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当前共找到 44643 篇文献，本页显示第 401 - 420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-10-23 |
stPularity: Spatial Domain Identification via Purity-Constrained Louvain Clustering on Spatially Smoothed Cell Type Proportions
2026-Oct-02, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1177/15578666261491611
PMID:42825456
|
研究论文 | 提出stPularity，一种基于纯度约束Louvain聚类的空间转录组反卷积后聚类工具，利用细胞类型比例向量识别空间域 | 直接对反卷积输出的完整细胞类型比例向量进行聚类而非仅取主导细胞类型；在Louvain目标函数中引入归一化熵纯度项以权衡模块度；通过贝叶斯优化自动设置超参数并自动确定聚类数，无需真实标签或人工分辨率选择；与反卷积方法无关，仅在低维细胞类型面板（4-38种细胞类型）上运行 | 基于表达量的空间方法因重新处理全转录组而获得更高的绝对ARI；stPularity目标不同，仅从比例向量中恢复可解释的空间结构，绝对性能不及全转录组方法；在四个基准中仅三个数据集优于argmax基线；比例向量与基因表达PCA嵌入互补，相对优势取决于空间结构是组成型还是转录组型 | 解决空间转录组反卷积后标准空间域识别仅保留主导细胞类型（argmax）而丢弃其余组成信号的问题 | 空间转录组数据中每个spot的细胞类型比例向量及空间坐标 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组反卷积、Louvain聚类、贝叶斯优化 | 改进的Louvain聚类（模块度与归一化熵纯度项权衡）、k近邻图 | 细胞类型比例向量、空间坐标 | 四个基准数据集，细胞类型面板包含4-38种细胞类型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 402 | 2026-10-23 |
Inferring gene expression profiles of tumor clones
2026-Oct-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag717
PMID:42830452
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研究论文 | 本文提出了一种名为ClonalGE的概率图模型，用于同时推断肿瘤组织中癌克隆的基因型、基因表达谱及其空间映射 | 首次提出能够同时推断克隆基因型和转录表型的计算工具，通过将空间转录组学中的单核苷酸变异位点与DNA测序推断的克隆特异性变异进行概率匹配，并将空间转录组spot中的基因表达反卷积为单个克隆的贡献，同时提出基于蒙特卡洛后验样本的HDI+ROPE准则识别克隆间差异表达基因 | 仅在模拟数据和单个前列腺癌样本上进行了验证，缺乏大规模临床样本验证 | 开发计算工具以同时推断肿瘤组织中克隆的基因型和转录表型 | 肿瘤克隆（以前列腺癌样本为研究对象） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学，DNA测序 | 概率图模型 | 图像，文本（空间转录组数据和DNA测序数据） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 403 | 2026-10-23 |
NoiBic: a noise-tolerant biclustering algorithm for high-throughput gene expression data analysis
2026-Oct-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag743
PMID:42841722
|
研究论文 | 该文提出一种名为NoiBic的耐受噪声双聚类算法，用于从高通量转录组数据中识别有意义的基因模块。 | 结合基于最长近似公共子序列的种子识别策略与噪声感知的列扩展方法，提升噪声和重叠条件下的双聚类检测效果。 | 仅在模拟数据和bulk及单细胞RNA-seq数据集上评估，未在更多真实复杂疾病场景中验证。 | 开发耐受噪声的双聚类算法，以在高通量基因表达数据中准确恢复功能模块。 | 高通量转录组基因表达数据，包括模拟数据集、bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据。 | 机器学习 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 双聚类算法 | 基因表达矩阵 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 404 | 2026-10-23 |
Cohesin haploinsufficiency and inv(16) cooperate to reinforce Fli1 gene transcriptional programs during acute myeloid leukemia initiation and maintenance
2026-Oct, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-03070-6
PMID:42509256
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研究论文 | 该研究通过小鼠模型揭示了黏连蛋白单倍剂量不足与inv(16)协同增强Fli1基因转录程序，从而促进急性髓系白血病的发生和维持 | 颠覆了黏连蛋白突变会负向影响inv(16)驱动AML的初始假设，首次发现黏连蛋白缺失反而增强inv(16)驱动AML的侵袭性，并识别Fli1作为黏连蛋白突变AML中此前未认识的治疗脆弱点 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；未全面探讨其他黏连蛋白亚基突变的影响 | 探究黏连蛋白单倍剂量不足对inv(16)驱动急性髓系白血病的影响及其分子机制 | inv(16)驱动急性髓系白血病小鼠模型及白血病前造血干/祖细胞 | 癌症基因组学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序, 染色质可及性测序 | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性测序 | NA | NA |
| 405 | 2026-10-23 |
Systemic Loss of Chromosome Y Associates With Age-Related Ophthalmic Diseases in Middle-Aged Men: A Longitudinal Multi-Omic Study
2026-Oct, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70775
PMID:42894102
|
研究论文 | 基于英国生物银行22万余名男性的大规模纵向多组学研究，揭示Y染色体嵌合缺失（LOY）与年龄相关眼科疾病（尤其AMD）的关联，并构建预测模型 | 首次在纵向大规模队列中证明系统性LOY独立预测AMD发病风险；发现诊断前15年血浆蛋白组的非线性动力学轨迹及关键蛋白MMP-12在终点前12年即出现显著偏离；整合单细胞转录组验证CD16单核细胞和驻留巨噬细胞LOY频率最高及促炎表型；构建LightGBM模型实现5年发病风险预测 | 研究基于英国生物银行欧洲人群数据，外推性有限；LOY与AMD的因果关系仍需实验验证；单细胞数据为公共数据集整合分析，样本量相对有限 | 探究造血系统Y染色体嵌合缺失对感觉器官（尤其是视网膜）退行性病变的纵向影响及其分子机制 | 英国生物银行223,051名男性参与者、外周血和脉络膜组织单细胞RNA测序数据、血浆蛋白质组数据 | 多组学、医学遗传学、眼科疾病 | 年龄相关黄斑变性、年龄相关眼科疾病 | 基因分型、Olink血浆蛋白质组学、单细胞RNA测序 | LightGBM、限制性立方样条、因果中介分析 | 基因组变异数据、蛋白质组数据、单细胞转录组数据、临床表型数据 | 223,051名男性参与者（英国生物银行队列）；单细胞RNA测序数据集（外周血和脉络膜组织） | Olink、Illumina | bulk蛋白质组学、单细胞RNA-seq | Olink血浆蛋白质组学面板、Illumina测序平台 | Olink Explore血浆蛋白质组学检测；单细胞RNA测序公共数据集 |
| 406 | 2026-10-23 |
Immune Landscape and Intercellular Crosstalk in the Cornea of an Autoimmune-Mediated Dry Eye Disease
2026-Oct-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.67.12.32
PMID:42885991
|
研究论文 | 该研究通过全片免疫荧光和单细胞RNA测序全面刻画了自身免疫调节因子缺陷（Aire-/-）小鼠干眼病角膜中免疫细胞的组成、空间分布及其与非免疫细胞的信号交互。 | 首次在自发性自身免疫性干眼病小鼠模型中系统解析角膜免疫景观，揭示单核细胞来源巨噬细胞的不同转录程序、CD40-CD40L信号在T细胞、B细胞和巨噬细胞间的桥梁作用，以及上皮细胞和角膜基质细胞主动参与免疫激活，提示非T细胞机制在慢性干眼病发病中的贡献。 | 研究基于小鼠模型，结果向人类干眼病的转化仍需验证；样本量和具体测序细胞数未在摘要中说明；未涉及蛋白水平的功能验证或治疗干预实验。 | 全面刻画自发性自身免疫性干眼病小鼠角膜中驻留和浸润免疫细胞的身份与信号谱，以及它们与非免疫细胞的相互作用。 | 野生型（WT）和自身免疫调节因子缺陷（Aire-/-）小鼠的角膜组织 | 数字病理学 | 干眼病 | 全片免疫荧光，单细胞RNA测序 | NA | 图像，文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2026-10-23 |
Txnip/PDK4-Mediated Hyperdependence on Fatty-Acid Oxidation Amplifies Susceptibility of Diabetic Myocardium to Ischemia-Reperfusion Damage
2026-Oct, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.70277
PMID:42899436
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序、荧光原位杂交、代谢组学和动物实验，揭示了糖尿病心肌对缺血再灌注损伤易感性增加的机制，即TXNIP/PDK4介导的脂肪酸氧化过度依赖 | 首次发现C6心肌细胞亚型（以心肌收缩为特征），并揭示其数量减少和代谢异质性降低是糖尿病心肌缺血再灌注损伤的基础；阐明TXNIP/PDK4介导的代谢重编程是糖尿病心肌易感性的重要原因 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究糖尿病心肌易感性增加的具体机制，并探索潜在的心肌保护策略 | 糖尿病心肌缺血再灌注损伤模型中的心肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病, 糖尿病 | 单细胞测序, 荧光原位杂交, 代谢组学, 动物实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 408 | 2026-10-23 |
3D bioprinted human vascular organoid sheets promote functional ischemic repair and exhibit adaptive in vivo remodeling
2026-09-25, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-05256-2
PMID:42806326
|
研究论文 | 本文通过3D生物打印构建人血管类器官片（hVOS），并在小鼠后肢缺血模型中评估其促血管修复作用及移植后的适应性重塑 | 利用挤出式3D生物打印在GelMA生物墨水中按确定比例共打印hPSC来源的内皮细胞和平滑肌细胞，构建组成和空间结构可控的预血管化类器官片，并结合活体双光子成像和移植后单细胞RNA测序揭示移植物来源人血管细胞的适应性重塑 | 研究主要在小鼠后肢缺血模型中完成，尚未在大型动物或临床环境中验证；移植后移植物来源内皮细胞向静脉偏向和炎症状态重塑的机制及长期安全性仍需进一步研究 | 开发可重复、设计灵活的3D生物打印血管组织平台，促进缺血组织修复，并研究工程化人血管组织移植后的体内命运和适应性重塑 | 人多能干细胞来源的内皮细胞和平滑肌细胞、3D生物打印的人血管类器官片（hVOS）、小鼠后肢缺血模型及移植后回收的移植物来源人细胞 | 再生医学、组织工程、单细胞组学 | 缺血性血管疾病 | 3D生物打印、单细胞RNA测序、免疫荧光成像、激光散斑灌注成像、活体双光子成像、组织学分析 | NA | 图像、文本（单细胞转录组数据）、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2026-10-23 |
Galectin-1 fuels monocyte hyperinflammation and is a novel therapeutic target in myeloproliferative neoplasms
2026-09-24, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025032631
PMID:42345360
|
研究论文 | 本文揭示了Galectin-1在骨髓增殖性肿瘤（MPN）单核细胞中富集，并通过TLR4和NF-κB信号通路驱动单核细胞介导的炎症，为MPN提供了新的治疗靶点 | 首次发现Gal-1在MPN单核细胞中富集并作为单核细胞炎症的关键驱动因子，揭示了TLR4与Gal-1信号通路之间的交叉对话，并证实遗传或药理抑制Gal-1可改善MPN疾病特征 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，缺乏临床试验数据；Gal-1抑制剂的长期安全性和有效性尚未评估 | 探究galectin在骨髓增殖性肿瘤中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | MPN患者样本和小鼠模型中的单核细胞 | 单细胞转录组学、免疫学 | 骨髓增殖性肿瘤 | 单细胞RNA测序、质谱流式细胞术、共免疫沉淀、蛋白质三维建模、报告基因检测 | NA | 单细胞转录组数据、质谱流式数据、文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-10-23 |
Molecular heterogeneity in systemic sclerosis skin: insights from single-cell and spatial omics, and implications for disease stratification and cutaneous assessment
2026-09-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag258
PMID:42329219
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综述 | 该综述综合了2021至2025年间关于系统性硬化症皮肤的单细胞和空间多组学研究，探讨分子异质性及其对疾病分层和皮肤评估的意义 | 系统整合近期单细胞与空间转录组学证据，提出皮肤纤维化并非均一过程，而是由不同细胞状态和空间程序驱动的异质性模型，并讨论其对临床分层和治疗反应异质性的影响 | 基于已有研究的综述性总结，相关分子发现能否改善患者分层、治疗选择或皮肤结局评估仍需在更大规模且临床特征明确的队列中前瞻性验证 | 总结系统性硬化症皮肤单细胞和空间多组学研究进展，评估分子异质性与临床表型的关系，并讨论其对皮肤评估、治疗反应异质性和生物学分层的影响 | 系统性硬化症患者的皮肤组织及相关临床表型 | 数字病理学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 文本，图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 411 | 2026-10-23 |
Single-cell transcriptomics unveils metabolic and cellular dysregulation in striae gravidarum
2026-09-18, The British journal of dermatology
DOI:10.1093/bjd/ljag181
PMID:42141898
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研究论文 | 该研究通过单细胞和单核RNA测序揭示妊娠纹（SG）中成纤维细胞异质性和脂肪酸代谢重编程，并验证ACSBG1作为治疗靶点 | 首次在单细胞分辨率下描绘妊娠纹的细胞图谱，发现成纤维细胞亚群sC7到sC5的分化受阻及脂肪酸代谢重编程，并确定ACSBG1为关键酶和治疗靶点 | 未明确说明样本量大小和队列规模，功能验证主要在体外和小鼠模型中进行，缺乏更大规模临床验证 | 在单细胞水平阐明妊娠纹的细胞景观和分子机制，重点关注成纤维细胞亚群动态、细胞间通讯和代谢重编程 | 人类妊娠纹皮损和匹配的健康皮肤标本 | 皮肤生物学、单细胞组学 | 妊娠纹 | 单细胞RNA测序、单核RNA测序、定量PCR、组织学染色、免疫荧光、孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据、组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序、单核RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2026-10-23 |
The brain of the female Anopheles gambiae mosquito at spatial and single-cell resolution
2026-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76839-z
PMID:42897131
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研究论文 | 该论文利用空间和单细胞分辨率技术，绘制了雌性冈比亚按蚊大脑的细胞多样性和空间组织图谱，并分析了与交配、吸血和衰老相关的转录变化 | 首次在空间和单细胞水平上构建了雌性冈比亚按蚊大脑的图谱，揭示了与生活史事件相关的转录调控，并比较了与其他昆虫的差异 | 未发现恶性疟原虫感染对大脑转录组的影响，且研究仅关注雌性蚊虫 | 探究雌性冈比亚按蚊大脑的细胞组成和空间结构，以及生活史事件（交配、吸血、衰老）和疟原虫感染对大脑转录组的影响 | 雌性冈比亚按蚊大脑 | 神经科学、单细胞生物学、空间转录组学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 转录组数据、空间数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 413 | 2026-10-23 |
Absence of a prolonged macrophage and B cell response inhibits heart regeneration in the Mexican cavefish
2026-09-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77725-4
PMID:42897151
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研究论文 | 该文通过单细胞转录组学和免疫扰动比较墨西哥洞穴鱼与表层鱼的心脏再生差异，揭示巨噬细胞和B细胞在再生中的顺序性作用。 | 首次在同一物种内利用表面鱼与洞穴鱼比较模型，发现两个独立且顺序性的晚期免疫机制（晚期巨噬细胞吞噬作用和B细胞促进心肌细胞增殖）区分再生与非再生心脏修复，并在斑马鱼中验证B细胞机制的保守性。 | 研究主要基于鱼类模型，向哺乳动物临床转化的适用性尚需进一步验证；未明确巨噬细胞和B细胞机制在人类心脏中的直接保守性。 | 探究心脏损伤后再生反应与瘢痕反应差异的免疫机制 | 墨西哥洞穴鱼（Astyanax mexicanus）表面鱼和Pachón洞穴鱼，以及斑马鱼 | 单细胞转录组学、心脏再生、比较生物学 | 心血管疾病、心脏损伤与纤维化 | 单细胞转录组学、免疫扰动、药理学抑制 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 414 | 2026-10-23 |
scTransMIL bridges patient-level disease states and single-cell transcriptomics for cancer screening and heterogeneity inference
2026-09-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77538-5
PMID:42875445
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研究论文 | 提出基于Transformer多实例学习的AI框架scTransMIL，将单细胞转录组图谱与样本级标签直接关联，用于癌症筛查和异质性推断 | 将生物样本视为单细胞集合，采用Transformer多实例学习直接连接单细胞转录组谱与样本级标签，无需细胞特异性注释即可预测样本级癌症表型并发现全转录组生物标志物 | 摘要未明确说明模型的具体局限性，可能依赖于样本级标注的质量和数量，且需进一步验证在不同癌症类型和数据来源中的泛化能力 | 建立单细胞转录组与样本级表型之间的计算桥梁，用于癌症筛查、肿瘤异质性解析和生物标志物发现 | 单细胞转录组样本及对应的样本级癌症表型标签，包括转移性肿瘤的原发组织来源 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | Transformer | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 415 | 2026-10-23 |
Vascular and lymphatic dysregulation via non-EndoMT Col2a1 signaling in bisphosphonate-related osteonecrosis of the jaw
2026-09-10, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-77692-w
PMID:42864361
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研究论文 | 该研究整合全器官组织透明化成像、单细胞转录组学和蛋白质组学，构建了小鼠和人类BRONJ下颌微环境的多模态图谱，揭示了血管和淋巴管失调是BRONJ的标志性特征 | 首次构建BRONJ下颌微环境的多模态图谱；发现四种内皮亚型存在异常的Col2a1上调；鉴定出病理性Lrrc15⁺/Chad⁺成纤维细胞和Il6⁺巨噬细胞；通过谱系追踪排除了EndoMT机制；提出COL2A1-CD44/SDC4轴作为治疗靶点 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明BRONJ中血管和淋巴管失调的机制，并寻找潜在治疗靶点 | 小鼠和人类BRONJ下颌骨微环境 | 数字病理学 | 双膦酸盐相关性颌骨坏死 | 单细胞转录组学, 蛋白质组学, 组织透明化成像, 谱系追踪, siRNA沉默 | NA | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-10-23 |
Comparative Analysis of Primary and Liver Fibroblasts Reveals MET as a Potent Target in Pancreatic Cancer Metastasis
2026-Sep-05, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2026.101872
PMID:42697413
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研究论文 | 通过单细胞转录组比较原发胰腺与肝转移胰腺导管腺癌病灶，发现肝成纤维细胞来源的HGF与肿瘤细胞MET信号轴在肝转移微环境中显著上调 | 首次系统比较原发胰腺与肝转移胰腺导管腺癌的基质-上皮互作网络，揭示MET信号通路在肝转移龛中的特异性激活并验证其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于单细胞转录组与体外功能实验及免疫健全小鼠模型，尚缺乏大规模临床队列验证，MET抑制剂的临床转化效果仍需进一步评估 | 解析胰腺导管腺癌肝转移微环境中基质细胞与肿瘤细胞的相互作用，寻找转移性疾病的新治疗靶点 | 胰腺导管腺癌原发灶与肝转移灶组织中的成纤维细胞与肿瘤细胞 | 数字病理学, 肿瘤微环境研究 | 胰腺癌, 肝癌 | 单细胞转录组测序, 配体-受体互作分析, 功能实验 | NA | 单细胞转录组数据, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 417 | 2026-10-23 |
The post-transcriptional regulator HuR promotes immune evasion in pancreatic ductal adenocarcinoma
2026-Sep-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-26-0472
PMID:42696395
|
研究论文 | 该文揭示了RNA结合蛋白HuR通过稳定mTOR通路转录本驱动代谢重编程、限制T细胞营养消耗，从而促进胰腺导管腺癌免疫逃逸的机制 | 首次发现肿瘤内在的转录后调控因子HuR在PDAC免疫逃逸中的作用，阐明了HuR通过营养竞争优势抑制T细胞功能的代谢免疫交叉调控新机制，并提出HuR阻断联合免疫检查点治疗的转化策略 | 研究主要基于两种免疫健全小鼠PDAC模型，缺乏大规模人类临床样本验证；HuR在其它免疫细胞亚群中的潜在作用未完全阐明 | 探究肿瘤内在转录后调控因子HuR在胰腺导管腺癌肿瘤免疫微环境和免疫逃逸中的作用及机制 | 人类PDAC样本及两种免疫健全小鼠PDAC模型 | 肿瘤免疫学、分子生物学 | 胰腺癌 | RNA免疫沉淀测序、单细胞RNA测序、流式细胞术、空间转录组分析 | NA | 文本、图像、单细胞表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq、single-cell RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
| 418 | 2026-10-23 |
WDGTA: a wavelet-denoised graph attention framework for spatial transcriptomics deconvolution
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag584
PMID:42896093
|
研究论文 | 该文提出并验证了一个基于小波去噪和图注意力机制的WDGTA框架，用于空间转录组数据的细胞类型解卷积 | 引入基于小波的多尺度去噪与重构模块，利用随机投影森林构建加权拓扑图，并应用多头图注意力推断空间位点中的细胞类型比例 | 摘要未明确说明具体局限性 | 开发一个统一的框架用于空间转录组细胞类型解卷积，并准确刻画异质组织中的空间细胞类型组织和低丰度细胞群 | 两个物种、四个器官的五个空间转录组数据集，包括小鼠大脑、小脑和紫外线照射皮肤数据 | 空间转录组学 | 皮肤癌 | 空间转录组测序 | 图注意力网络 | 空间转录组数据、图像 | 五个数据集，来自两个物种和四个器官 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 419 | 2026-10-22 |
Correction: STORM: spatial transcriptomics optimization by resolution via matrix factorization
2026-Sep-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbag604
PMID:42899510
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2026-10-23 |
Identification of a spatially organized TREM2-associated permissive macrophage niche in human pulmonary tuberculosis alveolar pneumonia
2026-08-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-76814-8
PMID:42875426
|
研究论文 | 该研究整合空间转录组学、单细胞RNA测序、高分辨率成像和功能实验，比较人肺结核肺泡性肺炎与邻近肉芽肿，揭示TREM2⁺巨噬细胞在肺泡肺炎中的空间组织化免疫抑制生态位 | 首次在人类肺结核肺组织中鉴定出空间定位的TREM2相关容许性巨噬细胞生态位，揭示其与邻近肉芽肿在免疫结构和抗菌程序上的显著差异，并提出维生素D₃可逆转该程序 | 样本量较小（仅4例男性患者），未在更大队列中验证，且TREM2⁺巨噬细胞促进Mtb持续感染的具体因果机制尚需进一步功能验证 | 比较人肺结核肺泡性肺炎与邻近肉芽肿的免疫微环境差异，探索TREM2⁺巨噬细胞在Mtb持续感染中的作用 | 4例男性肺结核患者的肺活检组织 | 空间转录组学、单细胞转录组学、免疫学 | 肺结核 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、高分辨率成像、功能实验 | NA | 图像、文本、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 4例男性肺结核患者肺活检组织 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |