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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 5841 - 5860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5841 | 2025-10-06 |
scDMSC: Deep Multi-View Subspace Clustering for Single-Cell Multi-Omics Data
2025-Jun, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3532784
PMID:40031269
|
研究论文 | 提出一种基于深度多视图子空间学习的单细胞多组学数据无监督聚类算法 | 通过加权重构协调组学数据的异质性，并利用深度子空间学习识别共享潜在特征 | NA | 开发单细胞多组学数据的聚类分析方法 | 单细胞多组学数据 | 机器学习 | NA | 单细胞多组学测序 | 深度多视图子空间学习 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5842 | 2025-10-06 |
Consensus nonnegative matrix factorization reveals metastatic gene expression program and identifies E74-like ETS transcription factor 3 confers to the lymph nodes metastasis in papillary thyroid cancer
2025-Jun, Endocrine
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s12020-025-04205-y
PMID:40048012
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研究论文 | 通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，利用共识非负矩阵分解识别甲状腺乳头状癌中的基因表达程序，发现ELF3基因驱动淋巴结转移 | 首次应用共识非负矩阵分解方法识别甲状腺乳头状癌中的EMT相关基因表达程序，并发现ELF3作为关键驱动基因 | 研究样本量有限，需要在更大队列中验证发现 | 探索甲状腺乳头状癌的转录异质性及其与淋巴结转移的关系 | 甲状腺乳头状癌恶性细胞 | 生物信息学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 机器学习, 体外功能验证, 药物筛选 | 共识非负矩阵 factorization, 机器学习框架 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5843 | 2025-10-06 |
Molecular Mechanisms of Intervertebral Disc Degeneration: Significance of SPARC Gene Expression
2025-Jun-01, Journal of musculoskeletal & neuronal interactions
IF:1.7Q4
PMID:40452200
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和体外实验探讨SPARC基因在椎间盘退变中的作用 | 结合单细胞测序数据和体外实验验证SPARC基因在椎间盘退变中的表达变化及其功能 | NA | 探索SPARC基因在椎间盘退变发病机制中的作用 | 髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫荧光, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5844 | 2025-10-06 |
CXCL10highTNFαhighKi67+ Microglia Recruit and Activate CD8+ T Cells in the Brainstem During Experimental Cerebral Malaria
2025-Jun, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1111/cns.70425
PMID:40457525
|
研究论文 | 本研究通过实验性脑疟疾模型鉴定了一种新型小胶质细胞亚型，并揭示了其通过CXCL10和TNFα介导CD8+ T细胞在脑干中募集和持续激活的机制 | 首次识别出CXCL10highTNFαhighKi67+小胶质细胞亚型，并阐明其在脑疟疾神经炎症中调控CD8+ T细胞活化的新机制 | 研究基于小鼠实验性脑疟疾模型，结果向人类疾病的转化需进一步验证 | 探究实验性脑疟疾中小胶质细胞的异质性及其在CD8+ T细胞募集和激活中的作用 | C57BL/6J小鼠、小胶质细胞、CD8+ T细胞 | 神经免疫学 | 脑疟疾 | 单细胞RNA测序、免疫荧光染色、电子显微镜、transwell实验、粘附实验、细胞毒性测试 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5845 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome profiling identifies cellular heterogeneity and immunosuppressive tumor microenvironment in inflammatory breast cancer
2025-Jun-01, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.05.061
PMID:40460936
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示炎性乳腺癌的细胞异质性和免疫抑制肿瘤微环境 | 首次在单细胞和空间水平系统描绘IBC的免疫景观，发现CXCL13表达下调与免疫抑制的关系，并筛选出天然产物免疫调节剂 | 样本量有限，需要更大规模验证；天然产物的具体作用机制尚未完全阐明 | 解析炎性乳腺癌的免疫微环境特征并寻找潜在治疗靶点 | 炎性乳腺癌和非炎性乳腺癌样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 荧光染色, 空间转录组分析, 肿瘤-免疫细胞共培养, 体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 基因表达数据 | 未明确样本数量 | NanoString | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | NanoString GeoMx Digital Spatial Profiler空间分析平台 |
| 5846 | 2025-10-06 |
Evaluating the practical aspects and performance of commercial single-cell RNA sequencing technologies
2025-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654974
PMID:40475448
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研究论文 | 对商业单细胞RNA测序技术进行实用性和性能评估的全面比较研究 | 首次对七种全转录组mRNA检测试剂盒和两种包含TCR分析的试剂盒进行标准化综合比较 | 研究主要基于PBMCs样本，可能不适用于其他细胞类型或组织 | 评估商业单细胞转录组测序平台的性能和实用性 | 来自不同供者的标准化PBMCs样本 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个供者的标准化PBMCs样本 | 多种商业平台公司 | 单细胞RNA-seq, TCR分析 | 七种全转录组mRNA检测试剂盒, 两种TCR分析试剂盒 | 商业单细胞转录组测序平台 |
| 5847 | 2025-10-06 |
Patient-Derived Three-Dimensional Lung Tumor Models to Evaluate Response to Immunotherapy
2025-May-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654890
PMID:40475675
|
研究论文 | 开发了一种新型患者来源三维肺肿瘤模型用于评估免疫检查点抑制剂的治疗反应 | 建立了能够维持人类细胞外基质特征、细胞间相互作用和组织结构的三维肺肿瘤模型，可模拟肿瘤微环境并快速评估免疫治疗反应 | 模型仍需进一步验证其与临床实际治疗反应的一致性 | 评估免疫检查点抑制剂在肺肿瘤中的治疗反应并开发预测生物标志物 | 非小细胞肺癌患者来源的三维肺肿瘤模型 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学 | 三维肿瘤模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5848 | 2025-10-06 |
Mapping satellite glial cell heterogeneity reveals distinct spatial organization and signifies functional diversity in the dorsal root ganglion
2025-May-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.19.654813
PMID:40475507
|
研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性，并通过空间定位揭示了其功能多样性 | 首次整合单细胞RNA测序与免疫组化等技术，在原生解剖背景下识别、验证并空间定位了四种不同的卫星胶质细胞亚群 | 研究主要聚焦于小鼠模型，人类背根神经节的分析相对有限 | 探索背根神经节中卫星胶质细胞的异质性及其功能意义 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫组化, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5849 | 2025-10-06 |
Simultaneous CRISPR screening and spatial transcriptomics reveal intracellular, intercellular, and functional transcriptional circuits
2025-Apr-17, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.02.012
PMID:40081369
|
研究论文 | 开发了一种结合空间转录组学和CRISPR筛选的新方法Perturb-FISH，用于研究单细胞分辨率下的遗传和分子关联 | 首次将成像空间转录组学与原位扩增引导RNA的光学检测相结合，能够同时分析细胞内、细胞间和功能转录回路 | NA | 开发一种能够在单细胞分辨率下研究空间和功能生物学遗传分子关联的通用方法 | 培养单细胞、三维异种移植模型、人诱导多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 空间转录组学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR筛选、空间转录组学、单细胞RNA测序 | Perturb-FISH | 空间转录组数据、功能表型数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5850 | 2025-10-06 |
Thymic and T-cell intrinsic critical roles associated with severe combined immunodeficiency and Omenn syndrome due to a heterozygous variant (G201R) in PSMB10
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1082
PMID:39734035
|
研究论文 | 本研究通过免疫学和分子特征分析，揭示PSMB10杂合变异(G201R)导致严重联合免疫缺陷和Omenn综合征的机制 | 首次证明PSMB10杂合变异通过显性负性作用影响免疫蛋白酶体表达，导致CD8+T细胞阳性选择受损和自身反应性T细胞阴性选择异常 | 研究仅针对单个病例，样本量有限，需要更多病例验证 | 探究PSMB10杂合变异在严重联合免疫缺陷和Omenn综合征中的免疫学和分子机制 | 携带PSMB10 p.G201R杂合变异的婴儿患者 | 免疫学 | 严重联合免疫缺陷 | 流式细胞术,免疫印迹,人工胸腺器官培养,单细胞RNA测序 | NA | 细胞表型数据,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 1例患者及其父母 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5851 | 2025-10-06 |
Identification of Causal Plasma Proteins in Hepatocellular Carcinoma via Two-Sample Mendelian Randomization and Integrative Transcriptomic‒Proteomic Analysis
2025-03-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0553
PMID:39991825
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研究论文 | 通过两样本孟德尔随机化和整合转录组-蛋白质组分析鉴定肝细胞癌中的因果血浆蛋白 | 首次结合大规模血浆蛋白质组数据和孟德尔随机化方法鉴定肝细胞癌的因果血浆蛋白，并通过单细胞RNA测序数据和分子对接验证 | 研究依赖于UK Biobank Pharma Proteomics Project的数据，样本来源相对单一 | 鉴定肝细胞癌的早期诊断和治疗靶点 | 肝细胞癌患者和相关的血浆蛋白质 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 两样本孟德尔随机化，单细胞RNA测序，分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据，基因组数据，单细胞RNA测序数据 | UK Biobank Pharma Proteomics Project的大规模样本 | NA | 蛋白质组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5852 | 2025-10-06 |
transCAE: Enhancing Cell Type Annotation in Single-cell RNA-seq Data with Transfer Learning and Convolutional Autoencoder
2025-Feb-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.168936
PMID:39798891
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研究论文 | 开发了一种基于迁移学习和卷积自编码器的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法transCAE | 将无监督降维与有监督细胞类型分类相结合，充分利用参考数据集和查询数据集信息，有效缓解批次效应 | 方法性能仍可能受到源数据质量的影响 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积自编码器, 迁移学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5853 | 2025-10-06 |
Unveiling patterns in spatial transcriptomics data: a novel approach utilizing graph attention autoencoder and multiscale deep subspace clustering network
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giae103
PMID:39804726
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研究论文 | 提出了一种名为STMSGAL的新型空间转录组数据分析框架，整合了图注意力自编码器和多尺度深度子空间聚类网络 | 首次将图注意力自编码器与多尺度深度子空间聚类相结合，构建细胞类型感知的共享最近邻图(ctaSNN)，能够更好地解析空间转录组数据中的复杂结构 | NA | 开发更准确的空间转录组数据分析方法，用于识别空间域、差异表达基因和细胞轨迹推断 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组测序 | 图注意力自编码器, 多尺度深度子空间聚类网络 | 空间基因表达数据 | 4个10x Genomics Visium数据集, 1个小鼠视觉皮层STARmap数据集, 2个Stereo-seq小鼠胚胎数据集, 2个乳腺癌组织, 1个成年小鼠大脑(FFPE) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 5854 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular dynamics and chemokine CXCL2-mediated smooth muscle cell proliferation in arterial repair
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1591557
PMID:40463365
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示动脉修复中的细胞动态及趋化因子CXCL2介导的平滑肌细胞增殖机制 | 首次在股动脉损伤模型中通过单细胞RNA测序识别出分泌CXCL2的炎症性平滑肌细胞亚群(SMC2)，并证实其通过促进平滑肌细胞增殖介导动脉重塑 | 研究主要基于动物模型，在人体中的适用性仍需进一步验证 | 探究PCI术后动脉修复的细胞机制及CXCL2在其中的作用 | 股动脉损伤模型中的细胞群体 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 股动脉损伤动物模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5855 | 2025-10-06 |
Succinylation-related molecular activities in cancer: metabolic adaptations, immune landscape, and prognostic significance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1571446
PMID:40463370
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研究论文 | 通过泛癌分析揭示琥珀酰化在代谢调控、免疫微环境和结直肠癌预后中的重要作用 | 首次系统性分析琥珀酰化在泛癌中的分子活动特征，构建基于琥珀酰化的预后模型并发现PCED1A的促癌功能 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证集中在结直肠癌，需要更多功能实验验证机制 | 探究琥珀酰化在癌症代谢适应、免疫景观和预后中的分子机制 | 泛癌数据集和结直肠癌样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、空间转录组、免疫组化、Western blotting | 预后风险模型 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据、蛋白质表达数据 | 来自TCGA、GEO、TISCH等多个数据库的泛癌数据集和结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5856 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing identifies two fibroblast subtypes and a Trem2+ macrophage subtype as the possible specific cellular targets in abdominal aortic aneurysms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1551308
PMID:40463378
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别腹主动脉瘤中两种成纤维细胞亚型和一种Trem2+巨噬细胞亚型作为特异性细胞靶点 | 首次在腹主动脉瘤中鉴定出特定的成纤维细胞亚型(Fib_Apoc1+/Fabp4+和inflam-Fib1)和巨噬细胞亚型(Mac_TREM2)，并揭示它们在疾病发展中的协同作用 | 研究基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证；抗炎疗法在临床应用中已被证明无效 | 探究腹主动脉瘤发病机制并识别新的治疗靶点 | 小鼠腹主动脉瘤模型中的细胞组成和功能表型 | 单细胞生物学 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5857 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics in colorectal cancer uncover the potential of metastasis and immune dysregulation of a cell cluster overexpressed PRSS22
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586428
PMID:40463392
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研究论文 | 通过单细胞转录组学在结直肠癌中发现过表达PRSS22的细胞簇具有转移和免疫失调潜力 | 首次通过单细胞测序技术识别出与结直肠癌进展相关的PRSS22高表达上皮细胞亚群，并验证其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 样本量相对有限（25例癌组织和10例癌旁组织），需要在更大规模队列中验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中细胞亚群的特性及其在肿瘤发生中的作用 | 结直肠癌患者组织样本中的细胞亚群 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | Boruta特征选择算法 | 单细胞转录组数据 | 25例结直肠癌组织和10例癌旁正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5858 | 2025-10-06 |
Unveiling the Therapeutic Potential of Baicalin in Intervertebral Disc Degeneration: Integrative Bulk and Single-Cell Transcriptome Analysis with Experimental Validation of PANoptosis Inhibition
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519179
PMID:40463856
|
研究论文 | 本研究通过整合分析和实验验证揭示了黄芩素通过抑制PANoptosis延缓椎间盘退变的治疗潜力 | 首次发现PANoptosis在椎间盘退变中的关键作用，并验证黄芩素通过调控PANoptosis相关基因发挥治疗作用 | 研究样本量有限，需要更大规模的临床验证 | 探索PANoptosis在椎间盘退变中的作用及黄芩素的治疗机制 | 椎间盘退变患者样本、体外NPC退变模型和大鼠IVDD模型 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 转录组测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，单细胞数据 | 多个公共数据集(GSE167199, GSE245147, GSE266883, GSE244889)及实验样本 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5859 | 2025-10-06 |
Depletion of Adipose Stroma-Like Cancer-Associated Fibroblasts Potentiates Pancreatic Cancer Immunotherapy
2025-01-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0298
PMID:39620946
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研究论文 | 本研究通过靶向清除表达脂肪基质细胞标志物的癌症相关成纤维细胞，增强胰腺癌免疫检查点阻断疗法的疗效 | 首次揭示不同CAF亚群对胰腺癌进展的差异性影响，并开发特异性清除ASC样CAFs的肽段D-CAN | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中验证 | 探究癌症相关成纤维细胞亚群在胰腺癌进展和治疗抵抗中的作用 | 胰腺导管腺癌小鼠模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5860 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Bone Marrow CD8+ T Cells in Myeloid Neoplasms Reveals Pathways Associated with Disease Progression and Response to Treatment with Azacitidine
2024-12-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0310
PMID:39485042
|
研究论文 | 通过单细胞分析研究骨髓CD8+ T细胞在髓系肿瘤中的作用机制及其与阿扎胞苷治疗反应的关系 | 首次发现CD57+CXCR3+ CD8+ T细胞亚群与阿扎胞苷治疗反应及患者生存率的相关性，并揭示IFN和TGF-β信号通路在治疗反应中的关键作用 | 样本量相对有限（104例），且仅针对骨髓样本进行分析 | 探索髓系肿瘤中CD8+ T细胞的功能变化及其在疾病进展和治疗反应中的作用机制 | 骨髓CD8+ T细胞 | 单细胞分析 | 髓系肿瘤（包括骨髓增生异常综合征和急性髓系白血病） | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 104例治疗前骨髓样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |