单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 37711 篇文献,本页显示第 421 - 440 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
421 2026-03-20
A simple liquid 3D cell culture paradigm models oxidative mitochondrial metabolism of epithelial breast cancer cells with relevance for lung metastases
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究比较了两种三维细胞培养模型(乳腺球培养和栓子培养)在模拟乳腺癌细胞生物学特性方面的差异,重点关注其对线粒体氧化代谢和肺转移潜能的影响 开发并验证了一种新型的“栓子培养”三维模型,该模型通过培养基粘度和机械摇动来富集上皮特征,能更好地模拟肿瘤组织的核与线粒体特征,并揭示了其与肺转移相关的独特代谢表型 研究仅使用了三种乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3、MDA-MB-468),且栓子培养模型最初是为炎性乳腺癌设计的,其普遍适用性有待进一步验证 比较和评估不同的三维细胞培养模型在模拟乳腺癌肿瘤生物学、特别是与转移相关的代谢和信号通路方面的适用性 乳腺癌细胞系(SUM149、IBC-3、MDA-MB-468) 数字病理 乳腺癌 蛋白质组学、单细胞转录组学、代谢通量分析、电子显微镜超微结构定量分析 NA 蛋白质组数据、转录组数据、代谢通量数据、电子显微镜图像 三种乳腺癌细胞系 NA 单细胞转录组学 NA NA
422 2026-03-20
Single-cell transcriptomics reveal alveolar macrophages-specific responses in single-hit ozone exposure model in mice
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠肺泡巨噬细胞在不同浓度臭氧暴露下的转录组变化及其功能调控 首次在单细胞分辨率下,系统性地分析了肺泡巨噬细胞对不同浓度臭氧暴露的转录组响应,并识别出浓度依赖性的功能通路变化和亚群异质性 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别或遗传背景差异;臭氧暴露时间固定为3小时,未探索时间依赖性效应;功能验证实验有限 探究肺泡巨噬细胞对臭氧暴露的分子响应机制,特别是不同浓度臭氧下的转录组变化和功能调控 C57BL/6J雄性成年小鼠的肺泡巨噬细胞 单细胞转录组学 呼吸系统疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 C57BL/6J雄性成年小鼠,分为过滤空气暴露组、1 ppm臭氧暴露组和1.5 ppm臭氧暴露组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
423 2026-03-20
KMT2D Regulates Tooth Enamel Development
2025-Jul, Journal of dental research IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过构建KMT2D条件性敲除小鼠模型,揭示了KMT2D通过直接激活成釉细胞分化关键基因在牙釉质发育中的关键作用 首次在体内模型中系统阐明了组蛋白甲基转移酶KMT2D在牙釉质发育中的具体调控机制,并识别了其直接靶向的8个关键基因 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的直接适用性仍需进一步验证 探究KMT2D基因在牙釉质发育(成釉作用)过程中的具体功能与分子机制 KMT2D条件性敲除小鼠的牙釉质、磨牙牙胚及其中涉及的各类细胞亚型 发育生物学与遗传学 牙釉质发育不全(amelogenesis imperfecta) 条件性基因敲除、显微计算机断层扫描、扫描电子显微镜、RNA测序、CUT&RUN测序、单细胞RNA测序分析 条件性敲除小鼠模型 影像数据、组织学数据、RNA测序数据、表观基因组数据 KMT2D条件性敲除小鼠及其对照 NA RNA-seq, CUT&RUN, 单细胞RNA-seq NA NA
424 2026-03-20
Primitive Hepatoblasts Driving Early Liver Development
2025-Jun-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究识别并表征了早期肝发育中一种先前未被认识的原始肝母细胞群体,揭示了其在肝发生中的关键作用 首次发现并命名了原始肝母细胞群体,揭示了其表达肝母细胞和间充质标志物的双重特性,并阐明了WNT抑制在RA许可的CDX2+FOXA2+祖细胞中驱动其出现的机制 原始肝母细胞在晚期胎儿和出生后发育中贡献减少,其长期功能和临床相关性需进一步研究 探究早期肝发育中肝母细胞的异质性和起源机制 小鼠和人类早期肝发育中的肝母细胞群体 发育生物学 NA 单细胞转录组学、谱系追踪、表观遗传和功能扰动研究 NA 转录组数据、谱系追踪数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
425 2026-03-20
Glucagon-like peptide-1 receptor signaling activation in alveolar type II cells enhances lung development in neonatal rats exposed to hyperoxia
2025-05, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了胰高血糖素样肽-1受体(GLP-1R)在新生大鼠高氧暴露模型中通过调节肺泡II型细胞的线粒体分裂和糖代谢促进肺发育的作用机制 首次揭示了GLP-1R在肺泡II型细胞中通过m6A甲基化修饰调控线粒体分裂和糖代谢,从而影响肺发育的新机制 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未在临床样本中验证,且机制研究集中在METTL14介导的m6A修饰,可能存在其他调控途径 探索GLP-1R在调节肺发育中的作用及其潜在机制,特别是在支气管肺发育不良(BPD)模型中的应用 新生Sprague-Dawley大鼠的肺组织、原代肺泡II型细胞和RLE-6TN细胞系 NA 支气管肺发育不良 单细胞RNA测序、Western blotting、免疫荧光染色、Seahorse XF96代谢分析、RT-qPCR、MeRIP-qPCR NA 基因表达数据、蛋白质表达数据、代谢数据 新生大鼠分组(高氧组与对照组),在出生后3、7、10、14天提取肺组织,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
426 2026-03-20
Extracellular vesicle-packaged GBP2 from macrophages aggravates sepsis-induced acute lung injury by promoting ferroptosis in pulmonary vascular endothelial cells
2025-05, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了巨噬细胞来源的细胞外囊泡通过递送GBP2蛋白,与OTUD5结合并促进GPX4泛素化,从而诱导肺血管内皮细胞铁死亡,加剧脓毒症诱导的急性肺损伤的机制 首次发现巨噬细胞来源的EVs通过GBP2-OTUD5-GPX4轴驱动内皮细胞铁死亡,并筛选出靶向GBP2的小分子化合物Plantainoside D,为si-ALI提供了新的治疗靶点 研究主要在细胞和小鼠模型中进行,临床转化潜力需进一步验证;GBP2在其他细胞类型中的作用未明确 阐明巨噬细胞来源的细胞外囊泡在脓毒症诱导的急性肺损伤中的作用机制,并探索潜在治疗策略 巨噬细胞(THP-1、RAW264.7)、肺血管内皮细胞、脓毒症患者外周血样本、CLP小鼠模型 分子病理学 脓毒症诱导的急性肺损伤 蛋白质组测序、转录组测序、单细胞测序、RNA干扰、腺相关病毒转染、分子对接、分子动力学模拟、细胞热位移分析 NA 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 脓毒症患者外周血样本、细胞系(THP-1、RAW264.7)、CLP小鼠模型 NA 单细胞测序 NA NA
427 2026-03-20
Transcriptional profiles of mouse oligodendrocyte precursor cells across the lifespan
2025-Apr, Nature aging IF:17.0Q1
研究论文 本研究通过构建转基因小鼠品系并进行单细胞RNA测序,揭示了少突胶质前体细胞在整个生命周期中从静息到增殖和分化关键转变的转录变化 构建了Matn4-mEGFP转基因小鼠品系,首次在单细胞分辨率下解析了OPCs在整个生命周期中不同状态下的转录组变化,并发现衰老通过激活HIF-1α和WNT通路影响OPCs功能 研究主要基于小鼠模型,人体OPCs的衰老机制可能有所不同;体外药理学实验的结果需要在体内模型中进一步验证 探究衰老如何影响少突胶质前体细胞的增殖和分化能力,及其对髓鞘稳态和修复的影响 小鼠少突胶质前体细胞 单细胞组学 神经系统衰老相关疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 跨多个年龄段的皮质OPCs单细胞测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
428 2026-03-20
EGR1 regulates oxidative stress and aldosterone production in adrenal cells and aldosterone-producing adenomas
2025-03, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了早期生长反应蛋白1(EGR1)在肾上腺细胞中调控氧化应激和醛固酮生产的双重作用,并探讨了其在醛固酮产生腺瘤(APAs)发病机制中的潜在意义 首次发现EGR1在肾上腺细胞中同时调控氧化应激和醛固酮生产,并利用空间转录组学技术揭示了其在APAs中的表达下调与氧化应激标志物减少相关 研究主要基于体外细胞实验和动物模型,人类样本分析有限,且EGR1表达与氧化应激之间的具体分子机制尚未完全阐明 探究EGR1在肾上腺细胞氧化应激和醛固酮生产调控中的作用,及其在醛固酮产生腺瘤发病机制中的潜在角色 人类肾上腺细胞、醛固酮产生腺瘤患者肾上腺组织、猪的肾上腺皮质 数字病理学 肾上腺肿瘤 RNA测序、空间转录组学、免疫染色 NA 基因表达数据、空间转录组数据、免疫组织化学图像 人类肾上腺细胞、APA患者肾上腺组织、猪肾上腺组织 NA 空间转录组学 NA NA
429 2026-03-20
Desflurane attenuates renal ischemia-reperfusion injury by modulating ITGB1/CD9 and reducing oxidative stress in tubular epithelial cells
2025-03, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了地氟醚通过调节ITGB1/CD9信号通路和减轻氧化损伤,在肾脏缺血再灌注损伤中的保护作用 首次揭示了地氟醚通过调控ITGB1/CD9轴减轻肾脏缺血再灌注损伤的分子机制 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体中进行验证 探究地氟醚对肾脏缺血再灌注损伤的保护作用及其分子机制 肾小管上皮细胞和小鼠肾脏缺血再灌注模型 单细胞组学 肾脏疾病 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR, Western blot, TUNEL检测 小鼠模型 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 蛋白质表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
430 2026-03-20
GAMG alleviates liver fibrosis through inducing ferroptosis in inflammatory macrophages via the IRF1/SLC7A11 signaling pathway
2025-03, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究探讨了天然化合物GAMG通过IRF1/SLC7A11信号通路诱导炎症巨噬细胞铁死亡,从而缓解肝纤维化的作用机制 首次揭示了GAMG通过激活IRF1/SLC7A11轴诱导炎症巨噬细胞铁死亡来治疗肝纤维化的新机制 NA 探究GAMG对肝纤维化的治疗作用及其分子机制 肝纤维化小鼠模型及炎症巨噬细胞 NA 肝纤维化 单细胞RNA测序, 质谱代谢组学分析 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
431 2026-03-20
Inhibition of glutathione peroxidase 4 suppresses gastric cancer peritoneal metastasis via regulation of RCC2 homeostasis
2025-03, Redox biology IF:10.7Q1
研究论文 本研究揭示了谷胱甘肽过氧化物酶4(GPx4)通过调节RCC2的稳态来驱动胃癌腹膜转移的分子机制 首次阐明了GPx4通过ROS积累激活Aurora A磷酸化,进而导致RCC2在K377位点泛素化降解,从而抑制胃癌腹膜转移的具体信号通路 研究主要基于体外和体内实验模型,临床样本验证的规模可能有限,且具体治疗策略的转化潜力有待进一步评估 探究GPx4在胃癌进展和转移中的作用机制,并寻找新的治疗靶点 胃癌细胞及临床样本 肿瘤生物学 胃癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq),蛋白质组学分析 NA 基因表达数据,蛋白质数据 回顾性临床样本及实验模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
432 2026-03-20
A comparative study of statistical methods for identifying differentially expressed genes in spatial transcriptomics
2025-Feb-22, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文比较了空间转录组学中识别差异表达基因的统计方法,并提出了一种基于广义估计方程框架的广义得分检验作为稳健解决方案 提出了一种新的广义得分检验方法,有效整合空间相关性,以克服现有方法如Wilcoxon秩和检验在空间转录组数据分析中的局限性 研究主要基于模拟数据和特定癌症数据集,可能未涵盖所有空间转录组学应用场景或组织类型 比较并改进空间转录组学中差异表达基因识别的统计方法,以提高分析准确性 空间转录组学数据,特别是来自乳腺癌和前列腺癌的数据集 空间转录组学 乳腺癌, 前列腺癌 空间转录组学 广义估计方程, Wilcoxon秩和检验, 稳健Wald检验 空间转录组学数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
433 2026-03-20
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了Seq-Scope-X技术,一种结合组织膨胀的测序空间转录组学方法,实现了亚微米级分辨率,超越传统光学限制 通过物理组织膨胀技术,Seq-Scope-X将空间特征密度提升一个数量级,首次在肝脏组织中实现单细胞核质区室分辨,并揭示代谢角色动态转换 未明确说明技术在不同组织类型中的普适性验证范围及样本量细节 开发超高分率空间组学技术以突破测序空间转录组学的分辨率限制 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏及人类扁桃体组织 空间转录组学 NA 测序空间转录组学、组织膨胀技术、空间蛋白质组分析 NA 空间转录组数据、蛋白质组数据 NA NA 单细胞空间转录组学、空间蛋白质组学 Seq-Scope-X 基于Seq-Scope的亚微米级分辨率组织膨胀改良系统
434 2026-03-20
The quality of SIV-specific fCD8 T cells limits SIV RNA production in Tfh cells during antiretroviral therapy
2025-01-31, Journal of virology IF:4.0Q2
研究论文 本研究通过建立SIV慢性感染cART模型,揭示了SIV-Gag特异性fCD8 T细胞的质量与Tfh细胞中SIV RNA产量之间的负相关关系,特别是在cART治疗或自然控制者中 首次在SIV感染猕猴模型中,结合组织切片分析和单细胞测序,系统研究了不同感染状态下(未治疗、cART治疗、自然控制)Tfh和fCD8 T细胞的特性,并揭示了cART下fCD8 T细胞更易耗竭和免疫衰老的转录组特征 研究样本量较小(15只猕猴),且为动物模型,结果向人类HIV感染的直接外推需谨慎 探究在慢性持续性HIV/SIV感染中,淋巴组织内HIV/SIV特异性滤泡CD8 T细胞(fCD8 T细胞)对潜伏感染细胞(主要存在于滤泡辅助T细胞,Tfh)的影响,以寻找潜在的治愈策略 15只感染SIVmac239的食蟹猴,分为进展者(8只,建立慢性期cART模型)和自然控制者(7只) 传染病学,免疫学 HIV/SIV感染 单细胞RNA测序(scRNA-seq),激活诱导标记物(AIMs)分析,组织切片分析 NA 单细胞转录组数据,流式细胞术数据,组织学数据 15只食蟹猴 NA 单细胞RNA-seq NA NA
435 2026-03-20
Single-Cell Analysis of Subcutaneous Fat Reveals Profibrotic Cells That Correlate With Visceral Adiposity in HIV
2024-Dec-18, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
研究论文 本研究通过单细胞分析揭示了HIV感染者皮下脂肪中与内脏脂肪体积相关的促纤维化细胞变化 首次在HIV感染者中利用单细胞RNA测序技术,系统性地分析了皮下脂肪组织细胞组成和转录程序与内脏脂肪体积的关联 研究为横断面设计,无法确定因果关系,需要进一步的纵向研究来明确方向性和机制 探究HIV感染者皮下脂肪组织特异性细胞和分子程序与内脏脂肪体积的关系 接受长期抗逆转录病毒治疗的HIV感染者 数字病理学 心血管代谢疾病 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,计算机断层扫描 NA RNA测序数据,影像数据 92名参与者进行bulk RNA测序,43名进行单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
436 2026-03-20
Altered Purinergic Signaling and CD8+ T Cell Dysregulation in STAT3 GOF Syndrome
2024-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文探讨了STAT3功能获得性突变综合征中CD8+ T细胞功能失调与嘌呤信号通路异常的关系 揭示了STAT3 GOF变异通过改变嘌呤信号通路(CD39上调,CD73和A2AR下调)导致CD8+ T细胞功能失调的新机制 研究主要基于患者样本和小鼠模型,具体分子机制仍需进一步阐明 研究STAT3 GOF变异如何驱动CD8+ T细胞病理学机制 STAT3 GOF综合征患者和小鼠模型中的CD8+ T细胞 免疫学 原发性免疫调节障碍 单细胞RNA测序,高维免疫分析,功能评估 NA 基因表达数据,功能数据 STAT3 GOF患者和小鼠模型样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
437 2026-03-20
The astrocyte-enriched gene deathstar plays a crucial role in the development, locomotion, and lifespan of D. melanogaster
2024-12, Fly IF:2.4Q3
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,在果蝇大脑中鉴定出一个星形胶质细胞富集表达的新基因deathstar,并揭示了其在个体发育、运动能力和寿命中的关键作用 首次在果蝇中鉴定出星形胶质细胞特异性表达的新基因deathstar,并系统阐明了其在发育、运动行为和寿命调控中的生理功能 研究主要基于果蝇模型,其发现向哺乳动物系统的直接推广性有待验证;RNA干扰技术可能存在脱靶效应 探究果蝇大脑星形胶质细胞特异性表达基因的功能及其在生理和行为调控中的作用 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)的大脑组织,特别是星形胶质细胞 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序,RNA干扰,免疫染色 NA 单细胞基因表达数据,图像数据 果蝇视叶和全脑的单细胞RNA测序数据,转基因成年果蝇脑组织样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
438 2026-03-20
Optimization of hybridization chain reaction for imaging single RNA molecules in Drosophila larvae
2024-12, Fly IF:2.4Q3
研究论文 本文提出了一种优化的杂交链式反应(HCR)流程,用于在果蝇幼虫中实现单RNA分子的成像 开发了优化的HCR探针设计开源代码,仅需五对探针即可实现高特异性、高灵敏度且可多重检测的RNA可视化,显著降低了实验成本和时间 未明确说明该方法在其他生物体系或更复杂组织中的适用性,也未提供与其他现有成像方法的定量比较数据 优化单RNA分子成像技术,以支持基于单细胞RNA测序数据的筛选项目 果蝇幼虫中的特定RNA分子 分子成像 NA 杂交链式反应(HCR) NA 图像 NA NA NA NA NA
439 2026-03-20
Attenuated kidney oxidative metabolism in young adults with type 1 diabetes
2024-Oct-22, The Journal of clinical investigation IF:13.3Q1
研究论文 本研究探讨了1型糖尿病年轻成人患者肾脏氧化代谢减弱与胰岛素敏感性及早期肾脏结构变化的关系 首次在1型糖尿病年轻成人中,结合高胰岛素-正常血糖钳夹、多模态成像、肾脏活检、单细胞RNA测序和空间代谢组学,系统揭示了近端肾小管细胞从稳定状态向适应/适应不良亚型转变的谱系,并发现其与氧化代谢减弱和早期肾脏结构损伤相关 样本量相对较小(T1D组30人,健康对照组20人),且研究对象为年轻成人,结果可能无法推广至其他年龄段的1型糖尿病患者或疾病晚期阶段 探究1型糖尿病中胰岛素敏感性受损是否通过改变肾脏氧化代谢而促进糖尿病肾病的发生 年轻1型糖尿病成人患者和健康对照者 数字病理学 糖尿病肾病 单细胞RNA测序,空间代谢组学,高胰岛素-正常血糖钳夹,MRI,11C-乙酸盐PET,肾脏活检 Slingshot算法(用于伪时间轨迹分析) 单细胞转录组数据,空间代谢组数据,影像数据,临床生化数据 1型糖尿病患者30人,健康对照20人 NA 单细胞RNA-seq,空间代谢组学 NA NA
440 2026-03-20
FAT1 as a tumor mutation burden specific gene affects the immunotherapy effect in head and neck squamous cell cancer
2024-09, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 本研究探讨了FAT1基因突变作为头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性标志物,及其对免疫治疗效果的影响 首次在头颈部鳞状细胞癌中揭示FAT1基因突变与高肿瘤突变负荷及免疫治疗耐药性的特异性关联,并利用单细胞RNA测序技术解析了高TMB样本中免疫微环境的特征细胞群 样本量较小(仅33例患者),且为单中心研究,需要更大规模的多中心队列进行验证 探究头颈部鳞状细胞癌中肿瘤突变负荷的特异性遗传突变及其对免疫治疗反应的影响机制 头颈部鳞状细胞癌患者 肿瘤免疫学 头颈部鳞状细胞癌 二代测序,单细胞RNA测序,转录组分析 NA 基因组测序数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 33例头颈部鳞状细胞癌患者 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
回到顶部