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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-01-26 |
Single-cell sequencing analysis and machine learning model reveal aberrant TIM-3 expression in microglia during Alzheimer's disease progression
2026-Jan-24, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07621-w
PMID:41580850
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 402 | 2026-01-26 |
POSTN⁺ cancer-associated fibroblast-CCL3⁺ macrophage crosstalk defines the immune-excluded tumor microenvironment in clear cell renal cell carcinoma
2026-Jan-23, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102682
PMID:41579565
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和大规模转录组学数据,揭示了透明细胞肾细胞癌中POSTN⁺癌症相关成纤维细胞与CCL3⁺巨噬细胞之间的相互作用,定义了驱动免疫排斥和免疫治疗抵抗的基质-免疫信号轴 | 首次在ccRCC中系统性地识别了七种成纤维细胞亚型,并发现POSTN⁺ CAFs与CCL3⁺巨噬细胞在肿瘤侵袭前沿的空间共定位,形成缺氧、纤维化微环境,导致CD8⁺ T细胞排斥 | 研究主要基于转录组学数据,缺乏功能实验验证POSTN⁺ CAFs与CCL3⁺巨噬细胞相互作用的因果机制 | 探究透明细胞肾细胞癌中免疫排斥肿瘤微环境的基质-免疫相互作用机制 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境,特别是成纤维细胞亚型和巨噬细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组学 | CellChat, NicheNet, SpaGene | 转录组数据, 空间定位数据 | 整合了八个单细胞RNA测序数据集、两个空间转录组数据集以及多个批量转录组队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 403 | 2026-01-26 |
Decoding the heterogeneity of human undifferentiated spermatogonia reveals RAS-dependent regulation of stem cell fate
2026-Jan-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116868
PMID:41579373
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和抗体筛选,解码了人类未分化精原细胞的异质性,揭示了RAS信号通路在调控干细胞命运中的作用 | 首次系统鉴定了人类未分化精原细胞的四个标志物(PIWIL4、EGR4、PPP1R36、NANOS3)及其功能特征,并发现RAS信号通路在维持原始未分化精原细胞状态中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和转录组分析,在体内功能验证和临床应用转化方面仍需进一步探索 | 阐明人类未分化精原细胞的异质性及其调控机制 | 人类未分化精原细胞 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序、抗体筛选、比较转录组学 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2026-01-26 |
Activated CD38+ mast cells promote gastric cancer progression by suppressing CD8+ T cell cytotoxic activity through adenosine metabolism
2026-Jan-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116863
PMID:41579372
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了幽门螺杆菌感染下胃癌进展过程中胃黏膜微环境的动态变化,并验证了活化的肥大细胞通过腺苷代谢抑制CD8+ T细胞毒性促进胃癌进展的机制 | 首次在幽门螺杆菌相关胃癌进展的四个典型阶段进行单细胞RNA测序,系统描绘了细胞景观和动态变化,并发现活化的肥大细胞通过CD38和COX2上调腺苷和前列腺素E分泌,进而抑制CD8+ T细胞毒性的新机制 | 样本量相对较小(21个胃黏膜样本),且研究主要基于单细胞转录组数据,缺乏蛋白质水平或功能实验的全面验证 | 探究幽门螺杆菌感染下胃癌进展过程中胃黏膜微环境的动态变化及免疫调控机制 | 幽门螺杆菌感染患者的胃黏膜组织,涵盖胃癌进展的四个典型阶段 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 21个胃黏膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 405 | 2026-01-26 |
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencing based on coordinate convolutional neural network
2026-Jan-22, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种基于坐标卷积神经网络(CoordConv)的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别新方法BP-Coord,通过引入坐标信息和双三次插值上采样层提升模型性能 | 提出BP-Coord方法,首次将坐标信息作为额外通道融入卷积神经网络,并引入双三次插值上采样层,有效解决了传统CNN在scRNA-seq数据中因平移不变性导致的细胞类型误分类问题 | 未在更多样化的单细胞多组学数据集上进行验证,且未与其他新兴的深度学习架构(如Transformer)进行系统比较 | 开发更高效准确的单细胞RNA测序数据自动细胞类型识别方法 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 卷积神经网络(CNN)、坐标卷积神经网络(CoordConv) | 基因表达矩阵(可视为二维数据) | 五个公共scRNA-seq基准数据集(包括大规模PBMC数据集) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 406 | 2026-01-26 |
RBM15/IGF2BP3 promotes immune escape in bladder cancer by enhancing m6A modification of PFKFB4
2026-Jan-22, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2026.150142
PMID:41579989
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研究论文 | 本研究揭示了RBM15通过m6A修饰和IGF2BP3依赖的机制稳定PFKFB4表达,从而促进膀胱癌的糖酵解并抑制CD8 T细胞功能,为免疫治疗提供了新靶点 | 首次将RBM15介导的m6A修饰与PFKFB4的稳定性、糖酵解调控及CD8 T细胞功能抑制联系起来,并证明靶向RBM15可增强抗PD1疗法的疗效 | 研究主要基于膀胱癌模型,在其他癌症类型中的普适性有待验证;体内实验的长期疗效和安全性需进一步评估 | 探究m6A修饰在膀胱癌肿瘤微环境塑造中的作用,特别是RBM15对免疫逃逸的调控机制 | 膀胱癌细胞、CD8 T细胞、小鼠移植瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | 单细胞测序、空间转录组学、m6A-seq、乳酸化蛋白质组学、RIP-qPCR、MeRIP-qPCR、荧光素酶报告实验、RNA稳定性检测 | NA | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、蛋白质组数据、m6A修饰数据 | 未明确样本数量,但涉及体外细胞实验和体内小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 407 | 2026-01-26 |
Bimekizumab long-term response in psoriasis: Mechanistic insights into efficacy level and durability
2026-Jan-22, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.12.1013
PMID:41580158
|
研究论文 | 本文评估了bimekizumab在银屑病患者中长达4年的临床反应持久性,并探讨了其分子机制 | 通过单细胞RNA测序揭示了病变皮肤中表达IL17A和/或IL17F的组织驻留记忆T细胞亚群,并发现其与bimekizumab疗效持久性相关 | 研究基于回顾性临床数据整合和转录组分析,可能受样本选择和测序技术限制 | 评估bimekizumab治疗银屑病的长期疗效持久性并探究其分子机制 | 银屑病患者 | 数字病理学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | 503名患者(来自临床试验),另加三个独立单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 408 | 2026-01-26 |
Deciphering the cellular and metabolic landscape of lymph node metastasis in breast cancer using single-cell and spatial multi-omics
2026-Jan-22, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2026.01.002
PMID:41580234
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术,解析了乳腺癌淋巴结转移的细胞和代谢景观 | 构建了乳腺癌淋巴结转移的单细胞图谱,识别了早期播散癌细胞,揭示了代谢重编程和免疫调节在转移中的作用,并进行了计算药物重定位 | 样本量相对有限,空间转录组学验证仅基于四个组织切片,可能需要更大队列验证 | 阐明乳腺癌淋巴结转移的微环境细胞组成和信号网络 | 78个原发性乳腺癌肿瘤及其配对的淋巴结转移样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq数据,空间转录组学数据 | 78个原发性肿瘤和配对的淋巴结转移样本,以及四个转移淋巴结组织切片 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 409 | 2026-01-26 |
A Nanovesicle-Sericin-Based Hydrogel Scaffold for RGC Survival in Glaucoma via Regulation of Microglial Polarization
2026-Jan-21, ACS applied materials & interfaces
IF:8.3Q1
DOI:10.1021/acsami.5c18589
PMID:41490471
|
研究论文 | 本研究开发了一种负载干细胞和纳米囊泡的丝胶基水凝胶支架,旨在通过调节小胶质细胞极化来促进青光眼模型中视网膜神经节细胞的存活 | 开发了一种新型的、集成了源自牙周膜干细胞的纳米囊泡(负载原花青素)的丝胶基光交联水凝胶支架,用于协同调节神经炎症微环境 | NA | 开发一种生物材料支架,以改善青光眼病理条件下视网膜神经节细胞的存活 | 视网膜神经节细胞、小胶质细胞、牙周膜干细胞 | 生物材料与组织工程 | 青光眼 | 单细胞RNA测序、RNA测序、超速离心、脂质体挤出 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 410 | 2026-01-26 |
Integrative transcriptomic profiling reveals subtype-specific therapeutic vulnerabilities and resistance mechanisms in prostate cancer
2026-Jan-21, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15357-5
PMID:41566241
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组数据和临床分析,揭示了前列腺癌中雄激素受体依赖性的异质性,并识别了与治疗抵抗相关的分子亚型及关键耐药驱动因子MCL1 | 结合CRISPR-Cas9筛选、多队列转录组整合及空间与单细胞测序,系统解析了前列腺癌的AR依赖性和耐药机制,并发现了具有独立预后价值的侵袭性分子亚型(Cluster 3) | 研究主要基于细胞系和回顾性队列数据,缺乏前瞻性临床验证,且样本来源可能受限于特定平台或技术 | 解析前列腺癌中雄激素受体依赖性和耐药机制,以识别亚型特异性治疗靶点 | 前列腺癌细胞系(如VCaP、LNCaP、DU145等)、TCGA-PRAD、Changhai和DKFZ队列的临床样本、原发性和转移性肿瘤组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | CRISPR-Cas9筛选、RNA测序、空间转录组学、单细胞RNA测序 | 共识聚类、模糊聚类 | 转录组数据、临床数据 | 多个细胞系及TCGA-PRAD、Changhai、DKFZ队列的样本(具体数量未明确说明) | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 411 | 2026-01-23 |
Single-cell transcriptome analysis reveals mechanisms by which hippocampal deep brain stimulation promotes neurorepair and microglial subpopulation remodeling in ischemic stroke
2026-Jan-21, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-07388-0
PMID:41566372
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 412 | 2026-01-26 |
APM⁺ macrophages associated with plaque vulnerability via MIF-CD74 signaling: a multi-omics study
2026-Jan-21, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-025-00869-9
PMID:41566509
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了与斑块脆弱性相关的APM⁺巨噬细胞及其通过MIF-CD74信号通路的作用机制 | 首次结合代谢组学、单细胞RNA测序和空间转录组学,系统性地解析了APM⁺巨噬细胞在动脉粥样硬化斑块不稳定中的核心作用 | 研究主要基于小鼠模型和有限的人类样本,临床转化需进一步验证 | 探究动脉粥样硬化与缺血性心肌病共享的代谢失调机制及斑块不稳定性的细胞基础 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞亚群 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 代谢组学, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 机器学习 | 代谢组数据, 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 涉及ApoE-/-小鼠模型及多个队列的人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 413 | 2026-01-26 |
Immunometabolic reprogramming of macrophages: Emerging roles in skeletal muscle regeneration and therapeutic perspectives
2026-Jan-21, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2026.108109
PMID:41577156
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综述 | 本文综述了巨噬细胞免疫代谢重编程在骨骼肌再生中的作用及其治疗潜力 | 整合单细胞和空间转录组学技术揭示巨噬细胞亚群的异质性,并强调免疫代谢编程作为巨噬细胞可塑性的关键驱动因素 | NA | 探讨巨噬细胞免疫代谢如何调控骨骼肌再生,特别是在急性和慢性疾病条件下 | 巨噬细胞及其在骨骼肌再生中的免疫代谢重编程 | 数字病理学 | 肌肉萎缩症 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 414 | 2026-01-26 |
ELK1 promotes the progress of myeloid leukemia by hindering the differentiation of neutrophils
2026-Jan-20, Experimental hematology & oncology
IF:9.4Q1
DOI:10.1186/s40164-025-00742-4
PMID:41559783
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研究论文 | 本研究探讨了ELK1在急性髓系白血病(AML)进展中的作用,发现其通过阻碍中性粒细胞分化促进疾病发展 | 首次揭示ELK1通过损害造血干细胞干性并阻碍中性粒细胞分化来加速KrasG12D诱导的髓系白血病发展,并证明抑制ELK1可促进白血病细胞向成熟中性粒细胞分化 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类临床试验中验证ELK1抑制剂的治疗效果 | 探索ELK1在AML发病机制中的作用,并评估其作为治疗靶点的潜力 | 小鼠模型(条件性Elk1和KrasG12D表达小鼠)、骨髓移植样本、未分化白血病细胞 | 分子生物学与血液肿瘤学 | 急性髓系白血病 | 条件性基因表达、骨髓移植、bulk-cell RNA测序、单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据、细胞表型数据 | 多种转基因小鼠品系及体外培养的白血病细胞 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2026-01-26 |
Multi-Scale Transcriptomics Redefining the Tumor Immune Microenvironment
2026-Jan-15, Biotech (Basel (Switzerland))
DOI:10.3390/biotech15010007
PMID:41562697
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综述 | 本文综述了批量、单细胞和空间转录组学方法在肿瘤免疫微环境研究中的原理、应用和局限性,并强调了整合分析的新兴策略 | 提出了多尺度转录组学框架,整合批量、单细胞和空间转录组数据,以更详细和机制性地理解肿瘤免疫微环境 | 综述文章未进行原始数据分析,主要总结现有方法,可能未涵盖最新技术进展 | 重新定义肿瘤免疫微环境,以支持更精确的生物技术和免疫治疗策略的开发 | 肿瘤免疫微环境 | 数字病理学 | 肿瘤 | 高通量测序技术 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 批量RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 416 | 2026-01-26 |
Integrated human and mouse single-cell profiling reveals immune-stromal niche driving silicosis
2026-Jan-09, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2026.01.003
PMID:41520918
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研究论文 | 本研究通过整合人类和小鼠的单细胞RNA测序数据,揭示了驱动矽肺病发展的免疫-基质微环境中的关键细胞群和相互作用 | 开发了一种使用微型支气管镜的位点特异性矽肺病小鼠模型,并结合单细胞测序与细胞间通讯建模,首次系统性地揭示了CCL2-hi单核样巨噬细胞(MLM)及其分化亚群与基质细胞(如Sfrp1-hi/Spp1-hi成纤维细胞)在矽肺纤维化中的动态互作网络 | 研究主要基于单细胞转录组数据,功能验证和机制深入解析有待后续实验补充,且小鼠模型与人类疾病在病理进程上可能存在差异 | 阐明矽肺病中巨噬细胞与基质细胞相互作用的分子机制,以发现潜在的治疗靶点 | 矽肺病患者(人类)和小鼠模型中的肺组织细胞 | 数字病理学 | 肺纤维化/矽肺病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 细胞-细胞通讯建模 | 单细胞转录组数据 | 矽肺患者的全肺灌洗液样本及小鼠模型肺组织样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 417 | 2026-01-26 |
Discovery of New Markers for Haemogenic Endothelium and Haematopoietic Progenitors in the Mouse Yolk Sac
2026-Jan-06, Journal of developmental biology
IF:2.2Q3
DOI:10.3390/jdb14010004
PMID:41562864
|
研究论文 | 本研究通过重新注释小鼠卵黄囊单细胞RNA测序数据,发现了造血内皮和红系-髓系祖细胞的新分子标记物 | 通过亚聚类和拟时序分析,鉴定了造血内皮细胞和红系-髓系祖细胞的新型细胞表面标记物(FXYD5、SCARF1、FCER1G),并揭示了可能调控卵黄囊造血发生的候选信号和代谢通路 | 研究基于公开可用的单细胞RNA测序数据集,可能受限于原始数据的质量和覆盖度;研究结果主要在小鼠模型中验证,在人类或其他哺乳动物中的适用性有待进一步确认 | 阐明小鼠卵黄囊中造血内皮和红系-髓系祖细胞的起源、身份和分化动力学 | 小鼠胚胎卵黄囊中的造血-血管细胞群体 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 拟时序分析 | 单细胞转录组数据 | 公开可用的单细胞RNA测序数据集(未指定具体样本数量) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 418 | 2026-01-26 |
GDF3 promotes adipose tissue macrophage-mediated inflammation via altered chromatin accessibility during aging
2026-Jan, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-01034-6
PMID:41398392
|
研究论文 | 本文揭示了巨噬细胞通过自分泌GDF3-SMAD2/3信号维持炎症表型并加剧内毒素血症的机制 | 发现GDF3-SMAD2/3轴通过限制甲基化依赖性染色质压缩驱动年龄相关染色质重塑和巨噬细胞炎症 | NA | 探究衰老过程中巨噬细胞炎症表型维持的机制及其与内毒素血症的关系 | 小鼠巨噬细胞、人类脂肪组织样本及11,084名社区动脉粥样硬化风险研究参与者 | NA | NA | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质测序分析 | NA | RNA测序数据、染色质可及性数据 | 人类脂肪组织样本及11,084名参与者 | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 419 | 2026-01-26 |
Dynamics of lung-infiltrating virus-specific T cells associated with age-dependent SARS-CoV-2 pneumonia severity
2026-Jan, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1013866
PMID:41533733
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研究论文 | 本研究利用Nr4a3-Tocky小鼠模型,探究了年龄相关的T细胞功能障碍与SARS-CoV-2肺炎严重程度之间的关联 | 建立了一种新型的鼠适应SARS-CoV-2毒株感染Nr4a3-Tocky小鼠模型,该模型能够通过荧光Timer蛋白在体内实时分析抗原反应性T细胞的动态和诱导过程 | 研究基于小鼠模型,其结果向人类临床的转化需要进一步验证 | 阐明SARS-CoV-2肺炎年龄依赖性发病的免疫学机制 | 成年和老年Nr4a3-Tocky小鼠 | 免疫学 | COVID-19肺炎 | 单细胞RNA测序,Timer蛋白荧光分析,细胞因子检测 | NA | RNA序列数据,荧光成像数据,细胞因子浓度数据 | 未明确说明具体数量,但涉及成年和老年两组小鼠,并在感染后多个时间点(1-8 d.p.i.)进行分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 420 | 2026-01-26 |
Immune checkpoint TIM-3 defines hyperactivated NK cells and predicts fatal outcome in severe fever with thrombocytopenia syndrome
2026-Jan, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0013928
PMID:41544143
|
研究论文 | 本研究探讨了TIM-3在严重发热伴血小板减少综合征患者外周血NK细胞上的表达特征及其与疾病预后的关系 | 首次在SFTS中系统表征TIM-3⁺ NK细胞的表达谱,发现其与致死结局相关,并鉴定sTIM-3和sGalectin-9作为新型预后生物标志物 | 样本量较小(21例患者),单中心研究,需要更大规模队列验证 | 阐明TIM-3在SFTS免疫失调中的作用机制并寻找预后生物标志物 | 严重发热伴血小板减少综合征患者的外周血NK细胞及血清样本 | 免疫学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,细胞因子检测 | 加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,血清蛋白数据 | 21例SFTS患者和14例健康供者的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |