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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4321 | 2026-01-10 |
MOH: A Novel Multilayer Multi-Omics Heterogeneous Graph for Single-Cell Clustering
2026-Jan, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2025.3589464
PMID:41385419
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研究论文 | 本文提出了一种基于多层多组学异质图的新型单细胞聚类算法MOH,用于整合scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学数据 | MOH通过构建多层异质图整合三种单细胞组学数据,同时捕获层内和层间关系,克服了传统方法仅整合两种组学数据且忽略细胞间相互作用的限制 | 未明确提及具体局限性,但传统方法在引入新组学数据时需要重新设计图结构,限制了可扩展性 | 开发一种能够整合多种单细胞组学数据的聚类算法,以更准确地识别细胞群体 | 单细胞多组学数据,包括scRNA-seq、scATAC-seq和空间转录组学 | 机器学习 | 癌症 | scRNA-seq, scATAC-seq, 空间转录组学 | 多层异质图模型 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4322 | 2026-01-10 |
Interferon-stimulated gene GALNT2 restricts respiratory virus infections
2026-Jan, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/s41564-025-02200-7
PMID:41387548
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研究论文 | 本研究通过转录组分析和单细胞RNA测序,发现干扰素刺激基因GALNT2通过O-连接糖基化限制多种冠状病毒和甲型流感病毒的复制,揭示了其抗病毒机制和遗传变异与COVID-19住院风险的相关性 | 首次将GALNT2鉴定为抗呼吸道病毒感染的干扰素刺激基因,并阐明其通过O-糖基化调控病毒糖蛋白加工和病毒-细胞融合的机制 | 研究主要基于体外和动物模型,人类遗传数据分析的样本规模和临床验证需进一步扩展 | 探索干扰素刺激基因在抗呼吸道病毒感染中的作用机制 | SARS-CoV-2、多种冠状病毒、甲型流感病毒以及COVID-19患者的样本 | 自然语言处理 | NA | 转录组分析、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 野生型和IFNAR小鼠的肺组织、COVID-19患者的支气管肺泡灌洗液和外周血单个核细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4323 | 2026-01-10 |
MMSpa is a deep learning-based tool that enhances the identification of spatial domains in spatial transcriptomics studies
2026-Jan, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003580
PMID:41490241
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研究论文 | 本文提出了一种名为MMSpa的深度学习工具,旨在提升空间转录组学研究中空间域的识别精度 | MMSpa采用掩码图注意力自编码器框架,结合边移除策略构建增强空间图,以解决跨域干扰并刻画更清晰的域边界,通过掩码基因表达重构学习稳定的潜在表征 | NA | 提升空间转录组学中空间域的识别准确性 | 空间转录组学数据中的空间域 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 掩码图注意力自编码器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4324 | 2026-01-10 |
HBx hijacks the miR-19a-3p/BAMBI/TGF-β1 axis to impair the anti-tumour activity of CD4+ T cells in diffuse large B-cell lymphoma
2026-Jan, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70578
PMID:41492119
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研究论文 | 本研究揭示了乙型肝炎病毒X蛋白通过下调miR-19a-3p激活BAMBI/Wnt信号通路,从而增强TGF-β1分泌并抑制弥漫性大B细胞淋巴瘤中CD4⁺ T细胞的抗肿瘤活性 | 首次阐明了HBx通过miR-19a-3p/BAMBI/TGF-β1轴调控DLBCL肿瘤微环境中CD4⁺ T细胞功能耗竭的具体分子机制,并利用单细胞测序解析了TGFB1-TGFBR2配体-受体对在细胞间通讯中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和动物模型,临床样本验证相对有限;针对miR-19a-3p或TGF-β的治疗策略尚未进行临床试验 | 探究乙型肝炎病毒感染影响弥漫性大B细胞淋巴瘤预后不良的免疫学机制 | HBV阳性弥漫性大B细胞淋巴瘤患者样本、DLBCL细胞系、CD4⁺ T细胞、小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序、双荧光素酶报告实验、qRT-PCR、Western blot、染色质免疫沉淀、免疫共沉淀、流式细胞术、酶联免疫吸附试验、免疫组化 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据、蛋白质数据、单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量,但包含患者样本、细胞系和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4325 | 2026-01-10 |
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneity of mucosaassociated invariant T cells in donor grafts and its diagnostic relevance in gastrointestinal graft-versus-host disease
2026-Jan-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.287114
PMID:40820727
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了供体移植物中黏膜相关恒定T细胞的异质性及其在胃肠道移植物抗宿主病中的诊断相关性 | 首次利用单细胞RNA测序技术系统解析了G-CSF动员对MAIT细胞功能的影响,并识别了CXCR6-CXCL16轴在MAIT细胞向肠道组织迁移中的关键作用,开发了基于MAIT细胞特征预测肠道aGVHD的流式细胞术模型 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床样本验证规模有限,MAIT细胞功能机制仍需进一步在人体中验证 | 探究G-CSF动员对MAIT细胞功能的影响及其在预防肠道移植物抗宿主病中的作用机制 | 供体G-CSF动员的外周血干细胞移植物中的黏膜相关恒定T细胞 | 单细胞组学 | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 预测模型 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 未明确样本数量,涉及供体移植物和受体小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4326 | 2026-01-10 |
ZNF282 Promotes Colorectal Cancer Progression Possibly via E2F1 Activation
2026-Jan, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70224
PMID:41125417
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析与实验验证,发现ZNF282基因通过可能激活E2F1促进结直肠癌进展 | 首次将ZNF282鉴定为结直肠癌进展的关键基因,并通过单细胞RNA测序与空间转录组学结合TCGA数据,揭示了其通过调控E2F1影响细胞周期的分子机制 | ZNF282调控E2F1的具体分子机制(如直接结合证据)仍需进一步实验验证 | 探究结直肠癌进展的新分子机制与潜在治疗靶点 | 结直肠癌细胞系、临床结直肠癌样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CRISPR/Cas9基因敲除,TCGA数据分析 | NA | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | TCGA数据库及临床CRC数据集(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4327 | 2026-01-10 |
The exploration of immunological landscape and drug targets in chronic rhinosinusitis with nasal polyps
2026-Jan, The World Allergy Organization journal
DOI:10.1016/j.waojou.2025.101140
PMID:41496791
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化方法,探索了慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉的免疫学特征和潜在药物靶点 | 首次将孟德尔随机化与单细胞RNA测序相结合,系统性地揭示了CRSwNP的细胞特异性基因表达模式和免疫微环境重塑机制 | 研究样本量未明确说明,且主要基于已有GWAS和eQTL数据,需要进一步实验验证 | 阐明慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉的免疫学发病机制并识别潜在治疗靶点 | 慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉患者的组织样本 | 生物信息学 | 慢性鼻-鼻窦炎 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 表达数量性状位点分析 | NA | 基因表达数据, 遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4328 | 2026-01-10 |
Unraveling the Causal Linkages of RBP7 and SCGB3A1 on Pelvic Organ Prolapse: Multifaceted Insights From Genome-Wide Mendelian Randomization, Single-Cell RNA Analysis, and Network Pharmacology
2026, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/bmri/9785848
PMID:41497737
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序、孟德尔随机化和网络药理学方法,揭示了RBP7和SCGB3A1基因在盆腔器官脱垂中的因果作用及潜在治疗药物 | 首次将单细胞RNA测序、全基因组孟德尔随机化和网络药理学多维度方法相结合,系统性地识别了盆腔器官脱垂的因果风险基因和保护基因,并探索了潜在的治疗药物 | 研究主要基于生物信息学分析和公开数据,缺乏实验验证;未来需要功能实验验证SCGB3A1在成纤维细胞中的作用,并进行临床前药物试验 | 探索盆腔器官脱垂的潜在发病机制并寻找有效的治疗靶点 | 盆腔器官脱垂患者的阴道黏膜组织 | 生物信息学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化, 网络药理学, 分子对接 | NA | 单细胞RNA测序数据, GWAS汇总统计数据, eQTL数据 | 来自盆腔器官脱垂患者和非患者的阴道黏膜组织单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4329 | 2026-01-10 |
Multi-modal choroid plexus pathology in aging and Alzheimer's disease
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.30.697051
PMID:41509283
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研究论文 | 本研究通过多模态方法构建了脉络丛图谱,揭示了其在衰老和阿尔茨海默病中的病理变化 | 整合单核转录组学、AI辅助定量组织病理学、空间转录组学和功能研究,首次系统表征了脉络丛在生命周期中的病理发展及其对阿尔茨海默病的贡献 | 研究主要基于死后样本和5xFAD小鼠模型,可能无法完全反映活体人类疾病进程 | 探究脉络丛在衰老和阿尔茨海默病中的病理机制及其作为血脑屏障和脑脊液产生者的作用 | 人类死后样本(年龄16至105岁)和5xFAD转基因小鼠模型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组学, AI辅助定量组织病理学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 组织病理图像, 空间转录组数据 | 超过500个死后样本(年龄16至105岁)和5xFAD小鼠 | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4330 | 2026-01-10 |
Progenitor Diversity and Architecture of the Human Ganglionic Eminences Shaping the Basal Ganglia
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.31.697063
PMID:41509357
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和染色质可及性分析,揭示了人类基底节发育中神经前体细胞的多样性和结构特征 | 首次在灵长类中结合单细胞多组学、活体成像和空间转录组学,系统解析了基底节神经前体细胞的异质性和谱系轨迹,并发现PCDH19在DEN结构形成中的关键调控作用 | 研究主要基于体外器官模型和有限发育阶段样本,体内验证和更广泛发育时期的分析仍需进一步探索 | 解析灵长类基底节发育过程中神经前体细胞的分子异质性、谱系关系和结构形成机制 | 人类胚胎期神经节隆起(MGE、LGE)的神经前体细胞及其衍生的神经元和胶质细胞 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞核转录组测序、染色质可及性分析、活体成像、空间转录组学、电子显微镜、类器官培养 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据、空间转录组数据、成像数据 | 人类胚胎期三个神经节隆起区域的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 4331 | 2026-01-10 |
Single-cell RNA-sequencing-guided reactive oxygen species-scavenging hydrogel design for regeneration of osteoporotic bone
2025-Dec-31, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2500254
PMID:41490726
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析,设计了一种微环境自适应水凝胶系统,用于促进骨质疏松性骨缺损的再生修复 | 利用单细胞RNA测序识别骨质疏松微环境中的关键病理特征,并以此指导设计具有双重功能的水凝胶系统 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发适用于骨质疏松病理微环境的生物材料以促进骨缺损再生 | 骨质疏松小鼠的骨缺损模型及骨髓来源的间充质干细胞 | 数字病理学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4332 | 2026-01-10 |
Constructing a PANoptosis-based prognostic signature to evaluate the immune landscape and therapeutic response in clear cell renal cell carcinoma
2025-Dec-31, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B2400132
PMID:41490727
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研究论文 | 本研究构建了一个基于PANoptosis的预后特征模型,用于评估透明细胞肾细胞癌的免疫景观和治疗反应 | 首次在ccRCC中整合焦亡、凋亡和坏死性凋亡相关基因构建预后模型,并验证其在免疫治疗反应预测中的价值 | 研究基于回顾性数据,需要前瞻性临床验证;模型在外部数据集验证有限 | 识别ccRCC中PANoptosis相关基因,构建预后模型并评估免疫治疗反应 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞RNA测序,免疫组化,RT-qPCR,CCK-8,Transwell实验 | LASSO回归,Cox回归 | 基因表达数据,临床数据 | 未明确样本数量,使用公共数据集和实验验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4333 | 2026-01-10 |
CausalGRN: deciphering causal gene regulatory networks from single-cell CRISPR screens
2025-Dec-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.30.692369
PMID:41509211
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研究论文 | 本文介绍了一个名为CausalGRN的可扩展计算框架,用于从单细胞CRISPR筛选数据中推断因果基因调控网络并预测细胞对未知扰动的响应 | 提出了一种新颖的自适应阈值校正方法,以减轻稀疏单细胞RNA-seq数据中普遍存在的虚假偏相关,从而能够稳健地推断无向图,并利用观察到的扰动结果进行定向,最终通过网络传播预测新扰动的下游效应 | NA | 从单细胞CRISPR筛选数据中解码因果基因调控网络 | 单细胞RNA-seq数据及CRISPR扰动结果 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq, CRISPR筛选 | 网络推断与传播模型 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4334 | 2026-01-10 |
GLP-1R Agonism Directly Improves the Pumping Capacity of Murine Collecting Lymphatic Vessels
2025-Dec-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.26.696603
PMID:41509291
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研究论文 | 本研究探讨了GLP-1R激动剂对小鼠集合淋巴管泵血能力的直接影响 | 首次发现GLP-1R在淋巴管内皮细胞中的特异性表达,并证明GLP-1R激动剂能直接改善淋巴管收缩功能 | 潜在的信号通路成分尚未完全阐明,需要进一步研究 | 研究GLP-1R激动剂是否对淋巴管功能有直接作用,而非仅通过体重减轻产生系统效益 | 野生型小鼠、饮食诱导肥胖小鼠和高胆固醇血症ApoE KO小鼠的淋巴管 | NA | 继发性淋巴水肿 | 单细胞RNA测序、荧光共聚焦显微镜、压力肌动描记术 | NA | 基因表达数据、图像数据、生理测量数据 | 多种小鼠模型(WT、DIO、ApoE KO)的淋巴管样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4335 | 2026-01-10 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.693132
PMID:41509209
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研究论文 | 本文详细介绍了针对小鼠肌肉骨骼组织样本的全面处理流程,旨在通过10x Genomics的Xenium Prime 5K平台实现高质量的空间转录组学数据生成 | 开发了一种综合样本处理流程,包括经心灌注、固定、脱钙、石蜡处理及样本共包埋策略,成功解决了在脱钙肌肉骨骼组织中保持RNA完整性的挑战 | NA | 旨在实现从小鼠肌肉骨骼组织中生成高质量的空间转录组学数据 | 小鼠的完整膝关节、胫骨和腰椎等肌肉骨骼组织样本 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学数据 | 涉及成年小鼠的多种组织类型,包括滑膜、半月板、髌腱、关节软骨、软骨下骨、皮质骨、骨髓、肌肉、骨折骨痂和背根神经节 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | Xenium Prime 5K平台,用于基于成像的空间转录组学分析 |
| 4336 | 2026-01-10 |
Single-Cell Dissection of Fibroblast Heterogeneity in Diabetic Ulcers: Platelet-Rich Plasma (PRP) Therapy Activates Core Regenerative Programs via PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7 Networks
2025-Dec-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL47450
PMID:41504054
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多组学方法,揭示了糖尿病溃疡中成纤维细胞的异质性,并评估了富血小板血浆(PRP)疗法通过激活PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7网络促进愈合的机制 | 首次在糖尿病溃疡中系统表征成纤维细胞异质性,并鉴定出PRP疗法通过PLAGL1/RUNX2/ZKSCAN7转录因子网络激活核心再生程序的新机制 | 研究样本量相对较小(人类样本n=14,动物模型验证),且主要基于观察性数据,需要进一步功能实验验证机制 | 表征糖尿病溃疡中成纤维细胞的异质性,并评估PRP疗法的疗效及分子机制 | 糖尿病足溃疡患者(愈合n=9,未愈合n=5)的皮肤组织,以及链脲佐菌素诱导的糖尿病溃疡大鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病溃疡 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),细胞间通讯分析,转录因子分析,伪时间轨迹重建,动物模型验证 | NA | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 人类样本:14例(愈合9例,未愈合5例);动物模型:糖尿病溃疡大鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4337 | 2026-01-10 |
Comprehensive Multi-Omics Analysis Identifies Lactylation-Related Gene RAN as a Novel Prognostic Biomarker and Therapeutic Target in Glioma
2025-Dec-18, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL46765
PMID:41504052
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与机器学习方法,鉴定出乳酸化修饰相关基因RAN是胶质瘤的新型预后生物标志物和治疗靶点 | 首次系统性地将乳酸化修饰与胶质瘤进展联系起来,并通过创新的多步骤分析流程(结合scRNA-seq、空间转录组学和101种机器学习组合策略)鉴定出RAN这一关键基因,揭示了其通过PI3K/AKT通路促进肿瘤恶性表型的新机制 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,功能验证仅在有限的胶质瘤细胞系(LN229, U87, U251)中进行,缺乏体内动物模型实验和临床样本的进一步验证 | 系统鉴定胶质瘤中关键的乳酸化修饰相关基因,阐明其功能和作用通路,并探索其作为新型治疗靶点的潜力 | 胶质瘤(中枢神经系统原发性恶性肿瘤) | 生物信息学, 计算生物学 | 胶质瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 机器学习特征选择, shRNA敲低, 细胞功能实验(CCK-8, 克隆形成, EdU, 伤口愈合, Transwell), 蛋白质印迹 | 多种机器学习算法(共10种)及其组合策略(共101种), 包括弹性网络(ENet, α = 0.4) | 基因表达数据(RNA-seq, scRNA-seq), 空间转录组数据, 临床预后数据 | 来自TCGA、GEO和CGGA数据库的多个数据集, 具体样本数量未在摘要中明确说明;功能验证使用了LN229、U87和U251三种胶质瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4338 | 2026-01-10 |
Cancer-Associated Fibroblast-Centric Risk Model Predicts Immunotherapy Resistance in Pancreatic Cancer and Reveals PLOD2 as a Key Stromal Therapeutic Target
2025-Dec-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL46316
PMID:41504058
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据与实验验证,构建了以癌症相关成纤维细胞为中心的风险模型,用于预测胰腺癌免疫治疗耐药性,并揭示PLOD2作为关键基质治疗靶点 | 首次系统性结合加权基因共表达网络和蛋白质-蛋白质相互作用网络分析,识别出CAF相关核心基因,并通过单细胞RNA测序验证其在CAF中的表达,建立风险模型预测免疫治疗反应 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏大规模临床队列验证,且未深入探讨所有核心基因的具体作用机制 | 探究癌症相关成纤维细胞在胰腺腺癌中的作用机制,并开发靶向CAF的治疗策略 | 胰腺腺癌患者的多组学数据、肿瘤细胞行为及癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多组学数据分析、加权基因共表达网络分析、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 风险预测模型 | 多组学数据、基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确指定样本数量,但基于多数据库分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4339 | 2026-01-10 |
Hypoxia-Activated PERK Promotes Epithelial-Mesenchymal Transition in Gliomas: A Single-Cell and Spatial Transcriptomic Study With Therapeutic Implications
2025-Dec-17, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL46692
PMID:41504057
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学分析,揭示了缺氧激活的PERK通路在胶质瘤中促进上皮-间质转化(EMT)的关键作用及其治疗意义 | 首次结合单细胞测序和空间转录组学技术,系统阐明了缺氧环境下PERK通路通过SPP1-CD44相互作用驱动胶质瘤EMT和侵袭的新机制 | 研究主要基于公共数据库数据,实验验证部分在细胞系和动物模型中进行,临床样本验证有限 | 探究内质网应激(ERS)特别是PERK通路在胶质瘤EMT和恶性进展中的作用 | 胶质瘤细胞系、裸鼠模型、公共单细胞和空间转录组数据 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、伪时间分析、细胞通讯分析 | NA | 转录组数据、空间转录组数据、细胞实验数据 | 公共数据库中的胶质瘤样本、PERK沉默的胶质瘤细胞系、裸鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4340 | 2026-01-10 |
Cross-Study Meta-Analysis of Blood Transcriptomes in Type 2 Diabetes
2025-Dec-15, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms262412046
PMID:41465472
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研究论文 | 本研究通过整合自身和公开的血液RNA-seq数据,进行跨研究荟萃分析,探索2型糖尿病的转录组变化和潜在生物标志物 | 首次通过跨研究荟萃分析整合多个血液转录组数据集,识别出2065个差异表达基因,其中包括713个在原始研究中未发现的新基因,并揭示了中性粒细胞活化和增殖在2型糖尿病中的潜在作用 | 不同研究间的基因表达变化一致性较低,仅少数差异表达基因在所有数据集中被一致识别,样本量相对较小,可能影响结果的普遍性 | 阐明2型糖尿病的致病机制并识别潜在的生物标志物 | 2型糖尿病患者和对照受试者的全血样本 | 自然语言处理 | 2型糖尿病 | bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | 9名T2D患者和9名对照受试者(自身研究),加上七个公开数据集 | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |