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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5701 | 2025-12-09 |
Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1663251
PMID:41200203
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了肾移植早期急性排斥反应的免疫景观,并识别出Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下描绘了肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和细胞间通讯网络,并验证了Ccl3-Ccr5轴作为治疗靶点的潜力 | 研究基于大鼠模型,结果在人类中的适用性需进一步验证;样本时间点有限,可能未覆盖所有动态变化 | 阐明肾移植早期急性排斥反应的免疫细胞动态和局部细胞间通讯机制,并探索潜在治疗靶点 | 大鼠肾移植模型中的CD45+免疫细胞 | 数字病理学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),多重免疫荧光,治疗干预实验 | 无监督聚类,细胞轨迹推断,细胞间通讯网络分析 | 单细胞转录组数据,图像数据 | 大鼠肾移植模型在移植后第0、1、3、7天采集的CD45+免疫细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5702 | 2025-12-09 |
Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1681989
PMID:41246346
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法,识别了主动脉夹层中与脂质代谢相关的新型生物标志物PLIN2和PLIN3 | 采用多模态策略结合单细胞RNA测序和机器学习,首次将PLIN2和PLIN3确定为主动脉夹层中脂质代谢的关键调节因子,并探索其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 研究主要基于计算分析和动物模型验证,缺乏大规模临床样本的直接验证,且分子机制需进一步实验探究 | 识别主动脉夹层中与脂质代谢失调相关的新型生物标志物,以阐明其病理机制并探索潜在治疗靶点 | 主动脉夹层患者样本和Ang II诱导的主动脉夹层小鼠模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析, 细胞间通讯分析, 伪时间轨迹重建, 分子对接 | 机器学习算法 | RNA测序数据 | 主动脉夹层和对照样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5703 | 2025-12-09 |
Correction: Single-cell transcriptomics unravels the early immune landscape of renal allograft rejection and nominates Ccl3-Ccr5 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1740964
PMID:41357176
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correction | 本文是对先前发表文章的更正,涉及肾脏移植排斥早期免疫景观的单细胞转录组学研究 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5704 | 2025-12-09 |
Correction: Identification of novel lipid metabolism-related biomarkers of aortic dissection by integrating single-cell RNA sequencing analysis and machine learning algorithms
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1742065
PMID:41357238
|
correction | 本文是对先前一篇关于整合单细胞RNA测序分析和机器学习算法识别主动脉夹层新型脂质代谢相关生物标志物文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 主动脉夹层 | 单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5705 | 2025-12-09 |
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350901
PMID:39101623
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研究论文 | 本研究探讨了通过靶向CD28H特异性表位来激活NK细胞,增强其对肿瘤细胞的杀伤活性,并克服HHLA2和HLA-E的抑制信号 | 揭示了靶向CD28H特定表位的单克隆抗体能强烈激活NK细胞的钙流和细胞活性,并首次在透明细胞肾癌中通过scRNA-seq分析发现CD28H NK细胞浸润HHLA2阳性肿瘤 | 研究主要基于体外实验和细胞系模型,缺乏体内动物模型验证;样本量有限,仅涉及透明细胞肾癌的scRNA-seq分析 | 探索CD28H作为NK细胞新型激活靶点在抗肿瘤免疫治疗中的潜力 | NK细胞、造血细胞系、透明细胞肾癌细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 未明确指定样本数量,但涉及透明细胞肾癌细胞的scRNA-seq分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5706 | 2025-12-09 |
A human fetal lung cell atlas uncovers proximal-distal gradients of differentiation and key regulators of epithelial fates
2022-Dec-08, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2022.11.005
PMID:36493756
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA与ATAC测序、高通量空间转录组学和单细胞成像技术,构建了一个人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱 | 结合单细胞方法与空间分析,首次全面描绘了人类肺发育中上皮、间充质、内皮及红细胞/白细胞等细胞区室,并识别了包括发育特异性分泌祖细胞和与人类小细胞肺癌相关的神经内分泌细胞亚型在内的新细胞状态 | NA | 构建人类胎儿肺发育的多组学细胞图谱,以揭示细胞分化梯度和关键调控因子 | 人类胎儿肺组织(孕后5-22周) | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 高通量空间转录组学, 单细胞成像 | NA | 单细胞多组学数据, 空间转录组数据, 成像数据 | 涵盖孕后5-22周的人类胎儿肺组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5707 | 2025-12-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals beneficial mechanisms of Exendin-4 in autoimmune uveitis
2026-Jan, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2025.117483
PMID:41173056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的有益作用机制 | 首次探索了Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的作用,并揭示了其通过抑制PIM1-AKT-FOXO1通路恢复Teff/Treg细胞平衡的新机制 | 研究主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎模型,在人类疾病中的验证仅限于VKH患者,样本代表性可能有限 | 探究Exendin-4在自身免疫性葡萄膜炎中的治疗潜力及其免疫调节机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎模型小鼠及Vogt-Koyanagi-Harada病(VKH)患者 | 单细胞组学 | 自身免疫性葡萄膜炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5708 | 2025-12-08 |
Regenerative teeth induced by in vitro mesenchymal cells in mice via repressing BMP4 and activating retinoic acid/osteopontin
2025-Dec-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00271-9
PMID:41345270
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研究论文 | 本研究开发了一种优化的N2B27培养基,成功在小鼠中通过抑制BMP4和激活视黄酸/骨桥蛋白,诱导了体外培养的牙间充质细胞再生牙齿 | 开发了能维持牙间充质细胞成牙潜能长达14天的优化培养基,显著优于传统方法(≤24小时),并揭示了BMP4抑制和骨桥蛋白/视黄酸激活在牙齿再生中的关键机制 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类细胞或临床环境中验证,且培养基的长期效果和安全性需进一步评估 | 研究牙齿再生中牙间充质细胞的体外培养和功能维持,以推进组织工程应用 | 小鼠牙间充质细胞(mDMCs) | 组织工程与再生医学 | 牙齿疾病或缺失 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5709 | 2025-12-08 |
Reversing lysosomal dysfunction restores youthful state in aged hematopoietic stem cells
2025-Dec-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.10.012
PMID:41289991
|
研究论文 | 本研究揭示了溶酶体功能障碍是造血干细胞衰老的关键驱动因素,并通过抑制溶酶体过度活化来恢复其年轻状态 | 首次发现衰老造血干细胞中溶酶体过度酸化、耗竭和异常激活,并证明通过v-ATPase抑制剂干预可逆转这些变化,显著提升干细胞再生能力 | 研究主要基于体外实验和动物模型,尚未在人体中进行验证,长期安全性和临床转化效果需进一步评估 | 探究溶酶体在造血干细胞衰老中的作用机制,并寻找恢复其功能的干预策略 | 衰老的造血干细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞转录组学、功能分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5710 | 2025-12-08 |
Human peripheral osteoclast-precursor-development patterns reveal the significance of RPS17-dependent ribosome synthesis to Ankylosing Spondylitis lesions
2025-Dec-04, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00474-5
PMID:41345114
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了强直性脊柱炎(AS)患者外周血中破骨细胞前体(OCP)发育模式的改变,并发现RPS17依赖性核糖体合成在AS病变中的关键作用 | 首次在AS患者外周血单核细胞中系统描绘了OCP发育轨迹,并识别出RPS17依赖性核糖体合成作为AS病变的核心机制,同时提出RPS17过表达的单核性OCP具有治疗潜力 | 研究样本量有限,且主要基于外周血分析,未深入探讨局部关节微环境的影响 | 阐明AS条件下破骨细胞前体发育模式的变化及其在AS病变中的作用 | 健康供体和AS患者(早期、加重期和缓解期)的外周血单核细胞(PBMCs) | 单细胞转录组学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转录组测序 | 轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据 | 健康供体和AS患者(早期、加重期和缓解期)的PBMCs样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5711 | 2025-12-08 |
LIMD2 is associated with an exhausted CD8⁺ T cell state linked to ICI response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27315-z
PMID:41345477
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据,发现LIMD2高表达的CD8⁺ T细胞与肾透明细胞癌患者对免疫检查点抑制剂的反应相关 | 首次将LIMD2鉴定为与CD8⁺ T细胞耗竭状态及免疫治疗反应相关的候选预测生物标志物 | 研究主要基于回顾性队列和公开数据集,需要前瞻性临床验证 | 阐明肾透明细胞癌中CD8⁺ T细胞功能状态与免疫检查点抑制剂反应的关系 | 肾透明细胞癌患者肿瘤浸润CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 肾癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 整合六个公开数据集及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5712 | 2025-12-08 |
Multi-omics integrated analysis identifies causal risk factors and therapeutic targets for diabetic retinopathy
2025-Dec-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07353-x
PMID:41340073
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研究论文 | 本研究通过多组学整合分析,系统识别了糖尿病视网膜病变的因果风险因素和治疗靶点 | 首次通过双样本孟德尔随机化、共定位/SMR、NHANES数据、转录组学和机器学习等多方法整合,系统识别DR的因果基因、风险因素和核心调控靶点 | 研究主要基于观察性数据和遗传学证据,需要进一步实验验证靶点的功能机制 | 探索糖尿病视网膜病变的风险因素、致病机制和潜在治疗靶点 | 糖尿病视网膜病变患者及其亚型(背景性DR、增殖性DR) | 生物信息学 | 糖尿病视网膜病变 | 孟德尔随机化、共定位分析、SMR、转录组学、单细胞转录组学、机器学习 | 逻辑回归、限制性立方样条、机器学习模型、列线图 | 遗传数据、蛋白质数据、转录组数据、临床调查数据 | NHANES 1999-2010横断面数据,涉及16,989个基因和2,923个蛋白质 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5713 | 2025-12-08 |
Pan-cancer gene set discovery via scRNA-seq for optimal deep learning based downstream tasks
2025-Dec-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-27296-z
PMID:41330999
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研究论文 | 本研究提出了一种通过整合单细胞RNA测序数据和先进分析技术,为癌症基因组学下游任务进行特征选择的稳健方法 | 首次提出利用单细胞RNA测序数据推导的基因集在泛癌研究中优于基于批量RNA测序选择的基因集,并整合hdWGCNA和XGBoost进行特征选择 | 研究仅分析了13种癌症类型的181个肿瘤活检样本,样本量和癌症类型覆盖范围可能有限 | 开发优化的基因集选择方法以提高泛癌下游任务的预测准确性 | 13种癌症类型的肿瘤活检样本及TCGA泛癌RNA测序数据 | 机器学习 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 多层感知机,图神经网络,XGBoost | 转录组数据 | 181个肿瘤活检样本(来自13种癌症类型) | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 5714 | 2025-12-08 |
Deciphering the liver's role in pancreatic cancer metastasis: pathways and therapeutic approaches
2025-Dec-02, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01202-2
PMID:41331510
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综述 | 本文综述了胰腺导管腺癌肝转移的机制,重点关注肝脏作为转移前微环境的形成过程及其分子通路 | 结合空间组织学图谱、单细胞测序等前沿技术,重新审视并批判性评估了Paget的‘种子与土壤’假说在肝转移微环境研究中的适用性 | 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行分析,未提出新的原始实验数据或临床验证 | 深入理解胰腺导管腺癌肝转移的生物学机制,为开发靶向治疗和改善临床预后提供理论基础 | 胰腺导管腺癌(PDAC)及其肝转移病灶 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 空间组织学图谱、单细胞测序、分子标记物鉴定 | NA | 组织切片、测序数据、分子标记数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 5715 | 2025-12-08 |
Abatacept restores dysregulated transcriptomic and proteomic profile in disorders of CTLA-4 insufficiency
2025-Dec, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.08.027
PMID:40967277
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研究论文 | 本研究通过多组学方法探究了阿巴西普治疗对LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者免疫系统的影响 | 首次采用整合纵向流式细胞术、靶向及单细胞转录组学与血浆蛋白质组学的多模态方法,揭示了阿巴西普治疗逆转免疫失调的新机制 | 研究样本可能较小,且为罕见疾病,结果推广需谨慎 | 探究阿巴西普在LRBA缺陷和CTLA-4功能不全疾病中的免疫调节作用 | LRBA缺陷和CTLA-4功能不全患者 | 生物信息学 | 原发性免疫失调疾病 | 纵向流式细胞术、靶向转录组学、单细胞RNA测序、血浆蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5716 | 2025-12-08 |
Integrated bulk and single-cell RNA sequencing identifies oxidative stress signatures of radiation-induced lung injury in mice through machine learning
2025-Dec, The international journal of biochemistry & cell biology
DOI:10.1016/j.biocel.2025.106863
PMID:40967560
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研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA和单细胞RNA测序数据,结合机器学习方法,在小鼠模型中系统分析了辐射诱导肺损伤的氧化应激特征,并筛选出关键生物标志物 | 首次整合bulk RNA和单细胞RNA测序数据,结合随机森林和SVM机器学习算法构建诊断模型,识别出5个与辐射诱导肺损伤相关的关键基因及其信号通路 | 研究基于小鼠模型,结果在人类临床中的适用性需要进一步验证 | 为辐射诱导肺损伤的早期诊断和靶向干预提供理论依据 | 小鼠辐射诱导肺损伤模型 | 机器学习 | 肺损伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, RT-PCR, IHC | 随机森林, SVM | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5717 | 2025-12-08 |
Decoding immune aging at single-cell resolution
2025-Dec, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2025.09.001
PMID:41006183
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在解码免疫衰老方面的应用,重点分析了年龄相关的细胞组成和功能变化 | 利用单细胞多组学技术绘制人类生命周期中的免疫轨迹,揭示了外周免疫细胞中先前未被认识的异质性和功能转变 | 存在显著的技术和分析挑战,包括跨平台和跨人群的数据整合问题 | 通过单细胞分辨率解码免疫衰老,以实现免疫衰老的早期检测、个性化免疫调节和延长健康寿命的精准策略 | 人类外周免疫细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5718 | 2025-12-08 |
Integrated multi-omics identifies GZMA targeting NK cells as a novel therapeutic strategy for hidradenitis suppurativa
2025-Dec, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2025.100363
PMID:41192724
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研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学、孟德尔随机化和单细胞转录组分析,确定了GZMA作为化脓性汗腺炎(HS)的潜在治疗靶点,并揭示了NK细胞在疾病发病机制中的关键作用 | 首次通过多组学整合方法将GZMA确定为HS的核心治疗靶点,并利用单细胞测序技术揭示了GZMA在NK细胞中的特异性表达及其与T细胞、B细胞的通讯差异 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据集,缺乏体内或体外实验验证;样本量可能有限,且孟德尔随机化分析可能存在残留混杂因素 | 阐明化脓性汗腺炎的发病机制并开发基于患者免疫特征的精准干预策略 | 化脓性汗腺炎(HS)患者及相关生物样本 | 生物信息学 | 皮肤病 | 批量转录组学、孟德尔随机化、单细胞转录组测序、分子对接模拟 | WGCNA、LASSO回归、IVW、加权中位数、简单模式、加权模式、贝叶斯MR | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5719 | 2025-12-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals tumor cell and immune cell variations associated with lymphatic metastasis in papillary thyroid cancer
2025-Dec-01, Endocrine connections
IF:2.6Q3
DOI:10.1530/EC-25-0514
PMID:41257484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了甲状腺乳头状癌中与淋巴转移相关的肿瘤细胞和免疫细胞变异 | 首次在单细胞水平上系统分析了PTC中淋巴转移相关的细胞异质性和细胞间通讯变化,特别是识别了CD8+驻留记忆T细胞在淋巴转移中的关键调控作用 | 样本量较小(仅6例患者),缺乏外部验证队列,且仅基于转录组数据 | 探究甲状腺乳头状癌中淋巴转移的细胞分子机制 | 甲状腺乳头状癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例PTC患者的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5720 | 2025-12-08 |
Single-cell transcriptomics reveals stepwise transformation of epithelial cells into Non-Professional Phagocytes
2025-Dec, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011953
PMID:41343490
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了果蝇卵巢上皮细胞分化为非专业吞噬细胞的逐步转化过程 | 通过Notch信号激活模型,结合单细胞RNA测序和轨迹分析,首次定义了NPP成熟的三个转录阶段,并鉴定了JNK-Jra-Arp2/3轴作为细胞骨架重塑的关键调控通路 | 研究基于果蝇模型,其机制在哺乳动物中的保守性尚未验证,且功能实验主要聚焦于JNK通路,其他潜在调控因子可能未被全面探索 | 探究上皮细胞向非专业吞噬细胞分化的遗传调控机制 | 果蝇卵巢上皮细胞(卵泡细胞) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序,轨迹分析,SCENIC分析,ChIP-seq,免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据,染色质免疫沉淀数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |