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当前共找到 37491 篇文献，本页显示第 4181 - 4200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4181 | 2026-01-13 |
Single cell transcriptional profiling of monocytes from asthma patients show a predisposition for an inflammatory response
2026-Jan, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2025.07.008
PMID:41263748
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析比较了哮喘患者和健康对照者血液单核细胞的基因表达差异，并评估了γMSCs输注对哮喘患者单核细胞转录组的影响 | 首次在单细胞水平上揭示了哮喘患者单核细胞对干扰素反应的增强倾向，并展示了γMSCs输注能显著改变单核细胞的基因表达谱，包括降低HLA I类和干扰素信号通路基因的表达 | 样本量相对较小，且研究仅基于单次γMSCs输注后的观察，缺乏长期随访数据 | 比较哮喘患者与健康对照者血液单核细胞的转录组差异，并评估γMSCs治疗对哮喘患者单核细胞转录组的影响 | 哮喘患者和健康对照者的血液单核细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包括哮喘患者（严重和轻度）和健康对照者的血液单核细胞样本，具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4182 | 2026-01-13 |
Scaling Large Language Models for Next-Generation Single-Cell Analysis
2026-Jan-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.14.648850
PMID:41279114
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研究论文 | 本文基于Cell2Sentence框架，通过训练大型语言模型整合单细胞转录组数据与文本信息，以提升单细胞分析的预测和生成能力 | 首次将大型语言模型扩展至270亿参数规模，用于单细胞分析，实现了转录组与文本数据的统一处理，并支持多细胞上下文信息合成 | 模型在训练期间未接触的人类细胞模型中的实验验证有限，可能影响泛化能力 | 开发可扩展的单细胞分析平台，整合转录组和文本数据以支持下一代单细胞研究 | 单细胞RNA测序数据、生物文本和元数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 大型语言模型 | 文本 | 超过十亿个转录组数据、生物文本和元数据标记 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4183 | 2026-01-13 |
Single-cell transcriptomics reveals dynamics of natural killer cell expansion in a feeder cell-free culture of peripheral blood mononuclear cells-implications for immunotherapy
2026-Jan, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2025.10.004
PMID:41308233
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析外周血单个核细胞在无饲养细胞培养中自然杀伤细胞扩增的动态变化，为免疫治疗提供新见解 | 首次在无饲养细胞培养系统中，通过单细胞转录组学揭示NK细胞扩增的早期（培养第3至8天）关键影响因素，并识别出与CCL信号通路相关的潜在生物标志物 | 研究仅基于三个供体样本，样本量较小，可能限制结果的普遍性 | 探究影响供体间NK细胞体外扩增变异性的因素，以优化免疫治疗中的NK细胞供应 | 外周血单个核细胞（PBMCs）及其在体外培养中扩增的自然杀伤细胞 | 单细胞转录组学 | 癌症 | 单细胞转录组测序 | 轨迹推断和差异基因表达分析 | 单细胞RNA测序数据 | 三个供体的外周血单个核细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4184 | 2026-01-13 |
Restoring NR4A3 function in neutrophils alleviates sepsis by limiting NF-κB-dependent NETs formation and organ damage
2026-Jan, Molecular immunology
IF:3.2Q3
DOI:10.1016/j.molimm.2025.11.013
PMID:41443148
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研究论文 | 本研究揭示了孤儿核受体NR4A3在脓毒症中通过抑制中性粒细胞NF-κB信号通路，减少NETs形成和器官损伤的保护作用 | 首次阐明NR4A3通过调控NF-κB信号通路抑制中性粒细胞NETosis在脓毒症中的具体机制，并证明其治疗潜力 | 研究主要基于细胞和小鼠模型，临床转化需进一步验证；未深入探讨NR4A3下游具体靶基因 | 阐明NR4A3在脓毒症中性粒细胞NETosis中的功能及治疗潜力 | 脓毒症患者外周血单个核细胞、ATRA分化的HL-60中性粒细胞细胞系、CLP诱导的脓毒症小鼠模型 | 单细胞转录组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织病理学数据 | 来自GEO数据库的GSE175453和GSE167363数据集（脓毒症患者和对照者PBMCs）、细胞实验、小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4185 | 2026-01-13 |
LIMPACAT: Multi-omics attention transformer for immune prediction in liver cancer using whole-slide imaging
2026, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0339667
PMID:41511965
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研究论文 | 本文介绍了一种名为LIMPACAT的深度学习框架，利用全玻片图像预测肝细胞癌中的免疫细胞水平 | 提出了一种结合多组学注意力的Transformer模型，首次使用全玻片图像直接预测肝癌免疫微环境中的细胞组成 | 研究依赖于TCGA-LIHC数据集，该数据集缺乏直接的免疫细胞组成数据，需通过反卷积方法推断 | 开发一个深度学习框架，从组织病理学图像中预测肝癌的免疫细胞水平，以支持预后评估和个性化治疗 | 肝细胞癌（HCC）的全玻片图像和相关的免疫细胞组成数据 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序，反卷积方法，多重实例学习 | 注意力Transformer，深度学习 | 图像，RNA-seq数据 | 基于TCGA-LIHC数据集，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4186 | 2026-01-13 |
Spatial and single-cell transcriptomics landscape of adenomyosis
2025-Dec-26, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.12.042
PMID:41456646
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研究论文 | 本研究利用单细胞和空间转录组学技术，深入解析了子宫腺肌症的细胞和分子特征，并评估了促性腺激素释放激素激动剂治疗的影响 | 首次在单细胞和空间转录组学水平上全面描绘了子宫腺肌症的细胞景观，揭示了纤毛上皮细胞和免疫-血管生成互作在疾病发病机制中的关键作用，并阐明了GnRHa治疗的作用机制 | 样本量相对较小，且主要基于转录组数据，需要进一步的功能实验验证 | 解析子宫腺肌症的病因和细胞分子机制，并评估GnRHa治疗的效果 | 子宫腺肌症患者和健康对照者的子宫组织样本 | 数字病理学 | 子宫腺肌症 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 图像数据 | 15名参与者用于测序分析（11名患者和4名对照），额外13名参与者用于验证（11名患者和2名对照） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4187 | 2026-01-13 |
The Role of Metabolites in Cell-Cell Communication: A Review of Databases and Computational Tools
2025-Dec-26, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010049
PMID:41511333
|
综述 | 本文综述了用于识别代谢物介导的细胞间通讯的现有数据库和计算工具，并讨论了当前局限性与未来改进方向 | 系统总结并批判性评估了基于scRNA-seq数据的代谢物介导细胞间通讯的数据库与计算工具，并提出了结合空间组学和人工智能的未来发展方向 | 现有数据库因缺乏统一标准而变异性大，计算工具多从通用CCC推断方法改编，未能充分捕捉代谢物与其传感器间复杂的互作机制 | 总结和评估用于推断代谢物介导细胞间通讯的数据库与计算工具，以促进该领域的方法学发展 | 代谢物介导的细胞间通讯及其相关数据库与计算工具 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | scRNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4188 | 2026-01-13 |
B-cell lymphocytosis and reprogramming due to biallelic CARD11 mutations
2025-Dec-26, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.991
PMID:41456721
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研究论文 | 本文报告了一种由新型CARD11突变R331P纯合子引起的BENTA疾病新遗传基础，其特征为B细胞大量扩增并伴有异常转录程序 | 首次发现由CARD11 R331P纯合突变引起的常染色体隐性遗传BENTA疾病，揭示了B细胞扩增和重编程的新机制 | 研究基于单个患者样本，需要更多病例验证；突变对B细胞淋巴瘤发生机制的具体影响仍需进一步探索 | 探究BENTA疾病的遗传基础及其对B细胞增殖和功能的分子机制 | 携带CARD11 R331P纯合突变的BENTA患者样本及体外表达的T和B细胞 | 免疫学 | B细胞淋巴增殖性疾病 | 全外显子组测序，流式细胞术，质谱流式细胞术，单细胞RNA测序，体外细胞功能实验 | NA | 基因组数据，转录组数据，细胞表型数据 | 单个患者样本及对照样本 | NA | 单细胞RNA测序，全外显子组测序 | NA | NA |
| 4189 | 2026-01-13 |
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity
2025-Dec-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.18.695193
PMID:41497642
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研究论文 | 本文介绍了一种名为STARIT的新方法，它将成像空间转录组学数据转换为图像张量表示，以利用亚细胞异质性识别细胞类型和状态 | STARIT创新地将imSRT数据中的转录本转换为图像张量表示，结合深度学习计算机视觉模型，首次实现了基于亚细胞转录定位的细胞状态识别，克服了传统基因计数方法的局限 | 方法依赖于模拟数据和真实imSRT数据的验证，但未明确说明在更广泛数据集或不同技术平台上的泛化能力，且可能受细胞分割质量的影响 | 开发一种新方法来利用成像空间转录组学数据中的亚细胞分子异质性，以更精确地识别和表征细胞类型和状态 | 成像空间转录组学数据中的细胞及其亚细胞转录本分布 | 计算机视觉 | NA | 成像空间转录组学 | 深度学习计算机视觉模型 | 图像张量 | NA | NA | 成像空间转录组学 | NA | NA |
| 4190 | 2026-01-13 |
Single-cell and spatial transcriptomic profiling reveals distinct tumor microenvironment dynamics in cervical adenocarcinoma and squamous cell carcinoma
2025-Dec-19, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09310-2
PMID:41420004
|
研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了宫颈腺癌和鳞状细胞癌之间不同的肿瘤微环境动态特征 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，系统比较了宫颈癌两种主要组织学亚型的细胞和空间异质性，并发现了亚型特异性的免疫和基质特征 | 未明确说明样本的具体数量，且研究结果需要在更大规模的队列中进行验证 | 解析宫颈癌不同组织学亚型的肿瘤微环境异质性，为开发亚型特异性治疗策略提供依据 | 宫颈腺癌和鳞状细胞癌组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 4191 | 2026-01-13 |
AI-driven virtual cell models in preclinical research: technical pathways, validation mechanisms, and clinical translation potential
2025-Dec-11, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02198-6
PMID:41381900
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综述 | 本文综述了AI驱动的虚拟细胞模型在临床前研究中的技术路径、验证机制及临床转化潜力 | 通过整合多模态组学数据与深度生成模型、图神经网络等先进算法，构建高精度预测药物反应、基因扰动和疾病进展的虚拟细胞模型，并强调从计算评估到CRISPR检测和类器官平台实验验证的闭环工作流程 | 在监管接受度、数据隐私和模型可解释性方面仍面临挑战 | 探讨AI驱动的虚拟细胞模型在生命科学研究中的技术路径、验证机制及其在精准医疗和药物发现中的临床转化潜力 | 虚拟细胞模型及其在药物筛选和疾病建模中的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、CRISPR检测 | 深度生成模型、图神经网络 | 多模态组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、单细胞蛋白质组学 | NA | NA |
| 4192 | 2026-01-13 |
AI-based Predictive Signaling Pathway Profiling in Cardiac Fibrosis Suggests a Novel Combinatorial Treatment Strategy
2025-Dec-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692460
PMID:41497580
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研究论文 | 本研究利用人工智能分析心脏纤维化相关文献，结合单细胞RNA测序数据，揭示了JAK-STAT和TGF-β信号通路在急慢性心脏损伤中的动态作用，并提出了一种基于时序的组合治疗策略 | 首次利用AI模型从大量文献中预测心脏纤维化的关键信号通路，并通过单细胞分析验证了致病性肌成纤维细胞亚群，提出了一种时序差异性的JAK-STAT与TGF-β联合抑制新策略 | 研究主要基于小鼠模型和有限临床样本，AI模型的预测依赖于历史文献数据，可能无法涵盖所有未知机制，且联合治疗策略的临床转化效果仍需进一步验证 | 探索心脏纤维化的关键信号通路机制，并开发更有效的治疗策略以减轻病理性纤维化而不影响急性损伤后的代偿性瘢痕形成 | 小鼠心脏纤维化模型（急性心肌梗死和慢性横向主动脉缩窄）及临床心脏损伤样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，动态富集分析，基因敲除技术 | AI预测模型 | 文本（文献数据），基因表达数据 | 基于过去十年6,528篇心脏纤维化出版物训练的AI模型，以及小鼠模型和临床样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4193 | 2026-01-13 |
Study design and rationale for the NeoTRACE trial: a multicenter phase II study of neoadjuvant sacituzumab govitecan plus zimberelimab followed by adjuvant zimberelimab with or without sacituzumab govitecan in patients with resectable non-small cell lung cancer
2025-Dec, Future oncology (London, England)
DOI:10.1080/14796694.2025.2591213
PMID:41268635
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研究论文 | 本文介绍了NeoTRACE试验的研究设计和原理，该试验是一项评估新辅助sacituzumab govitecan联合zimberelimab，随后进行辅助zimberelimab联合或不联合sacituzumab govitecan在可切除非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性的II期研究 | 评估一种不含铂类药物的新辅助治疗方案（sacituzumab govitecan联合PD-1抑制剂zimberelimab）在可切除NSCLC中的应用，并探索循环肿瘤DNA动态、TROP2表达和空间转录组学作为生物标志物 | 该研究为单臂II期研究，缺乏对照组，且样本量较小（计划纳入50名参与者） | 旨在提高可切除非小细胞肺癌患者的病理完全缓解率，降低毒性，提高手术可行性，并通过个性化辅助治疗改善长期预后 | 可切除的II期至IIIB（N2）期、无已知EGFR/ALK突变的非小细胞肺癌患者 | NA | 肺癌 | 循环肿瘤DNA分析，空间转录组学 | NA | NA | 计划纳入50名参与者 | NA | NA | NA | NA |
| 4194 | 2026-01-13 |
Hypergraph-driven spatial multimodal fusion for precise domain delineation and tumor microenvironment decoding
2025-Dec-01, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09312-0
PMID:41326702
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研究论文 | 本文提出了一种名为HAST的超图驱动空间多模态融合工具，用于精确划分空间域和解码肿瘤微环境 | HAST通过整合基因表达、空间坐标和组织学特征构建局部超图，有效建模多对多空间关系，并利用超图卷积网络结合自监督对比学习融合多视图信息 | 未在摘要中明确提及 | 精确划分空间域并解码肿瘤微环境，以促进癌症研究中的空间组学分析 | 肿瘤微环境中的空间域和细胞相互作用 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 超图卷积网络 | 基因表达、空间坐标、组织学特征 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4195 | 2026-01-13 |
Squidiff: Predicting cellular development and responses to perturbations using a diffusion model
2025-Aug-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.16.623974
PMID:40909548
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研究论文 | 本文提出了一种基于扩散模型的生成框架Squidiff，用于预测不同细胞类型在环境变化下的转录组变化 | 利用扩散模型通过连续去噪和语义特征整合，学习瞬时细胞状态并预测高分辨率转录组景观 | NA | 预测细胞发育和对扰动的响应，以促进精准医学 | 细胞分化、基因扰动、药物响应、血管类器官发育、中子辐射和生长因子响应 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 扩散模型 | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4196 | 2026-01-13 |
Bile acids activate cancer-associated fibroblasts and induce an immunosuppressive microenvironment in cholangiocarcinoma
2025-Aug-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.05.017
PMID:40578361
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研究论文 | 本研究揭示了胆汁酸通过激活癌症相关成纤维细胞中的GPBAR1-CXCL10轴，促进胆管癌的免疫抑制微环境形成 | 首次发现胆汁酸特异性激活胆管癌中癌症相关成纤维细胞的GPBAR1受体，并通过CXCL10招募中性粒细胞形成免疫抑制微环境 | 研究主要基于临床前模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究胆管癌免疫治疗疗效有限的机制并寻找潜在治疗靶点 | 胆管癌细胞、癌症相关成纤维细胞、中性粒细胞 | 肿瘤免疫学 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个胆管癌临床前模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4197 | 2026-01-13 |
Spatiotemporal Cellular Dynamics of Germinal Center Reaction in Coronavirus Disease 2019 Lung-Draining Lymph Node Based on Imaging-Based Spatial Transcriptomics
2025-01, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2024.102180
PMID:39522760
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研究论文 | 本研究利用成像空间转录组学技术，揭示了SARS-CoV-2感染非人灵长类动物后，肺引流淋巴结中免疫细胞组成和组织结构在初次感染、恢复期和再感染期间的动态变化，重点关注生发中心反应和免疫记忆形成 | 首次应用成像空间转录组学技术，在空间维度上解析COVID-19感染过程中肺引流淋巴结的细胞动态和转录组模式，揭示了生发中心形成与免疫细胞互作的新机制 | 研究基于非人灵长类动物模型，结果可能不完全适用于人类；样本规模未明确，可能限制统计效力 | 阐明SARS-CoV-2感染后淋巴结构恢复的细节及其对免疫记忆的影响，以优化疫苗策略和精准治疗干预 | 非人灵长类动物的肺引流淋巴结组织 | 空间转录组学 | COVID-19 | 成像空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4198 | 2026-01-13 |
NK cells with adhesion defects and reduced cytotoxic functions are associated with a poor prognosis in multiple myeloma
2024-09-19, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2023023529
PMID:38875515
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了多发性骨髓瘤患者中NK细胞的转录组变化及其与不良预后的关联 | 首次在多发性骨髓瘤中通过单细胞RNA测序系统描绘了NK细胞的转录组景观，并鉴定出具有粘附缺陷和细胞毒性功能降低的CD16/CD226低表达NK细胞亚群与患者生存期缩短相关 | 样本量相对较小（10例患者），且为回顾性队列分析，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探究多发性骨髓瘤患者中NK细胞的表型和功能变化及其临床意义 | 多发性骨髓瘤患者和健康对照者的NK细胞 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10例多发性骨髓瘤患者和10例年龄/性别匹配的健康对照者进行单细胞测序；177例患者进行回顾性队列分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4199 | 2026-01-13 |
Identification of Hypoxia-ALCAMhigh Macrophage- Exhausted T Cell Axis in Tumor Microenvironment Remodeling for Immunotherapy Resistance
2024-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202309885
PMID:38956900
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研究论文 | 本研究通过整合bulk、单细胞和空间转录组学，揭示了肿瘤微环境中缺氧诱导的ALCAM高表达巨噬细胞与耗竭CD8 T细胞轴在免疫治疗抵抗中的作用机制 | 首次在单细胞分辨率和空间架构下系统描绘缺氧景观，并发现由恶性细胞、ALCAM巨噬细胞和耗竭CD8 T细胞组成的缺氧介导细胞间通讯枢纽 | 研究主要基于转录组学数据，缺乏蛋白质水平验证；临床前模型结果需在人体临床试验中进一步证实 | 探究肿瘤微环境中缺氧导致免疫治疗抵抗的细胞适应性机制 | 肿瘤微环境中的恶性细胞、巨噬细胞和CD8 T细胞 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4200 | 2026-01-13 |
Astaxanthin Alleviates Autoimmune Hepatitis by Modulating CD8+ T Cells: Insights From Mass Cytometry and Single-Cell RNA Sequencing Analyses
2024-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202403148
PMID:38874408
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研究论文 | 本研究探讨了虾青素通过调节CD8+ T细胞来缓解自身免疫性肝炎的作用机制 | 结合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，首次系统分析了虾青素在自身免疫性肝炎中对CD8+ T细胞数量和功能的调控作用 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探究虾青素在自身免疫性肝炎中的作用及其对免疫微环境的调控机制 | 自身免疫性肝炎小鼠模型 | 数字病理学 | 自身免疫性肝炎 | 质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据, 质谱流式数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |