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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5681 | 2026-04-24 |
RIPK3 Orchestrates Scar-Associated Macrophage Dysfunction to Drive Pulmonary Fibrosis
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202519404
PMID:41709822
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研究论文 | 本研究揭示了RIPK3通过非坏死性凋亡的免疫代谢功能调控肺纤维化,并靶向疤痕相关巨噬细胞(SAMs)发挥促纤维化作用 | 首次发现RIPK3通过非坏死性凋亡的免疫代谢功能调控肺纤维化,并明确其在疤痕相关巨噬细胞(SAMs)中的关键作用 | NA | 探究RIPK3在特发性肺纤维化(IPF)中的非经典功能及其分子机制 | 特发性肺纤维化患者及小鼠模型中的巨噬细胞,特别是疤痕相关巨噬细胞(SAMs) | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | IPF患者及小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序用于分析巨噬细胞亚群 |
| 5682 | 2026-04-24 |
Single-Cell RNA Analysis of Murine Osteosarcoma Uncovers Skp2 Function in Metastasis, Genomic Instability, and Immune Activation and Reveals Additional Target Pathways
2026-Apr-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-25-0294
PMID:41877584
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠骨肉瘤,揭示Skp2在转移、基因组不稳定性和免疫激活中的作用,并发现其他靶向通路 | 首次在免疫健全的转基因小鼠骨肉瘤模型中应用单细胞RNA测序,系统揭示Skp2基因敲除对肿瘤异质性、微环境复杂性、T细胞耗竭减少、干扰素信号上调及转移抑制的多维度影响,并发现潜在逃逸机制 | 研究基于小鼠模型,结论向人类骨肉瘤的转化需要进一步验证;未详细说明单细胞分析的细胞数量或测序深度等具体数据 | 探索Skp2在骨肉瘤转移、基因组不稳定性及免疫激活中的功能,并识别新的治疗靶点 | Osx-Cre条件性Rb1/Trp53敲除小鼠的原发性骨肉瘤肿瘤细胞,以及Skp2敲除或Skp2-p27相互作用破坏的模型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学分析 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据 | 未明确具体样本数量,涉及多种基因型小鼠模型的肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5683 | 2026-04-24 |
Single-cell analysis of the human immune system reveals sex-specific dynamics of immunosenescence
2026-Apr, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-026-01099-x
PMID:41963713
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类免疫系统,揭示免疫衰老的性别特异性特征 | 首次在单细胞水平上系统揭示免疫衰老的性别二态性,发现女性免疫重塑更强且具有特定细胞亚群变化,男性则与慢性淋巴细胞白血病前驱状态相关的B细胞扩增 | 未提供具体局限性,但可能包括样本来源为外周血单核细胞,无法反映组织驻留免疫细胞的变化;横断面研究设计限制因果推断 | 探究生物学性别如何影响免疫系统在细胞水平的衰老过程 | 982名成年雌性和雄性捐赠者的外周血单核细胞 | 计算生物学, 单细胞组学 | 免疫衰老, 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 982名捐赠者(包括女性和男性) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5684 | 2026-04-24 |
Acupuncture inhibits astrocytic hyperactivationthe p38 mitogen-activated protein kinase/mitogen- and stress-activated protein kinase 1 signaling pathway in cerebral ischemia-reperfusion injury
2026-Apr, Journal of traditional Chinese medicine = Chung i tsa chih ying wen pan
DOI:10.19852/j.cnki.jtcm.2026.02.005
PMID:42015770
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序分析,探究针刺通过p38 MAPK/MSK1信号通路抑制脑缺血再灌注损伤后星形胶质细胞过度活化的机制 | 首次揭示针刺通过调控p38 MAPK/MSK1通路促进星形胶质细胞从促炎A1型向修复A2型转化的新机制 | 研究仅在大鼠模型中进行,未涉及人体临床试验验证 | 阐明针刺治疗脑缺血再灌注损伤的分子机制 | 大脑中动脉闭塞诱导的脑缺血大鼠模型 | 数字病理学 | 脑缺血再灌注损伤 | 转录组测序、单细胞测序、免疫印迹、免疫组化 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 大鼠模型,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5685 | 2026-04-24 |
Zishen Huoxue Decoction alleviates myocardial ischemia-reperfusion injury through dysregulation of endoplasmic reticulum-mitochondria homeostasis mediated by DUSP1-NDUFS4
2026-Apr, Chinese journal of natural medicines
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/S1875-5364(26)61171-5
PMID:42019993
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研究论文 | 研究滋肾活血方通过DUSP1-NDUFS4通路调控内质网-线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的机制 | 首次揭示滋肾活血方通过DUSP1-NDUFS4轴调控内质网-线粒体稳态缓解心肌缺血再灌注损伤的新机制,并鉴定了其主要活性成分山奈酚的保护作用 | 未明确说明研究的局限性 | 探索滋肾活血方调控缺血再灌注心肌线粒体蛋白稳态及代谢活动的新分子靶点 | 心肌缺血再灌注损伤的动物模型和细胞模型 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞测序,代谢组学,网络药理学 | NA | 单细胞转录组数据,代谢组数据 | 涉及动物和细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5686 | 2026-04-24 |
[Advances in tumor-associated macrophage research driven by single-cell sequencing and spatial omics technologies]
2026-Apr, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:42020332
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综述 | 本文综述了单细胞测序和空间组学技术在肿瘤相关巨噬细胞研究中的进展 | 利用单细胞RNA测序和空间组学技术识别多种转录上不同、功能特化的TAM亚群,超越了传统的M1/M2极化框架 | NA | 探讨单细胞和空间组学技术如何推动肿瘤相关巨噬细胞研究及精准免疫治疗策略开发 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAM)在各种实体肿瘤(包括胶质瘤、肝癌和乳腺癌)中的亚群 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 空间组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | NA |
| 5687 | 2026-04-24 |
TAZ alleviates ischemic stroke injury by activating Foxo1: Usp1-mediated deubiquitination is the pivotal mechanism
2026-Mar-30, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本文揭示了转录共激活因子TAZ通过Usp1介导的去泛素化稳定自身并激活Foxo1,从而减轻缺血性脑卒中氧化损伤和神经元凋亡的机制 | 首次发现Usp1-TAZ-Foxo1轴是缺血性脑卒中抗氧化防御和神经元存活的關鍵调控通路,并阐明了TAZ通过去泛素化稳定的分子机制 | 仅使用了小鼠模型和体外神经元损伤模型,研究结果尚需在临床样本中验证;机制细节如Usp1对TAZ的特异性调控仍需进一步探索 | 阐明转录共激活因子TAZ在缺血性脑卒中中调控氧化损伤的作用及其分子机制 | 缺血性脑卒中小鼠模型及氧糖剥夺/复氧神经元损伤模型 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5688 | 2026-04-24 |
Integrated single-cell and spatial mapping coupled with machine learning unveils core stemness landscapes and regulatory drivers in triple-negative breast cancer
2026-Mar-23, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04824-5
PMID:41870799
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研究论文 | 整合单细胞和空间转录组数据,结合机器学习构建三阴性乳腺癌干细胞性景观及调控驱动因子模型 | 首次将单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习技术相结合,构建基于五个核心干性相关基因(CALD1, ANP32B, FIS1, CD82, APLP2)的预测模型,并揭示了高干性评分与不良预后及免疫逃逸的关联 | 研究主要基于公开数据集,缺乏独立的临床队列验证;虚拟敲除实验尚未在体内或体外模型中进行功能验证 | 解析三阴性乳腺癌中癌症干细胞相关干性特征的分子调控机制,并构建预测模型以指导个性化治疗 | 三阴性乳腺癌患者的单细胞、空间转录组和批量转录组数据 | 机器学习, 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 | XGBoost, 机器学习 | 基因表达数据, 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5689 | 2026-03-18 |
Integrative bibliometrics and spatial transcriptomics identify CAF-associated genes and immune niches in hepatocellular carcinoma
2026-Mar-16, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04694-x
PMID:41838222
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5690 | 2026-04-24 |
IDH2 Clonal Hematopoiesis and IKAROS Loss Cooperate in a B-ALL Subtype after Lenalidomide Therapy for Multiple Myeloma
2026-03-13, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031047
PMID:41824395
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研究论文 | 该研究对57例来那度胺相关B细胞急性淋巴细胞白血病(LenB-ALL)进行了全面的分子特征分析,揭示了三种突变亚群,并发现IDH2 R140Q突变在LenB-ALL中高度富集 | 首次将来那度胺相关B-ALL定义为IDH2突变克隆造血与IKAROS缺失协同作用的分子亚型,并阐明了来那度胺通过促进IDH2突变克隆扩增及IKAROS下调导致B前体细胞成熟阻滞的致癌机制 | 研究样本量有限且为回顾性分析,未探索IDH2突变在不同种族人群中的差异,未明确继发白血病中其他遗传或表观遗传改变的具体类型 | 阐明来那度胺相关B-ALL的分子特征及致病机制 | 57例来那度胺治疗多发性骨髓瘤后继发B-ALL的患者标本 | 数字病理学 | B细胞急性淋巴细胞白血病, 多发性骨髓瘤 | NGS, RNA-seq, 甲基化测序, 单细胞RNA测序 | NA | DNA序列, RNA序列, 甲基化数据, 单细胞转录组数据 | 57例来那度胺相关B-ALL患者标本及对照样本 | Illumina | 单细胞RNA测序 | Illumina NovaSeq | NA |
| 5691 | 2026-04-24 |
Insights from pooled CRISPRi single-cell screens in K562 cells reveal gene functions, regulatory networks, and highlight opportunities and limitations
2026-Mar-13, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-026-12667-1
PMID:41826830
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研究论文 | 本研究利用改良的CRISPRi单细胞筛选技术在K562细胞中敲低六个转录因子,重建基因调控网络并评估技术潜力与局限性 | 优化CROP-seq方案实现sgRNA高效捕获,无需单独富集步骤,并揭示如LMO2-GATA2等新调控相互作用 | 仅约40-50%靶基因实现有效敲低,扰动效率存在实验间差异,需进一步优化标准化 | 评估联合CRISPRi和单细胞RNA测序的筛选技术在基因功能解析和调控网络重建中的潜力与局限性 | K562细胞系中的六个转录因子(LMO2、TCF3、LDB1、MYB、GATA2、RUNX1) | 功能性基因组学 | NA | CRISPRi、单细胞RNA测序、CROP-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | K562细胞系,具体样本数未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | CROP-seq | 改良CRISPR droplet sequencing (CROP-seq) 方案,从cDNA文库直接捕获sgRNA |
| 5692 | 2026-04-24 |
The MDM2-p53 Axis in Osteosarcoma: Current Understanding of Regulatory Mechanisms and Targeted Therapeutic Strategies
2026-Mar-13, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030476
PMID:41901322
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综述 | 系统阐述骨肉瘤中MDM2-p53通路的分子机制及靶向治疗策略 | 综述了新兴MDM2抑制剂(如APG-115)进入II期临床试验的突破进展,并引入单细胞测序和AI辅助药物设计加速开发 | 多数药物尚未在骨肉瘤专用队列中验证,早期抑制剂存在疗效有限与剂量限制性毒性 | 阐明MDM2-p53通路调控机制并总结靶向治疗策略 | 骨肉瘤患者及MDM2-p53通路相关分子机制 | 机器学习 | 骨肉瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5693 | 2026-04-24 |
Transcriptome combined with single-cell data to construct a prognostic model for glycosylation-related genes in osteosarcoma
2026-Mar-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04761-3
PMID:41820703
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研究论文 | 结合转录组和单细胞数据构建骨肉瘤糖基化相关基因的预后模型 | 首次系统性地将单细胞RNA测序数据与转录组数据结合,鉴定骨肉瘤中糖基化相关基因的预后价值,并构建了基于LASSO回归的预后模型 | 未明确指出具体局限,但可能包括数据集样本量有限和模型验证不足 | 鉴定骨肉瘤中糖基化相关预后基因并构建预后模型,探索其分子机制 | 骨肉瘤患者样本(来自GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048数据集) | 机器学习 | 骨肉瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序 | LASSO回归、Cox比例风险模型 | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明样本量,但涉及多个公开数据集(GSE36001、TARGET-OS、GSE21257和GSE152048) | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 5694 | 2026-04-24 |
Pericytes and mesenchymal stromal cells converge toward pro-tumor phenotypes in the tumor microenvironment
2026-Mar-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04790-y
PMID:41811593
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综述 | 综述间充质基质细胞和周细胞在肿瘤微环境中向促肿瘤表型的趋同现象 | 提出了MSC-周细胞状态分类框架,强调了空间分辨多标志物分析的重要性 | 该领域仍需更多实验验证机制,且目前对表型趋同的理解还比较有限 | 探讨MSCs和周细胞在肿瘤微环境中功能趋同的角色及其对治疗的影响 | 肿瘤微环境中的间充质基质细胞和周细胞 | 分子生物学 | 结直肠癌, 血液系统恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5695 | 2026-04-24 |
Comprehensive In Silico Investigation of L-Glutamine Transporters and Metabolism in Glioblastoma
2026-Mar-11, Pharmaceuticals (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/ph19030455
PMID:41901300
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研究论文 | 通过计算生物学方法系统研究了胶质母细胞瘤中L-谷氨酰胺转运蛋白和代谢的调控机制 | 首次系统整合多组学数据(转录组、表观遗传、单细胞RNA测序等)鉴定了三个与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义的基因(CP、SLC25A13、SLC38A2),并揭示其通过不同机制驱动GBM恶性进展 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据,缺乏独立实验验证,药物基因组学分析和分子对接仅作为辅助验证层 | 系统鉴定胶质母细胞瘤中与谷氨酰胺代谢相关且具有预后意义和生物学合理性的调控因子 | 胶质母细胞瘤(GBM)中谷氨酰胺代谢相关基因 | 机器学习 | 脑肿瘤 | RNA测序、单细胞RNA测序、分子对接 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、表观遗传数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和GTEx数据库的转录组数据,CGGA数据库的生存验证数据 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 5696 | 2026-04-24 |
HIF3A-mediated aberrant activation of TXNIP promotes Alzheimer's disease progression
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-43404-z
PMID:41807716
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示HIF3A通过转录上调TXNIP介导阿尔茨海默病中星形胶质细胞的异常氧化应激反应 | 首次在单细胞水平上鉴定了星形胶质细胞中HIF3A作为关键氧化应激相关基因,并阐明其通过直接结合TXNIP启动子促进阿尔茨海默病进展的分子机制 | NA | 探究阿尔茨海默病中细胞类型特异性的氧化应激机制 | 星形胶质细胞中HIF3A和TXNIP的调控关系 | 自然语言处理 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5697 | 2026-04-24 |
Spatial cartography of human thymus enables the geopositioning of lineage transcription factors in rare mimetic thymic epithelial cells
2026-Mar-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68596-w
PMID:41807357
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研究论文 | 利用Stereo-seq空间转录组学技术构建人类胎儿和儿童胸腺的高分辨率空间图谱,揭示稀有模拟胸腺上皮细胞中的谱系转录因子定位 | 首次应用Stereo-seq空间转录组学技术建立人类胎儿和儿童胸腺的高分辨率空间图谱,并定位调控稀有模拟胸腺上皮细胞的谱系转录因子 | 未提及具体限制,但可能涉及样本量有限(仅胎儿和儿童样本)以及空间分辨率的局限性 | 构建人类胸腺的高分辨率空间图谱,揭示稀有模拟胸腺上皮细胞中谱系转录因子的空间定位和调控机制 | 人类胎儿(受孕后13、14、17或18周)和儿童(7周、2、5或6岁)胸腺组织 | 空间转录组学 | NA | Stereo-seq空间转录组学, 空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据 | 多个胎儿(13、14、17或18周)和儿童(7周、2、5或6岁)胸腺样本 | BGI | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组学平台 |
| 5698 | 2026-04-24 |
Human neuronal differentiation under Aβ exposure: a single-cell transcriptomic and epigenomic dataset
2026-Mar-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06971-4
PMID:41807428
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研究论文 | 本研究呈现了一个多模态单细胞数据集,记录人类诱导多能干细胞衍生的神经前体细胞在淀粉样蛋白-β暴露下进行神经分化的转录组和表观基因组动态 | 首次提供配对单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序的多模态数据集,用于在淀粉样蛋白-β暴露条件下分析神经分化过程中的转录和染色质可及性动力学 | 未明确指出局限 | 构建一个参考多模态数据集,支持人类NPC衍生神经分化的研究及单细胞、多模态整合和调控网络分析 | 人类诱导多能干细胞衍生的神经前体细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | 基因表达数据,染色质可及性数据 | RNA测序42575个高质量细胞,ATAC测序30192个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 5699 | 2026-04-24 |
Mechanism of action of Astragalus membranaceus for treating diabetic foot ulcers based on single-cell RNA sequencing data and network pharmacology
2026-Mar-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-41921-5
PMID:41807627
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序数据和网络药理学探究黄芪治疗糖尿病足溃疡的作用机制 | 首次将单细胞RNA测序与网络药理学相结合,在单细胞分辨率下系统揭示黄芪通过调控巨噬细胞相关分子途径治疗糖尿病足溃疡的机制 | 结果基于公开数据集和分析手段,仍需进一步的功能和转化研究验证 | 探究黄芪治疗糖尿病足溃疡的潜在分子机制 | 糖尿病足溃疡患者和对照组的伤口组织样本中的巨噬细胞及其他细胞类型 | 生物信息学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序、网络药理学、分子对接、qPCR验证 | NA | 基因表达数据 | scRNA-seq队列:4例非糖尿病足溃疡和5例糖尿病足溃疡样本;临床验证队列:6例非糖尿病足溃疡和9例糖尿病足溃疡患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5700 | 2026-04-24 |
Gene expression dynamics of human and mouse craniofacial development at the single-cell level
2026-Mar-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70232-6
PMID:41803119
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研究论文 | 通过单细胞核RNA测序分析人类和老鼠颅面发育的基因表达动态 | 首次在单细胞水平上系统描绘人类颅面发育4至8周的细胞类型图谱,并比较人类与老鼠的发育保守性及差异,揭示细胞亚型对正常面部形态和唇腭裂风险的贡献 | 研究样本仅限于4至8周胚胎阶段,可能未覆盖更早或更晚发育时期的细胞动态;单细胞核测序可能遗漏某些细胞质的转录信息 | 阐明人类颅面发育过程中细胞类型的多样性和基因表达动态 | 人类和老鼠的颅面发育组织样本 | 单细胞组学 | 唇腭裂 | 单细胞核RNA测序,空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 人类颅面发育样本(孕4至8周);老鼠发育阶段样本 | 10x Genomics | 单细胞核RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium | NA |