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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2026-01-25 |
AugGCL: Multimodal graph learning for spatial transcriptomics analysis with enhanced gene and morphological data
2026-Jan-23, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013912
PMID:41576146
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研究论文 | 本文提出了一种名为AugGCL的增强图卷积学习框架,用于空间转录组学分析,通过整合基因和形态学数据来改善空间结构解码和基因表达重建 | AugGCL引入了邻域信息聚合机制和双流加权图卷积网络,结合表达相似性和空间邻近性构建加权图,并利用图像感知辅助重建增强弱空间信号和锐化边界 | NA | 解决空间转录组学中由于表达稀疏性、复杂组织结构和弱空间信号导致的空间域重建挑战 | 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和小鼠胚胎的空间转录组学数据集 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图卷积网络 | 基因表达数据和图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 462 | 2026-01-25 |
Development of an in situ small intestinal injection technique for targeted macromolecule delivery and in vivo functional studies in mice
2026-Jan-23, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70123
PMID:41577652
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研究论文 | 本研究开发了一种小鼠小肠原位注射技术,用于靶向大分子递送和体内功能研究 | 提出了一种微创、原位的小肠注射技术,能够绕过胃部屏障,实现局部腔内递送,避免了传统口服灌胃导致的大分子降解问题 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在更大动物或人体中验证;长期效应和潜在并发症需进一步评估 | 开发一种靶向递送生物大分子至小肠的技术,并评估其在生理环境中的功能应用 | 小鼠小肠,特别是十二指肠区域 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据,组织病理学图像 | 小鼠模型,具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 463 | 2026-01-25 |
Chemically guided single-cell transcriptomics reveals sulfotransferase-mediated scaffold remodeling in securinine biosynthesis
2026-Jan-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-68816-3
PMID:41577683
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研究论文 | 本研究结合化学逻辑、稳定同位素标记喂养实验和单细胞转录组学,揭示了Flueggea suffruticosa中一叶萩碱生物合成的核心途径,并发现磺基转移酶在支架重塑中的新作用 | 揭示了磺基转移酶作为支架重塑关键介导者的非传统生物合成角色,而非常规的修饰酶 | NA | 阐明一叶萩碱生物合成的核心途径 | Flueggea suffruticosa植物中的一叶萩碱生物合成 | 单细胞转录组学 | NA | 稳定同位素标记喂养实验,单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 464 | 2026-01-25 |
An integrated single-cell lung cancer atlas reveals distinct fibroblast phenotypes between adenocarcinoma and squamous cell carcinomas
2026-Jan-23, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-026-01279-3
PMID:41577803
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研究论文 | 本文通过整合公开可用的单细胞RNA测序数据,构建了一个非小细胞肺癌的单细胞图谱,揭示了肺腺癌和肺鳞状细胞癌之间肿瘤微环境异质性和细胞组成的差异,特别是癌症相关成纤维细胞亚型的显著不同 | 首次大规模整合单细胞RNA测序数据,系统比较了肺腺癌和肺鳞状细胞癌中癌症相关成纤维细胞亚型的差异,并通过共培养实验验证了不同肺癌细胞对成纤维细胞表型的诱导作用 | 研究依赖于公开数据集,可能受数据质量和批次效应影响;共培养实验可能无法完全模拟体内复杂的肿瘤微环境 | 探究非小细胞肺癌中肿瘤微环境的异质性,特别是癌症相关成纤维细胞亚型在肺腺癌和肺鳞状细胞癌中的差异及其与预后的关系 | 非小细胞肺癌组织样本,包括肺腺癌和肺鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2026-01-25 |
LMTK3 regulates breast cancer angiogenesis via a context-dependent mesenchymal-epithelial transition program
2026-Jan-23, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01001-2
PMID:41577842
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研究论文 | 本文揭示了LMTK3通过调控间充质-上皮转化程序在乳腺癌血管生成中的关键作用 | 发现了LMTK3在乳腺癌血管生成中的“辛普森悖论”现象,即在间充质样三阴性乳腺癌中促进血管生成,而在管腔样细胞中抑制血管生成 | 研究主要基于细胞模型和单细胞测序数据,缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 | 探索乳腺癌血管生成的上游分子调控机制 | 乳腺癌细胞,特别是三阴性乳腺癌和管腔样乳腺癌细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 466 | 2026-01-25 |
BMP6 as a therapeutic target for preeclampsia: enhancing trophoblast invasion and vascular mimicry
2026-Jan-23, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-025-06040-w
PMID:41577865
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研究论文 | 本研究探讨了BMP6在子痫前期(PE)中的作用机制,发现其通过ID1介导的SERPINE2和PlGF上调促进滋养细胞侵袭和血管拟态,并验证了早期补充BMP6在PE大鼠模型中的治疗潜力 | 首次揭示了BMP6通过ID1-SERPINE2/PlGF轴调控滋养细胞侵袭和血管拟态的具体分子机制,并证明早期BMP6补充可缓解PE表型 | 研究主要基于体外细胞模型和大鼠模型,人类临床样本验证有限,且BMP6在PE中的长期安全性和最佳治疗窗口需进一步探索 | 阐明BMP6在子痫前期发病中的作用机制并探索其治疗潜力 | 人类滋养细胞(原代细胞和HTR8/SVneo细胞系)、人类胎盘组织、Ad Flt1诱导的PE大鼠模型 | 生殖医学与病理学 | 子痫前期 | RNA-seq, scRNA-seq, 腺病毒载体技术 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、生理表型数据 | 未明确样本数量,包括人类滋养细胞、胎盘组织及PE大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 467 | 2026-01-25 |
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Jan-23, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02454-1
PMID:41578023
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研究论文 | 本研究构建了一个整合了转录组和染色质可及性数据的人类视网膜单细胞图谱 | 整合了多模态(转录组和染色质可及性)、多供体、多实验室的数据,创建了迄今为止最全面的人类视网膜细胞图谱,并鉴定了超过130种细胞类型 | 未在摘要中明确说明 | 创建全面的人类视网膜细胞参考图谱,以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 约390万个细胞,来自125名具有不同祖先背景的供体 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 468 | 2026-01-25 |
Aberrant cellular communities underlying disease heterogeneity in chronic obstructive pulmonary disease
2026-Jan-23, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02480-z
PMID:41578022
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序分析了141名参与者的肺组织,揭示了慢性阻塞性肺疾病(COPD)的细胞组成变化和疾病异质性,并识别了与疾病进展相关的细胞状态和生物标志物 | 首次在COPD中大规模应用单核RNA测序结合空间转录组学,系统揭示了疾病异质性的细胞群落基础,并发现了与疾病进展动态相关的上皮再生状态和炎症/纤维化状态 | 研究主要基于组织样本,未涉及疾病早期或不同治疗阶段的动态变化;样本量虽大但可能无法覆盖所有COPD亚型 | 研究慢性阻塞性肺疾病(COPD)的临床和分子异质性,揭示其潜在的细胞群落变化 | 141名研究参与者的肺组织样本(1,516,727个细胞核) | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单核RNA测序,空间转录组学,蛋白质组学分析 | 聚类分析,细胞通讯网络分析 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,蛋白质组数据 | 141名参与者,1,516,727个细胞核 | NA | 单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 469 | 2026-01-25 |
Histone demethylase KDM7A negatively regulates fibrotic macrophage polarization and lung fibrosis progression
2026-Jan-23, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-026-09610-1
PMID:41578150
|
研究论文 | 本文揭示了组蛋白去甲基化酶KDM7A通过调控TLR8表达来抑制促纤维化巨噬细胞极化,从而限制肺纤维化进展的表观遗传机制 | 首次发现KDM7A-TLR8轴作为抑制促纤维化巨噬细胞极化的关键表观遗传调控通路,并揭示其与年龄相关表达下降的临床关联 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证相对有限;性别差异的机制尚未完全阐明 | 探究表观遗传机制在调控巨噬细胞极化及肺纤维化进展中的作用 | 巨噬细胞、Kdm7a基因敲除小鼠、肺纤维化患者的肺组织 | 表观遗传学 | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、组织样本 | Kdm7a敲除小鼠及对照小鼠、肺纤维化患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 470 | 2026-01-25 |
zDUR: reference-free FASTQ compressor with high compression ratio and speed
2026-Jan-23, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06364-1
PMID:41578172
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为zDUR的无参考FASTQ压缩器,旨在高效处理多平台和测序数据类型的下一代测序数据 | zDUR在压缩比和速度之间实现了良好的整体平衡,特别是在单细胞RNA-seq和空间转录组学数据集上,相比现有先进压缩器SPRING,运行时性能提升超过十倍,同时保持更高的压缩比 | NA | 开发一种高效、可扩展的无参考FASTQ压缩器,以减轻高通量测序数据存储和传输的负担 | FASTQ数据,包括核苷酸序列、质量分数和读取标识符 | 机器学习 | NA | 高通量测序 | NA | FASTQ文件 | 15个代表性数据集,涵盖四种测序数据类型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 471 | 2026-01-25 |
Integrative microRNA and transcriptome analysis reveals sex-specific molecular divergence in human bladder cancer
2026-Jan-23, Biology of sex differences
IF:4.9Q1
DOI:10.1186/s13293-026-00829-5
PMID:41578372
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研究论文 | 本研究通过整合miRNA和转录组分析,揭示了膀胱癌中性别特异的分子差异及其调控机制 | 首次系统性地结合bulk mRNA、microRNA表达、生存模型和单细胞转录组分析,识别了性别特异的miRNA-mRNA调控对,并揭示了这些特征与生存率的性别依赖性关联 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性验证;单细胞分析样本量有限,可能影响统计效力 | 旨在识别膀胱癌中性别特异的分子特征和调控相互作用,以解释性别差异的生物学机制 | 人类膀胱癌组织样本,包括男性和女性患者的数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | bulk mRNA表达分析,microRNA表达分析,单细胞RNA-seq | 差异表达分析,生存分析(Kaplan-Meier和Cox模型),相关性分析 | 基因表达数据,生存数据,单细胞转录组数据 | 数据来源于TCGA、GEO和GSA数据库,具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2026-01-25 |
Defining the cellular and molecular identities of histologic subtypes in lung adenocarcinoma
2026-Jan-23, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00740-6
PMID:41578368
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析,揭示了肺腺癌不同组织学亚型的细胞和分子特征,特别是实体亚型中的免疫抑制微环境 | 首次整合单细胞转录组学和空间信息,识别出组织学亚型特异的癌细胞亚群和免疫抑制表型,并发现HMGA1作为实体亚型的潜在生物标志物和治疗靶点 | 样本量相对较小(18例患者),且仅针对初治肺腺癌,可能无法完全代表所有临床情况 | 探究肺腺癌组织学亚型的细胞和分子基础,以理解疾病异质性和开发亚型特异性治疗策略 | 肺腺癌患者肿瘤组织中的细胞,包括癌细胞和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),空间转录组学分析 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | 18例初治肺腺癌患者,共117,266个细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组平台 |
| 473 | 2026-01-25 |
Hepatic adaptation to chronic metabolic stress primes tumorigenesis
2026-Jan-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.11.031
PMID:41435820
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研究论文 | 本研究通过跨物种纵向单细胞多组学分析,揭示了慢性代谢压力如何驱动肝细胞功能失调并促进肿瘤发生 | 开发了整合计算方法识别并实验验证了调控肝细胞功能平衡和增殖的主调控因子,通过空间转录组学揭示了空间结构化的多细胞群落和信号相互作用 | 未明确提及具体样本量或技术平台的详细配置信息 | 探究慢性代谢压力对肝细胞功能的影响及其与肿瘤发生的关系 | 肝细胞 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 | 单细胞多组学,空间转录组学 | 整合计算方法,地理回归模型 | 单细胞多组学数据,空间转录组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学,空间转录组学 | NA | NA |
| 474 | 2026-01-25 |
Lenvatinib plus transarterial chemoembolization and PD-1 inhibitors as conversion therapies for unresectable intermediate-advanced hepatocellular carcinoma: a phase 2 trial and exploratory biomolecular study
2026-Jan-22, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02498-z
PMID:41565617
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研究论文 | 本研究是一项前瞻性II期多中心临床试验,评估了Lenvatinib联合TACE和PD-1抑制剂(LEN-TAP方案)对比单独TACE作为转化疗法治疗不可切除的中晚期肝细胞癌的疗效和安全性 | 首次在前瞻性II期试验中系统评估了Lenvatinib、TACE和PD-1抑制剂三联方案作为转化疗法的疗效,并通过单细胞测序和流式细胞术探索了循环HLA-DR+CD38+CD8+ T细胞作为潜在生物标志物的价值 | 研究为II期试验,样本量相对有限(142例),需要更大规模的III期试验验证;LEN-TAP组3级治疗相关不良事件发生率较高(60.6%) | 评估LEN-TAP方案作为转化疗法治疗不可切除肝细胞癌的疗效和安全性,并探索相关生物标志物 | 不可切除的中晚期肝细胞癌患者 | 临床肿瘤学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序, 流式细胞术 | NA | 临床数据, 单细胞测序数据, 流式细胞术数据 | 142例符合条件的患者(LEN-TAP组71例,TACE单药组71例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 475 | 2026-01-25 |
IGSF11-VISTA is a critical and targetable immune checkpoint axis in diffuse midline glioma
2026-Jan-22, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.12.020
PMID:41576930
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了弥漫性中线胶质瘤中IGSF11-VISTA免疫检查点轴的关键作用,并证明靶向该轴可抑制肿瘤生长并延长生存期 | 首次在弥漫性中线胶质瘤中识别出IGSF11-VISTA这一空间分布特异的免疫检查点轴,并证明其靶向治疗潜力,尤其强调了小胶质细胞介导的局部脑免疫反应,而非T细胞浸润 | 研究主要基于患者样本和实验小鼠模型,临床转化效果需进一步验证,且未详细探讨其他潜在免疫检查点的协同作用 | 探究弥漫性中线胶质瘤中免疫细胞与肿瘤细胞的空间相互作用,并识别可靶向的免疫治疗新靶点 | 弥漫性中线胶质瘤患者样本和实验小鼠模型 | 数字病理学 | 弥漫性中线胶质瘤 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 高维成像 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据, 成像数据 | 患者样本和实验小鼠模型 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 476 | 2026-01-25 |
Armored macrophage-targeted CAR-T cells reset and reprogram the tumor microenvironment and control metastatic cancer growth
2026-Jan-22, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.12.021
PMID:41576929
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研究论文 | 本研究介绍了一种表达IL-12的CAR-T细胞,靶向FOLR2或TREM2以耗竭促肿瘤的肿瘤相关巨噬细胞并重编程肿瘤微环境,从而在转移性卵巢癌和肺癌模型中显著提高生存率 | 创新点在于开发了IL-12装甲的、靶向巨噬细胞的CAR-T细胞,能够重塑肿瘤微环境并激活内源性抗肿瘤免疫反应,揭示了IL-12-FAS轴的作用机制 | NA | 研究目的是开发一种针对实体瘤肿瘤微环境的CAR-T细胞疗法,以克服免疫抑制并控制转移性癌症生长 | 研究对象包括转移性卵巢癌和肺癌模型中的肿瘤相关巨噬细胞和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肺癌, 卵巢癌 | 空间转录组学 | CAR-T细胞 | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 477 | 2026-01-25 |
Fibroblasts of disparate developmental origins harbor anatomically variant scarring potential
2026-Jan-22, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.12.014
PMID:41576949
|
研究论文 | 本研究通过小鼠伤口模型和单细胞RNA测序,揭示了不同发育来源的成纤维细胞在瘢痕形成潜力上的解剖学差异,并发现了ROBO2-EID1-EP300信号通路在面部伤口愈合中的关键作用 | 首次将神经嵴来源的面部成纤维细胞与其他部位成纤维细胞进行比较,识别出Robo2和Eid1基因表达差异,并通过抑制EP300组蛋白乙酰转移酶活性,成功在背部伤口中模拟面部愈合以减少瘢痕形成 | 研究基于小鼠模型,结果在人类中的适用性尚需进一步验证;未全面探索其他潜在信号通路或细胞类型在瘢痕形成中的作用 | 探究成纤维细胞异质性对伤口愈合和瘢痕形成的影响,并开发减少瘢痕形成的治疗策略 | 小鼠不同解剖部位(面部、头皮、腹侧、背侧)的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 皮肤瘢痕 | 单细胞RNA测序,转基因技术,小分子抑制剂 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 478 | 2026-01-25 |
Evaluation of statistical differential analysis methods for identification of senescent cells using single-cell transcriptomics
2026-Jan-22, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2025.101264
PMID:41576958
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研究论文 | 本研究系统评估了Seurat包中10种差异基因表达分析方法在单细胞转录组数据中识别衰老细胞的性能 | 首次系统比较了Seurat包中多种DGE方法在单细胞转录组数据中的表现,特别关注衰老细胞识别场景 | 仅评估了Seurat包内置方法,未涵盖所有可能的DGE工具;模拟数据可能与真实生物复杂性存在差异 | 评估单细胞转录组学中差异基因表达分析方法的性能,以优化衰老细胞识别 | 单细胞RNA测序数据中的衰老细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | 统计模型(包括Wilcoxon、t检验、负二项分布模型等) | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实scRNA-seq数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 479 | 2026-01-25 |
Regional spatial transcriptomics and immune cell profiling in folliculotropic mycosis fungoides
2026-Jan-21, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.12.032
PMID:41577077
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 480 | 2026-01-25 |
Longitudinal Spatial Transcriptomics Reveals the Molecular Dynamics of Pulmonary Artery Remodeling in Pulmonary Arterial Hypertension
2026-Jan-21, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.017
PMID:41577266
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研究论文 | 本研究通过纵向空间转录组学分析,揭示了肺动脉高压中肺动脉重塑的分子动态变化 | 首次对同一PAH患者进行纵向空间转录组学分析,比较了13年间不同时间点的血管病变,识别了严重受影响小肺动脉特有的115基因重塑特征和25基因核心特征 | 仅基于单一患者的样本进行分析,样本量较小,可能限制结果的普遍性 | 揭示肺动脉高压中肺动脉重塑的分子机制和动态变化 | 肺动脉高压患者的肺动脉组织,特别是小(20-500 µm)和大(>500 µm)肺动脉 | 空间转录组学 | 肺动脉高压 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 单一患者,在13年间两个时间点(代表严重和中等重塑)的肺移植样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |