单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 41858 篇文献,本页显示第 4361 - 4380 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4361 2026-05-29
Interpretable Multi-task Analysis of Single-Cell RNA-seq Data Through Topological Structure Preservation and Data Denoising
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出一个名为scIMTA的可解释多任务分析框架,用于单细胞RNA-seq数据的拓扑结构保持和数据降噪 scIMTA实现了稀疏高噪声基因表达数据的协同多任务分析,通过生物学基础增强可解释性,并在保持数据完整性的同时稳健处理丢失事件 未提及具体局限 开发一个可解释的多任务分析框架,解决单细胞RNA-seq数据中的拓扑结构保持和丢失事件问题 乳腺癌单细胞RNA-seq数据集 机器学习 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4362 2026-05-29
scRNA-Seq reveals anti-lymphoma immune responses in mogamulizumab-associated skin eruptions
2026-Jun, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV IF:8.4Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示mogamulizumab相关皮肤疹中的抗淋巴瘤免疫反应 首次对mogamulizumab相关皮疹进行全面的分子表征,发现残余恶性克隆呈现沉默免疫表型,并伴随潜在的抗肿瘤免疫反应 样本量较小(仅4例MAR患者),未明确说明机制验证实验 阐明mogamulizumab相关皮疹的分子特征及其与更好总生存期的关联机制 mogamulizumab相关皮疹患者的皮肤活检组织 单细胞测序 皮肤T细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 4例MAR患者,6例未治疗红皮病性CTCL患者,4例健康对照 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4363 2026-05-29
Heterogeneity of the adult mammalian forebrain neurogenic ependyma: A comprehensive cellular map
2026-Jun-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 利用单细胞RNA测序构建成年小鼠前脑室管膜表面的完整细胞图谱,揭示其细胞异质性 首次通过全组织单细胞RNA测序系统鉴定成年小鼠前脑室管膜表面的12种不同细胞亚型,并精细刻画了CD133+与CD133-细胞的分子特征分类 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证;未探讨不同细胞亚型的功能差异及神经干细胞潜能的具体机制 阐明成年哺乳动物前脑室管膜细胞的组成异质性,为解决神经干细胞存在争议提供新视角 成年小鼠前脑侧脑室侧壁的室管膜表面细胞 单细胞组学 神经系统疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 成年小鼠的侧脑室侧壁整体组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4364 2026-05-29
Characterization of p16-positive stromal cells in age-related cardiac disorders
2026-Jun-01, Journal of biochemistry IF:2.1Q4
研究论文 通过单细胞RNA测序分析衰老心脏中p16阳性基质细胞的特征及其在心脏纤维化中的作用 首次利用p16-Tom小鼠模型在单细胞水平上表征p16阳性成纤维细胞在年龄相关心脏纤维化中的转录组特征,并证明选择性清除这些细胞可减轻纤维化 未提供 探究p16阳性基质细胞在年龄相关心脏疾病中的功能与机制 衰老p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠的心脏成纤维细胞 单细胞生物学 心血管疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 老年p16-Tom小鼠和p16-Col1a2-LRTD小鼠 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium单细胞RNA测序平台
4365 2026-05-29
Enhanced endocrine-metabolic support and axonemal assembly in high-sperm-motility geese: insights from testicular cellular heterogeneity by scRNA-seq
2026-Jun, Poultry science IF:3.8Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示高精子运动能力鹅的睾丸细胞异质性,发现内分泌-代谢支持及轴丝组装增强与精子运动能力相关 首次在鹅中利用单细胞转录组学解析精子运动能力差异的细胞基础,发现支持细胞和间质细胞的内分泌-代谢增强及圆形精子的轴丝组装程序上调 样本量较小(每组3只),且仅关注生理范围内的精子运动能力差异,未涉及极端低活力情况 探究鹅精子运动能力差异的睾丸细胞和分子基础 60只鹅中精子运动能力最高和最低的10%各6只,其中3只用于单细胞RNA测序 单细胞转录组学 不适用 单细胞RNA测序 不适用 单细胞转录组数据 12只鹅用于表型比较,6只用于单细胞测序 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
4366 2026-05-29
stGNN: Spatially Informed Cell-Type Deconvolution Based on Deep Graph Learning and Statistical Modeling
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出基于深度图学习和统计建模的stGNN方法,用于空间转录组数据的细胞类型反卷积 创新性地结合图卷积网络与自编码器的双编码模块,以及自适应注意力机制,从低阶到高阶捕捉多尺度空间结构;采用负对数似然损失函数对齐ST与scRNA-seq参考数据的分布 依赖性于高质量scRNA-seq参考数据;未明确讨论计算效率或大规模数据扩展性 开发利用空间信息的细胞类型反卷积方法,提升空间转录组数据中细胞类型组成预测准确性 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等多个平台的六套空间转录组数据集,以及小鼠脑组织样本 机器学习 NA 空间转录组测序 图卷积网络、自编码器 空间转录组基因表达数据 六套来自多种平台的空间转录组数据集 10x Genomics 空间转录组学 10x Visium, Slide-seqV2, Visium HD 10x Visium、Slide-seqV2、Visium HD等不同分辨率的空间转录组平台
4367 2026-05-29
A Novel Dual-Level Momentum Distillation Method with Extreme Thresholding for Imputing Single-Cell RNA Sequencing Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出了一种名为MoDET的新方法,用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值,以提高数据质量和后续分析准确性 提出双重水平动量蒸馏与极端阈值机制相结合的方法,有效提升了细胞表征学习能力和对稀有细胞类型的识别精度 未提及跨平台或更大规模数据集验证,且对极端阈值机制的普适性未作深入讨论 解决单细胞RNA测序数据因缺失现象导致的稀疏性问题,提升下游聚类分析和稀有细胞类型识别的准确性 单细胞RNA测序数据中的基因表达矩阵 机器学习 NA scRNA-seq 双重水平动量蒸馏模型 基因表达矩阵 七个真实世界数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4368 2026-05-29
Joint Low Rank Representation with Symmetric Orthogonal Decomposition for Clustering of scRNA-seq Data
2026-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
研究论文 提出一种结合低秩表示与对称正交分解的单细胞RNA测序数据聚类新方法LRRS 引入新的正交对称分解策略,无需预设聚类数量,通过测量正交空间下的加权距离自适应表征局部特性 未在更大规模或更复杂的数据集上验证,且迭代优化方法可能增加计算复杂度 开发高效的单细胞RNA测序数据聚类方法以准确识别细胞类型,揭示复杂疾病分子机制 单细胞RNA测序数据中的细胞类型组成 机器学习 NA 单细胞RNA测序 低秩表示与对称正交分解模型 基因表达数据 11个基准数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4369 2026-05-29
scFAST-seq reveals a wide diversity of transcripts, CNV events, and regulatory activity in adrenocortical tumor
2026-May-28, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 比较10X Chromium 3' scRNA-seq和SeekGene scFAST-seq在肾上腺皮质肿瘤配对样本中的表现,发现scFAST-seq检测到更多长链非编码RNA、基因和转录本 首次系统比较scFAST-seq与主流10X Chromium 3' scRNA-seq技术在肾上腺皮质肿瘤单细胞转录组分析中的差异,揭示了scFAST-seq在检测长链非编码RNA、基因和转录本方面的优势 仅使用两个配对样本,样本量较小;未对不同肿瘤类型的适用性进行验证;对RNA动态和拷贝数变异检测差异的机制解释不够深入 比较两种高通量液滴式单细胞RNA测序技术在肾上腺皮质肿瘤研究中的性能差异 来自肾上腺皮质肿瘤的两个配对样本 单细胞转录组学 肾上腺皮质肿瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 两个肾上腺皮质肿瘤配对样本 10x Genomics, SeekGene 单细胞RNA-seq 10x Chromium 3', SeekGene scFAST-seq 10x Chromium 3' 单细胞RNA测序, SeekGene scFAST-seq单细胞RNA测序
4370 2026-05-29
Intrathecal Allogeneic B7-H3-targeted CAR γδ T Cells for Leptomeningeal Metastasis from Solid Tumors: Safety, Efficacy, and Immunological Dynamics in a Phase 1 Trial
2026-May-28, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 评估异体B7-H3靶向嵌合抗原受体γδ T细胞鞘内注射治疗软脑膜转移瘤的安全性、有效性和免疫动力学 首次在临床试验中评估异体B7-H3-CAR γδ T细胞疗法通过鞘内给药治疗软脑膜转移瘤,并展示了早期安全性、临床活性、局部持久性和IFN-γ相关的脑脊液免疫重塑 样本量小,仅有三名患者,且为单臂试验,缺乏对照组,初步概念验证性质 评估鞘内注射异体B7-H3靶向CAR γδ T细胞治疗软脑膜转移瘤的临床反应、安全性、总生存期、生活质量和药代动力学/药效学特征 三名来自B7-H3阳性实体瘤的软脑膜转移瘤患者,包括两名肺腺癌患者和一名三阴性乳腺癌患者 机器学习 肺癌, 乳腺癌 单细胞测序 NA 文本 3名患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4371 2026-05-29
Protocol for the isolation of human buccal cells for single-cell applications
2026-May-27, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 描述了一种从人体颊粘膜活检组织中分离高活力单细胞悬浮液的温和解离方案,适用于单细胞应用 结合可控酶消化(胶原酶和核酸酶)与优化的速度、温度和孵育时间,高效释放异质性细胞群同时最小化细胞损伤,获得≥80%活力的单细胞悬浮液 NA 建立一种可靠的人体颊粘膜细胞分离方案用于单细胞RNA测序和流式细胞术 人体颊粘膜活检组织中的上皮细胞、基质细胞和驻留免疫细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、细胞表型数据 未明确说明 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4372 2026-05-29
AdPrST:An Adversarial Graph Deep Learning Pre-clustering Framework for Deciphering Spatiotemporal Structures in Spatially Resolved Transcriptomics
2026-May-27, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 提出一种名为AdPrST的对抗性图深度学习预聚类框架,用于从空间分辨转录组学数据中解码时空结构,包括空间域识别、轨迹推断和伪时空图谱构建 通过对抗性自监督对比学习结合Wasserstein距离GAN和双重视图图结构,实现鲁棒的时空结构推断 未明确提及 解决空间分辨转录组学中复杂组织时空结构推断的挑战 空间分辨转录组学数据中的空间域、发育轨迹和时空特征 数字病理学 未指定 空间转录组学 生成对抗网络 基因表达数据 多个数据集 NA 空间转录组学 NA NA
4373 2026-05-29
Recurrence in the chemotherapy regimen of bladder carcinoma originates from quiescent epidermoid-like cells
2026-May-27, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 通过整合高分辨率CRISPR/Cas9进化谱系追踪与单细胞RNA测序,研究膀胱癌在化疗下的演化及复发机制 首次识别出类表皮样细胞状态群体作为化疗后复发的起源,并揭示其可塑性和进化动态 未提及局限性 解析膀胱癌在化疗过程中自然进展和复发的关键事件与进化动力学 膀胱癌小鼠模型的肿瘤细胞 机器学习 膀胱癌 CRISPR/Cas9谱系追踪、单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 小鼠模型中的肿瘤样本 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
4374 2026-05-29
Microglial state transitions dominate the brain immune response in the subacute phase after cardiac arrest
2026-May-27, Journal of neuroinflammation IF:9.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示心脏骤停后亚急性期大脑免疫反应中小胶质细胞状态的转变 首次描绘了心脏骤停后年轻和老年大脑在第三天的免疫景观,发现了五类心脏骤停相关小胶质细胞状态,并揭示了SPP1阳性小胶质细胞的时空动态特征 未提及具体局限 探究心脏骤停后大脑免疫反应中不同免疫细胞群体的贡献 心脏骤停后小鼠大脑免疫细胞 单细胞组学 心脏骤停相关脑损伤 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 年轻和老年小鼠(未具体说明数量) NA 单细胞RNA测序 NA NA
4375 2026-05-29
Syrosingopine enhances immune checkpoint blockade efficacy by inhibition of MCTs and metabolic reprogramming in triple-negative breast cancer
2026-May-26, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
研究论文 研究西罗辛平通过抑制MCTs和代谢重编程增强三阴性乳腺癌免疫检查点阻断疗效 首次证明双MCT1/MCT4抑制剂西罗辛平可通过阻断乳酸输出重新编程肿瘤微环境,增强抗肿瘤免疫,与抗PD-1协同抑制三阴性乳腺癌生长 基于模型和细胞系研究,临床验证尚需进一步开展 探索MCT抑制作为三阴性乳腺癌免疫治疗增敏策略的潜力 三阴性乳腺癌肿瘤细胞、CD8 T细胞、NK细胞、免疫活性小鼠模型 数字病理学 三阴性乳腺癌 批量转录组学、单细胞转录组学、组织分析 NA 转录组数据、组织切片数据 多个三阴性乳腺癌模型和免疫活性小鼠模型 NA NA NA NA
4376 2026-05-29
Characterization of natural killer (NK) cells in lung adenocarcinoma and construction of an NK risk signature based on single-cell and macromolecular RNA-seg data
2026-May-25, Discover oncology IF:2.8Q2
研究论文 基于单细胞和大分子RNA测序数据,研究肺腺癌中自然杀伤细胞的特性并构建其风险特征 首次利用单细胞RNA测序数据识别肺腺癌中NK细胞亚群,并建立基于NK细胞相关基因的风险特征用于预后预测 该研究主要基于公共数据库的数据,尚未在独立外部队列中进行验证 分析肺腺癌中NK细胞特征并建立基于NK细胞的风险特征以预测患者预后 肺腺癌患者的NK细胞及其基因表达数据 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 Cox回归, Lasso回归 基因表达数据 未明确指定样本数量 NA 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 NA NA
4377 2026-05-29
Targeting VEGF signaling and stromal remodeling enhances chemoimmunotherapy efficacy in esophageal cancer
2026-May-22, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 本研究整合单细胞RNA测序、免疫组库分析和空间转录组学,揭示了靶向VEGF信号和基质重塑可增强食管癌化学免疫治疗疗效,并识别出关键的基质细胞亚群 首次通过多组学整合分析揭示化疗免疫治疗后食管鳞癌肿瘤微环境中基质细胞(如ACKR1+内皮细胞和CFD+癌症相关成纤维细胞)的动态变化及其与治疗反应的关系,并发现VGFA信号驱动RGCC+内皮细胞和MMP11+癌症相关成纤维细胞协同形成免疫抑制微环境 样本量较小(9例患者),主要依赖计算分析结果,功能验证仍需进一步扩展 阐明新辅助化学免疫疗法在食管鳞癌中疗效的微环境驱动机制,为优化治疗方案提供理论基础 食管鳞癌患者肿瘤组织样本 机器学习和数字病理学 食管癌 单细胞RNA测序、免疫组库分析、空间转录组学 集成聚类、基因集富集分析、T细胞受体库表征、拷贝数估计、细胞间通讯推断 单细胞转录组数据、免疫组库数据、空间转录组数据 9例食管鳞癌患者,共18个样本 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 10x Chromium单细胞3'测序和10x Visium空间转录组学
4378 2026-05-29
Defining Clock Neurons Within Distributed Circadian Circuits Through Multiscale Technologies
2026-May-22, Journal of biological rhythms IF:2.9Q2
综述 通过整合多尺度技术,重新定义哺乳动物大脑中分布在多个脑区的昼夜节律时钟神经元 提出一个操作性框架,包含分子振荡、自主性、生理节律性和回路影响四个标准来识别时钟神经元,挑战传统的主时钟-外周模型 未提供具体实验数据验证框架,主要基于已有文献的综合分析 明确昼夜节律时钟神经元的定义,并绘制大脑中分布的昼夜节律回路 哺乳动物大脑中具有内在昼夜节律特性的神经元 神经科学 神经系统疾病、神经退行性疾病 单细胞转录组学、回路追踪、神经元操控 NA 分子数据、细胞数据、系统生物学数据 NA NA NA NA NA
4379 2026-05-29
Aberrant p53 fuels macrophage immunoregulatory polarization and refractory clinical outcome in urothelial carcinoma
2026-May-20, Journal for immunotherapy of cancer IF:10.3Q1
研究论文 研究异常p53状态如何驱动尿路上皮癌中肿瘤相关巨噬细胞的免疫调节极化和不良临床结局 首次整合单细胞RNA测序、免疫组化和流式细胞术,系统描绘p53突变与异常表达对巨噬细胞表型异质性和代谢重编程的影响,并揭示SPP1-CD44轴介导的协同免疫抑制网络 未提及具体不足之处 阐明异常p53状态(含TP53突变和p53异常表达)与肿瘤相关巨噬细胞表型和功能异质性之间的关联及其对免疫微环境的影响 尿路上皮癌患者肿瘤组织中的肿瘤相关巨噬细胞和CD4+ T细胞 机器学习 尿路上皮癌 单细胞RNA测序、免疫组化、流式细胞术 NA 单细胞转录组数据、免疫组化图像、流式细胞术数据 962例尿路上皮癌患者的多队列数据集 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Chromium Single Cell 3'
4380 2026-05-29
Identification of metabolism-associated molecular classification and prognostic genes for medulloblastoma based on bioinformatics analysis
2026-May-18, Clinics (Sao Paulo, Brazil)
研究论文 通过生物信息学分析鉴定与代谢相关的髓母细胞瘤分子分型和预后基因 基于代谢特征对髓母细胞瘤进行分子分型,补充了现有亚型分类的代谢视角,并建立了17基因代谢相关预后预测模型 17基因特征需要额外的多中心验证以确认其临床实用性 探究代谢相关基因在髓母细胞瘤病理生理机制中的作用,并建立代谢相关的分子分型和预后预测模型 髓母细胞瘤样本 机器学习 髓母细胞瘤 转录组测序、单细胞RNA测序 非负矩阵分解聚类 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、RNA测序数据 599个髓母细胞瘤样本(训练集400个,测试集199个),74个验证样本,8个单细胞RNA测序样本,37个RNA测序样本 NA 批量RNA测序, 单细胞RNA测序 NA NA
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