本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-09-05 |
Single-cell mapping of human endometrium and decidua reveals epithelial and stromal contributions to fertility
2026-01-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195254
PMID:41574608
|
研究论文 | 利用单细胞和批量RNA测序构建人类子宫内膜和蜕膜的高分辨率转录组图谱,揭示上皮和基质细胞对生育能力的贡献 | 首次通过单细胞RNA测序全面解析月经周期中分泌期腺上皮细胞的转录动态,并定义了包含556个基因的腺上皮容受性模块(GERM)特征,该特征在生育力受损女性中持续异常,提示其作为容受性标志物的潜力 | 摘要中未明确提及局限性 | 表征月经周期和早期妊娠蜕膜中子宫内膜的基因表达动态,以理解胚胎着床的分子机制 | 人类月经周期不同阶段的子宫内膜和早期妊娠的蜕膜组织 | 基因组学 | 不孕症 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未明确样本数量,涉及多个月经周期阶段和早期妊娠样本 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 562 | 2026-09-05 |
Fecal microbiota transplantation promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in patients with recurrent Clostridioides difficile
2026-01-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195678
PMID:41252206
|
研究论文 | 该研究通过临床试验分析粪便微生物群移植对复发性艰难梭菌感染患者的疗效及机制,发现FMT促进结肠上皮增殖和2型免疫反应 | 首次结合空间转录组学和单细胞基因集分析揭示FMT通过IL-33和双调蛋白上调Myc和mTORC1通路,促进结肠上皮增殖的机制 | 样本量较小(n=16),随访时间较短(2个月),缺乏对FMT后长期效果和机制验证的深入分析 | 阐明FMT治疗复发性艰难梭菌感染的免疫和黏膜机制 | 复发性艰难梭菌感染患者(n=16)和健康对照者 | 机器学习, 数字病理学 | 艰难梭菌感染 | 高通量测序, 空间转录组学, 流式细胞术 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据, 临床数据 | 16名患者和健康对照者(具体数量未提供) | 10x Genomics, Illumina | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | 10x Visium, Illumina NovaSeq | 10x Visium用于空间转录组分析,Illumina NovaSeq用于高通量测序 |
| 563 | 2026-09-05 |
Cannabidiol exerts antiinflammatory effects but maintains T effector memory cell differentiation in humans
2026-01-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198590
PMID:41252210
|
研究论文 | 本研究探讨了CBD在人类中的免疫调节作用,发现其具有混合效应,包括抗增殖、促炎和抗炎反应,且维持T效应记忆细胞分化 | 首次在CBD稳态并与他克莫司联合治疗条件下,通过单细胞和单核RNA测序解析CBD对人类免疫细胞亚群的影响 | 研究为离体实验,样本量较小,可能无法完全反映体内复杂的免疫反应 | 评估CBD在人类中稳态时的免疫调节效应,特别是在肾移植受者中使用时的安全性 | 23名健康参与者口服CBD后的外周血单核细胞(PBMC) | 免疫学 | 移植相关疾病 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、流式细胞术、细胞因子检测、串联质谱 | NA | 单细胞转录组数据、细胞因子水平、流式细胞术数据 | 23名参与者的外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium平台用于单细胞和单核RNA测序 |
| 564 | 2026-09-05 |
Spatial transcriptomics reveals immune-stromal crosstalk within the synovium of patients with juvenile idiopathic arthritis
2026-01-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.198074
PMID:41269758
|
研究论文 | 该研究利用亚细胞分辨率空间转录组学分析幼年特发性关节炎(JIA)患者的滑膜组织,揭示了多种免疫和基质细胞群体的空间组织及相互作用机制。 | 开发了新的空间共定位分析管道,并首次在JIA滑膜中描绘了微解剖结构,如NOTCH信号介导的内皮-成纤维细胞互作、CXCL9/CXCR3轴,以及JIA富集的特定细胞状态。 | 研究仅涉及活动性JIA患者的滑膜样本,样本量可能有限,且未深入分析细胞状态的分子驱动机制。 | 明确JIA滑膜中的空间细胞组成和互作网络,以理解疾病炎症机制并区分其与成人关节炎的差异。 | JIA患者的滑膜组织样本。 | 空间转录组学 | 幼年特发性关节炎 | 空间转录组学 | 计算管道(空间共定位分析) | 空间转录组数据 | 来自活动性JIA患者的滑膜组织样本(具体数量未在摘要中提及) | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 亚细胞分辨率空间转录组平台(具体配置未明确) |
| 565 | 2026-09-05 |
Single-cell immune transcriptomics reveals an inflammatory-inhibitory set-point spectrum in autoimmune diabetes
2026-01-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199050
PMID:41325163
|
研究论文 | 通过对自身免疫性糖尿病患者的单细胞免疫转录组分析,揭示了炎症-抑制设定点谱系,并确定了决定疾病异质性的免疫机制 | 首次在高分辨率下描绘了LADA和T1D的单细胞免疫转录组图谱,发现疾病异质性源于定性而非定量免疫差异,并提出了NF-κB/EGFR-JAK/STAT梯度和HLA-C-KIR轴作为潜在治疗靶点 | 样本量有限且为横断面研究,无法确定炎症设定点的动态变化;未进行功能验证实验 | 阐明自身免疫性糖尿病中不同炎症状态的决定性免疫机制,并确定潜在的治疗靶点 | 来自LADA患者、新诊断T1D患者和健康对照的PBMC | 单细胞转录组学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组和V(D)J序列数据 | 超过400,000个PBMCs,来自三组队列 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5' 或 3' 用于转录组和免疫受体分析 |
| 566 | 2026-09-05 |
Cellular immune endophenotypes separating early and late-onset myasthenia gravis
2026-01-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199679
PMID:41307955
|
研究论文 | 本研究通过多模式技术对早发性和晚发性重症肌无力进行细胞免疫表型分析,发现三种关键淋巴细胞群可区分这两种亚型。 | 首次利用深度光谱流式细胞术和单细胞测序结合,鉴定出特定免疫细胞亚群频率能高度准确区分早发与晚发性重症肌无力。 | 两独立队列样本有限,且未控制治疗用药和其他合并症等潜在混杂因素。 | 探究早发和晚发性重症肌无力在细胞免疫表型上的差异,并评估其作为临床分类生物标志物的潜力。 | 早发性和晚发性重症肌无力患者的免疫细胞群。 | 免疫学、临床医学 | 自身免疫性疾病(重症肌无力) | 深度光谱流式细胞术、单细胞测序 | NA | 细胞频率数据 | 两独立队列(具体样本数未在摘要中说明) | NA | 光谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 567 | 2026-09-05 |
An integrated single-cell and spatial transcriptomic atlas of thyroid cancer progression identifies prognostic fibroblast subpopulations
2026-01-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191990
PMID:41480746
|
研究论文 | 整合单细胞和空间转录组数据构建甲状腺癌进展图谱,识别与不良预后相关的成纤维细胞亚群 | 首次在包含儿童和成人样本的混合WDTC/ATC组织及小儿弥漫性硬化型甲状腺癌中,整合单细胞和空间转录组方法,精确定位了与侵袭性肿瘤细胞相关的POSTN+肌成纤维细胞CAFs亚群 | 未明确说明局限性,可能包括样本来源受限或验证不足 | 理解甲状腺癌在儿童和成人中的进化过程,并识别与疾病进展相关的关键微环境细胞亚群 | 甲状腺癌样本,包括WDTC、ATC、混合WDTC/ATC肿瘤及小儿弥漫性硬化型甲状腺癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、批量RNA测序数据 | 81个样本来源的423,733个细胞,28个肿瘤的空间转录组,5个批量RNA测序队列 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、批量RNA测序 | NA | NA |
| 568 | 2026-09-05 |
A murine model of sepsis induces age- and sex-specific chromatin remodeling in myeloid-derived suppressor cells
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1750174
PMID:41953016
|
研究论文 | 本研究通过MAPit-FENGC单分子技术绘制了脓毒症小鼠模型中髓源性抑制细胞(MDSCs)的启动子表观遗传图谱,发现染色质重塑受年龄和性别影响 | 首次使用MAPit-FENGC技术同时分析DNA甲基化和染色质可及性,在脓毒症MDSCs上实现高分辨率表观遗传图谱,并识别出九种启动子类别,揭示年龄和性别依赖的染色质动态变化 | 文章未提供明确的局限性信息 | 研究脓毒症后MDSCs中由年龄和性别介导的表观遗传重塑机制,以理解长期免疫功能障碍的分子基础 | 年轻和老年雄性及雌性小鼠的脾脏CD11b+Gr1+髓源性抑制细胞(MDSCs) | 表观遗传学 | 脓毒症 | MAPit-FENGC、单细胞RNA测序 | 无特定模型(应用小鼠脓毒症模型) | 单分子表观遗传数据、转录组数据 | 覆盖年轻和老年雄性及雌性小鼠的脾脏MDSCs(具体数量未提供) | NA | MAPit-FENGC, 单细胞RNA测序 | NA | MAPit-FENGC用于单分子DNA甲基化和染色质可及性分析;单细胞RNA测序用于转录组分析 |
| 569 | 2026-09-05 |
shinyDeepGxP: a user-friendly R shiny app for predicting surface protein abundance from scRNA-seq expression using deep learning in blood cells
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag203
PMID:42683442
|
研究论文 | 介绍了一个名为shinyDeepGxP的交互式R Shiny应用,用于基于单细胞RNA测序表达数据通过深度学习预测血细胞表面蛋白丰度 | 提供了一个无需编程技能即可访问的Web应用,使深度学习模型DeepGxP能够方便地被研究人员使用,并支持可视化辅助识别细胞群体 | 未明确指出局限性,但技术上可能受限于输入数据格式以及预测蛋白种类的范围 | 开发用户友好的Web工具,从仅RNA的单细胞数据集获取蛋白质水平信息,实现多模态发现 | 血细胞单细胞数据集中的表面蛋白丰度 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 570 | 2026-09-05 |
Integrated Transcriptomic Analyses and Experimental Validation Identify TSPO as a Mitochondria-Associated Therapeutic Target in Myocarditis
2026, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/2395578
PMID:42683863
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组分析和实验验证,识别TSPO作为心肌炎中线粒体相关治疗靶点 | 首次将TSPO确定为心肌炎中的线粒体相关保护性反应因子,并通过配体Ro5-4864验证其治疗潜力 | 摘要中未提及研究局限性 | 探索心肌炎中线粒体相关基因,识别新的治疗靶点 | CVB3病毒性心肌炎小鼠模型及人类心肌炎相关基因 | 转录组学 | 心肌炎 | 批量RNA测序、单细胞RNA测序、加权基因共表达网络分析、随机森林、SHAP分析 | NA | RNA测序数据 | 摘要中未提供样本数量 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 571 | 2026-09-05 |
Single-cell transcriptomics reveals cellular heterogeneity and neoadjuvant chemotherapy response signatures in triple-negative breast cancer
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1892582
PMID:42687923
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示三阴性乳腺癌的细胞异质性和新辅助化疗反应特征 | 利用单细胞RNA测序首次在TNBC中定义了与化疗反应相关的癌细胞亚型和巨噬细胞亚型,并识别出PDGFB-PDGFRB信号作为潜在的耐药通路 | 基于公共数据集的分析,样本量有限,且体外验证仅使用了一个细胞系模型,缺乏体内实验验证 | 阐明三阴性乳腺癌的细胞异质性及其对新辅助化疗反应的细胞决定因素,以识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 三阴性乳腺癌患者样本的转录组数据,包括癌细胞和肿瘤相关巨噬细胞等细胞亚型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,批量转录组分析 | 聚类分析,轨迹分析,细胞通讯推断 | 基因表达数据,临床数据 | GSE161529数据集包含来自TNBC患者的单细胞转录组数据,GSE25066和GSE58812为批量队列数据,具体样本量未在摘要中提及 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 572 | 2026-09-05 |
Multi-omics identification of MBNL2 associated with poor pathological response to neoadjuvant chemoimmunotherapy in lung squamous cell carcinoma
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1877829
PMID:42688075
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析,鉴定出MBNL2与肺鳞状细胞癌新辅助化疗免疫治疗的不良病理反应相关 | 首次将MBNL2作为肺鳞状细胞癌对NACI反应的新型生物标志物,并结合转录组、单细胞RNA测序和病理验证揭示其与肿瘤-成纤维细胞串扰及免疫抑制微环境的关联 | 信息不足,未在标题和摘要中明确提及,故输出NA | 为新辅助化疗免疫治疗在可切除肺鳞状细胞癌中的应用寻找与预后和免疫治疗反应相关的核心基因,并探究其作用机制 | 肺鳞状细胞癌(LUSC)患者肿瘤样本、TCGA转录组数据、scRNA-seq数据(GSE207422)及独立NACI前活检队列(n=36) | 数字病理学 | 肺鳞状细胞癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | 机器学习模型(例如TIDE算法等) | 基因表达数据、文本、图像 | 36例活检样本(独立验证队列) | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2026-09-05 |
Investigating the causal impact of gut microbiota on periodontitis based on Mendelian randomization, bulk transcriptomics, and single-cell transcriptomics
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1884760
PMID:42688170
|
研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化、批量转录组学和单细胞转录组学,探究肠道微生物群与牙周炎之间的因果关系,并鉴定关键基因 | 首次综合运用孟德尔随机化、多算法机器学习和单细胞RNA测序,系统解析肠道微生物群与牙周炎的因果关系及分子机制,并识别出NID2作为优先候选基因 | 缺乏功能实验验证,且样本量较小,可能影响结果的普遍性 | 确定肠道微生物群与牙周炎之间的因果关系,并鉴定关键分子靶点 | 牙周炎患者和健康对照的牙龈组织样本以及相关转录组数据集 | 生物信息学、转录组学 | 牙周炎 | 孟德尔随机化、批量转录组学、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blot | 机器学习算法 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、临床样本数据 | 6例牙周炎患者和6例健康对照的牙龈组织 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 574 | 2026-09-05 |
Monocyte TLR2/4 as predictive biomarkers for progression from dengue warning signs to severe disease
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1901740
PMID:42688165
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和临床验证,发现单核细胞TLR2/4在登革热预警期高表达,可作为预测疾病进展为重症登革热的生物标志物 | 首次揭示了TLR2/4/7/8在登革热预警期单核细胞中的表达峰值,并验证了单核细胞表面TLR2/4作为预测重症登革热进展的生物标志物的潜力 | 研究样本量较小,且仅在中国广东省进行,可能影响结果的普适性;未探讨TLR表达的分子机制 | 探索单核细胞TLR2/4表达作为登革热从预警期进展至重症的预测标志物的可行性 | 登革热患者和健康对照者的单核细胞TLR表达 | 免疫学 | 登革热 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 基因表达数据和蛋白表达数据 | 45名登革热患者和10名健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 575 | 2026-09-05 |
Recruited Monocyte-Derived Macrophages Drive T Cell Inflammation in Immune Checkpoint Inhibitor-Mediated Pneumonitis
2026, Cancer communications (London, England)
DOI:10.34133/cancomm.0049
PMID:42688372
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了免疫检查点抑制剂相关肺炎中招募的单核细胞衍生巨噬细胞通过IFN-γ-CXCL9/10-CXCR3轴驱动T细胞炎症的机制,并验证了治疗靶点的潜力。 | 首次整合患者和动物模型的单细胞转录组数据,阐明CCR2+单核细胞衍生巨噬细胞与CD8+ T细胞在CIP中的相互作用环路,并提出靶向CCR2/CCR5或CXCR3的干预策略,该策略在保留抗肿瘤免疫的同时改善了生存。 | 摘要中未提及具体局限性,如样本量、模型差异或临床转化障碍等。 | 阐明免疫检查点抑制剂介导肺炎的肺部免疫机制,识别可靶向的单核细胞/巨噬细胞-T细胞通路,为精准干预提供依据。 | CIP患者支气管肺泡灌洗液及外周血样本、肿瘤小鼠模型(FoxP3-DTR-GFP)的肺组织。 | 免疫学、单细胞转录组学 | 免疫检查点抑制剂相关肺炎(肺炎) | 单细胞RNA测序、流式细胞术、ELISA、Western blot、qPCR、微计算机断层扫描、组织病理学、多重免疫荧光、Transwell迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据、临床样本数据、小鼠影像和组织病理数据 | 纳入CIP患者和对照患者(具体数量未在摘要中提及),以及肿瘤小鼠模型。 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 576 | 2026-09-05 |
Orphan GPCRs in diabetes mellitus: metabolic control, inflammation, and drug development
2026, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2026.1916297
PMID:42688438
|
综述 | 全面评价孤儿G蛋白偶联受体在糖尿病中的作用,涵盖代谢控制、炎症和药物开发,并讨论新兴技术加速其去孤儿化 | 首次系统按功能分类孤儿GPCRs,结合FDA批准的糖尿病药物药理学特性,并提出重定向药物优先排序策略 | 缺乏实验验证,基于现有文献综述,其优先排序需进一步临床转化研究支持 | 探讨oGPCRs作为糖尿病和精准医学治疗靶点的潜力 | 孤儿G蛋白偶联受体及其在胰腺、脂肪组织、肝脏和肾脏中的功能 | 机器学习 | 糖尿病 | NA | NA | 文本 | 不适用 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 单细胞RNA测序和空间转录组学平台 |
| 577 | 2026-09-05 |
Pathway-based molecular subtyping identifies LAMP5 as an EMT-associated prognostic target in colorectal cancer
2026, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2026.1867118
PMID:42688481
|
研究论文 | 该研究通过通路层面的分子分型,在结直肠癌中识别出LAMP5作为与EMT相关的预后靶点 | 首次提出整合通路水平分子亚型发现、多队列验证、单细胞投射和机制靶点识别的框架,并鉴定LAMP5为新的预后生物标志物 | 未明确提及限制,但可能包括样本来源的偏倚、实验验证的模型限制等 | 建立基于通路的结直肠癌分子分型框架,并识别与EMT相关的预后靶点 | 结直肠癌患者样本,包括TCGA转录组数据、17个独立验证队列和3个单细胞RNA-seq数据集 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、基因集变异分析 | 共识聚类、最近模板预测、Cox回归 | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TCGA结直肠癌样本及17个外部队列和3个单细胞数据集 | 未明确提及 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | 未明确提及 | 未明确提及 |
| 578 | 2026-09-05 |
ECH1-Deficiency-Mediated Polyunsaturated Fatty Acid Accumulation Promotes Vascular Smooth Muscle Cell Ferroptosis and Chronic-Kidney-Disease-Associated Plaque Vulnerability
2026, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.1411
PMID:42688573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和脂质组学分析,揭示了ECH1缺乏导致的多不饱和脂肪酸积累促进血管平滑肌细胞铁死亡,进而加剧慢性肾病相关斑块易损性的机制 | 首次揭示了ECH1缺乏驱动的多不饱和脂肪酸积累是血管平滑肌细胞铁死亡和动脉粥样硬化斑块易损性的关键机制,并提出了靶向调控ECH1介导的PUFA代谢作为慢性肾病相关斑块易损性的潜在治疗策略 | 研究主要在细胞和动物模型中进行,需进一步在人类样本中验证其临床相关性 | 阐明慢性肾病环境下血管平滑肌细胞脂质代谢紊乱导致斑块易损性的分子机制 | 慢性肾病患者的动脉组织、血管平滑肌细胞、载脂蛋白E缺陷小鼠 | 生物信息学、单细胞测序、脂质组学 | 慢性肾病、动脉粥样硬化 | 单细胞测序、空间脂质组学、靶向脂质组学、生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据、脂质组学数据 | 未明确说明具体数量,但包含来自慢性肾病患者的动脉组织样本 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、脂质组学 | NA | NA |
| 579 | 2026-09-05 |
Deciphering novel targets in salivary gland pleomorphic adenoma by integrating plasma proteomics and parotid transcriptomics analyses
2026, Journal of dental sciences
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.jds.2025.07.3542
PMID:42688628
|
研究论文 | 通过整合血浆蛋白质组学与腮腺组织多组学分析,揭示唾液腺多形性腺瘤的新靶点 | 首次将基于血浆蛋白质定量性状位点的孟德尔随机化与腮腺组织的批量RNA测序和单细胞RNA测序等多组学分析系统整合,以探索唾液腺多形性腺瘤的分子驱动因素 | 批量RNA测序与孟德尔随机化结果一致性有限,且缺乏体外或体内功能实验验证 | 通过系统整合多组学分析,识别唾液腺多形性腺瘤的潜在分子靶点并验证其特异性 | 唾液腺多形性腺瘤患者及正常组织、腺样囊性癌、小鼠炎症病变样本 | 数字病理学, 机器学习的关联性不大 | 唾液腺多形性腺瘤 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 蛋白质组学 | 孟德尔随机化 | 蛋白质组学数据, 转录组学数据, 基因型数据, 组织图像数据 | 包含5450个血浆蛋白质定量性状位点、FinnGen联盟的唾液腺疾病全基因组关联研究数据、多例人体腮腺正常与肿瘤组织样品 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序可能使用10x Chromium平台构建文库 |
| 580 | 2026-09-05 |
Epigenetic regulation in medulloblastoma: from tumor heterogeneity to diagnostic, prognostic, and translational applications
2026, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2026.1909580
PMID:42688835
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的表观遗传调控,涵盖肿瘤异质性、诊断、预后及转化应用,并整合单细胞、空间转录组学等新兴技术进展 | 将经典表观遗传机制与新兴的多维表观基因组技术(如单细胞测序、空间转录组学、三维染色质图谱)整合到一个统一框架中,弥补了早期综述未充分涵盖的瘤内异质性和动态表观遗传调控内容 | 作为综述,其内容基于现有文献,可能无法涵盖所有最新未发表研究,且对新兴技术的讨论受限于当前研究阶段的成熟度 | 总结髓母细胞瘤表观遗传学的最新进展,并构建连接细胞可塑性、肿瘤微环境与生物标志物驱动的精准治疗的框架 | 髓母细胞瘤肿瘤及其表观遗传调控机制 | 表观遗传学 | 儿童脑肿瘤 | DNA甲基化测序、单细胞测序、空间转录组学、三维染色质图谱 | NA | 基因组数据、表观基因组数据、转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |