单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 41796 篇文献，本页显示第 381 - 400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2026-07-25 |
Ankyrin-B and ankyrin-G are required for synaptic integrity in the mouse outer retina
2026-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgag239
PMID:42491609
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| 382 | 2026-07-25 |
Beyond the Brain: Circulating Tumor Cells as a Tool for Diagnosis and Monitoring
2026-Jul, JCO precision oncology
IF:5.3Q1
DOI:10.1200/PO-25-01199
PMID:42492027
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| 383 | 2026-07-25 |
Cell-type-specific architecture of the hypothalamus in a socially plastic vertebrate
2026-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.25.734636
PMID:42427733
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| 384 | 2026-07-25 |
Circulating T-follicular helper and type I regulatory T cells have overlapping phenotypes in P. falciparum malaria and are maintained by parasite exposure
2026-Jun-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.24.734380
PMID:42427645
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| 385 | 2026-07-25 |
Anti-amyloid immunotherapy drives APOE4 specific increases in glial reactivity, perivascular immune activation, and ARIA-like events
2026-Jun-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.26.734793
PMID:42427668
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| 386 | 2026-07-02 |
IntegrateRigor: annotation-free integration optimization for cell identity recovery reveals cancer-immune interface niches
2026-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.05.14.725078
PMID:42182279
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研究论文 | 提出IntegrateRigor框架，无需注释即可优化单细胞与空间转录组数据整合，恢复细胞身份并揭示癌症-免疫界面微环境 | 首次提出数据驱动、无注释、方法无关的积分优化框架，通过基因稳定性评分与整合平衡指标自动选择基因与超参数，无需先验细胞身份注释 | 该方法依赖于批次间稳定性基因的选择，可能忽略某些批次特异性但有生物学意义的基因；对高度复杂或小样本数据集的表现需进一步验证 | 解决单细胞和空间转录组数据整合中过度整合与欠整合问题，实现可靠的细胞身份恢复 | 结直肠癌的单细胞与空间转录组数据集，以及涵盖多种批次间变异来源的多个公开数据集 | 机器学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | 基因表达数据， 空间转录数据 | 结直肠癌数据集及多个公开数据集 | NA | 单细胞RNA测序， 空间转录组学 | NA | NA |
| 387 | 2026-07-25 |
An Integrated muti-omics cell atlas of the human trabecular meshwork and ciliary body
2026-Jun-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2026.06.17.732980
PMID:42395492
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| 388 | 2026-06-18 |
CXCL8 producing macrophages shape gastric cancer outcomes
2026-Jun-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05452-9
PMID:42307886
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研究论文 | 基于趋化因子构建预后模型并揭示CXCL8阳性巨噬细胞在胃癌肿瘤微环境中的作用 | 首次构建基于六种差异表达趋化因子的预后模型，并结合单细胞RNA测序鉴定CXCL8主要来源于巨噬细胞，揭示其通过SPP1信号通路促进肿瘤的机制 | 未明确说明数据来源的潜在偏倚及模型的临床验证范围 | 开发基于趋化因子的胃癌预后签名并阐明其细胞基础 | 胃癌患者转录组数据及单细胞RNA测序样本 | 机器学习 | 胃癌 | RNA测序,单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归 | 转录组数据,单细胞基因表达数据 | TCGA和GEO队列整合数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 389 | 2026-07-25 |
Identification of Estrogen-Related Biomarkers in Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease Through Machine Learning and Single-Cell Analysis
2026-Jun-10, Clinical and translational gastroenterology
IF:3.0Q2
DOI:10.14309/ctg.0000000000001059
PMID:42269031
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 390 | 2026-06-10 |
Development and validation of a cuproptosis-immune prognostic signature for risk stratification and personalized therapy in cutaneous melanoma
2026-Jun-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05396-0
PMID:42262432
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研究论文 | 基于铜死亡与免疫相关基因构建皮肤黑色素瘤预后风险特征，用于风险分层和个性化治疗决策 | 首次将铜死亡与免疫相关基因联合分析，构建12基因预后模型，并通过单细胞RNA测序和功能实验验证XCL2基因抑制黑色素瘤细胞增殖、迁移和侵袭的作用 | 研究基于TCGA和GTEx数据库，缺乏独立外部验证队列；功能实验仅针对XCL2基因，其他模型基因的机制有待探索 | 开发并验证一种结合铜死亡与免疫相关基因的预后特征，用于皮肤黑色素瘤的风险分层和个性化治疗 | 皮肤黑色素瘤患者 | 机器学习 | 皮肤黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA测序, 铜死亡相关分析, 免疫相关分析 | Cox回归, LASSO回归, 列线图 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 391 | 2026-06-10 |
ArchVelo: archetypal velocity modeling for single-cell multi-omic trajectories
2026-Jun-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-74000-4
PMID:42248920
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研究论文 | ArchVelo是一个从配对单细胞染色质可及性和转录组数据推断细胞轨迹的计算框架 | 将染色质可及性表示为共享调控程序的“原型”（archetypes），模型调控对转录的动态影响 | 未提及 | 从静态单细胞数据推断细胞动态和基因调控轨迹 | 小鼠脑、人类造血、病毒感染的CD8 T细胞 | 机器学习 | 病毒感染 | 单细胞多组学 | 原型速度模型 | 单细胞染色质可及性（scATAC-seq）和转录组（scRNA-seq）数据 | 小鼠脑、人类造血数据集及病毒感染的CD8 T细胞样本 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 392 | 2026-06-06 |
Integrative genomic analysis of 21 orofacial diseases identifies shared genetic architecture with systemic diseases
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73925-0
PMID:42243103
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研究论文 | 通过对英国生物银行中21种口面部疾病的整合基因组分析，发现48个新基因座并优先筛选出160个推定致病基因，揭示了口面部疾病与全身疾病之间的遗传结构和因果关系 | 首次系统性地对21种口面部疾病进行全基因组、全转录组、罕见变异关联研究和孟德尔随机化的整合分析，发现了ALDH1A2基因同义变异通过影响翻译效率与牙周炎相关，并利用单细胞RNA测序揭示了牙周炎组织中视黄酸信号受损及Th17偏斜的免疫表型 | 未明确提及局限性，但可能包括因果关系验证的样本选择偏差或UK Biobank人群代表性不足等问题 | 探究口面部疾病与全身疾病的遗传结构和因果关系 | 21种口面部疾病（如牙周炎、龋齿、舍格伦综合征等）及全身疾病（如肺癌、脑卒中） | 机器学习 | 老年性疾病 | 全基因组关联分析、全转录组关联分析、罕见变异关联研究、孟德尔随机化、CRISPR-Cas9编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、遗传变异数据、单细胞表达数据 | 英国生物银行（UK Biobank）中21种口面部疾病患者及对照组数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 393 | 2026-06-06 |
Inference of spatial chromatin accessibility via integration of spatial transcriptomics and single-cell multi-omics data
2026-Jun-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-73948-7
PMID:42243114
|
研究论文 | 提出了一个统一的计算方法ISON，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，推断空间染色质可及性 | ISON能够准确预测空间位点的染色质可及性图谱，并重建空间分辨的基因调控网络，且在时间和内存上具有可扩展性；其预测的染色质可及性可捕捉顺式和反式调控信息，并能估计位点水平的转录因子活性，区分同一家族内的转录因子，这是仅依靠染色质可及性数据的方法所不具备的特点 | 当前尚无商用试剂盒可同时进行空间多组学分析，阻碍了广泛数据生成 | 开发一种统一的计算方法，通过整合空间转录组学和单细胞多组学数据，实现空间多组学分析 | 空间转录组数据和单细胞多组学数据（基因表达和染色质可及性） | 计算生物学、机器学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞多组学、空间转录组学、计算建模 | 深度学习模型 | 基因表达数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 阿尔茨海默病数据（样本数量未在摘要中明确） | 不适用 | 空间转录组学、单细胞多组学（单细胞RNA-seq与单细胞ATAC-seq联合分析） | 不适用 | 不适用 |
| 394 | 2026-06-18 |
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2026-Jun-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000967
PMID:41563281
|
研究论文 | 研究基质硬度如何通过早期损伤和酮生成程序指导肾脏修复 | 发现Mfap2通过大肿瘤抑制激酶1介导的非经典Hippo通路驱动机械代谢信号，并揭示Mfap2-雌激素受体2-Hmgcs2回路可能成为减轻急性肾损伤的药物靶点 | 未在文中明确说明 | 探究细胞外基质在急性肾损伤修复中的机械调节机制 | 成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学、磷酸化蛋白质组学、数据非依赖采集全局蛋白质组学 | NA | 蛋白质组学数据、空间转录组学数据 | 遗传和药物诱导的急性肾损伤动物模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 395 | 2026-07-25 |
Patient-derived organoid-immune co-cultures integrated with multi-omics reveal immunotherapy resistance mechanisms in urothelial carcinoma
2026-Jun, iMeta
IF:23.7Q1
DOI:10.1002/imt2.70130
PMID:42491341
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2026-06-03 |
Application of single-cell transcriptomic technology in cell fate determination of embryonic liver
2026-May-29, Histology and histopathology
IF:2.5Q2
DOI:10.14670/HH-25-100
PMID:42227418
|
综述 | 综述单细胞转录组技术在胚胎肝脏细胞命运决定中的应用，整合单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合和类器官建模的最新进展 | 提出细胞图谱构建、细胞间通讯分析、空间验证和类器官功能建模形成迭代循环的新范式，推动从描述性编目向机制解析的转变 | 未明确说明本综述的局限 | 总结单细胞转录组学在解析胚胎肝脏发育中细胞命运决定机制的研究进展，为先天性肝病、肿瘤分层和再生医学提供概念和方法基础 | 人及小鼠胚胎肝脏中的肝母细胞、肝细胞、胆管细胞、肝胆双能祖细胞、内皮细胞和星状细胞等非实质细胞 | 机器学习和数字病理学 | 先天性肝病 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、多组学整合、类器官建模 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、多组学数据 | 人类和小鼠胚胎肝脏样本（具体数量未提及） | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 397 | 2026-05-29 |
Thyroid-stimulating hormone receptor mediates peripheral-central neuroimmune crosstalk in autoimmune thyroid diseases
2026-May-27, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04957-y
PMID:42204533
|
研究论文 | 通过多组学整合分析揭示促甲状腺激素受体在自身免疫性甲状腺疾病中介导外周-中枢神经免疫串扰的分子机制 | 首次从多组学层面系统证明TSHR作为分子枢纽连接外周与中枢神经免疫串扰，并鉴定出三种潜在的再利用化合物 | 样本量有限，缺乏纵向随访和体内验证，结果需谨慎解释并进一步研究 | 阐明促甲状腺激素受体如何连接外周自身免疫与中枢神经系统特征 | Graves病、Graves眼病患者及小鼠模型 | 自然语言处理 | 甲状腺疾病 | GWAS, RNA-seq, 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 脑影像数据 | NA | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 398 | 2026-05-29 |
Integrative single-cell and bulk analyses reveal ATF4-associated immune suppression and WNT/β-catenin signaling in osteosarcoma
2026-May-27, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00797-1
PMID:42204636
|
研究论文 | 整合单细胞和批量分析揭示骨肉瘤中ATF4相关的免疫抑制和WNT/β-catenin信号通路 | 首次通过整合单细胞RNA-seq和批量转录组数据，系统揭示ATF4在骨肉瘤中连接应激相关肿瘤程序、免疫抑制和WNT/β-catenin激活的关键作用，并构建了ATF/CREB相关风险评分（ACS）用于预后分层 | 主要依赖公开数据集进行生物信息学分析，缺乏大规模前瞻性临床验证；ATF4在骨肉瘤中的具体分子机制和调控网络仍需进一步实验验证 | 探究ATF/CREB应激反应网络（特别是ATF4）在骨肉瘤免疫抑制微环境和预后的作用机制 | 骨肉瘤（OS）肿瘤样本的单细胞RNA-seq和批量转录组数据 | 机器学习 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子动力学模拟 | NA | 单细胞基因表达数据, 批量转录组数据 | 多个公共数据集，包括TARGET和GEO队列，具体样本量未详细列出 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2026-07-25 |
Investigation of the clinical value of artificial intelligence-derived prognostic signature in cervical cancer based on machine learning algorithms
2026-May-27, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05182-y
PMID:42201622
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 400 | 2026-07-25 |
Decoding lactylation heterogeneity in glioblastoma: machine learning identifies G6PC3 as a prognostic target
2026-May-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-026-16225-6
PMID:42192326
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |