单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 5941 - 5960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5941 | 2024-11-23 |
Single-Cell and Spatial Multi-omics Reveal Interferon Signaling in the Pathogenesis of Perianal Fistulizing Crohn's Disease
2024-Nov-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.08.620717
PMID:39574705
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研究论文 | 研究使用单细胞和空间多组学技术揭示了肛周瘘管性克罗恩病发病机制中的干扰素信号 | 首次通过单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和空间转录组学等多组学方法，全面分析了肛周瘘管性克罗恩病中的免疫和非免疫细胞群，并揭示了干扰素信号在疾病发病机制中的关键作用 | 研究样本量较小，且未涉及长期随访数据 | 探讨肛周瘘管性克罗恩病的发病机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 肛周瘘管性克罗恩病患者、无肛周疾病的克罗恩病患者和特发性肛周瘘管患者的黏膜细胞 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 共63名患者，包括24名肛周瘘管性克罗恩病患者、10名无肛周疾病的克罗恩病患者和29名特发性肛周瘘管患者 |
| 5942 | 2024-11-23 |
Spatial Transcriptomics Reveals the Temporal Architecture of the Seminiferous Epithelial Cycle and Precise Sertoli-Germ Synchronization
2024-Nov-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.28.620681
PMID:39554074
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研究论文 | 本文利用空间转录组学技术研究了小鼠睾丸中精原上皮周期的时间结构和Sertoli细胞与生殖细胞的精确同步 | 首次通过空间转录组学技术揭示了精原上皮周期中的转录变化模式，并发现Sertoli细胞与生殖细胞发育的周期性转录特征紧密同步 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及其他物种 | 揭示精原上皮周期中的转录变化及其与生殖细胞和体细胞的关联 | 小鼠睾丸中的生殖细胞和体细胞 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 216,090个细胞，2,638个基因 |
| 5943 | 2024-11-23 |
Tryptophan 2,3-dioxygenase-positive matrix fibroblasts fuel breast cancer lung metastasis via kynurenine-mediated ferroptosis resistance of metastatic cells and T cell dysfunction
2024-Nov, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12608
PMID:39221971
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研究论文 | 研究揭示了色氨酸2,3-双加氧酶阳性基质成纤维细胞通过犬尿氨酸介导的铁死亡抵抗和T细胞功能障碍促进乳腺癌肺转移的作用 | 首次揭示了色氨酸2,3-双加氧酶阳性基质成纤维细胞在乳腺癌肺转移中的关键作用，并提出了针对肺特异性基质细胞代谢的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人体中验证其结果 | 解析成纤维细胞异质性及其在乳腺癌肺转移形成中的不同作用 | 乳腺癌肺转移中的成纤维细胞和T细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用小鼠模型进行实验，具体样本数量未在摘要中提及 |
| 5944 | 2024-11-23 |
Blockade of CCR5+ T Cell Accumulation in the Tumor Microenvironment Optimizes Anti-TGF-β/PD-L1 Bispecific Antibody
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408598
PMID:39303165
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研究论文 | 研究通过scRNA-seq分析肿瘤微环境变化，发现YM101治疗后存在免疫抑制性CCR5 T细胞，并提出使用Maraviroc抑制CCR5 T细胞积累以优化YM101疗效 | 首次揭示了YM101治疗后肿瘤微环境中CCR5 T细胞的免疫抑制作用，并提出联合使用Maraviroc以增强YM101的抗肿瘤效果 | 研究主要在肿瘤小鼠模型中进行，尚未在临床试验中验证 | 探索肿瘤微环境中的免疫抑制因素，优化YM101抗肿瘤效果 | 肿瘤微环境中的免疫细胞和免疫抑制机制 | NA | NA | scRNA-seq | NA | RNA | 多只肿瘤小鼠 |
| 5945 | 2024-11-23 |
Spatiotemporal Analysis of Mesenchymal Stem Cells Fate Determination by Inflammatory Niche Following Soft Tissue Injury at a Single-Cell Level
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310282
PMID:39308190
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研究论文 | 研究探讨了软组织损伤后炎症微环境中间充质干细胞命运的决定机制 | 通过单细胞RNA测序、空间转录组和谱系追踪分析，揭示了炎症微环境中间充质干细胞向软骨和骨细胞分化的动态过程及其调控机制 | NA | 探讨创伤诱导的炎症暴露对间充质干细胞命运决定的影响 | 间充质干细胞及其在炎症微环境中的分化 | 数字病理学 | 软组织损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5946 | 2024-11-23 |
Spatial Isoforms Reveal the Mechanisms of Metastasis
2024-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202402242
PMID:39312471
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研究论文 | 研究食管鳞状细胞癌中淋巴结转移的机制，特别是CD8 T细胞在化疗耐药和转移中的作用 | 利用空间转录组学和单细胞RNA测序技术，分析了空间异构体在人类实体瘤和淋巴结中的表达和分布模式，并提出了异构体生成动力学对异构体时间异质性的影响 | 尚未完全阐明CD8 T细胞在化疗耐药和转移患者中的调控机制 | 揭示食管鳞状细胞癌中淋巴结转移的机制，特别是CD8 T细胞在化疗耐药和转移中的作用 | 食管鳞状细胞癌中的CD8 T细胞和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 食管癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、T细胞受体测序 | NA | 转录组数据 | 涉及人类实体瘤和淋巴结样本 |
| 5947 | 2024-11-23 |
Mouse enteric neurons control intestinal plasmacytoid dendritic cell function via serotonin-HTR7 signaling
2024-Oct-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-53545-2
PMID:39455564
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研究论文 | 研究了肠道血清素能神经元通过血清素-HTR7信号通路调控肠道浆细胞样树突状细胞功能 | 揭示了肠道血清素能神经元与肠道免疫稳态之间的紧密相互作用，增强了黏膜防御 | NA | 探讨肠道血清素能神经元在免疫反应调控中的作用 | 肠道血清素能神经元、肠道浆细胞样树突状细胞、IgA B细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 5948 | 2024-11-23 |
The spatial impact of a Western diet in enriching Galectin-1-regulated Rho, ECM, and SASP signaling in a novel MASH-HCC mouse model
2024-Oct-14, Biomarker research
IF:9.5Q1
DOI:10.1186/s40364-024-00660-3
PMID:39402682
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研究论文 | 研究西方饮食对Galectin-1调控的Rho、ECM和SASP信号在新型MASH-HCC小鼠模型中的空间影响 | 开发了一种新型MASH-HCC小鼠模型，并使用空间转录组学和多重免疫组化技术研究了西方饮食对Galectin-1信号的影响 | NA | 探讨西方饮食对Galectin-1信号在MASH向HCC进展中的影响 | MASH-HCC小鼠模型中的Galectin-1信号 | NA | 肝细胞癌 | 空间转录组学、多重免疫组化 | NA | 转录组数据、免疫组化数据 | 小鼠样本 |
| 5949 | 2024-11-23 |
Transcriptomic mapping of the 5-HT receptor landscape
2024-Oct-11, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2024.101048
PMID:39569210
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和多重荧光原位杂交技术，对成年小鼠大脑中的5-HT受体进行了全面的转录组分析 | 首次在单细胞水平上揭示了5-HT受体的多样性分布和共转录现象 | NA | 研究5-HT受体在小鼠大脑中的转录模式和空间分布 | 5-HT受体及其在小鼠大脑中的表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、多重荧光原位杂交（MERFISH） | NA | 转录组数据 | 约400万细胞（scRNA-seq）和约1000万细胞（MERFISH） |
| 5950 | 2024-11-23 |
An Anterior Second Heart Field Enhancer Regulates the Gene Regulatory Network of the Cardiac Outflow Tract
2023-11-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 研究通过CRISPR-Cas9基因编辑技术删除心脏增强子，探讨其在心脏流出道基因调控网络中的作用 | 揭示了前第二心场增强子在连接GATA6与NKX2-5依赖的旋转和隔膜基因程序中的关键作用 | NA | 探讨心脏流出道发育异常的基因调控网络 | 心脏流出道、前第二心场增强子、GATA6、NKX2-5 | NA | 心血管疾病 | CRISPR-Cas9基因编辑、RNA测序、单细胞RNA测序、染色质免疫沉淀测序、转座酶可及染色质测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 小鼠模型、人类诱导多能干细胞衍生的心肌细胞 |
| 5951 | 2024-11-23 |
Single-Cell Integration of BMD GWAS Results Prioritize Candidate Genes Influencing Age-Related Bone Loss
2023-Oct, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/jbm4.10795
PMID:37808401
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序数据整合骨密度全基因组关联研究结果，优先筛选影响年龄相关骨丢失的候选基因 | 通过单细胞RNA测序数据，揭示了候选基因在特定细胞类型中的表达特征，为骨密度维持提供了新的治疗靶点 | 主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 研究年龄相关骨丢失的遗传机制，并筛选潜在的治疗靶点 | 骨密度相关基因及其在不同细胞类型中的表达 | 基因组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 老年小鼠的骨髓和骨组织样本 |
| 5952 | 2024-11-23 |
Mammary duct luminal epithelium controls adipocyte thermogenic programme
2023-Aug, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06361-5
PMID:37495690
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研究论文 | 研究报告了乳腺导管上皮细胞在脂肪微环境中调节冷暴露诱导的小鼠皮下白色脂肪组织中脂肪细胞UCP1表达的作用 | 首次揭示了乳腺导管上皮细胞通过分泌因子'mammokines'调控脂肪细胞UCP1表达，并发现这些因子在性别特异性脂肪生成中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普遍性和在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨乳腺导管上皮细胞在脂肪细胞UCP1表达调控中的作用及其在性别特异性脂肪生成中的意义 | 小鼠皮下白色脂肪组织中的乳腺导管上皮细胞和脂肪细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠皮下白色脂肪组织样本 |
| 5953 | 2024-11-23 |
SPICEMIX enables integrative single-cell spatial modeling of cell identity
2023-01, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-022-01256-z
PMID:36624346
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研究论文 | 介绍了一种名为SPICEMIX的计算方法，用于整合单细胞空间转录组数据，以揭示细胞身份 | SPICEMIX基于概率潜变量建模，能够显著改进细胞类型及其空间模式的推断，优于现有方法 | NA | 开发一种能够利用空间转录组数据独特性质揭示细胞身份的计算方法 | 空间转录组数据中的细胞类型及其空间模式 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | 概率潜变量模型 | 基因表达数据 | 人类和小鼠脑区的空间转录组数据，通过seqFISH+、STARmap和Visium技术获取 |
| 5954 | 2024-11-23 |
RNase H-dependent PCR-enabled T-cell receptor sequencing for highly specific and efficient targeted sequencing of T-cell receptor mRNA for single-cell and repertoire analysis
2019-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0195-x
PMID:31341290
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研究论文 | 介绍了一种基于RNase H依赖的PCR技术进行T细胞受体测序的方法，用于单细胞和T细胞受体库分析 | 该方法通过RNase H依赖的PCR技术实现了T细胞受体的特异性扩增和双索引条码的添加，简化了工作流程，并提高了单细胞T细胞受体配对信息的成功率 | 与基于液滴的方法相比，该方法的通量较低，适用于分析小规模的排序细胞群体 | 开发一种高效且特异性的T细胞受体测序方法，用于单细胞和T细胞受体库分析 | T细胞受体（TCR）的α/β克隆型和T细胞受体库 | 基因测序 | NA | RNase H依赖的PCR（rhPCR） | NA | RNA | 单细胞或批量RNA样本，单细胞分析可处理384孔板中的细胞 |
| 5955 | 2024-11-22 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-Jan-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究探讨了神经炎症通过小胶质细胞吞噬PNNs导致PV阳性中间神经元功能障碍和相关γ振荡，从而引发小鼠认知障碍的机制 | 首次揭示了小胶质细胞吞噬PNNs在神经炎症诱导的认知障碍中的关键作用，并提出ApoE可能介导这一过程 | 研究主要集中在小鼠模型上，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨神经炎症导致认知障碍的具体机制 | 小鼠的认知功能、神经振荡、小胶质细胞基因表达 | 神经科学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 |
| 5956 | 2024-11-22 |
Exploring the Unknown: How Can We Improve Single-cell RNAseq Cell Type Annotations in Non-model Organisms?
2024-Nov-21, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icae112
PMID:39013613
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研究论文 | 本文探讨了如何改进非模式生物中单细胞RNA测序（scRNAseq）细胞类型注释的方法 | 提出了利用细胞谱系进化背景进行注释、使用机器学习进行无参考注释以及利用未注释基因作为潜在细胞标记的新方法 | 未具体讨论这些方法在实际应用中的效果和局限性 | 改进非模式生物中单细胞RNA测序的细胞类型注释，以发现新的细胞类型并提高注释的准确性 | 非模式生物中的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | 机器学习 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 5957 | 2024-11-22 |
A cell atlas foundation model for scalable search of similar human cells
2024-Nov-20, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08411-y
PMID:39566551
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研究论文 | 开发了一种名为SCimilarity的度量学习框架，用于学习统一的、可解释的细胞表示，以便快速查询数千万个细胞档案 | 提出了SCimilarity框架，能够跨研究快速查询转录相似的细胞状态 | NA | 开发一种能够跨人体快速查询相似细胞状态的工具 | 人类细胞的单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 间质性肺病 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 度量学习框架 | 单细胞RNA测序数据 | 2340万细胞，来自412项研究 |
| 5958 | 2024-11-22 |
CD38 ligation in sepsis promotes nicotinamide phosphoribosyltransferase-mediated IL-6 production in kidney stromal cells
2024-Nov-20, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfae269
PMID:39568061
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研究论文 | 研究探讨了CD38在脓毒症中的作用及其对肾脏基质细胞IL-6产生的影响 | 首次揭示了CD38结合通过烟酰胺磷酸核糖基转移酶信号通路促进肾脏基质细胞中IL-6的产生 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证 | 阐明CD38结合在脓毒症中的作用，并寻找新的治疗靶点 | 小鼠和人类的脓毒症模型 | NA | 脓毒症 | 单细胞和单核RNA测序（scRNA-seq和snRNA-seq） | NA | RNA | 小鼠和人类脓毒症组织的样本 |
| 5959 | 2024-11-22 |
Single-cell transcriptional analysis of murine norovirus infection in a human intestinal cell line
2024-Nov-19, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01617-24
PMID:39475272
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析探讨了在小鼠诺如病毒感染的人类肠细胞系中的复制机制和宿主反应 | 建立了表达小鼠诺如病毒受体的人类肠细胞系，并首次在单细胞水平上分析了病毒感染过程中的转录组变化 | 研究仅限于特定的人类肠细胞系和小鼠诺如病毒，可能不适用于其他病毒或细胞类型 | 探讨小鼠诺如病毒在人类肠细胞系中的复制机制和宿主反应 | 小鼠诺如病毒感染的人类肠细胞系 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个时间点的单细胞样本 |
| 5960 | 2024-11-22 |
A single-cell transcriptomic census of mammalian olfactory epithelium aging
2024-Nov-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2024.07.020
PMID:39173624
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析年轻和老年小鼠嗅上皮细胞，识别出与衰老相关的差异表达基因 | 首次在单细胞分辨率下揭示了嗅上皮衰老的细胞和分子机制 | NA | 研究嗅上皮衰老的细胞和分子机制 | 年轻和老年小鼠的嗅上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠的嗅上皮细胞，涉及21种细胞类型 |