单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 4281 - 4300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4281 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals the landscape of epithelial-mesenchymal transition molecular heterogeneity in esophageal squamous cell carcinoma
2024-04-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216723
PMID:38342234
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示食管鳞状细胞癌上皮间质转化的分子异质性景观 | 首次在单细胞水平系统描绘ESCC中EMT的分子异质性，发现SERPINH1作为新的EMT标志物，并验证靶向EMT的潜在药物 | 样本量相对有限，需要更大规模验证 | 探究食管鳞状细胞癌中上皮间质转化的分子异质性及其临床意义 | 食管鳞状细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据，RNA-seq数据，TCGA数据 | 44名患者的39个肿瘤样本和16个癌旁样本，共209,231个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4282 | 2025-10-06 |
Up-regulation of RAN by MYBL2 maintains osteosarcoma cancer stem-like cells population during heterogeneous tumor generation
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216708
PMID:38336287
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示骨肉瘤癌症干细胞通过MYBL2-RAN通路维持异质性肿瘤的分子机制 | 首次发现MYBL2转录上调RAN并通过增强MYC蛋白核积累促进癌症干细胞自我更新的正反馈机制 | 研究主要基于体外实验，需要进一步体内验证 | 探索骨肉瘤癌症干细胞维持肿瘤异质性的调控机制 | 骨肉瘤癌症干细胞及其分化的异质性细胞群体 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 临床骨肉瘤组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4283 | 2025-10-06 |
Inhibition of ATM promotes PD-L1 expression by activating JNK/c-Jun/TNF-α signaling axis in triple-negative breast cancer
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216642
PMID:38278470
|
研究论文 | 本研究揭示ATM通过抑制JNK/c-Jun/TNF-α信号轴负向调控PD-L1表达的新机制 | 首次发现ATM通过JNK/c-Jun/TNF-α信号通路负向调控PD-L1表达的分子机制 | 样本量有限（4例scRNA-seq，86例免疫组化），需更大规模研究验证 | 探索ATM调控PD-L1表达的分子机制及其在TNBC免疫治疗中的意义 | 三阴性乳腺癌细胞系、动物模型和临床标本 | 癌症生物学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序，免疫组化染色，细胞因子阵列分析，Western blot，荧光素酶报告基因检测 | 基因敲低稳定细胞系，动物模型 | 基因表达数据，蛋白质表达数据，临床病理数据 | 4例scRNA-seq临床标本，86例免疫组化TNBC标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4284 | 2025-10-06 |
Single-cell characterization of infiltrating T cells identifies novel targets for gallbladder cancer immunotherapy
2024-04-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216675
PMID:38280478
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建胆囊癌浸润T细胞图谱并建立分子分型标准 | 首次基于T细胞特征建立胆囊癌分子分型标准，识别了12种T细胞亚型及其与肿瘤微环境的关系 | 未提及样本量大小和研究队列的局限性 | 探索胆囊癌中T细胞的异质性并开发免疫治疗新靶点 | 胆囊癌患者的浸润T细胞 | 单细胞生物学 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4285 | 2025-10-06 |
Neoadjuvant chemotherapy-induced remodeling of human hormonal receptor-positive breast cancer revealed by single-cell RNA sequencing
2024-03-31, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216656
PMID:38266804
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示新辅助化疗对人类激素受体阳性乳腺癌的免疫微环境重塑作用 | 首次在单细胞水平系统揭示HR乳腺癌化疗前后免疫细胞组成变化，发现新的免疫细胞亚群与化疗敏感性相关 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索激素受体阳性乳腺癌化疗耐药机制及化疗对肿瘤微环境的重塑作用 | 激素受体阳性乳腺癌患者配对的化疗前后肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据,免疫荧光图像数据 | 配对的化疗前后HR乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4286 | 2025-10-06 |
scRNA-seq of colorectal cancer shows regional immune atlas with the function of CD20+ B cells
2024-03-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2024.216664
PMID:38253219
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析结直肠癌不同区域的免疫图谱，揭示CD20+ B细胞的功能 | 首次系统描绘结直肠癌不同解剖区域的免疫特征，发现CD20+ B细胞在右半和左半结直肠癌中具有不同的发育轨迹并与预后相关 | 样本量相对有限（19个样本），需要在更大队列中验证 | 表征结直肠癌不同区域的免疫景观并寻找潜在治疗靶点 | 结直肠癌患者肿瘤组织和配对正常组织 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19个样本（来自4个区域），共39,484个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4287 | 2025-10-06 |
Updates in Skin Cancer in Transplant Recipients and Immunosuppressed Patients: Review of the 2022-2023 Scientific Symposium of the International Immunosuppression and Transplant Skin Cancer Collaborative
2024, Transplant international : official journal of the European Society for Organ Transplantation
IF:2.7Q2
DOI:10.3389/ti.2024.12387
PMID:38562207
|
综述 | 总结2022年国际免疫抑制与移植皮肤癌协作组科学研讨会关于移植受者和免疫抑制患者皮肤癌的最新研究进展 | 汇集了皮肤癌在免疫抑制人群中的最新研究成果，包括化学预防、免疫抑制方案、免疫治疗和空间转录组学等前沿领域 | NA | 回顾和总结移植受者和长期免疫抑制患者皮肤癌研究领域的最新科学进展 | 实体器官移植受者和其他形式长期免疫抑制患者 | NA | 皮肤癌 | 空间转录组学 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4288 | 2025-10-06 |
Idiopathic subglottic stenosis arises at the epithelial interface of host and pathogen
2023-May-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2945067/v1
PMID:37292825
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究特发性声门下狭窄的发病机制，揭示上皮细胞异常与微生物群位移在纤维化过程中的作用 | 首次利用国际患者队列和单细胞RNA测序无偏倚地表征声门下狭窄的细胞亚群，发现上皮祖细胞耗竭和微生物群位移至固有层的新机制 | 疾病罕见性和患者地理分布广泛可能限制样本代表性，动物模型与人类疾病的完全一致性尚需验证 | 探究特发性声门下狭窄的发病机制和病理过程 | 特发性声门下狭窄患者的病变黏膜组织和动物模型 | 单细胞基因组学 | 特发性声门下狭窄 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、微生物组数据 | 国际iSGS患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4289 | 2025-10-06 |
Unique Cell Type-Specific Signaling Patterns Define Cholesteatoma
2025-Aug-01, Otology & neurotology : official publication of the American Otological Society, American Neurotology Society [and] European Academy of Otology and Neurotology
IF:1.9Q2
DOI:10.1097/MAO.0000000000004455
PMID:40062383
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析胆脂瘤的细胞组成和细胞类型特异性信号通路 | 首次在单细胞水平上识别胆脂瘤的细胞类型特异性信号模式，揭示了传统批量分析无法发现的细胞异质性 | 样本量有限，仅为计算机模拟细胞研究 | 识别驱动胆脂瘤的细胞类型和信号通路 | 人类胆脂瘤标本和正常人类鼓膜组织 | 数字病理学 | 胆脂瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | CellChat算法 | 单细胞RNA测序数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4290 | 2025-10-06 |
Network-Guided Sparse Subspace Clustering on Single-Cell Data
2025-Jul-15, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666251359688
PMID:40662619
|
研究论文 | 开发了一种网络引导的稀疏子空间聚类方法NetworkSSC，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型识别 | 在传统稀疏子空间聚类基础上整合了基因网络拉普拉斯矩阵的正则化项，能够捕捉基因间的功能关联 | 仅在九个单细胞RNA测序数据集上进行了比较分析，样本规模有限 | 解决单细胞数据高维特性导致的传统聚类方法效果不佳问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型识别 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 稀疏子空间聚类 | 基因表达数据 | 九个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4291 | 2025-10-06 |
Integrative Single-Cell Analysis Decodes Gene Expression and Chromatin Accessibility in the Developing Human Fetal Brain
2025-Jul-15, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05184-x
PMID:40663269
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和染色质可及性测序，系统解析人类胎儿大脑发育过程中的基因表达和染色质调控机制 | 首次构建人类胎儿大脑发育的单细胞多组学整合图谱，揭示神经细胞分化轨迹和动态调控机制 | 研究样本仅涵盖8-17周孕期的流产胎儿组织，样本来源有限 | 解析人类胎儿大脑发育过程中的细胞异质性、谱系关系和转录调控网络 | 8-17周孕期的人类胎儿脑组织 | 单细胞组学 | 神经发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 流产胎儿脑组织（孕8-17周） | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4292 | 2025-10-06 |
Testis Molecular Pathways in CAIS Unveil Testosterone/Estradiol on Germ Cell Tumor Risk in Non-Obstructive Azoospermia
2025-Jul-14, The Journal of clinical endocrinology and metabolism
DOI:10.1210/clinem/dgaf404
PMID:40658795
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示非梗阻性无精子症中睾丸分子通路与生殖细胞肿瘤风险的关联 | 首次在CAIS患者睾丸体细胞中发现与精原细胞瘤微环境相关的转录特征，并证实睾酮/雌二醇比值对非遗传性NOA患者TGCC的预后价值 | 样本量有限，特别是CAIS病例仅有一例，需要更大规模研究验证 | 建立非遗传性和遗传性NOA睾丸体细胞中共享或特异的分子通路 | 睾丸体细胞、NOA患者、CAIS患者、Klinefelter综合征患者和睾丸生殖细胞癌患者 | 单细胞测序分析 | 男性不育症、睾丸生殖细胞癌 | 单细胞RNA测序、数据整合分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床数据 | 752名年龄匹配男性（120名生育者，155名不育者，116名NOA患者，18名KS患者，343名TGCC患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4293 | 2025-10-06 |
SCassist: An AI Based Workflow Assistant for Single-Cell Analysis
2025-Jul-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf402
PMID:40650988
|
研究论文 | 开发了一个基于大型语言模型的R包SCassist，用于指导单细胞RNA测序数据分析 | 首次将大型语言模型集成到单细胞RNA测序分析工作流中，提供参数推荐和结果解释 | NA | 简化单细胞RNA测序数据分析流程，降低技术门槛 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | LLM（大型语言模型） | 基因表达数据 | NA | Google, OpenAI, Meta | 单细胞RNA-seq | Gemini, GPT, Llama3 | 基于大型语言模型的单细胞分析辅助工具 |
| 4294 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals immunotherapy-driven bone marrow niche remodeling in AML
2025-Jul-11, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adw4871
PMID:40632867
|
研究论文 | 本研究通过单细胞空间转录组学揭示了免疫治疗驱动的急性髓系白血病骨髓微环境重塑 | 整合单细胞RNA测序与单细胞空间转录组学数据，开发基于深度学习的图像分析方法，实现精确的转录本定位和细胞间距离量化 | 存在测序深度限制，需要整合多种技术来弥补数据不足 | 研究免疫治疗对AML骨髓微环境中细胞相互作用的影响 | 接受pembrolizumab和地西他滨治疗的急性髓系白血病患者骨髓样本 | 数字病理学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学, 深度学习图像分析 | CNN | 空间转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 4295 | 2025-10-06 |
PIP4K2C inhibition reverses autophagic flux impairment induced by SARS-CoV-2
2025-Jul-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61759-1
PMID:40640184
|
研究论文 | 研究发现小分子抑制剂RMC-113通过抑制PIP4K2C和PIKfyve脂质激酶，逆转SARS-CoV-2诱导的自噬流障碍，从而抑制病毒复制 | 首次揭示PIP4K2C在SARS-CoV-2进入、RNA复制和组装/释放中的作用，并发现其与病毒非结构蛋白6结合调控自噬流 | 研究主要基于人类肺类器官模型，尚未进行体内验证 | 开发广谱抗病毒药物，研究SARS-CoV-2复制机制 | SARS-CoV-2和其他RNA病毒，人类肺类器官 | 病毒学 | COVID-19 | 脂质组学分析，蛋白质组学，单细胞转录组学，功能测定 | NA | 分子相互作用数据，基因表达数据，代谢物数据 | 人类肺类器官模型 | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4296 | 2025-10-06 |
Mineralocorticoid receptor knockout alters hippocampal CA2 neurons to become like those in CA1
2025-Jul-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08378-0
PMID:40640339
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法发现盐皮质激素受体敲除会导致海马CA2神经元获得CA1样分子表型 | 首次揭示盐皮质激素受体在控制海马CA2神经元身份中的关键作用，证明其缺失会使CA2神经元转变为CA1样表型 | 研究主要关注发育阶段，对成年期的影响尚不明确 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区域神经元 | 神经科学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4297 | 2025-10-06 |
Antiviral Monocytes Increase Prior to Detectable HIV-1 Rebound Viremia
2025-Jul-09, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf367
PMID:40628395
|
研究论文 | 本研究通过分析HIV-1治疗中断前后血浆蛋白质组和单细胞转录组，发现病毒反弹前CD16++单核细胞增加并表达抗病毒基因 | 首次在可检测的病毒反弹前发现CD16++单核细胞增加及其抗病毒基因表达特征 | 样本量有限，仅观察外周血单核细胞，未涉及组织驻留细胞 | 识别治疗中断后病毒反弹前的早期免疫信号 | HIV-1感染者的外周血单核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞转录组测序, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 4298 | 2025-10-06 |
Early developmental origins of cortical disorders modeled in human neural stem cells
2025-Jul-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61316-w
PMID:40634286
|
研究论文 | 本研究通过人类神经干细胞模型探索皮层障碍的早期发育起源 | 首次在人类神经干细胞中系统分析皮层和神经精神疾病风险基因的表达动态，揭示疾病特异性关键阶段和跨疾病信号汇聚机制 | 研究主要基于体外模型，与体内真实发育环境存在差异 | 探索人类端脑早期发育阶段在皮层障碍病因学中的作用 | 人类神经干细胞和皮层发育过程 | 发育神经生物学 | 皮层障碍，自闭症 | 单细胞转录组测序，基因表达分析 | 人类神经干细胞体外分化模型 | 基因表达数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4299 | 2025-10-06 |
Ptbp1 is not required for retinal neurogenesis and cell fate specification
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.02.662808
PMID:40631124
|
研究论文 | 本研究通过条件性敲除Ptbp1基因评估其在视网膜神经发生和细胞命运决定中的作用 | 首次在视网膜发育过程中系统评估Ptbp1功能，发现其缺失不影响视网膜正常发育 | 研究主要关注视网膜发育过程，未全面评估其他神经系统的可能影响 | 评估Ptbp1在发育性神经发生中的作用 | 视网膜祖细胞和Müller胶质细胞 | 神经发育生物学 | NA | 条件性基因敲除, bulk RNA-Seq, 单细胞RNA-Seq, 免疫染色 | NA | 基因表达数据, 剪接模式数据 | 胚胎期E16和成熟视网膜样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4300 | 2025-10-06 |
TCF7 functions as a prognostic biomarker in bladder cancer by strengthening EMT and stemness associated with TGF-β/SMAD3 signaling
2025-Jul, Molecular and cellular biochemistry
IF:3.5Q3
DOI:10.1007/s11010-025-05241-y
PMID:40025258
|
研究论文 | 本研究探讨TCF7通过调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路，从而促进膀胱癌EMT和干细胞特性的机制 | 首次揭示TCF7通过转录调控TGFBR1影响TGF-β/SMAD3通路驱动膀胱癌EMT和干细胞特性的新机制 | TCF7在膀胱癌中的具体转录调控机制仍需进一步阐明 | 探究TCF7在膀胱癌进展中的作用及调控机制 | 膀胱癌 | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |