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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4921 | 2025-10-30 |
Primed human pluripotent stem cell-derived blastocyst-like cell aggregates with partial lineage specification
2025-Dec, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.10.007
PMID:41142457
|
研究论文 | 本研究开发了一种从primed人多能干细胞直接生成人类囊胚样细胞聚集体的方法 | 使用热响应水凝胶直接从primed hPSCs生成囊胚样细胞聚集体,避免了传统方法对naïve hPSCs的依赖 | 相当比例的细胞仍保持未分化状态,未完全实现谱系特化 | 建立更易操作的人类早期发育研究模型 | primed人多能干细胞衍生的囊胚样细胞聚集体 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序,免疫细胞化学,体外植入实验 | NA | 图像,转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4922 | 2025-10-30 |
Multi-omics and experimental validation unveil BDNF as a diagnostic biomarker and therapeutic target in endoplasmic reticulum stress-driven lung adenocarcinoma: Therapeutic potential of Esketamine
2025-Dec, Oncology letters
IF:2.5Q3
DOI:10.3892/ol.2025.15336
PMID:41158314
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证发现BDNF可作为内质网应激驱动肺腺癌的诊断生物标志物和治疗靶点,并证实Esketamine的治疗潜力 | 首次将BDNF鉴定为内质网应激相关基因在肺腺癌中的关键作用因子,并验证Esketamine通过抑制BDNF表达对肺腺癌的治疗效果 | 研究主要基于体外细胞实验(A549和BEAS-2B细胞),缺乏体内动物模型验证 | 探索BDNF在肺腺癌中的潜在功能并验证BDNF相关药物Esketamine的治疗应用潜力 | 肺腺癌(LUAD)细胞系A549和正常肺上皮细胞BEAS-2B | 生物信息学与肿瘤学研究 | 肺腺癌 | 多组学整合分析,单细胞转录组分析,批量RNA-seq,机器学习,孟德尔随机化分析,RT-qPCR,siRNA干扰,CCK-8检测,克隆形成实验,分子对接,Transwell实验,伤口愈合实验,TUNEL检测,Western blotting | 预测模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,实验数据 | 67个内质网应激相关基因,两种细胞系(A549和BEAS-2B) | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 4923 | 2025-10-30 |
Immune cell involvement in ulcer repair in radiation esophagitis and its role in the TGF-β1/p38MAPK/FN axis (Review)
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2904
PMID:41158707
|
综述 | 探讨TGF-β1/p38MAPK/FN信号轴与免疫细胞在放射性食管炎溃疡修复中的作用机制 | 阐明TGF-β1/p38MAPK/FN信号轴在放射性食管炎中的双重作用及免疫细胞与信号轴的复杂互作关系 | 放射性食管炎病理过程复杂,限制了人们对信号轴如何精确调控不同修复阶段免疫细胞及其特性与互作的理解 | 探索放射性食管炎溃疡修复机制 | TGF-β1/p38MAPK/FN信号轴和免疫细胞(巨噬细胞、T细胞、树突状细胞) | 病理机制研究 | 放射性食管炎 | 多组学技术、单细胞测序技术 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4924 | 2025-10-30 |
pQTL Mendelian randomization analysis combined with single-cell sequencing to identify biomarkers and drug targets for bladder cancer
2025-Dec, Molecular and clinical oncology
IF:1.4Q4
DOI:10.3892/mco.2025.2901
PMID:41158706
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研究论文 | 通过pQTL孟德尔随机化分析和单细胞测序技术识别膀胱癌的生物标志物和药物靶点 | 结合孟德尔随机化分析与单细胞测序技术识别膀胱癌新型生物标志物ATRAID和TRIM25 | NA | 发现膀胱癌的新型生物标志物和药物靶点 | 膀胱癌相关基因和细胞类型 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 孟德尔随机化分析,单细胞测序,qPCR | 诺莫图模型 | 基因表达数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4925 | 2025-10-30 |
The spatial and temporal activation of macrophages during fibrosis
2025-Nov, Nature reviews. Immunology
DOI:10.1038/s41577-025-01186-x
PMID:40467841
|
综述 | 本文探讨巨噬细胞在纤维化过程中的时空激活机制及其治疗潜力 | 提出解释巨噬细胞跨时空调控组织纤维化的新模型,并整合单细胞转录组学揭示的巨噬细胞异质性新发现 | NA | 阐明巨噬细胞在纤维化过程中的时空调控机制 | 人类和小鼠组织中的巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 纤维化疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4926 | 2025-10-30 |
Utilizing CRISPR-Cas13d-knockdown in zebrafish to study a rare monogenic bone fragility syndrome
2025-Nov, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf153
PMID:41143154
|
研究论文 | 利用CRISPR-Cas13d基因敲降技术研究斑马鱼中罕见单基因骨脆性综合征的分子机制 | 首次应用新型CRISPR-Cas13d基因敲降技术建立斑马鱼疾病模型研究CDL综合征 | 研究仅关注胚胎和早期幼体阶段,未涉及成年期表型分析 | 探究SMS2基因功能及CDL骨脆性综合征的分子机制 | 斑马鱼胚胎和幼体 | 基因功能研究 | 骨质疏松症 | CRISPR-Cas13d基因敲降,单细胞RNA测序,原位杂交 | 斑马鱼疾病模型 | 基因表达数据,表型图像 | 野生型和基因敲降斑马鱼胚胎及幼体 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4927 | 2025-10-30 |
Cuproptosis-Related Ferroptosis Gene Signature: A Prognostic Tool for Colon Cancer Patients
2025-Nov, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/cnr2.70372
PMID:41152153
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研究论文 | 基于铜死亡相关铁死亡基因构建结肠癌预后预测模型 | 首次整合铜死亡和铁死亡两种程序性细胞死亡机制构建结肠癌预后特征模型 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 构建结肠腺癌预后预测模型并评估其与免疫浸润的关系 | 结肠腺癌患者 | 生物信息学 | 结肠癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 免疫组化, RT-PCR | LASSO算法, Cox回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的结肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4928 | 2025-10-30 |
IL4/IL13 inhibition via dupilumab reduces malignant T cell proliferation and promotes antitumor immunity in Sezary syndrome
2025-Oct-29, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0677
PMID:41159943
|
研究论文 | 本研究探讨了dupilumab通过抑制IL4/IL13通路在Sezary综合征中的抗肿瘤作用机制 | 首次使用单细胞RNA测序结合T细胞免疫组库分析揭示dupilumab在SS治疗中的分子机制,证明其比单独阻断IL4或IL13更有效抑制恶性淋巴细胞增殖 | 研究样本量有限,主要基于体外实验和患者特异性转录变化分析 | 评估dupilumab在Sezary综合征中的治疗潜力及其对肿瘤微环境的影响 | Sezary综合征患者的恶性T淋巴细胞、反应性T淋巴细胞、单核细胞和树突状细胞 | 单细胞测序分析 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序,T细胞免疫组库分析 | NA | 单细胞转录组数据 | Sezary综合征患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4929 | 2025-10-30 |
Dynamic urinary proteomics integrates single-cell and spatial transcriptomics to reveal tumour microenvironment and predict immunotherapy response in biliary tract cancer
2025-Oct-28, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335513
PMID:41151791
|
研究论文 | 本研究通过整合动态尿液蛋白质组学、单细胞转录组学和空间转录组学,揭示胆道癌肿瘤微环境特征并预测免疫治疗反应 | 首次将尿液蛋白质组学应用于免疫肿瘤学,开发了基于4种尿液蛋白的机器学习预测模型,并整合多组学数据揭示肿瘤微环境动态变化 | 样本量相对有限,外部验证队列规模较小(n=24),需要更大规模的前瞻性研究验证 | 建立尿液蛋白质组学作为免疫检查点抑制剂反应预测工具,阐明其与肿瘤动态和肿瘤微环境重塑的关系 | 胆道癌患者 | 生物信息学 | 胆道癌 | 质谱分析, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 机器学习 | 机器学习模型 | 蛋白质组数据, 转录组数据, 空间转录组数据 | 97名初治胆道癌患者的211份尿液样本,11份治疗前肿瘤活检样本的单细胞转录组数据,外加24例独立队列验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 质谱蛋白质组学 | NA | 平行反应监测质谱 |
| 4930 | 2025-10-30 |
Single-cell landscape of mouse lungs exposed to intermittent hypoxia
2025-Oct-28, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03370-y
PMID:41152825
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示间歇性缺氧暴露下小鼠肺组织的细胞景观和分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘间歇性缺氧诱导的肺重构细胞图谱,并发现SP1作为核心调控因子 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究间歇性缺氧诱导肺重构的细胞和分子机制 | 间歇性缺氧暴露的小鼠肺组织 | 单细胞组学 | 阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征 | 单细胞RNA测序 | 计算分析方法 | 单细胞转录组数据 | GSE145435数据集中的小鼠肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4931 | 2025-10-30 |
IFITM3-MET interaction drives osimertinib resistance through AKT pathway activation in EGFR-mutant non-small cell lung cancer
2025-Oct-28, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-025-02493-6
PMID:41152910
|
研究论文 | 本研究揭示了IFITM3-MET相互作用通过激活AKT通路驱动EGFR突变非小细胞肺癌对奥希替尼耐药的新机制 | 首次发现肿瘤微环境细胞因子驱动的IFITM3上调通过与MET相互作用激活AKT通路诱导奥希替尼耐药 | 研究主要基于临床样本和细胞系模型,需要在更大规模临床队列中验证 | 探究EGFR突变非小细胞肺癌对奥希替尼获得性耐药的分子机制 | EGFR突变非小细胞肺癌患者临床样本、PC-9和H1975细胞系、小鼠异种移植瘤模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 转录组学分析、空间转录组学、RNA测序、免疫印迹、质谱蛋白质组学、免疫共沉淀、邻近连接分析、细胞活力检测 | 小鼠异种移植瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据、临床病理数据 | EGFR突变NSCLC患者临床标本和细胞系 | NA | 空间转录组学,RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 4932 | 2025-10-30 |
Identifying the anti-infection NK and T cell subgroups in preterm newborns with sepsis using single-cell RNA-seq analysis
2025-Oct-28, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03272-1
PMID:41152979
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析识别早产新生儿败血症中的抗感染NK和T细胞亚群 | 首次在早产儿败血症中鉴定出具有增强免疫调节活性的特定T细胞和NK细胞亚群及其关键调控因子 | 数据来源于公共数据库,样本量有限,需要进一步实验验证 | 探索免疫细胞在早产儿败血症中的抗感染作用 | 早产新生儿晚发型败血症患者 | 单细胞转录组学 | 败血症 | 单细胞RNA测序 | Seurat, harmony, SCENIC | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4933 | 2025-10-30 |
Resolving intra-tumor heterogeneity and clonal evolution of core-binding factor acute myeloid leukemia patients with single-cell resolution
2025-Oct-28, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00718-4
PMID:41152985
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量DNA测序数据解析核心结合因子急性髓系白血病的肿瘤内异质性和克隆演化 | 开发了将亚克隆体细胞拷贝数变异整合到系统发育树和克隆演化分析的方法,在单细胞水平证明融合基因是白血病发生的最早期事件 | 样本量有限(8例初诊患者和3例化疗后患者) | 解析肿瘤内异质性和克隆演化,识别化疗耐药机制 | 核心结合因子急性髓系白血病患者 | 单细胞基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞DNA测序,批量DNA测序 | 系统发育树分析 | DNA测序数据 | 8例初诊患者和3例化疗后患者 | NA | 单细胞DNA测序,批量DNA测序 | NA | NA |
| 4934 | 2025-10-30 |
Panmim: a resource of pan-cancer metastasis immune microenvironment
2025-Oct-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06484-5
PMID:41152997
|
研究论文 | 开发了一个名为Panmim的整合资源,用于研究转移性肿瘤的免疫微环境 | 构建了首个专注于癌症转移免疫微环境的综合数据库,整合了90个单细胞RNA-seq数据集 | 数据库资源仍需不断扩展和更新,当前仅包含特定类型和部位的转移癌数据 | 研究癌症转移过程中的免疫微环境特征和分子机制 | 转移性癌症的单细胞RNA-seq数据,涵盖14个转移部位和36种原发癌类型 | 生物信息学 | 癌症转移 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA-seq数据 | 90个单细胞RNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4935 | 2025-10-30 |
Unveiling metabolic pathway dysregulation in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer: a single-cell analysis of epithelial cell trajectories
2025-Oct-27, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000003859
PMID:41159285
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示结直肠癌发展过程中上皮细胞代谢通路失调和细胞通讯变化 | 首次在单细胞水平构建结直肠癌上皮细胞分化轨迹,揭示脂肪酸和胆汁酸代谢通路失调与乳酰化修饰在癌变过程中的关键作用 | 研究样本量有限,需要更大队列验证发现;机制研究主要基于计算推断,需要实验验证 | 探究结直肠癌发展过程中代谢通路重编程和细胞通讯变化机制 | 正常结肠组织、息肉组织和结直肠癌组织中的上皮细胞 | 数字病理 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | 轨迹分析,细胞通讯分析,调控网络分析 | 单细胞转录组数据 | 包含正常、息肉和肿瘤结肠组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4936 | 2025-10-30 |
Interrogation of the cellular hierarchies reveals neoplastic evolution and therapeutic vulnerability in craniopharyngioma
2025-Oct-24, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf249
PMID:41159376
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示颅咽管瘤的细胞层级结构和肿瘤演化过程 | 首次在单细胞和空间水平揭示颅咽管瘤的肿瘤编程和演化,识别出PCP和RCC之间的疾病谱系连续性 | 研究样本数量有限,动物模型结果需要进一步临床验证 | 阐明颅咽管瘤的发病机制和肿瘤演化过程 | 颅咽管瘤(包括ACP、PCP亚型)和Rathke裂囊肿 | 数字病理学 | 颅咽管瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多重免疫组化,离体垂体培养 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,组织学图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 4937 | 2025-10-30 |
Heterochronic transcription factor expression drives cone-dominant retina development in 13-lined ground squirrels
2025-Oct-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.25.650540
PMID:40654702
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了13线地松鼠视锥细胞优势视网膜发育的分子机制 | 发现视锥细胞不仅来源于早期神经源性祖细胞,还来源于晚期神经源性祖细胞,这一过程由转录因子表达的异时性转变驱动 | 研究仅针对13线地松鼠,未在其他物种中验证 | 探索视锥细胞优势视网膜发育的调控机制 | 13线地松鼠视网膜发育过程 | 发育生物学 | 视力障碍 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4938 | 2025-10-30 |
Enhanced RNA Preservation in Mouse Brain Tissue: A Strategy Combining Cardiac Perfusion with Hypersaline Immersion
2025-Oct-21, ACS omega
IF:3.7Q2
DOI:10.1021/acsomega.5c05379
PMID:41141763
|
研究论文 | 开发了一种结合心脏灌注和高渗盐水浸泡的策略,用于增强小鼠脑组织RNA保存效果 | 首次将心脏灌注与高渗盐水浸泡相结合,建立了标准化的RNA保存框架,显著延长了RNA在组织切片中的完整性保持时间 | 仅在小鼠脑组织中验证,未在其他组织类型或物种中测试 | 解决空间转录组学研究中RNA降解问题,建立标准化的RNA保存方法 | 小鼠脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,RNA完整性检测 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4939 | 2025-10-30 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal intratumor heterogeneity and immune evasion in natural killer/T cell lymphoma
2025-Oct-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113626
PMID:41142990
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学揭示自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和免疫逃逸机制 | 首次在NKTCL中鉴定出五个具有不同功能通路、分化轨迹和空间分布的恶性元程序亚群,并发现FABP5抑制剂可下调c-Myc抑制肿瘤生长 | NA | 探究自然杀伤/T细胞淋巴瘤的肿瘤内异质性和肿瘤微环境相互作用 | 自然杀伤/T细胞淋巴瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4940 | 2025-10-30 |
Deciphering the cellular tumor microenvironment landscape in salivary gland carcinomas using multiplexed imaging mass cytometry
2025-Oct-13, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03551-z
PMID:41083996
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研究论文 | 利用多重成像质谱流式技术解析唾液腺癌肿瘤微环境的细胞景观 | 首次在唾液腺癌中应用13标志物成像质谱流式技术进行空间单细胞分析,发现基质癌相关成纤维细胞(mCAF)与内皮细胞的空间相互作用与转移相关 | 样本量相对有限(54例),空间转录组数据仅包含3例病例 | 空间表征唾液腺癌单细胞肿瘤微环境并鉴定预后生物标志物 | 唾液腺癌患者组织样本,包括唾液腺导管癌、腺泡细胞癌、黏液表皮样癌和分泌性癌 | 数字病理 | 唾液腺癌 | 成像质谱流式技术,空间转录组学,RNA测序 | CAF算法,空间分析,Cox回归分析 | 多通道图像数据,单细胞数据,RNA测序数据 | 54例原发灶和淋巴结转移病例,验证队列包含67例唾液腺导管癌病例 | NA | 成像质谱流式,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | 13标志物成像质谱流式面板 |