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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4201 | 2026-05-31 |
A spatial atlas of the healthy human liver from live donors
2026-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10377-y
PMID:41986723
|
研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序构建健康人体肝脏空间基因表达图谱,并揭示早期脂肪变性肝细胞的动态变化 | 首次从活体健康捐赠者获取肝脏样本,避免了传统死后或病变邻近组织样本的基因表达偏差,并结合多种空间转录组学技术(Visium、Visium HD、MERFISH、PhenoCycler)和单核RNA测序进行全面分析 | 样本量有限(16个样本),且仅涉及早期脂肪变性,未涵盖其他肝脏疾病阶段 | 构建健康人体肝脏的空间基因表达参考图谱,并研究早期脂肪变性中肝细胞的变化 | 健康肝脏和病变肝脏的邻近正常组织 | 空间转录组学 | 肝脏疾病 | 空间转录组学、单核RNA测序(snRNA-seq)、多重抗误差荧光原位杂交(MERFISH)、PhenoCycler成像 | NA | 基因表达数据、图像 | 16个肝脏样本:8个来自年轻健康活体捐赠者,8个来自肝脏病变个体的邻近正常组织 | 10x Genomics, Vizgen, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 单核RNA测序, 多重抗误差荧光原位杂交, PhenoCycler成像 | 10x Visium, 10x Visium HD, MERFISH, PhenoCycler | 10x Visium空间转录组学、10x Visium HD高分辨率空间转录组学、Vizgen MERFISH多重抗误差荧光原位杂交、Akoya PhenoCycler成像系统 |
| 4202 | 2026-05-31 |
Spatial atlas of diabetic kidney disease reveals a B cell-rich subgroup
2026-May, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10363-4
PMID:42056516
|
研究论文 | 利用空间转录组学和单核RNA测序构建糖尿病肾病空间图谱,揭示以B细胞为主的亚群与疾病进展加速相关 | 跨平台整合Xenium和CosMx单细胞空间转录组学与单核RNA测序,首次构建可计算的组织架构图谱,并鉴定出以B细胞为主的免疫微环境定义的糖尿病肾病亚型 | 未提及 | 建立糖尿病肾病的空间转录组图谱,识别不同预后亚群及其组织微环境特征 | 糖尿病肾病患者的肾脏组织样本 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学、单核RNA测序 | 未提及 | 空间转录组数据、单核RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 | 10x Genomics、NanoString | 单细胞空间转录组学、单核RNA测序 | Xenium、CosMx | 未提及具体平台配置 |
| 4203 | 2026-05-31 |
Redundant and distinct mechanisms suppress innate immune activation during SARS-CoV-2 infection
2026-May, PLoS biology
IF:7.8Q1
DOI:10.1371/journal.pbio.3003808
PMID:42160380
|
研究论文 | 利用一系列重组SARS-CoV-2病毒,揭示NSP1与NSP15等蛋白通过冗余和不同机制抑制先天免疫激活 | 首次通过构建12个点突变的重组SARS-CoV-2病毒库,系统比较多种病毒蛋白在感染背景下对先天免疫的抑制相对贡献,并明确NSP1和NSP15在抑制I型干扰素应答和树突状细胞成熟中的关键作用 | 未在动物模型中对其他突变蛋白(如NSP2、ORF6等)进行体内验证;体外实验主要基于293T-ACE2/TMPRSS2细胞和Calu-3细胞系,可能不能完全代表体内感染微环境 | 阐明SARS-CoV-2感染过程中多种病毒蛋白抑制宿主先天免疫的机制及其相对重要性 | SARS-CoV-2病毒蛋白(NSP1、NSP2、NSP3、NSP6、NSP12、NSP13、NSP14、NSP15、NSP16、ORF3a、ORF6和ORF8)及相关突变病毒,人类细胞(293T-ACE2/TMPRSS2,Calu-3),人单核细胞来源树突状细胞,K18 hACE2转基因小鼠 | 分子生物学 | COVID-19 | 细菌人工染色体介导的诱变,ISRE驱动的荧光素酶报告基因检测,RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 12个重组SARS-CoV-2病毒突变体;293T-ACE2/TMPRSS2细胞;Calu-3细胞;人单核细胞来源树突状细胞;K18 hACE2转基因小鼠(具体数量未说明) | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA-seq平台 |
| 4204 | 2026-05-31 |
Atypical memory B cell clonal expansion and inflammatory programs associate with platelet-activating antibody development in COVID-19
2026-Apr-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.201033
PMID:41746733
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研究论文 | 运用单细胞RNA测序和B细胞受体库测序,揭示COVID-19患者中与血小板激活抗体产生相关的非典型记忆B细胞克隆扩增和炎症特征 | 首次系统描述血小板激活抗体阳性COVID-19患者的免疫特征,特别是非典型记忆B细胞的克隆扩增和RKH/Y5重链基序的富集 | 本摘要未明确提及研究局限性 | 鉴定与COVID-19患者血小板激活抗体产生相关的免疫特征 | COVID-19患者中产生血小板激活抗体(PEA+)和不产生抗体(PEA-)的亚群 | 数字病理学 | 冠状病毒病 | 单细胞RNA测序、单B细胞V(D)J-seq、血浆细胞因子和趋化因子分析 | NA | 基因表达数据、序列数据、蛋白质数据 | 未明确提及样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞B细胞V(D)J-seq | NA | NA |
| 4205 | 2026-04-20 |
Deciphering immune and cellular reprogramming during the progression from inflammatory bowel disease to colorectal cancer using multi-omics single-cell and spatial transcriptomics
2026-Apr-18, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08158-2
PMID:42001187
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4206 | 2026-04-17 |
Single-cell transcriptomics uncovers heterogenous cell clusters and the biomarker FUT11 in ovarian cancer progression
2026-Apr-15, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04299-y
PMID:41987229
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4207 | 2026-05-31 |
Hypoxia-Induced Fibroblast IL-6 Promotes Immunosuppressive Macrophage Phenotypes in Pancreatic Cancer
2026-Apr-13, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15080683
PMID:42041553
|
研究论文 | 揭示缺氧诱导的成纤维细胞IL-6通过JAK/STAT信号通路促进胰腺癌中免疫抑制性巨噬细胞表型的机制 | 利用胰腺星状细胞-肿瘤类器官共培养模型和单细胞RNA测序分析,首次揭示缺氧驱动的成纤维细胞重编程通过IL-6/JAK/STAT轴促进免疫抑制性巨噬细胞表型 | NA | 阐明缺氧微环境如何通过肿瘤-成纤维细胞-巨噬细胞互作促进胰腺导管腺癌免疫抑制 | 胰腺星状细胞、肿瘤类器官、巨噬细胞 | 计算机视觉 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | na |
| 4208 | 2026-05-31 |
Delta family protocadherins contribute to protoglomerular targeting of olfactory sensory neuron axons in the olfactory bulb
2026-Apr, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1012090
PMID:41920906
|
研究论文 | 通过斑马鱼嗅觉感觉神经元单细胞RNA测序,发现delta家族原钙黏蛋白在嗅觉轴突靶向投射中起重要作用 | 首次鉴定delta1和delta2原钙黏蛋白家族成员分别特异调控不同嗅觉小球区域的轴突靶向定位 | 仅使用斑马鱼模型,未在哺乳动物中验证;敲低实验未完全排除代偿机制影响 | 阐明嗅觉感觉神经元轴突靶向投射的分子机制 | 斑马鱼嗅觉感觉神经元及其轴突在嗅球中的投射 | 神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼嗅觉感觉神经元单细胞样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序系统 |
| 4209 | 2026-05-31 |
Single-cell analysis reveals that MXRA8 affected the progression of breast cancer via regulating ferroptosis
2026-Feb-02, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-026-04175-9
PMID:41629963
|
研究论文 | 通过单细胞分析揭示MXRA8通过调节铁死亡影响乳腺癌进展的机制 | 首次在单细胞水平上揭示MXRA8通过调控铁死亡影响乳腺癌进展的机制,并识别出对铁死亡最敏感的肿瘤亚群 | 尚未进行体内实验验证,且基于已有单细胞数据的再分析可能存在数据偏倚 | 探索乳腺癌细胞在铁死亡中的异质性及其调控机制,寻找新的生物标志物和治疗靶点 | 26名乳腺癌患者的单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF)算法 | 基因表达数据 | 26名乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4210 | 2026-05-31 |
Hyperactivated YAP1 Drives an Invasive EMT Subtype of Cervical Squamous Cell Carcinoma
2026-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.18.700207
PMID:41648504
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研究论文 | 揭示了由Hippo-YAP信号通路破坏导致的YAP1过度激活能够诱导一种不依赖于HPV的侵袭性宫颈鳞癌亚型,该亚型缺乏表面病变,从而可以逃避HPV和细胞学检测 | 首次发现YAP1过度激活可诱导HPV非依赖性侵袭性宫颈癌新亚型,该亚型可逃避现有筛查策略,并利用单细胞RNA测序和高分辨率空间转录组学揭示了其细胞结构、分子途径和免疫微环境 | NA | 探究YAP1过度激活在HPV非依赖性侵袭性宫颈癌亚型中的作用及其免疫逃逸机制 | YAP1驱动的HPV非依赖性侵袭性宫颈癌 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,高分辨率空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4211 | 2026-05-31 |
Cross-disease immune cells atlas reveals the similarities and differences of cell characteristics and interactions in rheumatic diseases
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1820336
PMID:42210923
|
研究论文 | 系统性比较五种风湿病和健康对照的外周血单个核细胞单细胞转录组数据,揭示免疫细胞特征和相互作用的共性与特异性 | 首次跨多种风湿病系统比较免疫细胞特征和细胞间相互作用网络,发现γδ T细胞功能受损的共享模块及MIF和GALECTIN信号通路的关键作用 | 仅涉及外周血单个核细胞,未涵盖组织驻留免疫细胞;样本量有限可能限制发现的普适性 | 揭示风湿病中免疫细胞特征和相互作用的共性与差异模式 | 五种风湿病患者(包含贝赫切特病、系统性红斑狼疮等)和健康对照的外周血免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 风湿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 五种风湿病患者及健康对照的外周血单个核细胞样本 | 未明确提及 | 单细胞RNA-seq | 未明确提及 | NA |
| 4212 | 2026-05-31 |
Key cellular subpopulations and mechanisms of propranolol in infantile hemangioma: insights from single-cell omics
2026, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2026.1795094
PMID:42210920
|
综述 | 通过单细胞组学揭示普萘洛尔治疗婴儿血管瘤的关键细胞亚群与机制 | 系统性地利用单细胞RNA测序技术解析了婴儿血管瘤的细胞异质性,明确了APLN阳性内皮细胞、CENPF阳性增殖周细胞等IH特异性亚群,以及CD146阳性壁细胞的促血管生成至脂肪生成动态转化,提出了疾病进展受主导细胞亚群动态转变调控而非单纯内皮过度增殖的新模型 | 研究主要基于对现有单细胞测序研究的综述,可能受限于原始研究的样本量及技术局限性,且对不同细胞亚群相互作用的体内验证尚不充分 | 阐明婴儿血管瘤双相行为(增殖期与消退期)的细胞基础及普萘洛尔作用机制 | 婴儿血管瘤组织的各种细胞类型,包括血管内皮细胞、周细胞、壁细胞、巨噬细胞、肥大细胞、端粒细胞等 | 数字病理学 | 婴儿血管瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4213 | 2026-05-31 |
SLC10A3 drives glioblastoma progression by remodeling the immunosuppressive microenvironment and promoting M2 macrophage migration
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1742452
PMID:42211491
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研究论文 | 探讨SLC10A3在胶质母细胞瘤进展和免疫逃逸中的临床意义与生物学作用 | 首次揭示SLC10A3通过重塑免疫抑制微环境和促进M2型巨噬细胞迁移驱动胶质母细胞瘤进展的机制 | NA | 研究SLC10A3在胶质母细胞瘤进展和免疫逃逸中的临床意义及生物学功能 | SLC10A3基因及其在胶质母细胞瘤中的作用 | 机器学习和数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 转录组测序、单细胞RNA测序、细胞间通讯分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | TCGA和CGGA队列的批量转录组数据 | NA | 批量RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4214 | 2026-05-31 |
Defining the urine proteome in boys with posterior urethral valves: a pilot study
2026, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2026.1752740
PMID:42211568
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研究论文 | 本研究利用液相色谱-串联质谱法分析后尿道瓣膜男孩的尿液蛋白质组,并结合单细胞RNA-seq图谱探究蛋白质的组织和细胞来源 | 首次对后尿道瓣膜男孩的尿液蛋白质组进行系统分析,并整合单细胞RNA-seq图谱以推断相关蛋白质的组织和细胞来源 | 样本量较小,仅为初步试点研究,结果需要在更大样本的纵向研究中验证 | 探索后尿道瓣膜男孩尿液蛋白质组的变化及其与肾功能和膀胱功能障碍的关系 | 20名后尿道瓣膜男孩和20名未受影响的对照男孩 | 机器学习 | 后尿道瓣膜 | 液相色谱-串联质谱, 单细胞RNA-seq | NA | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据 | 40名男孩(20例PUV患者和20例对照) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4215 | 2026-05-31 |
Deep Transfer Learning Links Benign Glands to Prostate Cancer Progression via Transcriptomics
2025-Dec-22, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf119
PMID:41317378
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研究论文 | 利用DEGAS深度学习框架分析前列腺癌空间转录组,发现形态良性腺体与癌症进展相关 | 首次将深度迁移学习应用于高分辨率空间转录组学,揭示形态良性腺体的分子改变与前列腺癌进展的关联 | 未明确提及潜在局限性,如样本量或验证范围 | 探究良性腺体在转录水平上与前列腺癌进展的联系,验证“场效应”假说 | 前列腺癌空间转录组数据、单细胞转录组数据及组织样本 | 计算机视觉, 机器学习 | 前列腺癌 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫组化 | 深度迁移学习(DEGAS框架) | 转录组数据, 图像 | 包含有无5年远处转移患者的前列腺组织样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 4216 | 2026-05-31 |
RAB25 modulates pit cell commitment by coordinating transforming growth factor-alpha secretion from gastric epithelial cells
2025-Dec-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08316-2
PMID:41365858
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析发现Rab25在胃上皮细胞中调控转化生长因子-α分泌,从而调节胃小凹细胞定向分化的机制 | 首次揭示Rab25通过调控TGFA分泌协调EGFR信号通路,影响胃体部小凹细胞定向分化的分子机制,并发现其在人Ménétrier病中表达降低 | 主要基于小鼠模型和体外细胞培养实验,人类样本数据有限,具体机制研究尚需进一步验证 | 探究胃上皮细胞中Rab25对转化生长因子-α分泌及小凹细胞定向分化的调控机制 | 胃体部小凹细胞和胃上皮细胞 | 数字病理学 | 消化系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠原代细胞培养样本及RAB25敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4217 | 2026-05-31 |
Age- and Sex- Driven Transcriptional and Metabolic Diversity in Myeloid-Derived Suppressor Cells After Mouse Sepsis
2025-Oct-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.06.680736
PMID:41278644
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了小鼠脓毒症后年龄和性别对骨髓源性抑制细胞转录和代谢多样性的影响 | 首次系统性地描述了年龄和性别对脓毒症后MDSC的扩增、转录组、通路激活、RNA速度、线粒体代谢及细胞间通讯的差异影响 | 未在人类样本中进行验证,且仅使用小鼠模型,可能无法完全反映人类脓毒症的复杂性 | 探究年龄和性别对脓毒症后骨髓源性抑制细胞(MDSC)转录和代谢状态的影响 | 年轻(3-4个月)和老年(18-24个月)成年雄性和雌性小鼠的脾脏白细胞 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠脾脏白细胞样本,包括年轻和老年雄性和雌性小鼠各若干只 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序平台 |
| 4218 | 2026-05-31 |
Single-cell RNA sequencing: enhancing the predictive accuracy of tumor immunotherapy efficacy
2025-09-08, Essays in biochemistry
IF:5.6Q1
DOI:10.1042/EBC20253017
PMID:40857744
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在提高肿瘤免疫治疗效果预测准确性方面的应用 | 全面探讨scRNA-seq在免疫治疗疗效预测和生物标志物发现中的潜力,并提出生物材料整合带来的新研究方向 | 未明确指出具体研究限制,但暗示现有研究存在挑战需进一步探索 | 回顾scRNA-seq在免疫治疗中的现状,识别挑战并提出未来方向 | 肿瘤微环境中的免疫细胞异质性及生物材料整合 | 机器学习 | 肿瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4219 | 2026-05-31 |
Insight into pericytes in glioblastoma angiogenesis: In vivo tracking by two-photon microscopy and proteomic profiling
2025-09, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70073
PMID:40772404
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研究论文 | 通过双光子显微镜和蛋白质组学分析,揭示周细胞在胶质母细胞瘤血管生成中的时空动态和分子重编程 | 首次结合双光子活体成像和蛋白质组学分析,动态追踪周细胞在胶质母细胞瘤血管生成中的空间重排和分子变化,并发现周细胞在肿瘤早期和晚期具有阶段依赖性作用,为抗血管治疗提供了新靶点 | 研究主要基于小鼠模型,未在人类样本中进行实时成像验证;蛋白质组学数据来自FACS分选细胞,可能遗漏低丰度或细胞间异质性变化 | 阐明周细胞在胶质母细胞瘤血管生成中的时空动态、分子重编程及其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠胶质母细胞瘤模型中的Pdgfrb+周细胞、肿瘤细胞和肿瘤血管 | 数字病理学, 计算机视觉 | 胶质母细胞瘤 | 双光子显微镜, 蛋白质组学, RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 图像, 蛋白质组数据, 转录组数据 | 小鼠模型(GL261-Luc和GL261-CFP细胞)及转基因小鼠(PT小鼠和DTA小鼠);人类胶质母细胞瘤单细胞RNA-seq数据用于验证 | Illumina, NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | Illumina NovaSeq, NA | 用于单细胞RNA-seq的人类胶质母细胞瘤样本测序;蛋白质组学使用LC-MS/MS |
| 4220 | 2026-05-31 |
Single-cell atlas of human liver and blood immune cells across fatty liver disease stages reveals distinct signatures linked to liver dysfunction and fibrogenesis
2025-Sep, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02255-y
PMID:40883571
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研究论文 | 通过对人类肝脏和血液免疫细胞在脂肪肝疾病各阶段的单细胞图谱分析,揭示了与肝功能障碍和纤维化相关的独特免疫特征 | 首次提供了涵盖MASLD/MASH全谱系人类队列的外周血和肝脏细针穿刺样本的单细胞RNA测序图谱,识别了MASH进展中增强的免疫调节程序及其与肝功能障碍和纤维化的关联 | 未明确提及,但可能包括样本量有限及对免疫机制的进一步验证需求 | 阐明免疫细胞在代谢功能障碍相关脂肪性肝病及其肝炎(MASLD/MASH)不同阶段中的角色,识别阶段特异性免疫靶点 | 人类外周血和肝脏细针穿刺样本中的免疫细胞 | 机器学习和数字病理学相关(基于单细胞转录组分析) | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病/脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 涵盖MASLD/MASH全谱系的人类队列(具体数量未提及) | 10x Genomics(推测,基于单细胞RNA-seq技术) | 单细胞RNA-seq | NA | NA |