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当前共找到 35679 篇文献，本页显示第 4361 - 4380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4361 | 2025-11-15 |
KEGNI: knowledge graph enhanced framework for gene regulatory network inference
2025-Sep-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03780-7
PMID:40983951
|
研究论文 | 提出一种知识图谱增强的基因调控网络推断框架KEGNI，利用图自编码器从单细胞RNA测序数据中推断细胞类型特异性基因调控网络 | 首次将知识图谱与图自编码器相结合用于基因调控网络推断，能够识别驱动基因并阐明不同细胞背景下的调控机制 | NA | 开发更准确的细胞类型特异性基因调控网络推断方法 | 基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序 | 图自编码器 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4362 | 2025-11-15 |
scooby: Modeling multi-modal genomic profiles from DNA sequence at single-cell resolution
2025-Jul-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.19.613754
PMID:39345504
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研究论文 | 提出首个从DNA序列建模单细胞分辨率多组学数据的框架scooby | 首个在单细胞分辨率从序列建模scRNA-seq覆盖度和scATAC-seq插入谱的框架，通过细胞特异性解码器和预训练模型微调实现 | NA | 理解调控DNA元件如何影响单个细胞中的基因表达，建立统一的基因调控模型 | 造血系统数据集中的单细胞多组学数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 多组学分析 | 基于Borzoi预训练模型的深度学习框架 | 基因组序列, 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4363 | 2025-11-15 |
Integrative machine learning and multi-omics framework identifies shared biomarkers for rheumatoid arthritis and ulcerative colitis
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0336243
PMID:41212891
|
研究论文 | 通过整合机器学习和多组学方法识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享生物标志物 | 开发了包含12种算法和交叉验证的综合机器学习框架，首次系统识别RA和UC的共享生物标志物，并通过单细胞RNA测序验证 | 研究主要基于公共基因表达数据集，需要进一步实验验证生物标志物的临床适用性 | 识别类风湿关节炎和溃疡性结肠炎的共享诊断生物标志物 | 类风湿关节炎和溃疡性结肠炎患者的基因表达数据 | 机器学习 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, 机器学习 | 集成学习框架(包含12种算法) | 基因表达数据 | 公共基因表达数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4364 | 2025-11-15 |
Metalloproteinase-9 as a Pyroptosis-Hypoxia Synergy Effector Drives Immune Remodeling in Ischemic Stroke: A Multi-Omics Validated Diagnostic Biomarker and Therapeutic Target
2025, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S550007
PMID:41220599
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定基质金属蛋白酶-9(MMP9)作为缺血性脑卒中诊断生物标志物和治疗靶点 | 首次系统探索细胞焦亡与缺氧在缺血性脑卒中中的协同调控作用，并通过多组学验证MMP9的诊断价值 | 研究样本量有限，需要更大规模临床验证 | 探索缺血性脑卒中早期诊断生物标志物和治疗靶点 | 缺血性脑卒中患者外周血样本 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 转录组测序,单细胞测序,RT-qPCR,分子对接 | LASSO,支持向量机,随机森林 | 基因表达数据 | 三个独立数据集(GSE66724,GSE58294,GSE16561)和RT-qPCR验证样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4365 | 2025-11-15 |
Intratumoral heterogeneity and potential treatment strategies in small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1657441
PMID:41220942
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综述 | 本文综述了小细胞肺癌的分子亚型分类、瘤内异质性、肿瘤可塑性及相关治疗策略的最新研究进展 | 通过基因组学和单细胞测序技术揭示了SCLC存在动态分子亚型及其空间互斥与共存关系，提出了肿瘤可塑性的新视角 | NA | 探讨小细胞肺癌的瘤内异质性特征及潜在治疗策略 | 小细胞肺癌细胞系、动物模型和肿瘤组织 | 肿瘤学 | 肺癌 | 基因组学，单细胞测序 | NA | 基因组数据，单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4366 | 2025-11-15 |
SPP1+ TAM: CD8+ T Cell Crosstalk Associates with Blocking Radiotherapy Efficacy in Lung Cancer
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0851
PMID:41221295
|
研究论文 | 本研究揭示了SPP1+肿瘤相关巨噬细胞通过抑制CD8+ T细胞浸润限制肺癌放疗疗效的机制 | 首次发现放疗后上调的SPP1是免疫抑制性巨噬细胞的关键因子，并证明靶向SPP1可增强放疗效果 | NA | 探索肺癌放疗疗效受限的免疫机制并寻找联合治疗策略 | 非小细胞肺癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4367 | 2025-11-15 |
Inflammatory Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2024-Dec-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.24.630257
PMID:39763863
|
研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断后病毒反弹前后的血浆蛋白质组和单细胞转录组，发现可检测病毒血症前炎症单核细胞增加 | 首次在可检测HIV-1病毒反弹前观察到CD16单核细胞增加和独特转录特征 | 研究样本量有限，仅关注外周血单个核细胞 | 识别治疗停止后病毒反弹的早期信号，为延长HIV-1缓解期提供策略 | HIV-1感染者的外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV-1感染 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4368 | 2025-11-15 |
Genetically Engineered Mouse Models for Alzheimer Disease and Frontotemporal Dementia: New Insights from Single-Cell and Spatial Transcriptomics
2024-Dec-19, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2024.11.006
PMID:39743215
|
综述 | 本文综述了阿尔茨海默病和额颞叶痴呆的基因工程小鼠模型，重点总结了单细胞转录组学、多组学和空间转录组学研究的新发现 | 整合单细胞转录组学、多组学和空间转录组学技术为神经退行性疾病小鼠模型提供新见解 | 承认没有任何小鼠模型是完美的，存在模型局限性 | 研究神经退行性疾病的病因学和潜在治疗方法 | 基因工程小鼠模型，特别是阿尔茨海默病和额颞叶痴呆模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学, 多组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 4369 | 2025-11-15 |
Apoptosis recognition receptors regulate skin tissue repair in mice
2023-12-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.86269
PMID:38127424
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示凋亡识别受体在小鼠皮肤组织修复中的调控机制 | 首次在皮肤伤口炎症期间系统描绘细胞动态图谱，发现Axl和Timd4两种胞葬受体在组织修复中的不同作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类糖尿病足伤口数据有限，TLR3非依赖性机制尚未完全阐明 | 探究凋亡细胞识别与清除机制如何调控组织修复过程 | 小鼠皮肤伤口模型和人类糖尿病足伤口样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病足溃疡 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4370 | 2025-11-15 |
Single-cell characterization of human GBM reveals regional differences in tumor-infiltrating leukocyte activation
2023-12-21, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.92678
PMID:38127790
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示了人类胶质母细胞瘤中肿瘤浸润白细胞的区域差异 | 首次在配对样本中揭示了GBM肿瘤中心、外周浸润区和血液中免疫细胞的区域特异性转录特征 | 样本量较小（仅5例患者），需要更大规模验证 | 解析胶质母细胞瘤肿瘤微环境中免疫细胞的区域异质性 | 人类胶质母细胞瘤患者 | 单细胞组学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例原发性GBM患者的配对样本（肿瘤中心、外周浸润区、血液） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4371 | 2025-11-15 |
Single-cell sequencing highlights heterogeneity and malignant progression in actinic keratosis and cutaneous squamous cell carcinoma
2023-12-15, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.85270
PMID:38099574
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术揭示光化性角化病和皮肤鳞状细胞癌的异质性及恶性进展机制 | 首次通过单细胞RNA测序全面描绘从正常皮肤到光化性角化病再到侵袭性皮肤鳞癌的完整进展过程，发现基底细胞恶性亚型并鉴定关键驱动基因 | 样本量较小（仅6名患者的13个样本），需要更大规模研究验证发现 | 解析皮肤鳞状细胞癌的发病机制和恶性进展过程 | 光化性角化病、原位鳞状细胞癌、皮肤鳞状细胞癌患者组织样本 | 单细胞测序 | 皮肤鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组织化学, 免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据, 组织图像 | 6名患者的13个样本，共138,982个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 4372 | 2025-11-15 |
Neural tube-associated boundary caps are a major source of mural cells in the skin
2023-12-14, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.69413
PMID:38095361
|
研究论文 | 本研究揭示神经管相关边界帽细胞是小鼠皮肤血管壁细胞的主要来源 | 首次发现边界帽细胞衍生物沿神经迁移至皮肤并分化为血管周细胞和血管平滑肌细胞 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类或其他物种中验证 | 探索边界帽细胞在皮肤血管发育中的新功能 | 小鼠胚胎和新生小鼠的边界帽细胞及其衍生物 | 发育生物学 | NA | Cre报告基因细胞追踪，单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据，细胞追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4373 | 2025-11-15 |
Avoiding false discoveries in single-cell RNA-seq by revisiting the first Alzheimer's disease dataset
2023-12-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.90214
PMID:38047913
|
研究论文 | 重新分析首个阿尔茨海默病单细胞RNA-seq数据集，通过改进数据处理和差异表达分析方法显著减少假阳性发现 | 采用最佳实践方法重新分析首个AD单核RNA-seq数据，将假发现率0.05下的差异表达基因减少549倍 | 仅针对单个数据集进行重新分析，未涉及其他独立验证数据集 | 评估质量控制和分析方法对疾病相关基因发现的影响，纠正先前研究中的假阳性发现 | 阿尔茨海默病患者脑组织单细胞RNA-seq数据 | 单细胞转录组学 | 阿尔茨海默病 | 单核RNA-seq | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA-seq | NA | NA |
| 4374 | 2025-11-15 |
Epicardioid single-cell genomics uncovers principles of human epicardium biology in heart development and disease
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01718-7
PMID:37012447
|
研究论文 | 本研究通过人类多能干细胞衍生的心外膜类器官揭示人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学原理 | 开发了自组织人类多能干细胞衍生的心外膜类器官模型，首次实现了左心室壁典型的心外膜和心肌形态、分子和功能模式 | 类器官模型可能无法完全模拟体内真实心脏环境的复杂性 | 探索人类心外膜在心脏发育和疾病中的生物学功能和作用机制 | 人类多能干细胞衍生的心外膜类器官 | 单细胞基因组学 | 心脏疾病 | 谱系追踪, 单细胞转录组测序, 染色质可及性分析 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 4375 | 2025-11-15 |
SEACells infers transcriptional and epigenomic cellular states from single-cell genomics data
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01716-9
PMID:36973557
|
研究论文 | 提出SEACells算法，可从单细胞基因组学数据中推断转录和表观基因组细胞状态 | 克服单细胞数据稀疏性，同时保留传统细胞聚类所掩盖的异质性 | NA | 从单细胞测序数据中识别代表高度细粒度细胞状态的元细胞 | 单细胞RNA和ATAC测序数据 | 单细胞基因组学 | COVID-19, 造血系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | SEACells算法 | 单细胞基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 4376 | 2025-11-15 |
Multimodal spatiotemporal phenotyping of human retinal organoid development
2023-12, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01747-2
PMID:37156914
|
研究论文 | 本研究通过多模态时空表型分析探索人类视网膜类器官发育过程 | 开发了可视化工具包整合多组学数据，构建了首个整合空间分割细胞核的多模态视网膜类器官发育图谱 | NA | 研究人类视网膜类器官发育过程中的空间尺度和分子模态特征 | 人类多能干细胞生成的视网膜类器官和原代成人视网膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组测序,染色质可及性测序,多重蛋白成像 | 基因调控网络 | 空间蛋白质组数据,单细胞转录组数据,表观基因组数据 | 视网膜类器官时间序列样本和原代成人视网膜组织 | NA | 单细胞RNA-seq,单细胞ATAC-seq,空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 4377 | 2025-11-15 |
Genomic and immune signatures predict clinical outcome in newly diagnosed multiple myeloma treated with immunotherapy regimens
2023-12, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-023-00657-1
PMID:37945755
|
研究论文 | 本研究通过整合肿瘤全基因组和微环境单细胞RNA测序数据，揭示了基因组驱动因素和免疫特征对新诊断多发性骨髓瘤患者免疫治疗临床结局的预测价值 | 首次在包含达雷妥尤单抗的免疫治疗方案中，系统整合肿瘤基因组与微环境单细胞测序数据，发现APOBEC突变活性、特定基因缺失和免疫细胞动态变化对治疗反应的预测作用 | 研究基于二期临床试验数据，样本量有限，需要更大规模验证 | 探索影响新诊断多发性骨髓瘤患者接受含达雷妥尤单抗免疫治疗方案临床结局的预测因素 | 新诊断的多发性骨髓瘤患者 | 基因组学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据 | 二期临床试验患者队列 | NA | 全基因组测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4378 | 2025-11-15 |
Microglia promote anti-tumour immunity and suppress breast cancer brain metastasis
2023-12, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-023-01273-y
PMID:37957324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和基因工程小鼠模型揭示了小胶质细胞在乳腺癌脑转移中发挥促炎和抑瘤作用 | 首次明确区分小胶质细胞与其他肿瘤相关巨噬细胞，并发现其在脑转移中独特的免疫促进作用 | 小胶质细胞与其他巨噬细胞的区分在技术上具有挑战性 | 探究小胶质细胞在乳腺癌脑转移中的免疫调节作用 | 小鼠模型和人类小胶质细胞 | 单细胞生物学 | 乳腺癌脑转移 | 单细胞RNA测序，基因工程小鼠模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4379 | 2025-11-15 |
Microfluidics-free single-cell genomics with templated emulsification
2023-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01685-z
PMID:36879006
|
研究论文 | 开发了一种无需微流控设备的单细胞基因组学方法——PIP-seq，通过模板乳化技术实现单细胞封装和条形码标记 | 首次提出基于粒子模板乳化的单细胞测序方法，无需专用微流控设备、专业技术或硬件，仅需涡旋混合器即可完成 | NA | 开发更简单、灵活和可扩展的单细胞测序工作流程 | 小鼠-人类混合细胞、人类乳腺组织细胞、混合表型急性白血病细胞 | 单细胞基因组学 | 乳腺癌、急性白血病 | 单细胞RNA测序、多组学测量 | NA | 转录组数据、多组学数据 | 数千个样品或数百万个细胞 | NA | 单细胞RNA测序、单细胞多组学 | PIP-seq | 粒子模板即时分区测序，支持微孔板和大体积锥形管等多种乳化格式 |
| 4380 | 2025-11-15 |
High-resolution alignment of single-cell and spatial transcriptomes with CytoSPACE
2023-11, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-023-01697-9
PMID:36879008
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为CytoSPACE的优化方法，用于将单细胞RNA测序图谱中的单个细胞映射到空间表达谱 | 开发了能够以单细胞分辨率进行组织图谱绘制的新方法，在噪声容忍度和准确性方面优于先前方法 | NA | 解决空间转录组学中基因恢复有限和空间分辨率低的问题 | 单细胞RNA测序图谱和空间表达谱 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 优化方法 | 基因表达数据，空间表达谱 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |