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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5141 | 2025-12-21 |
Inhibition of microglial Slc2a5 attenuates ischemic brain injury
2026-Feb, Metabolism: clinical and experimental
DOI:10.1016/j.metabol.2025.156429
PMID:41205649
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研究论文 | 本研究揭示了小胶质细胞中Slc2a5介导的果糖代谢途径在急性缺血性脑卒中(AIS)早期进展中的关键作用及其神经保护机制 | 首次发现小胶质细胞Slc2a5(果糖转运蛋白)通过调控果糖代谢加剧AIS脑损伤,并阐明其通过PKM2介导小胶质细胞向神经保护亚群分化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化仍需验证;机制研究集中在PKM2通路,可能存在其他调控途径 | 探究小胶质细胞果糖代谢在急性缺血性脑卒中病理机制中的作用,寻找潜在治疗靶点 | 小胶质细胞、小鼠AIS模型 | 神经科学 | 急性缺血性脑卒中 | 单细胞转录组测序(scRNA-seq)、条件性基因敲除、体外实验 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、病理表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5142 | 2025-12-21 |
A cell-type-specific regulon controlling monoterpene indole alkaloid biosynthesis with feedback and feedforward activation loops
2026-Jan, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70712
PMID:41208325
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,探究了两种植物中单萜吲哚生物碱生物合成基因的细胞类型特异性及其调控网络 | 首次在两种远缘植物物种中,通过单细胞RNA-seq数据揭示了MYB和bHLH转录因子在细胞类型特异性MIA生物合成中的共同调控机制,并构建了包含反馈和前馈激活环路的基因调控网络 | 研究主要基于单细胞RNA-seq数据,可能未完全覆盖所有调控因子或细胞类型,且实验验证主要依赖于过表达分析 | 探究单萜吲哚生物碱生物合成基因的细胞类型特异性及其转录调控机制 | 两种植物物种:Catharanthus roseus和Camptotheca acuminata | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 来自C. acuminata茎部的单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5143 | 2025-12-21 |
Bulk Transcriptome and Single-Cell Sequencing Datasets Reveal Key Programmed Cell Death Patterns in Radiation-Induced Lung Injury: Crosstalk Between NETosis and Macrophages' Responses
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503208R
PMID:41405834
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研究论文 | 本研究整合了批量转录组和单细胞RNA测序数据集,揭示了辐射诱导肺损伤中NETosis与巨噬细胞反应之间的关键程序性细胞死亡模式 | 首次通过整合批量转录组和单细胞测序数据,识别出NETosis是辐射诱导肺损伤中最显著的程序性细胞死亡亚型,并揭示了中性粒细胞与巨噬细胞之间的交互作用及转录因子调控网络 | 研究依赖于公共数据集,可能受限于样本来源和实验条件的异质性,且未进行体内或体外实验验证 | 探究辐射诱导肺损伤中程序性细胞死亡的特定亚型及其细胞类型特异性模式 | 肺组织样本,包括辐射处理和对照 | 数字病理学 | 肺损伤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自三个公共数据集(GSE25295, GSE41789, GSE211713)的样本,具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5144 | 2025-12-21 |
Single-cell and bulk transcriptome analysis reveals the impact of inflammatory microglia on prognosis and immunotherapy response in primary glioblastoma
2025-Dec-20, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-025-04135-1
PMID:41420790
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研究论文 | 本研究通过单细胞和批量转录组分析,探讨了炎症性小胶质细胞对原发性胶质母细胞瘤预后和免疫治疗反应的影响 | 首次基于炎症性小胶质细胞相关基因对GBM患者进行分层,揭示了其与预后、免疫治疗反应及肿瘤微环境特征的关联 | 研究基于回顾性数据分析,需进一步实验验证炎症性小胶质细胞的具体作用机制 | 评估炎症性小胶质细胞在GBM中的影响,以改善预后预测和免疫治疗策略 | 胶质母细胞瘤患者及其肿瘤微环境中的小胶质细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,批量转录组分析 | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 三个独立数据集中的患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 5145 | 2025-12-21 |
CD27 agonism enhances long-lived CD4 T cell vaccine responses critical for antitumor immunity
2025-Dec-19, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adz2294
PMID:41417923
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研究论文 | 本研究探讨了CD27激动剂如何增强HER2靶向疫苗诱导的长期CD4 T细胞记忆反应,从而改善抗肿瘤免疫效果 | 首次在长期存活(>18年)的HER2乳腺癌患者中鉴定出HER2特异性CD27+记忆T细胞,并证明CD27激动剂与疫苗联用可显著增强CD4 T细胞的长期记忆功能,该抗肿瘤效果不完全依赖于CD8 T细胞 | 研究包含回顾性临床分析和小鼠模型实验,尚未在大型前瞻性临床试验中验证;机制研究主要基于转基因小鼠模型 | 探究如何通过CD27信号增强肿瘤疫苗的长期免疫记忆,提高抗肿瘤疗效 | HER2阳性乳腺癌患者、人CD27转基因小鼠、HER2特异性T细胞 | 免疫肿瘤学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、过继性T细胞转移 | 转基因小鼠模型 | 单细胞转录组数据、免疫表型数据 | 长期存活(>18年)的HER2乳腺癌患者队列、转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5146 | 2025-12-18 |
Integrate bulk RNA and single-cell sequencing to identify prognostic genes associated with dietary restriction and circadian rhythm in colorectal cancer and conduct experimental verification
2025-Dec-17, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01993-5
PMID:41405668
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5147 | 2025-12-21 |
Comprehensive analysis based on spatial domains identifies CD44 as a potential target of puerarin
2025-Dec-17, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-025-06389-2
PMID:41405724
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和分子对接技术,探讨了葛根素在黑色素瘤中的空间靶向机制,并识别CD44作为潜在作用靶点 | 首次结合空间域分析和多组学方法,揭示葛根素在黑色素瘤中的空间特异性作用,并通过分子模拟优先确定CD44为候选受体 | 研究结果仅为假设生成性,需要进一步实验验证CD44是否确实介导葛根素的空间效应 | 阐明葛根素在黑色素瘤中的治疗特异性及其空间靶向机制 | 黑色素瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 分子对接, 蛋白质-配体模拟 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 分子结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5148 | 2025-12-21 |
Comprehensive molecular characterization of high-stemness gastric cancer cells using single-cell transcriptomics, spatial mapping, and machine learning
2025-Dec-17, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01177-0
PMID:41408440
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、空间转录组学和机器学习,全面表征了高干性胃癌细胞的分子特征和功能 | 首次系统性地整合单细胞RNA测序、空间转录组学和机器学习算法,识别并验证了高干性胃癌细胞的特定基因特征及其在化疗耐药中的潜在作用 | 研究主要基于计算分析和体外细胞系验证,缺乏体内模型或大规模临床队列的进一步验证 | 全面表征高干性胃癌细胞的分子特征,并探索其在肿瘤侵袭性和治疗抵抗中的作用 | 胃癌细胞,特别是高干性亚群 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,bulk RNA测序,机器学习 | 支持向量机,SHAP分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,bulk RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但使用了SGC7901和HGC-27胃癌细胞系进行实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5149 | 2025-12-21 |
In situ DC-primed vaccine combined with CD137 agonist elicits long-lasting antitumor immunity through cDC1-mediated tumor antigen-specific CD8+ T cell responses
2025-Dec-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011665
PMID:41386973
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研究论文 | 本研究评估了原位DC启动疫苗与CD137激动剂联合疗法在小鼠肺癌和结肠癌模型中的抗肿瘤效果及免疫机制 | 首次揭示了该联合疗法通过cDC1介导的肿瘤抗原特异性CD8+ T细胞反应建立持久抗肿瘤免疫的新机制,并发现其对调节性T细胞的功能重塑作用 | 研究基于小鼠模型,临床转化效果尚需验证;单细胞测序样本量有限,需扩大验证 | 探索癌症免疫治疗中新型联合疗法的抗肿瘤免疫机制 | 小鼠肺癌和结肠癌模型中的免疫细胞(CD8+ T细胞、cDC1、Tregs等) | 免疫学 | 肺癌, 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 植入性小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5150 | 2025-12-21 |
Immunoregulatory Roles of Tumor-Originated Pericytes Identified by Single-Cell Analysis in Glioblastoma
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511856
PMID:41001759
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析人原发胶质母细胞瘤中的周细胞,揭示了肿瘤来源周细胞的存在及其在调节肿瘤相关巨噬细胞极化和促进肿瘤生长中的免疫调节作用 | 首次在胶质母细胞瘤中通过单细胞分析区分出肿瘤来源周细胞和正常来源周细胞,并发现CD44标记的周细胞亚群与肿瘤相关巨噬细胞密切相关,具有促进M2极化和肿瘤生长的功能 | NA | 阐明胶质母细胞瘤中周细胞的起源、功能异质性及其免疫调节作用 | 人原发胶质母细胞瘤样本中的CD146阳性周细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人原发胶质母细胞瘤样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5151 | 2025-12-21 |
Extracellular Vesicle-Packaged circTAX1BP1 from Cancer-Associated Fibroblasts Regulates RNA m6A Modification through Lactylation of VIRMA in Colorectal Cancer Cells
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514008
PMID:41017455
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)来源的细胞外囊泡(EVs)中circTAX1BP1通过VIRMA的乳酰化调控RNA m6A修饰,从而促进结直肠癌肝转移(CRLM)的分子机制 | 首次发现CAFs来源的EVs中circTAX1BP1通过招募AARS2促进VIRMA的乳酰化,进而增强SP1 mRNA的m6A修饰和稳定性,形成CRC细胞与ITGA11 myCAFs亚群之间的正反馈环路 | 研究主要基于体外和体内模型,临床样本验证有限,且PDX模型中的联合阻断策略需进一步临床前评估 | 阐明结直肠癌肝转移(CRLM)中肿瘤细胞与癌症相关成纤维细胞(CAFs)相互作用的分子机制 | 结直肠癌(CRC)细胞、癌症相关成纤维细胞(CAFs)、细胞外囊泡(EVs)、circTAX1BP1、VIRMA蛋白、SP1转录因子 | 肿瘤生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、体内外功能实验、患者来源异种移植(PDX)模型 | NA | 测序数据、实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5152 | 2025-12-21 |
Associations of Plasma Metabolite Phenylacetylglutamine on Coronary Plaque Characterization in Patients with ST-Segment Elevation Myocardial Infarction
2025-Dec, Cardiovascular toxicology
IF:3.4Q2
DOI:10.1007/s12012-025-10067-7
PMID:41091431
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研究论文 | 本研究探讨了肠道菌群代谢物苯乙酰谷氨酰胺(PAGln)与ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者罪犯斑块特征之间的关联 | 首次揭示了PAGln浓度与易损斑块特征独立相关,并通过单细胞RNA测序发现巨噬细胞可能参与此过程 | 研究为观察性设计,无法确定因果关系;样本仅来自STEMI患者,结果可能不适用于其他人群 | 探究血浆PAGln水平与STEMI患者罪犯斑块特征之间的关系 | ST段抬高型心肌梗死(STEMI)患者 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 光学相干断层扫描(OCT),单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归模型 | 血浆代谢物数据,OCT影像数据,单细胞RNA测序数据 | 776名接受OCT成像的STEMI患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5153 | 2025-12-21 |
Effect of acupuncture on brain microenvironment in rats with post-stroke limb spasticity based on single-cell transcriptome sequencing technology
2025-Dec, Journal of traditional Chinese medicine = Chung i tsa chih ying wen pan
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组测序技术,探讨了针刺对脑卒中后肢体痉挛大鼠脑微环境的影响及其可能机制 | 首次结合单细胞转录组测序技术研究针刺改善脑卒中后肢体痉挛的细胞类型比例变化及关键差异基因 | 研究仅在大鼠模型中进行,样本量有限,且未进行长期随访观察 | 探究针刺改善脑卒中后肢体痉挛的可能机制 | 大脑中动脉闭塞模型大鼠 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组测序,Western blot,实时定量聚合酶链反应,酶联免疫吸附测定 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 32只大鼠,分为对照组、假手术组、模型组和针刺组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5154 | 2025-12-21 |
Exploring Functionally Enhanced BLP-Trained Macrophage Subpopulations in S. Aureus Infection: Underlying Mechanisms and Therapeutic Significance
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417142
PMID:41117166
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析BLP训练巨噬细胞在金黄色葡萄球菌感染中的转录组特征,揭示其增强抗感染能力的机制 | 首次在单细胞水平鉴定出BLP训练诱导的两个新巨噬细胞亚群C5和C7,并阐明其通过NRF2信号通路和代谢重编程增强抗感染功能的机制 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化潜力需进一步评估 | 探究BLP训练巨噬细胞增强抗感染能力的分子机制及其治疗潜力 | 小鼠骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) | 单细胞组学 | 败血症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5155 | 2025-12-21 |
Idiopathic Pulmonary Fibrosis: Cellular Heterogeneity, Mechanisms, and Therapeutic Implications
2025-Dec, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70521
PMID:41409095
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化(IPF)的细胞异质性、致病机制及治疗意义,整合了单细胞RNA测序和空间转录组学的最新发现 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示IPF中关键致病细胞群及其信号串扰,提出多维数据合成的细胞分子框架 | IPF的动态细胞间网络和时空调控机制仍不明确,致病机制尚未完全理解 | 阐明IPF的致病机制,为生物标志物引导的精准治疗提供概念基础 | 特发性肺纤维化(IPF)及其纤维化微环境中的上皮细胞、间充质细胞、免疫细胞和血管细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5156 | 2025-12-21 |
Immune-modulating effects on tumor-draining lymph nodes of neoadjuvant chemoradiotherapy combined with dual immunotherapy in patients with T3-4N0-2 NSCLC
2025-Nov-28, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013237
PMID:41314982
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研究论文 | 本研究探讨了在T3-4N0-2非小细胞肺癌患者中,新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结的免疫调节作用 | 结合空间转录组学和免疫组织化学分析,首次系统研究了新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结的免疫调节效应,特别是在不同辐射剂量下的影响 | 研究为观察性队列设计,样本量有限(每组25例),且仅针对特定亚型的非小细胞肺癌患者,结果可能无法推广到其他癌症类型或治疗组合 | 评估新辅助放化疗联合双重免疫疗法对肿瘤引流淋巴结免疫功能的调节作用 | T3-4N0-2非小细胞肺癌患者的肿瘤引流淋巴结 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 空间转录组数据, 免疫组织化学图像 | 50例患者(INCREASE试验组25例,匹配对照组25例) | NA | 空间转录组学 | GeoMx | GeoMx空间转录组学分析平台,用于CD8/Ki67+T细胞热点区域的转录组分析 |
| 5157 | 2025-12-21 |
Spatially organized cellular communities shape functional tissue architecture in the pancreas
2025-Nov-14, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adx5791
PMID:41223257
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研究论文 | 本研究结合单细胞和空间转录组学技术,绘制了小鼠胰腺从胚胎发育到成年稳态的细胞群体空间时间图谱 | 首次结合单细胞和空间转录组学解析胰腺细胞类型的空间异质性,并发现上皮-间充质单元作为基本组织微环境 | 研究主要基于小鼠模型,人类模型验证有限 | 揭示胰腺细胞如何通过空间组织形成功能性组织结构 | 小鼠和人类胰腺组织 | 空间转录组学 | 胰腺疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5158 | 2025-12-21 |
scHLens: a web server for hierarchically and interactively exploring single cell RNA-seq data
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf675
PMID:41403052
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scHLens的交互式网络服务器,用于分层探索单细胞RNA测序数据 | 开发了支持用户自定义分析流程和分层探索模式的交互式网络服务器,解决了现有方法在界面友好性、流程灵活性和细胞亚型识别方面的不足 | 未在摘要中明确说明 | 降低单细胞RNA测序数据分析的技术门槛,提高细胞异质性识别的灵活性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5159 | 2025-12-21 |
Temporal dynamics of uterine immune microenvironment remodeling in a murine model of adenomyosis
2025-Oct-02, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf057
PMID:41298316
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研究论文 | 本研究利用他莫昔芬诱导的小鼠子宫腺肌症模型,探究了受孕前子宫免疫微环境的动态演变 | 首次在小鼠模型中系统描绘了子宫腺肌症发展过程中免疫微环境的时间动态变化,揭示了早期先天性与适应性免疫间的动态交互作用 | 研究依赖单一动物模型、仅分析两个时间点、缺乏对调节性T细胞的功能评估 | 阐明子宫腺肌症在受孕前免疫微环境的演变机制 | 他莫昔芬诱导的子宫腺肌症小鼠模型 | NA | 子宫腺肌症 | 免疫荧光、流式细胞术、定量聚合酶链反应 | NA | 组织样本 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5160 | 2025-12-21 |
Lactate metabolism orchestrates immune dysregulation in renal cancer: A multi-omics and causal inference study
2025 Oct-Dec, Science progress
IF:2.6Q2
DOI:10.1177/00368504251408094
PMID:41406083
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和因果推断方法,探讨了乳酸代谢基因在肾细胞癌中的调控作用及其与免疫失调的关联 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和孟德尔随机化分析,识别出与肾癌风险相关的关键乳酸代谢基因,并通过组织芯片免疫荧光实验验证了基因表达 | 研究主要基于公共数据库数据,样本来源可能有限,且实验验证仅针对部分基因,需要进一步的功能性研究来确认机制 | 探究乳酸代谢基因在肾细胞癌进展中的作用,识别潜在的治疗靶点 | 肾细胞癌患者样本及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 空间转录组学, 孟德尔随机化, 组织芯片免疫荧光 | CIBERSORT, GSEA, ssGSEA, RCTD, CellChat | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 基于GEO数据库的多项数据集(GSE242299, GSE102101, GSE175540),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |