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当前共找到 43167 篇文献,本页显示第 581 - 600 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
581 2026-09-05
Integrated analysis of single-cell and bulk RNA-sequence data reveal plasma dendritic cell-related diagnostic model for Sjögren's syndrome based on machine learning
2026, Journal of dental sciences IF:3.4Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量RNA测序数据,基于浆细胞样树突状细胞(pDCs)相关基因特征构建了干燥综合征的诊断模型。 结合单细胞和批量转录组数据,利用15种机器学习算法的204种组合筛选诊断生物标志物,构建了高精度的nomogram模型,并揭示了pDCs与单核细胞之间的MIF信号相互作用。 摘要中未提及明确的局限性。 开发基于pDC相关基因特征的诊断模型,并探索pDCs在干燥综合征发病机制中的作用。 干燥综合征患者的单细胞和批量转录组数据。 机器学习 干燥综合征 单细胞RNA测序、批量RNA测序、机器学习 机器学习模型(具体类型未指定) 转录组数据 训练集和独立验证集(具体样本数未提供) NA 单细胞RNA测序、批量RNA测序 NA NA
582 2026-09-05
Hormone priming and metabolic engineering of phytohormone crosstalk in rice under combined biotic and abiotic stresses: a multi-omics perspective for climate-resilient crop development
2026, Frontiers in plant science IF:4.1Q1
综述 本文综述了水稻在生物和非生物联合胁迫下,通过激素引发和代谢工程调控植物激素串扰的多组学视角,旨在为气候适应性作物开发提供系统级路线图 整合了空间和单细胞转录组学解析激素引发与表观遗传胁迫记忆的分子架构,并讨论了CRISPR-Cas9、碱基/引物编辑、合成基因回路以及人工智能和数字孪生等前沿技术在精准修饰和预测性胁迫管理中的应用 未提及具体局限性 提出一个系统级路线图,用于开发气候适应性水稻品种,使其在复杂组合胁迫下维持产量稳定性,保障全球粮食安全 水稻 多组学、代谢工程、人工智能 NA 多组学整合(包括空间和单细胞转录组学)、代谢工程、基因组编辑、人工智能 数字孪生 组学数据(转录组学等)、计算模型 NA NA 空间转录组学、单细胞转录组学 NA NA
583 2026-09-05
Targeting KRAS Inhibitor-Resistant Pancreatic Cancer with an MUC1-C Antibody-Drug Conjugate
2025-Dec-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 本研究探讨了MUC1-C蛋白在胰腺导管腺癌对KRAS抑制剂耐药中的作用,并评估了抗MUC1-C抗体药物偶联物的治疗效果 首次揭示MUC1-C通过激活炎症IFN I型通路介导PDAC对KRAS G12D抑制剂的耐药,并证明抗MUC1-C ADC对耐药模型有效 主要基于PDAC KRAS G12D突变模型,未涵盖其他KRAS突变类型,且ADC的临床应用需进一步验证 阐明MUC1-C在PDAC对KRAS抑制剂耐药中的机制,并评估靶向MUC1-C的ADC治疗策略 PDAC KRAS G12D突变细胞系、患者来源的KRAS抑制剂耐药类器官和异种移植模型,以及患者肿瘤组织 药物研发、肿瘤学 胰腺导管腺癌 单细胞RNA测序、免疫组化、ADC技术 细胞系、患者来源类器官、异种移植模型 基因表达数据、图像 3种PDAC KRAS G12D突变细胞系,患者来源类器官和异种移植模型,以及患者肿瘤样本(具体数量未提及) 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 用于肿瘤组织的单细胞RNA测序
584 2026-09-05
Construction of a gene-metabolite-microbiome regulatory network reveals novel therapeutic targets in bladder cancer through multi-omics analysis
2025-12, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 通过多组学分析构建膀胱癌基因-代谢物-微生物调控网络,揭示潜在治疗靶点 首次整合转录组、全外显子测序、代谢组和肿瘤内微生物组数据进行膀胱癌多组学分析,并构建基因-代谢物-微生物调控网络 未提供明确的局限性信息 阐明膀胱癌的潜在发病机制,并识别新的治疗靶点 膀胱癌患者的肿瘤组织和相邻正常组织 多组学分析 膀胱癌 转录组测序, 全外显子测序, 代谢组学分析, 微生物组分析, 单细胞测序 NA 转录组数据, 全外显子数据, 代谢组数据, 微生物组数据, 单细胞数据 膀胱癌患者的肿瘤及相邻组织样本 NA 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 代谢组学, 微生物组分析 NA NA
585 2026-09-05
Identification of a prognostic signature consisting of three macrophage-related genes for glioblastoma based on bulk and single-cell transcriptomes analyses
2025-12, Annals of medicine IF:4.9Q1
研究论文 基于批量及单细胞转录组分析,识别出由三个巨噬细胞相关基因组成的胶质母细胞瘤预后特征 首次建立了由ISG20、PARP12和IFIT5三个巨噬细胞相关基因组成的预后特征,并验证其在预测治疗反应中的价值 主要在转录组水平分析,未进行功能实验验证,且预后特征的临床转化需进一步验证 识别与胶质母细胞瘤预后和治疗反应相关的巨噬细胞相关基因 胶质母细胞瘤患者 生物信息学 胶质母细胞瘤 RNA-seq、单细胞RNA-seq 基因特征模型 转录组数据、单细胞转录组数据 TCGA-GBM 159例,CGGA-GBM 374例 NA bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、多重免疫荧光 NA NA
586 2026-09-05
Cancer-testis antigen ACRBP: Cytotoxic response to its HLA-A2 restricted peptide and immune features in ovarian cancer
2025-12, Human vaccines & immunotherapeutics IF:4.1Q2
研究论文 本研究评估了癌症睾丸抗原ACRBP的HLA-A2限制性肽段诱导的细胞毒性T淋巴细胞在卵巢癌中的抗肿瘤效果,并通过单细胞和批量RNA测序分析了ACRBP的免疫特征。 首次在体内和体外验证了ACRBP肽诱导的CTLs对卵巢癌的抗肿瘤作用,并结合单细胞和批量转录组数据揭示了ACRBP表达与免疫分子及化疗反应的相关性。 尚不清楚肽诱导的T细胞反应在卵巢癌患者中的临床相关性,且研究的样本量有限。 评估ACRBP肽段诱导的细胞毒性T淋巴细胞在卵巢癌中的抗肿瘤效果,并探究ACRBP表达的免疫学影响及潜在治疗应用。 卵巢癌细胞系OVCAR-3、SCID小鼠、卵巢癌患者外周血单核细胞、8例卵巢癌患者的单细胞RNA测序数据和308例TCGA卵巢癌批量RNA测序数据。 数字病理学 卵巢癌 RNA测序 NA 图像、文本 8例卵巢癌患者单细胞样本,308例TCGA卵巢癌批量样本 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
587 2026-09-05
Circulating Cathepsin D Exacerbates Injury-Induced Brain Damage by Promoting Neutrophil Infiltration Into the Brain
2025-11-04, Journal of the American Heart Association IF:5.0Q1
研究论文 本研究揭示了循环中的组织蛋白酶D(CTSD)通过上调脑内皮VCAM-1表达促进中性粒细胞浸润,从而加重创伤和缺血性脑损伤的机制。 首次阐明循环中的非酶原型CTSD(pro-CTSD)通过激活脑内皮细胞并上调VCAM-1,促进中性粒细胞跨内皮迁移,加重脑损伤,为脑损伤治疗提供了新靶点。 未明确CTSD下调在临床上的应用安全性及长期效果,且研究仅限于小鼠模型,需进一步验证于人类。 探究循环CTSD水平对脑损伤后炎症反应和神经功能恢复的影响及其分子机制。 转基因高表达CTSD小鼠(hCTSDhi)和CTSD敲除小鼠(CTSDMono),以及其脑组织和内皮细胞。 神经科学 脑损伤(包括创伤性脑损伤和缺血性损伤) 单细胞RNA测序 转基因小鼠模型 基因表达数据 两组转基因hCTSDhi小鼠分别用于创伤和缺血模型,另有CTSDMono敲除小鼠;未提供具体样本数。 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
588 2026-09-05
Triple checkpoint blockade of PD-1, Tim-3, and Lag-3 enhances adoptive T cell immunotherapy in a mouse model of ovarian cancer
2025-Sep-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 该研究在卵巢癌小鼠模型中评估了PD-1、Tim-3和Lag-3三重阻断联合工程化T细胞治疗的效果,发现三重阻断可显著增强T细胞功能并延长生存期。 首次在实体瘤模型中证明同时靶向PD-1、Tim-3和Lag-3三种免疫检查点的三重阻断联合工程化T细胞治疗,具有更好的抗肿瘤效果。 该研究仅在卵巢癌小鼠模型中进行,需要进一步在人体内验证疗效和安全性。 提高过继性T细胞疗法在卵巢癌中的疗效。 卵巢癌小鼠模型中的工程化T细胞(表达靶向间皮素MSLN的T细胞受体)和肿瘤微环境。 癌症免疫疗法、基因工程T细胞 卵巢癌 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据(单细胞RNA测序) 卵巢癌小鼠模型中的T细胞样本,具体数量未提及。 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
589 2026-09-05
Unraveling the Role of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from the Crosstalk between Immunometabolism and Ferroptosis
2025-Sep-18, Current neuropharmacology IF:4.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,探索了血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的作用机制,特别是免疫代谢与铁死亡之间的相互作用。 首次将血管周围巨噬细胞的免疫代谢与铁死亡联系起来,并利用孟德尔随机化识别了八个与AD风险因果相关的关键基因,为AD发病机制提供了新视角。 结果主要基于公开数据库的分析,缺乏实验验证;样本量可能有限,且未涉及功能实验证实因果关系。 阐明血管周围巨噬细胞是否通过免疫代谢与铁死亡的串扰参与AD病理,并识别关键基因作为潜在治疗靶点。 AD患者和对照组的血管周围巨噬细胞 免疫学、神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、孟德尔随机化分析、免疫细胞浸润分析、转录因子分析 NA 单细胞基因表达数据 来自GEO数据库的AD患者和对照组样本,具体数量未在摘要中说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
590 2026-09-05
Essential role of CD56dimNKG2C+ NK cells trained by SARS-CoV-2 vaccines in protecting against COVID-19
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
研究论文 本研究探讨了SARS-CoV-2灭活疫苗诱导的CD56dimNKG2C+ NK细胞在预防COVID-19中的关键作用,并揭示其与巨噬细胞和T细胞协同保护机制 首次从先天免疫角度评估疫苗效果,强调特定NK细胞亚群(CD56dimNKG2C+)和巨噬细胞在疫苗保护中的重要性,并利用单细胞测序和质谱流式揭示其在衰老个体中的缺陷 研究主要基于猕猴模型和人体样本,样本量可能有限,且未深入探讨疫苗诱导NK细胞的具体分子机制 评估SARS-CoV-2疫苗诱导的先天免疫应答,特别是NK细胞和巨噬细胞在抗病毒保护中的作用,以优化疫苗开发 猕猴模型及人类外周血单核细胞,重点关注CD56dimNKG2C+ NK细胞、M2样巨噬细胞、CD8 T细胞和经典单核细胞 免疫学、单细胞组学 COVID-19 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术(CyTOF) 不适用(未使用深度学习模型) 单细胞转录组数据、质谱流式数据 猕猴模型及人类受试者(具体数量未提供) 10x Genomics、Fluidigm 单细胞RNA测序、质谱流式 10x Chromium、CyTOF 单细胞RNA测序使用10x Chromium平台,质谱流式使用Fluidigm CyTOF系统
591 2026-09-05
CRISPR for cystic fibrosis: Advances and insights from a systematic review
2025-Sep-03, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy IF:12.1Q1
综述 本文通过系统综述,分析了27篇关于CRISPR技术靶向囊性纤维化(CF)致病基因突变的研究,总结策略设计、编辑效率及功能恢复等,为基因编辑疗法提供见解。 本综述通过横向比较多篇研究,全面评估了不同CRISPR技术(如同源定向修复、碱基编辑和引导编辑)在CF治疗中的应用,并强调了标准化报告以及单细胞RNA测序和体内研究的必要性,提供了跨研究的技术视角。 综述可能受限于已发表研究的异质性,缺乏标准化的效率和功能恢复报告,且单细胞RNA测序和体内研究数据有限,限制了临床相关结论的得出。 系统梳理CRISPR技术在CF基因编辑中的应用现状,评估不同策略的优缺点,并为未来研究和临床治疗提供技术指导。 27篇关于CRISPR技术应用于囊性纤维化(CF)相关CFTR基因突变编辑的研究文章。 基因组编辑 囊性纤维化 CRISPR基因编辑,同源定向修复,碱基编辑,引导编辑 NA 文本 27篇研究文章 NA NA NA NA
592 2026-09-05
OmnibusX: A unified platform for accessible multi-omics analysis
2025-09, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 OmnibusX是一个集成的、注重隐私的平台,通过用户友好界面实现无代码多组学数据分析,整合了多种技术工作流 提供一个统一的无代码平台,整合多种组学技术,并包含专有的高精度细胞类型预测引擎和交互式绘图编辑器,同时确保本地数据处理以保护隐私 未提及 降低计算门槛,提高多组学数据分析的可重复性和可及性,以加速生物发现 多组学数据集,包括批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq和空间转录组学 生物信息学 不适用 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 不适用 基因组数据 未提及 不适用 批量RNA-seq、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 不适用 不适用
593 2026-09-05
Time, the final frontier
2025-08, Molecular oncology IF:5.0Q1
评论 本文倡导在癌症研究中整合时间动态维度,推动从静态端点实验向数据驱动的连续方法转变。 强调将时间维度和空间维度相结合,推动癌症研究从静态观察转向动态连续分析,并提出开发先进活体成像、时间组学方法和计算工具。 未提及具体的研究数据或实验验证,可能缺乏实际应用案例。 主张将时间动态纳入癌症研究,以更全面地理解肿瘤异质性和微环境相互作用。 肿瘤及其微环境。 数字病理学 癌症 NA NA NA NA NA NA NA NA
594 2026-09-05
Improving cell-type composition inference in spatial transcriptomics with SpaDAMA
2025-08, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 介绍了一种名为SpaDAMA的域对抗掩码自编码器方法,用于提高空间转录组数据中细胞类型组成的推断准确率 引入域对抗学习(DAL)来弥合scRNA-seq与ST数据之间的模态差异,并采用掩码策略降噪,以增强模型从真实ST数据中提取可靠特征的能力 未详细提及方法的局限性 改进空间转录组数据中细胞类型组成的推断,以支持疾病靶点识别和组织异质性理解 空间转录组数据(包括模拟和真实数据集)及对应的单细胞RNA测序参考数据 机器学习 不适用 空间转录组学,单细胞RNA测序 掩码自编码器(掩码自编码器),域对抗网络 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 32个模拟数据集和4个真实世界数据集 不适用 空间转录组学,单细胞RNA测序 不适用 不适用
595 2026-09-05
EZH2 coordinates memory B-cell programming and recall responses
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 该研究确定了组蛋白甲基转移酶EZH2在小鼠流感感染后记忆B细胞形成和再次应答中的关键作用 首次揭示EZH2在记忆B细胞亚群分化中的协调作用,并鉴定其潜在靶基因 未明确EZH2靶基因的直接调控机制及人类中的相关性 阐明EZH2在记忆B细胞形成和再次应答中的表观遗传调控作用 小鼠(Mus musculus)的B细胞亚群,特别是记忆B细胞 表观遗传学 流感感染 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 涉及小鼠模型,具体样本数量未提供 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序系统
596 2026-09-05
Spatial transcriptomics in glomerular diseases
2025-03-01, Rheumatology (Oxford, England)
综述 本文综述了空间转录组学在肾小球疾病中的应用,重点讨论了数字空间分析技术在免疫相关肾病和巨细胞动脉炎中的发现。 强调了空间转录组学技术及其在非肿瘤疾病中的新应用,通过数字空间分析揭示特定病变区域的差异表达基因。 技术存在预分析变异和探针选择带来的伪影问题,需结合组织病理学知识进行解读。 讨论空间转录组学技术及其在自身免疫和炎症性疾病(包括肾小球疾病)中的研究潜力,以促进疾病机制理解和预测疾病进程。 肾小球疾病(特别是pauci-immune局灶坏死性肾小球肾炎)和巨细胞动脉炎的组织样本。 空间转录组学 肾小球疾病, 巨细胞动脉炎 空间转录组学, 数字空间分析 NA 基因表达数据和病理图像 综述未提及具体样本数量 NA 空间转录组学 NA 数字空间分析技术(如Digital Spatial Profiling)
597 2026-09-05
SpaceBar enables clone tracing in spatial transcriptomic data
2025-Feb-14, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 介绍了一种名为SpaceBar的细胞条形码策略,用于在空间转录组数据中同时进行克隆追踪和空间基因表达分析 开发了由96种合成条形码序列组成的文库,可被成像型空间转录组学(seqFISH)稳健检测,并结合基因评分指标区分内在细胞信号与外在环境信号驱动的转录调控 未明确提及 实现空间转录组数据中的克隆追踪及其与基因表达分析的联合应用,并区分克隆动态与环境驱动的转录调控 肿瘤异种移植模型中的黑色素瘤细胞 数字病理学 黑色素瘤 seqFISH空间转录组学、细胞条形码 NA 空间基因表达数据 NA(未明确样本数量) NA 空间转录组学 seqFISH 成像型空间转录组学(seqFISH)
598 2026-09-05
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2025-Jan-09, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文通过整合单细胞和空间转录组学数据,构建甲状腺癌进展的图谱,识别与疾病进展相关的预后成纤维细胞亚群。 首次整合单细胞测序、空间转录组学和bulk RNA测序,系统描绘甲状腺癌从分化型到未分化型进展过程中基质细胞亚群及其空间分布的变化。 摘要未提及研究的局限性,如样本数量、验证实验或机制研究的深度等。 旨在通过整合单细胞和空间转录组学,解析甲状腺癌进展中的基质细胞异质性,并识别与肿瘤侵袭和转移相关的成纤维细胞亚群。 甲状腺癌的肿瘤细胞和基质细胞,特别是癌症相关成纤维细胞(CAFs)。 数字病理学 甲状腺癌 单细胞RNA测序、空间转录组学、bulk RNA测序 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序 NA NA
599 2026-09-05
Dissection of Gene Expression at the Single-Cell Level: scRNA-seq
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
综述 本章讨论了单细胞RNA测序(scRNA-seq)如何成为以单细胞分辨率深入理解基因表达的金标准技术 强调单细胞RNA测序通过生成条形码化单个细胞,能够追踪成千上万转录本的来源,揭示与疾病相关的新型细胞类型及不同细胞状态 文中未明确提及局限性 阐述单细胞RNA测序在单细胞水平解析基因表达的优势和应用价值 感兴趣的组织的单细胞转录组 转录组学 NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
600 2026-09-05
Integration of Imaging-based and Sequencing-based Spatial Omics Mapping on the Same Tissue Section via DBiTplus
2024-Dec-11, Research square
研究论文 DBiTplus是一种在同一组织切片上整合基于成像和基于测序的空间组学方法,结合空间转录组学和蛋白质成像实现单细胞分辨率细胞分型和基因组规模通路研究 创新点在于DBiTplus将测序为基础的空间转录组学与成像为基础的蛋白质空间图谱相结合,并通过RNaseH保留组织完整性实现高复用蛋白成像,以及开发了用于两种模态数据注册的计算流程 未明确提及局限性 开发一种整合多模态空间组学方法,以同时获取转录组和蛋白质信息,实现单细胞分辨率的细胞分型和基因组规模的生物学通路探索 小鼠胚胎、正常人淋巴结和人淋巴瘤FFPE组织 空间组学 淋巴瘤 空间转录组学、成像蛋白质组学、微流控、CODEX NA 空间转录组数据、蛋白质成像数据、图像 三种组织类型(具体数量未知) NA 空间转录组学、空间蛋白质组学 NA NA
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