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当前共找到 34043 篇文献,本页显示第 561 - 580 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
561 2025-12-09
Single-cell RNA sequencing reveals a putative lncRNA-associated ceRNA network in high-grade serous ovarian cancer
2025-Dec, Genes & genomics IF:1.6Q3
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了高级别浆液性卵巢癌中一个由长链非编码RNA MIR100HG、微小RNA mir-224-5p和EYA4基因组成的竞争性内源RNA网络,该网络可能通过调控Wnt信号通路促进肿瘤进展 首次在高级别浆液性卵巢癌中结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据,识别出癌细胞特异性的竞争性内源RNA网络,并揭示了MIR100HG可能作为mir-224-5p的分子海绵调控EYA4表达的新机制 研究主要基于生物信息学分析和公共数据库验证,缺乏直接的实验功能验证来证实ceRNA网络的具体调控机制 识别高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中活跃的长链非编码RNA相关竞争性内源RNA网络 高级别浆液性卵巢癌的癌细胞 数字病理学 卵巢癌 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 加权基因共表达网络分析 RNA测序数据 未明确说明具体样本数量,但使用了单细胞RNA测序和批量RNA测序数据集,并利用癌症基因组图谱数据进行验证 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
562 2025-12-09
Spatial Transcriptomics of Patients With Kaposi Sarcoma Identifies Mechanisms of Immune Evasion
2025-Dec, Journal of medical virology IF:6.8Q1
研究论文 本研究利用空间转录组学技术分析卡波西肉瘤(KS)皮肤病变,以识别KSHV感染的细胞类型和免疫相互作用 首次将空间转录组学与单细胞RNA测序参考数据集结合,对KS病变进行空间解析的细胞类型反卷积分析,并同时检测人类和KSHV基因表达 样本量较小(7个KS肿瘤和6个正常皮肤样本),且仅针对皮肤病变进行分析 阐明KSHV感染如何重塑皮肤组织、抑制免疫反应并导致抗癌治疗耐药的潜在机制 卡波西肉瘤(KS)患者的皮肤肿瘤组织 空间转录组学 卡波西肉瘤 空间转录组学,单细胞RNA测序 空间解析的细胞类型反卷积方法 空间基因表达数据,单细胞RNA测序数据 7个KS皮肤肿瘤样本,6个正常皮肤样本 NA 空间转录组学,单细胞RNA-seq NA NA
563 2025-12-09
Phylogenomic Analysis of Deep-Branching Telonemid
2025-Nov-28, Genome biology and evolution IF:3.2Q2
研究论文 本文通过单细胞转录组测序和系统基因组学分析,研究了来自太平洋远洋的TEL2亚群Telonemid对Telonemia与SAR超群及其他稀疏采样或不稳定超群(如Hemimastigophora、Provora和Haptista)关系的影响 首次从TEL2亚群中分离并测序单细胞Telonemid,为Telonemia的系统发育提供了新数据,并探讨了其在超群关系中的不稳定性 贝叶斯分析未能收敛于特定拓扑结构,且不同数据子集(如基因采样、比对修剪和位点移除)导致超群关系不稳定,表明结果可能受采样偏差影响 通过系统基因组学分析,探究Telonemia与SAR超群及其他稀疏采样超群(Hemimastigophora、Provora和Haptista)的进化关系 来自太平洋远洋的TEL2亚群Telonemid单细胞 系统基因组学 NA 单细胞转录组测序 最大似然法(ML)、贝叶斯分析 转录组数据 一个单细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
564 2025-12-09
Molecular signatures and lineage diversification of neurogenic and gliogenic radial glia in the gyrencephalic ferret cortex
2025-Nov-28, Research square
研究论文 本研究利用具有脑回结构的雪貂模型,系统表征了皮质放射状胶质细胞的分子特征和谱系动力学,揭示了调控哺乳动物皮质神经发生和胶质发生的保守程序及信号网络 首次在雪貂模型中整合单细胞RNA测序、BrdU标记和免疫组化方法,系统揭示了ERK/PKA信号通路在促进外层放射状胶质细胞自我更新和神经发生中的协同作用,并发现了皮质胶质生成放射状胶质细胞的区域特异性分化机制 研究主要基于雪貂模型,虽然与人类皮质具有相似性,但直接推论至人类仍需进一步验证;信号通路的相互作用机制仍需更深入的分子层面解析 探究哺乳动物大脑皮质神经发生和胶质发生的分子调控机制及进化适应性 雪貂和人类大脑皮质的放射状胶质细胞 神经科学 NA scRNA-Seq, BrdU标记, 免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 图像数据 雪貂和人类皮质组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
565 2025-12-09
Retinoic Acid Reprograms Mast Cells Toward a Proinflammatory State to Enhance Antitumor Immunity
2025-Nov-27, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,全面绘制了十种癌症类型中肥大细胞的转录和空间异质性,揭示了视黄酸信号在驱动肥大细胞向促炎状态重编程中的关键作用 识别出一种独特的促炎肥大细胞(PMC)群体,并揭示了视黄酸-RARα-CIITA信号通路在肥大细胞重编程中的新机制,为增强抗肿瘤免疫提供了潜在治疗靶点 研究主要基于转录组学数据,功能验证和临床转化仍需进一步实验支持 探究肥大细胞在肿瘤微环境中的分子特征和功能多样性,以增强抗肿瘤免疫 十种癌症类型中的肥大细胞 数字病理学 多种癌症 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 转录组数据, 空间数据 十种癌症类型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
566 2025-12-09
Single-cell transcriptomic analysis reveals metabolic reprogramming and tumor microenvironment remodeling in aldosterone-producing adenoma
2025-Nov-27, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序揭示了醛固酮瘤的代谢重编程和肿瘤微环境重塑机制 首次构建了醛固酮瘤的单细胞图谱,系统揭示了肿瘤细胞的代谢重编程(脂质生成、氧化磷酸化、mTOR信号上调)、分化轨迹紊乱以及肿瘤微环境中免疫浸润、血管生成和基质重塑的特征 样本量较小(仅3例患者和3例对照),且为观察性研究,需进一步功能验证 阐明醛固酮瘤的细胞异质性、肿瘤发生机制及微环境特征 醛固酮瘤患者的肾上腺组织 数字病理学 肾上腺肿瘤 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 3例醛固酮瘤患者和3例对照的肾上腺组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
567 2025-12-09
Airway Delivery of Encapsulated Cytokine-Secreting Cells for Local Immunomodulation in Inflammatory Lung Diseases
2025-Nov-27, Research square
研究论文 本文开发了一种基于细胞的微胶囊平台,可通过气道给药,在肺部实现局部、持久且可调控的免疫调节蛋白递送,用于治疗炎症性肺病 开发了一种模块化的细胞基微胶囊平台,可通过气道进行局部给药,实现持久且可调控的免疫调节蛋白递送,避免了全身给药的脱靶效应 研究主要在动物模型中进行,尚未进行人体临床试验 开发一种局部免疫调节疗法,用于治疗炎症性肺病,如急性呼吸窘迫综合征和肺纤维化 炎症性肺病(如急性呼吸窘迫综合征和肺纤维化) 生物医学工程 急性呼吸窘迫综合征, 肺纤维化 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 啮齿动物模型(ARDS和肺纤维化模型)及大型动物模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
568 2025-12-09
Spatial Transcriptomics Reveals CXCL12 ⁺ Fibroblasts as Central Immune Organizers through CXCR4 Signaling in Abdominal Aortic Aneurysm
2025-Nov-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过空间转录组学技术揭示了腹主动脉瘤中CXCL12⁺成纤维细胞通过CXCR4信号作为中心免疫组织者的作用 首次生成了人类腹主动脉瘤的亚细胞分辨率空间转录组图谱,识别了CXCL12⁺成纤维细胞作为通过CXCR4介导的B细胞和T细胞交互组织适应性免疫微环境的中心基质枢纽 观察性横断面研究设计限制了因果推断,样本量较小(11例AAA患者和12例对照) 阐明腹主动脉瘤中免疫-基质相互作用的分子机制和空间组织 人类腹主动脉瘤组织样本(来自11例患者)和对照主动脉组织样本(来自12例个体) 空间转录组学 心血管疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 23个样本(11例AAA患者,12例对照) 10x Genomics 空间转录组学 Xenium Xenium空间转录组学平台,用于分析福尔马林固定石蜡包埋组织
569 2025-12-09
Amaranth: Enhanced Single-Cell Transcript Assembly via Discriminative Modeling of UMI Reads and Internal Reads
2025-Nov-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种名为Amaranth的新型单细胞转录本组装工具,通过区分建模UMI reads和internal reads,显著提高了单细胞RNA测序中全长转录本重建的准确性 首次识别并系统建模了UMI reads和internal reads在链特异性、5'/3'覆盖偏差和局部分布上的显著差异,并基于此开发了专门针对这两种reads不同偏好的新启发式算法 目前主要针对Smart-seq3协议进行优化,在其他单细胞测序协议上的性能尚未验证 提高单细胞RNA测序中全长转录本重建的准确性,实现细胞分辨率的异构体水平表达分析 单细胞转录组数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 判别式模型 测序reads 人类和小鼠的Smart-seq3数据集 NA 单细胞RNA-seq Smart-seq3 Smart-seq3协议(结合UMI-linked reads和internal reads)
570 2025-12-09
Deciphering HTLV-1-associated Lung Pathology through Integrated in vitro and Multi-cohort Multi-omics Analysis: Inflammation, Monocyte Recruitment and Differentiation Triggered by HTLV-1-exposed Alveolar Epithelial Cells
2025-Nov-24, Research square
研究论文 通过体外共培养模型和多组学分析,揭示了HTLV-1感染如何通过肺泡上皮细胞触发炎症、单核细胞招募和分化,导致肺部病理 结合体外共培养模型与多队列多组学分析,首次系统阐明HTLV-1通过NF-κB信号通路驱动肺部炎症的机制,并验证了模型在人类数据中的相关性 研究主要基于体外细胞模型,可能无法完全模拟体内复杂环境;多组学分析虽广泛,但样本来源和队列异质性可能影响结果普适性 探究HTLV-1感染对肺部炎症的影响及其分子机制 A549肺泡上皮细胞、HTLV-1感染的MT-2细胞、THP-1细胞、原代单核细胞以及多队列人类样本 生物信息学 HTLV-1相关肺部疾病 RNA-seq、RT-qPCR、CRISPR/Cas9基因敲除、系统生物学分析、多组学整合分析(包括转录组学、病毒互作组学和全基因组关联分析) 共培养模型 转录组数据、单细胞数据、基因组数据 涉及多队列人类样本,具体数量未在摘要中明确说明 NA 单细胞转录组学、批量转录组学 NA NA
571 2025-12-09
Loss of Intestinal Endosome-associated Protein Sorting Nexin 27 Disrupts Epithelial Barrier and Promotes Inflammation
2025-Nov-17, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 本研究探讨了SNX27蛋白在肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的未知作用 首次揭示了SNX27在肠道中的关键功能,包括维持上皮屏障和防止炎症,并开发了肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠模型 研究主要基于小鼠模型,人类数据来自现有数据库,缺乏直接的人类样本验证 确定SNX27在调节肠道稳态、上皮屏障完整性和炎症反应中的作用 人类炎症性肠病(IBD)患者数据和肠道上皮细胞特异性SNX27敲除小鼠 分子生物学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
572 2025-12-09
Enhancing RNA Capture Efficiency in Spatial Transcriptomics: A Review of Innovative Technologies and Strategies
2025-Nov-16, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文系统回顾了近年来提升空间转录组学RNA捕获效率的创新技术与策略 通过比较分析Decoder-seq、Stereo-seq V2、MAGIC-seq和MSN-seq等前沿技术,总结了在解决RNA扩散、探针密度和组织处理等挑战方面的进展,并特别强调了针对FFPE临床样本的优化方法以及整合人工智能的计算预测方法 NA 为研究人员提供如何提升空间转录组捕获效率的全面理解,并推动该技术在基础研究和临床应用中的效用 空间转录组学技术及其RNA捕获效率提升策略 数字病理学 NA 空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
573 2025-12-09
Adaptive resampling for improved machine learning in imbalanced single-cell datasets
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种自适应的重采样方法,用于改善不平衡单细胞数据集中的机器学习性能 提出了一种通用的自适应重采样方法,能够基于学习到的潜在结构在线、自适应地重采样数据,以增强单细胞表示学习 未明确提及具体限制,可能包括方法在特定数据集或任务中的泛化能力需要进一步验证 旨在提高单细胞转录组学数据中机器学习模型的表示学习和预测性能 单细胞转录组学数据,特别是基因表达重建、细胞类型分类和扰动响应预测任务 机器学习 NA 单细胞RNA-seq NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
574 2025-12-09
Pan-cancer multi-omics profiling of MS4A2 unveils its functional landscape in lung adenocarcinoma
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过多组学分析揭示了MS4A2在肺腺癌中的功能景观及其预后价值 首次在四种生存指标(OS、DSS、PFI、DFI)上系统评估MS4A2在肺腺癌中的预后分层,并发现其通过双向趋化因子调控塑造免疫抑制微环境 研究主要基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证和前瞻性临床队列 阐明MS4A2在肺腺癌中的表达模式、预后意义及功能机制 肺腺癌患者及多种癌症类型的肿瘤样本 生物信息学 肺腺癌 RNA-seq, 单细胞转录组学, 甲基化分析, 药物敏感性分析 Cox回归模型, Kaplan-Meier模型 基因表达数据, 生存数据, 甲基化数据, 药物反应数据 TCGA/GTEx数据库中的33种癌症类型及NSCLC单细胞队列 NA bulk RNA-seq, 单细胞转录组学 NA NA
575 2025-12-09
Multi-omic profiling reveals age-specific blood biomarkers and aging-driven B cell remodeling in osteoarthritis
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了骨关节炎中年龄特异性的血液生物标志物以及衰老驱动的B细胞重塑 首次整合了四种OA受累关节组织的转录组分析,并利用机器学习识别出五个外周血生物标志物,同时通过单细胞RNA测序揭示了老年OA患者中B细胞分化轨迹和功能状态的年龄特异性改变 研究样本量相对有限,且主要关注膝关节OA,其他关节类型的OA可能具有不同的特征 开发骨关节炎的非侵入性诊断工具并阐明其与年龄相关的免疫失调机制 骨关节炎患者(包括年轻和老年患者)的关节组织(软骨、滑膜等)和外周血样本 数字病理学 骨关节炎 转录组分析,单细胞RNA测序,流式细胞术 机器学习 基因表达数据,单细胞数据 217,983个关节细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
576 2025-12-09
Unraveling molecular characteristics and functional exploration of panoptosis for prognosis stratification in lung adenocarcinoma: a tumor marker prognostic study
2025-Nov-01, International journal of surgery (London, England)
研究论文 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法,开发了一个基于PANoptosis的预后评分模型(PAN Score),用于预测肺腺癌患者的预后和治疗反应,并探索了YWHAG基因在其中的关键作用 首次将PANoptosis这一新型细胞死亡模式与肺腺癌预后关联,结合10种机器学习方法构建了101种算法组合的预后模型,并发现了YWHAG-血管加压素-PANoptosis轴作为潜在治疗靶点 研究主要基于回顾性队列数据,需要前瞻性临床验证;体外和体内实验仅验证了YWHAG基因的部分机制 探索PANoptosis在肺腺癌中的分子特征和预后价值,开发预后分层模型 肺腺癌患者活检样本(超过1500例)及其他癌症样本 机器学习 肺腺癌 单细胞RNA测序、转录组分析、机器学习算法 多种机器学习算法组合(10种方法形成101种组合) 转录组数据、单细胞RNA测序数据 超过1500例肺腺癌活检样本及其他癌症样本 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
577 2025-12-09
ResNet50 and Single-Cell Multi-Omics analysis identify key cellular and molecular features in pediatric acute lymphoblastic leukemia
2025-Nov, Annals of hematology IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合基于深度学习的图像分析与单细胞转录组学和T细胞受体测序,揭示了儿童急性淋巴细胞白血病的细胞和分子特征 首次将ResNet50深度学习模型用于白血病单细胞图像分类,并与单细胞多组学数据整合,以阐明疾病机制并发现潜在的复发生物标志物 未明确说明样本的具体数量或来源,可能限制了结果的普遍适用性 解决儿童急性淋巴细胞白血病早期诊断、复发预测和个体化治疗的挑战 儿童急性淋巴细胞白血病(ALL) 数字病理学 白血病 单细胞转录组测序, T细胞受体测序 ResNet50, Grad-CAM 图像, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞多组学 NA NA
578 2025-12-09
Rationale, design and baseline characteristics of REMODEL, a mechanism-of-action trial with semaglutide in people with type 2 diabetes and chronic kidney disease
2025-Oct-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
研究论文 本文介绍了REMODEL试验的设计和基线特征,旨在通过多模态方法探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病中的肾脏特异性效应和作用机制 该试验首次结合MRI成像、肾脏活检以及单核和空间转录组学等多维技术,系统研究GLP-1受体激动剂在糖尿病肾病中的机制 样本量相对较小(106名参与者),且研究周期为52周,可能无法完全捕捉长期效应 探究索马鲁肽在2型糖尿病和慢性肾病患者中的肾脏保护作用机制 患有2型糖尿病和慢性肾病的成年人 NA 2型糖尿病和慢性肾病 磁共振成像(MRI)、单核转录组学、空间转录组学、病理学和组织学评估 NA 影像数据、组织样本数据、临床生化数据 106名参与者(其中33名为肾脏活检亚组) NA 单核转录组学, 空间转录组学 NA NA
579 2025-12-09
A Dynamic DNA Nano-Antioxidant Targeting Galectin-3 Attenuates Liver Fibrosis via Reducing Macrophage Oxidative Stress
2025-Oct-30, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
研究论文 开发了一种靶向Galectin-3的动态DNA纳米抗氧化剂,通过减少巨噬细胞氧化应激来减轻肝纤维化 利用单细胞RNA测序识别Galectin-3与巨噬细胞氧化应激的正相关性,并设计动态DNA纳米结构实现肝巨噬细胞特异性siRNA递送 研究基于小鼠模型,尚未在人类临床试验中验证,且长期安全性和脱靶效应需进一步评估 开发靶向治疗肝纤维化的纳米递送平台,以减轻巨噬细胞介导的氧化应激 肝巨噬细胞和Galectin-3蛋白,在CCl4诱导的小鼠肝纤维化模型中测试 生物医学工程 肝纤维化 单细胞RNA测序,IVIS成像,转录组分析 NA 基因表达数据,荧光成像数据 CCl4诱导的小鼠模型,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
580 2025-12-09
Scaling Large Language Models for Next-Generation Single-Cell Analysis
2025-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文基于Cell2Sentence框架,通过训练大型语言模型(LLMs)整合单细胞RNA测序数据和文本信息,以提升单细胞分析的预测和生成能力 将单细胞RNA测序数据表示为文本“细胞句子”,并训练参数达270亿的大型语言模型,实现转录组和文本数据在空前规模上的统一,支持多细胞上下文信息合成的高级下游任务 模型在训练期间未见过的人类细胞模型中进行了实验验证,但可能存在其他未知细胞类型或条件的泛化限制 开发可扩展、灵活且能整合文本信息的下一代单细胞分析平台 单细胞RNA测序数据、生物文本和元数据 自然语言处理 NA 单细胞RNA测序 大型语言模型(LLMs) 文本 包含超过十亿个转录组数据、生物文本和元数据标记的语料库 NA 单细胞RNA-seq NA NA
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