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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 501 | 2026-07-23 |
IL-1β signaling modulates T follicular helper and regulatory cells in human lymphoid tissues
2025-06-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188724
PMID:40392614
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研究论文 | 本研究通过多组学方法解析了IL-1β信号在人类淋巴组织中调节滤泡辅助性T细胞和滤泡调节性T细胞的作用 | 首次在人体次级淋巴器官中揭示IL-1β信号通过IL-1R1/IL-1R2受体平衡调节Tfh/Tfr细胞分化及活化状态 | 未明确说明研究局限性 | 阐明IL-1β信号在人类滤泡T细胞活化及自身免疫疾病中的调控机制 | 人类扁桃体、脾脏、肠系膜淋巴结及自身免疫病患者样本 | 免疫学 | 抗体介导的自身免疫病 | 流式细胞术、单细胞转录组学、体外培养 | NA | 流式细胞数据、单细胞转录组数据 | 包含人类次级淋巴器官及自身免疫病患者样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 502 | 2026-07-23 |
Tumor suppressors in Sox2-mediated lung cancers promote distinct cell-intrinsic and immunologic remodeling
2025-06-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.171364
PMID:40327401
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研究论文 | 本文探讨了在Sox2介导的肺癌中,抑癌因子Trp53和Pten的缺失如何影响肿瘤进展及免疫微环境重塑 | 首次在Sox2高表达的NSCLC小鼠模型中系统比较Trp53和Pten缺失对肿瘤组织学、转移能力及免疫微环境的不同影响,并发现LN2A模型中CD38+肿瘤相关炎性单核细胞激活补体通路的新机制 | 基于小鼠模型,结果需在人类患者中验证;未探讨其他常见抑癌因子(如KRAS)的协同作用 | 阐明抑癌因子Trp53和Pten在Sox2介导的NSCLC亚型(LUSC和LUAD)进展及免疫微环境重塑中的作用 | 小鼠模型:SNL、SNL-Trp53、SNL-Pten及LN2A细胞系;C57BL/6背景小鼠 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多组基因修饰小鼠模型(每组数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'试剂盒 |
| 503 | 2026-07-23 |
Resident memory T cell development is gradual and shows AP-1 gene expression in mature cells
2025-06-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187381
PMID:40548376
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研究论文 | 利用单细胞RNA-seq深入探究组织驻留记忆T细胞在不同时间点的发育过程及AP-1转录因子的作用 | 通过线性模型捕捉T细胞从效应到记忆状态的基因表达变化,并定义了跨组织的时序TRM特征,发现被既往研究忽略的AP-1转录因子家族成员在成熟细胞中的关键作用 | 未提及明显限制,可能包括样本量有限或仅聚焦于两种组织类型 | 揭示CD8+ TRM细胞分化和记忆效应功能启动的机制 | 皮肤和小肠上皮内淋巴细胞中的CD8+ TRM细胞 | 自然语言处理, 数字病理学, 计算机视觉 | 心血管疾病, 老年病 | 单细胞RNA测序, ATAC测序, CyCIF组织成像 | 线性模型 | 基因表达数据, 染色质开放区域数据, 组织成像数据 | 10个发育时间点的单细胞RNA-seq数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序, ATAC-seq, CyCIF成像 |
| 504 | 2026-07-23 |
Type 2 diabetes alters quiescent pancreatic stellate cells to tumor-prone state
2025-06-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187424
PMID:40548381
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了2型糖尿病如何改变静止胰腺星状细胞的亚群,使其向促肿瘤状态转变 | 首次通过单细胞RNA测序技术,在2型糖尿病背景下详细分析了静止胰腺星状细胞的亚群变化,并发现了一种新型的促肿瘤免疫和血管生成的Paf亚群(tapPafs) | 研究仅限于小鼠模型和早期人体样本,缺乏对长期糖尿病进程中PSC动态变化的追踪 | 探究2型糖尿病对静止胰腺星状细胞亚群的影响及其在胰腺导管腺癌发展中的作用 | 8周龄C57BL/6J小鼠和糖尿病db/db小鼠的胰腺星状细胞以及人胰腺组织样本 | 数字病理学 | 胰腺癌、2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胰腺星状细胞样本(具体数量未提及)及部分人体组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 505 | 2026-07-23 |
ICOS+CD4+ T cells define a high susceptibility to anti-PD-1 therapy-induced lung pathogenesis
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.186483
PMID:40198121
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研究论文 | 本研究探讨了抗PD-1治疗引发的肺部病理发生机制,发现ICOS+CD4+ T细胞在老年小鼠和患者中易导致免疫相关不良事件 | 首次揭示ICOS+CD4+ T细胞在抗PD-1治疗诱导的肺部毒性中的关键作用,并确认了年龄因素对免疫相关不良事件易感性的影响 | 主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且未完全阐明ICOS+CD4+ T细胞活化的上游信号通路 | 阐明抗PD-(L)1治疗中免疫相关不良事件的细胞机制,特别是年龄对肺部毒性的影响 | 荷瘤老年小鼠和癌症患者 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年小鼠和年轻小鼠,以及癌症患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2026-07-23 |
Shared roles of immune and stromal cells in the pathogenesis of human bronchiolitis obliterans syndrome
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.176596
PMID:40232854
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析人类闭塞性细支气管炎综合征的免疫和基质细胞在发病机制中的共享作用 | 首次在两种形式的人类BOS(CLAD-BOS和cGVHD-BOS)中鉴定出CD8+组织驻留记忆T细胞的扩增群体,并发现其与其他慢性肺疾病不同,同时揭示了非免疫细胞群中与巨噬细胞趋化和增殖相关的基因和通路 | 样本量较小(CLAD-BOS患者4例、cGVHD-BOS患者3例、对照组3例),可能限制了结果的普遍性 | 阐明闭塞性细支气管炎综合征的发病机制,寻找共享的细胞和分子通路 | 人类闭塞性细支气管炎综合征的肺部组织样本 | 自然语言处理 | 慢性肺病,移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10例:4例CLAD-BOS患者、3例cGVHD-BOS患者、3例对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 507 | 2026-07-23 |
Characterization of a pathogenic nonmigratory fibroblast population in systemic sclerosis skin
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185618
PMID:40232859
|
研究论文 | 研究系统性硬化症皮肤中一种致病性非迁移成纤维细胞群体的特征 | 首次从皮肤活检中分离出非迁移的“驻留”成纤维细胞群体,并与常规外植体培养的迁移细胞进行比较,揭示其在疾病不同阶段和自身抗体亚组中的致病差异 | 未提供明确的局限性说明 | 探索系统性硬化症中非迁移成纤维细胞群体的致病作用及其在纤维化中的潜在角色 | 系统性硬化症患者的成纤维细胞(迁移和驻留群体) | 机器学习和数字病理学 | 系统性硬化症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 多通道免疫荧光 | NA | 文本和图像 | 从系统性硬化症患者的皮肤活检组织中分离的成纤维细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 508 | 2026-07-23 |
Transcriptional signatures of endothelial cells shape immune responses in cardiopulmonary health and disease
2025-05-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.191059
PMID:40401523
|
综述 | 本文综述了心肺脉管系统中内皮细胞的转录特征及其在免疫调控中的作用,重点关注单细胞RNA测序揭示的细胞异质性和疾病状态下的转录重编程 | 首次系统总结心肺系统中内皮细胞亚群的免疫调节特性,包括抗原呈递、细胞因子分泌、免疫细胞募集等功能的转录特征,并提出内皮细胞作为未来治疗靶点的潜力 | 未提供具体实验数据验证,依赖现有文献综述,可能缺乏对不同疾病模型中内皮细胞功能的定量比较 | 阐述心肺健康与疾病中内皮细胞的免疫调控功能,特别是适应性及非适应性免疫调节作用 | 心肺脉管系统中的内皮细胞亚群 | 自然语言处理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 509 | 2026-07-23 |
Identification of maize genes that condition early systemic infection of sugarcane mosaic virus through single-cell transcriptomics
2025-05-12, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101297
PMID:40045576
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学鉴定甘蔗花叶病毒早期系统感染中起作用的玉米基因 | 首次利用单细胞RNA测序技术研究甘蔗花叶病毒早期系统感染期间病毒积累与细胞内基因表达变化的共变模式,识别了潜在抗病毒或促病毒因子 | 只关注了早期系统感染阶段,未覆盖后期症状表现或长期互作动态 | 探究玉米叶片早期系统感染甘蔗花叶病毒时病毒积累与基因表达变化的共变关系 | 甘蔗花叶病毒感染的玉米叶片 | 单细胞转录组学 | 植物病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 甘蔗花叶病毒感染的玉米叶片样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 510 | 2026-07-23 |
IFN-γ and donor leukocyte infusions for relapsed myeloblastic malignancies after allogeneic hematopoietic stem cell transplantation
2025-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.190655
PMID:40131369
|
研究论文 | 一项I期临床试验评估了IFN-γ联合供体白细胞输注治疗异基因造血干细胞移植后复发的髓系恶性肿瘤的安全性和疗效 | 首次在人类临床试验中验证IFN-γ联合供体白细胞输注治疗移植后复发髓系肿瘤的安全性和初步疗效,并通过单细胞RNA测序证实IFN-γ在体内激活造血干细胞/髓系祖细胞中的IFN-γ反应通路 | 样本量较小(仅7例患者),需要更大规模研究正式验证该方法的疗效 | 评估IFN-γ联合供体白细胞输注治疗异基因造血干细胞移植后复发髓系恶性肿瘤的安全性和耐受性 | 异基因造血干细胞移植后复发的急性髓系白血病或骨髓增生异常综合征患者 | 数字病理学 | 急性髓系白血病, 骨髓增生异常综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7例患者(其中6例接受供体白细胞输注) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 511 | 2026-07-23 |
The brain-body circuit mediates acute stress-induced antiinflammatory reflex in bacterial cystitis by suppressing ILC2 activation
2025-05-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.189362
PMID:40100274
|
研究论文 | 发现急性应激通过大脑-身体回路抑制膀胱ILC2细胞活化,从而减轻细菌性膀胱炎的炎症反应 | 首次揭示下丘脑室旁核(PVN)通过糖皮质激素信号直接调控ILC2细胞功能,形成脑-体抗炎反射通路 | 摘要未提及研究局限性 | 探究急性应激状态下大脑神经回路调控膀胱感染的分子机制 | 小鼠模型中的膀胱组织、室旁核神经元、2型先天淋巴细胞(ILC2) | 机器学习和单细胞转录组学 | 泌尿系统感染(膀胱炎) | 单细胞RNA测序、逆行神经示踪 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠膀胱免疫细胞(具体数量未提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' 试剂盒 |
| 512 | 2026-07-23 |
Single-cell RNA-seq reveals the immune response of Co-infection with streptococcus pneumoniae after influenza A virus by a lung-on-chip: The molecular structure and mechanism of tight junction protein ZO-1
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.141815
PMID:40057081
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研究论文 | 利用肺芯片模型和单细胞RNA测序揭示甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响,重点关注紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 首次结合人肺芯片模型和单细胞RNA测序技术,系统研究流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响,并揭示紧密连接蛋白ZO-1在维持肺屏障完整性中的关键作用及其下调与异常定位机制 | 未提及具体限制 | 探索甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染对肺部免疫反应的影响,特别是紧密连接蛋白ZO-1的分子结构和作用机制 | 人肺芯片模型中甲型流感病毒与肺炎链球菌共感染的肺细胞 | 数字病理学 | 肺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 513 | 2026-07-23 |
Two duplicated GhMML3 genes coordinately control development of lint and fuzz fibers in cotton
2025-04-14, Plant communications
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.xplc.2025.101281
PMID:39943690
|
research paper | 本文发现两个重复的GhMML3基因通过剂量依赖性方式协同调控棉花长绒和短绒纤维的发育 | 首次揭示两个重复的GhMML3基因通过剂量依赖机制协同调控棉花两种纤维发育,并阐明其与关键纤维起始基因GhHD-1和GhMYB25的调控关系 | 未详细说明基因编辑突变体的脱靶效应评估及大田环境下的表型验证 | 解析棉花长绒和短绒纤维发育的遗传与分子调控机制 | 棉花(包括野生型J668和隐性裸籽突变体nNSM) | machine learning | NA | CRISPR-Cas9基因编辑、基因过表达、转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 包括J668、nNSM突变体、基因编辑突变体#mml3s及杂交后代群体 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 514 | 2026-07-23 |
Multi-Omic Insight Into the Molecular Networks in the Pathogenesis of Coronary Artery Disease
2025-04, Journal of the American Heart Association
IF:5.0Q1
DOI:10.1161/JAHA.124.037203
PMID:40135555
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研究论文 | 通过整合基因甲基化、表达和蛋白质水平的多组学数据,利用孟德尔随机化和共定位分析,识别与冠状动脉疾病相关的基因,并探讨其分子机制 | 创新性地结合多组学数据和孟德尔随机化方法,发现TAGLN2、APOB、GIP等基因与冠状动脉疾病风险的新关联,展示了多组学整合在揭示因果关系方面的优势 | 研究主要基于公开数据集,样本量有限,且未进行功能验证实验,结果可能受到混杂因素的影响 | 探索冠状动脉疾病的分子网络和潜在因果基因 | 冠状动脉疾病患者和对照组的基因甲基化、表达和蛋白质数据 | 机器学习 | 心血管疾病 | 孟德尔随机化,共定位分析,单细胞RNA测序 | NA | 多组学数据(甲基化、基因表达、蛋白质水平) | 多项研究数据集,具体样本量未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 515 | 2026-07-23 |
Predicting Prognosis and Immunotherapy Response in Glioblastoma (GBM) With a 5-Gene CAF-Risk Signature
2025-04, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70158
PMID:40226936
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研究论文 | 开发并验证了一个5基因癌症相关成纤维细胞(CAF)风险特征,用于预测胶质母细胞瘤(GBM)患者的预后和免疫治疗反应 | 首次构建并验证了基于CAF的5基因风险特征(ITGA5、MMP14、FN1、COL5A1和COL6A1),并证明其与免疫浸润和免疫治疗反应显著相关 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 探究CAF在GBM中的作用,通过开发CAF风险特征并探索其与免疫浸润和免疫治疗反应的相关性 | 胶质母细胞瘤(GBM)患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | RNA-seq、单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归模型 | 基因表达数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、批量RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2026-07-23 |
Mutual exclusivity and co-occurrence patterns of immune checkpoints indicate NKG2A relates to anti-PD-1 resistance in gastric cancer
2024-08-03, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05503-1
PMID:39097734
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和多元线性回归交互模型,揭示胃癌中免疫检查点的互斥与共现模式,并指出NKG2A与抗PD-1耐药性相关 | 揭示了PD-1与NKG2A的共现模式和互斥性,鉴定了两种不同的免疫检查点表达模式(ICEP1和ICEP2),并发现ICEP2 CD8+ T细胞与抗PD-1治疗耐药性相关 | 未明确提及,可能需要进一步验证小样本或特定机制的局限性 | 分析胃癌中免疫检查点表达模式,识别最优的抗PD-1与其他免疫检查点抑制剂的联合治疗策略 | 胃癌中CD8+ T细胞及其免疫检查点表达特征 | 机器学习和数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 多元线性回归交互模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确提及,可能包括多个胃癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 517 | 2026-07-23 |
Metastasis and basement membrane-related signature enhances hepatocellular carcinoma prognosis and diagnosis by integrating single-cell RNA sequencing analysis and immune microenvironment assessment
2024-07-31, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05493-0
PMID:39085893
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序分析和免疫微环境评估,构建了一种基于转移和基底膜相关基因的预后模型,用于增强肝细胞癌的预后和诊断能力 | 首次将转移与基底膜相关基因结合起来构建预后模型,并结合单细胞RNA测序和多种免疫算法全面评估免疫微环境,揭示了ITGA3在肿瘤转移中的作用 | 研究主要依赖公共数据库(TCGA和ICGC)的数据,缺乏独立外部验证队列;生物学机制验证仅限于体外细胞实验,未进行体内模型验证 | 探索和评估潜在生物标志物以改善肝细胞癌患者的生存结果和治疗效果 | 肝细胞癌患者(来自TCGA的424例和ICGC的240例)以及HepG2细胞系 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序 | Cox回归模型 | 转录组数据, 临床数据, 突变数据 | 424例TCGA患者和240例ICGC患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2026-07-23 |
Single-cell hdWGCNA reveals metastatic protective macrophages and development of deep learning model in uveal melanoma
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05421-2
PMID:39075441
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研究论文 | 通过单细胞RNA-seq和hdWGCNA分析揭示葡萄膜黑色素瘤中转移保护性巨噬细胞,并开发深度学习模型用于区分原发与转移患者及预后预测 | 首次利用高维加权基因共表达网络分析(hdWGCNA)在单细胞水平鉴定转移保护性巨噬细胞及其关键基因模块,并结合深度学习卷积神经网络模型实现原发与转移患者的精准区分 | 研究数据来源有限,未提及外部独立验证队列的多样性;转移保护的巨噬细胞亚群功能机制仍需进一步实验验证 | 探索葡萄膜黑色素瘤转移的免疫微环境机制,并基于关键基因开发预后预测模型 | 葡萄膜黑色素瘤患者的原发和转移样本中的巨噬细胞亚群及相关基因 | digital pathology, machine learning | uveal melanoma | 单细胞RNA-seq, 高维加权基因共表达网络分析 | 卷积神经网络, 机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | NA(未明确样本量) | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-07-23 |
Spatial transcriptome and single-cell reveal the role of nucleotide metabolism in colorectal cancer progression and tumor microenvironment
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05495-y
PMID:39075485
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研究论文 | 整合单细胞与空间转录组学,揭示核苷酸代谢在结直肠癌进展和肿瘤微环境中的作用 | 首次通过整合多种单细胞富集评分方法和空间转录组分析,识别出核苷酸代谢高表达的肿瘤细胞亚群(NUhighepi),并阐明其与成纤维细胞的互作机制,同时发现关键基因NME1在抑制转移中的作用 | 未说明具体局限性 | 深入理解核苷酸代谢在结直肠癌肿瘤细胞和肿瘤微环境中的功能 | 结直肠癌肿瘤细胞、肿瘤微环境中的成纤维细胞及免疫细胞 | 计算机视觉, 自然语言处理, 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 核苷酸代谢分析 | RCTD, stlearn, MISTy, 多种机器学习算法 | 单细胞数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 多个单细胞队列和多批量转录组队列(具体数量未说明) | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 520 | 2026-07-23 |
Communication between alveolar macrophages and fibroblasts via the TNFSF12-TNFRSF12A pathway promotes pulmonary fibrosis in severe COVID-19 patients
2024-07-29, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-024-05381-7
PMID:39075394
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研究论文 | 研究严重COVID-19患者肺泡巨噬细胞与成纤维细胞通过TNFSF12-TNFRSF12A通路促进肺纤维化的机制 | 首次揭示了TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19相关肺纤维化中介导肺泡巨噬细胞-成纤维细胞通信的关键作用,并发现沉默TNFRSF12A可逆转纤维化效应 | NA | 探究TNFSF12-TNFRSF12A通路在严重COVID-19肺纤维化中肺泡巨噬细胞与成纤维细胞间通信的作用 | 严重COVID-19患者的肺泡巨噬细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 新型冠状病毒病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 严重COVID-19患者和健康对照者的肺组织样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |