单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
421	2025-05-15	Vagus nerve modulates acute-on-chronic liver failure progression via CXCL9 2025-May-05, Chinese medical journal IF:7.5Q1 DOI:10.1097/CM9.0000000000003104 PMID:38945689	research paper	该研究揭示了迷走神经通过调控CXCL9表达在急性-慢性肝衰竭（ACLF）发展中的作用机制	首次发现迷走神经-巨噬细胞-CXCL9轴的神经免疫通讯机制在ACLF发展中的关键作用	研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，临床转化需要进一步验证	阐明迷走神经调控ACLF发展的分子机制	急性-慢性肝衰竭（ACLF）小鼠模型和患者样本	神经免疫学	肝病	蛋白质组学分析、scRNA-seq、流式细胞术、免疫组化/免疫荧光染色、CRISPR/Cas9技术	小鼠ACLF模型	蛋白质组数据、单细胞转录组数据、流式细胞数据、组织图像数据	ACLF小鼠模型和患者样本（具体数量未明确说明）
422	2025-05-15	Comprehensive single-cell profiling of T and B cell subsets in mice reveals impacts on memory immune responses in FMDV infection 2025-May, Virology IF:2.8Q3 DOI:10.1016/j.virol.2025.110496 PMID:40090183	研究论文	通过单细胞RNA测序技术，研究了FMDV感染对小鼠T和B细胞亚群记忆免疫反应的影响	首次全面分析了FMDV感染对记忆免疫细胞亚群的影响，并揭示了Fos相关基因的关键作用	研究仅限于小鼠模型，未在人类或其他动物模型中验证	探究FMDV感染对记忆免疫反应的影响机制	小鼠脾脏中的T和B细胞亚群	免疫学	口蹄疫	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	未明确说明的小鼠脾脏细胞样本
423	2025-05-15	Single-Cell Transcriptomics Identifies a Prominent Role for the MIF-CD74 Axis in Myasthenia Gravis Thymus 2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation DOI:10.1212/NXI.0000000000200384 PMID:40117520	研究论文	该研究通过单细胞转录组学揭示了MIF-CD74轴在重症肌无力胸腺中的重要作用	首次构建了EOMG患者胸腺淋巴细胞的单细胞转录组图谱，并揭示了MIF-CD74轴在B细胞存活信号传导中的关键作用	样本量较小(仅11例未接受免疫治疗的患者)，且仅针对早期发病的AChR抗体阳性MG患者	探究重症肌无力胸腺中B细胞增殖和存活的分子机制	11例未接受免疫治疗的早期发病AChR抗体阳性重症肌无力患者的胸腺组织	单细胞转录组学	重症肌无力	单细胞转录组测序、多重组织学染色、ELISA	NA	单细胞转录组数据、组织学图像、蛋白质浓度数据	11例EOMG患者的胸腺样本
424	2025-05-15	BDNF-GABA signaling in astrocytes: enhancing neural repair after SCI through MSC therapies 2025-May, Spinal cord IF:2.1Q1 DOI:10.1038/s41393-025-01077-x PMID:40229538	研究论文	本研究通过生物信息学分析探索星形胶质细胞在脊髓损伤（SCI）后的变化，揭示BDNF调控的GABA信号在神经元再生中的关键作用，并评估hUC-MSCs和iPS来源的MSCs在促进神经修复中的潜力	揭示了BDNF调控的GABA信号在星形胶质细胞中对神经元再生的关键作用，并评估了hUC-MSCs和iPS-MSCs通过激活该通路促进神经修复的潜力	研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	探索SCI后星形胶质细胞的变化及其在神经修复中的作用，评估MSCs治疗的潜力	星形胶质细胞、hUC-MSCs、iPS来源的MSCs	生物信息学	脊髓损伤	scRNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq、GSEA	NA	转录组数据	来自GEO数据库的scRNA-seq、空间转录组学和bulk RNA-seq数据
425	2025-05-15	Single-cell transcriptomics reveals that human milk feeding shapes neonatal immune cell interleukin signaling pathways in a nonrandomized clinical trial 2025-Apr-26, The American journal of clinical nutrition DOI:10.1016/j.ajcnut.2025.04.024 PMID:40294751	研究论文	通过单细胞转录组学分析，比较母乳喂养和配方奶喂养对新生儿免疫细胞白细胞介素信号通路的影响	首次使用单细胞RNA测序技术，揭示了母乳喂养与配方奶喂养在新生儿免疫细胞基因表达和信号通路上的差异	样本量较小（母乳喂养6例，配方奶喂养3例），且为非随机临床试验	探究母乳喂养与配方奶喂养对新生儿免疫细胞基因表达的影响	健康新生儿的外周血单个核细胞（PBMCs）	免疫学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	基因表达数据	母乳喂养婴儿6例，配方奶喂养婴儿3例
426	2025-05-15	USP14-IMP2-CXCL2 axis in tumor-associated macrophages facilitates resistance to anti-PD-1 therapy in gastric cancer by recruiting myeloid-derived suppressor cells 2025-04-23, Oncogene IF:6.9Q1 DOI:10.1038/s41388-025-03425-w PMID:40269263	研究论文	该研究揭示了USP14-IMP2-CXCL2轴在肿瘤相关巨噬细胞中通过招募髓源性抑制细胞促进胃癌抗PD-1治疗耐药性的机制	首次揭示了USP14-IMP2-CXCL2信号轴在TAMs中驱动抗PD-1治疗耐药性的分子机制，并提出通过抑制该轴增强治疗敏感性的新策略	研究主要基于临床样本和动物模型，尚未在更大规模临床试验中验证	探究胃癌抗PD-1治疗耐药性的分子机制并寻找潜在治疗靶点	胃癌患者的肿瘤相关巨噬细胞和髓源性抑制细胞	肿瘤免疫学	胃癌	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	基因表达数据	来自无法手术胃癌患者的内镜活检样本
427	2025-05-15	Cold-Induced DHRS4 Promotes Thermogenesis via Enhanced Fatty Acid β-Oxidation in Porcine Subcutaneous Adipocytes 2025-Apr-22, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1 DOI:10.3390/ani15091190 PMID:40362005	研究论文	研究通过猪的冷暴露模型，探讨了皮下脂肪组织适应冷环境的机制，发现DHRS4基因在冷诱导的产热脂肪细胞亚群中表达上调，促进脂肪酸β-氧化和产热能力	首次在缺乏经典棕色脂肪组织的大型哺乳动物（猪）中，揭示了DHRS4作为表观遗传-代谢开关调控冷适应的机制	研究仅针对猪的皮下脂肪组织，未涉及其他脂肪组织或其他物种的验证	探究大型哺乳动物脂肪组织对冷适应的表观遗传调控机制	猪的皮下脂肪组织	表观遗传学	NA	单细胞RNA测序和批量转录组分析	NA	转录组数据	未明确说明样本数量，但使用了猪的冷暴露模型
428	2025-05-15	A cohort of highly activated CD99- CD72+ B cells promoting autoimmune progression in juvenile systemic lupus erythematosus 2025-Apr-16, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114466 PMID:40090085	研究论文	研究发现了一类在青少年系统性红斑狼疮中高度激活的CD99- CD72+ B细胞亚群，这些细胞表达高水平的TLR7，并促进自身免疫反应	首次在青少年系统性红斑狼疮中鉴定出CD72 BCs这一关键过渡细胞群，揭示了其在自身抗体分泌细胞生成中的作用	研究主要基于青少年SLE患者，结果在成人SLE中的适用性需要进一步验证	探究CD72+ B细胞在系统性红斑狼疮自身免疫反应中的作用机制	青少年系统性红斑狼疮患者的B细胞亚群	免疫学	系统性红斑狼疮	单细胞RNA测序(scRNA-seq)，批量RNA测序(RNA-seq)，多组学整合分析	NA	RNA测序数据	未明确提及具体样本数量，研究对象为青少年SLE患者的B细胞
429	2025-05-15	Integration of Transcriptomic and Single-Cell Data to Uncover Senescence- and Ferroptosis-Associated Biomarkers in Sepsis 2025-Apr-11, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040942 PMID:40299574	research paper	该研究通过整合转录组学和单细胞数据，揭示了脓毒症中与衰老和铁死亡相关的生物标志物	首次结合WGCNA和scRNA-seq技术，识别脓毒症中铁死亡和衰老相关的关键基因，并评估其诊断潜力及药物相互作用	需要进一步的临床验证和精准医学应用研究	探索脓毒症的病理生理机制，并寻找诊断和靶向治疗的生物标志物	脓毒症患者	生物信息学	脓毒症	WGCNA, scRNA-seq, 分子对接	NA	转录组数据, 单细胞RNA测序数据	公共数据集(GSE57065, GSE65682, GSE26378)
430	2025-05-15	Radiotherapy promotes cuproptosis and synergizes with cuproptosis inducers to overcome tumor radioresistance 2025-Apr-10, Cancer cell IF:48.8Q1 DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.031 PMID:40215978	研究论文	本研究揭示了放疗通过诱导铜依赖性细胞死亡（铜死亡）来克服肿瘤放射抗性的机制	首次发现放疗可诱导铜死亡，并揭示了铜死亡与放射抗性之间的分子机制	研究主要基于食管癌模型，其他癌症类型的适用性尚需验证	探索放疗诱导铜死亡的机制及其在克服肿瘤放射抗性中的应用	癌细胞、患者肿瘤组织、细胞系和患者来源的异种移植模型	肿瘤学	食管癌	RNA-seq、单细胞RNA-seq	NA	基因表达数据	包括放射抗性食管癌细胞、患者肿瘤组织及异种移植模型
431	2025-05-15	Revealing tumor microenvironment communication through m6A single-cell analysis and elucidating immunotherapeutic potentials for cutaneous melanoma (CM) 2025-Apr-09, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3 DOI:10.1007/s00432-025-06176-z PMID:40205154	研究论文	通过m6A单细胞分析揭示皮肤黑色素瘤肿瘤微环境中的通讯机制，并探讨其免疫治疗潜力	首次在皮肤黑色素瘤中研究m6A修饰的作用，并发现COL3A1基因作为黑色素瘤-成纤维细胞相互作用的关键调节因子	研究仅基于三个皮肤黑色素瘤样本的公开数据，样本量较小	探索m6A RNA甲基化在皮肤黑色素瘤肿瘤微环境中的作用及其免疫治疗潜力	皮肤黑色素瘤的肿瘤微环境细胞	肿瘤微环境分析	皮肤黑色素瘤	单细胞RNA测序(scRNA-seq), 非负矩阵分解(NMF)分析	NMF聚类模型	单细胞RNA测序数据	3个皮肤黑色素瘤样本(来自公共数据库GSE215121)
432	2025-05-15	Comprehensive Integrated Analysis Reveals the Spatiotemporal Microevolution of Cancer Cells in Patients with Bone-Metastatic Prostate Cancer 2025-Apr-09, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040909 PMID:40299503	研究论文	本研究通过单细胞转录组学系统分析了前列腺癌骨转移的异质性和微环境适应性	整合了迄今为止最大的单细胞转录组数据集，揭示了上皮癌细胞在转移过程中的关键进化轨迹，并鉴定了一个新的上皮亚群NEndoCs	传统聚类方法在面对癌症上皮细胞显著异质性时存在挑战	系统表征前列腺癌骨转移的异质性和微环境适应性	前列腺癌骨转移患者	数字病理学	前列腺癌	单细胞转录组学	无监督聚类	单细胞转录组数据	124个样本（包括原发前列腺肿瘤、不同骨转移部位和非恶性组织），602,497个高质量单细胞转录组
433	2025-05-15	Immune Regulation and Disulfidptosis in Atherosclerosis Influence Disease Progression and Therapy 2025-Apr-09, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040926 PMID:40299531	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和生物信息学方法，探讨了免疫调节和二硫键凋亡在动脉粥样硬化中的作用及其对疾病进展和治疗的影响	首次将二硫键凋亡与动脉粥样硬化联系起来，并确定了CTSC、TGFBI和GMFG作为关键生物标志物，开发了高精度的诊断风险评分模型	研究主要基于单细胞RNA测序数据，可能受到样本量和测序深度的限制	探究动脉粥样硬化的分子机制，寻找新的治疗靶点和诊断方法	动脉粥样硬化斑块中的免疫细胞和平滑肌细胞	生物信息学	心血管疾病	scRNA-seq, WGCNA, 机器学习	诊断风险评分模型	单细胞RNA测序数据	NA
434	2025-05-15	Exploring Immune-Related Ferroptosis Genes in Thyroid Cancer: A Comprehensive Analysis 2025-Apr-08, Biomedicines IF:3.9Q1 DOI:10.3390/biomedicines13040903 PMID:40299520	研究论文	本研究探索甲状腺癌中免疫相关铁死亡基因（IRFGs），以发现新的治疗靶点	整合了批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，构建了一个稳健的预后模型，并鉴定了与免疫细胞浸润和免疫反应密切相关的IRFGs	研究样本可能不足以代表所有甲状腺癌亚型，且需要进一步的实验验证	发现甲状腺癌中免疫相关铁死亡基因（IRFGs）作为新的治疗靶点，并改进预后评估	甲状腺癌患者及其肿瘤微环境（TME）中的免疫相关铁死亡基因	生物信息学	甲状腺癌	CIBERSORTx, WGCNA, LASSO Cox回归, Pearson相关性分析, 单细胞RNA测序（scRNA-seq）, qRT-PCR	预后风险评分模型	RNA测序数据	TCGA-THCA数据集中的甲状腺癌样本，具体数量未明确说明
435	2025-05-15	Exploring Human Brain Metabolism via Genome-Scale Metabolic Modeling with Highlights on Multiple Sclerosis 2025-Apr-02, ACS chemical neuroscience IF:4.1Q2 DOI:10.1021/acschemneuro.5c00006 PMID:40091499	研究论文	本研究通过基因组尺度代谢模型（GEMs）探索人脑代谢，特别关注多发性硬化症（MS）	整合单细胞RNA-seq数据和全局Human1，通过tINIT算法重建脑细胞特异性GEMs，并生成组合脑模型iHumanBrain2690	NA	理解脑生理和疾病状态下的复杂代谢	神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞及其前体细胞	系统生物学	多发性硬化症	单细胞RNA-seq, tINIT算法	GEMs	RNA-seq数据	NA
436	2025-05-15	A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations 2025-Apr, Computational biology and chemistry IF:2.6Q2 DOI:10.1016/j.compbiolchem.2025.108362 PMID:39919386	综述	本文系统回顾了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用和创新，特别是在胰岛细胞研究中的进展	强调了scRNA-seq在解析细胞类型、基因活性和细胞间相互作用方面的创新应用，为理解复杂生物过程和疾病提供了新视角	讨论了scRNA-seq在样本制备、测序和计算分析方面的挑战和限制	回顾scRNA-seq技术在胰岛细胞研究中的应用及其对理解复杂生物过程和疾病的贡献	胰岛细胞及其在葡萄糖稳态中的作用	基因组学	糖尿病	scRNA-seq	NA	RNA测序数据	NA
437	2025-05-15	Characterization of shell field populations in gastropods and their autonomous specification mechanism independent of inter-quartet interactions 2025-Apr-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204538 PMID:40105679	research paper	本研究重新调查了帽贝壳场规范的诱导假说，并识别了发育壳场中的三个细胞群体	发现壳场早期规范在2q来源细胞中基本独立于其他四分体的相互作用	研究仅针对帽贝，可能不适用于其他软体动物	探究软体动物壳场规范的自主性	帽贝的胚胎壳场细胞群体	developmental biology	NA	two-color in situ hybridization, single-cell transcriptome analysis	NA	gene expression data	16-cell embryos of limpets
438	2025-05-15	Deletion of hepcidin disrupts iron homeostasis and hematopoiesis in zebrafish embryogenesis 2025-Apr-01, Development (Cambridge, England) DOI:10.1242/dev.204307 PMID:40110772	research paper	研究通过CRISPR/Cas9系统创建稳定的hamp敲除斑马鱼模型，揭示了hamp在铁调节和造血中的关键作用	首次在斑马鱼模型中揭示了hamp缺失导致母体铁过载，并影响血红蛋白基因表达和血液祖细胞发育	研究仅局限于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物或人类中进行验证	探索hamp在斑马鱼造血过程中的作用及其对铁稳态的影响	斑马鱼胚胎及其血液祖细胞	developmental biology	blood disorders	CRISPR/Cas9系统, 单细胞RNA测序	CRISPR knockout model	genetic and RNA sequencing data	斑马鱼胚胎及其血液祖细胞样本
439	2025-05-15	Microvascular aberrations found in human polycystic kidneys are an early feature in a Pkd1 mutant mouse model 2025-Apr-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.052024 PMID:40114603	研究论文	本研究通过单细胞转录组学、三维成像及多模态磁共振成像技术，探讨了人类多囊肾中微血管异常的特征及其在小鼠模型中的早期表现	首次在人类ADPKD肾脏中鉴定出一种分子特征独特的微血管亚群，并在Pkd1突变小鼠模型中发现了类似的早期血管异常	研究主要关注ADPKD的血管异常，未涉及其他类型肾脏疾病的比较	探究ADPKD肾脏血管异常的起始时间和特征，为靶向血管治疗提供依据	人类ADPKD肾脏及Pkd1突变小鼠模型	数字病理学	多囊肾病	单细胞转录组学、三维成像、多模态磁共振成像	Pkd1突变小鼠模型	图像、转录组数据	人类ADPKD肾脏样本及Pkd1突变小鼠肾脏样本
440	2025-05-15	Insights into the single-cell transcriptome characteristics of porcine endometrium with embryo loss 2025-Mar-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2 DOI:10.1096/fj.202402212RR PMID:40105155	研究论文	本研究通过构建单细胞转录组图谱，揭示了猪子宫内膜在胚胎丢失和成功妊娠状态下的分子特征和细胞亚群差异	首次在猪模型中系统比较胚胎丢失与成功妊娠子宫内膜的单细胞转录组特征，发现纤毛细胞在胚胎丢失组织中更活跃，并揭示了与胚胎附着相关的信号网络差异	研究仅聚焦于围植入期，未涵盖整个妊娠过程；样本量可能有限	探究猪生殖障碍的子宫内膜微环境分子机制	猪子宫内膜组织（胚胎丢失组与成功妊娠组）	单细胞转录组学	生殖障碍	单细胞RNA测序(scRNA-seq)	NA	单细胞转录组数据	未明确说明样本数量（包含胚胎丢失和成功妊娠两组子宫内膜组织）