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当前共找到 35679 篇文献，本页显示第 4141 - 4160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4141 | 2025-11-19 |
How Single-Cell Transcriptomics of Hydractinia Is Informing the Evolution of Cnidarian Sensory Systems
2025-Sep-26, Integrative and comparative biology
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/icb/icaf090
PMID:40504553
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学技术构建了水螅虫成年群体的细胞图谱，探索其细胞生物学和细胞类型表达谱 | 构建了更新的水螅虫单细胞转录组图谱，首次全面探索其感觉细胞类型（包括刺细胞和神经元）及其基因表达的进化 | NA | 深入了解水螅虫的细胞生物学、细胞分化遗传调控以及感觉系统的进化 | 水螅虫（Hydractinia symbiolongicarpus 和 H. echinata）的成年群体 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序，CRISPR/Cas9基因敲除，shRNA敲低，合成RNA过表达 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4142 | 2025-11-19 |
Distinct roles for NF-κB in hematopoietic stem cells and the bone marrow milieu in promoting hematopoietic aging
2025-Sep-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116193
PMID:40875292
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研究论文 | 本研究通过实验模型解析NF-κB在造血衰老中的不同作用机制 | 首次揭示NF-κB在造血干细胞自主功能和骨髓微环境中分别调控造血衰老不同表型的独立机制 | 研究基于特定基因缺陷模型，可能无法完全反映自然衰老过程 | 阐明炎症信号通路NF-κB在造血衰老过程中的具体作用机制 | 造血干细胞和骨髓微环境 | 单细胞生物学 | 造血系统衰老 | 单细胞RNA测序 | IκB缺陷小鼠模型 | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型及人类HSC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4143 | 2025-11-19 |
Hypertension-Induced Neurovascular and Cognitive Dysfunction at Single-Cell Resolution
2025-Sep-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.14.648770
PMID:41000655
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究高血压诱导的神经血管和认知功能障碍的分子机制 | 首次在单细胞分辨率下揭示高血压早期（3天）就出现内皮细胞、少突胶质细胞和中间神经元的分子变化，远早于认知障碍显现 | 研究仅使用小鼠模型，需要在人类样本中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探索高血压影响脑细胞的分子机制及其与认知功能障碍的关系 | 高血压小鼠模型的新皮层细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高血压小鼠模型在不同时间点（3天和42天）的新皮层样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4144 | 2025-11-19 |
Development of an electroconductive Heart-on-a-chip model to investigate cellular and molecular response of human cardiac tissue to gold nanomaterials
2025-Sep, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 开发了一种导电性心脏芯片模型，用于研究人类心脏组织对金纳米材料的细胞和分子响应 | 首次将导电性水凝胶支架与微流控芯片系统结合，构建具有改善电生理特性的3D心脏芯片模型 | 模型仍需进一步验证其在长期培养和疾病建模中的稳定性 | 开发更仿生的体外心脏组织模型以研究心脏发育和药物反应 | 人类诱导多能干细胞来源的心肌细胞和心脏成纤维细胞 | 组织工程 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 心脏芯片模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4145 | 2025-11-19 |
The current landscape and emerging challenges of benchmarking single-cell methods
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf380
PMID:41045508
|
综述 | 本文系统评估了单细胞测序计算方法基准测试的研究现状与新兴挑战 | 提供了最全面的单细胞基准测试研究量化总结，涵盖282篇论文的系统分析 | 基于文献综述，缺乏原始实验数据验证 | 评估单细胞计算方法基准测试领域现状并识别关键挑战 | 单细胞测序计算方法基准测试研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 282篇研究论文（130篇纯基准测试论文+152篇方法开发论文） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4146 | 2025-11-19 |
A multi-omics resource of B cell activation reveals genetic mechanisms for immune-mediated diseases
2025-Jun-14, medRxiv : the preprint server for health sciences
DOI:10.1101/2025.05.22.25328104
PMID:40475139
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研究论文 | 本研究构建了一个B细胞激活的多组学资源，揭示了免疫介导疾病的遗传机制 | 首次系统表征了26名健康女性供体B细胞在六种不同激活条件下的多组学响应，揭示了刺激特异性开放染色质区域与免疫疾病遗传风险的关联 | 样本仅来自健康女性供体，未包括男性或患者样本，且样本量相对有限 | 阐明B细胞激活状态在免疫介导疾病中的遗传机制 | 来自26名健康女性供体的B细胞 | 基因组学 | 自身免疫疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, CITE-seq | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 26名健康女性供体 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 表观基因组学 | NA | CITE-seq（单细胞RNA-seq与表面蛋白标记联合检测） |
| 4147 | 2025-11-19 |
Peptide Driven Identification of TCRs (PDI-TCR) reveals dynamics and phenotypes of CD4 T cells in tuberculosis
2025-May-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652535
PMID:40654739
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为PDI-TCR的新方法，用于识别抗原特异性T细胞受体，并应用于结核病患者分析CD4 T细胞的动态变化和表型特征 | 开发了PDI-TCR检测方法，能够通过比较非重叠肽池反应来区分真正的抗原特异性TCR克隆型与非特异性旁观者激活相关的TCR | NA | 开发识别抗原特异性TCR的方法并研究结核病中T细胞的动态变化 | 结核病患者和结核分枝杆菌致敏健康个体的CD4 T细胞 | 免疫学 | 结核病 | 肽驱动TCR识别、单细胞RNA测序、TCR测序 | NA | 序列数据、基因表达数据 | 结核病患者和IGRA+健康个体 | NA | 单细胞RNA测序、bulk TCR测序 | NA | NA |
| 4148 | 2025-11-19 |
Distinct causes of three phenotypic hallmarks of hematopoietic aging
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.632900
PMID:39868295
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研究论文 | 本研究通过实验模型解析NFkappaB活性在造血衰老表型中的作用机制 | 建立了NFkappaB活性升高实验模型，首次揭示造血衰老三大表型由不同调控机制驱动 | 实验模型可能无法完全模拟自然衰老过程 | 解析造血衰老表型的分子机制 | 造血干细胞(HSC)和骨髓微环境 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,表观基因组学,转录组学 | IkappaBminus实验模型 | 单细胞RNA测序数据,表观基因组数据,转录组数据 | 老年小鼠和人类HSC数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4149 | 2025-11-19 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Adventitial Fibroblast Alterations during Mouse Atherosclerosis
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.05.616802
PMID:39868275
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小鼠动脉粥样硬化过程中外膜成纤维细胞的动态变化 | 首次在动脉粥样硬化发生过程中对外膜细胞进行单细胞RNA测序分析，并发现SERPINH1基因在成纤维细胞功能中的关键作用 | 研究仅使用雄性Ldlr -/-小鼠模型，样本量较小（每组两个样本，每个样本由三只小鼠混合） | 探究外膜细胞在动脉粥样硬化中的作用机制 | 小鼠主动脉外膜细胞和人类外膜成纤维细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 雄性Ldlr -/-小鼠，每组两个样本（每个样本由三只小鼠混合） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4150 | 2025-11-19 |
<italic>PDIA5</italic> and <italic>ARFIP1</italic> as Immunogenetic Biomarkers and Therapeutic Targets in Pancreatic Neuroendocrine Neoplasms: A Multi-Omics Study Integrating MR, Gene Expression Microarray, and Single-Cell Transcriptomics
2025, Neuroendocrinology
IF:3.2Q2
DOI:10.1159/000548070
PMID:41129479
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研究论文 | 通过多组学方法鉴定PDIA5和ARFIP1作为胰腺神经内分泌肿瘤的免疫遗传生物标志物和治疗靶点 | 整合孟德尔随机化、基因表达微阵列和单细胞转录组学数据，首次系统鉴定PDIA5和ARFIP1在胰腺神经内分泌肿瘤中的生物标志物价值 | 需要进一步验证和临床探索 | 识别胰腺神经内分泌肿瘤的可操作分子靶点和生物标志物 | 胰腺神经内分泌肿瘤（PanNENs） | 生物信息学 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 孟德尔随机化,基因表达微阵列,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA）,CIBERSORT | 蛋白质组数据,基因表达数据,单细胞转录组数据 | 多个公共数据集（GSE73338、GSE43795、GSE256136、TCGA、GTEx） | NA | 单细胞RNA-seq,基因表达微阵列 | NA | NA |
| 4151 | 2025-11-19 |
ELLA: Modeling Subcellular Spatial Variation of Gene Expression within Cells in High-Resolution Spatial Transcriptomics
2024-Sep-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.23.614515
PMID:39386706
|
研究论文 | 提出一种名为ELLA的计算方法，用于建模高分辨率空间转录组学中亚细胞水平的基因表达空间变异 | 创建统一细胞坐标系锚定不同细胞形态，利用非均匀泊松过程建模空间计数数据，采用表达梯度函数表征亚细胞表达模式 | NA | 开发计算工具分析高分辨率空间转录组数据中的亚细胞基因表达定位 | mRNA的亚细胞定位模式 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 非均匀泊松过程 | 空间基因表达数据 | 四个不同技术的空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4152 | 2025-11-19 |
Mapping single-cell developmental potential in health and disease with interpretable deep learning
2024-Mar-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.19.585637
PMID:38562882
|
研究论文 | 开发了可解释的深度学习框架CytoTRACE 2，用于从单细胞RNA测序数据中表征细胞发育潜能和分化状态 | 首次在绝对尺度上量化细胞潜能，在31个数据集上优于现有方法，能够重建胚胎发育时间层次并发现与癌症预后相关的细胞表型 | 仅基于scRNA-seq数据，未整合其他组学数据验证 | 表征单细胞发育潜能和分化状态 | 人类和小鼠单细胞 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 单细胞RNA测序数据 | 31个人类和小鼠scRNA-seq数据集，涵盖28种组织类型，62个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4153 | 2025-11-19 |
Single-cell RNA sequencing identifies eggplant as a regulator of germ cell development in Drosophila
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256475
PMID:37603128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术发现茄子基因(eggpl)在果蝇生殖细胞发育中起关键调控作用 | 首次发现茄子基因(eggpl)在连接营养状态与生殖细胞增殖分化中的调控作用 | 研究仅限于果蝇模型，未在其他生物中进行验证 | 探索果蝇生殖细胞发育的调控机制 | 果蝇卵巢生殖系干细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序,RNAi筛选,生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4154 | 2025-11-19 |
Defects in microvillus crosslinking sensitize to colitis and inflammatory bowel disease
2023-10-09, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202357084
PMID:37691494
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研究论文 | 本研究探讨微绒毛交联缺陷如何通过破坏肠道屏障功能增加结肠炎和炎症性肠病的易感性 | 首次揭示微绒毛交联在肠道屏障功能中的关键作用，并证明CDHR5缺陷与黏液层通透性增加共同导致炎症性肠病易感性 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来自单细胞RNA测序分析，需要进一步验证 | 探究微绒毛交联在结肠炎和炎症性肠病发病机制中的作用 | CDHR5基因敲除小鼠和溃疡性结肠炎患者的肠道上皮细胞 | 细胞生物学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,电子显微镜 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,显微图像 | CDHR5缺陷小鼠和溃疡性结肠炎患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4155 | 2025-11-19 |
Deciphering pathogenic cellular module at single-cell resolution in checkpoint inhibitor-related pneumonitis
2023-10, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-023-02805-4
PMID:37653115
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示检查点抑制剂相关肺炎的关键致病细胞模块和分子通路 | 首次在单细胞分辨率下系统解析CIP的免疫微环境，发现CXCL13+ T细胞和CXCL9+单核细胞的关键作用，并提出具有高诊断能力的免疫特征 | 样本来源仅限于支气管肺泡灌洗液，未涉及其他组织部位；样本量相对有限 | 阐明检查点抑制剂相关肺炎的病理生理机制，为精准诊断和治疗提供新策略 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 单细胞生物学 | 免疫相关肺炎 | 单细胞RNA测序，T细胞受体分析，拟时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4156 | 2025-11-19 |
Old and newly synthesized histones are asymmetrically distributed in Drosophila intestinal stem cell divisions
2023-07-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256404
PMID:37255015
|
研究论文 | 本研究报道了果蝇肠道干细胞分裂过程中新旧组蛋白H3和H4的不对称分配现象及其与细胞命运决定的关系 | 首次在体细胞干细胞谱系中发现组蛋白不对称继承现象，并证明其通过影响Delta基因表达参与细胞命运决定 | 研究仅针对果蝇肠道干细胞，在其他物种或组织中的普适性尚未验证 | 探究组蛋白继承模式在干细胞分裂和细胞命运决定中的作用机制 | 果蝇肠道干细胞及其分裂后的细胞对 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，突变体表达 | NA | 基因表达数据，蛋白质分布数据 | 果蝇肠道干细胞及其衍生细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4157 | 2025-11-19 |
Monocytes differentiate along two alternative pathways during sterile inflammation
2023-07-05, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202256308
PMID:37191947
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了单细胞在无菌炎症中沿两种不同途径分化为巨噬细胞或树突状细胞的命运决定机制 | 首次通过时间序列单细胞RNA测序在体外模型中同时追踪人类单细胞向巨噬细胞和树突状细胞的分化路径，并鉴定出关键的命运决定转录因子 | 研究主要基于体外模型和小鼠体内验证，人类体内直接证据有限 | 阐明单细胞在炎症过程中分化为巨噬细胞或树突状细胞的命运决定机制 | 人类单细胞和小鼠无菌性腹膜炎模型 | 单细胞生物学 | 炎症性疾病 | 单细胞RNA测序，计算生物学方法 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4158 | 2025-07-30 |
Leveraging single-cell spatial transcriptomics and connectomics to resolve brain circuit function in psychiatry
2026-Jan, Neuropsychopharmacology : official publication of the American College of Neuropsychopharmacology
IF:6.6Q1
DOI:10.1038/s41386-025-02178-0
PMID:40721521
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4159 | 2025-11-18 |
EP300 as a potential mediator of stress-induced sleep disruption through blood-brain barrier dysfunction and neuroinflammation
2025-Dec, Sleep medicine
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.sleep.2025.106802
PMID:40939466
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了EP300基因在应激诱导睡眠障碍中通过血脑屏障功能障碍和神经炎症的潜在作用机制 | 首次发现EP300在睡眠障碍中的潜在作用，并揭示其通过影响小胶质细胞、血脑屏障功能和IL-1β表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 识别影响睡眠障碍的关键基因，为理解、预防和治疗睡眠障碍提供新视角 | 基因表达数据、慢性不可预见应激小鼠模型的前额叶皮层组织 | 生物信息学 | 睡眠障碍 | 差异表达分析、加权基因共表达网络分析、孟德尔随机化、qPCR、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、RNA测序数据 | 慢性不可预见应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4160 | 2025-11-18 |
Multi-tissue spatial transcriptomics identified simultaneous responses to oxidative stress and apoptosis in parallel with tissue-specific reprogramming in modeled chronic kidney disease-mineral and bone disorder
2025-Dec, JBMR plus
IF:3.4Q2
DOI:10.1093/jbmrpl/ziaf161
PMID:41216610
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研究论文 | 本研究通过多组织空间转录组学方法，揭示了慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱模型中氧化应激和凋亡的同步响应以及组织特异性重编程 | 首次采用多组织空间转录组学方法同时分析皮质骨、肌肉和骨髓中的基因组重编程，识别了组织特异性和共同性转录变化 | 研究仅使用雄性小鼠模型，样本量有限，且仅采用一种疾病诱导方法 | 识别和区分慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱中组织特异性和共同性基因组重编程 | 腺嘌呤饮食诱导的慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱雄性小鼠的股骨-肌肉组织 | 空间转录组学 | 慢性肾脏病-矿物质和骨紊乱 | 空间转录组学，qPCR | 均匀流形逼近与投影 | 空间转录组数据，基因表达数据 | 腺嘌呤饮食诱导CKD-MBD小鼠和酪蛋白对照饮食小鼠的股骨-肌肉组织切片 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium | Visium空间转录组技术 |