺癌中进行了多组学验证,结合免疫景观分析预测预后和治疗反应 首次结合铁死亡相关基因与多组学分析(包括单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫浸润分析)构建胰腺导管腺癌的预后模型,并验证了其与免疫逃逸和药物反应的关联 模型基于公开数据集,可能受样本异质性影响,且铁死亡相关基因的功能机制尚未完全阐明 建立基于铁死亡相关基因的预后模型,评估其在胰腺导管腺癌中的临床意义和治疗反应预测能力 胰腺导管腺癌患者样本及其转录组数据、单细胞RNA测序数据和空间转录组数据 机器学习 胰腺导管腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 Cox回归模型(单变量、LASSO、多变量) 基因表达数据 TCGA-PDAC队列、GTEx数据、GEO数据集(GSE62452、GSE78229、GSE183795、GSE212966)和空间转录组样本GSM8452850 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
586 2026-07-15
A machine learning-guided epithelial plasticity score refines prognostication and immune-context stratification in muscle-invasive bladder cancer
2026-Jul-13, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 开发了基于机器学习的上皮可塑性评分(EPRS)用于改善肌层浸润性膀胱癌的预后评估和免疫微环境分层 首次通过整合机器学习策略和连续可塑性指数,构建了可塑性相关风险评分,揭示了基底-腔上皮可塑性轴与基质-免疫重塑的关联 未提及外部验证队列的种族多样性及潜在选择偏倚 开发并验证一个基于上皮可塑性的风险评分,以改善MIBC患者的预后分层和免疫特征理解 肌层浸润性膀胱癌(MIBC)患者样本 机器学习 膀胱癌 RNA-seq, 单细胞RNA测序 Ridge回归模型 转录组数据 368例TCGA-MIBC原发性病例 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
587 2026-07-15
Sustained AMPAR expression in CA3 neurons may mediate neuroprotection following FLASH-RT
2026-Jul-13, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 通过空间转录组学揭示FLASH放疗对正常脑组织长期神经保护作用的早期机制,发现CA3神经元中AMPAR持续表达可能介导神经保护 首次利用空间转录组学技术分析FLASH放疗后海马CA3区和齿状回神经元的早期转录特征,发现Gria基因上调及AMPAR蛋白持续表达与长期认知保护相关 仅基于小鼠模型,需进一步验证人类脑组织中的机制 阐明FLASH放疗在正常脑组织中产生长期神经保护效应的早期分子机制 C57BL/6J小鼠的海马CA3区和齿状回神经元及神经祖细胞 机器学习 神经退行性疾病 空间转录组学 NA 转录组数据 C57BL/6J小鼠全脑照射后样本,涉及1或3次10 Gy照射的不同剂量率组 Nanostring 空间转录组学 Nanostring空间转录组学平台 Nanostring空间转录组学分析
588 2026-07-15
Tumor innervation drives cancer cell plasticity and immune evasion through the SLPI-GZMB axis
2026-Jul-13, Cancer letters IF:9.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序,揭示肿瘤神经支配通过SLPI-GZMB轴驱动癌细胞可塑性和免疫逃逸的机制 首次发现神经来源的P物质通过TACR1受体诱导肿瘤细胞分泌SLPI,并明确SLPI通过抑制颗粒酶B介导的细胞凋亡和焦亡促进免疫逃逸,同时提出SP-TACR1-SLPI轴作为联合免疫治疗的靶点 主要基于小鼠模型和临床数据集分析,尚需在人类肿瘤中进一步验证;SLPI在神经支配肿瘤中的具体调控网络及下游信号通路的全貌尚未完全阐明 探究神经信号如何调控癌细胞可塑性和免疫抵抗的分子机制 小鼠神经内与非神经内肿瘤配对模型、人肿瘤样本(具有神经浸润)以及临床免疫治疗数据集 机器学习 肿瘤 单细胞RNA测序、蛋白质组学、生物化学分析 NA 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 小鼠模型(具体数量未提及)及人类肿瘤临床样本 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
589 2026-07-15
Restoring the CD226 in CD8+T cells overcomes TIGIT-refractory immunity in HER2+ breast cancer
2026-Jul-13, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究揭示通过恢复CD8+T细胞中的CD226来克服HER2阳性乳腺癌中TIGIT介导的免疫耐受机制 首次发现TIGIT信号通路是HER2+乳腺癌免疫治疗耐受的关键轴,并证明恢复CD226共刺激受体可逆转这一耐受 未提及临床转化中的潜在副作用或长期治疗效果的评估 探究HER2+乳腺癌对免疫检查点阻断治疗耐受的机制并开发新的联合治疗策略 HER2阳性乳腺癌患者和动物模型中的CD8+T细胞、肿瘤细胞及肿瘤微环境 免疫肿瘤学 乳腺癌 单细胞转录组学、体外共培养实验、体内扰动实验、多重组织分析 动物模型(抗HER2非敏感小鼠模型)、患者队列(新辅助治疗非pCR队列) 单细胞转录组数据、临床队列数据、组织切片数据 采用抗HER2非敏感小鼠模型和包含新辅助治疗非pCR患者队列 NA 单细胞RNA测序 NA NA
590 2026-07-15
Transcriptomic analysis of tissue-resident memory T cells of the fallopian tube reveals a precursor immune surveillance network for ovarian cancer prevention
2026-Jul-13, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序分析输卵管组织驻留记忆样T细胞,揭示其在卵巢癌预防中的前体免疫监视网络 首次发现输卵管来源与肿瘤浸润的驻留记忆样T细胞之间存在显著克隆和功能重叠,并鉴定出与表观遗传可塑性和代谢适应相关的新型SIK3高表达亚群 未提及 研究输卵管组织驻留记忆样T细胞在卵巢癌免疫监视和预防中的作用 来自患者配对非癌性输卵管、转移性肿瘤和外周血的组织驻留记忆样T细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序、配对T细胞受体测序、类器官共培养 NA 单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 患者配对样本(非癌性输卵管、转移性肿瘤和外周血) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序和配对T细胞受体测序
591 2026-07-15
Dynamic single-cell transcriptomic analysis of peripheral blood mononuclear cells identifies novel biomarkers for autoimmune encephalitis
2026-Jul-13, Molecular psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 对自身免疫性脑炎患者外周血单核细胞进行动态单细胞转录组分析,鉴定出NKT细胞及其亚群NKT-6减少可作为新型生物标志物 首次通过动态单细胞转录组分析揭示自然杀伤T细胞及其亚群NKT-6减少是自身免疫性脑炎的特异性标志物,并在多种神经精神疾病独立队列中验证其疾病特异性 未提及具体局限性 鉴定自身免疫性脑炎的新型生物标志物 自身免疫性脑炎患者外周血单核细胞 机器学习 自身免疫性脑炎 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 自身免疫性脑炎急性期患者及六个月序贯治疗随访样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞3'测序
592 2026-07-15
Ex utero 3D culture system illuminates post-implantation development and functions of the mouse yolk sac
2026-Jul-13, Communications biology IF:5.2Q1
研究论文 提出一种新型3D仿生培养平台,在体外精确重现小鼠卵黄囊的植入后发育过程,并揭示其代谢、凝血、血管发育和屏障形成等新功能 开发了一种操作简单、高可重复性的3D仿生培养平台,首次在体外成功模拟了卵黄囊的中胚层、血管和内胚层分化,并通过单细胞RNA测序确认其与体内模型的保真度,揭示了卵黄囊在糖代谢、脂代谢、蛋白质代谢、凝血、物质运输和屏障形成中的新功能 未明确提及局限性 阐明卵黄囊在植入后发育中的分子和细胞机制,优化全胚胎培养系统 小鼠卵黄囊及其发育过程 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 3D仿生培养平台 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
593 2026-07-15
High-resolution reconstruction of cell-type-specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2026-Jul-13, Nature biotechnology IF:33.1Q1
研究论文 引入深度学习方法DeepDETAILS,从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 提出一种准监督的交叉模态解卷积框架DeepDETAILS,利用scATAC-seq参考库对批量数据集进行碱基对分辨率基因组信号映射,适用于多种组学数据 未明确说明 开发一种从批量测序样本中解析细胞类型特异性转录调控信号的方法 人类组织和细胞类型,包括39种组织和86种细胞类型 机器学习 原发性硬化性胆管炎 scRNA-seq, scATAC-seq, PRO-cap, PRO-seq, ChIP-seq 深度学习 基因组信号数据 39种人类组织、86种细胞类型 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
594 2026-07-15
Single-cell and spatial transcriptomic analysis reveal distinct tumor microenvironment signatures in primary and recurrent hypopharyngeal squamous cell carcinoma
2026-Jul-13, Cellular & molecular biology letters IF:9.2Q1
研究论文 通过单细胞和空间转录组学分析揭示原发性和复发性下咽鳞状细胞癌中不同的肿瘤微环境特征 首次系统描绘复发性下咽鳞状细胞癌的肿瘤微环境特征,发现恶性上皮细胞通过IGF2BP2介导的m6A修饰稳定SMAD3 mRNA进而激活TGF-β信号,以及FN1介导的基质激活和CTLA4上调驱动的免疫逃逸机制 样本量较小(原发6例、复发3例),需要更大队列验证;功能验证实验有限,未深入探讨IGF2BP2抑制剂或CTLA4阻断的疗效 阐明下咽鳞状细胞癌复发相关的肿瘤微环境特征和分子机制 原发性和复发性下咽鳞状细胞癌的肿瘤组织样本 数字病理学 下咽鳞状细胞癌 scRNA-seq, 空间转录组学 NA 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 6例原发性下咽鳞状细胞癌和3例复发性下咽鳞状细胞癌样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序平台, 10x Visium空间转录组学平台
595 2026-07-15
Machine learning-based prognostic model and single-cell transcriptomic integration for identifying brain metastasis-associated malignant subpopulations and potential therapeutic targets in lung adenocarcinoma
2026-Jul-13, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 通过机器学习构建肺腺癌脑转移预后模型,并结合单细胞转录组学分析识别恶性亚群及潜在治疗靶点 首次整合机器学习算法与单细胞转录组分析,构建12基因脑转移相关预后签名,并发现SEC61G和CFL1作为新的治疗候选生物标志物 研究主要基于公开数据集,可能需要更多独立外部队列验证;单细胞分析样本量有限,可能影响细胞亚群全面性 识别肺腺癌脑转移的生物标志物和治疗靶点,并构建预后模型 肺腺癌脑转移样本的单细胞转录组数据以及多个肺腺癌患者队列 单细胞转录组学 肺腺癌、脑转移 单细胞RNA-seq、inferCNV、hdWGCNA、机器学习、qRT-PCR、免疫组化 机器学习预后模型(101种算法组合) 单细胞转录组数据 肺腺癌脑转移样本及多个肺腺癌生存队列 NA 单细胞RNA-seq NA NA
596 2026-07-15
An integrative epigenomic and single-cell framework identifies a prognostic DNA methylation risk score and ZNF638 silencing in urothelial carcinoma
2026-Jul-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 该研究通过整合表观基因组和单细胞分析框架,鉴定了尿路上皮癌中的预后DNA甲基化风险评分和ZNF638沉默 首次构建了基于441个预后甲基化单倍型块的DNA甲基化风险评分,并在多个独立队列中验证其预后价值;揭示了ZNF638通过调控抗病毒先天免疫基因表达发挥肿瘤抑制作用的新机制 需在前瞻性队列和功能研究中进一步验证ZNF638的治疗相关性,研究为回顾性注册且样本量有限 阐明表观遗传失调如何塑造尿路上皮癌的肿瘤身份、免疫微环境和临床风险 尿路上皮癌患者的肿瘤组织和细胞系 数字病理学 尿路上皮癌 EM-seq, WGBS, scRNA-seq, RNA-seq, CUT&Tag NA DNA甲基化数据、单细胞RNA测序数据、转录组数据 72例EM-seq样本、9例WGBS样本、9例scRNA-seq样本、574例验证队列 Illumina 单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序、EM-seq Illumina NovaSeq NA
597 2026-07-15
Spatial organization of the TNBC tumor microenvironment: multicellular niches, T-cell bottlenecks, and therapeutic opportunities
2026-Jul-13, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
综述 综述了三阴性乳腺癌肿瘤微环境的空间组织,包括多细胞微环境、T细胞瓶颈和治疗机会 整合单细胞测序、空间转录组学和多重成像技术,系统阐述了微环境中多细胞互作的空间异质性及免疫抑制微环境的形成机制 主要基于现有文献总结,可能缺乏原创新数据;对跨队列可重复性微环境结构的验证尚有限 揭示TNBC肿瘤微环境的空间组织模式及其对免疫治疗反应的影响,提出基于空间特征的精准分层和联合治疗策略 三阴性乳腺癌(TNBC)的肿瘤微环境,包括免疫细胞、成纤维细胞、血管、神经等组分及其空间互作 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞测序, 空间转录组学, 多重成像 NA 图像, 文本 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3’测序, 10x Visium FFPE空间转录组学
598 2026-07-15
Integrative transcriptomics and scpagwas analysis predicts immune-related markers of preeclampsia
2026-Jul-11, Journal of reproductive immunology IF:2.9Q2
研究论文 整合转录组学和scPagwas分析预测子痫前期免疫相关标志物 首次整合单细胞RNA测序与批量转录组数据,利用scPagwas算法评估遗传关联,并结合LASSO和随机森林算法筛选出子痫前期巨噬细胞中三个关键枢纽基因(ARL4C、SLC16A10、DAB2) 样本量较小(单细胞数据4例,批量数据157例),且主要基于公共数据库的分析,缺乏实验验证 识别子痫前期胎盘组织中的免疫调控因子 子痫前期患者和正常妊娠的胎盘组织 机器学习 子痫前期 单细胞RNA测序、批量转录组测序、scPagwas分析 LASSO、随机森林、Monocle 基因表达数据 单细胞RNA测序4例,批量转录组数据157例 NA 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq NA NA
599 2026-07-15
Spatial transcriptome profiling links SERPINA3 to nerve-associated immunosuppression in pancreatic cancer
2026-Jul-10, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 利用空间转录组学等技术揭示SERPINA3在胰腺癌神经相关免疫抑制中的作用 首次通过空间转录组学等方法阐明感觉神经元诱导的SERPINA3促进胰腺癌免疫逃逸的机制 尚处于临床前研究阶段,需进一步验证临床转化潜力 探究胰腺导管腺癌中神经-免疫相互作用的机制 胰腺导管腺癌肿瘤细胞、感觉神经元、CD8 T细胞等 机器学习 胰腺癌 空间转录组学、多重免疫荧光、单细胞RNA测序 NA 空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 涉及多种细胞培养和动物模型,样本量未明确说明 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium 10x Visium空间转录组学平台
600 2026-07-15
High salt supplementation of a MASH-inducing diet causes lean MASH phenotype with increased hepatic urea cycle activity and EIF5A hypusination
2026-Jul-09, Molecular metabolism IF:7.0Q1
研究论文 高盐补充诱导的瘦型MASH小鼠模型揭示了肝脏尿素循环活性增强和EIF5A羟脯氨酸化增加与肥胖型MASH不同的机制 创建了一种饮食诱导的瘦型MASH小鼠模型,并发现了与肥胖型MASH在肝脏尿素循环、线粒体蛋白合成和免疫细胞激活方面的差异 目前缺乏合适的动物模型,且环境触发因素和分子机制尚不明确 探究瘦型MASH的环境触发因素和分子机制,建立合适的动物模型 小鼠(Western diet加液体果糖诱导的肥胖型MASH和高盐补充的瘦型MASH模型) 机器学习 代谢性肝病 单细胞测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
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