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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5481 | 2025-10-05 |
Unveiling the mechanisms of yanhusuo's therapeutic effects in neuropathic pain through network pharmacology, single-cell RNA sequencing, and molecular docking
2025-Sep-24, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00551-z
PMID:40993792
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研究论文 | 本研究通过整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子对接技术,系统揭示延胡索治疗神经病理性疼痛的多靶点多通路作用机制 | 首次将网络药理学、单细胞测序和分子对接技术整合应用于中药延胡索的神经病理性疼痛治疗机制研究 | 研究主要基于计算预测和体外实验,需要进一步的体内实验验证 | 阐明延胡索治疗神经病理性疼痛的分子机制 | 神经病理性疼痛患者和延胡索活性成分 | 生物信息学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序,网络药理学,分子对接 | 无监督聚类,蛋白质-蛋白质相互作用网络 | 基因表达数据,化合物结构数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5482 | 2025-10-05 |
JMJD6-driven epigenetic activation of COL4A2 reprograms glioblastoma vascularization via integrin α1β1-dependent PI3K/MAPK signaling
2025-Sep-24, Acta neuropathologica communications
IF:6.2Q1
DOI:10.1186/s40478-025-02114-9
PMID:40993804
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现JMJD6驱动的COL4A2通过整合素α1β1激活PI3K/MAPK信号通路,促进胶质母细胞瘤血管生成 | 首次揭示JMJD6介导的COL4A2表观遗传激活通过整合素α1β1受体促进胶质母细胞瘤血管生成的新机制 | NA | 探索胶质母细胞瘤血管生成的分子机制并寻找新的抗血管生成治疗靶点 | 胶质母细胞瘤细胞、肿瘤相关内皮细胞 | 表观遗传学、肿瘤生物学 | 胶质母细胞瘤 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多组学分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5483 | 2025-10-05 |
Comprehensive profiling of immune cell infiltration and biomarker identification in intervertebral disc degeneration
2025-Sep-24, Journal of orthopaedic surgery and research
IF:2.8Q1
DOI:10.1186/s13018-025-06250-9
PMID:40993805
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析和单细胞RNA测序技术,系统描绘了椎间盘退变中的免疫细胞浸润动态并识别了关键生物标志物 | 首次结合CIBERSORT反卷积分析、WGCNA网络分析和单细胞RNA测序,系统揭示了椎间盘退变中免疫细胞浸润的动态变化特征 | 研究主要基于大鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 阐明椎间盘退变过程中的免疫细胞浸润特征并识别治疗靶点 | 椎间盘退变大鼠模型和体外培养的髓核细胞 | 生物信息学 | 椎间盘退变 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,蛋白质印迹,免疫组织化学 | NA | 基因表达数据,单细胞测序数据,蛋白质表达数据 | 大鼠椎间盘退变模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5484 | 2025-10-05 |
Integrating multi-omic Mendelian randomization, microarray, single-cell RNA sequencing, and spatial RNA sequencing to identify potential therapeutic targets for vitiligo
2025-Sep-24, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.09.015
PMID:41005615
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研究论文 | 通过多组学孟德尔随机化分析结合单细胞和空间转录组测序,鉴定CTSS作为白癜风潜在治疗靶点 | 首次整合多组学孟德尔随机化、微阵列、单细胞RNA测序和空间RNA测序技术系统研究白癜风发病机制 | NA | 鉴定白癜风潜在治疗靶点 | 白癜风患者黑色素细胞和免疫细胞 | 生物信息学 | 白癜风 | 多组学孟德尔随机化, 微阵列, 单细胞RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 4,479个可药物化基因的QTL数据结合GWAS数据 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | NA |
| 5485 | 2025-10-05 |
Next-gen tools in cancer neuroscience
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116258
PMID:40934086
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综述 | 本文综述了推动癌症神经科学领域发展的新一代技术工具 | 整合了单细胞转录组学、空间转录组学、光遗传学、化学遗传学等多种前沿技术来研究神经系统与癌症的相互作用 | NA | 探讨连接肿瘤学与神经科学的关键技术 | 神经系统与癌症相互作用的组成部分 | 癌症神经科学 | 癌症 | 单细胞转录组学,空间转录组学,光遗传学,化学遗传学,工程病毒,神经元活动可视化 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5486 | 2025-10-05 |
Tertiary lymphoid structures in Merkel cell carcinoma facilitate naïve and central memory T-cell infiltration linked to immunotherapy response
2025-Sep-23, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-012224
PMID:40992783
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研究论文 | 本研究探讨默克尔细胞癌中三级淋巴结构对T细胞浸润和免疫治疗反应的影响机制 | 首次系统揭示三级淋巴结构通过高内皮小静脉促进初始和中央记忆T细胞浸润的详细机制,并发现TCR克隆多样性与病毒抗原反应性的关联 | 样本量较小(27例患者),部分分析仅在选定病例中进行空间转录组学 | 阐明三级淋巴结构在默克尔细胞癌免疫微环境中的作用机制 | 27例默克尔细胞癌患者的肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 默克尔细胞癌 | 转录组分析、多重免疫可视化分析、T细胞受体克隆分型、空间转录组学 | 加权基因共表达网络分析 | RNA测序数据、免疫组织化学数据、空间转录组数据 | 27例默克尔细胞癌患者 | NA | 空间转录组学、RNA测序、V(D)J测序 | NA | NA |
| 5487 | 2025-10-05 |
Spatial regulation of CD8+ T cells at the HLA-E-NKG2A axis drives HIV persistence in lymph node B cell follicles
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116181
PMID:40849901
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学和高维组织细胞计量技术揭示了HIV在淋巴结B细胞滤泡中持续存在的免疫调控机制 | 首次发现HLA-E-NKG2A轴在调节滤泡CD8+T细胞功能中的关键作用,揭示了HIV免疫逃避的新机制 | 研究样本仅限于HIV感染者,缺乏健康对照组比较 | 探究淋巴结B细胞滤泡中HIV持续存在的免疫调控机制 | HIV感染者的淋巴结组织样本 | 数字病理学 | HIV感染 | 空间转录组学,高维组织细胞计量,荧光激活细胞分选 | NA | 空间转录组数据,组织图像,流式细胞数据 | 不同抗逆转录病毒治疗阶段的HIV感染者淋巴结样本 | NA | 空间转录组学,单细胞分析 | NA | NA |
| 5488 | 2025-10-05 |
Junctional adhesion molecule C limits glioblastoma stem-like cell invasion by regulating integrin adhesion at the endothelial interface
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116194
PMID:40875295
|
研究论文 | 本研究揭示了连接粘附分子C(JAMC)通过调节整合素粘附在限制胶质母细胞瘤干细胞样细胞侵袭中的关键作用 | 首次发现JAMC通过调节整合素粘附在胶质母细胞瘤干细胞样细胞与内皮细胞界面相互作用中的关键调控功能 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索胶质母细胞瘤干细胞样细胞与血管内皮界面相互作用的分子机制 | 胶质母细胞瘤干细胞样细胞(GSCs) | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 空间转录组学,定量蛋白质组学,脱细胞基质,共培养,器官型脑切片 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,细胞行为数据 | 人类样本和小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5489 | 2025-10-05 |
Single-cell transcriptomic reconstruction of the human hair cycle: Capturing the temporal dynamics of skin tissue remodeling
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116196
PMID:40884793
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序重建人类毛发周期的时间动态,揭示皮肤组织重塑的分子机制 | 首次在人类皮肤组织中构建了毛发周期的伪时间序列,揭示了16种不同细胞群体在毛发周期中的连续基因表达变化 | 样本数量有限(19个皮肤组织),且为计算重建的伪时间序列而非真实时间序列 | 研究人类皮肤组织在毛发周期中的动态重塑过程 | 人类皮肤组织中的毛囊及相关细胞群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 伪时间序列分析 | 单细胞转录组数据 | 19个人类皮肤组织样本,每个样本包含单个毛囊 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5490 | 2025-10-05 |
Epac1 deletion attenuates Müller glial pathological activation and mitigates retinal neurodegeneration in ischemia-induced retinopathy
2025-Sep-19, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.09.031
PMID:40976555
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研究论文 | 本研究通过基因敲除Epac1探索其在缺血性视网膜病变中对Müller胶质细胞病理激活和视网膜神经变性的作用机制 | 首次揭示Epac1通过调节Müller细胞中VEGF信号通路促进视网膜神经变性的新机制 | 研究仅使用小鼠OIR模型,尚未在人类疾病中验证 | 探究Epac1在缺血性视网膜病变中的作用及其分子机制 | 氧诱导视网膜病变(OIR)小鼠模型和原代Müller细胞 | 眼科疾病研究 | 缺血性视网膜病变 | 单细胞RNA测序,免疫染色,qPCR,Western blot,邻近连接分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,蛋白质数据,组织形态数据 | 未明确样本数量的小鼠视网膜组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5491 | 2025-10-05 |
Immune microenvironment and fibroblast subpopulation in diabetic wound healing
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113440
PMID:40995117
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析糖尿病足溃疡肉芽组织,揭示免疫微环境和成纤维细胞亚群在伤口愈合中的作用 | 首次在单细胞水平系统描绘糖尿病伤口修复微环境中免疫细胞和成纤维细胞亚群的特定改变 | NA | 探究糖尿病足溃疡愈合障碍的细胞分子机制 | 糖尿病足溃疡患者的肉芽组织 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序,荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5492 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of heterogeneity and molecular changes in cultured corneal epithelial stem cells during serial passage
2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf041
PMID:40574692
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析长期传代培养的角膜缘干细胞群体动态和基因表达变化 | 首次在单细胞水平识别出三种不同的角膜缘祖细胞亚群,并发现RepSox小分子处理可部分维持长期培养中的干细胞特性 | 研究主要基于体外培养模型,体内验证仍需进一步研究 | 探索长期传代培养中角膜缘干细胞异质性和分子变化机制 | 培养的角膜上皮干细胞 | 单细胞生物学 | 角膜疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 22708个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5493 | 2025-10-05 |
Consistent self-organized emergence of hyaline cartilage in human induced pluripotent stem cell-derived multi-tissue organoids
2025-Sep-17, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf043
PMID:40577622
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研究论文 | 开发了一种利用人多能干细胞生成透明软骨的简化多组织类器官方案 | 建立了无需异源成分和饲养层的简单培养方案,实现了透明软骨在类器官中的稳定形成 | 未提及临床转化应用的具体验证数据 | 开发稳定生成透明软骨的hiPSC培养方案 | 人诱导多能干细胞衍生的多组织类器官 | 组织工程 | 软骨相关疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 组织学, 免疫组织化学 | 多组织类器官模型 | 基因表达数据, 组织图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5494 | 2025-10-05 |
Human-mouse cross-species comparison identifies common and unique aspects of intestinal mesenchyme development
2025-Sep-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.03.674033
PMID:40950081
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和组织学方法比较小鼠和人类肠道间充质发育的异同 | 首次进行跨物种比较揭示肠道间充质细胞类型的高度保守性及物种特异性基因表达差异 | 研究仅关注发育阶段,未涉及成熟或病理状态下的间充质细胞 | 探究小鼠和人类肠道间充质细胞发育的保守性和差异性 | 发育中小鼠和人类肠道的间充质(成纤维细胞)群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 荧光原位杂交, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5495 | 2025-10-05 |
FemXpress: Systematic Analysis of X Chromosome Inactivation Heterogeneity in Female Single-Cell RNA-Seq Samples
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504754
PMID:40583143
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研究论文 | 介绍了一种名为FemXpress的计算工具,用于分析女性单细胞RNA测序数据中的X染色体失活异质性 | 开发了首个不依赖亲本基因组信息即可基于X连锁SNPs对单细胞进行X染色体失活起源分类的计算工具 | NA | 开发分析女性单细胞RNA测序数据中X染色体失活异质性的计算方法 | 女性单细胞RNA测序样本 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个组织的食蟹猴单细胞RNA测序数据,以及胚胎和结肠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5496 | 2025-10-05 |
Tracing and Capturing the Epiblast Pluripotency of Sheep Preimplantation Embryos
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417764
PMID:40586282
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了绵羊植入前胚胎中上胚层多能性的变化,并成功建立了绵羊形成性和定型多能干细胞 | 首次在绵羊中建立了能够长期传代的形成性和定型多能干细胞,并揭示了物种间早期胚胎发育的保守性和差异性 | 研究主要聚焦于绵羊模型,跨物种比较的深度和广度有待进一步扩展 | 研究绵羊植入前胚胎上胚层多能性的变化规律及其调控机制 | 绵羊植入前胚胎(E1-E14天)及衍生的多能干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 绵羊胚胎E1至E14天发育时间点的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5497 | 2025-10-05 |
Integrated Transcriptome and Metabolomics Analyses Show MYC as a Potential Therapeutic Target for Behçet's Uveitis
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417843
PMID:40586758
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研究论文 | 本研究通过整合转录组和代谢组学分析,揭示MYC作为贝赫切特葡萄膜炎潜在治疗靶点 | 首次结合非靶向代谢组学和单细胞RNA测序技术,发现MYC通过调控糖酵解促进效应T细胞异常反应的新机制 | 研究样本量有限,主要基于实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠模型,需要更多临床验证 | 探索贝赫切特葡萄膜炎的疾病特异性代谢改变及其治疗靶点 | 贝赫切特葡萄膜炎患者、健康对照者和实验性自身免疫性葡萄膜炎小鼠 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 非靶向代谢组学,单细胞RNA测序 | NA | 代谢组数据,单细胞转录组数据 | 贝赫切特葡萄膜炎患者和健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序,代谢组学 | NA | NA |
| 5498 | 2025-10-05 |
Choroid Plexus Fibroblast-ILC2 Niche Promotes Adult Hippocampal Neurogenesis after Traumatic Brain Injury
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202415984
PMID:40605604
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研究论文 | 本研究揭示创伤性脑损伤后脉络丛中ILC2细胞的积累及其通过调节免疫微环境和促进海马神经发生改善神经功能的机制 | 首次发现脉络丛成纤维细胞与ILC2形成的生态位在创伤性脑损伤后促进海马神经发生的作用机制 | NA | 探究创伤性脑损伤后脉络丛结构变化和免疫细胞浸润特征及其对神经修复的影响 | 创伤性脑损伤小鼠模型中的脉络丛组织和海马组织 | 神经科学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,组织学分析 | NA | 基因表达数据,组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序 | NA | NA |
| 5499 | 2025-10-05 |
Roadmap for spatial transcriptomics of HIV in tissues
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000961
PMID:40626838
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综述 | 本文概述了空间转录组学在HIV组织研究中的应用路线图,包括平台选择、工作流程和生物信息学分析 | 提出了HIV组织持久性研究的空间转录组学路线图,整合了多种空间分析技术 | 目标RNA捕获中目标数量增加会降低灵敏度,分析需要确保严谨性并验证发现 | 探索HIV在组织中的持久性机制并为治疗策略提供信息 | HIV感染细胞及其周围组织微环境 | 空间转录组学 | HIV感染 | 空间转录组学, ATAC-seq, T细胞受体测序 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5500 | 2025-10-05 |
The Evolutionary Trajectory and Prognostic Value of GITR+ Tregs Reprogramed by Tumor-Intrinsic PD-1/c-MET Signaling in Pancreatic Cancer
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500806
PMID:40673866
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺癌中肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路通过驱动GITR⁺ Tregs的积累促进免疫逃逸的机制 | 首次发现MET信号通路选择性驱动具有强免疫抑制功能的GITR⁺ Tregs亚群积累,并阐明MET-IL-23-STAT4轴在其中的关键作用 | 研究主要基于胰腺导管腺癌模型,在其他癌症类型中的普适性需要进一步验证 | 探究肿瘤内在PD-1/c-MET信号通路的免疫调节作用及其在胰腺癌免疫逃逸中的机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤微环境中的免疫细胞,特别是GITR⁺调节性T细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,原位肿瘤模型 | NA | 基因表达数据,免疫组化数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |