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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4401 | 2025-11-14 |
Comparative transcriptomics of lateral hypothalamic cell types reveals conserved growth hormone-tachykinin dynamics in feeding
2025-Dec, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102251
PMID:40947010
|
研究论文 | 本研究通过比较转录组学分析揭示了侧下丘脑细胞类型中生长激素-速激肽动态在摄食行为中的保守机制 | 首次在斑马鱼和老鼠中鉴定出共表达生长激素受体和速激肽的保守GABA能神经元集群,并发现其在摄食状态下的激活机制 | 研究主要基于幼虫斑马鱼模型,在成年动物和人类中的保守性需要进一步验证 | 阐明侧下丘脑神经元在食欲调控中的分子和细胞特征及其进化保守性 | 斑马鱼和老鼠的侧下丘脑神经元 | 神经科学 | 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序,Act-seq方法,整合比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 幼虫斑马鱼侧下丘脑神经元(饥饿和饱食状态) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Act-seq方法(活动依赖性转录特征捕获) |
| 4402 | 2025-11-14 |
LILRB4 regulates circadian disruption-induced mammary tumorigenesis via non-canonical WNT signaling pathway
2025-Dec, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03597-5
PMID:41102383
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研究论文 | 本研究探讨了昼夜节律紊乱通过LILRB4和非经典WNT信号通路促进乳腺肿瘤发生的作用机制 | 首次揭示LILRB4作为昼夜节律紊乱与侵袭性乳腺肿瘤发生之间的关键连接分子,并证明靶向LILRB4免疫疗法可抑制肿瘤转移 | 研究主要基于基因工程小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 阐明昼夜节律紊乱促进乳腺肿瘤发生的分子机制 | 侵袭性乳腺癌基因工程小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,多重免疫染色,实时PCR | 基因工程小鼠模型 | 单细胞测序数据,流式数据,图像数据,基因表达数据 | LD12:12和昼夜节律紊乱小鼠的肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4403 | 2025-11-14 |
Mapping atherogenesis mechanisms in smooth muscle cells by targeting genes linked to coronary artery disease
2025-Nov-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113698
PMID:41210961
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研究论文 | 本研究结合冠状动脉疾病GWAS与单细胞RNA测序,识别平滑肌细胞中的风险基因并揭示其在动脉粥样硬化中的调控机制 | 首次将CAD GWAS与动脉粥样硬化斑块单细胞RNA测序整合,通过扰动实验发现不同风险基因共同调控收缩装置、细胞周期等关键通路 | 研究主要聚焦于平滑肌细胞,未全面评估其他血管细胞类型的贡献 | 解析冠状动脉疾病中平滑肌细胞的发病机制 | 人类动脉粥样硬化斑块中的平滑肌细胞及SMC来源的间充质细胞 | 单细胞基因组学 | 心血管疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4404 | 2025-11-14 |
From plasma proteomics Mendelian randomization to neuropathological validation: The potential role of CTSH-GRN-TMEM106B and TREM2-IL-34 networks of microglia in Alzheimer's disease
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178297
PMID:41138838
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研究论文 | 本研究通过双向孟德尔随机化框架结合神经病理学验证,揭示了外周生物标志物与阿尔茨海默病之间的因果关系及小胶质细胞相关网络的作用机制 | 首次采用双向孟德尔随机化方法系统分析血浆、脑脊液和脑组织蛋白质与AD的因果关系,并结合单细胞转录组数据和神经病理学验证构建了小胶质细胞相关网络 | 研究主要基于遗传工具变量和相关性分析,无法完全排除潜在混杂因素的影响,且样本来源主要为死后脑组织 | 阐明外周生物标志物与中枢系统在阿尔茨海默病发生发展中的相互作用机制 | 血浆蛋白质(734种)、脑脊液蛋白质(151种)、脑组织蛋白质(1296种)及AD患者死后脑组织标本 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 免疫荧光, 蛋白质相互作用分析 | 双向孟德尔随机化框架 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 神经病理学图像数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及734种血浆蛋白、151种脑脊液蛋白、1296种脑蛋白及AD死后脑组织标本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4405 | 2025-11-14 |
Paraptosis landscape reveals distinct prognoses and immune microenvironments in osteosarcoma: Experimental validation of key regulator TNK2
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178304
PMID:41167410
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研究论文 | 本研究通过生物信息学方法描绘了骨肉瘤中副凋亡相关基因的景观及其与预后和免疫微环境的关联 | 首次系统描绘骨肉瘤中副凋亡相关基因景观,发现TNK2在副凋亡调控中的关键作用 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索骨肉瘤中副凋亡相关基因的预后价值和免疫微环境特征 | 骨肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, LASSO-Cox回归, 共识聚类, 通路富集分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | TARGET和GSE21257队列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4406 | 2025-11-14 |
Repurposing antimicrobials, disulfiram, and metformin for cancer therapy: Bridging mechanistic gaps through RNA sequencing
2025-Nov-15, European journal of pharmacology
IF:4.2Q1
DOI:10.1016/j.ejphar.2025.178258
PMID:41101682
|
综述 | 探讨抗菌药物、双硫仑和二甲双胍通过RNA测序技术在癌症治疗中的再利用潜力 | 系统阐述RNA测序在药物重定位中的作用机制,整合单细胞和空间转录组学提升治疗精准性 | 临床转化结果不一致,存在药物相互作用、亚治疗浓度、耐药机制和肿瘤微环境等挑战 | 通过转录组学指导药物重定位以改善癌症治疗效果 | 抗菌药物(阿奇霉素、克拉霉素等)、双硫仑和二甲双胍 | 自然语言处理 | 癌症 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4407 | 2025-11-14 |
Pan-cancer single-cell RNA sequencing analysis refines multi-origin monocyte and macrophage lineages
2025-Nov-13, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-1255
PMID:41231218
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析构建泛癌骨髓细胞图谱,揭示肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型及其与临床预后的关联 | 提出肿瘤相关巨噬细胞的双重起源模型:C1QC+ TAMs来源于组织驻留巨噬细胞,SPP1+和ISG15+ TAMs来源于循环单核细胞 | NA | 解析肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 健康组织和泛癌组织中的骨髓细胞群体 | 单细胞组学 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4408 | 2025-11-14 |
CanSig Benchmarks Methods for Reproducible Cancer Cell State Discovery from Single-Cell Transcriptomic Data
2025-Nov-13, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0940
PMID:41231245
|
研究论文 | 开发了CanSig基准测试工具,用于评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 开发了首个综合评估单细胞转录组特征发现方法可重复性的基准测试框架 | 仅评估了13种方法在12个数据集上的表现,覆盖的癌症类型和方法数量有限 | 建立标准化框架评估单细胞转录组数据分析方法的可重复性 | 单细胞RNA测序数据和癌症细胞状态发现方法 | 生物信息学 | 多癌种(胶质母细胞瘤、乳腺癌、肺腺癌、横纹肌肉瘤、皮肤鳞状细胞癌) | 单细胞RNA测序 | 多种整合方法(包括Harmony、BBKNN、fastMNN等) | 单细胞转录组数据 | 185名患者的174,000个恶性细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4409 | 2025-11-14 |
An Extracellular Matrix-Producing Subset of Cancer-Associated Fibroblasts Drives Chemoresistance in Breast Cancer via SRC Activation and G0S2 Upregulation
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-0966
PMID:41223328
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和肿瘤芯片技术,识别出一种产生细胞外基质的癌症相关成纤维细胞亚群(ECM-myCAFs),该亚群通过激活SRC激酶和上调G0S2驱动三阴性乳腺癌化疗耐药 | 首次识别出特定的ECM-myCAF亚群在化疗耐药中的关键作用,并揭示SRC激活和G0S2上调是介导耐药的新机制 | 研究主要基于体外模型,需要进一步体内验证;机制细节如ECM-myCAFs分泌的具体因子尚未完全阐明 | 解析三阴性乳腺癌化疗耐药机制,识别驱动耐药的关键CAF亚群 | 三阴性乳腺癌患者样本和肿瘤芯片模型中的癌细胞与癌症相关成纤维细胞 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 肿瘤芯片技术, 高级细胞成像, 功能分析 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 三阴性乳腺癌患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4410 | 2025-11-14 |
Deep-Learning Tool ScVital Enables Species-Agnostic Integration of Cancer Cell States
2025-Nov-12, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4889
PMID:41223329
|
研究论文 | 开发了跨物种整合癌症细胞状态的深度学习工具scVital | 使用变分自编码器和判别器创建物种无关的潜在空间,并开发了潜在空间相似性评分新指标 | NA | 克服物种间比较的生物批次效应,识别跨物种共享的细胞状态 | 基因工程小鼠模型和原发性患者样本中的癌细胞状态 | 机器学习 | 胰腺癌,肺癌,肉瘤 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4411 | 2025-11-14 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals immune remodeling in bone marrow during aged sepsis
2025-Nov-12, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-025-01966-2
PMID:41225282
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示老年脓毒症中骨髓免疫重塑的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘老年脓毒症的骨髓免疫图谱,发现HSC-髓系细胞间Lgals9-Cd44信号通路的通讯障碍是免疫衰竭的关键机制 | 临床可行性和安全性尚未验证,样本量较小(每组2-3只小鼠) | 探究老年脓毒症免疫功能障碍的分子机制 | 年轻和老年雄性小鼠的骨髓免疫细胞 | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,CellChat细胞通讯分析,Transwell迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 10只小鼠(Y-Sham组2只,Y-CLP组3只,A-Sham组2只,A-CLP组3只) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4412 | 2025-11-14 |
Single Cell Transcriptomics of Traditional Chinese Medicine Bioactives: Mapping Immune, Neural and Hepatic Responses
2025-Nov-10, Zhongguo ying yong sheng li xue za zhi = Zhongguo yingyong shenglixue zazhi = Chinese journal of applied physiology
DOI:10.62958/j.cjap.2025.028
PMID:41207694
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研究论文 | 本研究应用单细胞RNA测序技术解析中药活性成分对免疫、神经和肝脏系统的细胞特异性反应 | 首次在单细胞分辨率揭示中药活性成分的细胞特异性药效学机制,发现传统批量转录组学研究无法检测的细胞类型特异性反应 | 研究仅使用小鼠模型,样本数量相对有限,需要进一步人体验证 | 阐明中药活性成分在免疫、神经和肝脏系统中的细胞特异性药理作用机制 | 小鼠脾脏、海马体和肝脏组织分离的单细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序,RT-qPCR,免疫荧光 | Seurat,CellChat | 单细胞转录组数据 | 超过42,000个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 4413 | 2025-11-14 |
Descendants of hypertrophic chondrocytes promote angiogenesis by secreting THBS4 during bone growth and injury repair
2025-Nov-10, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00469-2
PMID:41207902
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研究论文 | 本研究揭示了肥大软骨细胞后代通过分泌THBS4促进血管生成在骨骼生长和损伤修复中的关键作用 | 首次发现肥大软骨细胞后代中特定细胞亚群(PADs)通过分泌THBS4调控血管生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证 | 探究肥大软骨细胞转化在骨骼发育和修复中的病理生理意义 | 小鼠肥大软骨细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,组织透明化,体外细胞培养 | Col10a1-Cre; R26基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,图像数据 | 小鼠股骨和跖骨样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4414 | 2025-11-14 |
Unveiling prognostic biomarkers and immunotherapeutic insights in prostate cancer through multi-omics and machine learning
2025-Nov-10, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03363-z
PMID:41207909
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研究论文 | 通过多组学和机器学习方法识别前列腺癌预后生物标志物和免疫治疗靶点 | 整合单细胞和bulk转录组数据,开发包含14种算法和162种算法组合的机器学习框架构建共识免疫预后特征 | NA | 评估前列腺癌相关基因的临床相关性和预后潜力 | 前列腺癌肿瘤微环境中的细胞群体 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 多组学分析 | 机器学习集成算法 | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4415 | 2025-11-14 |
STAT3 regulates NK and NKT cell differentiation through C-X3-C motif chemokine receptor 1 (CX3CR1) in hyper-IgE syndrome
2025-Nov-10, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00323-1
PMID:41212476
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和流式细胞术揭示了STAT3基因突变通过CX3CR1调控NK和NKT细胞分化在高IgE综合征中的作用机制 | 首次发现STAT3突变导致CX3CR1CD57 NK和NKT细胞群体增加,并通过CUT&Tag分析揭示突变STAT3增强与IL-4转录起始位点的结合 | STAT3突变的分子机制仍然复杂且未完全阐明,研究样本量有限 | 探究STAT3突变在高IgE综合征中导致免疫失调的分子机制 | STAT3突变患者、STAT3条件性敲除小鼠的免疫细胞(NK细胞、NKT细胞、CD4 T细胞) | 免疫学 | 高IgE综合征 | 单细胞测序, 流式细胞术, CUT&Tag分析 | NA | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 表观基因组数据 | STAT3突变患者和STAT3条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4416 | 2025-11-14 |
MZT2B promotes malignant phenotypes in NSCLC cells by enhancing mitochondrial function and COX5B expression
2025-Nov-10, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08182-y
PMID:41213905
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研究论文 | 本研究揭示MZT2B通过增强线粒体功能和促进COX5B表达驱动非小细胞肺癌恶性进展的分子机制 | 首次发现MZT2B在NSCLC中的致癌作用及其通过调控线粒体功能和COX5B表达促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于细胞系和动物模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索NSCLC新型治疗靶点及MZT2B的致癌机制 | 非小细胞肺癌细胞系、临床组织标本和皮下异种移植模型 | 癌症生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因编辑, shRNA基因沉默, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据, 临床病理数据, 功能实验数据 | TCGA数据库NSCLC组织样本、多种NSCLC细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4417 | 2025-11-14 |
Distinct autoreactive CD19- plasma cell subsets accumulate in lupus-prone mice
2025-Nov-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-65906-6
PMID:41213970
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术鉴定了狼疮易感小鼠中自身反应性CD19⁻浆细胞亚群的积累特征 | 首次发现自身反应性CD19⁻浆细胞亚群在狼疮发病中的关键作用,并揭示其独特的基因表达谱和来源途径 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 | 鉴定系统性红斑狼疮中致病性浆细胞亚群,为靶向治疗提供依据 | 狼疮易感小鼠和系统性红斑狼疮患者外周血 | 单细胞生物学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, B细胞受体谱分析, 遗传模型 | NA | 单细胞转录组数据, B细胞受体序列数据 | 狼疮易感小鼠模型和SLE患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4418 | 2025-11-14 |
Neutrophil-derived Il1r2 modulates inflammation and alleviates acute lung injury by promoting M2 macrophage polarization
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14278-4
PMID:41213982
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研究论文 | 本研究揭示了中性粒细胞来源的Il1r2通过促进M2巨噬细胞极化调节炎症反应并缓解急性肺损伤的分子机制 | 首次发现中性粒细胞表达的Il1r2在急性肺损伤中通过促进M2巨噬细胞极化发挥抗炎作用 | 研究主要基于LPS诱导的小鼠模型,临床转化价值需进一步验证 | 探索急性肺损伤的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 生物信息学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, western blotting, 免疫组织化学, 免疫荧光 | 机器学习, 基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4419 | 2025-11-14 |
Identification of T cell stress response state (TSTR) and key genes related to T cells in discoid lupus erythematosus
2025-Nov-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-23088-7
PMID:41214060
|
研究论文 | 通过转录组和单细胞测序数据联合分析,鉴定盘状红斑狼疮中T细胞应激反应状态及相关关键基因 | 首次在DLE真皮中发现大量浸润的T细胞应激反应状态(TSTR),并通过多组学数据交叉验证筛选出CXCL13等9个关键疾病基因 | 需要进一步实验验证这些关键基因在DLE发病机制中的具体功能 | 深入探索盘状红斑狼疮的发病机制和生物标志物 | 盘状红斑狼疮患者的T细胞 | 生物信息学 | 自身免疫性疾病 | 转录组测序,单细胞RNA测序,WGCNA分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4420 | 2025-11-14 |
Development and validation of a novel nerve-related prognostic model for gastric cancer based on bulk and single-cell RNA sequencing data
2025-Nov-10, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15202-9
PMID:41214583
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研究论文 | 基于大量和单细胞RNA测序数据开发并验证了一种新型的胃癌神经相关预后模型 | 首次结合大量和单细胞RNA测序数据构建神经相关风险评分模型,系统分析神经相关基因在胃癌中的预后价值和肿瘤微环境特征 | 样本量相对有限,单细胞测序仅包含8例患者,需要更大规模验证 | 开发胃癌神经相关预后模型并评估其临床价值 | 胃癌患者组织样本和公开数据库中的基因表达数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,大量RNA测序,LASSO回归分析 | LASSO回归模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据,临床数据 | 8例胃癌患者的匹配癌组织和癌旁组织(单细胞测序),TCGA和GEO数据库中的大量数据 | NA | 单细胞RNA-seq,大量RNA-seq | NA | NA |