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当前共找到 37491 篇文献，本页显示第 4041 - 4060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4041 | 2026-01-16 |
Elucidating cardiac fibroblasts heterogeneity and activation during experimental autoimmune myocarditis using spatial transcriptomics
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102344
PMID:41341993
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，探究了实验性自身免疫性心肌炎急性炎症期中心脏成纤维细胞的转录模式变化及其异质性 | 首次在实验性自身免疫性心肌炎模型中，通过空间转录组学解析了心脏成纤维细胞在急性炎症期的时空异质性及其与免疫细胞浸润的共定位关系 | 研究基于动物模型，其结果向人类疾病的转化需进一步验证；空间转录组学分辨率可能不足以完全区分所有细胞亚群 | 阐明实验性自身免疫性心肌炎急性炎症期心脏成纤维细胞的异质性、激活状态及其与免疫微环境的相互作用 | 实验性自身免疫性心肌炎小鼠模型中的心脏组织 | 空间转录组学 | 心肌炎、扩张型心肌病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 1545个心脏成纤维细胞富集区域（其中657个以成纤维细胞为主） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4042 | 2026-01-16 |
ER Stress Ire1-Xbp1s Pathway Maintains Youthful Epidermal Basal Layer Through the Regulation of Cell Proliferation
2025-Dec, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70258
PMID:41077712
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研究论文 | 本研究通过引入Ire1-Xbp1s内质网应激反应通路敏感报告基因到短寿命脊椎动物Nothobranchius furzeri中，揭示了该通路在维持年轻表皮基底层细胞增殖和皮肤老化中的作用 | 首次在Nothobranchius furzeri模型中利用Ire1-Xbp1s通路敏感报告基因，结合光隔离化学空间转录组学，发现了该通路通过激活细胞周期调节因子Vcp维持年轻表皮细胞增殖的新机制 | 研究主要基于短寿命脊椎动物模型，结果在人类或其他哺乳动物中的普适性尚需进一步验证 | 探究内质网应激反应在衰老过程中的时空调控和功能角色 | 短寿命脊椎动物Nothobranchius furzeri的表皮组织 | 空间转录组学 | 皮肤老化 | 光隔离化学空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4043 | 2026-01-16 |
Systematic analysis of the expression profiles and prognostic values of the FAM72 family in liver cancer
2025-Dec, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102358
PMID:41378103
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析评估了FAM72家族成员在肝癌中的表达水平和预后意义 | 首次系统分析了FAM72A-D在肝癌中的表达谱和预后价值，并构建了基于FAM72的基因特征来预测肝癌患者预后 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；单细胞RNA测序结果仅提示FAM72A-D主要存在于增殖性T细胞中，具体机制未深入探讨 | 探究FAM72家族成员在肝癌中的表达模式、预后价值及其与肿瘤发生的关系 | 肝癌组织和正常组织中的FAM72A-D基因 | 生物信息学 | 肝癌 | 生物信息学分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4044 | 2026-01-16 |
MUSE: A Multi-slice Joint Analysis Method for Spatial Transcriptomics Experiments
2025-Nov, Proceedings of the ... ACM International Conference on Information & Knowledge Management. ACM International Conference on Information and Knowledge Management
DOI:10.1145/3746252.3761240
PMID:41527556
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MUSE的计算框架，用于处理大规模多切片空间转录组数据的联合嵌入、空间域识别和基因表达插补 | 开发了首个专门针对多切片空间转录组数据的联合分析框架，采用双模块架构（对齐模块和优化模块）结合最优传输和虚拟邻居生成技术，有效解决了跨切片不一致性和数据质量差异问题 | 方法性能在模拟和真实数据集上得到验证，但未提及对超大规模切片数量（如数百个切片）的扩展性测试 | 开发一个能够有效整合多切片空间转录组数据的计算框架，以提高跨切片一致性、空间域识别和基因表达插补的准确性 | 空间转录组数据，特别是来自同一组织或实验的多个连续或相关切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 图模型，最优传输，联合嵌入框架 | 空间转录组数据（基因表达矩阵与空间坐标） | 12个真实数据集和48个模拟数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4045 | 2026-01-16 |
CD34+CLDN5+ tumor associated senescent endothelial cells through IGF2-IGF2R signaling increased cholangiocellular phenotype in hepatocellular carcinoma
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.008
PMID:39674501
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定出肝细胞癌中与胆管细胞表型形成相关的特定衰老内皮细胞亚群，并揭示了其通过IGF2-IGF2R信号通路招募间充质干细胞促进肿瘤恶性进展的机制 | 首次在肝细胞癌中鉴定出CD34+CLDN5+衰老内皮细胞亚群，并阐明其通过分泌IGF2招募间充质干细胞、增强癌症干细胞样特性从而促进胆管细胞表型形成的全新机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，在人类患者中的临床验证仍需进一步开展 | 阐明肝细胞癌中胆管细胞表型形成的细胞机制和分子通路 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的内皮细胞、间充质干细胞和肿瘤细胞 | 单细胞组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4046 | 2026-01-16 |
Insulin-like growth factor binding protein 7 identified in aged dental pulp by single-cell RNA sequencing
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.018
PMID:39674503
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了年轻与衰老牙髓组织的异质性，并鉴定出衰老牙髓的新标记物IGFBP7，进一步探究了其在缓解细胞衰老中的作用机制 | 首次在单细胞水平上系统解析了年轻与衰老牙髓组织的细胞组成异质性，并发现IGFBP7作为衰老牙髓的新标记物，能减轻过氧化氢诱导的牙髓成纤维细胞衰老 | 需要更全面的研究来阐明IGFBP7影响牙髓衰老的确切机制，样本量相对有限 | 探索年轻与衰老牙髓组织的异质性，寻找衰老牙髓的新标记物并研究其作用机制 | 年轻与衰老的人牙髓组织样本、过氧化氢诱导的牙髓成纤维细胞衰老模型 | 单细胞组学 | 牙髓衰老 | 单细胞RNA测序、免疫组化染色、RNA测序、SA-β-Gal染色、γ-H2AX染色、F-actin细胞骨架染色 | NA | 单细胞转录组数据、RNA测序数据、图像数据 | 8个牙髓样本，共32,012个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4047 | 2026-01-16 |
Comprehensive analysis of heterogeneity and cell-cell interactions in Crohn's disease reveals novel location-specific insights
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.042
PMID:39732334
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了克罗恩病中结肠和回肠的异质性，并发现了一个新的DUOX2高表达上皮细胞亚群 | 首次在单细胞水平系统比较克罗恩病结肠与回肠的异质性，发现DUOX2-epi新上皮亚群及其部位特异性炎症机制 | 研究样本限于初治患者，未涵盖治疗中或难治性病例，且样本量相对较小 | 阐明克罗恩病结肠与回肠的异质性及其对发病机制和治疗反应的影响 | 克罗恩病初治患者的结肠和回肠组织 | 单细胞组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及初治克罗恩病患者的结肠和回肠组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4048 | 2026-01-16 |
Multi-omics approach reveals TGF-β signaling-driven senescence in periodontium stem cells
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.037
PMID:39743213
|
研究论文 | 本研究采用多组学方法揭示了TGF-β信号驱动牙周膜干细胞衰老的机制 | 首次绘制了小鼠颌骨组织的空间转录组图谱，并发现DNA甲基化是TGF-β1诱导牙周膜干细胞衰老的关键机制 | 研究主要基于体外细胞模型，体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明TGF-β1在牙周膜干细胞衰老中的作用及其分子机制，以促进对年龄相关性牙周疾病的理解和靶向治疗策略的开发 | 小鼠颌骨组织及人牙周膜干细胞 | 数字病理学 | 牙周疾病 | 空间转录组学，DNA甲基化分析，伪时间分析 | NA | 空间转录组数据，细胞表型数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4049 | 2026-01-16 |
Parkin modulates the hepatocellular carcinoma microenvironment by regulating PD-1/PD-L1 signalling
2025-Oct, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.12.045
PMID:39755271
|
研究论文 | 本研究探讨了Parkin蛋白通过调节PD-1/PD-L1信号通路影响肝细胞癌免疫微环境的机制 | 揭示了Parkin作为E3泛素连接酶通过泛素化降解PD-1来调节肿瘤免疫微环境的新机制，并首次在单细胞水平解析了Parkin缺失对肝肿瘤中T淋巴细胞和髓系细胞亚群的影响 | 研究主要基于小鼠模型，人体内的验证尚不充分；Parkin调节PD-1的具体分子机制仍需进一步阐明 | 探究Parkin在肝肿瘤免疫微环境中的作用及其通过PD-1/PD-L1信号通路调节抗肿瘤免疫的机制 | 四氯化碳诱导的肝肿瘤小鼠模型（Park2-/-小鼠） | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot、免疫荧光、免疫共沉淀、定量蛋白质组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、蛋白质组数据、免疫组化图像 | Park2-/-小鼠与对照小鼠的肝肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4050 | 2026-01-16 |
Exploring therapeutic targets for hepatocellular carcinoma through druggable genes
2025-Sep-26, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000044627
PMID:41029168
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研究论文 | 本研究利用孟德尔随机化等方法探索肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 整合多种分析方法（包括两样本孟德尔随机化、基于汇总数据的MR、贝叶斯共定位和蛋白质-蛋白质相互作用网络）来优先排序药物靶点，并结合单细胞RNA测序验证细胞类型特异性表达模式 | NA | 识别与肝细胞癌风险相关的潜在治疗靶点 | 肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化（MR）、基于汇总数据的MR、贝叶斯共定位、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4051 | 2026-01-16 |
Prior chemotherapy deteriorates T-cell quality for CAR T-cell therapy in B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2025-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010709
PMID:40210237
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研究论文 | 本研究评估了化疗对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者T细胞功能的影响，发现化疗会降低T细胞质量，从而影响CAR T细胞疗法的效果 | 首次通过多参数流式细胞术、单细胞RNA测序和全基因组DNA甲基化阵列综合分析化疗对T细胞功能的影响，为优化CAR T细胞疗法提供了新见解 | 样本量相对较小，且仅针对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者，结果可能不适用于其他癌症类型 | 评估化疗对T细胞功能的影响，以优化CAR T细胞疗法的效果 | B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 多参数流式细胞术, 单细胞RNA测序, 全基因组DNA甲基化阵列, 体外功能测试 | NA | 细胞, 基因表达数据, 甲基化数据 | 两个患者队列（治疗前和治疗后），具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组DNA甲基化阵列 | NA | NA |
| 4052 | 2026-01-16 |
Cross-species analyses of thymic mimetic cells reveal evolutionarily ancient origins and both conserved and species-specific elements
2025-Jan-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.11.025
PMID:39731911
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了人类、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞，揭示了其进化上的古老起源以及物种特异性和保守性元素 | 首次在人类儿科供体中高分辨率地描绘了胸腺模拟细胞的单细胞图谱，并进行了跨物种比较分析，突出了神经内分泌和肌肉亚型的多样化 | 研究主要基于儿科供体样本，可能无法完全代表成人或疾病状态下的胸腺模拟细胞特征 | 探究胸腺模拟细胞的进化起源、物种间保守性及适应性，以理解其在自身免疫中的潜在作用 | 人类儿科供体、小鼠和斑马鱼的胸腺模拟细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类儿科供体的纯化胸腺模拟细胞区室 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4053 | 2026-01-16 |
Analysis of intracellular and intercellular crosstalk from omics data
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0334981
PMID:41124151
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研究论文 | 本文提出了一种名为“Ulisse”的分析方法，用于评估组学数据中细胞内和细胞间分子相互作用的改变 | 开发了Ulisse方法，补充了现有富集分析、通路串扰分析和细胞间通讯分析方法的不足，特别关注控制过程或细胞间相互作用的组分改变，并采用两种不同的零模型支持串扰量化 | 仅以三阴性乳腺癌单细胞RNA测序数据作为概念验证，未在其他疾病或数据类型中广泛验证 | 评估组学数据中细胞内和细胞间分子相互作用的可能改变 | 基因列表（通常来自组学或多组学研究） | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 网络分析、零模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4054 | 2026-01-16 |
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-11, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.07.003
PMID:39127549
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综述 | 本文综述了单细胞等位基因特异性表达（ASE）数据的计算处理方法，包括从原始读取到统计分析的完整流程 | 系统总结了单细胞ASE分析的计算方法，并强调了集成优化生物信息学流程和统计方法进一步发展的需求 | 作为综述文章，未提出新的实验数据或算法，主要基于现有文献进行归纳 | 综述单细胞等位基因特异性表达的计算分析方法及其在生物学问题中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的等位基因特异性表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4055 | 2026-01-16 |
Unveiling contact-mediated cellular crosstalk
2024-10, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.05.010
PMID:38906738
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综述 | 本文探讨了细胞间相互作用在复杂生物功能中的作用，并综述了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术如何革新我们对细胞间通讯的理解 | 整合了单细胞测序、空间转录组学与生物工程工具，提供了分析细胞接触介导基因表达变化的新视角 | 作为综述文章，未涉及具体实验数据或方法验证 | 解析细胞间接触如何调控细胞反应网络 | 多细胞生物中的细胞间相互作用 | 计算生物学 | NA | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4056 | 2026-01-16 |
APOE ε4-associated downregulation of the IL-7/IL-7R pathway in effector memory T cells: Implications for Alzheimer's disease
2024-09, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
DOI:10.1002/alz.14173
PMID:39129310
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研究论文 | 本研究探讨了APOE ε4等位基因通过下调IL-7/IL-7R通路影响效应记忆T细胞，从而加剧阿尔茨海默病中海马萎缩的机制 | 首次揭示了APOE ε4等位基因与IL-7/IL-7R通路下调在效应记忆T细胞中的关联，并建立了血浆IL-7水平与海马萎缩程度的负相关关系 | 样本量较小（仅54名患者），且为横断面研究，无法确定因果关系 | 探究APOE ε4等位基因影响外周炎症和神经炎症的潜在机制 | 晚发性阿尔茨海默病患者（包括APOE ε4携带者和非携带者） | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | RNA序列数据 | 54名患者（28名APOE ε4携带者，26名非携带者） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4057 | 2026-01-16 |
Discovering mechanisms of human genetic variation and controlling cell states at scale
2024-07, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.03.010
PMID:38658256
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评论 | 本文探讨了单细胞测序在揭示人类遗传变异机制和控制细胞状态方面的潜力 | 提出将单细胞测序用于大规模构建变异效应表型图谱，并将遗传变异解释方法应用于工程化治疗性细胞状态 | NA | 加速人类遗传变异机制发现并推动基因组医学发展 | 人类遗传变异和细胞状态 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4058 | 2026-01-16 |
Single-cell phylotranscriptomics of developmental and cell type evolution
2024-06, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.02.005
PMID:38490933
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综述 | 本文总结了单细胞系统转录组学在揭示发育和细胞类型进化分子机制中的应用 | 利用单细胞系统转录组学分析，揭示了发育过程中谱系和细胞类型间转录组年龄的异质性，并识别了驱动整体生物钟形模式的谱系和组织 | NA | 探讨单细胞系统转录组学在理解发育进化模式和细胞类型进化史中的作用 | 发育过程中的谱系、细胞类型和组织 | 计算生物学 | NA | 单细胞系统转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4059 | 2026-01-16 |
The Transpeptidase Sortase A Binds Nucleic Acids and Mediates Mammalian Cell Labeling
2024-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202305605
PMID:38581131
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研究论文 | 本文发现金黄色葡萄球菌的转肽酶Sortase A能与核酸结合，并基于此开发了CellID技术用于单细胞RNA测序中的样本多重标记 | 首次揭示了Sortase A与核酸的未知相互作用，并利用这一特性开发了新的细胞标记技术CellID | 未详细探讨Sortase A与核酸结合的具体分子机制，且技术应用潜力尚未完全验证 | 探索Sortase A的非经典功能及其在生物技术中的应用 | 金黄色葡萄球菌Sortase A蛋白、哺乳动物细胞、核酸寡核苷酸 | 生物技术 | NA | CRISPR筛选、scRNA-seq | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4060 | 2026-01-16 |
Selective loss of resident macrophage-derived insulin-like growth factor-1 abolishes adaptive cardiac growth to stress
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.006
PMID:34363749
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研究论文 | 本文揭示了心脏驻留巨噬细胞通过产生胰岛素样生长因子-1在高血压应激下促进心肌细胞适应性生长和心脏功能维持的关键作用 | 首次明确了心脏驻留巨噬细胞来源的IGF-1在高血压诱导的心脏适应性生长中的绝对必要性，并识别了人类心肌病中保守的IGF-1表达巨噬细胞亚群 | 研究主要基于动物模型，人类数据仅通过单细胞转录组学识别相关巨噬细胞亚群，未进行功能验证 | 探究免疫细胞在高血压应激下心脏适应性生长中的作用机制 | 心脏驻留巨噬细胞和心肌细胞 | 单细胞转录组学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |