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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-03-20 |
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Feb-25, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-026-10169-4
PMID:41741649
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研究论文 | 本研究通过多组学单细胞测序技术,分析了人类海马体神经发生在不同年龄和阿尔茨海默病状态下的分子特征 | 首次在人类海马体中结合单细胞RNA测序和染色质可及性分析,揭示了神经发生与认知弹性和衰退的分子网络 | 研究基于死后组织样本,无法动态追踪神经发生过程,且样本量相对有限 | 探究人类海马体神经发生在成年、衰老及阿尔茨海默病中的存在、调控机制及其与认知功能的关系 | 人类死后海马体组织,来自年轻成人、无认知障碍老年成人、超常记忆能力老年成人(SuperAgers)、临床前病理成人及阿尔茨海默病患者 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞多组学测序(单核RNA测序和单核ATAC测序) | NA | 单细胞多组学数据(RNA和染色质可及性) | 355,997个海马体分离的细胞核 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 402 | 2026-03-20 |
Genomics link obesity and type 2 diabetes to Alzheimer's disease to unveil novel biological insights
2026-Feb-17, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.64898/2026.02.10.26344393
PMID:41728290
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研究论文 | 本研究通过基因组学方法探讨了肥胖和2型糖尿病与阿尔茨海默病之间的共享遗传通路,揭示了性别特异性风险机制和潜在药物靶点 | 首次结合多性状分析、机器学习和单细胞转录组学,系统揭示了BMI和T2D对AD风险的性别特异性影响,并发现了35个效应基因及可药物靶点 | 研究主要基于遗传数据,需要进一步实验验证机制;样本分层可能限制普适性 | 阐明肥胖和2型糖尿病如何通过共享遗传通路影响阿尔茨海默病风险 | BMI和T2D的遗传数据与AD风险的关联 | 基因组学 | 阿尔茨海默病 | 基因分型、单细胞转录组学、机器学习 | 机器学习 | 遗传数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 403 | 2026-03-20 |
Seq-Scope-eXpanded: spatial omics beyond optical resolution
2026-02-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69346-8
PMID:41667485
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Seq-Scope-X的空间组学技术,它通过组织膨胀将测序分辨率提升至亚微米级别,实现了单细胞核质区室分辨的转录组和蛋白质组分析 | 将组织膨胀技术与Seq-Scope结合,首次实现测序空间转录组学的亚微米分辨率,突破光学衍射极限 | 未明确说明技术对样本类型的普适性及操作复杂度 | 开发超高分辨率空间组学技术以研究细胞结构与功能 | 小鼠肝脏、脑组织、结肠、脾脏及人类扁桃体组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序、空间蛋白质组学 | NA | 空间转录组数据、蛋白质组数据 | 多种组织类型(未明确样本数量) | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 基于组织膨胀的亚微米分辨率空间组学平台 |
| 404 | 2026-03-20 |
A single-cell transcriptomic dataset profiling traumatic brain injury and NeuroD1-based gene therapy in mice
2026-Feb-10, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-026-06788-1
PMID:41667502
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠创伤性脑损伤及NeuroD1基因治疗后的转录组变化 | 首次利用单细胞转录组学数据集揭示TBI后细胞组成和星形胶质细胞亚型的显著变化,并阐明NeuroD1基因治疗如何恢复线粒体和代谢功能 | 研究仅基于小鼠模型,机制尚未完全阐明 | 阐明创伤性脑损伤及NeuroD1基因治疗的分子和细胞机制 | 小鼠皮层刺伤模型的创伤性脑损伤 | 数字病理学 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals multiple pathways involving pulmonary immune and epithelial cells through which aryl hydrocarbon receptor activation attenuates acute respiratory distress syndrome
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf295
PMID:41182312
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了芳烃受体激活通过影响肺免疫和上皮细胞的多条通路来减轻急性呼吸窘迫综合征 | 首次在单细胞水平上系统解析了AhR激活在ARDS中调节多种细胞类型(如肺泡巨噬细胞、内皮细胞和上皮细胞)的转录组变化及通路机制 | 研究基于小鼠LPS诱导的ARDS模型,结果在人类ARDS中的直接适用性尚需验证 | 探究芳烃受体激活对LPS诱导的急性呼吸窘迫综合征的缓解作用及分子机制 | LPS诱导的ARDS小鼠模型中的肺组织细胞 | 单细胞组学 | 急性呼吸窘迫综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明样本数量,但涉及LPS诱导的ARDS小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2026-03-20 |
Spatial transcriptomics reveals coordinated endothelial and epithelial activator protein-1 activation in chronic lung allograft dysfunction
2026-Feb-07, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2026.01.028
PMID:41663041
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析揭示了慢性肺移植物功能障碍(CLAD)中内皮细胞和上皮细胞协调性激活蛋白-1(AP-1)活化的基因表达特征 | 首次在CLAD中利用空间转录组学技术同时揭示了上皮和内皮细胞中AP-1靶基因的协同上调,并发现JUNB和FOS在促炎、促纤维化基因网络中的核心枢纽作用 | 研究样本量有限,且为观察性研究,未能验证AP-1活化的具体调控机制 | 阐明慢性肺移植物功能障碍(CLAD)的特定基因表达谱和发病机制 | 人类肺组织样本(来自CLAD患者、非CLAD移植受者和非移植对照者) | 空间转录组学 | 肺移植相关疾病 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | 人类肺组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2026-03-20 |
From inhibition to regulation: serpins in health and disease
2026-Feb, Biomedical journal
IF:4.1Q2
DOI:10.1016/j.bj.2026.100950
PMID:41616576
|
综述 | 本期生物医学期刊聚焦于调控衰老、疾病进展和生物复杂性的多层次机制,特别是PAI-1的多功能作用及相关治疗策略 | 强调了PAI-1作为连接纤维蛋白溶解、细胞衰老、干细胞动态、纤维化和肿瘤生物学的多功能调节剂,并探讨了其小分子抑制剂在多种疾病中的治疗潜力 | NA | 探讨分子、细胞和系统水平上调控衰老、疾病进展和生物复杂性的机制 | PAI-1、m6A表观转录组重塑、铁死亡敏感性、外泌体介导的细胞间通讯等生物分子和过程 | 生物医学 | 血栓性疾病、慢性髓性白血病、系统性硬化症、肺癌、皮肤癌、肝细胞癌等 | 单细胞RNA测序分析、机器人辅助量化、可解释深度学习框架、定量三维成像、锥形束计算机断层扫描 | 深度学习框架 | 医学影像、测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 408 | 2026-03-20 |
GeoMx and RNAscope: A Comparative Assessment of Their Utility for Spatial mRNA Expression Profiling in Formalin-Fixed Breast Cancer Tissue
2026-Feb, Cytometry. Part A : the journal of the International Society for Analytical Cytology
DOI:10.1002/cyto.a.70020
PMID:41795633
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研究论文 | 本研究比较了NanoString GeoMx数字空间分析仪和RNAscope两种技术在福尔马林固定乳腺癌组织中空间mRNA表达谱分析的效用 | 首次在福尔马林固定乳腺癌组织中对高多重空间转录组学技术(GeoMx)和成熟的低多重原位杂交技术(RNAscope)进行直接定量比较 | PD-L1表达仅在少数样本中检测到,无法进行相关性分析;研究仅针对乳腺癌组织,结果可能不适用于其他组织类型 | 比较GeoMx和RNAscope两种技术在福尔马林固定组织中空间mRNA表达谱分析的性能和适用性 | 乳腺癌组织微阵列(TMA)样本,包括三阴性乳腺癌(n=48)和不同ER/HER2状态的乳腺癌(n=45) | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学,mRNA原位杂交 | NA | 空间mRNA表达数据 | 93个乳腺癌组织核心样本(来自两个组织微阵列) | NanoString, ACD Bio-Techne | 空间转录组学,mRNA原位杂交 | GeoMx Digital Spatial Profiler, RNAscope | GeoMx Cancer Transcriptomics Atlas(约1,800个基因),RNAscope探针(GATA3、SOX10、PD-L1 mRNA) |
| 409 | 2026-03-20 |
Spatial transcriptomic profiling uncovers the molecular effects of the neurotoxicant polychlorinated biphenyls (PCBs) in the brains of adult mice
2026-Jan-31, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-026-03466-x
PMID:41620578
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术,探讨了多氯联苯(PCBs)暴露对成年小鼠大脑功能和认知的影响 | 首次结合空间转录组学分析,揭示了PCBs暴露对小鼠多个脑区基因表达的特异性影响,并关联了血脑屏障完整性破坏的机制 | 研究仅使用雄性C57BL/6J小鼠,未考虑性别差异;暴露时间和剂量可能无法完全模拟人类长期低剂量暴露情况 | 评估PCBs暴露对大脑功能和认知的分子机制影响 | 成年雄性C57BL/6J小鼠 | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | 成年雄性C57BL/6J小鼠(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 410 | 2026-03-20 |
Tumor-infiltrating natural killer cell profiling for therapeutic stratification in patients with resectable non-small cell lung cancer
2026-Jan-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.01.01.696292
PMID:41509400
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析,识别了与吸烟相关的肿瘤浸润自然杀伤细胞亚群,并探讨了它们在可切除非小细胞肺癌患者治疗分层中的潜在应用 | 首次在非小细胞肺癌中识别出与吸烟和慢性阻塞性肺疾病严重程度相关的两种自然杀伤细胞亚群,并揭示了它们对手术和化疗免疫疗法反应的预测价值 | 样本量相对有限,且研究主要基于回顾性分析,需要前瞻性临床试验验证 | 识别吸烟相关的免疫细胞决定因素,以指导可切除非小细胞肺癌患者的治疗策略 | 非吸烟者和吸烟者的肺组织、浸润性肺腺癌患者的肿瘤免疫微环境、接受新辅助化疗免疫疗法后手术的非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 计算机细胞去卷积分析 | NA | RNA测序数据 | 61例肺组织(非吸烟者和吸烟者)、19例浸润性肺腺癌、102例切除的非小细胞肺癌、24例接受新辅助化疗免疫疗法的非小细胞肺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2026-03-20 |
Single-Cell Transcriptome and Microbiome Profiling Uncover Ileal Immune Impairment in Intrauterine Growth-Retarded Piglets
2026, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和微生物组分析,揭示了宫内生长迟缓(IUGR)仔猪回肠免疫功能受损的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和16S rRNA测序,系统探究IUGR仔猪回肠免疫细胞亚群分布、信号通路及微生物组变化,并识别出新的免疫相关转录因子和关键微生物作为潜在治疗靶点 | 样本量较小(仅3只IUGR仔猪和3只正常仔猪),且研究局限于7日龄仔猪,未涵盖其他发育阶段 | 探究IUGR仔猪肠道免疫功能障碍的基因调控模式和微生物组变化 | 宫内生长迟缓(IUGR)仔猪和正常同窝仔猪的回肠组织及内容物 | 单细胞组学 | 宫内生长迟缓 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),16S rRNA扩增子测序(16S-seq) | NA | 单细胞转录组数据,微生物组数据 | 3只IUGR仔猪和3只正常同窝仔猪 | NA | 单细胞RNA-seq,16S rRNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2026-03-20 |
Antibody Generation Using Cancer-Derived Small Extracellular Vesicles (sEVs): A Platform for Targeted Cancer Therapy and Potential Personalized Applications
2026-Jan, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202506918
PMID:41311345
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研究论文 | 本文开发了一种利用癌症来源的小细胞外囊泡(sEVs)生成肿瘤靶向单克隆抗体的新方法,并评估了其在靶向癌症治疗中的效果 | 创新点在于使用癌症来源的sEVs作为免疫原生成特异性单克隆抗体,并将其功能化到载药T细胞来源的sEVs上,实现靶向递送和免疫激活 | 研究主要基于卵巢癌细胞系OVCAR-8和小鼠模型,尚未在更广泛的癌症类型或临床环境中验证 | 开发更有效的肿瘤靶向配体,提高药物递送效率,应用于靶向癌症治疗和个性化肿瘤学 | 人类卵巢癌细胞系OVCAR-8、小鼠模型、癌症来源的小细胞外囊泡(sEVs)和单克隆抗体 | 靶向治疗与免疫学 | 卵巢癌 | 杂交瘤技术、RNA测序、空间转录组学 | NA | 测序数据、转录组数据 | 使用OVCAR-8细胞系和小鼠模型进行实验 | NA | RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 413 | 2026-03-20 |
Liver Sinusoidal Endothelial Cells Promote Metabolic Dysfunction-associated Steatohepatitis Progression via Interleukin-1R1-mediated Chemokine Production Induced by Macrophage-derived Interleukin-1β
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101698
PMID:41344438
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞来源的IL-1β通过LSEC上的IL1R1信号通路诱导趋化因子产生,从而驱动MASH炎症和纤维化进展的机制 | 首次阐明了在MASH中,巨噬细胞与肝窦内皮细胞之间通过IL-1β/IL1R1轴相互作用,并利用空间转录组学技术定位了这种相互作用主要发生在门静脉周围区域 | 体外研究使用了细胞系而非原代细胞,动物模型为饮食诱导,可能无法完全模拟人类MASH的复杂性 | 阐明IL-1β在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)病理进展中的作用机制 | THP-1巨噬细胞系、TMNK-1肝窦内皮细胞系、内皮细胞特异性Il1r1敲除小鼠、Cxcl10全身敲除小鼠、MASH患者肝组织 | 数字病理学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | RNA测序、空间转录组学分析 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | 小鼠模型(Il1r1ΔEC和Cxcl10-/-小鼠)、MASH患者肝组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 414 | 2026-03-20 |
Repeated Dextran Sulfate Sodium Exposure Elicits Distinct Immune Responses Reflecting Human Ulcerative Colitis
2026, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101714
PMID:41453640
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研究论文 | 本研究通过比较单次与重复DSS暴露诱导的小鼠结肠炎模型,评估其与人类溃疡性结肠炎的免疫反应相似性 | 首次系统比较了急性与重复DSS暴露模型在免疫细胞亚型状态、转录程序及微生物组变化方面的差异,并验证了重复暴露模型更贴近人类溃疡性结肠炎的免疫特征 | 研究基于小鼠模型,其免疫反应与人类疾病仍存在物种差异;样本量未明确说明,可能影响统计效力 | 评估不同DSS暴露模式(急性vs重复)作为溃疡性结肠炎研究模型的适用性,并确定更贴近人类疾病的实验条件 | DSS诱导的小鼠结肠炎模型,包括单次(急性)和两次(重复)DSS暴露组 | 数字病理学 | 溃疡性结肠炎 | 组织病理学、流式细胞术、单细胞RNA测序、16S rRNA分析 | NA | 图像、文本(转录组数据)、微生物组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2026-03-20 |
GPR65 as a Laryngeal Cancer Risk Gene Identified through Single-Cell Transcriptomics, Mendelian Randomization Analysis, and Experimental Validation
2026, Anti-cancer agents in medicinal chemistry
IF:2.6Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学、孟德尔随机化分析和实验验证,识别出GPR65作为喉癌的潜在风险基因,并探讨其在癌症发生中的功能机制 | 首次结合单细胞转录组学、孟德尔随机化分析和体外实验验证,系统识别并验证GPR65作为喉癌风险基因的功能 | 研究主要基于体外细胞实验,缺乏体内动物模型验证,且样本来源和数量可能有限 | 识别喉癌的潜在风险基因并研究其功能机制 | 喉鳞状细胞癌(LSCC)细胞系(TU686和Hep-2)、正常上皮细胞、肿瘤组织与正常组织 | 数字病理学 | 喉癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、全基因组关联研究(GWAS)、表达数量性状位点(eQTL)分析、qRT-PCR、免疫组化、细胞增殖、迁移和侵袭实验 | NA | 单细胞转录组数据、GWAS数据、TCGA数据、实验数据 | 未明确指定样本数量,但涉及LSCC细胞系、正常上皮细胞及组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-03-20 |
A clustering method for single-cell RNA sequencing data based on denoising and masking learning
2026, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2026.1758257
PMID:41852496
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研究论文 | 本文提出了一种基于去噪和掩码学习的单细胞RNA测序数据聚类方法scDMAC,旨在解决数据高维、稀疏和噪声问题 | 结合零膨胀负二项分布去噪自编码器和掩码自编码器,通过概率去噪和特征重建学习基因相关性,提升聚类性能 | 未在更广泛或更复杂的单细胞多组学数据上验证,且计算效率可能受数据规模影响 | 开发一种针对单细胞RNA测序数据的高效聚类方法,以应对数据稀疏性和噪声挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器(包括ZINB去噪自编码器和掩码自编码器) | 基因表达数据 | 多个基准scRNA-seq数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2026-03-20 |
A chromosome-level assembly and functional genomic resources for the model annelid Capitella teleta
2025-Nov-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.31.685816
PMID:41279112
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研究论文 | 本研究通过结合长读长和短读长测序与Hi-C染色质构象捕获数据,组装了多毛类模型生物Capitella teleta的染色体水平核基因组和线粒体基因组,提供了高质量的基因组资源 | 首次为Capitella teleta提供了染色体水平的基因组组装,揭示了核基因组与线粒体基因组之间的重排现象,并利用多组学数据集改进了功能基因组分析 | NA | 更新Capitella teleta的基因组资源,以支持进化发育生物学、比较基因组学、保护和生态毒理学研究 | 多毛类模型生物Capitella teleta的实验室品系 | 比较基因组学 | NA | 长读长测序, 短读长测序, Hi-C染色质构象捕获, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | 基因组序列, 转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, EM-seq | NA | NA |
| 418 | 2026-03-20 |
Lymphatic dysfunction is linked to disease pathogenesis in Duchenne muscular dystrophy animal models
2025-Sep-23, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2505656122
PMID:40966282
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研究论文 | 本研究通过动物模型探究了杜氏肌营养不良症(DMD)中淋巴系统功能障碍与疾病发病机制之间的关联 | 首次在DMD动物模型中系统性地揭示了淋巴管结构和功能失调,并发现炎症性淋巴管生成与肌肉功能改善相关 | 研究主要基于动物模型(小鼠和大),尚未在DMD患者中得到直接验证 | 探究淋巴系统在DMD疾病进展中的作用,特别是淋巴功能失调与慢性炎症的关系 | DMD动物模型(mdx小鼠、GRMD犬)以及小鼠和大鼠的淋巴肌细胞 | 单细胞组学 | 杜氏肌营养不良症 | 单细胞RNA测序,显微淋巴管造影,磁共振淋巴管造影,免疫荧光分析 | NA | 基因表达数据,影像数据,蛋白质数据 | 使用mdx小鼠、GRMD犬模型以及对照动物的淋巴肌细胞和组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 419 | 2025-03-22 |
Spatial Transcriptomics Reveals Differential Inflammatory Pathways in Discoid Lupus Erythematosus and Lichen Planus
2025-Sep, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.148
PMID:40113031
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2026-03-20 |
An integrated single-nucleus and spatial transcriptomics atlas reveals the molecular landscape of the human hippocampus
2025-Sep, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-025-02022-0
PMID:40739059
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研究论文 | 本研究通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据,揭示了人类海马体的分子景观和细胞类型空间组织 | 首次结合单核RNA测序和空间转录组学技术,构建了人类海马体的综合分子图谱,并利用NMF和标签转移方法整合数据,揭示了兴奋性和抑制性突触后特化的空间组织模式 | 研究仅基于十名成年神经典型捐赠者的样本,样本量相对较小,且可能未涵盖所有海马体亚区域或疾病状态 | 解析人类海马体中细胞类型的分子特征和空间组织,以理解其与认知和情绪功能的关联 | 人类海马体组织样本 | 空间转录组学 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | 非负矩阵分解, 标签转移 | 转录组数据 | 十名成年神经典型捐赠者的海马体样本 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |