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当前共找到 37441 篇文献，本页显示第 5341 - 5360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 5341 | 2025-12-17 |
A single-cell and spatially resolved atlas of human osteosarcomas
2024-08-20, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-024-01598-7
PMID:39164791
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析，构建了人类骨肉瘤的细胞组成和空间组织结构图谱 | 首次提供了人类骨肉瘤的单细胞和空间分辨率转录组学综合分析，构建了细胞元图谱来解析空间转录组数据，并识别了与化疗耐药相关的独特空间生态位 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 深入理解骨肉瘤的细胞组成、组织结构、功能状态及其对化疗的反应，为靶向治疗提供基础 | 人类骨肉瘤组织 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5342 | 2025-12-17 |
Cell cycle-driven transcriptome maturation confers multilineage competence to cardiopharyngeal progenitors
2024-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.23.604718
PMID:39091743
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研究论文 | 本研究利用海鞘Ciona模型，探索了心脏咽部祖细胞在发育过程中通过细胞周期驱动的转录组成熟获得多谱系能力的机制 | 揭示了转录组成熟过程，包括候选“成熟基因”如Rho GAP编码基因在G2晚期达到峰值，以及行为能力概念，通过多谱系启动和定向不对称分裂影响命运决定 | 研究基于海鞘模型，可能不直接适用于所有脊椎动物系统，且功能验证可能有限 | 探究多谱系能力的获得以及命运决定与细胞周期进程之间的耦合机制 | 心脏咽部祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5343 | 2025-12-17 |
Unagi: Deep Generative Model for Deciphering Cellular Dynamics and In-Silico Drug Discovery in Complex Diseases
2023-Dec-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3676579/v1
PMID:38196613
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研究论文 | 本文介绍了一种名为UNAGI的深度生成神经网络，用于分析时间序列单细胞转录组数据，以解码复杂疾病中的细胞动态并进行计算机药物发现 | UNAGI是一种专门针对时间序列单细胞转录组数据设计的深度生成模型，能够捕获疾病进展中的复杂细胞动态，并增强药物扰动建模和发现能力 | NA | 开发一种计算工具，用于详细分析疾病进展并进行靶向计算机药物干预 | 时间序列单细胞转录组数据，特别是来自特发性肺纤维化（IPF）患者和COVID数据集的数据 | 机器学习 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序 | 深度生成神经网络 | 时间序列单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5344 | 2025-12-16 |
Spatial transcriptomics expression prediction from histopathology based on cross-modal mask reconstruction and contrastive learning
2026-Feb, Medical image analysis
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.media.2025.103889
PMID:41330094
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研究论文 | 本研究开发了一种基于对比学习的深度学习方法，用于从全切片图像预测空间转录组基因表达 | 提出了一种结合跨模态掩码重建与对比学习的框架，无需大规模预训练数据集或抽象语义表示，即可在特征空间建立组织病理学形态与空间基因表达的对应关系 | 未明确提及方法在更广泛疾病类型或更大规模数据集上的泛化能力 | 从组织病理学图像预测空间转录组基因表达，以克服空间转录组数据获取成本高、规模有限的挑战 | 肿瘤微环境分析及组织病理学的分子图谱 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 基于对比学习的深度学习模型 | 图像（全切片图像）、空间转录组数据 | 六个不同疾病数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5345 | 2025-12-16 |
The China Brain Multi-omics Atlas Project (CBMAP)
2026-Jan, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03250-3
PMID:40954277
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研究论文 | 中国脑多组学图谱项目（CBMAP）旨在生成超过1000个人类大脑的全面分子参考图谱，整合基因组、表观基因组、转录组、蛋白质组和代谢组数据，以解决东亚人群在脑研究中代表性不足的问题 | 首次针对东亚人群生成大规模脑多组学图谱，整合空间转录组学、蛋白质组学和单核3D染色质结构分析等先进技术，提供全面的分子参考资源 | NA | 研究衰老相关脑表型和神经精神疾病的分子基础，加速脑部疾病的药物发现和精准医疗 | 超过1000个人类大脑样本，覆盖广泛年龄范围和多个中国地区 | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、空间转录组学、单核3D染色质结构分析 | NA | 多组学数据 | 超过1000个人类大脑样本 | NA | 空间转录组学, 单核3D染色质结构分析 | NA | NA |
| 5346 | 2025-12-16 |
Molecular glue degrader function of SPOP inhibitors enhances STING-dependent immunotherapy efficacy in melanoma models
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI191772
PMID:41148213
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研究论文 | 本研究揭示了SPOP通过降解STING促进黑色素瘤生长，并发现SPOP抑制剂可作为分子胶降解剂增强STING依赖性免疫治疗效果 | 首次发现SPOP抑制剂具有分子胶降解剂功能，能重定向SPOP降解新底物如CBX4，从而增强DNA损伤和先天免疫反应 | 研究主要基于小鼠黑色素瘤模型，人类临床相关性尚需进一步验证 | 探索SPOP在肿瘤免疫中的作用及其抑制剂在免疫治疗中的潜在应用 | 黑色素瘤细胞、小鼠B16肿瘤模型、STING蛋白、CBX4蛋白 | 癌症免疫学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序、免疫检查点阻断、CAR-T细胞疗法 | NA | RNA-seq数据、免疫细胞浸润数据 | 小鼠B16肿瘤模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5347 | 2025-12-16 |
Artificial Intelligence and Multimodality Data Integration Decipher Tertiary Lymphoid Structure Maturity in Gastric Cancer
2025-Dec-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1793
PMID:41150905
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Transformer的深度学习模型，用于从胃腺癌全切片图像中定量表征三级淋巴结构（TLS）的成熟度，并结合多组学数据揭示了成熟TLS中关键的免疫细胞相互作用 | 首次开发了基于Transformer的AI模型来自动化评估胃腺癌中TLS成熟度，并通过整合单细胞RNA测序、多重免疫组化、流式细胞术和功能共培养实验，揭示了CD8+组织驻留记忆T细胞与B细胞通过CXCL13-CXCR5轴形成的免疫回路 | 样本量相对有限（单细胞RNA测序仅来自17例患者），且模型在外部验证队列中的泛化能力未明确说明 | 开发自动化工具以评估胃腺癌中三级淋巴结构的成熟度，并探究其与患者预后及抗肿瘤免疫机制的关系 | 胃腺癌患者组织样本及其相关的多模态数据 | 数字病理学 | 胃腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫组化, 流式细胞术, 功能共培养实验 | Transformer | 图像, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 253例胃腺癌患者（全切片图像），其中17例进行了单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5348 | 2025-12-16 |
The cell-type-specific genetic architecture of chronic pain in brain and dorsal root ganglia
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI197583
PMID:41055971
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研究论文 | 本研究整合了慢性疼痛的GWAS数据与人类大脑和背根神经节的单细胞RNA测序数据，揭示了慢性疼痛在特定细胞类型中的遗传结构 | 通过整合GWAS与单细胞测序数据，首次系统性地揭示了慢性疼痛在中央和周围神经系统特定细胞类型中的遗传富集模式，包括谷氨酸能神经元和特定神经元亚型 | 研究主要基于相关性分析，未进行功能验证实验；样本来源和数量可能限制结果的普适性；依赖动物模型数据可能不完全反映人类生物学 | 探究慢性疼痛在细胞类型特异性层面的遗传基础，以理解其病理机制 | 人类大脑、背根神经节（hDRG）、小鼠背角组织 | 生物信息学 | 慢性疼痛 | GWAS, 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）, 单细胞染色质可及性分析 | NA | 基因组关联数据, 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞染色质可及性分析 | NA | NA |
| 5349 | 2025-12-16 |
IL-17-producing γδ T cells in the tumor microenvironment promote radioresistance in mice
2025-Dec-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI193945
PMID:41055972
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤微环境中产生IL-17的γδ T细胞通过招募髓源性抑制细胞促进小鼠放疗抵抗的机制 | 首次阐明了放疗后肿瘤微环境中γδ T细胞通过产生IL-17A促进放疗抵抗的具体机制，并发现肿瘤细胞来源的微粒通过cGAS-STING/NF-κB通路调控CCL20表达的关键作用 | 研究基于小鼠模型，在人体中的适用性有待验证；机制研究主要集中在γδ T细胞和巨噬细胞的相互作用，其他免疫细胞的作用可能未完全涵盖 | 探究γδ T细胞在肿瘤放疗抵抗中的作用机制 | 小鼠肿瘤模型中的γδ T细胞、髓源性抑制细胞、巨噬细胞及肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5350 | 2025-12-16 |
Distinct Cellular and Molecular Patterns in Pretreatment Peripheral Blood Are Associated with CAR T-cell Outcomes in Diffuse Large B-cell Lymphoma
2025-Dec-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3596
PMID:41071708
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了弥漫性大B细胞淋巴瘤患者治疗前外周血样本和CAR T细胞产品，揭示了与临床结局相关的分子和细胞特征 | 首次在单细胞水平上系统关联了治疗前外周血免疫特征与CAR T细胞治疗结局，并识别了与良好反应相关的B细胞存在 | 样本量相对有限（57例患者），且为观察性研究，需要更大规模的前瞻性验证 | 探究CAR T细胞治疗在弥漫性大B细胞淋巴瘤中反应和耐药的决定因素 | 57例弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的治疗前外周血样本和抗CD19 CAR T细胞产品 | 单细胞组学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 57例弥漫性大B细胞淋巴瘤患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5351 | 2025-12-16 |
Cholesterol-metabolic TAMs regulates tumor budding like cell subpopulation to promote chordoma stemness via BACH1/ANGPTL4/SDC4 axis
2025-Dec-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf286
PMID:41390963
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研究论文 | 本研究揭示了脊索瘤中肿瘤出芽样结构的存在及其通过BACH1/ANGPTL4/SDC4轴与胆固醇代谢性肿瘤相关巨噬细胞相互作用，促进肿瘤干细胞性和恶性进展的机制 | 首次在脊索瘤中定义并评估了肿瘤出芽样结构，并发现了胆固醇代谢性肿瘤相关巨噬细胞通过BACH1-ANGPTL4-SDC4信号轴激活肿瘤出芽样细胞亚群的新机制 | 研究主要基于回顾性队列和临床前模型，需要进一步的前瞻性临床验证 | 探究脊索瘤中肿瘤出芽样结构的分子机制及其对肿瘤进展的功能影响 | 481例脊索瘤患者的肿瘤样本及临床前模型 | 数字病理学 | 脊索瘤 | GeoMx数字空间分析、空间转录组学、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序、多重定量免疫荧光 | NA | 多组学数据 | 481例脊索瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5352 | 2025-12-16 |
Spatially defined multicellular functional units in colorectal cancer revealed from single cell and spatial transcriptomics
2025-Dec-12, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.104815
PMID:41384492
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研究论文 | 本文结合单细胞RNA测序、Slide-seq空间转录组学和原位多重RNA分析，绘制了健康和发育不良结肠细胞生态系统的详细空间图谱，并揭示了其在结直肠癌进展中的关联 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术，首次在结直肠癌中定义了具有特定空间组织和功能交互的多细胞功能单元，并验证了小鼠模型与人类疾病之间的保守性 | 研究主要基于小鼠模型，虽然与人类数据进行了比较，但直接应用于临床仍需进一步验证 | 揭示结直肠癌中细胞的空间组织和功能交互，以理解疾病进展机制 | 健康和发育不良的结肠组织，包括诱导性遗传结直肠癌小鼠模型和人类结直肠癌样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 原位多重RNA分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Slide-seq | NA |
| 5353 | 2025-12-16 |
Integrated single-cell atlases unveil the operation principles of whole-brain 5-HT neuronal subsystems
2025-Dec-12, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv8128
PMID:41385633
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞图谱揭示了全脑5-HT神经元亚系统的运作原理 | 开发了包含单细胞投射组学、两个独立的scRNA-seq数据集和全脑5-HT神经元功能成像数据库的资源数据集，首次在斑马鱼中系统揭示了5-HT神经元亚系统的模块化功能组织原则 | 研究基于斑马鱼模型，虽然为哺乳动物系统提供了见解，但直接转化到哺乳动物仍需进一步验证 | 阐明5-羟色胺（5-HT）神经元亚系统的运作原理及其在生理和行为调节中的复杂作用 | 斑马鱼全脑5-HT神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），功能成像，单细胞投射组学 | NA | 单细胞转录组数据，成像数据，投射组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5354 | 2025-12-16 |
A single-cell transcriptomic atlas reveals resident dendritic-like cells in the zebrafish brain parenchyma
2025-Dec-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.91427
PMID:41379882
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了成年斑马鱼大脑中免疫细胞的复杂性，并发现了一种与哺乳动物树突状细胞相似的驻留性髓系细胞亚群 | 首次在非哺乳类脊椎动物（斑马鱼）大脑中发现并表征了具有树突状细胞特征的髓系细胞亚群，揭示了脊椎动物大脑免疫细胞异质性的进化保守性 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限；突变体表型分析尚未完全阐明这些细胞的生理功能 | 探究斑马鱼大脑免疫细胞的多样性及其与哺乳动物的进化保守性 | 成年斑马鱼大脑中的免疫细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量，但涉及野生型和多种突变体斑马鱼 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5355 | 2025-12-16 |
scRegulate: single-cell regulatory-embedded variational inference of transcription factor activity from gene expression
2025-Dec-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf638
PMID:41288963
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scRegulate的生成式深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中推断转录因子活性和基因调控网络 | scRegulate通过变分推理整合先验生物学知识与数据驱动推断，能够捕获新颖、动态和上下文特定的调控相互作用，相比现有方法更具可扩展性和生物学基础 | NA | 开发一种从单细胞RNA测序数据中准确推断转录因子活性和基因调控网络的计算方法 | 转录因子活性和基因调控网络 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 生成式深度学习框架，变分推理 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5356 | 2025-12-16 |
Deciphering the Osteoimmune Landscape in Subtalar Arthrodesis: A Single-Cell RNA Sequencing Approach
2025-Dec, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70980
PMID:41381396
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，探讨了距下关节融合术患者中免疫细胞动态变化与骨愈合的关系 | 首次应用单细胞RNA测序技术系统性解析距下关节融合术后的骨免疫景观，揭示了单核细胞和NK细胞在骨愈合中的关键作用及功能差异 | 样本量相对较小，仅分析了术后3个月的时间点，未涵盖更长期的愈合过程 | 阐明距下关节融合术后骨愈合的免疫机制，并探索免疫调节对骨修复的潜在影响 | 接受距下关节融合术的患者外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确具体数量，但涉及早期愈合和延迟愈合两组患者的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5357 | 2025-12-16 |
Loureirin B Accelerates Diabetic Wound Healing by Promoting TGFβ/Smad-Dependent Macrophage M2 Polarization: A Concerted Analytical Approach Through Single-Cell RNA Sequencing and Experimental Verification
2025-Dec, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.8373
PMID:39532388
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验验证，揭示了龙血竭提取物龙血素B通过激活TGFβ/Smad信号通路促进巨噬细胞M2极化，从而加速糖尿病伤口愈合的机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术与实验验证，系统阐明了龙血素B在糖尿病伤口愈合中通过TGFβ/Smad通路调控巨噬细胞极化的具体分子机制 | 研究主要在动物模型和体外实验中进行，尚未在人体临床试验中验证其疗效和机制 | 探究龙血素B促进糖尿病伤口愈合的分子机制和疗效 | 糖尿病伤口愈合过程中的巨噬细胞和成纤维细胞 | 单细胞组学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 糖尿病足溃疡组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5358 | 2025-12-16 |
Unveiling the role of the extracellular matrix in the osteosarcoma tumor microenvironment through integrated transcriptomics and experimental validation
2025-Dec, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00970-0
PMID:41057667
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学分析和实验验证，揭示了细胞外基质（ECM）在骨肉瘤肿瘤微环境中的关键作用，并确定了COL5A2基因和C0成骨细胞簇作为重要的ECM相关标志物 | 首次通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，结合实验验证，系统性地揭示了COL5A2基因通过激活黏着斑通路和IGFBP3-TMEM219轴介导的细胞间通讯来驱动骨肉瘤增殖的新机制 | 研究主要基于公共数据库的数据和体外实验，缺乏体内动物模型的验证，并且ECM其他成分的作用有待进一步探索 | 阐明细胞外基质在骨肉瘤肿瘤微环境中的作用机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 骨肉瘤肿瘤微环境中的细胞外基质成分及相关细胞类型（如成骨细胞、内皮细胞） | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 生物信息学分析, Western blot, CCK-8, 集落形成实验 | 预后模型 | 转录组数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5359 | 2025-12-16 |
Uncovering senescent fibroblast heterogeneity connects DNA damage response to idiopathic pulmonary fibrosis
2025-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.26.690792
PMID:41394576
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研究论文 | 本研究揭示了特发性肺纤维化（IPF）中衰老成纤维细胞的异质性，并连接DNA损伤反应与疾病机制 | 首次在人类原代肺成纤维细胞中展示了DNA损伤后衰老的微妙异质性，并开发了新的衰老相关基因集以识别疾病相关细胞 | 研究主要基于体外细胞模型，可能未完全反映体内复杂环境；样本量有限，需进一步验证 | 探索特发性肺纤维化中衰老成纤维细胞的异质性及其与DNA损伤反应的联系 | 健康供体和特发性肺纤维化患者的原代人类肺成纤维细胞 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | NA | 基因表达数据 | 健康供体和IPF患者的原代肺成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5360 | 2025-12-16 |
High-resolution MRI Guided Whole Mouse Brain Cell Type Atlas using Deep Learning
2025-Nov-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.25.690475
PMID:41394590
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研究论文 | 本研究提出了一种深度学习框架，整合高分辨率扩散MRI与三维光片显微镜数据，生成了小鼠全脑细胞类型图谱 | 首次将高分辨率扩散MRI与三维光片显微镜结合，利用深度学习直接预测细胞类型，实现了10微米各向同性分辨率的全脑细胞图谱 | 研究依赖于特定成像技术的配准精度，且方法在其它物种或成像模式中的普适性尚未验证 | 开发高效高分辨率的脑细胞图谱生成方法，探索先进成像技术揭示大脑细胞机制的潜力 | 小鼠全脑 | 计算机视觉 | NA | 扩散MRI、三维光片显微镜、空间转录组学 | 深度学习 | 图像 | NA | NA | NA | NA | NA |