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当前共找到 44757 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-10-24 |
The construction of CD8+ T cell-associated molecular subtypes in esophageal squamous cell carcinoma reveals tumor heterogeneity, tumor microenvironment, and immunotherapy
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1775837
PMID:41972154
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研究论文 | 该研究利用CD8+ T细胞分化相关基因构建食管鳞癌分子亚型，分析肿瘤异质性、肿瘤微环境及免疫治疗反应 | 基于CD8+ T细胞分化过程中的基因表达谱构建新的分子亚型，结合孟德尔随机化分析鉴定RHOB为新的生物标志物 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 通过CD8+ T细胞分化基因表达谱构建新的分子亚型，并预测食管鳞癌患者的预后和治疗效果 | 食管鳞状细胞癌（ESCC）患者及CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | Seurat, Harmony, Monocle2, 非负矩阵分解（NMF）, 孟德尔随机化（MR）分析 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 522 | 2026-10-24 |
Advances in multi-omics research on neuroblastoma
2026, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2026.1739376
PMID:42078544
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综述 | 本文综述了转录组学、影像组学、数字病理分析和多组学融合策略在神经母细胞瘤诊断和治疗决策中的应用进展 | 系统整合转录组学、影像组学和数字病理分析等多组学数据，构建更精确的疾病分类模型并推动个性化治疗方案的制定 | 文中未明确提及具体研究局限 | 探讨转录组学、影像组学、数字病理分析及多组学融合策略在提高神经母细胞瘤诊断精度和优化治疗决策中的关键作用 | 神经母细胞瘤 | 数字病理 | 神经母细胞瘤 | 转录组学，单细胞测序，影像组学（MRI、PET-CT、CT），人工智能数字病理图像分析，多组学融合 | NA | 图像，文本，组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，转录组学，影像组学 | NA | NA |
| 523 | 2026-10-24 |
Ubiquitination-Associated Ductal-Fibroblast Crosstalk Shapes Tumor Progression and Prognosis in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2026, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1155/humu/1665552
PMID:42079345
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研究论文 | 本文整合单细胞RNA测序、空间转录组学和bulk RNA-seq数据，多组学分析胰腺导管腺癌中泛素化相关的导管-成纤维细胞互作及其对肿瘤进展和预后的影响 | 首次从泛素化视角解析PDAC微环境中细胞类型特异性的泛素化活性及其空间组织，揭示泛素化介导的导管-成纤维细胞互作与侵袭区域的空间关联，并构建基于泛素化相关基因特征的预后模型 | 摘要未明确说明具体样本量及队列规模，预后模型的外部验证情况未详细描述，功能实验仅针对单一关键因子进行验证 | 探究泛素化在PDAC微环境中的细胞类型特异性活性与空间组织特征，阐明其在导管-成纤维细胞互作、肿瘤进展及预后中的作用 | 胰腺导管腺癌组织及癌旁正常组织 | 数字病理, 肿瘤微环境, 多组学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq, 基因集打分算法, 细胞通讯分析, 空间互作分析, 基因沉默功能实验 | 预后风险模型, NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2026-10-24 |
Single-cell RNA sequencing of leukocytes at the maternal-fetal interface in physiological and pathological Nodal-deficient pregnancies
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1611813
PMID:42079595
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，对生理性和病理性Nodal缺陷妊娠中期母胎界面的白细胞进行了表征，揭示了免疫细胞在胎盘发育和生殖失败中的作用 | 首次在Nodal缺陷妊娠模型中利用单细胞RNA测序全面解析母胎界面白细胞的转录组特征，特别是对胎盘相关母体巨噬细胞进行了转录特征描述，并将其与人类生殖病理中的免疫功能障碍相关联 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化仍需进一步验证；样本量相对有限；仅聚焦于妊娠中期，未涵盖妊娠全程的动态变化 | 利用单细胞RNA测序表征生理性和病理性Nodal缺陷妊娠中期蜕膜和胎盘中的白细胞，阐明白细胞在胎盘发育中的作用，为理解生理妊娠和生殖失败相关机制提供基础 | Nodal缺陷雌性小鼠与野生型小鼠妊娠中期的蜕膜和胎盘组织中的白细胞 | 单细胞组学、生殖免疫学 | 生殖障碍、胎盘功能不全、胎儿生长受限 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 525 | 2026-10-24 |
Identification of a migrasome-related lncRNA signature and its prognostic and immunological role in bladder cancer
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1763443
PMID:42079608
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研究论文 | 该研究整合TCGA转录组数据识别迁移体相关lncRNA，构建膀胱癌预后风险模型，并分析其免疫学特征及单细胞转录组异质性 | 首次构建迁移体相关lncRNA预后特征模型，并结合单细胞转录组揭示膀胱癌微环境中的细胞异质性和细胞间通讯模式，同时通过实验验证关键lncRNA SEC24B-AS1的生物学功能 | 研究主要基于TCGA公共数据回顾性分析，实验验证仅限于细胞水平，缺乏体内动物实验和独立大样本前瞻性队列验证，且迁移体相关lncRNA的具体调控机制尚未完全阐明 | 识别迁移体相关lncRNA预后特征，评估其在膀胱癌预后预测和免疫微环境中的作用 | 膀胱癌患者及其肿瘤组织转录组数据 | 数字病理学、机器学习 | 膀胱癌 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、qRT-PCR | LASSO Cox回归、单因素Cox回归、多因素Cox回归、CIBERSORT、ESTIMATE | 转录组数据、临床数据、图像 | 基于TCGA膀胱癌队列及单细胞RNA测序数据，具体样本量未在摘要中明确给出 | NA | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2026-10-24 |
Innate immune profiling reveals a specific reduction of CD57+CD62L+CD161+ NK cells in CMV-positive males with hypertension
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1749702
PMID:42079601
|
研究论文 | 该研究利用质谱流式细胞术（CyTOF）和单细胞RNA测序，揭示了高血压男性患者中CD57+CD62L+CD161+ NK细胞亚群的特定减少及其致病性重塑机制 | 首次发现高血压男性患者中CD57+CD62L+CD161+ NK细胞亚群的特定减少，并通过单细胞RNA测序揭示了该亚群内六个转录异质性亚群及高血压驱动的亚群组成倒置（KLRC2high Adaptive亚群选择性耗竭而FCER1Ghigh Cytotoxic亚群相对保留），机制上关联IL-15信号受损及促存活/促凋亡因子失衡 | 样本量较小（发现队列20例，验证队列16例），仅纳入男性受试者，未涉及女性或更大人群验证；单细胞RNA测序仅针对分选的CD57+CD62L+CD161+ NK细胞，未涵盖其他免疫细胞类群 | 探究固有免疫尤其NK细胞在高血压发病机制中的作用，并明确高血压相关NK细胞亚群变化及其转录异质性和分子机制 | 高血压男性患者和血压正常男性受试者的外周血单个核细胞（PBMCs）及分选的CD57+CD62L+CD161+ NK细胞 | 免疫学、单细胞组学 | 高血压、心血管疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF）、全光谱流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、流式细胞术数据 | 发现队列20例男性受试者（10例高血压、10例血压正常）的PBMCs；验证队列16例男性受试者（10例高血压、6例血压正常）；并对分选的CD57+CD62L+CD161+ NK细胞进行单细胞RNA测序 | NA | 质谱流式细胞术、单细胞RNA测序、全光谱流式细胞术 | NA | NA |
| 527 | 2026-10-24 |
Single-cell landscape of melanoma reveals ETV5-driven C3 ID4+ tumor subpopulation with extracellular vesicle-associated immunosuppressive and pro-metastatic potential
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1795778
PMID:42079653
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组分析10例黑色素瘤样本，识别出由ETV5驱动的C3 ID4+肿瘤亚群，该亚群具有细胞外囊泡相关的免疫抑制和促转移潜能。 | 首次在黑色素瘤中识别出C3 ID4+肿瘤亚群，并揭示ETV5作为该亚群的关键转录调控因子，通过TGF-β信号轴与C0 GMPR+肿瘤细胞广泛交互，CRISPR/Cas9功能验证证实ETV5对维持该侵袭性表型至关重要。 | 细胞外囊泡相关信号仅作为潜在但未验证的成分被探讨；样本量较小（仅10例I/III期黑色素瘤样本）；缺乏体内动物实验验证；部分结论基于计算预测而非全面实验验证。 | 解析黑色素瘤瘤内异质性和免疫抑制肿瘤微环境，识别驱动恶性进展和免疫逃逸的关键肿瘤亚群及其转录调控机制。 | I/III期黑色素瘤患者的肿瘤组织样本 | 肿瘤单细胞组学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例I/III期黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2026-10-24 |
scRNA sequencing revealed HIV-associated inflammation-mediated lung epithelial dysregulation and fibroblast remodeling
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1789140
PMID:42079650
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研究论文 | 该研究通过对HIV感染者和未感染者（包括吸烟者和非吸烟者）的肺组织进行单细胞RNA测序，揭示了HIV感染相关的肺部细胞组成改变、上皮细胞转录重编程及成纤维细胞重塑 | 首次在单细胞水平上系统刻画HIV感染对人肺组织上皮、免疫和基质细胞区室的细胞组成和转录程序的影响，并发现AT1、AT2及肌成纤维细胞中细胞类型特异性的上皮-间质转化（EMT）标志物变化 | 摘要中未明确说明样本量、具体测序平台及验证实验等细节，且研究为描述性分析，未通过功能实验验证所发现的通路是否具有治疗相关性 | 表征HIV感染肺部后的细胞和分子图谱，评估上皮重塑以及HIV驱动的肺细胞组成和转录程序改变 | HIV感染者和未感染者的肺组织（包括吸烟者和非吸烟者） | 单细胞组学 | HIV感染相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 所有实验组共分析54,230个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2026-10-24 |
Tumor reactivity assessment using clonal expression reveals tumor reactive CD8+ T cell heterogeneity across solid tumors
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1815974
PMID:42079667
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研究论文 | 本研究开发了一种基于克隆型水平的CD8+肿瘤反应性T细胞分类器TRACE，利用多个数据集的scRNA-seq数据训练，并在多种实体瘤中验证其性能 | 构建了不依赖单一数据集、供体或适应症的克隆型水平CD8+ TRT分类器TRACE，无需数据集操作即可应用于新数据集，并公开了模型权重 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 开发并验证一种基于单细胞RNA测序的肿瘤反应性T细胞分类算法，用于评估实体瘤中TRT的频率和异质性 | 肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）、外周血单核细胞（PBMC）克隆、肺癌/结直肠癌/胰腺癌患者样本 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌, 结直肠癌, 胰腺癌, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 分类器（TRACE） | 单细胞转录组数据 | 数百例患者样本（来自多个肿瘤图谱，涵盖肺癌、结直肠癌和胰腺癌） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2026-10-24 |
Application of multi-omics in systemic autoimmune rheumatic diseases: a bibliometric and visualization analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1759610
PMID:42079670
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文献计量学研究论文 | 通过文献计量与可视化分析系统梳理2005至2025年多组学技术在系统性自身免疫性风湿病（SARDs）中的应用现状与发展趋势 | 首次对SARDs多组学研究进行跨二十年的文献计量与可视化分析，揭示从蛋白质组学、滑液分析向表观遗传学、代谢组学及单细胞RNA测序驱动的免疫细胞分化研究的主题演变，并划分三个发展阶段 | 仅检索Web of Science核心合集英文文献，可能存在语言和数据库偏倚；多组学定义限定为至少整合两个组学层次，可能遗漏部分研究；文献计量分析无法评估研究质量与方法学细节 | 系统回顾多组学技术在SARDs研究中的应用状况与发展趋势，为未来研究方向提供量化框架 | 2005年1月1日至2025年12月31日发表的多组学应用于系统性自身免疫性风湿病的英文文献 | 文献计量学, 多组学, 免疫学, 风湿病学 | 系统性自身免疫性风湿病 | 文献计量分析, 可视化分析, 关键词突现分析, 引文分析 | NA | 文本（文献题录数据） | 2576篇文献（2072篇研究论文和504篇综述） | Clarivate | NA | Web of Science Core Collection, CiteSpace, VOSviewer, bibliometrix R包, PubMed | Web of Science核心合集数据库检索，使用CiteSpace、VOSviewer、Python和bibliometrix R包进行文献计量与可视化分析，并辅以PubMed分析验证 |
| 531 | 2026-10-24 |
An optimization framework for hierarchical clustering
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag107
PMID:42079811
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研究论文 | 提出了一种基于平均链接的层次聚类优化框架DOMUS，通过生成数据的多视图并学习融合相似度来改进聚类效果。 | 结合局部与全局信息，生成输入数据的多个视图并学习如何将它们融合为集成相似度度量。 | 未明确提及 | 改进层次聚类方法，克服平均链接的短视贪心特性导致的结构次优层次。 | 合成数据集、经典基准数据集以及单细胞RNA测序数据。 | 机器学习 | NA | NA | NA | 数值数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 532 | 2026-10-24 |
Metabolic reprogramming of NK cells in chronic brucellar arthritis: role of the HIF-1α/mTOR axis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1961240
PMID:42903054
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序及多种实验手段，揭示布鲁氏菌感染诱导NK细胞HIF-1α过表达，抑制mTOR信号通路，导致NK细胞代谢重编程和功能耗竭，从而促进慢性布鲁氏菌性关节炎的发生发展 | 首次系统揭示HIF-1α/mTOR轴在慢性布鲁氏菌性关节炎NK细胞代谢重编程中的核心调控作用，并通过HIF-1α敲除和mTOR抑制剂干预实验证实HIF-1α通过抑制mTOR驱动NK细胞功能异常 | 摘要中未明确说明研究局限性 | 探究慢性布鲁氏菌性关节炎中NK细胞的功能状态、代谢特征及HIF-1α/mTOR轴的调控机制 | 健康对照者、急性期布鲁氏菌性关节炎患者和慢性期布鲁氏菌性关节炎患者的外周血和滑膜组织样本，以及NK-92细胞系和HIF-1α敲除细胞系 | 免疫学 | 布鲁氏菌性关节炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、实时定量PCR、JC-1线粒体膜电位检测、Seahorse代谢分析、Western blotting、转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、蛋白质数据、代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 533 | 2026-10-24 |
Integrating Mendelian randomization with single-cell and spatial transcriptomics to investigate gut microbiota-associated genetic signals and molecular characteristics in prostate cancer
2026, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2026.1899354
PMID:42903126
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研究论文 | 该研究整合孟德尔随机化、生物信息学、单细胞RNA测序和空间转录组学，探究肠道菌群与前列腺癌风险的遗传因果关系及肿瘤微环境中相关基因的表达模式 | 首次将孟德尔随机化与单细胞及空间转录组学整合，系统揭示肠道菌群相关遗传信号与前列腺癌风险的因果关系，并在肿瘤微环境中定位候选基因的细胞类型特异性表达和空间分布 | 特征基因与特定细胞背景之间的关联仅为潜在提示，仍需进一步实验验证；这些基因是否直接参与菌群相关前列腺癌进展尚不明确 | 评估肠道菌群与前列腺癌风险之间的因果关系，并表征菌群相关候选基因在前列腺癌肿瘤微环境中的表达模式 | 前列腺癌（PRAD）患者及肠道菌群相关遗传数据 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 孟德尔随机化, 生物信息学分析, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, qRT-PCR | 随机森林 | 文本, 图像, 基因表达数据 | OpenGWAS汇总统计数据及GEO数据集（具体样本量未在摘要中说明） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 534 | 2026-10-24 |
TREM2+ macrophages mediate anticancer therapy-induced immune evasion in lung adenocarcinoma via the CCL5/CCL22-Treg axis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1914462
PMID:42903166
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研究论文 | 该研究揭示TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞在奥希替尼和顺铂治疗下通过CCL5/CCL22-CCR5/CCR4-Treg轴促进肺腺癌免疫逃逸 | 首次阐明TREM2+巨噬细胞在抗癌治疗诱导的免疫逃逸中通过CCL5/CCL22招募Treg细胞的关键作用，并提出靶向TREM2可增强NSCLC标准治疗疗效 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，患者来源数据为回顾性scRNA-seq数据集分析，缺乏前瞻性临床验证 | 探究TREM2阳性肿瘤相关巨噬细胞是否在抗癌治疗下通过CCL5/CCL22-CCR5/CCR4-Treg轴促进免疫逃逸 | 非小细胞肺癌患者组织样本、人肺腺癌组织芯片、顺铂处理的小鼠肺癌模型、THP-1来源巨噬细胞、骨髓来源巨噬细胞 | 肿瘤免疫学、单细胞组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、组织芯片、细胞通讯分析、基因表达谱分析 | CellChat | 单细胞转录组数据、图像、文本 | NSCLC患者来源scRNA-seq数据集及人肺腺癌组织芯片（具体样本量未在摘要中说明）、顺铂处理小鼠肺癌模型、THP-1来源巨噬细胞及骨髓来源巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-10-24 |
Integrated multi-omics and machine learning identify core mechanobiology-associated immune genes in pulmonary arterial hypertension
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1867114
PMID:42903205
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研究论文 | 整合多组学数据与机器学习识别肺动脉高压中机械生物学相关的核心免疫基因 | 首次将一套精选的2537个机械相关基因与多组学数据及多种机器学习方法结合，系统识别并验证了PAH中四个免疫相关核心基因（CD83、CD86、IL6、TLR7），并揭示了其细胞区室依赖性表达模式 | 四基因面板仅表现出中等内部判别能力（交叉验证AUC为0.765），研究未建立机械应力与血管炎症之间的直接机械转导靶点或因果通路，样本量较小，需进一步临床与功能验证 | 探究肺动脉高压中伴随血管重塑和机械信号改变的免疫相关转录组变化，识别核心机械生物学相关免疫基因 | 肺动脉高压（PAH）患者及野百合碱诱导的肺动脉高压大鼠模型 | 多组学与机器学习 | 肺动脉高压 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, WGCNA, LASSO, 随机森林 | LASSO, 随机森林 | 转录组数据（bulk及单细胞RNA-seq） | 肺组织bulk数据（GSE15197）、PBMC bulk数据（GSE33463）、单细胞RNA-seq数据（GSE169471）、10例IPAH患者和10例对照的PBMC、野百合碱诱导的PH大鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2026-10-24 |
HEXB as a Candidate Target Gene in Keloid Radiotherapy: Based on Multi-Omics Analysis and Mendelian Randomization
2026, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S641187
PMID:42904139
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研究论文 | 该研究通过整合单细胞RNA测序、多组学数据、机器学习和孟德尔随机化分析，鉴定HEXB为瘢痕疙瘩放疗相关的候选保护基因，并探索靶向该基因的潜在治疗药物 | 首次通过整合多组学分析、多种机器学习算法和孟德尔随机化方法，将HEXB鉴定为瘢痕疙瘩的候选保护基因，并结合空间转录组学、虚拟敲除分析和分子对接技术系统阐明其空间定位、功能角色及靶向药物潜力 | 摘要中未明确说明研究局限性，但基于方法学推测可能缺乏湿实验验证，孟德尔随机化结果需进一步功能实验证实，分子对接和分子动力学模拟结果需体外和体内实验验证 | 探究辐射相关基因与瘢痕疙瘩之间的关系，鉴定关键基因并探索靶向该基因的潜在治疗药物 | 瘢痕疙瘩患者样本及公共基因表达数据库数据 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 机器学习, 分子对接, 分子动力学模拟 | 机器学习算法, 孟德尔随机化模型, 分子对接模型, 分子动力学模拟 | 基因表达数据, 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 537 | 2026-10-24 |
Applications of single-cell RNA sequencing in fungal infections
2026, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2026.1996773
PMID:42904236
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综述 | 综述单细胞RNA测序在皮肤、黏膜、肺部、中枢神经系统和系统性真菌感染研究中的应用，关注组织背景、实验设计和验证强度 | 系统整合多部位真菌感染的单细胞转录组证据，强调同名细胞状态在不同组织或感染中功能不等价，并关注真菌自身单细胞研究及方法学偏倚 | 多数证据集中于少数真菌和模型，慢性皮肤真菌病等研究受限；存在解离偏倚、细胞回收不均、真菌RNA稀疏、跨物种映射困难及人类队列样本量小等问题 | 总结单细胞RNA测序在真菌感染研究中的应用现状，评估其技术可行性、疾病覆盖范围和证据强度，并提出未来临床转化所需的方向 | 皮肤、黏膜、肺部、中枢神经系统及系统性真菌感染相关研究，涉及宿主髓系、淋巴系、上皮和基质细胞区室以及真菌细胞 | 单细胞转录组学 | 真菌感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 538 | 2026-10-24 |
Seeing Chemistry in Context: Mass Spectrometry Imaging for Biomedical Research and Multi-Omic Integration
2026, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-032-29437-1_7
PMID:42907627
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综述 | 本章综述了质谱成像（MSI）技术的基本原理、实验设计、样本制备方法及其在生物医学研究和多组学整合中的应用 | 系统性地阐述了MSI实验设计的关键考量，包括模型系统选择、样本制备（包埋、固定、切片）以及如何设计与多组学（如空间转录组学、bulk分析）的整合实验，并通过最新文献案例展示MSI整合多组学层揭示分子变化的研究范式 | 作为综述章节，未提供原始实验数据或定量性能评估；仅讨论了一小部分可用的电离方法，未全面覆盖所有MSI技术变体 | 介绍质谱成像技术的基础实验流程和实验设计策略，探讨MSI与多组学整合在生物医学研究中的应用 | 质谱成像技术（MSI）及其在生物医学研究中的应用，包括药物发现和疾病机制研究 | 空间组学, 质谱成像, 多组学整合 | NA | MALDI MSI, 质谱成像, 空间转录组学, bulk omics | NA | 图像, 质谱数据, 分子数据 | NA | NA | 质谱成像, 空间转录组学 | MALDI MSI | NA |
| 539 | 2026-10-24 |
Diverse infections transcriptionally reprogram the intestinal epithelium and epithelial-immune cell interactions
2025-Dec-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.695505
PMID:41497582
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研究论文 | 该研究构建了GutPath图谱，包含超过50万个单细胞，涵盖91种细胞状态，用于研究不同感染下回肠上皮和上皮-免疫细胞相互作用 | 首次构建了跨多种感染类型的回肠单细胞和空间转录组图谱，揭示了病原体特异性的肠上皮细胞反应，并发现了一种与细菌载量和组织病理学空间关联的新肠上皮细胞状态 | 研究主要关注回肠，未涵盖小肠其他区域；摘要中未提及样本量、平台细节等具体信息，可能限制可重复性 | 研究不同感染下回肠上皮细胞的转录重编程以及上皮细胞与免疫细胞之间的相互作用 | 回肠组织中的上皮细胞和免疫细胞，涉及多种感染类型 | 单细胞转录组学、空间转录组学 | 感染性疾病、克罗恩病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质表达谱分析 | NA | 单细胞RNA表达数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据 | 超过500,000个单细胞，涵盖91种细胞状态 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 540 | 2026-10-24 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序和跨物种比较转录组学，揭示了斑马鱼外侧下丘脑神经元亚型及其在摄食调控中的保守生长激素-速激肽动态 | 首次在斑马鱼外侧下丘脑中使用Act-seq方法捕获活动依赖性转录特征，并通过跨物种比较鉴定出保守的GABA能GH受体-速激肽共表达神经元群，提出GH具有急性食欲增强作用的新观点 | 研究主要基于斑马鱼幼虫和已发表的小鼠数据集进行比较分析，需要在更多物种中进一步验证，且GH信号通路的急性调控机制仍需深入解析 | 定义斑马鱼外侧下丘脑神经元的分子和细胞身份，鉴定跨脊椎动物保守的LH细胞类型，并研究其在食欲调控中的作用 | 斑马鱼幼虫外侧下丘脑神经元及小鼠外侧下丘脑数据集 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | Act-seq方法 |