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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 381 | 2025-12-07 |
XPR1 regulates fetal liver macrophage development, identity, and pyrenocyte clearance
2026-Feb-02, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20241587
PMID:41335223
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研究论文 | 本文揭示了磷酸盐转运蛋白XPR1对胎儿肝脏巨噬细胞发育、身份识别及红细胞核清除功能的关键作用 | 首次发现XPR1作为唯一已知的磷酸盐输出蛋白,对胎儿巨噬细胞发育具有特异性调控作用,并阐明了其在红细胞生成相关巨噬细胞功能中的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚未验证;巨噬细胞功能变化的分子通路细节有待进一步解析 | 探究磷酸盐转运蛋白XPR1在胎儿巨噬细胞发育和功能中的作用机制 | 小鼠胎儿肝脏巨噬细胞、脾脏红髓巨噬细胞、骨髓巨噬细胞 | 发育生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、条件性基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、流式细胞数据 | 条件性Xpr1敲除小鼠胚胎及成年个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 382 | 2025-12-07 |
RNA tomography reveals spatial gene expression maps of Arabidopsis thaliana roots infected with Heterodera schachtii
2026-Jan, The New phytologist
DOI:10.1111/nph.70674
PMID:41104608
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研究论文 | 本研究介绍了一种名为RNA tomography的空间转录组学技术,用于绘制拟南芥根部感染甜菜胞囊线虫后的空间基因表达图谱 | 首次将RNA tomography技术应用于植物研究,实现了高空间分辨率的基因表达分析,并成功定位了线虫咽腺及未表征基因的表达区域 | 研究仅关注感染后1-2天的早期阶段,可能未覆盖整个寄生过程的动态变化,且技术应用范围有待进一步验证 | 探究植物寄生线虫诱导的取食结构形成与发育的分子机制 | 拟南芥(Arabidopsis thaliana)根部及感染其的甜菜胞囊线虫(Heterodera schachtii) | 空间转录组学 | 植物寄生线虫病 | RNA tomography | NA | 空间基因表达数据 | 96个连续横截面(每片20微米),采集自感染后1天和2天的拟南芥根部 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 383 | 2025-12-07 |
A genomic view of Earth's biomes
2026-Jan, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00888-1
PMID:40954201
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综述 | 本文综述了基因组中心方法在调查地球生物群落中微生物和病毒多样性中的应用,包括单细胞测序和功能分析的最新进展 | 整合了基因组中心方法,特别是单细胞测序和功能分析技术,以全面理解微生物多样性及其功能 | NA | 通过基因组数据更全面地理解地球生物群落中微生物组的结构和功能 | 地球生物群落中的微生物和病毒 | 自然语言处理 | NA | 高通量测序,单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 384 | 2025-12-07 |
Microglial Prrc2a regulates microglia-neuron interaction in cerebellum and motor functions in mice
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113949
PMID:41341849
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研究论文 | 本研究探讨了转录后调节因子Prrc2a在小脑小胶质细胞中的功能,及其对小胶质细胞-神经元相互作用和小鼠运动功能的调控机制 | 首次在小脑特异性小胶质细胞条件性敲除模型中揭示Prrc2a通过调控转录组稳定性影响小胶质细胞活化状态,进而调节浦肯野细胞形态与电生理活动 | 研究局限于小鼠模型,未在人类组织或临床样本中验证;机制研究主要基于转录组层面,缺乏蛋白质水平验证 | 探究小胶质细胞特异性转录后调节因子Prrc2a在小脑发育与功能中的作用机制 | 小脑小胶质细胞、浦肯野细胞、小鼠运动功能 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、条件性基因敲除、电生理记录 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据、形态学数据、电生理数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 385 | 2025-12-07 |
Unraveling tumor associated macrophage biology in gynecological cancers for targeted therapy in the single cell omics era
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113924
PMID:41341850
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综述 | 本文总结了单细胞组学时代下,针对妇科癌症中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的生物学特性及其作为靶向治疗新策略的最新证据 | 系统性地整合了单细胞RNA测序技术揭示的TAM亚群异质性、表型可塑性及其在肿瘤进展和耐药中的特定作用,并评估了靶向特定TAM亚型的转化策略 | 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行总结和评述,未提供新的原始实验数据或验证 | 旨在阐明妇科癌症中肿瘤相关巨噬细胞的生物学特性,探索其作为改善临床疗效的靶向治疗新途径 | 妇科癌症(如卵巢癌、宫颈癌、子宫内膜癌等)及其肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 妇科癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 386 | 2025-12-07 |
Single‑cell RNA sequencing reveals fibroblast heterogeneity and identifies CLOCK as a key regulator in fibrotic skin diseases
2025-Dec-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-30260-6
PMID:41350567
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了纤维化皮肤疾病中成纤维细胞的异质性,并识别出CLOCK作为瘢痕疙瘩的关键调控因子 | 首次通过单细胞RNA测序系统解析了正常皮肤、瘢痕、瘢痕疙瘩和硬皮病中成纤维细胞的异质性,并发现了疾病特异性调控因子如CLOCK | 研究主要基于公共数据库数据,缺乏实验验证的深度;样本来源可能有限,未涵盖所有纤维化疾病亚型 | 探究纤维化皮肤疾病的细胞机制,识别关键调控因子以开发靶向治疗策略 | 纤维化皮肤疾病(包括瘢痕、瘢痕疙瘩、硬皮病)中的成纤维细胞 | 数字病理学 | 皮肤纤维化疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自公共数据库的多个样本,涵盖正常皮肤、瘢痕、瘢痕疙瘩和硬皮病 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 387 | 2025-12-07 |
Using single-cell and transcriptome data to identify prognostic genes associated with SUMO-ylation and their molecular regulatory mechanisms in breast cancer
2025-Dec-06, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15265-8
PMID:41350692
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,识别了与乳腺癌预后相关的SUMO化修饰基因,并构建和验证了一个风险预测模型 | 首次在单细胞水平上系统性地识别并验证了与乳腺癌预后相关的SUMO化修饰基因,并构建了具有良好预测性能的风险模型 | 研究主要基于生物信息学分析,尽管进行了RT-qPCR验证,但进一步的体内外功能实验验证尚不充分 | 探索SUMO化修饰相关基因在乳腺癌中的预后价值及其分子调控机制 | 乳腺癌患者组织样本及其转录组和单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,转录组分析,RT-qPCR | 风险预测模型,列线图模型 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据,临床数据 | 未在摘要中明确说明具体样本数量,涉及乳腺癌及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 388 | 2025-12-07 |
Single-cell transcriptomics reveals heterocellular g-globin gene expression in Agdb-thalassemia
2025-Dec-06, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016755
PMID:41351474
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 389 | 2025-12-07 |
Drosophila and mouse intestinal stem cells are spatiotemporally specified by Notch suppression and Wnt activation
2025-Dec-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.ady7272
PMID:41337595
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研究论文 | 本研究通过果蝇和小鼠模型,揭示了肠道干细胞在发育过程中通过Notch抑制和Wnt激活的时空协调机制进行特化的保守过程 | 首次在果蝇蛹期肠道中精确量化了ISC特化的时间窗口和细胞数量,并证明了Notch抑制与Wnt激活的空间协同作用在昆虫到哺乳动物中的保守性 | 研究主要基于果蝇和小鼠的胚胎/发育阶段,成年肠道稳态中的机制可能有所不同,且单细胞测序样本量相对有限 | 探究肠道干细胞在发育过程中的特化机制及其信号通路调控 | 果蝇蛹期中肠和小鼠胚胎肠道中的肠道干细胞及前体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序、遗传学实验、细胞计数与追踪 | NA | 单细胞基因表达数据、显微图像数据 | 约6000个果蝇肠道上皮细胞(其中约150个ISC) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 390 | 2025-12-07 |
Single-cell sequencing of rodent ventral pallidum reveals diverse neuronal subtypes with noncanonical interregional continuity
2025-Dec-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adp3059
PMID:41337598
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了腹侧苍白球(VP)的神经元亚型多样性及其与基底神经节外区域的非典型连续性 | 首次对啮齿类动物腹侧苍白球进行跨物种单细胞转录组测序,鉴定出16个保守的神经元亚类,并发现这些细胞类型超越了传统解剖边界,与纹状体、下丘脑等区域共享 | 研究主要基于啮齿类动物模型,人类VP的转录组特征仍需验证;高脂饮食影响的分子机制尚未完全阐明 | 探究腹侧苍白球的区域身份特征及其细胞类型多样性 | 小鼠和大鼠的腹侧苍白球组织 | 单细胞组学 | NA | 单细胞核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 啮齿类动物(小鼠和大鼠)腹侧苍白球组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 391 | 2025-12-07 |
Uncoupling Protein 1 (UCP1) in Non-Adipose Tissue
2025-Dec-05, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00260.2025
PMID:41348594
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研究论文 | 本研究系统性地探究了UCP1在非脂肪组织中的表达模式及其在发育过程中的潜在非产热功能 | 首次发现UCP1在胚胎发育早期(E10.5)即在非产热组织中表达,早于脂肪组织形成,并揭示了其在视网膜发育中的生理作用 | UCP1在非脂肪组织中的具体分子机制和广泛生理功能仍需进一步研究 | 探究UCP1在非脂肪组织中的表达模式、发育动态及其非产热功能 | UCP1基因敲入小鼠、UCP1-Cre转基因小鼠及其与Ai9-tdTomato报告鼠的杂交后代 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、免疫染色分析、基因敲除 | NA | 基因表达数据、图像数据 | 多种基因工程小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 392 | 2025-12-07 |
Molecular basis for de novo thymus regeneration in a vertebrate, the axolotl
2025-Dec-05, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adw9903
PMID:41348861
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研究论文 | 本研究揭示了脊椎动物蝾螈能够实现胸腺的从头再生,并探讨了其分子机制 | 首次在脊椎动物中展示了胸腺的从头再生能力,并识别了midkine信号作为早期驱动因子,而FOXN1在再生启动中非必需 | 研究主要基于蝾螈模型,其发现向哺乳动物临床应用的转化仍需进一步验证 | 探究脊椎动物胸腺再生的分子基础,以指导未来促进胸腺再生的临床策略 | 蝾螈(axolotl)的胸腺组织 | 发育生物学与再生医学 | 免疫系统疾病 | 单细胞转录组学、遗传学方法、移植实验 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 393 | 2025-12-07 |
Extracellular Vesicle-Packaged MIR4435-2HG Facilitates Cigarette Smoke-Induced Bladder Cancer Progression through Enolase 1-Dependent Glycolytic Reprogramming
2025-Dec-05, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c15108
PMID:41348936
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研究论文 | 本研究揭示了吸烟相关细胞外囊泡包裹的lncRNA MIR4435-2HG通过ENO1依赖的糖酵解重编程促进膀胱癌进展的机制 | 首次发现M2巨噬细胞在吸烟致癌物4-ABP刺激下分泌EV包裹的MIR4435-2HG,通过ac4C修饰稳定ENO1并激活PI3K-Akt信号,介导肿瘤细胞间通讯 | 研究主要基于体外和动物模型,临床样本验证有限,且未涉及其他吸烟相关致癌物的潜在影响 | 阐明吸烟促进膀胱癌进展的分子机制,探索EV包裹lncRNA在肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌患者尿液和血浆样本、M2巨噬细胞、膀胱肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 膀胱癌 | RNA测序、组织芯片、单细胞RNA测序、CRISPR/Cas9、Seahorse能量代谢分析、ac4C乙酰化实验 | NA | RNA测序数据、单细胞转录组数据、临床样本数据 | 膀胱癌患者尿液和血浆样本(具体数量未明确) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 394 | 2025-12-07 |
Exploring the human brain: spatial transcriptomics challenges and approaches in post-mortem analysis
2025-Dec-05, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awaf452
PMID:41349001
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综述 | 本文回顾了空间转录组学技术在人类大脑研究中的应用,比较了不同工具,总结了现有研究,并讨论了相关的挑战与机遇 | 聚焦于空间转录组学在人类大脑这一复杂器官分析中的具体挑战,并提供了指导性框架以应对这些挑战 | NA | 探讨空间转录组学在人类大脑研究中的应用挑战与机遇 | 人类大脑 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | mRNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 395 | 2025-12-07 |
Identification of sepsis pyroptosis-related genes based on single-cell sequencing technology and experimental verification
2025-Dec-05, BMC immunology
IF:2.9Q3
DOI:10.1186/s12865-025-00785-6
PMID:41350624
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 396 | 2025-12-07 |
Ferroptosis-induced remodeling of glycosylation the immune microenvironment and improves survival in pancreatic cancer
2025-Dec-05, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04146-w
PMID:41350704
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研究论文 | 本研究探讨了铁死亡在胰腺导管腺癌中如何重塑糖基化模式和免疫微环境,并揭示了其与临床预后的关联 | 首次将O-GlcNAc修饰肽和N-糖基化肽的双通路特异性富集策略应用于铁死亡研究,实现了细胞死亡过程中糖基化模式的系统分析;结合高分辨率质谱、转录组和单细胞转录组数据,构建了多组学相互验证的全景分析框架;引入Scissor方法将TCGA铁死亡通路活性映射到单细胞数据,实现了从群体水平到细胞亚群的跨尺度分析 | 研究主要依赖高通量组学和计算分析,缺乏系统的体外和体内功能验证、联合药物敏感性实验以及真实世界临床队列的支持 | 探究铁死亡与肿瘤糖基化及免疫重塑之间的相互作用,为胰腺癌治疗提供新的潜在策略 | 胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 基于质谱的糖蛋白质组学、转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、Western blot | NA | 蛋白质组学数据、转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 397 | 2025-12-07 |
Polystyrene nanoplastics disrupt epididymal initial segment by perturbing NK cell differentiation and epithelial homeostasis
2025-Dec-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03892-z
PMID:41350722
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学、非靶向代谢组学和体内实验,揭示了聚苯乙烯纳米塑料暴露通过干扰自然杀伤细胞分化和上皮稳态,破坏大鼠附睾起始段的结构与功能 | 首次从多组学角度详细研究聚苯乙烯纳米塑料对附睾起始段的影响,揭示了其通过激活ERK1/2信号通路上调AQP9、促进NK细胞向细胞毒性和增殖亚型分化,并破坏血-附睾屏障的新机制 | 研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类或其他物种中验证;长期暴露效应和可逆性尚未明确;具体分子机制仍需进一步深入探究 | 探究聚苯乙烯纳米塑料暴露对附睾起始段的细胞重塑和功能影响 | 大鼠附睾起始段组织、细胞(包括上皮细胞、自然杀伤细胞、基底细胞等) | 单细胞组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞转录组学、非靶向代谢组学、体内实验 | NA | 单细胞转录组数据、代谢组数据、组织形态数据 | 大鼠分组实验(对照组、低剂量组、中剂量组、高剂量组),具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 398 | 2025-12-07 |
PEGylated black-phosphorus nanosheet-alginate hydrogels enable local PRRX1 delivery to drive fibroblast reprogramming in intestinal fibrosis
2025-Dec-05, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03896-9
PMID:41350883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了克罗恩病肠道纤维化中的关键转录因子PRRX1,并开发了一种新型水凝胶递送系统用于局部PRRX1递送,以驱动成纤维细胞重编程 | 首次将PRRX1鉴定为肠道纤维化的核心调控因子,并创新性地开发了PEG化黑磷-海藻酸盐水凝胶(PRRX1@BP-PEG/Alg)用于局部蛋白质递送,实现了对成纤维细胞表型的直接重编程 | 研究主要基于小鼠模型和体外人类成纤维细胞实验,尚未在人类患者中进行验证;水凝胶系统的长期安全性和生物相容性有待进一步评估 | 阐明肠道纤维化的分子机制并开发靶向治疗策略 | 克罗恩病患者的成纤维细胞、小鼠模型(Col1a2-Cre; Prrx1)、人类肠道成纤维细胞 | 单细胞组学与生物材料 | 克罗恩病(肠道纤维化) | 单细胞RNA测序、ChIP-seq、报告基因检测、蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据、蛋白质数据、基因组数据 | 来自克罗恩病患者的配对纤维化和非纤维化回肠组织(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 399 | 2025-12-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals regulatory programs of prognosis-associated RNA binding proteins during LIHC development
2025-Dec-05, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-04088-z
PMID:41351009
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析,揭示了与肝细胞癌预后相关的RNA结合蛋白在肿瘤发展过程中的调控程序 | 在单细胞水平上解析了肝细胞癌中RNA结合蛋白的异质性,并鉴定出HDGF作为一个候选致癌性RNA结合蛋白,通过体外实验和选择性剪接分析验证了其功能 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验,缺乏体内实验验证;单细胞测序样本量有限,可能无法完全代表肿瘤异质性 | 探究肝细胞癌中RNA结合蛋白的单细胞水平异质性、调控作用及其治疗潜力 | 肝细胞癌肿瘤组织、恶性细胞群、髓系来源细胞群 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序、TCGA数据分析、NMF算法、GO/KEGG富集分析、CCK-8、EdU、Transwell实验、SpliceSeq分析 | NMF算法、单细胞转录组分析 | 单细胞RNA测序数据、TCGA-LIHC批量RNA测序数据 | 未明确指定,使用了TCGA-LIHC数据集和单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 400 | 2025-12-07 |
Tumor-initiating stem cells fine-tune the plasticity of neutrophils to sculpt a protective niche
2025-Dec-04, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.11.001
PMID:41349542
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤起始干细胞通过调节中性粒细胞的塑性,塑造保护性微环境以影响癌症免疫治疗疗效的机制 | 首次发现SOX2肿瘤起始干细胞通过Fads1-AA-PGE信号通路调节中性粒细胞的干扰素反应,从而影响免疫治疗效果 | 研究主要聚焦于鳞状细胞癌,结果在其他癌症类型中的普适性有待验证 | 探究肿瘤相关中性粒细胞异质性及其对免疫治疗响应的影响机制 | 肿瘤相关中性粒细胞和肿瘤起始干细胞 | 数字病理学 | 鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,遗传操作 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |