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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4361 | 2026-01-10 |
Single-Cell Sequencing Uncovers a TMSB10-Expressing Fibroblast Subpopulation Driving Renal Fibrosis in Diabetic Nephropathy
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S559695
PMID:41497884
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,识别并验证了在糖尿病肾病中驱动肾纤维化的TMSB10高表达成纤维细胞亚群 | 首次在糖尿病肾病中鉴定出TMSB10高表达的成纤维细胞亚群,并揭示其通过TGF-β/SMAD通路调控纤维化的新机制 | 样本量有限,且使用小鼠成纤维细胞模型进行验证,需在人类原代细胞中进一步确认 | 阐明糖尿病肾病中肾纤维化的细胞和分子驱动因素 | 人类糖尿病肾病及对照肾脏样本,以及NIH-3T3成纤维细胞和糖尿病小鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4362 | 2026-01-10 |
Single-Cell Transcriptomics Reveal Microenvironment Alterations in Canine Peri-Implantitis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9937505
PMID:41498023
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研究论文 | 本研究通过建立犬类种植体周围炎模型,利用单细胞RNA测序技术首次在单细胞分辨率下比较了软硬组织在疾病中的重塑过程,揭示了牙龈和牙槽骨微环境中不同的炎症相关细胞亚群扩增和信号通路 | 首次在单细胞分辨率下提供了种植体周围炎软硬组织重塑的比较图谱,发现了牙龈和牙槽骨微环境中独特的细胞亚群扩增(如IL6+/IL18BP+内皮细胞、CXCL8+成纤维细胞)以及牙槽骨中APOD+成纤维细胞驱动的C3-C3AR1信号通路 | 研究基于犬类模型,其向人类临床的转化仍需进一步验证;样本量可能有限;流式细胞术验证虽补充了发现,但功能实验有待深入 | 探究种植体周围炎在牙龈和牙槽骨微环境中的组织特异性异质性和分子细胞动力学,以寻找潜在治疗靶点并验证犬类模型的转化相关性 | 比格犬的牙龈和牙槽骨组织(来自疾病模型和健康对照) | 数字病理学 | 种植体周围炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据 | 比格犬模型中的牙龈和牙槽骨组织样本(具体数量未在摘要中明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4363 | 2026-01-10 |
Mitochondrial Dysfunction and Immune Cell Infiltration in Diabetic Kidney Disease: A Mendelian Randomization and Multiomics Study
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/5592084
PMID:41498039
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化和多组学方法,探讨了线粒体功能障碍和免疫细胞浸润在糖尿病肾病发病机制中的因果作用和复杂相互作用 | 结合孟德尔随机化、单细胞RNA测序和外周血单核细胞分析,首次系统性地揭示了特定线粒体基因表达与免疫细胞特征在糖尿病肾病中的因果关联和介导作用 | 研究主要基于观察性数据和遗传学关联,需要进一步的实验验证来确认因果机制 | 阐明线粒体功能障碍和免疫细胞浸润在糖尿病肾病发病中的因果作用和分子机制 | 糖尿病肾病患者、肾脏组织中的足细胞和肾小管细胞、外周血单核细胞 | 生物信息学 | 糖尿病肾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 差异基因表达分析 | NA | 遗传学数据, 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及糖尿病肾病患者的肾脏组织和外周血单核细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4364 | 2026-01-10 |
Neuroepithelial cell transforming 1 as a key regulator in non-small cell lung cancer: unveiling causal links and therapeutic potentials
2024-Nov-30, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-587
PMID:39697721
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验室实验,探索了神经上皮细胞转化基因1(NET1)在非小细胞肺癌(NSCLC)进展中的关键调控作用及其治疗潜力 | 结合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和孟德尔随机化(MR)算法,首次揭示了NET1与NSCLC之间的因果关系,并验证了其在细胞增殖和抑制铁死亡中的作用,同时通过分子对接分析识别了潜在治疗化合物 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内动物模型或临床样本的进一步验证,且分子对接结果需实验确认 | 揭示NSCLC进展的分子机制,并探索潜在的治疗靶点和药物 | 非小细胞肺癌(NSCLC)相关基因和细胞过程 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、孟德尔随机化(MR)、qRT-PCR、细胞活力测定、MDA检测、分子对接 | NA | 基因表达数据、细胞实验数据 | 未明确指定样本数量,但涉及非恶性肺组织和肿瘤的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4365 | 2026-01-10 |
Genome-wide identification and expression analysis of heat shock protein gene family in cassava
2023-12, The plant genome
DOI:10.1002/tpg2.20407
PMID:37899677
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研究论文 | 本研究通过全基因组分析,识别了木薯中的225个热休克蛋白基因,并利用转录组和单细胞转录组数据分析了它们的表达模式 | 首次在木薯中系统鉴定热休克蛋白基因家族,结合单细胞转录组数据揭示基因表达特异性 | 研究主要基于生物信息学预测和表达分析,缺乏直接的实验功能验证 | 探究木薯热休克蛋白基因家族的功能特征和进化关系 | 木薯(Manihot esculenta)中的热休克蛋白基因家族 | 植物分子生物学 | NA | 全基因组鉴定、转录组分析、单细胞转录组测序、qRT-PCR | NA | 基因组序列、转录组数据、单细胞转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4366 | 2026-01-10 |
Single-cell transcriptomic analyses reveal cellular and molecular patterns of rubber tree response to early powdery mildew infection
2023-07, Plant, cell & environment
DOI:10.1111/pce.14585
PMID:36929646
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,首次构建了橡胶树叶片在早期白粉病感染下的单细胞转录组图谱,揭示了细胞类型特异性基因表达模式,并鉴定了关键抗病基因HbCNL2的功能 | 首次构建橡胶树叶片的单细胞转录组图谱,系统揭示了白粉病感染下不同细胞类型的基因表达动态,并鉴定出HbCNL2基因通过调控防御反应在抗病中发挥关键作用 | 研究仅关注早期感染阶段,未涵盖整个病程;样本量相对有限;功能验证主要在模式植物烟草中进行,在橡胶树中的直接证据有待加强 | 探究橡胶树在病原体感染下的细胞水平转录响应机制,鉴定关键抗病基因 | 橡胶树(Hevea brasiliensis)叶片在白粉病感染下的细胞 | 植物病理学与单细胞组学 | 植物真菌病害(白粉病) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但涉及橡胶树叶片在感染条件下的细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4367 | 2026-01-09 |
Dual itaconate delivery systems modulate macrophage Acod1-Hif-1α-glycolysis axis for immunotherapy of bioprosthetic heart valve calcification
2026-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.11.040
PMID:41492369
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学及多种实验模型,揭示了生物人工心脏瓣膜钙化的免疫学机制,并开发了基于衣康酸递送的靶向免疫调节策略以抑制钙化 | 首次构建了BHV钙化的时空细胞图谱,鉴定出低Acod1表达的新型促钙化巨噬细胞亚群,并揭示了Acod1-Hif-1α-糖酵解轴在钙化中的作用机制;创新性地设计了两种基于生物材料的衣康酸递送系统用于局部免疫调节治疗 | NA | 阐明生物人工心脏瓣膜钙化的免疫学机制并开发靶向免疫调节治疗策略 | 生物人工心脏瓣膜、巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4368 | 2026-01-09 |
Bioinspired scaffold recapitulating chondrogenic ontogeny and microenvironment for functional cartilage regeneration
2026-Apr, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.11.041
PMID:41502980
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研究论文 | 本文开发了一种仿生三层支架,通过模拟软骨发育过程和微环境,有效修复局灶性关节软骨缺损并促进功能性软骨再生 | 创新性地设计了一种三层仿生支架(CE-SKP/CPH/P2G3),该支架能模拟软骨发育过程(从软骨到钙化软骨)并重建局部缺氧微环境,成功修复了软骨缺损并恢复了正常的生理结构 | NA | 开发一种能够模拟软骨发育过程和微环境的支架,以实现功能性关节软骨再生和治疗骨关节炎 | 局灶性关节软骨缺损、骨关节炎 | 组织工程、再生医学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4369 | 2026-01-09 |
Evaluating imputation methods for accurate estimation of cell population fractions in single-cell RNA sequencing
2026-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf204
PMID:41503159
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研究论文 | 本研究系统评估了八种单细胞RNA测序数据插补算法在准确估计细胞群体比例方面的性能 | 首次系统评估多种插补算法在改善细胞群体大小估计方面的能力,并定义了改善估计的条件 | 仅评估了八种算法,可能未涵盖所有现有方法;依赖于模拟和参考数据集,可能无法完全代表真实生物样本的复杂性 | 评估单细胞RNA测序数据插补方法在准确估计细胞群体比例方面的有效性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群体比例估计 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | MAGIC, SAVER, scVI, DCA, scBiG, kNN-smoothing, scImpute, ALRA | 单细胞RNA测序数据 | 两个模拟数据集和一个深度测序参考数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4370 | 2026-01-09 |
Altered Thymopoiesis in Thymoma Is Associated with Defects in Negative Selection Machinery and Decreased Treg Abundance
2026-Jan-08, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0190
PMID:41143696
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研究论文 | 本研究通过表型、单细胞RNA测序和空间分析,探讨了胸腺瘤中胸腺生成异常与自身免疫的关系 | 首次结合单细胞RNA测序和空间分析,揭示了胸腺瘤中胸腺上皮细胞的转录组缺陷和皮质-髓质分区丧失,关联了胸腺生成异常与自身免疫 | 研究样本可能有限,且未详细探讨胸腺瘤亚型间的差异 | 研究胸腺瘤中胸腺生成的异常机制及其与自身免疫的关联 | 胸腺瘤中的T细胞和肿瘤性胸腺上皮细胞 | 数字病理学 | 胸腺瘤 | 单细胞RNA测序, 空间分析, 多重免疫组化染色 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4371 | 2026-01-09 |
Molecular Docking and Single-Cell RNA-Seq Analysis Identify PTGS2 as a Key Target of Osthole in the Oral Squamous Cell Carcinoma Microenvironment
2026-Jan-08, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过分子对接和单细胞RNA-seq分析,鉴定PTGS2为蛇床子素在口腔鳞状细胞癌微环境中的关键靶点 | 首次结合分子对接和单细胞RNA-seq技术,系统性地揭示了蛇床子素通过靶向PTGS2调控OSCC微环境的分子机制 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的直接功能验证 | 探究蛇床子素在口腔鳞状细胞癌中的治疗作用及其分子机制 | 口腔鳞状细胞癌(OSCC)及其肿瘤微环境中的免疫细胞 | 计算生物学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA-seq, 分子对接, 差异表达分析, 基因集富集分析, 免疫浸润分析 | 列线图(nomogram) | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4372 | 2026-01-09 |
Alterations in NK Cell Function and Glucose Metabolism Characteristics in Patients With Progressive Hepatocellular Carcinoma
2026-Jan-07, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70095
PMID:41500969
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术,揭示了进展性肝细胞癌患者中NK细胞功能抑制和糖代谢异常的特征,并确定TIM3为关键标志物和潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平上系统描绘了进展性肝细胞癌中NK细胞的免疫抑制状态和代谢重编程特征,并明确了TIM3高表达NK细胞亚群的功能耗竭表型及其临床预后价值 | 样本量较小(仅6例患者),且为单中心研究,需要更大规模的前瞻性队列验证 | 探究进展性肝细胞癌患者自然杀伤细胞的功能和代谢改变特征 | 肝细胞癌患者的自然杀伤细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,多色流式细胞术,多色荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,组织荧光图像数据 | 6例初治肝细胞癌患者的外周血样本,以及配对的肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4373 | 2026-01-09 |
Dual inhibition of ACLY and ACSS2 by EVT0185 reduces steatosis, hepatic stellate cell activation, and fibrosis in mouse models of MASH
2026-Jan-06, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2025.11.015
PMID:41500198
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研究论文 | 本研究证明,一种名为EVT0185的ACLY和ACSS2双重抑制剂,能有效减少小鼠MASH模型的肝脏脂肪变性、肝星状细胞活化和纤维化 | 首次报道了一种同时靶向ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)和乙酰辅酶A合成酶2(ACSS2)的双重抑制剂EVT0185,并通过空间转录组学和单细胞RNA测序揭示了其通过抑制ACSS2介导的乙酸代谢和胆固醇合成来发挥作用的机制 | 研究主要基于小鼠模型,在人类肝切片和原代肝星状细胞中的验证仍需进一步临床研究确认 | 探索通过双重抑制ACLY和ACSS2来治疗代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)和肝纤维化的新治疗策略 | 小鼠MASH模型、人类肝切片、原代人类肝星状细胞 | NA | 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)、肝纤维化 | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4374 | 2026-01-09 |
HIV disrupts the lung molecular clock, leading to lung inflammation and features of emphysema
2026-Jan-05, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09284-1
PMID:41486302
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研究论文 | 本研究探讨HIV如何通过TAT蛋白上调miR-126-3p并抑制SIRT1,从而破坏肺分子钟,导致肺炎症和肺气肿特征 | 首次识别TAT/miR-126-3p/SIRT1轴作为HIV诱导肺炎症的关键介导因子,并在转基因小鼠和HIV阳性供体肺中验证 | 研究样本量有限,仅涉及4个月大的SP-C TAT小鼠和HIV阳性供体肺,未涵盖更广泛的人群或长期效应 | 探究HIV如何破坏肺分子钟并促进肺炎症,以识别缓解HIV相关COPD的治疗策略 | 原代人支气管上皮细胞、SPC-TAT转基因小鼠和HIV阳性供体肺 | 分子生物学 | HIV感染相关肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 4个月大的SP-C TAT小鼠肺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4375 | 2026-01-09 |
Development and validation of a prognostic model based on T cell signature genes in colon cancer using single-cell RNA sequencing
2026-Jan-02, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01994-4
PMID:41483215
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据识别T细胞特征基因,开发并验证了一个基于七个基因的结肠癌预后模型 | 首次结合单细胞RNA测序数据与TCGA转录组数据,通过交叉分析和LASSO回归筛选出T细胞特征基因构建结肠癌预后模型 | 模型在部分外部验证数据集中的长期预测性能(如7年AUC)有待提高,且需要更多前瞻性临床研究验证其临床实用性 | 开发一个基于T细胞特征基因的结肠癌预后预测模型 | 结肠癌患者 | 数字病理学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO回归,Cox比例风险模型 | 基因表达数据 | TCGA-COAD数据集及三个GEO数据集(GSE39582,GSE17537,GSE161158) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4376 | 2026-01-09 |
SAMD4A inhibits abdominal aortic aneurysm development and VSMC phenotypic transformation through targeting KDM2B
2026-Jan, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.018
PMID:40081568
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研究论文 | 本研究探讨了RNA结合蛋白SAMD4A通过靶向KDM2B抑制腹主动脉瘤(AAA)发展和血管平滑肌细胞(VSMC)表型转化的机制 | 首次揭示了SAMD4A在AAA中通过结合KDM2B调控VSMC收缩表型,并利用单细胞RNA测序技术鉴定了VSMC亚型及其在AAA形成过程中的转化 | 研究主要基于小鼠模型,未在人体样本中验证,且机制探索可能未涵盖所有相关通路 | 确定SAMD4A是否抑制VSMC表型转化并阻止AAA形成 | 腹主动脉瘤(AAA)和血管平滑肌细胞(VSMC) | 单细胞测序 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、RNA测序(RNA-seq)、RNA免疫沉淀测序(RIP-seq)、染色质免疫沉淀定量PCR(ChIP-qPCR) | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确指定样本数量,但涉及小鼠AAA模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4377 | 2026-01-09 |
Development of a fully human glioblastoma-in-brain-spheroid model for accelerated translational research
2026-Jan, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.03.055
PMID:40188875
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研究论文 | 本文开发了一种名为hGliCS的全人源胶质母细胞瘤-脑球模型,用于加速转化研究 | 结合患者来源的胶质母细胞瘤细胞与诱导多能干细胞来源的成熟人类皮质神经元,克服了现有模型系统的关键限制 | NA | 研究胶质母细胞瘤进展和治疗抵抗与脑微环境(特别是神经元)的相互作用 | 患者来源的胶质母细胞瘤细胞和诱导多能干细胞来源的人类皮质神经元 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4378 | 2026-01-09 |
Magnifying Glass on Sinonasal NUT Carcinoma Heterogeneity via Spatial Transcriptomics
2026-Jan, Head & neck
DOI:10.1002/hed.28231
PMID:40621801
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探索了鼻窦NUT癌的肿瘤异质性 | 首次应用空间转录组学分析鼻窦NUT癌,揭示了肿瘤内和肿瘤间的细胞类型多样性 | 样本量较小(仅3例),行为相关性仅为推测性 | 阐明鼻窦NUT癌的肿瘤异质性及其潜在治疗意义 | 鼻窦NUT癌患者的福尔马林固定石蜡包埋组织 | 数字病理学 | 鼻窦癌 | 空间转录组学测序 | 图神经网络 | 空间转录组数据 | 3例鼻窦NUT癌病例 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10X Genomics Visium Spatial Gene Expression分析平台 |
| 4379 | 2026-01-09 |
Epithelial cell derived lumican modulates extracellular matrix dynamics in early-life airways disease
2026-Jan, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.08.030
PMID:40972979
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研究论文 | 本研究探讨了学龄前喘息和学龄期哮喘中气道重塑的机制,重点关注细胞外基质动态变化及上皮细胞来源的lumican的作用 | 首次揭示了lumican在早期生命气道重塑中的关键作用,并展示了胶原相关表型和几何变化的新角色 | 研究样本可能有限,且机制研究主要基于动物模型,需进一步验证人类样本中的直接因果关系 | 研究学龄前喘息和学龄期哮喘中气道细胞外基质改变的机制 | 学龄前喘息和学龄期哮喘儿童的气道活检标本,以及屋尘螨暴露的新生小鼠肺标本 | 空间转录组学 | 哮喘 | 空间转录组学、共聚焦显微镜、二次谐波显微镜 | NA | 转录组数据、图像数据 | 涉及学龄前喘息(1-5岁)和学龄期哮喘(6-16岁)儿童的气道活检标本,以及屋尘螨暴露的新生小鼠肺标本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4380 | 2026-01-09 |
Mapping Satellite Glial Cell Heterogeneity Reveals Distinct Spatial Organization and Implies Functional Diversity in the Dorsal Root Ganglion
2026-Jan, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202511569
PMID:41134052
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研究论文 | 本研究首次全面表征了小鼠背根神经节中卫星胶质细胞的异质性,识别了四种亚型并进行了空间定位 | 首次在背根神经节中原位表征卫星胶质细胞的异质性,结合单细胞RNA测序与先进成像技术识别并验证了四种功能不同的亚型 | 研究主要基于小鼠模型,人类背根神经节的研究仅初步观察了标记物表达差异,功能验证有待深入 | 揭示背根神经节中卫星胶质细胞的异质性及其功能多样性 | 小鼠和人类背根神经节中的卫星胶质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 原位杂交, 先进成像技术 | NA | RNA测序数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |