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当前共找到 33880 篇文献，本页显示第 421 - 440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 421 | 2025-12-07 |
Chaihu shugan powder ameliorated chronic pancreatitis by reprogramming SMS2-mediated sphingolipid metabolism in M1 macrophages
2025-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157565
PMID:41308384
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研究论文 | 本研究探讨了柴胡疏肝散通过调控SMS2介导的鞘脂代谢改善慢性胰腺炎的机制 | 首次揭示柴胡疏肝散中的橙皮素通过靶向SMS2抑制M1巨噬细胞极化，从而改善慢性胰腺炎 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，临床转化需进一步验证 | 阐明柴胡疏肝散治疗慢性胰腺炎的作用机制及关键活性成分 | 慢性胰腺炎小鼠模型、骨髓来源巨噬细胞、原代胰腺星状细胞 | NA | 慢性胰腺炎 | 靶向鞘脂分析、单细胞RNA测序、流式细胞术、分子对接 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 422 | 2025-12-07 |
Endothelial cells as early therapeutic targets in chronic obstructive pulmonary disease: Insights into Tongxinluo's multiple protective mechanisms against cigarette smoke-induced lung injury
2025-Dec, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157600
PMID:41313847
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了内皮细胞作为慢性阻塞性肺疾病早期治疗靶点的潜力，并探讨了中药通心络胶囊通过Apelin/APJ/p38MAPK通路减轻香烟烟雾诱导的肺损伤的多重保护机制 | 首次将内皮细胞作为COPD早期治疗靶点进行研究，结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了通心络胶囊通过Apelin/APJ/p38MAPK通路促进内皮细胞增殖和内皮介导的上皮再生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证，且通心络胶囊的具体活性成分和作用靶点需进一步明确 | 评估内皮细胞作为COPD早期治疗靶点的潜力，并探究中药通心络胶囊的干预效果 | 香烟烟雾暴露的小鼠模型，以及体外培养的内皮细胞和上皮细胞 | 数字病理学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 基因表达数据，空间分布数据 | 香烟烟雾暴露2、4、6、12和24周的小鼠，其中12周时进行单细胞RNA测序和空间测序 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 423 | 2025-12-07 |
A scheduler for rhythmic gene expression
2025-Dec, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00155-9
PMID:41073798
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研究论文 | 本文以秀丽隐杆线虫蜕皮时钟为模型，研究遗传振荡器如何调度数千个基因的有序表达 | 开发了一个线性模型，基于超过200个转录因子的结合来预测染色质动态，并识别出九个关键调控因子，这些因子通过加性作用决定每个调控元件的峰值相位和振幅，同时还能通过破坏性干扰产生组成性、非节律性活动 | NA | 探究遗传振荡器如何调度基因的有序表达，以理解发育和其他动态生物过程中的复杂基因表达模式 | 秀丽隐杆线虫的蜕皮时钟及相关基因表达 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 时间分辨ATAC-seq | 线性模型 | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 424 | 2025-12-07 |
Single-Cell Transcriptomics Unravels Growth Factor Erv1-Like Mediated Ferroptosis as a Key Driver of Intestinal Epithelial Dysfunction in Ulcerative Colitis
2025-Dec, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202502014
PMID:41098076
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学揭示了生长因子Erv1样蛋白（GFER）通过调节铁死亡在溃疡性结肠炎肠道上皮功能障碍中的关键作用 | 首次证明GFER在UC中调节铁死亡的关键作用，并发现其通过与PCBP1相互作用维持铁稳态，以及通过激活PGC-1α/PPARγ通路减少脂质过氧化 | NA | 阐明溃疡性结肠炎中肠道上皮功能障碍的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞、DSS诱导的结肠炎小鼠模型、LPS诱导的体外肠道上皮细胞炎症模型 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 425 | 2025-12-07 |
Elucidating cardiac fibroblasts heterogeneity and activation during experimental autoimmune myocarditis using spatial transcriptomics
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102344
PMID:41341993
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，探讨了实验性自身免疫性心肌炎急性炎症期中心脏成纤维细胞的转录模式变化及其异质性 | 首次在实验性自身免疫性心肌炎模型中应用空间转录组学分析心脏成纤维细胞，揭示了其六个不同亚群在急性炎症期的动态变化及与免疫细胞浸润的空间共定位关系 | 研究基于动物模型，结果可能无法完全反映人类疾病情况；样本量相对有限，仅分析了1545个成纤维细胞富集点 | 阐明心脏成纤维细胞在实验性自身免疫性心肌炎急性炎症期的异质性和激活机制 | 实验性自身免疫性心肌炎模型中的心脏成纤维细胞 | 空间转录组学 | 心肌炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1545个心脏成纤维细胞富集点（其中657个以成纤维细胞为主） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 426 | 2025-12-07 |
A unique microglia subset associated with aggressive α-synucleinopathy uncovered in a rapidly progressive multiple system atrophy cerebellar type model
2025-Nov-29, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107206
PMID:41325908
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研究论文 | 本研究通过构建一种快速进展的多系统萎缩小脑型小鼠模型，发现了一种与侵袭性α-突触核蛋白病相关的独特小胶质细胞亚群 | 首次在MSA-C模型中鉴定出一种表达TLR2、Tgm2、Msr1等标志物的促炎性小胶质细胞亚群，该亚群位于p-α-syn聚集物附近，且不同于已知的保护性疾病相关小胶质细胞和边界相关巨噬细胞 | 研究基于小鼠模型，其病理过程可能与人类疾病存在差异；人类样本量较小（6例尸检病例） | 探究多系统萎缩小脑型的病理机制，特别是小胶质细胞在疾病进展中的作用 | Tet-Off诱导的MSA-C小鼠模型（少突胶质细胞特异性过表达人A53T α-syn）以及6例人类MSA-C尸检病例 | 神经科学，单细胞组学 | 多系统萎缩，α-突触核蛋白病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，组织病理学数据 | 小鼠模型及6例人类MSA-C尸检病例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 427 | 2025-12-07 |
Targeted NAT10 Degradation by PROTAC NP1192 Suppresses Hypoxia-Adaptive Glycolysis and Reinvigorates CD8+ Effector T‑Cell Function for Synergistic Cancer Immunotherapy
2025-Nov-26, ACS central science
IF:12.7Q1
DOI:10.1021/acscentsci.5c00812
PMID:41341045
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研究论文 | 本研究开发了一种名为NP1192的PROTAC降解剂，靶向降解NAT10蛋白，通过抑制缺氧适应性糖酵解和增强CD8+效应T细胞功能，从而协同增强癌症免疫治疗效果 | 首次开发了靶向NAT10的PROTAC降解剂NP1192，证明了其通过双重代谢-免疫调节策略（抑制缺氧糖酵解和增强T细胞功能）来克服免疫检查点阻断疗法耐药性的新机制 | 研究主要在宫颈癌细胞系、肿瘤类器官和异种移植模型中进行，尚未在更广泛的癌症类型或人体临床试验中得到验证 | 开发一种新的治疗策略，以克服肿瘤对免疫检查点阻断疗法的耐药性，并增强癌症免疫治疗的效果 | NAT10蛋白、缺氧肿瘤微环境、CD8+ T细胞、宫颈癌细胞、肿瘤类器官、小鼠异种移植模型 | 癌症免疫治疗 | 宫颈癌 | PROTAC技术、单细胞RNA测序、共培养实验、异种移植模型 | NA | 基因表达数据、蛋白质降解数据、代谢物测量数据、细胞功能数据 | 三种肿瘤类器官、小鼠异种移植模型、宫颈癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 428 | 2025-12-07 |
Licochalcone B targets neural cell adhesion molecule 1 to inhibit osteosarcoma progression and ferroptosis resistance via extracellular signal-regulated kinase 5 and nuclear factor kappa B pathways
2025-Nov-22, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157584
PMID:41349457
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研究论文 | 本研究探讨了神经细胞粘附分子1（NCAM1）在骨肉瘤中的致癌作用，并评估了甘草查尔酮B通过靶向NCAM1抑制骨肉瘤进展和铁死亡抵抗的治疗潜力 | 首次揭示NCAM1在骨肉瘤中的致癌特性，并发现甘草查尔酮B通过靶向NCAM1抑制ERK5和NF-κB通路，从而促进铁死亡并逆转免疫抑制微环境 | 研究未明确甘草查尔酮B与NCAM1结合的具体分子机制，且体内外实验模型可能无法完全模拟人类骨肉瘤的复杂性 | 阐明NCAM1的致癌特性，并评估甘草查尔酮B作为靶向NCAM1的治疗剂在骨肉瘤中的疗效 | 骨肉瘤细胞系、临床患者样本（通过RNA-seq数据）以及体内动物模型 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, 体外细胞实验, 体内动物实验 | NA | RNA-seq数据（包括bulk和单细胞）、体外细胞功能数据、体内肿瘤生长数据 | 未明确具体样本数量，但涉及临床RNA-seq队列和实验模型 | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 429 | 2025-12-07 |
Fibroblast-Specific Loss of TGF-β Signaling Mediates Lipomatous Metaplasia in the Infarcted Heart
2025-Nov-18, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究揭示了心肌梗死后成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失如何通过Smad非依赖性途径介导成纤维细胞向脂肪细胞转化，导致心脏瘢痕中的脂肪化生 | 首次发现成纤维细胞特异性TGF-β信号缺失通过Smad非依赖性级联反应促进成纤维细胞向脂肪细胞转化，为心肌梗死后脂肪浸润提供了新的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析，需要进一步验证 | 探究心肌梗死后脂肪化生的细胞机制，特别是成纤维细胞向脂肪细胞转化的分子途径 | 小鼠心肌梗死模型和人类心肌梗死患者的单细胞RNA测序数据 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 430 | 2025-12-07 |
Bisphenol S disrupts human sertoli cell function through NR1H3 degradation: Mechanistic insights from integrated bulk and single-cell transcriptomics
2025-Nov-15, Ecotoxicology and environmental safety
IF:6.2Q1
DOI:10.1016/j.ecoenv.2025.119418
PMID:41241997
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研究论文 | 本研究揭示了双酚S通过靶向降解NR1H3蛋白损害人类支持细胞功能，从而可能导致男性不育的分子机制 | 首次结合批量与单细胞转录组学，并通过计算模拟与实验验证，确定了NR1H3是双酚S在人类支持细胞中的直接作用靶点 | 研究主要基于体外永生化细胞模型，体内生理环境下的效应仍需进一步验证 | 探究环境污染物双酚S损害人类支持细胞功能并导致男性不育的分子机制 | 永生化人类支持细胞及非梗阻性无精子症睾丸组织 | 生物信息学 | 男性不育症 | RNA测序，单细胞转录组测序，分子对接，分子动力学模拟，MM/GBSA结合自由能计算 | NA | 转录组数据，蛋白质数据 | NA | NA | 批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 431 | 2025-12-07 |
Therapeutic Potential of CLDN Family Proteins in Ovarian Cancer: Emerging Biomarkers and Targets
2025-Nov-11, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL45244
PMID:41351424
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、单细胞RNA测序和功能实验，系统评估了CLDN家族成员（特别是CLDN6、CLDN9和CLDN10）在卵巢癌中的表达、预后价值及治疗潜力 | 首次综合多组学数据（包括单细胞RNA测序）和功能实验，明确CLDN6、CLDN9和CLDN10作为卵巢癌的新型诊断和预后生物标志物组合，并揭示CLDN6通过Wnt/β-catenin通路调控肿瘤恶性表型的关键作用 | CLDN10在肿瘤细胞中高表达但其风险比小于1的机制尚不明确，且研究主要基于公共数据库和体外/体内实验，需要更多临床样本和前瞻性研究进一步验证 | 识别卵巢癌的新型诊断和预后生物标志物及潜在治疗靶点 | CLDN家族基因（特别是CLDN6、CLDN9和CLDN10）在卵巢癌中的表达、功能及临床意义 | 生物信息学与癌症研究 | 卵巢癌 | 生物信息学分析、单细胞RNA测序、免疫组化、Western blot、siRNA敲低、细胞功能实验（如Transwell侵袭、伤口愈合、线粒体去极化、ROS积累、细胞周期和凋亡检测）、裸鼠体内实验 | 逻辑回归模型、随机效应模型、ROC曲线分析 | 基因表达谱、临床数据、单细胞RNA测序数据、组织微阵列图像、蛋白质印迹数据 | TCGA-OV队列、两个GEO数据集（GSE18520、GSE26712）、独立组织微阵列、卵巢癌细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 432 | 2025-12-07 |
Spatial transcriptomics and immunophenotyping uncover chronic inflammation-induced immune adaptations favoring dysplasia development in patients at risk of colitis-associated cancer
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf184
PMID:41081629
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫表型分析，揭示了慢性炎症诱导的免疫适应机制如何促进炎症性肠病（IBD）患者中结肠炎相关癌症（CAC）的发育 | 结合GeoMx数字空间分析和成像质谱流式技术，首次在CAC风险患者中系统性地识别了慢性炎症导致的免疫细胞重编程，特别是发现IL-10表达增加和CD8+上皮内T细胞减少与CAC易感性相关 | 样本量相对较小（发现队列11例，验证队列最多14例），且研究主要基于观察性数据，需要进一步实验验证机制 | 确定慢性炎症在IBD患者中诱导的免疫细胞重编程，以理解其如何促进CAC发展 | 结肠炎相关癌症（CAC）患者、散发性结直肠癌（SCRC）患者以及有或无发育不良的IBD患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | 空间转录组学、免疫表型分析、成像质谱流式、免疫组织化学/免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、免疫表型图像数据 | 发现队列11例（CAC和SCRC患者），验证队列包括CAC患者10例、SCRC患者14例，以及IBD患者有发育不良6例、无发育不良18例 | NA | 空间转录组学, 免疫表型分析 | GeoMx数字空间分析系统 | GeoMx数字空间分析用于空间转录组学，成像质谱流式用于免疫表型分析 |
| 433 | 2025-12-07 |
Circuit-specific gene editing for precision modulation of neuronal activity with CRISPR-rabies virus
2025-Nov-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.03.686433
PMID:41278687
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研究论文 | 开发了一种结合CRISPR基因编辑和狂犬病毒跨突触传播的CRISPR-狂犬病毒（CRV）系统，用于在解剖学定义的神经回路中进行精确基因编辑 | 利用狂犬病毒的跨突触传播特性，首次实现了在特定神经回路而非仅细胞类型层面的基因编辑，结合细胞类型特异性Cas9表达，能精确调控回路功能 | 未明确提及具体样本量或实验规模，可能受限于病毒递送效率和编辑特异性 | 研究神经回路中基因功能的精确调控，为脑部疾病开发新型基因疗法 | 神经元，特别是海马CA3区的PV中间神经元和锥体神经元 | 神经科学 | 脑部疾病 | CRISPR基因编辑，狂犬病毒递送系统，3'-捕获单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据，单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'-捕获单细胞RNA-seq |
| 434 | 2025-12-07 |
HTRA1-AS1, an ARMS2-region long non-coding RNA, is downregulated in retinas of age-related macular degeneration patients
2025-Nov-06, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.10.29.25338834
PMID:41282784
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研究论文 | 本研究在年龄相关性黄斑变性（AMD）的主要遗传风险位点10q26区域内，鉴定并验证了一个长链非编码RNA HTRA1-AS1，发现其在AMD患者视网膜中表达下调，并在氧化应激条件下表达显著上调 | 首次在AMD关键遗传风险区域ARMS2-HTRA1内鉴定出长链非编码RNA HTRA1-AS1，并揭示了其在AMD患者视网膜中的表达异常及在氧化应激反应中的动态变化 | 研究样本量相对有限（43例AMD vs 44例对照），且功能机制研究尚不深入，主要基于表达相关性分析 | 探索10q26基因座在年龄相关性黄斑变性发病机制中的非编码RNA调控作用 | 人类死后视网膜组织、人诱导多能干细胞（iPSC）分化的视网膜色素上皮（RPE）细胞 | 基因组学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA-seq、RT-PCR、Sanger测序、单细胞RNA-seq数据分析 | NA | RNA序列数据、基因表达数据 | 87例人类视网膜捐赠者（43例AMD患者，44例对照） | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 435 | 2025-12-07 |
Single Cell Analysis of pBMCs of Psoriasis patients reveals distinct CD4+ T cell phenotypes associated with response to IL-23 blockade
2025-Nov-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.11.04.686122
PMID:41279198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析银屑病患者外周血单个核细胞，揭示了与IL-23阻断治疗反应相关的CD4+ T细胞表型 | 首次利用单细胞RNA测序技术，在银屑病患者外周血中识别出与IL-23抑制剂治疗反应相关的特定CD4+ T细胞群体，特别是Th1样细胞，并发现其转录组特征与皮损区T细胞相似 | 样本量相对较小（27名患者），且仅基于外周血分析，未直接评估皮损组织；研究结果需在更大队列中验证 | 旨在识别与IL-23阻断治疗反应相关的免疫细胞特征，以预测银屑病患者的临床疗效 | 银屑病或银屑病关节炎患者的外周血单个核细胞（pBMCs） | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 27名银屑病或银屑病关节炎患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 436 | 2025-12-07 |
scRNA-seq of Penaeus japonicus hemocytes under environmentally-induced restriction of sand-diving behavior
2025-Nov, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111125
PMID:41038398
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了日本对虾在沙潜行为受限下的血细胞分子响应，揭示了关键细胞亚群和差异表达基因 | 首次在日本对虾中应用单细胞转录组技术研究沙潜行为受限的分子机制，并识别出与行为调控相关的关键候选基因 | 候选基因的具体功能需要进一步验证，且研究仅关注了血细胞，未涉及其他组织或长期效应 | 探究日本对虾在沙潜行为受限下的分子应激响应及行为调控机制 | 日本对虾的血细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNA原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个养殖系统组（沙底组、无沙组、无沙应激组）的日本对虾血细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 437 | 2025-12-07 |
ScASplicer: An interactive shiny/R application for alternative splicing analysis of single-cell sequencing
2025-Nov, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111116
PMID:41038402
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研究论文 | 本文介绍了ScASplicer，一个基于Shiny/R的交互式应用，用于单细胞测序的替代剪接分析 | 开发了Python包简化输入文件生成，并创建了Shiny/R包ScASplicer，支持多细胞群体的交互式、无代码分析，提升了MARVEL工具的可用性和功能 | 未在摘要中明确提及具体限制 | 改进单细胞RNA测序中替代剪接分析的可用性和功能性 | 单细胞RNA测序数据中的替代剪接事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 438 | 2025-12-07 |
SerpinB2 promotes the proliferation of glioma cells by regulating the cell cycle through the Wnt/β-catenin signaling pathway
2025-Nov, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111148
PMID:41176096
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研究论文 | 本研究结合转录组测序和单细胞转录组分析，揭示了SerpinB2通过Wnt/β-catenin信号通路调控细胞周期，从而促进胶质瘤细胞增殖的分子机制 | 首次将转录组测序与单细胞转录组分析相结合，系统阐明了SerpinB2在胶质瘤中通过Wnt/β-catenin通路调控细胞周期的具体机制 | 研究主要基于体外细胞实验和动物模型，缺乏临床患者样本的直接验证，且信号通路的具体调控细节仍需进一步探索 | 阐明SerpinB2在胶质瘤细胞增殖中的分子调控机制 | 胶质瘤细胞系、胶质瘤组织样本、荷瘤小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 转录组测序, 单细胞转录组分析, CCK-8, 伤口愈合实验, 流式细胞术, q-PCR, Western blotting | NA | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 未明确具体样本数量，但使用了CGGA和TISCH数据库的胶质瘤组织数据、细胞系实验及荷瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 439 | 2025-12-07 |
A bioinformatics pipeline for identifying homoplasmic and heteroplasmic mitochondrial DNA SNVs in single-cell RNA-Seq datasets
2025-Nov, Genomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.ygeno.2025.111122
PMID:41061772
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研究论文 | 开发了一种用于从单细胞RNA测序数据中识别同质和异质线粒体DNA单核苷酸变异的生物信息学流程 | 提出了一种新型生物信息学流程，包括质量控制和可定制的覆盖度依赖阈值，以可靠检测scRNA-seq数据中的mtDNA SNVs，并过滤测序错误 | NA | 开发一个生物信息学流程，用于从单细胞RNA测序数据中识别线粒体DNA单核苷酸变异 | 单细胞RNA测序数据集中的线粒体DNA单核苷酸变异 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 440 | 2025-12-07 |
ST-GCP: a graph convolutional network model with contrastive consistency and permutation for spatial transcriptomics
2025-Nov-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf643
PMID:41348600
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研究论文 | 本文提出了一种名为ST-GCP的自监督图表示学习框架，用于空间转录组数据，通过结合结构-特征扰动机制来提升聚类效果 | ST-GCP引入了特征级随机置换和空间邻接网络中的随机边丢弃，创建两个互补的增强图视图，并利用对比一致性目标对齐视图特定表示，从而在低维空间中耦合图拓扑与转录组谱 | NA | 开发一种自监督图表示学习框架，以更好地利用空间转录组数据中的空间信息，提升聚类和模式发现能力 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 图卷积网络 | 基因表达矩阵和空间邻接网络 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |