单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 41796 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 441 | 2026-07-25 |
Multi-modal integration of histopathology and transcriptomics reveals STAB1+ macrophage-associated efferocytosis as a suppressive immune mechanism in colon adenocarcinoma
2025-12-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07348-8
PMID:41361444
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 442 | 2025-12-10 |
CXCL12 deficiency promotes colorectal cancer progression and reduces anti-PD-L1 immunotherapy efficacy through MDSC regulation
2025-12-05, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07309-1
PMID:41351014
|
研究论文 | 本研究探讨了CXCL12缺乏如何通过调控髓源性抑制细胞（MDSC）促进结直肠癌进展并降低抗PD-L1免疫疗法的疗效 | 首次将CXCL12缺乏与MDSC调控及抗PD-L1耐药性联系起来，并识别了CPEB3、DDX39B和SIDT2作为结直肠癌的新型生物标志物 | 研究机制仍需进一步深入探索，且临床转化策略有待优化 | 阐明CXCL12缺乏在结直肠癌进展及抗PD-L1免疫疗法耐药性中的作用机制 | 结直肠癌细胞、动物模型以及单细胞转录组数据 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序、体外细胞实验、体内动物实验 | 机器学习方法 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2025-11-04 |
Identification of a CD138-Negative Therapy-Resistant Subpopulation in Multiple Myeloma with Vulnerability to Splicing Factor Inhibition
2025-11-03, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-24-0340
PMID:40890913
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序识别多发性骨髓瘤中CD138阴性的耐药亚群及其对剪接因子抑制的敏感性 | 发现CD138阴性多发性骨髓瘤细胞中存在耐药亚群，并首次揭示该亚群对剪接通路抑制具有特异性脆弱性 | 研究样本量有限，耐药机制需进一步验证 | 探索多发性骨髓瘤治疗抵抗的分子机制 | 从患者骨髓中纯化的原代多发性骨髓瘤细胞 | 单细胞测序 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, VDJ靶向测序, CRISPR/Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing analysis of mouse cochlea identifies a novel proinflammatory CD74+CD14+ macrophage subset in mice with age-related and noise-induced hearing loss
2025-10, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2025.109376
PMID:40743638
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析小鼠耳蜗免疫细胞，发现与年龄相关和噪声性听力损失相关的促炎性CD74+CD14+巨噬细胞亚群 | 首次在年龄相关和噪声性听力损失中鉴定出CD74+CD14+巨噬细胞亚群，并揭示其与螺旋神经节神经元的增强细胞通讯 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究年龄相关和噪声性听力损失中耳蜗免疫微环境的变化 | 小鼠耳蜗免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 445 | 2026-05-12 |
ArchVelo: Archetypal Velocity Modeling for Single-cell Multi-omic Trajectories
2025-Sep-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.14.676182
PMID:41000980
|
研究论文 | 介绍了ArchVelo，一种利用单细胞同时测定的染色质可及性（scATAC-seq）和转录组（scRNA-seq）数据来建模基因调控和推断细胞轨迹的新方法 | 将染色质可及性表示为基因调控程序的集合（原型），并建模其对转录的动态影响，与传统方法相比提高了推理准确性和基因级潜伏时间对齐能力 | NA | 从静态单细胞测量中推断动态细胞过程，建模基因调控并识别细胞轨迹 | 发育中的小鼠大脑、人类造血系统以及响应病毒感染的CD8 T细胞 | 机器学习 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | 原型模型（Archetypal Velocity Model） | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞ATAC测序， 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 446 | 2025-10-06 |
CXCR4-Mediated Chemokine Signaling Orchestrates the Progression of Conjunctival Melanocytic Lesions
2025-08-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.11.23
PMID:40778698
|
研究论文 | 本研究通过转录组分析揭示了CXCR4介导的趋化因子信号通路在结膜黑色素瘤恶性进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统描绘结膜黑色素病变微环境异质性，并证实CXCR4拮抗剂AMD3100通过抑制PI3K/Akt和MEK/ERK通路发挥抗肿瘤作用 | 样本量有限，需要更大规模研究验证临床转化潜力 | 阐明结膜良恶性黑色素病变的微环境差异及趋化因子信号在病变进展中的作用机制 | 结膜黑色素病变组织标本、PIG1黑色素细胞、结膜黑色素瘤细胞系(CRMM1, CRMM2, CM2005.1) | 数字病理学 | 结膜黑色素瘤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 蛋白质印迹法, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 组织图像数据 | 多个细胞系和未明确数量的组织标本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2025-10-06 |
SLC6A6-Mediated Taurine Uptake Sustains Corneal Epithelial Stem/Progenitor Cell Function to Counteract Age-Related Dysfunction
2025-06-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.25
PMID:40478558
|
研究论文 | 本研究揭示了SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及对抗年龄相关功能障碍中的作用 | 首次发现SLC6A6介导的牛磺酸摄取通过Notch1信号通路调控角膜缘干细胞稳态，为年龄相关性角膜疾病提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，需要进一步验证在人类角膜组织中的适用性 | 阐明SLC6A6介导的牛磺酸转运在维持角膜缘干细胞功能及年龄相关性角膜愈合中的作用机制 | C57BL/6J小鼠角膜组织、小鼠角膜上皮干细胞/祖细胞(TKE2细胞) | 干细胞生物学 | 角膜疾病 | 液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)、单细胞RNA测序、定量PCR、免疫荧光染色、转录组分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、代谢物浓度数据 | 小鼠角膜组织样本和TKE2细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 448 | 2025-10-06 |
Insights of immune cell heterogeneity, tumor-initiated subtype transformation, drug resistance, treatment and detecting technologies in glioma microenvironment
2025-06, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.07.033
PMID:39097088
|
综述 | 全面分析胶质瘤微环境中免疫细胞异质性、亚型转化机制及其对化疗耐药和治疗策略的影响 | 系统阐述胶质瘤诱导免疫细胞亚型转化的具体机制，并探索单细胞测序技术在免疫细胞亚型研究中的应用潜力 | NA | 深入理解胶质瘤微环境中免疫细胞的异质性及其在肿瘤进展和治疗中的作用 | 胶质瘤微环境中的中性粒细胞、巨噬细胞、淋巴细胞、髓源性抑制细胞等主要免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2025-05-09 |
BRAF mutation cancer, colorectal cancer, tumor associated lymph node structure and immune microenvironment study: MAPK protein kinase molecular action and SIRPG-CD47 protein signaling pathway
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142191
PMID:40101830
|
研究论文 | 本研究探讨了BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响，特别是对肿瘤相关淋巴结构成熟和功能的影响 | 通过单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析和空间转录组分析，揭示了BRAF突变对T细胞亚群和B细胞亚群的影响，以及其在肿瘤免疫微环境重塑中的作用 | 研究样本量未明确说明，可能影响结果的普遍性 | 系统评估BRAF基因突变对结直肠癌免疫微环境重塑的影响 | 结直肠癌患者的临床样本 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、伪时间轨迹分析、空间转录组分析、免疫组织化学、多重荧光染色技术 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 450 | 2025-10-06 |
SOX4 as a Key Oncogene Driving Tumor Invasion in Retinoblastoma
2025-05-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.5.24
PMID:40402518
|
研究论文 | 本研究探讨SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及其致癌通路机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示SOX4在MKI67+光感受器减少细胞中特异性高表达，并证实其通过Wnt/β-catenin和cyclin D1信号通路驱动肿瘤侵袭 | 研究样本量有限，机制研究主要基于细胞系和动物模型，需要更多临床样本验证 | 探索SOX4在视网膜母细胞瘤侵袭中的作用及分子机制 | 人视网膜组织、眼内和眼外视网膜母细胞瘤样本、RB细胞系(Y79, WERI-RB1)及异种移植模型 | 癌症生物学 | 视网膜母细胞瘤 | RNA-seq, scRNA-seq, siRNA敲除, CCK-8, EdU, 克隆形成, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 细胞功能数据 | 人视网膜组织、RB组织样本及两种RB细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 451 | 2026-07-25 |
Inhibiting BCL2L1 preferentially targets aneuploid cells in acute myeloid leukemia
2025-Jan-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2026083
PMID:42494299
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 452 | 2025-10-07 |
Integrative machine learning approach for identification of new molecular scaffold and prediction of inhibition responses in cancer cells using multi-omics data
2025-01-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf006
PMID:40251828
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和机器学习方法，识别新的分子支架并预测癌细胞中的抑制反应 | 结合机器学习与多组学数据预测药物反应，并采用相似性搜索方法从ChEMBL数据库识别潜在先导化合物 | 研究为计算机模拟分析，尚未进行实验验证 | 开发预测癌症细胞药物抑制反应的方法并识别新的治疗分子 | 癌细胞系和MDM2抑制剂 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 分子对接, 分子动力学 | 机器学习 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2025-10-07 |
Enhancer RNA in cancer: identification, expression, resources, relationship with immunity, drugs, and prognosis
2025-01-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf007
PMID:40285345
|
综述 | 本综述系统阐述了增强子RNA在癌症中的鉴定方法、表达特征、功能机制及其与免疫治疗、药物反应和预后的关联 | 全面整合eRNA在肿瘤免疫微环境重编程中的作用，提出eRNA特征作为免疫治疗反应和化疗耐药性监测的预测生物标志物 | 属于综述性文章，未涉及原始实验数据验证 | 系统总结eRNA在癌症生物学中的调控功能及其临床转化潜力 | 增强子RNA及其在癌症中的调控机制 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞转录组学, 表观基因组整合分析 | NA | 基因组学数据, 转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 表观基因组学 | NA | NA |
| 454 | 2025-10-05 |
A survey of biclustering and clustering methods in clustering different types of single-cell RNA sequencing data
2025-01-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf010
PMID:40795763
|
综述 | 本文系统综述了双聚类和聚类方法在不同类型单细胞RNA测序数据分析中的应用与性能比较 | 首次系统评估5种双聚类和21种聚类方法在10个真实scRNA-seq数据集上的性能，并从六个维度量化数据集特性以推荐最适合的方法 | 仅评估了有限数量的方法（5种双聚类和21种聚类），且仅使用10个公开数据集，可能无法覆盖所有场景 | 评估当前无监督方法在单细胞RNA测序数据分析中的发展现状，总结各方法的优缺点和改进策略 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类方法, 聚类方法 | 基因表达数据 | 10个公开真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 455 | 2025-11-27 |
VARGG: a deep learning framework advancing precise spatial domain identification and cellular heterogeneity analysis in spatial transcriptomics
2025-01-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf018
PMID:41275376
|
研究论文 | 提出VARGG深度学习框架，通过结合视觉Transformer和图神经网络提升空间转录组学中空间域识别精度和细胞异质性分析能力 | 首次将预训练视觉Transformer与图神经网络自编码器结合，利用自注意力机制捕获全局上下文信息，并通过多层门控残差图神经网络和高斯噪声增强特征表示和模型泛化能力 | NA | 开发能够准确识别空间域并分析细胞异质性的深度学习框架 | 人类胶质母细胞瘤、小鼠胚胎、乳腺癌等组织样本 | 空间转录组学 | 胶质母细胞瘤,乳腺癌 | 空间转录组学 | Vision Transformer,图神经网络自编码器 | 空间基因表达数据 | 多个不同规模数据集 | 10x Genomics,其他 | 空间转录组学 | 10x Visium, Slide-seqV2, Stereo-seq, MERFISH | 10x Visium空间转录组平台 |
| 456 | 2025-10-06 |
Clearance of p21 highly expressing senescent cells accelerates cutaneous wound healing
2025-01, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00755-4
PMID:39537987
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术识别伤口愈合过程中p21高表达衰老细胞的作用机制 | 首次发现p21高表达衰老细胞亚群在伤口愈合中的促炎特性及其清除对伤口闭合的加速作用 | 未明确p21高表达衰老细胞的具体来源及其与其他衰老细胞亚群的相互作用机制 | 探究p21高表达衰老细胞在皮肤伤口愈合过程中的功能作用 | 皮肤伤口愈合过程中的衰老细胞亚群 | 空间转录组学 | 皮肤创伤 | Xenium空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium | Xenium空间转录组分析平台 |
| 457 | 2025-10-06 |
Transcriptional reprogramming primes CD8+ T cells toward exhaustion in Myalgic encephalomyelitis/chronic fatigue syndrome
2024-12-10, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2415119121
PMID:39621903
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征中CD8+ T细胞趋向耗竭状态的转录重编程机制 | 首次整合单细胞RNA测序、RNA测序和ATAC测序对ME/CFS患者T细胞亚群进行多组学分析，发现CD8+ T细胞效应记忆亚群的耗竭特征 | 样本量有限，需要更大规模研究验证；未明确T细胞耗竭与疾病症状间的因果关系 | 阐明肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征中T细胞失调的基因调控机制 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征患者的T细胞亚群，特别是CD8+ T细胞和先天T细胞 | 免疫学 | 肌痛性脑脊髓炎/慢性疲劳综合征 | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ATAC-seq, 流式细胞术 | NA | 基因组学数据，表观基因组学数据，蛋白质表达数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 458 | 2024-12-12 |
Rescue of cochlear vascular pathology prevents sensory hair cell loss in Norrie disease
2024-12-03, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2322124121
PMID:39585982
|
研究论文 | 研究通过条件激活β-catenin在血管内皮细胞中的稳定表达，探讨其在Norrie疾病小鼠模型中对耳蜗血管病理和感觉毛细胞损失的修复作用 | 首次证明在耳蜗微血管中，β-catenin是norrin结合内皮细胞表面受体后的主要下游细胞内效应因子，并验证了恢复该信号通路足以防止感觉毛细胞死亡和听力损失 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类中验证 | 探讨Norrie疾病中耳蜗病理的修复机制 | Norrie疾病小鼠模型的耳蜗血管病理和感觉毛细胞损失 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类耳蜗样本 | NA | NA | NA | NA |
| 459 | 2024-11-18 |
Preexisting senescent fibroblasts in the aged bladder create a tumor-permissive niche through CXCL12 secretion
2024-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00704-1
PMID:39251867
|
研究论文 | 研究揭示了衰老膀胱中预先存在的衰老成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 首次揭示了衰老膀胱中p16-sn成纤维细胞通过分泌CXCL12促进肿瘤生长的机制 | 研究主要基于基因修饰小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证 | 探讨衰老如何通过特定机制促进膀胱癌的发生 | 衰老膀胱中的成纤维细胞及其在膀胱癌中的作用 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 基因修饰小鼠模型中的成纤维细胞 | NA | NA | NA | NA |
| 460 | 2025-10-07 |
Brain-wide alterations revealed by spatial transcriptomics and proteomics in COVID-19 infection
2024-11, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-024-00730-z
PMID:39543407
|
研究论文 | 通过空间转录组学和蛋白质组学分析COVID-19感染后全脑范围的分子改变 | 首次结合多种实验和分析方法揭示COVID-19对全脑范围的影响，发现与年龄相关神经退行性疾病重叠的分子通路改变 | 样本量相对有限（总计42例），仅研究严重急性/亚急性COVID-19病例 | 探究SARS-CoV2感染后神经系统症状的病理生理机制 | COVID-19患者和匹配肺部病理对照的尸检脑组织 | 空间生物学 | COVID-19神经系统并发症 | 空间转录组学, 批量基因表达分析, 蛋白质组学 | NA | 转录组数据, 蛋白质组数据 | 42例尸检脑组织（COVID-19患者和对照） | NA | 空间转录组学, 批量RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |