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当前共找到 35760 篇文献，本页显示第 4021 - 4040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4021 | 2025-11-24 |
Decoding immune low-response states in sepsis: single-cell and 3D spatial transcriptomic insights into immunoparalysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1696914
PMID:41268561
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综述 | 本文综述了脓毒症免疫低反应状态（免疫麻痹）的单细胞和3D空间转录组学研究进展 | 整合单细胞RNA/ATAC测序、免疫组库分析和3D空间转录组学技术，解析脓毒症免疫麻痹的细胞程序 | 检测标准化不足、单核细胞HLA-DR阈值缺乏统一标准、临床兼容空间平台有限 | 探讨脓毒症免疫低反应状态的分子机制和精准医疗策略 | 脓毒症患者的免疫细胞（单核细胞、树突状细胞、淋巴细胞、NK细胞） | 单细胞组学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫组库分析, 3D空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 空间转录组学 | NA | FFPE-ready空间检测 |
| 4022 | 2025-11-24 |
A single-cell transcriptomic atlas elucidates the hair cycle and apoptosis mechanisms in goat hair follicles
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1693637
PMID:41268577
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序构建了山羊毛囊凋亡的高分辨率细胞图谱，揭示了毛周期中毛囊细胞凋亡的分子机制 | 首次在山羊毛囊中鉴定出九种细胞类型，发现基质细胞富集Wnt信号通路和凋亡相关基因，并揭示了决定基质细胞命运的关键动态基因和调控因子 | NA | 探索山羊毛周期中毛囊凋亡的分子机制 | 山羊毛囊细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 8,214个毛囊细胞（来自生长期、退行期和休止期） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4023 | 2025-11-24 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160300
|
研究论文 | 本研究探索利用空间转录组学数据通过对比跨模态预训练机制生成深度学习模型，以提取分子和组织学信息用于基于图的学习任务 | 首次将空间转录组学数据与组织学成像配对，通过对比跨模态预训练机制增强基于图的深度学习模型在癌症病理分析中的性能 | NA | 开发能够更好理解癌变形态学和分子基础的算法，提升基于图的深度学习在癌症病理分析中的性能 | 癌症组织病理学全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | 对比跨模态预训练，基于图的深度学习 | 图神经网络 | 图像，空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 50微米分辨率定位的组织学成像与空间转录组学数据配对 |
| 4024 | 2025-11-24 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160301
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研究论文 | 本研究探索从常规H&E染色组织切片推断空间转录组信息的潜力，以增强皮肤光老化的大规模分子评估 | 开发了从常规H&E染色切片推断空间转录组信息的机器学习方法，避免了昂贵空间转录组技术的限制 | 研究样本量有限（仅4名患者），且存在患者间变异性 | 增强皮肤光老化的大规模分子评估能力，为皮肤癌研究提供新方法 | 皮肤组织标本，特别是基底细胞癌和鳞状细胞癌手术切除部位邻近的皮肤组织 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学，全玻片成像，机器学习 | 机器学习模型 | 图像，转录组数据 | 来自261个皮肤标本队列中的4名患者 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组分析，50微米分辨率，分析超过18,000个基因 |
| 4025 | 2025-11-24 |
Enhancing Spatial Transcriptomics Analysis by Integrating Image-Aware Deep Learning Methods
2024, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
PMID:38160299
|
研究论文 | 提出一种整合空间转录组学和组织病理学图像的深度学习方法，以更好地识别癌症组织中的生物学模式 | 首次将空间转录组学数据与组织病理学图像通过深度学习模型相结合，利用ResNet提取形态学特征，实现图像感知的特征发现 | 方法主要针对胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌等特定癌症类型，在其他疾病中的适用性有待验证 | 开发能够整合空间转录组学和图像数据的分析方法，以更好地理解癌症组织的空间异质性 | 胶质母细胞瘤和三阴性乳腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学，深度学习 | ResNet-50, Louvain聚类 | 空间基因表达数据，高分辨率全切片组织学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4026 | 2025-11-24 |
Potential to Enhance Large Scale Molecular Assessments of Skin Photoaging through Virtual Inference of Spatial Transcriptomics from Routine Staining
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551188
PMID:37577612
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研究论文 | 本研究开发了从常规H&E染色组织切片推断空间转录组信息的机器学习方法 | 首次探索从常规H&E染色切片虚拟推断空间转录组信息，以克服现有技术成本高和样本间变异大的限制 | 研究样本量相对较小（仅4名患者），可能限制结果的普适性 | 通过虚拟推断空间转录组信息来增强皮肤光老化的大规模分子评估能力 | 皮肤光老化组织，特别是基底细胞和鳞状细胞角质瘤手术切除部位邻近的皮肤标本 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 空间转录组学，全玻片成像，机器学习 | 机器学习模型 | 图像，转录组数据 | 来自261个皮肤标本队列中的4名患者样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium CytAssist | Visium CytAssist空间转录组分析，50微米分辨率，分析超过18,000个基因 |
| 4027 | 2025-11-24 |
Spatial Omics Driven Crossmodal Pretraining Applied to Graph-based Deep Learning for Cancer Pathology Analysis
2023-Jul-31, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.30.551187
PMID:37577686
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研究论文 | 本研究探索利用空间转录组学数据通过对比跨模态预训练机制生成深度学习模型，以提取分子和组织学信息用于基于图的学习任务 | 首次将空间组学数据与组织学成像配对，通过对比跨模态预训练机制增强基于图的深度学习模型在癌症病理分析中的性能 | NA | 开发能够更好理解癌变形态学和分子基础的算法，提升基于图的深度学习在癌症病理分析中的性能 | 癌症组织病理学全切片图像和空间转录组学数据 | 数字病理学 | 癌症 | 对比跨模态预训练，基于图的深度学习 | 图神经网络 | 图像，空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 50微米分辨率定位的组织学成像 |
| 4028 | 2025-11-23 |
Residual disease in NPM1-mutated acute myeloid leukemia
2026-Jan-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2025.120586
PMID:40912477
|
综述 | 本文综述了NPM1突变急性髓系白血病中微小残留病监测的技术进展与挑战 | 系统评估了qPCR、NGS、ddPCR等传统技术与CRISPR-Cas9、单细胞测序、人工智能等新兴技术在MRD监测中的综合应用 | 人工智能工具临床转化有限，受限于数据质量、算法偏见、基础设施和监管框架缺失等问题 | 评估NPM1突变AML中MRD监测技术的临床应用价值与发展前景 | NPM1突变急性髓系白血病患者的微小残留病监测 | 自然语言处理 | 急性髓系白血病 | 定量PCR、下一代测序、微滴数字PCR、CRISPR-Cas9、单细胞测序 | 人工智能、机器学习 | 分子检测数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4029 | 2025-11-23 |
Cutting-edge nanobiosensors: Revolutionizing cancer diagnosis and enabling precision medicine
2026-Jan-15, Clinica chimica acta; international journal of clinical chemistry
DOI:10.1016/j.cca.2025.120613
PMID:40962167
|
综述 | 本文综述了结合纳米技术与人工智能的尖端纳米生物传感器在癌症诊断和精准医疗中的革命性应用 | 整合纳米技术与人工智能提升生物传感器性能，开发多功能平台融合分子识别、成像和治疗功能，拓展RNA靶向检测新领域 | 存在规模化制造、长期稳定性、监管合规和环境可持续性方面的重大挑战 | 推动癌症早期检测、实时疾病监测和精准医疗发展 | 循环肿瘤DNA(ctDNA)、循环肿瘤细胞(CTCs)和微RNA(miRNAs)等关键生物标志物 | 生物医学工程 | 癌症 | 纳米生物传感技术、单细胞测序、表观转录组检测 | NA | 生物分子数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4030 | 2025-11-21 |
Single-cell transcriptome profiling reveals altered neural crest cell dynamics and novel biomarkers in EDNRB mutant mice with Hirschsprung's disease phenotype
2026-Jan, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101765
PMID:41262530
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4031 | 2025-11-23 |
Single-Cell Spatial Transcriptomic of Sjögren's Disease Salivary Glands
2026, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4997-8_14
PMID:41269557
|
研究论文 | 本章探讨利用10X Genomics的Visium HD空间转录组技术分析干燥综合征患者唾液腺组织的细胞和分子景观 | 首次应用高分辨率空间转录组技术研究人类干燥综合征唾液腺组织，保留组织结构的同时解析免疫细胞与结构细胞的相互作用 | 研究受限于小唾液腺活检组织的有限样本量 | 解析干燥综合征炎症环境的异质性，探索疾病机制和治疗机会 | 福尔马林固定石蜡包埋的人类小唾液腺组织 | 空间转录组学 | 干燥综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10X Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组协议 |
| 4032 | 2025-11-23 |
NOTCH gene pattern predicts prognosis, immune infiltration, and drug response in Head and Neck squamous cell carcinoma
2025-Dec, Journal of stomatology, oral and maxillofacial surgery
DOI:10.1016/j.jormas.2025.102582
PMID:41022354
|
研究论文 | 本研究开发并验证了基于NOTCH相关基因的头颈鳞状细胞癌预后风险模型 | 首次构建NOTCH评分系统用于HNSCC预后预测，并揭示其与肿瘤免疫微环境和治疗反应的关联 | 研究样本量有限，需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床适用性 | 开发头颈鳞状细胞癌的预后预测模型并探索其临床意义 | 头颈鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，LASSO回归，ROC分析 | 预后风险模型 | 基因表达数据，临床数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4033 | 2025-11-23 |
Macrophages mediate acute kidney allograft rejection via a toll-like receptor 4-dependent mechanism
2025-Dec, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.09.014
PMID:41033459
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研究论文 | 本研究揭示了巨噬细胞通过TLR4/HIF1α依赖机制介导急性肾移植排斥反应 | 首次证明髓系细胞特异性TLR4缺失可显著抑制急性肾移植排斥，并发现HIF1α是TLR4下游关键靶点 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需进一步验证 | 探究巨噬细胞在急性肾移植排斥反应中的作用机制 | 髓系细胞特异性TLR4基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 肾移植排斥 | 单细胞RNA测序，免疫分型，药理学抑制 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据，免疫细胞表型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4034 | 2025-11-23 |
TrajLens: Visual Analysis for Constructing Cell Developmental Trajectories in Cross-Sample Exploration
2025-Nov-21, IEEE transactions on visualization and computer graphics
IF:4.7Q1
DOI:10.1109/TVCG.2025.3634875
PMID:41269813
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研究论文 | 开发了一个名为TrajLens的可视分析系统，用于构建跨样本细胞发育轨迹 | 提出了基于GNN的跨样本细胞发育轨迹预测模型，并开发了集成细胞分布和发育方向特征的可视分析系统 | 需要人工参与轨迹精炼过程，系统性能仅通过两个案例研究和专家访谈验证 | 解决单细胞RNA测序分析中跨样本细胞发育轨迹构建的挑战 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | GNN | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4035 | 2025-11-23 |
Can LLMs Bridge Domain and Visualization? A Case Study on High-Dimension Data Visualization in Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-21, IEEE transactions on visualization and computer graphics
IF:4.7Q1
DOI:10.1109/TVCG.2025.3633869
PMID:41269823
|
研究论文 | 本研究探索使用大型语言模型分析单细胞转录组学领域文献中高维数据可视化的应用情况 | 提出了一种人机协作的LLM工作流程，能够分析大量专业文献并将领域特定术语转化为标准化的数据和任务抽象 | 研究依赖于LLM的分析能力，可能受到模型理解专业术语准确性的限制 | 探索LLM在弥合可视化设计与领域特定应用之间差距的潜力 | 单细胞转录组学领域文献中的高维数据可视化 | 自然语言处理 | NA | 大型语言模型、图像处理、传统NLP方法 | LLM | 文本、图像 | 1,203篇论文，包含2,056个高维可视化 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4036 | 2025-11-23 |
BMAL1 insufficiency increases the risk of thoracic aortic aneurysm and dissection
2025-Nov-21, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf259
PMID:41270048
|
研究论文 | 本研究探讨BMAL1表达不足通过诱导血管平滑肌细胞凋亡增加胸主动脉瘤和夹层风险的机制 | 首次揭示BMAL1/REV-ERBα/c-MYC信号轴在TAAD发病中的关键作用，并发现BMAL1激活剂ISX-9和REV-ERBα激动剂SR9009的治疗潜力 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证 | 阐明BMAL1在胸主动脉瘤和夹层发病机制中的作用 | TAAD患者组织样本、BAPN诱导的TAAD小鼠模型、血管平滑肌细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 转录组分析、空间转录组学、分子检测、组织学分析 | NA | 基因表达数据、组织学图像、分子互作数据 | TAAD患者和BAPN诱导的小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4037 | 2025-11-23 |
Cancer-Associated Fibroblasts Promote Imatinib Resistance in Gastrointestinal Stromal Tumors through PGK1-Mediated Metabolic Reprogramming
2025-Nov-21, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-1404
PMID:41270149
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过PGK1介导的代谢重编程促进胃肠道间质瘤对伊马替尼耐药的新机制 | 首次发现CAF通过TGF-β1/CCN2/Rack1/PGK1信号轴介导代谢重编程驱动伊马替尼耐药，突破了既往主要关注遗传驱动因素的研究局限 | 研究主要基于共培养模型和单细胞测序，尚未在更大规模的临床队列中验证该机制 | 探索胃肠道间质瘤中肿瘤微环境介导的伊马替尼耐药机制 | 胃肠道间质瘤细胞和癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤生物学 | 胃肠道间质瘤 | 单细胞RNA测序, 共培养模型 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4038 | 2025-11-23 |
Phenotypic characterization and prognostic impact of CD103+ tissue-resident memory T cells in diffuse large B cell lymphoma
2025-Nov-21, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-25-0445
PMID:41270222
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研究论文 | 本研究通过免疫荧光、流式细胞术和单细胞RNA测序揭示了弥漫性大B细胞淋巴瘤中CD103+组织驻留记忆T细胞的表型特征及其与良好预后的关联 | 首次在DLBCL中系统表征CD103+ TRM细胞的表型、转录组特征和功能活性，并证实其预后价值 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证结果 | 探究CD103+组织驻留记忆T细胞在弥漫性大B细胞淋巴瘤中的表型特征和预后意义 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者组织样本 | 免疫肿瘤学 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤 | 免疫荧光染色, 流式细胞术, 单细胞RNA测序, CITEseq, 共培养实验 | NA | 组织图像, 流式细胞数据, 单细胞转录组数据 | 两个患者队列的DLBCL样本 | NA | 单细胞RNA测序, CITEseq | NA | NA |
| 4039 | 2025-11-23 |
Efferocytosis-Driven Polyamine Metabolism in Macrophages Enhances Cancer Stem Cell Enrichment after Chemotherapy in Ovarian Cancer
2025-Nov-21, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202512508
PMID:41271556
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研究论文 | 本研究揭示巨噬细胞通过胞葬作用驱动的多胺代谢促进卵巢癌化疗后癌症干细胞富集的新机制 | 首次发现胞葬作用通过ODC1介导的多胺代谢重编程促进癌症干细胞富集，为克服化疗耐药提供了新靶点 | 研究机制尚未在更广泛的癌症类型中验证，临床转化潜力需进一步评估 | 探究化疗后肿瘤微环境变化如何促进卵巢癌癌症干细胞富集及化疗耐药 | 卵巢癌肿瘤微环境中的巨噬细胞和癌症干细胞 | 单细胞测序 | 卵巢癌 | 单细胞测序,多重免疫组化分析,代谢组学,转录组学 | NA | 单细胞测序数据,代谢组数据,转录组数据,免疫组化图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4040 | 2025-11-23 |
Spatial Location of SPP1+TAMs and Mutually Exclusive Subsets Based on Single-Cell and Transcriptome Data
2025-Nov-21, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70247
PMID:41273053
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组数据分析揭示了SPP1+TAMs在肺腺癌中的空间定位和互斥细胞亚群特征 | 首次系统阐明SPP1+TAMs和MARCO+M2巨噬细胞在肺腺癌不同发展阶段形成互斥细胞亚群，并揭示其空间分布特征与肿瘤侵袭性的关系 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 阐明SPP1+TAMs在肺腺癌中的空间定位和细胞亚群特征，为精准治疗提供科学依据 | 肺腺癌组织中的肿瘤相关巨噬细胞 | 单细胞分析 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组,免疫组化 | UMAP | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫组化数据 | TCGA、GTEx、GEO和HPA数据库中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |