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当前共找到 37711 篇文献，本页显示第 561 - 580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2026-03-19 |
Robust identification of perturbed cell types in single-cell RNA-seq data
2024-09-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51649-3
PMID:39218971
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研究论文 | 本文提出了一种名为scDist的计算工具，用于在单细胞RNA-seq数据中稳健地识别受扰动的细胞类型 | 基于混合效应模型，提供统计严谨且计算高效的方法，以克服个体和队列变异导致的假阳性问题 | 未在摘要中明确提及 | 检测单细胞转录组数据中因疾病或条件变化而改变的细胞类型 | 单细胞RNA-seq数据中的细胞类型，特别是免疫细胞如树突状细胞、浆细胞样树突状细胞和FCER1G+NK细胞 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | 混合效应模型 | 单细胞转录组数据 | 未在摘要中明确提及 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 562 | 2026-03-19 |
The heart is a resident tissue for hematopoietic stem and progenitor cells in zebrafish
2024-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51920-7
PMID:39217144
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和高分辨率成像技术，揭示了斑马鱼心内膜是造血干细胞和祖细胞的常驻组织，并证明了心内膜对造血的贡献 | 首次在斑马鱼中证实心内膜能够产生并维持稳定的造血细胞群，特别是造血干细胞/祖细胞和巨核细胞-红系前体细胞，并揭示了其作为造血储备库的功能 | 研究主要基于斑马鱼模型，在哺乳动物中的适用性仍需进一步验证；对维持机制的探索尚未完全阐明所有依赖因素 | 探究心内膜细胞对造血谱系的贡献及其维持机制 | 斑马鱼心内膜细胞及相关的造血干细胞和祖细胞 | 发育生物学与造血研究 | NA | 单细胞测序，高分辨率显微镜，光转换示踪实验，光片显微镜活体成像 | NA | 单细胞转录组数据，显微成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 563 | 2026-03-19 |
scCAD: Cluster decomposition-based anomaly detection for rare cell identification in single-cell expression data
2024-08-31, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51891-9
PMID:39215003
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研究论文 | 本文提出了一种基于聚类分解的异常检测方法scCAD，用于在单细胞表达数据中识别稀有细胞类型 | scCAD通过迭代分解聚类，基于每个聚类中最具差异的信号来有效分离稀有细胞类型，克服了现有方法在聚类阶段可能遗漏稀有细胞的问题 | NA | 开发一种新方法以在单细胞RNA测序数据中准确识别稀有细胞类型 | 单细胞表达数据中的稀有细胞类型 | 数字病理学 | 透明细胞肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 基于聚类分解的异常检测方法 | 单细胞表达数据 | 25个真实世界scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2026-03-19 |
STIE: Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in in situ capturing-based spatial transcriptomics
2024-08-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-51728-5
PMID:39214995
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的期望最大化算法，用于在基于原位捕获的空间转录组学中实现单细胞水平的去卷积、卷积和聚类 | STIE算法通过将空间转录组与匹配的组织学图像核形态对齐，从约70%的间隙区域恢复缺失细胞，实现了真实单细胞水平和全玻片尺度的分析 | NA | 解决原位捕获空间转录组学中固定大小和位置的斑点无法精确捕获随机分布单细胞的问题，实现单细胞水平转录组分析 | 空间转录组数据及其匹配的组织学图像 | 空间转录组学 | NA | 原位捕获空间转录组学 | 期望最大化算法 | 空间转录组数据、组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 565 | 2026-03-19 |
Single-cell tumor heterogeneity landscape of hepatocellular carcinoma: unraveling the pro-metastatic subtype and its interaction loop with fibroblasts
2024-Aug-02, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02062-3
PMID:39095854
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，揭示了肝细胞癌的肿瘤异质性景观，识别了三种肿瘤细胞亚型，并发现S100A6+促转移亚型与成纤维细胞之间的相互作用环路 | 首次通过整合52个单细胞RNA测序和5个空间转录组学数据，建立了肝细胞癌恶性细胞的异质性景观，识别了三种肿瘤细胞亚型，并揭示了S100A6+促转移亚型与成纤维细胞之间的正反馈环路 | 未明确提及样本的具体来源或数量限制，且研究主要基于现有数据分析，缺乏实验验证的详细描述 | 理解肝细胞癌的肿瘤异质性及其在肿瘤进展和转移中的作用 | 肝细胞癌的肿瘤细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 整合分析方法，轨迹分析，富集分析 | 单细胞RNA测序数据，空间转录组学数据 | 52个单细胞RNA测序数据和5个空间转录组学数据 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 566 | 2026-03-19 |
Apolipoprotein L genes are novel mediators of inflammation in beta cells
2024-01, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-023-06033-z
PMID:37924378
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研究论文 | 本研究探讨了载脂蛋白L（APOL）基因家族在炎症诱导的胰岛β细胞损伤中的作用 | 首次发现APOL基因在人类胰岛β细胞中表达，并通过JAK-STAT通路上调，揭示了APOL1通过增加内质网应激调控细胞死亡的新机制 | 研究主要基于体外细胞模型和单细胞转录组数据，体内功能验证和临床转化潜力仍需进一步探索 | 探究炎症导致β细胞功能障碍的分子机制 | 人类胰岛β细胞（包括EndoC-βH1细胞系和原代胰岛） | 单细胞转录组学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量（使用公共数据集GSE218316及实验室生成数据） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2026-03-19 |
Single-cell level deconvolution, convolution, and clustering in spatial transcriptomics by aligning spot level transcriptome to nuclear morphology
2023-Dec-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.12.17.572084
PMID:38187541
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研究论文 | 本文提出了一种名为STIE的算法，通过将空间转录组数据与匹配的组织学图像中的核形态对齐，实现单细胞水平的去卷积、卷积和聚类分析 | STIE算法首次通过核形态相似性和邻域信息，从斑点间高达约70%的间隙区域恢复缺失细胞，实现了真正的单细胞水平分析，超越了现有方法仅关注斑点大小提升的局限 | 算法依赖于匹配的组织学图像和核形态数据，可能受图像质量或配准误差影响，且在处理高度异质或重叠细胞时性能未完全评估 | 旨在解决基于斑点的空间转录组学中无法精确捕获单细胞转录组的问题，实现单细胞水平的分辨率提升 | 真实和模拟的空间转录组学数据，包括低分辨率和高分辨率斑点 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | EM算法 | 图像、文本（转录组数据） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 568 | 2026-03-19 |
Endogenous adenine mediates kidney injury in diabetic models and predicts diabetic kidney disease in patients
2023-10-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI170341
PMID:37616058
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研究论文 | 本研究提出内源性腺嘌呤可能是糖尿病肾病（DKD）的致病因子，并探讨了尿腺嘌呤/肌酐比值（UAdCR）作为预测终末期肾病（ESKD）的机制性生物标志物的潜力 | 首次提出内源性腺嘌呤是DKD的致病因子，发现UAdCR可作为无大量白蛋白尿患者ESKD的预测生物标志物，并确定了腺嘌呤通过mTOR通路促进肾损伤的机制 | 研究主要基于观察性队列，因果关系需进一步实验验证；样本来自特定人群，结果外推需谨慎 | 探究内源性腺嘌呤在糖尿病肾病发生发展中的作用，并寻找预测DKD进展的机制性生物标志物 | 糖尿病患者（来自CRIC、SMART2D和美国印第安人研究）、糖尿病小鼠模型、肾小管细胞 | 代谢组学与转录组学 | 糖尿病肾病 | 空间代谢组学、单细胞转录组学 | NA | 尿液代谢物数据、空间代谢组数据、单细胞转录组数据 | 多个队列的糖尿病患者（具体人数未明确说明）、糖尿病小鼠模型 | NA | 空间代谢组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 569 | 2026-03-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies hippocampal microglial dysregulation in diet-induced obesity
2023-Mar-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.106164
PMID:36915697
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了高脂饮食诱导的肥胖对海马区小胶质细胞功能失调的影响及其与认知障碍的关联 | 利用单细胞转录组学分析，揭示了肥胖状态下海马小胶质细胞在细胞间通讯、免疫调节和蛋白质处理方面的动态变化机制 | 研究基于小鼠模型，其机制在人类中的适用性仍需进一步验证 | 探究肥胖诱导的认知障碍中海马小胶质细胞激活的精确分子机制 | 高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型中的海马小胶质细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 570 | 2026-03-19 |
Cross center single-cell RNA sequencing study of the immune microenvironment in rapid progressing multiple myeloma
2023-Jan-26, NPJ genomic medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.1038/s41525-022-00340-x
PMID:36702834
|
研究论文 | 本研究通过多中心单细胞RNA测序，分析了快速进展型多发性骨髓瘤患者的骨髓免疫微环境特征 | 首次通过多中心协作的单细胞RNA测序研究，系统比较了快速进展与非进展多发性骨髓瘤患者的免疫微环境差异，并验证了不同研究中心数据的一致性 | 样本量相对有限（18名患者），且为横断面研究，无法确定观察到的细胞群变化与疾病进展的因果关系 | 探究多发性骨髓瘤快速进展的免疫微环境机制 | 多发性骨髓瘤患者的骨髓CD138样本 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 48份骨髓样本（来自18名患者），共计102,207个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 571 | 2026-03-18 |
PANX1-mediated NLRP3 inflammasome activation promotes an adaptive doxorubicin resistance through IL-1β signaling in breast cancer
2026-May-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2026.218387
PMID:41765358
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研究论文 | 本研究揭示了PANX1通过激活NLRP3炎症小体和IL-1β信号通路，促进乳腺癌对阿霉素产生适应性耐药的新机制 | 首次发现PANX1在乳腺癌化疗耐药中的关键作用，并阐明其通过NLRP3-IL-1β信号轴介导适应性耐药的分子机制 | 研究主要基于临床队列和动物模型，需要在更大规模的前瞻性临床试验中进一步验证PANX1作为生物标志物和治疗靶点的有效性 | 探究PANX1在乳腺癌化疗耐药中的作用机制，并评估其作为预测生物标志物和治疗靶点的潜力 | 乳腺癌患者队列、乳腺癌细胞系和动物模型 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、药理学抑制、基因敲低 | 动物模型、细胞模型 | 转录组数据、临床数据 | 患者队列（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 572 | 2026-03-18 |
Artificial sweeteners and male infertility: Network toxicology and experimental evidence reveal FGFR1 as the critical target
2026-04, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
DOI:10.1016/j.reprotox.2026.109191
PMID:41713522
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研究论文 | 本研究通过整合计算预测、网络分析和湿实验验证，探讨人工甜味剂导致男性不育的机制，并确定FGFR1为关键靶点 | 首次结合网络毒理学、机器学习特征选择、分子对接与动力学模拟以及单细胞RNA-seq分析，系统揭示人工甜味剂通过FGFR1信号通路影响男性生殖功能的分子机制 | 研究主要基于体外细胞实验和计算模拟，缺乏体内实验和蛋白质水平验证，且仅针对部分人工甜味剂 | 探索人工甜味剂导致男性不育的潜在分子机制 | 七种人工甜味剂（如阿斯巴甜、纽甜、三氯蔗糖）及其与男性生殖系统相关的分子靶点 | 网络毒理学 | 男性不育 | 单细胞RNA-seq、RT-qPCR、分子对接、分子动力学模拟、机器学习特征选择 | 机器学习特征选择 | 基因表达数据、分子结构数据、单细胞转录组数据 | TM3 Leydig细胞系暴露于阿斯巴甜（0.5-2 mM）48小时 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2026-03-18 |
Integrating histology and spatial transcriptomics via multimodal transformers and contrastive representation learning for accurate gene expression prediction
2026-Apr, Journal of biomedical informatics
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbi.2026.105003
PMID:41763376
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研究论文 | 本文提出了一种统一的多模态学习框架，通过结合组织学图像和空间转录组学数据，利用多模态Transformer和对比表示学习来准确预测基因表达 | 采用ResNet50卷积主干和MobileViT Transformer编码器提取层次视觉表示，并通过对比学习目标在共享潜在空间中对齐图像和转录组特征，显著提高了预测准确性 | NA | 从组织学图像预测空间基因表达，以理解组织结构和分子表型 | 人类肝脏组织 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | ResNet50, MobileViT Transformer | 图像, 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium数据集 |
| 574 | 2026-03-18 |
GITR activation potentiates anti-tumor immunity of tumor-infiltrating lymphocytes expanded from glioblastoma by rescuing exhaustion
2026-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03705-z
PMID:41776051
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研究论文 | 本研究优化了从胶质母细胞瘤病灶体外扩增肿瘤浸润淋巴细胞的方法，并通过单细胞RNA测序揭示了其异质性，发现GITR激活可通过NF-κB/KALRN信号轴增强CD8 TIL的抗肿瘤免疫，为改善胶质母细胞瘤的TIL疗法提供了新策略 | 发现GITR不仅高表达于免疫抑制性Treg细胞，也高表达于耗竭的CD8 TILs；GITR激动剂具有双重作用：直接增强CD8 TIL活化同时消除Treg介导的免疫抑制；揭示了GITR激活通过NF-κB/KALRN信号轴促进免疫突触形成的作用机制 | NA | 探索改善胶质母细胞瘤自体肿瘤浸润淋巴细胞疗法疗效的策略 | 从胶质母细胞瘤病灶扩增的肿瘤浸润淋巴细胞 | NA | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 575 | 2026-03-18 |
KRAS-extrachromosomal DNA drives intratumoral heterogeneity in gastric cancer
2026-Apr, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-026-03713-z
PMID:41786878
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序和单细胞RNA测序揭示了胃癌中KRAS基因在染色体外DNA（ecDNA）上的扩增及其在肿瘤内异质性中的关键作用 | 首次在胃癌中鉴定出KRAS-ecDNA，并系统分析了其驱动的转录异质性、功能特征及药物反应预测，为靶向ecDNA驱动的致癌程序提供了新策略 | 研究仅基于单个胃癌样本，样本量有限，且功能验证和临床相关性需进一步探索 | 探究KRAS基因通过染色体外DNA（ecDNA）在胃癌中的功能影响及肿瘤内异质性机制 | 胃癌样本 | 数字病理学 | 胃癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 1个胃癌样本 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 576 | 2026-03-18 |
Single-Atom Nanozyme Driven Lactate Reversal Fuels Oxidative Metabolism and Represses Lactylation to Heal Diabetic Wounds
2026-Mar-17, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c20192
PMID:41757688
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研究论文 | 本研究开发了一种磷掺杂单原子铁纳米酶（Fe@CN-P），用于通过乳酸氧化和ROS清除促进糖尿病伤口愈合 | 通过磷掺杂调控铁活性中心的电子密度，实现金属基纳米酶的高效乳酸氧化，并建立“逆转-再利用”代谢通路 | 未明确提及实验样本量或临床验证的局限性 | 设计具有精确电子调控和治疗功能的单原子纳米酶，以调节炎症并促进糖尿病伤口愈合 | 糖尿病伤口愈合过程中的乳酸代谢和线粒体活性 | 单细胞分析 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2026-03-18 |
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.6c00010
PMID:41758996
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综述 | 本文综述了代谢RNA标记技术结合单细胞RNA测序在时间分辨转录组分析中的最新进展，包括方法开发、应用扩展及未来展望 | 开发了Well-TEMP-seq和scDUAL-seq等新技术，提高了时间分辨单细胞RNA测序的性能，并实现了从体外到体内、从时间到时空的维度扩展 | 当前化学工具在单细胞RNA动态分析中仍存在局限性，如标记效率和准确性有待进一步提升 | 研究单细胞水平上基因表达的异质性和动态调控机制 | 细胞在胚胎发育、疾病进展和刺激响应等过程中的转录组动态变化 | 单细胞组学 | NA | 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 578 | 2026-03-18 |
CRLF1 Secreted by Cardiac Fibroblasts Promotes Human Hypertrophic Cardiomyopathy
2026-Mar-17, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究通过整合分析肥厚型心肌病患者的组织样本，发现心脏成纤维细胞分泌的CRLF1是驱动心肌细胞肥大的关键旁分泌因子，揭示了HCM发病的非遗传性共同机制 | 首次鉴定出CRLF1作为HCM的通用致病因子，跨越遗传异质性患者，提供了一种新的非遗传性旁分泌机制解释 | 研究主要基于手术切除的梗阻性HCM患者样本，可能不适用于所有HCM亚型；动物模型为Myh6 R404Q/+小鼠，与人类疾病存在物种差异 | 探究肥厚型心肌病的统一分子基础，寻找跨越遗传异质性的共同致病通路 | 269名接受手术心肌切除术的梗阻性HCM患者的肥厚室间隔组织，以及Myh6 R404Q/+小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 肥厚型心肌病 | 靶向肌节基因筛查、bulk RNA测序、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、生化检测、功能获得与缺失研究 | NA | 基因序列数据、RNA表达数据、单细胞转录组数据 | 269名HCM患者组织样本及小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 579 | 2026-03-18 |
Single-cell sequencing combined with transcriptome sequencing to reveal the molecular mechanisms related to integrated stress responses in atherosclerosis
2026-Mar-17, Journal of cardiothoracic surgery
IF:1.5Q3
DOI:10.1186/s13019-026-03862-y
PMID:41840716
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 580 | 2026-03-18 |
ChemR23 prevents phenotypic switching of vascular smooth muscle cells into macrophage-like foam cells in atherosclerosis
2026-Mar-16, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf258
PMID:41264461
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研究论文 | 本研究探讨了ChemR23在血管平滑肌细胞表型转换中的作用及其对动脉粥样硬化的影响 | 揭示了ChemR23在非造血细胞（特别是血管平滑肌细胞）中调控表型转换的新功能，并发现其配体C9和抑制剂α-NETA在动脉粥样硬化中的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，人类数据仅来自单细胞转录组分析，缺乏直接的人类体内验证 | 阐明ChemR23在血管平滑肌细胞表型转换和动脉粥样硬化发展中的具体作用 | 小鼠模型（Apoe-/-和ChemR23e/e双缺陷小鼠）和人类主动脉平滑肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确）, 人类动脉粥样硬化斑块单细胞数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |