单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 37711 篇文献,本页显示第 481 - 500 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
481 2026-03-19
Single-cell transcriptomics identifies NF-κB/STAT3-associated neutrophil inflammatory reprogramming in rheumatoid arthritis synovium
2026-Mar-12, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学揭示了类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性及其炎症重编程机制 首次在类风湿关节炎滑膜中系统鉴定出以C1(趋化因子)和C3(S100A8/A9)表型为主的浸润性中性粒细胞亚群,并发现NF-κB/STAT3轴是调控其炎症重编程的关键节点 样本量相对有限(8例单细胞测序患者),且功能验证主要依赖计算模拟,需后续实验验证 阐明类风湿关节炎滑膜中中性粒细胞的异质性及其在炎症微环境中的作用机制 类风湿关节炎患者的滑膜组织细胞 数字病理学 类风湿关节炎 单细胞RNA测序 hdWGCNA(高维加权基因共表达网络分析) 单细胞转录组数据 8例RA患者(66,539个细胞)用于单细胞测序,19例独立样本用于批量RNA-seq验证 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
482 2026-03-19
PIN1 suppresses bladder cancer progression by inducing cellular senescence and activating the interferon response pathway
2026-Mar-12, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了PIN1在膀胱癌中作为肿瘤抑制因子的新角色,其通过诱导细胞衰老和激活干扰素反应通路来抑制肿瘤进展 首次在膀胱癌中识别PIN1为肿瘤抑制因子,并阐明其通过激活干扰素通路诱导细胞衰老的分子机制 研究主要基于体外实验和小鼠模型,临床验证和机制细节仍需进一步探索 探究PIN1在膀胱癌中的表达模式、生物学功能及其分子机制 膀胱癌组织、细胞系及小鼠异种移植模型 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Western blot, qRT-PCR, RNA测序 NA 单细胞RNA测序数据, 临床标本数据, 体外实验数据 未明确指定样本数量,但涉及临床标本、细胞系和小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
483 2026-03-19
Inhibition of NFAT after human uterus transplant promotes loss of tissue-resident NK cells and attendant pregnancy complications
2026-Mar-11, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过比较子宫移植受者与健康对照的样本,揭示了NFAT信号抑制导致组织驻留子宫自然杀伤细胞减少,进而引发妊娠并发症的机制 首次在人类中揭示了NFAT信号在调节子宫自然杀伤细胞组织驻留程序中的关键作用,并关联了子宫移植后妊娠并发症的生物学基础 研究基于子宫移植受者这一高风险人群,样本量可能有限,且机制研究主要依赖体外实验,需进一步验证 探究子宫移植后妊娠并发症的生物学机制,特别是组织驻留子宫自然杀伤细胞的作用 子宫移植受者的子宫内膜和蜕膜组织样本,以及健康对照的相应组织 单细胞组学 妊娠并发症 流式细胞术、免疫荧光显微镜、单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据、图像数据 子宫移植受者队列与健康对照的子宫内膜和蜕膜组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
484 2026-03-19
Reconstitution of the uterine immune milieu after uterus or hematopoietic stem cell transplantation
2026-Mar-11, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和高参数流式细胞术,探讨了子宫移植或造血干细胞移植后人类子宫免疫微环境的重建过程 首次在人类中系统评估子宫移植和造血干细胞移植后子宫免疫系统的重建,利用单核苷酸多态性和HLA表达差异追踪供体与受体细胞起源,揭示了免疫细胞在转录组、表型和空间层面的恢复能力 研究样本量有限,且受他克莫司药物影响,可能限制了组织驻留淋巴细胞特征的体外诱导观察 探究人类组织特异性免疫系统的建立与重建机制,特别是在子宫这一持续再生器官中的免疫持久性和恢复能力 接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者的子宫内膜免疫细胞 单细胞组学 移植免疫 单细胞RNA测序, 高参数流式细胞术 NA 单细胞转录组数据, 流式细胞数据 未明确具体样本数量,涉及接受子宫移植或造血干细胞移植的女性患者 NA 单细胞RNA-seq NA NA
485 2026-03-19
Vps35 p. D620N causes Lrrk2 kinase hyperactivity, chronic microglial activation and inflammation
2026-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了Vps35 p.D620N突变如何通过激活LRRK2激酶活性,导致慢性小胶质细胞激活和炎症,从而影响帕金森病的发病机制 首次在Vps35 p.D620N敲入小鼠模型中,结合单细胞RNA测序技术,系统揭示了该突变如何驱动小胶质细胞的慢性促炎表型,并增强其吞噬活性和突触重塑能力 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证;样本量较小(6月龄VKI小鼠),且未涵盖其他年龄或疾病阶段 阐明Vps35 p.D620N突变如何通过LRRK2激酶活性影响小胶质细胞功能,进而促进帕金森病的神经退行性过程 Vps35 p.D620N敲入小鼠(VKI)的小胶质细胞 数字病理学 帕金森病 单细胞RNA测序,免疫组织化学,定量PCR NA 转录组数据,图像数据 6月龄VKI小鼠的小胶质细胞样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
486 2026-03-19
Bisphenol analogs affected hepatic development and disrupted lipid homeostasis in zebrafish larvae
2026-Mar-10, Environmental pollution (Barking, Essex : 1987)
研究论文 本研究探讨了双酚类似物对斑马鱼幼虫肝脏发育和脂质稳态的影响 首次比较了BPA及其替代物BPAF和BPG对斑马鱼早期肝脏发育和脂质代谢的差异影响,并利用10x单细胞RNA-Seq技术揭示了相关分子通路 研究仅基于斑马鱼模型,结果向人类外推需谨慎;暴露浓度设置可能未覆盖所有环境相关水平 探究双酚类似物干扰肝脏发育和脂质稳态的机制 斑马鱼胚胎和幼虫 毒理学 肝脏疾病 单细胞RNA-Seq, 脂质组学分析, 油红O染色 NA 基因表达数据, 脂质组数据, 图像数据 斑马鱼胚胎暴露于不同浓度双酚类似物 10x Genomics 单细胞RNA-seq 10x Chromium 10x单细胞RNA-Seq分析
487 2026-03-19
Macrophage SLC9A1 Links Endocytic Trafficking to Innate Immune Activation in Myocardial Injury
2026-Mar-10, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞中的钠氢交换体SLC9A1通过调节巨胞饮作用,连接膜离子转运与心肌损伤后先天免疫激活的新机制 首次发现SLC9A1作为连接膜离子转运与炎症信号传导的桥梁,并证实巨噬细胞巨胞饮作用是心肌梗死后先天免疫激活的关键调节器 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中得到验证;SLC9A1抑制剂EIPA的特异性可能影响其他细胞功能 探究心肌梗死后巨噬细胞感知缺血危险信号的上游机制,特别是巨胞饮作用和SLC9A1在先天免疫激活中的作用 心肌梗死小鼠模型中的巨噬细胞,特别是梗死相关巨噬细胞 心血管疾病研究 心血管疾病 单细胞RNA测序,药理学抑制,基因敲除技术 NA 基因表达数据,功能表型数据 使用单核细胞和单核细胞来源巨噬细胞特异性敲除小鼠模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
488 2026-03-19
Deciphering Cell Cycle Dynamics and Cell States in Single-cell RNA-seq data with SPAE
2026-Mar-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为SPAE的集成正弦与分段自编码器模型,用于在单细胞RNA测序数据中表征细胞周期动态和细胞状态 提出了一种基于自编码器的分段线性模型(SPAE),在细胞周期表征方面比现有方法具有显著提升的准确性和鲁棒性,并能准确预测癌细胞周期转换及有效去除基因表达数据中的细胞周期效应 未在摘要中明确说明 解决在scRNA-seq数据中准确识别和分析细胞周期动态的挑战 单细胞RNA测序数据中的细胞周期动态和细胞状态 机器学习 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 自编码器(AutoEncoder)、分段线性模型 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
489 2026-03-19
SR2P: an efficient stacking method to predict protein abundance from gene expression in spatial transcriptomics data
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文提出了一种基于堆叠机器学习框架SR2P,用于从空间转录组学数据中的基因表达预测蛋白质丰度 SR2P整合了11种互补的预测模型,在多个空间多组学基准测试中持续优于现有方法,能够从仅含RNA的空间数据推断蛋白质丰度 技术成本和约束仍是障碍,且依赖于现有空间多组学基准数据的可用性 预测空间转录组学数据中的蛋白质丰度,以增强肿瘤免疫学研究中的分析能力 头颈鳞状细胞癌患者的空间转录组学数据 空间转录组学 头颈鳞状细胞癌 空间转录组学,空间多组学分析 堆叠机器学习框架 空间转录组学数据(RNA表达) NA NA 空间转录组学 NA NA
490 2026-03-19
ENS lineage potential is not intrinsically regionalized but is modulated by PTPRZ1 signaling
2026-Mar-07, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能扰动实验,揭示了肠道神经系统在小肠发育中缺乏内在区域化,而是通过微环境信号如PTPRZ1信号进行次级调控 首次证明ENS缺乏内在前-后区域化,并识别出PTPRZ1信号作为关键的时空调控因子,影响人类ENS发育中的增殖和神经分化程序 研究主要聚焦于小鼠E13.5至E18.5发育阶段,人类数据基于干细胞衍生模型,可能无法完全模拟体内复杂性 探究肠道神经系统在小肠发育过程中是否经历区域化转录多样化,以及微环境信号如何调控其成熟 小鼠胚胎肠道神经系统(ENS)、上皮细胞、间充质细胞,以及人类多能干细胞衍生的ENS培养物 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序、功能扰动实验、配体-受体分析 NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
491 2026-03-19
Crohn's disease under single-cell map: from INFLARE metaplastic cells to rare immune cell subpopulations
2026-03-05, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
综述 本文综述了利用单细胞测序技术在克罗恩病中发现的多种新型免疫细胞亚群及其在疾病发病机制中的作用 系统总结了单细胞测序揭示的克罗恩病相关新型免疫细胞亚群,如INFLAREs、CAITs等,并探讨了它们作为未来治疗靶点的潜力 这是一篇综述文章,主要整合现有研究发现,未提供新的原始实验数据 总结克罗恩病中通过单细胞测序技术鉴定的关键免疫细胞亚群,并探讨其病理作用与治疗潜力 克罗恩病患者样本中的免疫细胞 单细胞组学 克罗恩病 单细胞测序 NA 单细胞基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
492 2026-03-19
Spatial transcriptomics reveals mechanism of autoimmunity driven by internalized autoantibodies
2026-Mar-05, medRxiv : the preprint server for health sciences
研究论文 本研究利用空间转录组学揭示了自身抗体内化作为多种自身免疫性疾病共享的致病机制 首次通过空间转录组学证明抗体分泌细胞将细胞质物质(如免疫球蛋白RNA)转移到邻近受影响的细胞中,并揭示了自身抗体诱导的转录程序与细胞损伤和特异性炎症反应相关 NA 探究自身抗体内化在自身免疫性疾病发病机制中的作用及其普遍性 抗Mi2皮肌炎、抗PM/Scl硬化性肌炎、抗U1RNP混合性结缔组织病、抗Ku重叠综合征和抗Scl70系统性硬化症患者的肌肉活检组织和其他组织样本 数字病理学 自身免疫性疾病 空间转录组学、bulk RNA测序、直接免疫荧光 NA 转录组数据、图像数据 多个独立队列的患者肌肉活检样本 NA 空间转录组学、bulk RNA-seq NA NA
493 2026-03-19
Mesoscale molecular architecture of the human striatum across cell types and lifespan
2026-Mar-05, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用Slide-tags单细胞空间转录组技术,揭示了人类纹状体的中尺度分子结构,将其划分为六个分子定义的功能区,并探讨了这些区域在衰老过程中的转录变化 首次在人类纹状体中发现了由分子定义的、稳健的中尺度结构,揭示了六个功能区域及其在衰老过程中的动态变化 研究基于死后组织样本,可能无法完全反映活体状态;样本量相对有限(19例用于空间转录组分析) 解析人类纹状体的分子结构及其与功能特化和衰老易感性的关联 人类纹状体(前纹状体) 空间转录组学 NA 单细胞空间转录组学,单细胞核RNA测序 NA 空间转录组数据,单细胞RNA测序数据 19例死后捐赠者用于空间转录组分析(110万个细胞),131例捐赠者用于单细胞核RNA测序分析 NA 单细胞空间转录组学,单细胞RNA测序 Slide-tags Slide-tags(可扩展的单细胞核空间转录组技术)
494 2026-03-19
CNS-resident B cells develop locally into a pro-inflammatory age-associated phenotype during aging and after stroke
2026-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过流式细胞术、单细胞RNA测序和B细胞受体测序,揭示了衰老和缺血性中风后中枢神经系统内B细胞亚群的局部发育和促炎性表型变化 识别了新型B1b细胞前体池,不同于经典的胸膜/腹膜生态位,并展示了其在衰老和卒中后向年龄相关B细胞(ABC)亚群的转化及克隆扩增 研究主要基于小鼠模型,人类样本仅来自死后脑组织,可能无法完全反映活体动态过程 定义中枢神经系统局部B细胞亚群,探究其在衰老和缺血性中风后的免疫表型变化 老年雄性和雌性小鼠的未损伤和卒中后脑组织B细胞,以及老年人类死后脑实质组织 免疫学 缺血性中风 流式细胞术, 单细胞RNA测序, B细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 老年小鼠脑组织B细胞及老年人类死后脑组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
495 2026-03-19
Organization and evolution of sex-biased gene expression in Drosophila adult sexual circuits
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究利用单细胞转录组学技术,以果蝇性决定基因为分子工具,探究了成年性回路中性别偏向基因表达的细胞水平组织与进化模式 首次在细胞分辨率下系统分析了果蝇性回路中性别偏向基因表达的转录组景观和进化动态,揭示了其物种特异性、细胞类型特异性以及发育动态性 研究主要基于果蝇模型,结论在其他动物物种中的普适性有待验证,且未深入探讨基因表达变化的功能性后果 探究性回路中性别偏向基因表达的组织结构和进化机制,以理解性二态行为如何从共享发育蓝图演化而来 果蝇(Drosophila)成年性回路 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA-seq数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
496 2026-03-19
Multiscale confidence quantification for virtual spatial transcriptomics with UTOPIA
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了UTOPIA,一个模型无关的框架,用于虚拟空间转录组学的多尺度置信度量化,以评估预测的统计可靠性 UTOPIA是首个为虚拟空间转录组学提供多尺度统计校准置信度评分的框架,能够控制从基因到元基因、从特定细胞类型到更广泛细胞类别的错误发现率 未明确提及具体局限性,但可能依赖于输入模型的质量和组织上下文假设 提高虚拟空间转录组学预测的统计可靠性和可解释性 虚拟空间转录组学预测的基因表达、元基因和细胞类型 数字病理学 NA 虚拟空间转录组学 模型无关框架 组织学图像和空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
497 2026-03-19
Functional Type I and Type II interferon crosstalk restricts progenitor exhausted CD8 T cells through spatial exclusion and checkpoint enforcement
2026-Mar-03, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文揭示了在慢性LCMV感染中,I型和II型干扰素通过空间排斥和检查点调控协同限制前体耗竭CD8 T细胞(Tpex)的新机制 发现了一个以前未被识别的、空间编码的干扰素回路,该回路通过将Tpex隔离在富含PDL1的B细胞生态位中并抑制T细胞源性IFNγ,间接限制其扩增 研究主要基于慢性LCMV感染模型,在其他慢性感染或肿瘤环境中的普适性有待验证 探究I型和II型干扰素在慢性感染中如何协同调控CD8 T细胞的命运 慢性LCMV感染模型中的前体耗竭CD8 T细胞(Tpex)及其子代效应CD8 T细胞 免疫学 慢性病毒感染 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
498 2026-03-19
Epitope-spanning antigenic variation reprograms immunodominance and broadens immunity in sequential influenza vaccination
2026-Mar-02, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究探讨了通过靶向改变流感病毒血凝素头部多个位点的抗原变异,以重新编程免疫优势表位,从而增强流感疫苗的广谱性和持久性保护 提出了“表位层次重塑”概念,通过靶向抗原变异重定向免疫记忆至保守表位,拓宽了免疫反应并增强了交叉保护 研究基于雪貂模型,可能不完全反映人类免疫反应的复杂性,且未在多种病毒株或长期保护中进行验证 研究旨在克服免疫印记对流感疫苗广谱性和持久性保护的限制,通过抗原变异策略增强疫苗效果 A(H3N2)流感病毒的血凝素(HA)头部位点(A、B和D)以及雪貂模型中的免疫反应 免疫学 流感 单细胞转录组学、ELISpot检测、表位映射和结构分析 NA 转录组数据、免疫学检测数据 雪貂模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
499 2026-03-19
Targeted Ferroptosis Improves RPE Phagocytosis via MERTK/NFE2L2/HMOX1 Axis to Alleviate Retinitis Pigmentosa
2026-Mar-02, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过靶向铁死亡改善RPE的吞噬功能,揭示了MERTK/NFE2L2/HMOX1轴在缓解色素性视网膜炎中的作用机制 首次将铁死亡与MERTK缺陷型色素性视网膜炎的RPE功能障碍联系起来,并确定了MERTK/NFE2L2/HMOX1这一新的信号轴 研究主要基于RCS大鼠模型和体外细胞实验,尚未在更广泛的人类患者样本中进行验证 探究色素性视网膜炎中RPE细胞的致病性改变,并寻找潜在的治疗策略 皇家外科学院大鼠模型、人原代RPE细胞 单细胞组学 色素性视网膜炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 RCS大鼠和RDY大鼠的视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
500 2026-03-19
Systematic analyses uncover endocrine-disrupting chemical-responsive genes linked to endometriosis
2026-03, Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.)
研究论文 本研究通过整合孟德尔随机化、贝叶斯共定位和单细胞RNA测序,识别了与内分泌干扰物反应相关并可能影响子宫内膜异位症风险的基因 首次将孟德尔随机化、贝叶斯共定位与单细胞RNA测序整合,系统性地揭示了内分泌干扰物通过特定基因影响子宫内膜异位症风险的分子通路 研究主要基于遗传学和转录组学数据,需要进一步的实验验证来确认这些基因在EDC暴露下的功能机制 识别内分泌干扰物反应基因,并探究它们如何影响子宫内膜异位症的发病风险 与内分泌干扰物反应相关的基因及其在子宫内膜异位症中的潜在作用 生物信息学 子宫内膜异位症 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 贝叶斯共定位分析, 全基因组关联研究 NA 基因表达数据, 遗传变异数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
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