单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 5681 - 5700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5681 | 2024-12-08 |
Chrna5 and lynx prototoxins identify acetylcholine super-responder subplate neurons
2023-Feb-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2023.105992
PMID:36798433
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研究论文 | 研究通过复杂转基因小鼠模型探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性，发现Chrna5+神经元中存在乙酰胆碱超反应者亚群，并利用单细胞转录组学揭示了其分子标记 | 首次发现Chrna5+神经元中的乙酰胆碱超反应者亚群，并确定了其独特的GPI锚定lynx原毒素基因表达模式 | NA | 探索Chrna5+神经元及其对内源性乙酰胆碱的敏感性，揭示其在注意力障碍中的潜在作用 | Chrna5+神经元及其对乙酰胆碱的反应 | 神经科学 | 注意力障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 复杂转基因小鼠模型 |
| 5682 | 2024-12-08 |
Differential expression of single-cell RNA-seq data using Tweedie models
2022-08-15, Statistics in medicine
IF:1.8Q1
DOI:10.1002/sim.9430
PMID:35656596
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研究论文 | 本文提出使用Tweedie广义线性模型来建模跨平台单细胞RNA测序数据的技术变异性，并比较了其与现有差异表达方法的性能 | 本文提出了一种新的Tweedie广义线性模型和零膨胀Tweedie模型，用于建模单细胞RNA测序数据中的技术变异性和零膨胀现象 | NA | 研究如何更好地识别单细胞RNA测序数据中的差异表达特征 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达特征 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Tweedie广义线性模型 | 基因表达数据 | 使用了合成数据和已发表的基于板和液滴的单细胞RNA测序数据集 |
| 5683 | 2024-12-08 |
A public antibody class recognizes an S2 epitope exposed on open conformations of SARS-CoV-2 spike
2022-08-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-32232-0
PMID:35927266
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研究论文 | 研究了SARS-CoV-2感染和疫苗接种引发的抗体起源和特性，特别是针对S蛋白S2亚基上的非中和表位的抗体 | 发现了一类针对SARS-CoV-2 S蛋白S2亚基上非中和表位的抗体，这些表位在疫苗使用的S蛋白从原生预融合状态转变时暴露 | NA | 理解SARS-CoV-2感染和疫苗接种引发的抗体的益处和潜在不足 | SARS-CoV-2 S蛋白反应性B细胞的特征和起源 | NA | NA | 流式细胞术和单细胞测序 | NA | 细胞 | 未暴露个体的SARS-CoV-2 S蛋白反应性B细胞 |
| 5684 | 2024-12-08 |
Single-cell multiomics revealed the dynamics of antigen presentation, immune response and T cell activation in the COVID-19 positive and recovered individuals
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.1034159
PMID:36532041
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术研究COVID-19阳性、康复和健康个体中的抗原呈递、免疫反应和T细胞激活的动态变化 | 首次使用单细胞多组学技术研究COVID-19康复个体中的免疫反应动态变化 | 研究样本量相对较小，可能影响结果的普适性 | 深入理解COVID-19感染后的免疫反应动态变化，特别是康复患者的免疫状态 | COVID-19阳性、康复和健康个体的免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞多组学（全转录组分析和抗体测序） | 贝叶斯网络模型 | 单细胞转录组和表面标记数据 | 33个个体（健康=4，COVID-19阳性=16，COVID-19康复=13），共163,197个细胞（数据质控后124,726个细胞） |
| 5685 | 2024-12-08 |
Gut-licensed IFNγ+ NK cells drive LAMP1+TRAIL+ anti-inflammatory astrocytes
2021-02, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-03116-4
PMID:33408417
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研究论文 | 研究通过高通量流式细胞术筛选、单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9介导的细胞特异性体内遗传扰动，鉴定出表达LAMP1和TRAIL的星形胶质细胞亚群，并探讨其在中枢神经系统炎症中的作用 | 首次揭示了LAMP1TRAIL星形胶质细胞通过TRAIL-DR5信号诱导T细胞凋亡来限制中枢神经系统炎症，并发现这种星形胶质细胞亚群由肠道微生物群调节的IFNγ NK细胞维持 | 研究主要在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨星形胶质细胞在中枢神经系统炎症中的抗炎作用及其调控机制 | 星形胶质细胞、NK细胞、肠道微生物群 | 神经科学 | NA | 高通量流式细胞术、单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9 | NA | RNA | 小鼠 |
| 5686 | 2024-12-08 |
Integrated single-cell analysis of multicellular immune dynamics during hyperacute HIV-1 infection
2020-04, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0799-2
PMID:32251406
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了HIV-1感染期间的免疫细胞动态变化 | 揭示了先前未被重视的个体和细胞类型特异性干扰素刺激基因上调，以及在批量分析中被掩盖的时间相关基因表达反应 | 研究仅限于四个未治疗的个体，样本量较小 | 探讨HIV-1感染期间免疫细胞的动态变化及其分子驱动因素 | HIV-1感染期间的外周血单核细胞 | 数字病理学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 四个未治疗的个体的外周血单核细胞样本 |
| 5687 | 2024-12-07 |
Neonatal inflammation impairs developmentally-associated microglia and promotes a highly reactive microglial subset
2025-Jan, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2024.09.019
PMID:39322088
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研究论文 | 研究新生儿炎症对小鼠神经发育障碍模型中脑髓样细胞亚群的影响 | 通过单细胞RNA测序和流式细胞术，识别出表达补体受体C5ar1的特定微胶质细胞亚群，并发现其在炎症途径中高度激活 | NA | 探讨新生儿炎症对神经发育障碍中微胶质细胞发育轨迹的影响 | 小鼠神经发育障碍模型中的脑髓样细胞亚群 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 5688 | 2024-12-07 |
Elevated Shear Stress Modulates Heterogenous Cellular Subpopulations to Induce Vascular Remodeling
2024-Dec, Tissue engineering. Part A
DOI:10.1089/ten.TEA.2023.0362
PMID:38753711
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研究论文 | 研究探讨了高剪切应力对血管重塑过程中异质细胞亚群的调节作用 | 首次在单细胞分辨率下全面研究高剪切应力诱导血管重塑的分子机制 | 研究仅限于动物模型，尚未在人体中验证 | 探讨高剪切应力对血管重塑的影响及其分子机制 | 血管内皮细胞和巨噬细胞 | 心血管疾病 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用大鼠隐静脉构建动静脉环路模型 |
| 5689 | 2024-12-07 |
A Strategy Involving Microporous Microneedles Integrated with CAR-TREM2-Macrophages for Scar Management by Regulating Fibrotic Microenvironment
2024-Dec, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202406153
PMID:39313983
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研究论文 | 本文介绍了一种利用微孔微针集成CAR-TREM2-巨噬细胞的策略，通过调节纤维化微环境来管理瘢痕 | 开发了CAR-TREM2-巨噬细胞，能够靶向DPP4成纤维细胞并调节瘢痕微环境中的内皮细胞亚型，有效预防瘢痕形成 | NA | 研究通过多因素调节瘢痕微环境来抑制瘢痕形成的有效策略 | DPP4阳性成纤维细胞、内皮细胞、TREM2巨噬细胞 | 数字病理学 | 皮肤损伤 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 5690 | 2024-12-07 |
Investigating TCR-pMHC interactions for TCRs without identified epitopes by constructing a computational pipeline
2024-Dec, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2024.136502
PMID:39423970
|
研究论文 | 本文提出了一种计算流程，结合结构信息和单细胞测序数据，研究未识别表位的TCR的表位识别机制 | 通过抗原特异性聚类，将已知表位和未知表位的TCR进行表位序列映射，并使用分子动力学模拟揭示表位识别机制 | NA | 研究TCR与pMHC相互作用的分子机制，以激活T细胞免疫反应并合理设计基于TCR的治疗方法 | 未识别表位的TCR的表位识别机制 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 分子动力学模拟 | 序列数据 | 614个T细胞（TCR-614）和204个T细胞（TCR-204） |
| 5691 | 2024-12-01 |
Cellular diversity of human inner ear organoids revealed by single-cell transcriptomics
2024-Dec-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.202524
PMID:39612289
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学揭示了人类内耳类器官的细胞多样性 | 本文讨论了通过单细胞转录组学分析提供的新见解，有助于定义理解内耳发育的新研究路径 | 目前尚不清楚这些类器官在多大程度上模拟了体内人类内耳的发育和细胞组成 | 研究人类内耳类器官的细胞多样性及其在发育、听力损失和眩晕相关突变以及新疗法中的应用 | 人类内耳类器官及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5692 | 2024-12-07 |
Alpha-2-macroglobulin mitigates glucocorticoid-induced osteonecrosis via Keap1/Nrf2 pathway activation
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了α-2-巨球蛋白通过激活Keap1/Nrf2信号通路减轻糖皮质激素诱导的股骨头坏死的作用 | 首次揭示了α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其通过Keap1/Nrf2通路减轻症状的机制 | 研究主要基于动物模型和患者样本的转录组和蛋白质组分析，缺乏更大规模的人体临床试验验证 | 探讨α-2-巨球蛋白在糖皮质激素诱导的股骨头坏死中的作用及其机制 | 糖皮质激素诱导的股骨头坏死及其相关生物标志物 | NA | 股骨头坏死 | 转录组分析、蛋白质组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 患者样本和糖皮质激素诱导的股骨头坏死大鼠模型 |
| 5693 | 2024-12-07 |
Taurine ameliorates radiation-induced oxidative stress in bone marrow mesenchymal stromal cells and promotes osteogenesis
2024-Nov-20, Free radical biology & medicine
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研究论文 | 研究探讨了牛磺酸对辐射诱导的骨髓间充质干细胞氧化应激的影响及其促进成骨的作用 | 首次揭示了牛磺酸代谢在辐射后下颌骨间充质细胞中的激活，并通过补充牛磺酸显著改善了辐射小鼠的生存率和下颌骨成骨 | 研究主要集中在小鼠模型上，尚未在人类患者中进行验证 | 探讨牛磺酸在辐射诱导的下颌骨坏死中的作用及其潜在的治疗价值 | 骨髓间充质干细胞和辐射小鼠 | NA | NA | scRNA-Seq 和代谢组学 | NA | NA | 辐射和未辐射的骨髓间充质干细胞，以及辐射和未辐射的小鼠 |
| 5694 | 2024-12-07 |
[Revealing research progress for immunological characteristics of chronic hepatitis B applying single-cell RNA sequencing technology]
2024-Nov-20, Zhonghua gan zang bing za zhi = Zhonghua ganzangbing zazhi = Chinese journal of hepatology
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研究论文 | 本文总结了单细胞RNA测序技术在慢性乙型肝炎免疫特征研究中的进展 | 利用单细胞RNA测序技术揭示慢性乙型肝炎中免疫细胞转录组微小变化，为探索免疫发病机制和潜在治疗靶点提供技术支持 | NA | 探讨慢性乙型肝炎的免疫机制和潜在治疗靶点 | 慢性乙型肝炎患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 5695 | 2024-12-07 |
Hexokinase 2 expression in apical enterocytes correlates with inflammation severity in patients with inflammatory bowel disease
2024-10-23, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03710-7
PMID:39444028
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研究论文 | 研究了炎症性肠病患者中顶端肠上皮细胞的己糖激酶2表达与炎症严重程度的关系 | 首次系统研究了己糖激酶2表达与炎症性肠病活动性的关系，并提出了靶向己糖激酶2抑制作为潜在治疗途径 | 研究基于两个独立队列的数据，但样本量和队列数量有限 | 探讨己糖激酶2表达与炎症性肠病炎症严重程度的关系 | 炎症性肠病患者的顶端肠上皮细胞 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 转录组数据 | 两个独立队列的炎症性肠病患者，包括克罗恩病和溃疡性结肠炎患者 |
| 5696 | 2024-12-07 |
Integrative bioinformatics analysis for identifying the mitochondrial-related gene signature associated with immune infiltration in premature ovarian insufficiency
2024-10-08, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-024-03675-7
PMID:39379953
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析，识别与早发性卵巢功能不全（POI）相关的线粒体基因特征及其与免疫浸润的关系 | 首次揭示了线粒体功能与免疫反应在POI发展中的相互作用，并识别出可能的生物标志物和治疗药物 | 研究主要基于转录组数据和生物信息学分析，缺乏体内实验验证 | 探讨线粒体功能与免疫反应在早发性卵巢功能不全中的相互作用 | 早发性卵巢功能不全（POI）及其相关的线粒体基因和免疫细胞 | 生物信息学 | 生殖疾病 | 转录组分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络构建、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括POI模型和人类颗粒细胞（GCs）在内的多种细胞类型 |
| 5697 | 2024-12-07 |
Early amyloid-induced changes in microglia gene expression in male APP/PS1 mice
2024-03, Journal of neuroscience research
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/jnr.25295
PMID:38515329
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研究论文 | 研究了阿尔茨海默病模型小鼠中早期淀粉样蛋白诱导的微胶质细胞基因表达变化 | 首次揭示了早期淀粉样蛋白诱导的微胶质细胞基因表达变化，并使用单细胞RNA测序技术分析了从稳态到CD11c阳性微胶质细胞的转录轨迹 | 研究仅限于雄性APP/PS1小鼠，且样本量较小 | 探究阿尔茨海默病早期淀粉样蛋白诱导的微胶质细胞基因表达变化 | 雄性APP/PS1小鼠的海马微胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个月大的APP/PS1小鼠和野生型同窝小鼠的海马微胶质细胞 |
| 5698 | 2024-12-07 |
Statistical inference with a manifold-constrained RNA velocity model uncovers cell cycle speed modulations
2024-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576093
PMID:38328127
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研究论文 | 本文开发了一种生成模型和贝叶斯推断方法，用于解决现有RNA速度算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题，并在细胞周期研究中验证了其有效性 | 提出了一个生成模型和贝叶斯推断方法，将速度场和流形估计结合在一个统一的框架中，以一致地识别自主动力系统的参数 | NA | 开发一种新的RNA速度推断方法，以解决现有算法的不稳定性和缺乏统计控制的问题 | 细胞周期中的基因调控动力学 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA速度 | 生成模型 | 基因表达数据 | 多个样本和全基因组Perturb-seq数据 |
| 5699 | 2024-12-07 |
Flow-induced reprogramming of endothelial cells in atherosclerosis
2023-11, Nature reviews. Cardiology
DOI:10.1038/s41569-023-00883-1
PMID:37225873
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综述 | 本文讨论了动脉粥样硬化中血流诱导的内皮细胞重编程现象及其潜在的致动脉粥样硬化机制 | 提出了血流诱导的内皮细胞重编程（FIRE）作为潜在的致动脉粥样硬化机制 | NA | 探讨血流诱导的内皮细胞重编程机制及其在动脉粥样硬化中的作用 | 内皮细胞在动脉粥样硬化中的重编程机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序和染色质可及性分析 | NA | NA | 使用小鼠模型进行研究 |
| 5700 | 2024-12-06 |
Subtype-specific transcription factors affect polyamine metabolism and the tumor microenvironment in breast cancer
2025-Feb, Cancer innovation
DOI:10.1002/cai2.138
PMID:39629335
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研究论文 | 研究了转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢和肿瘤微环境的影响 | 首次确定了三个亚型特异性转录因子，它们调控高风险乳腺癌亚型中的三个多胺代谢基因，并影响肿瘤微环境 | 研究仅限于乳腺癌亚型，未涵盖其他癌症类型 | 探讨转录因子对乳腺癌亚型中多胺代谢基因的调控及其对肿瘤微环境的影响 | 乳腺癌亚型中的多胺代谢基因及其转录因子 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 涉及四种乳腺癌亚型的RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据 |