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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 481 | 2026-07-23 |
COVARE for modeling latent random effect correlations to detect genes with specific spatial expression patterns
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111242
PMID:41941898
|
研究论文 | 提出COVARE方法,基于线性混合效应模型建模潜在随机效应相关性,以检测具有特定空间表达模式的基因 | 首次在线性混合效应模型框架下整合多种先验生物学信息并考虑协变量间的潜在交互作用,实现对基因空间表达的多因素共调控的精确分析 | 未提及具体局限性 | 开发一种能够检测空间可变基因并考虑协变量交互效应的新方法 | 基因的空间表达模式及细胞微环境中的协变量交互效应 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 线性混合效应模型 | 空间转录组数据 | 使用了公共数据集进行模拟和分析,未说明具体样本量 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 482 | 2026-07-23 |
OMICX: An AI-powered web platform for integrative analysis of multi-condition single-cell transcriptomics data
2026-05, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2026.111243
PMID:41941899
|
研究论文 | 介绍了一个名为OMICX的基于AI的Web平台,用于多条件单细胞转录组数据的综合分析 | 搭载大型语言模型助手OMICX-Agent,用户可通过自然语言对话进行高级单细胞数据分析,无需编程技能 | 未明确提及局限性 | 开发一个交互式、无需编程的Web平台,使研究者能够通过自然语言对话进行单细胞数据的综合分析 | 单细胞RNA测序数据、批量RNA测序数据、GWAS汇总统计数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 文本 | 三个真实案例研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 483 | 2026-07-23 |
Tumor Matrix Proteoglycan Accumulation and Processing Alter T-cell Effector Function and the Response to Immunotherapy in Patients with Oligometastatic Colorectal Cancer
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2780
PMID:41671077
|
研究论文 | 本研究探讨了肿瘤基质蛋白聚糖versican(VCAN)在少转移性结直肠癌患者中的积累和加工如何影响T细胞效应功能及免疫治疗反应 | 首次在前瞻性临床试验中评估VCAN对免疫监视和免疫治疗反应的影响,并发现VCAN的蛋白水解产物versikine与CD8+ T细胞效应表型及临床预后改善相关 | 样本量较小(15例),仅涉及微卫星稳定的少转移性结直肠癌患者,且VCAN蛋白水解表型与获益趋势的相关性未达到统计学显著性 | 评估VCAN在少转移性结直肠癌免疫监视和免疫治疗反应中的作用 | 结直肠癌患者(243例跨分期组织样本,15例微卫星稳定少转移性结直肠癌患者) | 机器学习和数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织样本和单细胞RNA测序数据 | 243例组织样本(跨分期)和15例微卫星稳定少转移性结直肠癌患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序 |
| 484 | 2026-07-23 |
CD14+CD16- monocytes exhibit NF-κB hyperactivation in biliary atresia: Clinical association and murine therapeutic validation
2026-May-01, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1097/HC9.0000000000000941
PMID:41974027
|
研究论文 | 该研究探讨了胆道闭锁中经典单核细胞(CD14+CD16-)的NF-κB过度激活及其在胆管损伤中的作用,并通过小鼠模型验证了治疗潜力 | 首次揭示CD14+CD16-单核细胞在胆道闭锁患者胆管损伤区域的空间富集及其NF-κB通路的过度激活,并利用恒河猴轮状病毒诱导的BA小鼠模型验证了靶向单核细胞或NF-κB轴的治疗策略 | NA | 阐明经典单核细胞在胆道闭锁发病机制中的具体作用,尤其是NF-κB信号通路的调控机制 | 胆道闭锁患者和对照组的肝脏组织及血液样本,以及恒河猴轮状病毒诱导的BA小鼠模型 | 计算机视觉 | 胆道闭锁 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、RNA测序、细胞因子分析 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 胆道闭锁患者和对照组肝脏组织及血液样本,以及恒河猴轮状病毒诱导的BA小鼠 | 10x Genomics, Illumina | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | 10x Chromium, Illumina NovaSeq | 10x Chromium用于单细胞RNA测序, Illumina NovaSeq用于RNA测序 |
| 485 | 2026-07-23 |
The B7 family subgroup reflects tumor cell heterogeneity and patient post-operative prognosis in gallbladder cancer
2026-Apr-18, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00802-7
PMID:42001193
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research paper | 通过单细胞分辨率揭示B7家族亚群在胆囊癌中的肿瘤细胞异质性和患者术后预后 | 首次在单细胞水平上解析胆囊癌中B7家族免疫检查点分子CD276、VTCN1和HHLA2的表达及其下游信号,并构建整合这三个分子表达与肿瘤大小和分化的梯度提升机模型用于术后风险分层 | 样本量相对较小(7例原发肿瘤用于单细胞测序,188例用于生存建模),且研究仅聚焦于B7家族分子,可能未完全涵盖其他免疫相关因素 | 阐明胆囊癌细胞的生物异质性并改进术后风险分层 | 胆囊癌患者肿瘤细胞 | machine learning | gallbladder cancer | scRNA-seq | GBM | gene expression data | 7例原发肿瘤用于单细胞测序,188例手术治疗的胆囊癌患者 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 486 | 2026-07-23 |
CD73high fibroblasts orchestrate keratinocyte inflammation in the psoriasis-associated epithelial immune microenvironment
2026-Apr-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71323-0
PMID:41957361
|
研究论文 | 通过对银屑病患者皮肤进行代谢组学、单细胞和空间转录组学分析,发现CD73高表达的成纤维细胞通过腺苷信号调控角质形成细胞炎症,揭示成纤维细胞-角质形成细胞互作在银屑病发病中的关键作用 | 首次揭示CD73高表达成纤维细胞通过腺苷代谢途径介导成纤维细胞与角质形成细胞间的互作,驱动银屑病上皮免疫微环境炎症,为靶向代谢微环境治疗炎症性皮肤病提供新思路 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,其结论在人体内的普适性及长期临床转化效果仍需进一步验证 | 探究银屑病上皮免疫微环境中代谢失调的免疫机制及下游后果 | 银屑病患者皮肤组织、咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠皮肤炎症模型 | 机器学习 | 银屑病 | 代谢组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 基因敲除, 药理学抑制 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 银屑病患者皮肤组织样本(数量未明确说明),以及咪喹莫特和IL-23A诱导的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序,10x Visium用于空间转录组学分析 |
| 487 | 2026-07-23 |
Impact of OMICS Technologies in Our Understanding of the Pathogenesis of Peri-Implantitis
2026-Apr, Clinical and experimental dental research
IF:1.7Q3
DOI:10.1002/cre2.70350
PMID:41973972
|
综述 | 评估组学技术对理解种植体周围炎发病机制中宿主免疫方面的贡献 | 通过多组学整合分析揭示种植体周围炎作为宿主-微生物分子生态系统的多层特征,并识别出免疫失调、细胞外基质破坏和组织重塑等汇聚通路 | 缺乏大规模队列研究和功能验证,需要更多临床转化支持 | 从宿主免疫角度评估组学技术对理解种植体周围炎发病机制的贡献 | 种植体周围炎的发病机制及其宿主免疫反应 | 机器学习 | 口腔疾病 | 基因组学、表观基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学、RNA测序、单细胞和空间转录组学、多组学 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 488 | 2026-07-23 |
The Evolution of Spatial Omics Technologies Introduces A Novel Avenue for Lung Cancer Research
2026-Mar-27, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag010
PMID:41619173
|
综述 | 综述空间组学技术的发展及其在肺癌研究中的应用,包括肿瘤异质性、进展机制和生物标志物发现 | 系统总结了空间组学技术在肺癌研究中的最新应用,并提出了将空间组学整合到肺癌研究中的策略,为精准医学提供新视角 | 当前空间组学技术仍存在技术限制,如分辨率、通量和数据分析算法的挑战 | 探讨空间组学技术在肺癌研究中的应用,以理解肿瘤生态系统和异质性 | 肺癌肿瘤生态系统,包括肿瘤细胞和微环境 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间组学技术 | NA | 空间组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 489 | 2026-07-23 |
Metabolic RNA Labeling-Enabled Time-Resolved Single-Cell RNA Sequencing
2026-Mar-17, Accounts of chemical research
IF:16.4Q1
DOI:10.1021/acs.accounts.6c00010
PMID:41758996
|
综述 | 本文综述了利用代谢RNA标记实现时间分辨单细胞RNA测序的最新进展,重点讨论了Well-TEMP-seq、scDUAL-seq和Dyna-vivo-seq等方法 | 提出基于大小排阻和局部准静态水动力学的Well-TEMP-seq方法提高了通量和效率;开发scDUAL-seq双核苷酸标记策略同步监测RNA合成与降解;开创体内代谢RNA标记的单细胞RNA测序(Dyna-vivo-seq)研究活体动物模型 | 化学工具在单细胞RNA动力学分析中仍存在局限性,需进一步改善 | 实现单细胞水平时间分辨的RNA动力学分析,揭示异质性和动态基因表达调控 | 单细胞转录组及RNA合成与降解动力学 | 数字病理学 | 不适用 | 代谢RNA标记、单细胞RNA测序 | 不适用 | RNA序列数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA测序 | Well-TEMP-seq, scDUAL-seq, Dyna-vivo-seq | 基于大小排阻和局部准静态水动力学的微孔板平台 |
| 490 | 2026-07-23 |
Tissue-Specific High-Quality Protoplast Isolation for Single-Cell Analyses in Arabidopsis
2026-02-06, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/69330
PMID:41729799
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研究论文 | 提出一套从拟南芥多种组织中高效分离高质量原生质体的方案,为单细胞RNA测序等应用提供可靠细胞来源 | 针对不同组织(地上部分和根)的生理特性,系统优化了酶解消化和纯化步骤,确保原生质体高产且代表多种细胞类型 | NA | 建立一套可重复的原生质体分离方案,支持植物单细胞分析应用 | 拟南芥的叶片、茎、花和根组织 | 数字病理学 | NA | NA | NA | 细胞 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 491 | 2026-07-23 |
CREB5 Inhibits Neuronal Ferroptosis via Transactivating ApoL6 to Regulate Lipid Droplet Metabolism After Spinal Cord Injury
2026-02, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70783
PMID:41700484
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研究论文 | 该研究揭示了转录因子CREB5通过反式激活ApoL6调控脂滴代谢,从而抑制脊髓损伤后神经元铁死亡的分子机制 | 首次发现CREB5通过调控ApoL6的转录活性影响脂滴分解,进而抑制神经元铁死亡,为脊髓损伤治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,在人类患者中的验证尚需进一步探索;部分机制细节如CREB5表达先升后降的调控机制未完全阐明 | 阐明CREB5在脊髓损伤后抑制神经元铁死亡中的分子和细胞机制 | 小鼠脊髓损伤模型及体外原代神经元 | 机器学习和数字病理学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞基因表达数据,单细胞染色质可及性数据 | 小鼠脊髓损伤模型样本及体外原代神经元实验样本(具体数量未明确提及) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序和单细胞ATAC-seq |
| 492 | 2026-07-23 |
Medicinal cannabis plant extract (NTI164) modifies epigenetic, ribosomal, and immune pathways in paediatric acute-onset neuropsychiatric syndrome
2026-Jan, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2025.e00828
PMID:41513541
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研究论文 | 研究药用大麻提取物NTI164对儿科急性发作神经精神综合征(PANS)的表观遗传、核糖体和免疫通路的修饰作用 | 首次通过多组学方法(包括单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学和DNA甲基化分析)揭示NTI164在PANS患儿中调节表观遗传和免疫通路的作用机制 | 开放标签试验且样本量较小(14名儿童),缺乏对照组 | 评估NTI164在慢性复发性PANS患儿中的安全性和疗效,并探索其对表观遗传和免疫通路的生物学效应 | 14名慢性复发性PANS患儿(平均年龄12.1岁,范围4-17岁,71%为男性) | 机器学习和数字病理学 | 儿科急性发作神经精神综合征 | 单细胞RNA测序、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学、DNA甲基化分析 | NA | 转录组、蛋白质组、磷酸蛋白质组和DNA甲基化数据 | 14名慢性复发性PANS患儿(平均年龄12.1岁;范围4-17岁;71%为男性)治疗前后的血液样本 | Illumina | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学 | Illumina NovaSeq | 用于批量及单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸蛋白质组学和DNA甲基化的Illumina NovaSeq测序平台 |
| 493 | 2026-07-23 |
Tfh2 and a subset of Tfh1 cells associate with antibody-mediated immunity to malaria
2025-12-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196828
PMID:41118256
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序和VDJ测序分析疟疾感染中Tfh细胞的异质性,发现Tfh2和部分Tfh1细胞与保护性抗体反应相关 | 首次在人类疟疾感染中揭示Tfh细胞基于CCR7表达的额外异质性,并明确Tfh1-CCR7+和Tfh2亚群与抗体介导免疫的关联 | NA | 研究人类外周血Tfh细胞在疟疾感染中的表型和功能异质性,及其与保护性抗体反应的关系 | 健康个体在控制性人类疟疾感染前后的外周血Tfh细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, 单细胞VDJ测序 | NA | 基因表达数据, 免疫受体序列数据 | 健康个体(具体数量未在摘要中提供) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序和VDJ测序 |
| 494 | 2026-07-23 |
Next-generation immune profiling - beyond blood cancer cells
2025-12, Trends in molecular medicine
IF:12.8Q1
DOI:10.1016/j.molmed.2025.06.004
PMID:40645853
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评论 | 文章讨论了在血液恶性肿瘤诊断中整合下一代免疫分析技术的重要性,以超越传统的癌细胞特征分类 | 提出将免疫微环境分析纳入血液恶性肿瘤诊断分类,并标准化炎症亚型定义 | 未提及具体技术实现细节或临床验证数据 | 强调在血液肿瘤诊断中整合下一代免疫分析技术的必要性 | 血液恶性肿瘤的免疫微环境 | 机器学习 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞测序,空间转录组学,先进流式细胞术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 495 | 2026-07-23 |
Mapping Macrophage Diversity in Coats' Disease: A Lipid-Associated Subset in the Pathogenesis of Exudative Retinopathy
2025-10-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.13.19
PMID:41065482
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序首次描绘Coats病视网膜微环境的细胞图谱,揭示脂质相关巨噬细胞在渗出性视网膜病变发病机制中的关键作用 | 首次构建Coats病视网膜微环境单细胞图谱,鉴定出脂质相关巨噬细胞亚群及其由吞噬向炎症和胞外基质重塑的功能转变,并发现ABCA1为核心的调控模块 | 样本量有限,仅来自一名Coats病患者,且未涉及正常对照视网膜组织 | 探究Coats病渗出性视网膜病变的细胞和分子机制 | Coats病患者及增殖性玻璃体视网膜病变对照患者的视网膜前膜和玻璃体样本中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1例Coats病患者和4例增殖性玻璃体视网膜病变对照患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 496 | 2026-07-23 |
TRAF3IP2-AS1 Deficiency Induces Necroptosis to Promote Pancreatic Cancer Liver Metastasis
2025-09-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4784
PMID:40586914
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研究论文 | 发现TRAF3IP2-AS1缺失通过诱导坏死性凋亡促进胰腺癌肝转移,并揭示了其分子机制及免疫抑制微环境形成 | 首次发现长链非编码RNA TRAF3IP2-AS1通过调控MLKL mRNA稳定性和RIPK3磷酸化来抑制坏死性凋亡,并揭示TGFβ1反馈环路在平衡坏死性凋亡中的作用 | 仅使用患者来源类器官模型和小鼠模型,未在更大样本队列中验证;机制研究主要集中于体外实验 | 探究TRAF3IP2-AS1在胰腺癌肝转移中的作用及分子机制 | 胰腺导管腺癌患者样本、患者来源类器官、TGFβ1条件性敲除小鼠模型 | 分子生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、条件性基因敲除小鼠模型 | NA | 基因表达数据、组织图像 | 未明确说明样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium用于单细胞RNA测序 |
| 497 | 2026-07-23 |
Tumor-Specific MHC-II Activates CD4+ and CD8+ T Cells in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma to Boost Immunotherapy Efficacy
2025-09-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4383
PMID:40540325
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和T细胞受体测序,揭示肿瘤特异性MHC-II通过激活CD4+和CD8+ T细胞增强头颈鳞癌免疫治疗效果 | 首次鉴定肿瘤特异性MHC-II作为头颈鳞癌新辅助免疫治疗的优越预测标志物,并阐明其通过诱导趋化因子CCL5招募T细胞、激活Th1免疫应答及依赖CD4+ T细胞抑制肿瘤生长的机制 | NA | 探究肿瘤特异性MHC-II在头颈鳞癌新辅助免疫治疗中的作用机制及其作为生物标志物的价值 | 头颈鳞癌患者肿瘤组织样本 | 数字病理学 | 头颈鳞癌 | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | 基因表达数据, T细胞受体序列 | II期新辅助免疫治疗临床试验前的头颈鳞癌活检样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 498 | 2026-07-23 |
Pan-Cancer Spatial Profiling Reveals Conserved Subtypes and Niches of Cancer-Associated Fibroblasts
2025-07-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-2181
PMID:40440095
|
研究论文 | 通过跨癌症类型的空间多组学数据,识别出四种保守的癌症相关成纤维细胞亚型及其空间生态位 | 利用空间邻近信息进行癌症相关成纤维细胞亚型的从头发现,而非依赖单细胞转录组学的标记物方法,建立了空间环境与成纤维细胞身份之间的关联 | NA | 以系统级视角解析肿瘤微环境中的基质异质性,并定义癌症相关成纤维细胞的空间分类 | 多种癌症类型中的癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞空间多组学 | NA | 空间多组学数据 | 涉及多种癌症类型和平台的数据集 | 10x Genomics | 单细胞空间转录组学 | 10x Visium | 单细胞空间多组学平台 |
| 499 | 2026-07-23 |
Allergen induces pulmonary neuroendocrine cell hyperplasia in a model of asthma
2025-07-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.187018
PMID:40626365
|
研究论文 | 该文章研究在哮喘模型中发现过敏原可诱导肺部神经内分泌细胞增生 | 首次揭示在成年小鼠气道中,过敏原(屋尘螨)通过抑制Notch信号通路诱导PNEC增生,且PNEC增生来源于现有PNEC增殖和Club细胞转分化 | 未明确说明 | 探究过敏原诱导的肺部神经内分泌细胞(PNEC)在哮喘反应中的调控机制 | 成年小鼠气道中的肺部神经内分泌细胞(PNEC) | 机器学习 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型(具体数量未明确) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台 |
| 500 | 2026-07-23 |
Early multiple sclerosis activity associated with TBX21+CD21loCXCR3+ B cell expansion resembling EBV-induced phenotypes
2025-06-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.188543
PMID:40359016
|
研究论文 | 该研究分析了早期多发性硬化患者外周血B细胞的单细胞表达,发现TBX21+CD21loCXCR3+ B细胞扩增与EB病毒诱导的表型相似,并与早期疾病活动相关 | 首次通过单细胞RNA测序和流式细胞术证实非典型B细胞(ABCs)在早期多发性硬化患者中显著富集,并发现其炎性反应与EB病毒相关,但并非直接感染 | 未检测到ABCs直接感染EB病毒,且样本量可能有限;研究仅关注早期MS患者,无法推广至所有病程阶段 | 探究EB病毒感染在多发性硬化发病中的致病机制,特别是B细胞的作用 | 早期多发性硬化患者的外周血B细胞,包括CD19+CD20+CD21loCD11c+T-bet+非典型B细胞 | 计算机视觉 | 多发性硬化 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | 单细胞表达数据 | 来自免疫耐受网络STAyCIS试验的纵向早期MS患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |